Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Роль генетических и эпигенетических факторов в развитии рака молочной железы и немелкоклеточного рака лёгкого

Диссертация: Роль генетических и эпигенетических факторов в развитии рака молочной железы и немелкоклеточного рака лёгкого
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Гиперметилирование CpG-островков в промоторном районе найдено для ряда генов-супрессоров, таких как GSTP1, MGMT RASSF1A и др. (Ходырев и др., 2011). Метилирование регуляторных участков нарушает их взаимодействие с факторами транскрипции, блокируя эти участки с помощью белков, специфично связывающихся с метилированными CpG-парами (Methyl-CpG binding proteins), и более того, вносит изменения… Читать ещё >

Содержание

  • Список сокращений
  • 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Общие закономерности канцерогенеза
      • 1. 1. 1. Онкогены и гены-супрессоры опухолевого роста
    • 1. 2. Современные подходы к поиску новых «онкозначимых» генов
      • 1. 2. 1. Основные подходы к анализу генетического полиморфизма генов в эпителиальных опухолях
      • 1. 2. 2. Подходы к анализу метилирования промоторных районов генов в ^ эпителиальных опухолях
      • 1. 2. 3. Комплексные подходы
    • 1. 3. Роль генных полиморфизмов в формировании онкологического риска
      • 1. 3. 1. Полиморфные маркеры генов глутатион-8-трансфераз в патогенезе онкологических заболеваний
      • 1. 3. 2. Ген ТР53 и его регулятор МБМ2 — связь с формированием и ^ развитием рака
    • 1. 4. Роль метилирования ДНК в канцерогенезе
    • 1. 5. Гены многоуровневой системы «клеточной защиты» организма, вовлечённые в патогенез немелкоклеточного рака легкого и рака молочной 40 железы
      • 1. 5. 1. Гены биотрансформации ксенобиотиков — С5ТМ/, С5ТТ1 и ^ в8ТР
      • 1. 5. 2. Гены системы репарации, пролиферации, клеточного цикла и апоптоза
        • 1. 5. 2. 1. Ген ТР53 и функционально связанный с ним ген М?>М
        • 1. 5. 2. 2. Ген МБЗПА
        • 1. 5. 2. 3. ГенМСЖГ
  • 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Реактивы, ферменты и буферные растворы
    • 2. 2. Материалы исследования
    • 2. 3. Выделение геномной ДНК из крови и ткани
    • 2. 4. ПЦР-ПДРФ
    • 2. 5. Бисульфитная конверсия ДНК
    • 2. 6. Метил-специфичная полимеразная цепная реакция (МС-ПЦР)
    • 2. 7. Статистическая обработка результатов
      • 2. 7. 1. Сравнение выборок по частотам аллелей и генотипов. Точный ^ критерий Фишера. Поправка Бонферрони
      • 2. 7. 2. Оценка относительного риска. Odds ratio. Доверительный интервал
      • 2. 7. 3. Критерий согласия Пирсона х
  • 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3. 1. Ассоциация полиморфных маркеров генов биотрансформации с риском развития немелкоклеточного рака лёгкого и рака молочной железы. 64 Связь с клинико-гистологическими параметрами опухоли

    3.2. Ассоциация полиморфных маркеров генов пролиферации клеточного цикла и апоптоза с риском развития немелкоклеточного рака лёгкого и ^ рака молочной железы. Связь с клинико-гистологическими параметрами опухоли.

    3.3. Изменение профиля метилирования промоторных районов генов RASSF1A и MGMT при немелкоклеточном раке лёгкого и раке молочной 73 железы- связь с прогрессией рака.

    3.4. Сравнительный анализ исследованных генов и их комбинаций у больных с немелкоклеточным раком легкого и раком молочной железы.

Роль генетических и эпигенетических факторов в развитии рака молочной железы и немелкоклеточного рака лёгкого (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

В последние десятилетия частота онкологических заболеваний неуклонно растет. Ежегодно более 10 млн. человек во всем мире заболевают раком и 6 млн. человек умирают от рака ежегодно, что составляет 12% от умерших во всем мире.

Факт, что злокачественное новообразование возникает в результате генетических и эпигенетических повреждений в одной клетке уже не вызывает сомнений, а количество генов прямо или косвенно вовлеченных в канцерогенез неуклонно возрастает. Единичного повреждения, как правило, недостаточно для превращения клетки в опухолевую. Лишь накопление 5−10 таких повреждений в течение продолжительного времени, часто многих лет, приводит к злокачественному новообразованию. Генетические и эпигенетические нарушения способствуют либо активации протоонкогенов, стимулирующих пролиферацию клеток, либо подавлению генов — супрессоров опухолевого роста, тормозящих пролиферацию. Неправильная работа генов, контролирующих рост и деление клеток, вызывает неконтролируемую клеточную пролиферацию.

Только около 5−10% случаев рака являются наследственными, а остальные случаи рака являются результатом генетических и эпигенетических повреждений, возникающих в течение жизни в соматических клетках. Но даже при наследственной передаче предрасположенности к раку злокачественное новообразование возникает только в результате дополнительных соматических повреждений. Повреждения могут происходить либо вследствие воздействия внешних факторов (курение, химические вещества, радиация, инфекционные агенты, солнечное излучение, алкоголь), либо внутренних (гормоны, иммунная система, наследуемые мутации).

Ещё 100 лет назад рак легкого (PJI) считался уникально редким заболеванием, в частности, к 1898 г. в медицинской литературе было описано всего 140 случаев PJ1. Широкое распространение курения в начале XX века привело к тому, что PJI быстро занял позицию самого частого онкологического заболевания: ежегодно новообразования лёгкого диагностируются примерно у 1,2 миллиона человек, причём более 1 миллиона жителей планеты погибают от PJI. В структуре онкологической заболеваемости на PJI приходится 12,8%. Показатели 5-летней выживаемости при PJI выглядят весьма удручающе: даже в странах с самым высоким стандартом здравоохранения они составляют всего 15%, а при среднем уровне развития медицины эта цифра едва достигает 5−7% {Jemal et al., 2010). В разных географических регионах среди мужчин ежегодно регистрируется от 5,3 до 99,7 новых случаев PJI на 100 000 человек в год, заболеваемость женщин в 6−10 раз ниже. В России ежегодно от PJ1 погибает свыше 60 000 человек, что составляет более 20% всех умерших от злокачественных опухолей (Имянитов, 2006). Приблизительно 80% всех опухолей легкого приходится на немелкоклеточный рак (HMPJI), оставшиеся 20% представлены мелкоклеточным раком легкого.

В этиологии рака легкого определённую роль играют химические соединения, связанные с индустриальными процессами и неблагоприятными экологическими условиями. Однако, несмотря на большой перечень канцерогенных воздействий, влияющих на превращение нормальных клеток эпителия легкого в злокачественные, их вклад в развитие опухолей легкого не превышает 10−20%. Подавляющее большинство случаев PJI (80−90%) обусловлено курением. Популяризация «низкосмолистых» (lowtar) сигарет, «как менее канцерогенных», привела к возрастанию доли аденокарцином, среди опухолей легкого. Подобные изменения в эпидемиологии PJI связаны с тем, что в сигаретах с высоким содержанием смолы основная доля канцерогенов представлена полициклическими ароматическими углеводородами (ПАУ), тогда как в «низкосмолистых» преобладают нитрозамины (Имянитов, 2006).

Рак молочной железы (РМЖ) занимает лидирующие позиции среди злокачественных опухолей у женщин, каждая 10-я — имеет риск заболеть в течение жизни, смертность доходит до 40%. Последние годы наблюдается тенденция омоложения РМЖ. Так средний возраст женщин с диагнозом РМЖ составляет 53 года, тогда как 10 лет назад он составлял 65 лет (Мусаева и др., 2005; Asadzadeh et al., 2011). В отличие от рака легкого, ни один из канцерогенов окружающей среды не удалось убедительно связать с причиной возникновения рака молочной железы. Поэтому на первый план выходят факторы, участвующие в поддержании геномной стабильности. Во-первых, гены, задействованные в распознавании и/или репарации повреждений ДНК (Imyanitov et al., 2004). Во-вторых, гены ответственные за регуляцию клеточного цикла и алоптоза.

Согласно современным представлениям, важную роль в процессе канцерогенеза играют не только генетические факторы, в том числе и различные индивидуальные вариации ферментных систем (Ревазова и др., 2006), но и эпигенетические факторы — метилирование промоторных районов генов и ацетилирование гистонов {Логинов и др., 2004; Ходырев и др., 2011).

Гиперметилирование CpG-островков в промоторном районе найдено для ряда генов-супрессоров, таких как GSTP1, MGMT RASSF1A и др. (Ходырев и др., 2011). Метилирование регуляторных участков нарушает их взаимодействие с факторами транскрипции, блокируя эти участки с помощью белков, специфично связывающихся с метилированными CpG-парами (Methyl-CpG binding proteins), и более того, вносит изменения в окружающий хроматин, переводя его в стабильно репрессированное состояние {Springfield et al., 2012). Изменение статуса метилирования промоторных районов некоторых генов является характерной чертой опухолевых клеток, причем аномальное метилирование наблюдается уже на ранних этапах канцерогенеза. Изменения в уровне метилирования промоторных районов ряда генов показаны для рака молочной железы, простаты, легкого и рака других локализаций {Shenker et al., 2012; Lu et al., 2012).

Таким образом, генетические и эпигенетические факторы предрасположенности к развитию онкологических заболеваний связаны с несколькими уровнями системы клеточной защиты организма. Первый уровень — связан с генами биотрансформации, которые обеспечивают метаболизм чужеродных соединений. В этот процесс главным образом вовлечены гены глутатион 8 трансфераз Т1, М1, Р1 (ОБТП, С8ТМ1, ОБТР!) (Мартов и др., 2010; Корчагина и др., 2011). Следующий уровень клеточной защиты связан с механизмом репарации молекул ДНК при повреждении её структуры. На этом уровне важным геном является регулятор опухолевой супрессии ДНК метилтрансфераза 06-метилгуанина (МСМГ) (Степанов и др., 2010; Пономарева и др., 2011). Третий уровень — связан с генами контроля пролиферации, дифференцировки и роста клеток. Таковыми являются ген-супрессор КАББРЫ и транскрипционный фактор ТР53 со своим регуляторным геном МИМ2 {Желтухин и Чумаков, 2010).

В данном исследовании сделана попытка объединить две позиции в изучении проблемы повреждения генома человека — нарушение статуса метилирования генов ЯАББРЫ и МСМГ и генетический полиморфизм систем клеточного контроля и детоксикации ксенобиотиков, применительно к генам, кодирующим ключевые ферменты этих систем — СБТТ!, СБТМ!, С5ТР1, ТР53 и МБМ2. При этом чтобы подчеркнуть универсальность участия данных ферментов в онкологических процессах были выбраны две принципиально различные по механизмам развития онкопатологиинемелкоклеточный рак легкого и рак молочной железы.

Противоречивость данных литературы о вкладе полиморфных маркеров генов контроля клеточного цикла и ферментов системы биотрансформации ксенобиотиков в развитие НМРЛ и РМЖ, отсутствие информации о влиянии комбинаций их генотипов, а также связи полиморфных маркеров с метилированием ключевых генов с развитием этих форм рака делает целесообразным, на наш взгляд, проведение исследования по оценке вклада сочетаний этих генов в предрасположенность к НМРЛ и РМЖ. Не менее актуальным представляется установление взаимосвязи повреждения исследуемых генов с клинико-морфологическими особенностями онкозаболеваний, а так же проведение сравнительного анализа полиморфных маркеров генов ТР53, МйМ2, глутатион-8-трансфераз и их комбинаций при НМРЛ и РМЖ. Полученные данные послужат основой для определения дополнительных критериев прогноза клинического течения заболевания.

Целью данного исследования является изучение роли метилирования промоторных районов генов ЯАББРЫ и МСМТ, а так же полиморфных маркеров генов СБТР1, СБТП, ОБТМ!, ТР53 и МВМ2 в патогенезе немелкоклеточного рака легкого и рака молочной железы.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

выводы.

1. Обнаружена высокодостоверная ассоциация полиморфных маркеров генов систем биотрансформации (б^ГМ/, 08ТТ1, СБТР!) и пролиферации клеточного цикла и апоптоза (ТР53 и МБМ2) с развитием НМРЛ и РМЖ и их гистологических подтипов.

2. Составлен профиль метилирования СрО-островков промоторных районов генов МСМТ и КАБЗПА. Впервые показано значимое повышение частоты метилирования гена МСМТ при раке молочной железы.

3. Показана ассоциация полиморфных маркеров изученных генов (Сг8ТМ1, ОБТП, С8ТР1, ТР53 и Ш) М2) и метилирования промоторных районов генов МСМТ и 11А88ПА с клинико-гистологическими и патофизиологическими параметрами опухолей.

4. Впервые выявлена статистически значимая ассоциация частоты метилирования гена МСМТ с прогрессией РМЖ, в том числе и у пациентов с трижды негативным раком молочной железы.

5. Обнаружены высоко достоверные ассоциации сочетанных генотипов исследованных в работе генов с риском развития НМРЛ и РМЖ. Выявлены как общие, так и специфичные предраспологающие сочетанные генотипы для НМРЛ и РМЖ.

6. Показано независимое влияние на риск развития НМРЛ генетических и эпигенетических факторов онкологического процесса.

7. Впервые показана связь полиморфных вариантов ферментов второй фазы биотрансформации ксенобиотиков и апаптоза с метилированием генов супрессоров опухолей с риском развития РМЖ.

Показать весь текст

Список литературы

  1. В.П., Кочетков Д. В., Чумаков П. М. р53 Инструмент для терапии злокачественных заболеваний человека. Молекулярная биология. 2007, 41(6), 947 963
  2. B.C. Генетический паспорт основа индивидуальной и предиктивной медицины. Санкт-Петербург: H-JI. 2009, 527 с
  3. .Ф. Метилирование ДНК и эпигенетика. Генетика. 2006, 42(9), 1186— 1199
  4. ДНК-технология. Методическое пособие. Основы полимеразной цепной реакции (ПЦР). Москва. 2012, 68−71
  5. А.Т., Попов В. Н., Федорин Д. Н. Идентификация и исследование экспрессии генов Учебно-методическое пособие для вузов Издательско-полиграфический центр Воронежского государственного университета. 2008, 2831
  6. А.О. и Чумаков П.М. Повседневные и индуцируемые функции гена р53. Успехи биоорганической химии. 2010, 50, 447−516
  7. Д.В., Немцова М. В., Стрельников В. В., Бабенко О. В., Васильев Е. В., Землякова В. В., Жевлова А. И., Дрозд О. В. Диагностика эпигенетической патологии при наследственных и онкологических заболеваниях. Молекулярная биология. 2004, 38(2), 213−223
  8. Имянитов Е. Н Наследственный рак молочной железы Практическая онкология. 2010, 11(4), 258−266.
  9. E.H., Молекулярная патология рака лёгкого: клинические аспекты. Практическая онкология. 2006, 7(3), 131−137
  10. Н.П., Киселев Ф. Л. Деметилирование ДНК и канцерогенез (обзор). Биохимия. 2005, 70, 900−912
  11. .П. Опухолевые супрессоры и мутаторные гены. Сборник обзорных статей «Канцерогенез», под ред. Д. Г. Заридзе, М: Научн. Мир. 2000, 75−92
  12. .П., Копнин П. Б., Хромова Н. В., Агапова Л. С. Многоликий р53: разнообразие форм, функций, опухольсупрессирующих и онкогенных активностей. Клиническая онкогематология. 2008,1(1), 2−9
  13. A.B., Киселева Н. П. Биохимия. 2001, 66(3), 657−69
  14. В.И., Ходырев Д. С., Пронина И. В., Малюкова A.B., Казубская Т. П., Ермилова В. Д., Гарькавцева Р. Ф., Забаровский Е. Р., Брага Э. А. Два CpG-островка гена SEMA3B: метилирование при светлоклеточном раке почки. Молекуляр. Биология, 2009,43(3), 436−445
  15. Н.Э., Дыхно Ю. А. Качество жизни больных при раке молочной железы, Сибирский Онкологический Журнал. 2005, 2(14), 50−55
  16. A.A., Е.Ю. Рыкова, H.B. Чердынцева, Чойнзонов E. JL, Лактионов П. П., Власов В. В. Молекулярно-генетические маркеры в диагностике рака легкого. Молекулярная биология. 2011, 45(2), 203−217
  17. Г. П., Дамманн Р. Метилирование гена опухолевого супрессора RASSFIA в человеческих опухолях. Биохимия. 2005, 70, 699−708
  18. Ю.А., Хрипач Л. В., Сидорова И. Е., Юрченко В. В., Зыкова И. Е. Комплексный подход к оценке нестабильности генома человека. Вестник Российской АМН. 2006, 4, 36−41
  19. A.B., Манзюк Л. В. Значение биомаркеров для определения тактики лечения и прогноза злокачественных опухолей. Практическая онкология. 2011, 12(4), 166−170
  20. А.Г. 2000. Онкогены. Сборник обзорных статей «Канцерогенез», под ред. Д. Г. Заридзе, М: Научн. Мир, 57−74
  21. С.А., Стенина М. Б., Фролова М. А. Тройной негативный рак молочной железы. Практическая онкология. 2010, 11(4), 247−252
  22. Д.С., Логинов В. И., Пронина И. В., Казубская Т. П., Забаровский Е. Р., Брага Э. А. Изменение метилирования генов из критичных районов хромосомы 3 в эпителиальных опухолях. Молекулярная медицина. 2011, 1, 3−10
  23. A.B., Хохрин Д. В., Лимборская С. А. Полиморфизм генов глутатион-S-трансфераз в популяциях русского населения европейской части России. Генетика. 2008, 44, 1429−1434
  24. H.H., Михаленко Е. П., Полонецкая С. Н., Чеботарева Н. В., Демидчик Ю. Е., Жилко A.A., Квитко О. В., Крупнова Э. В. Полиморфизм GST-генов и цитогенетические изменения в ткани легкого больных раком легкого. Цитология и генетика. 2009, 43(1), 48−53
  25. П.М. Белок р53 и его универсальные функции в многоклеточном организме. Успехи биологической химии. 2007, 47, 3−52
  26. Adams J.M. and Cory S. The Bcl-2 apoptotic switch in cancer development and therapy. Oncogene. 2007, 26, 1324−1337
  27. Ahmad ST, Arjumand W, Seth A, Kumar Saini A, Sultana S. Impact of glutathione transferase Ml, Tl, and PI gene polymorphisms in the genetic susceptibility of North Indian population to renal cell carcinoma. DNA Cell Biol. 2012, 31(4), 636−643
  28. Alawadi S, Ghabreau L, Alsaleh M, Abdulaziz Z, Rafeek M, Akil N, Alkhalaf M. P53 gene polymorphisms and breast cancer risk in Arab women. Med Oncol. 2011, 28(3), 709−715
  29. Alimirah F, Peng X, Murillo G, Mehta RG. Functional significance of vitamin D receptor Fokl polymorphism in human breast cancer cells. PLoS One. 2011, 6(1) el6024
  30. Alshatwi AA, Hasan TN, Shafi G, Alsaif MA, Al-Hazzani AA, Alsaif AA. A single-nucleotide polymorphism in the TP53 and MDM-2 gene modifies breast cancer risk in an ethnic Arab population. Fundam Clin Pharmacol. 2012, 26(3), 438−43.
  31. Antognelli C, Del Buono C, Ludovini V, Gori S, Talesa VN, Crin6 L, Barberini F, Rulli A. CYP17, GSTP1, PON1 and GLOl gene polymorphisms as risk factors for breast cancer: an Italian case-control study. BMC Cancer. 2009, 9, 115
  32. Arnold CN, Sosnowski A, Schmitt-Graff A, Arnold R, Blum HE. Analysis of molecular pathways in sporadic neuroendocrine tumors of the gastro-entero-pancreatic system. Int J Cancer. 2007, 120(10), 2157−2164
  33. Asadzadeh VF, Breeders MJ, Kiemeney LA, Verbeek AL. Opportunity for breast cancer screening in limited resource countries: a literature review and implications for Iran. Asian Pac J Cancer Prev. 2011,12(10), 2467−2475
  34. Atinkaya C, Taspinar M, Sakiragaoglu O, Oz G, Yazici U, Oztuna D, Tastepe I, Sunguroglu A. The effect of CYP1A1, GSTT1 and GSTM1 polymorphisms on the risk of lung cancer: a case-control study. Hum Exp Toxicol. 2012, 31(10), 1074−1080.
  35. Auerkari EI. Methylation of tumor suppressor genes pl6(INK4a), p27(Kipl) and E-cadherin in carcinogenesis. Oral Oncol. 2006, 42(1), 5−13
  36. Baig RM, Mahjabeen I, Sabir M, Masood N, Hafeez S, Malik FA, Kayani MA. Genetic changes in the PTEN gene and their association with breast cancer in Pakistan. Asian Pac J Cancer Prev. 2011, 12(10), 2773−2778.
  37. Bao LD, Niu JX, Song H, Wang Y, Ma RL, Ren XH, Wu XL. Association between the GSTP1 codon 105 polymorphism and gastric cancer risk: an updated meta-analysis. Asian Pac J Cancer Prev. 2012, 13(8), 3687−3693
  38. Baylin S.B. Mechanisms underlying epigenetically mediated gene silencing in cancer. Semin Cancer Biol. 2002, 12, 331−337
  39. Bejrananda T, Phukaoloun M, Boonpipattanapong T, Wanitsuwan W, Kanngern S, Sangthong R, Sangkhathat S. WT1 expression as an independent marker of poor prognosis in colorectal cancers. Cancer Biomark. 2010−2011, 8(1), 35−42.
  40. Benchabane H, Ahmed Y. The adenomatous polyposis coli tumor suppressor and Wnt signaling in the regulation of apoptosis. Adv Exp Med Biol. 2009, 656, 75−84.
  41. Bisof V, Salihovic MP, Narancic NS, Skaric-Juric T, Jakic-Razumovic J, Janicijevic B, Turek S, Rudan P. TP53 gene polymorphisms and breast cancer in Croatian women: a pilot study. Eur J Gynaecol Oncol. 2010, 31(5), 539−544
  42. Bjerkvig R, Tysnes BB, Aboody KS, Najbauer J, Terzis AJ. Opinion: the origin of the cancer stem cell: current controversies and new insights. Nat Rev Cancer. 2005, 5(11), 899−904
  43. Boldrini L, Gisfredi S, Ursino S, Lucchi M, Greco G, Mussi A, Donati V, Fontanini G. Effect of the p53 codon 72 and intron 3 polymorphisms on non-small cell lung cancer (NSCLC) prognosis. Cancer Invest. 2008, 26(2), 168−172
  44. Bolt HM, Thier R. Relevance of the deletion polymorphisms of the glutathione S-transferases GSTT1 and GSTM1 in pharmacology and toxicology. Curr Drug Metab. 2006, 7(6), 613−628
  45. Bondurant AE, Huang Z, Whitaker RS, Simel LR, Berchuck A, Murphy SK. Quantitative detection of RASSF1A DNA promoter methylation in tumors and serum of patients with serous epithelial ovarian cancer. Gynecol Oncol. 2011, 123(3), 581−587
  46. Botana-Rial M, De Chiara L, Valverde D, Leiro-Fernandez V, Represas-Represas C, Del Campo-Perez V, Fernandez-Villar A. Prognostic value of aberrant hypermethylation in pleural effusion of lung adenocarcinoma. Cancer Biol Ther. 2012, 13(14), 1436−1442
  47. Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.V. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms Amer. J. Hum. Genet. 1980, 32(3), 314−331
  48. Bourdon JC, Fernandes K, Murray-Zmijewski F, Liu G, Diot A, Xirodimas DP, Saville MK, Lane DP. p53 isoforms can regulate p53 transcriptional activity. Genes Dev. 2005, 19(18), 2122−2137
  49. Bubnov V, Moskalev E, Petrovskiy Y, Bauer A, Hoheisel J, Zaporozhan V. Hypermethylation of TUSC5 genes in breast cancer tissue. Exp Oncol. 2012, 34(4), 370 372
  50. Burkhart D.L. and Sage J. Cellular mechanisms of tumour suppression by the retinoblastoma gene. Nat. Rev. Cancer. 2008, 8, 671−682-
  51. Bustin S.A. and Mueller R. Real-time reverse transcription PCR (qRT-PCR) and its potential use in clinical diagnosis. Clinical Science. 2005, 109, 365−379
  52. Cabral RE, Caldeira-de-Araujo A, Cabral-Neto JB, Costa Carvalho Mda G. Analysis of GSTM1 and GSTT1 polymorphisms in circulating plasma DNA of lung cancer patients. Mol Cell Biochem. 2010, 338(1−2), 263−269
  53. Caceres DD, Quinones LA, Schroeder JC, Gil LD, Irarrazabal CE. Association between p53 codon 72 genetic polymorphism and tobacco use and lung cancer risk. Lung. 2009, 187(2), 110−115
  54. Cavenee W.K., Dryja T.P., Philips R.A., Benedict W.F., Godbout R., Gallie B.L., Murphree A.L., Strong L.C. and White R. Expression of recessive alleles by chromosomal mechanisms in retinoblastoma. Nature, 1983, 305, 779−784
  55. Cesinaro AM, Sartori G, Migaldi M, Schirosi L, Pellacani G, Collina G, Maiorana A. Prognostic significance of MGMT gene promoter methylation in differently treated metastatic melanomas. Pathology. 2012, 44(4), 313−317
  56. Chan QK, Khoo US, Ngan HY, Yang CQ, Xue WC, Chan KY, Chiu PM, Ip PP, Cheung AN. Single nucleotide polymorphism of pi-class glutathione s-transferase and susceptibility to endometrial carcinoma. Clin Cancer Res. 2005, 11(8), 2981−2985
  57. Chen HY, Shao CJ, Chen FR, Kwan AL, Chen ZP. Role of ERCC1 promoter hypermethylation in drug resistance to cisplatin in human gliomas. Int J Cancer. 2010, 126(8), 1944−1954.
  58. Chen X, Liang L, Hu X, Chen Y. Glutathione S-transferase PI gene Ilel05Val polymorphism might be associated with lung cancer risk in the Chinese Han population. Tumour Biol. 2012, 33(6), 1973−1981
  59. Chen XX, Zhao RP, Qiu LX, Yuan H, Mao C, Hu XC, Guo XM. Glutathione S-transferase T1 polymorphism is associated with breast cancer susceptibility. Cytokine. 2011,56(2), 477−480
  60. Choi N, Son DS, Song I, Lee HS, Lim YS, Song MS, Lim DS, Lee J, Kim H, Kim J. RASSF1A is not appropriate as an early detection marker or a prognostic marker for non-small cell lung cancer. Int. J. Cancer. 2005, 115, 575−581
  61. Choo S., Lum S.S., Li H" Soh L.Y., Sabapathy K" Seow A. Effect of MDM2 SNP309 and P53 codon 72 polymorphisms on lung cancer risk and survival among non-smoking Chinese women in Singapore. BMC Cancer. 2010, 10(88), 1186−1193
  62. Christiansen L., Brasch-Andersen C., Bathum L. et al. A longitudinal study of the effect of GSTT1 and GSTM1 gene copy number on survival. Mech. Ageing Dev. 2006, 127, 597−599
  63. Christmann M, Verbeek B, Roos WP, Kaina B. 0(6)-Methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) in normal tissues and tumors: enzyme activity, promoter methylation and immunohistochemistry. Biochim Biophys Acta. 2011, 1816(2), 179−190
  64. Chua HW, Ng D, Choo S, Lum SS, Li H, Soh LY, Sabapathy K, Seow A. Effect of MDM2 SNP309 and p53 codon 72 polymorphisms on lung cancer risk and survival among non-smoking Chinese women in Singapore. BMC Cancer. 2010, 10, 88
  65. Chuang LY, Yang CH, Tsui KH. Restriction Enzyme Mining for SNPs in Genomes Anticancer Research. 2008, 28, 2001−2008
  66. Coles AH, Jones SN. The ING gene family in the regulation of cell growth and tumorigenesis. J Cell Physiol. 2009, 218(1), 45−57
  67. Cong, Y., and Shay, J.W. Actions of human telomerase beyond telomeres. Cell Res. 2008,18, 725−732
  68. Costa S, Pinto D, Pereira D, Rodrigues H, Cameselle-Teijeiro J, Medeiros R, Schmitt F. Importance of TP53 codon 72 and intron 3 duplication 16bp polymorphisms in prediction of susceptibility on breast cancer. BMC Cancer. 2008, 8, 32
  69. Costello J.F., Plass C. Methylation matters. J. Med. Genet. 2001, 38, 285−303
  70. Cowey CL, Rathmell WK. VHL gene mutations in renal cell carcinoma: role as a biomarker of disease outcome and drug efficacy. Curr Oncol Rep. 2009, 11(2), 94−101.
  71. Curto M., Cole B.K., Lallemand D., Liu C.H. and McClatchey A.I. Contact-dependent inhibition of EGFR signaling by Nf2/Merlin. J. Cell Biol. 2007, 177, 893−903
  72. Czerninski R, Krichevsky S, Ashhab Y, Gazit D, Patel V, Ben-Yehuda D. Promoter hypermethylation of mismatch repair genes, hMLHl and hMSH2 in oral squamous cell carcinoma. Oral Dis. 2009, 15(3), 206−213.
  73. Damin AP, Frazzon AP, Damin DC, Roehe A, Hermes V, Zettler C, Alexandre CO. Evidence for an association of TP53 codon 72 polymorphism with breast cancer risk. Cancer Detect Prev. 2006, 30(6), 523−529
  74. Daniel FI, Cherubini K, Yurgel LS, de Figueiredo MA, Salum FG. The role of epigenetic transcription repression and DNA methyltransferases in cancer. Cancer. 2011, 117(4), 677 687
  75. Daniunaite K, Berezniakovas A, Jankevicius F, Laurinavicius A, Lazutka JR, Jarmalaite S. Frequent methylation of RASSF1 and RARB in urine sediments from patients with early stage prostate cancer. Medicina (Kaunas). 2011, 47(3), 147−153
  76. Denisov EV, Cherdyntseva NV, Litvyakov NV et al. TP53 mutations and Arg72Pro polymorphism in breast cancers. Cancer Genet Cytogenet. 2009, 192, 93−95
  77. Dohi S, Ohno S, Ohno Y, Kyo S, Soma G, Sugiyama H, Inoue M. WT1 expression correlates with angiogenesis in endometrial cancer tissue. Anticancer Res. 2010, 30(8), 3187−3192.
  78. Dong J, Ren B, Hu Z, Chen J, Hu L, Dai J, Jin G, Xu L, Shen H. MDM2 SNP309 contributes to non-small cell lung cancer survival in Chinese. Mol Carcinog. 2011, 50(6), 433−438.
  79. Donninger H, Vos MD, Clark GJ. The RASSF1A tumor suppressor. J Cell Sei. 2007, 120(18), 3163−3172
  80. Dufloth RM, Arruda A, Heinrich JK, Schmitt F, Zeferino LC. The investigation of DNA repair polymorphisms with histopathological characteristics and hormone receptors in a group of Brazilian women with breast cancer. Genet Mol Res. 2008, 7(3), 574−582
  81. Economopoulos KP, Sergentanis TN. Differential effects of MDM2 SNP309 polymorphism on breast cancer risk along with race: a meta-analysis. Breast Cancer Res Treat. 2010, 120(1), 211−216
  82. Ekim M., Caner V., Buyukpinarba§ ih N., Tepeli E., Elmas L., Bagci G. Determination of 06-methylguanine DNA methyltransferase promoter methylation in non-small cell lung cancer. Genet Test Mol Biomarkers. 2011, 15(5), 357−360
  83. Erali M, Palais R, Wittwer C. SNP genotyping by unlabeled probe melting analysis. Methods Mol Biol. 2008,429,199−206
  84. Ertel A, Dean JL, Rui H, Liu C, Witkiewicz AK, Knudsen KE, Knudsen ES. RB-pathway disruption in breast cancer: differential association with disease subtypes, disease-specific prognosis and therapeutic response. Cell Cycle. 2010, 9(20), 4153−4163.
  85. Feng X, Zheng BS, Shi JJ, Qian J, He W, Zhou HF. Association of glutathione S-transferase PI gene polymorphism with the susceptibility of lung cancer. Mol Biol Rep. 2012, 39(12), 10 313−10 323
  86. Fernandes MS, Carneiro F, Oliveira C, Seruca R. Colorectal cancer and RASSF family-a special emphasis on RASSF1A. Int J Cancer. 2013, 132(2), 251−258
  87. Fernandez-Rubio A, Lopez-Cima MF, Gonzalez-Arriaga P, Garcia-Castro L, Pascual T, Marron MG, Tardon A. The TP53 Arg72Pro polymorphism and lung cancer risk in a population of Northern Spain. Lung Cancer. 2008, 61(3), 309−316
  88. Frommer M., McDonald L.E., Millar D.S., Collies C.M., Watt F., Grigg G.W. A genomic sequencing protocol that yields a positive display of 5-methylcytosine residues in individual DNA strands. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89, 1827−1831
  89. Frova C. Glutathione transferases in the genomics era: New insights and perspectives. Biomol. Enginering. 2006, 23, 149−169
  90. Furuya M, Nishiyama M, Kasuya Y, Kimura S, Ishikura H. Pathophysiology of tumor neovascularization. Vase Health Risk Manag. 2005, 1(4), 277−290
  91. Gong M, Dong W, An R. Glutathione S-transferase T1 polymorphism contributes to bladder cancer risk: a meta-analysis involving 50 studies. DNA Cell Biol. 2012, 31(7), 1187−1197
  92. Grodzicker T., Williams J., Sharp P., Sambrook J. Physical mapping of temperature-sensitive mutations of adenoviruses. Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1975, 39, 1, 439−446
  93. Gronbaek K, Hother C, Jones PA. Epigenetic changes in cancer. APMIS. 2007, 115(10), 1039−1059
  94. Gupta R, Nagarajan A, Wajapeyee N. Advances in genome-wide DNA methylation analysis. Biotechniques. 2010, 49(4), iii-xi
  95. Haimovich AD. Methods, challenges, and promise of next-generation sequencing in cancer biology. Yale J Biol Med. 2011, 84(4), 439−446
  96. Hammel P, Hentic O, Neuzillet C, Faivre S, Raymond E, Ruszniewski P. New treatment options with cytotoxic agents in neuroendocrine tumours. Target Oncol. 2012, 7(3), 169 172
  97. Han J.Y., Lee G.K., Jang D.H., Lee S.Y., Lee J.S. Association of P53 codon 72 polymorphism and MDM2 SNP309 with clinical outcome of advanced nonsmall cell lung cancer. Cancer. 2008, 113(4), 799−807
  98. Han W, Kang SY, Kang D, Park SK, Lee JY, Kim H, Park AK, Noh DY., Multiplex genotyping of 1107 SNPs from 232 candidate genes identified an association between ILIA polymorphism and breast cancer risk. Oncol Rep. 2010, 23(3), 763−769
  99. Hanahan D and Weinberg RA., Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell. 2011, 144, 646−674
  100. Hartman M., Loy E.Y., Ku C.S., Chia K.S. Molecular epidemiology and its current clinical use in cancer management. Lancet. Oncol. 2010,11, 383−390
  101. Hassler MR, Klisaroska A, Kollmann K, Steiner I, Bilban M, Schiefer AI, Sexl V, Egger G. Antineoplastic activity of the DNA methyltransferase inhibitor 5-aza-2'-deoxycytidine in anaplastic large cell lymphoma. Biochimie. 2012, 94(11), 2297−2307
  102. Hawes SE, Stern JE, Feng Q, Wiens LW, Rasey JS, Lu H, Kiviat NB, Vesselle H. DNA hypermethylation of tumors from non-small cell lung cancer (NSCLC) patients is associated with gender and histologic type. Lung Cancer. 2010, 69(2), 172−9.
  103. Hayashi H, Nagae G, Tsutsumi S, Kaneshiro K, Kozaki T, Kaneda A, Sugisaki H, Aburatani H. High-resolution mapping of DNA methylation in human genome using oligonucleotide tiling array. Hum Genet. 2007, 120(5), 701−711
  104. Heist R.S., Zhou W., Chirieac L.R., Cogan-Drew T., Liu G., Su L., Neuberg D., Lynch T.J., Wain J.C., Christiani D.C. MDM2 polymorphism, survival, and histology in early-stage non-small-cell lung cancer .J Clin. Oncol. 2007, 25(16), 2243−2247
  105. Hel OL van der, Bueno-de-Mesquita HB, van Gils CH, Roest M, Slothouber B, Grobbee DE, Peeters PH. Cumulative genetic defects in carcinogen metabolism may increase breast cancer risk (The Netherlands). Cancer Causes Control. 2005, 16(6), 675−681
  106. Herman J.G., Graff J.R., Myohanen S., Nelkin B.D., Baylin S.B. Methylation-specific PCR: a novel PCR assay for methylation status of CpG islands. Proc.Natl.Acad.Sci. 1996, 93,9821−9826
  107. Herranz M, Esteller M. DNA methylation and histone modifications in patients with cancer: potential prognostic and therapeutic targets. Methods Mol Biol. 2007, 361, 25−62
  108. Hesson LB, Cooper WN, Latif F. The role of RASSF1A methylation in cancer. Dis Markers. 2007, 23(1−2), 73−87
  109. Hirohashi S., Kanai Y. Cell adhesion system and human cancer morphogenesis. Cancer Sci., 2003, 94, 575−581
  110. Horn HF, Vousden KH. Coping with stress: multiple ways to activate p53. Oncogene. 2007, 26(9), 1306−1316
  111. Ho ward JH, Frolov A, Tzeng CW, Stewart A, Midzak A, Majmundar A, Godwin A, Heslin M, Bellacosa A, Arnoletti JP. Epigenetic downregulation of the DNA repair gene MED1/MBD4 in colorectal and ovarian cancer. Cancer Biol Ther. 2009, 8(1), 94−100.
  112. Hrstka R, Coates PJ, Vojtesek B. Polymorphisms in p53 and the p53 pathway: roles in cancer susceptibility and response to treatment. J Cell Mol Med. 2009,13(3), 440−453
  113. Iliopoulos D, Oikonomou P, Messinis I, Tsezou A. Correlation of promoter hypermethylation in hTERT, DAPK and MGMT genes with cervical oncogenesis progression. Oncol Rep. 2009, 22(1), 199−204
  114. Jarmalaite S, Jankevicius F, Kurgonaite K, Suziedelis K, Mutanen P, Husgafvel-Pursiainen K. Promoter hypermethylation in tumour suppressor genes shows association with stage, grade and invasiveness of bladder cancer. Oncology. 2008, 75(3−4), 145−151
  115. Jemal A., Center M.M., DeSantis C., Ward E.M. Global patterns of cancer incidence and mortality rate and trends. Cancer Epid. Biomar. Prev. 2010, 19(8), 1893−1907
  116. Ji M, Tang J, Zhao J, Xu B, Qin J, Lu J. Polymorphisms in genes involved in drug detoxification and clinical outcomes of anthracycline-based neoadjuvant chemotherapy in Chinese Han breast cancer patients. Cancer Biol Ther. 2012, 13(5), 264−271
  117. Jiang Y, Cui L, Chen WD, Shen SH, Ding LD. The prognostic role of RASSF1A promoter methylation in breast cancer: a meta-analysis of published data. PLoS One. 2012, 7(5), e36780
  118. Jiang Z, Li C, Wang X Glutathione S-transferase Ml polymorphism and bladder cancer risk: a meta-analysis involving 33 studies. Exp Biol Med (Maywood). 2011, 236(6), 723 728
  119. Juillerat A, Juillerat-Jeanneret L. S-alkylthiolation of 06-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT) to sensitize cancer cells to anticancer therapy. Expert Opin Ther Targets. 2007,11(3), 349−361
  120. Kadouri L, Kote-Jarai Z, Hubert A, Baras M, Abeliovich D, Hamburger T, Peretz T, Eeles RA. Glutathione-S-transferase Ml, T1 and PI polymorphisms, and breast cancer risk, in BRCA ½ mutation carriers. Br J Cancer. 2008, 98(12), 2006−2010
  121. Kaina B., Christmann M., Naumann S., Roos W. P. MGMT: key node in the battle against genotoxicity, carcinogenicity and apoptosis induced by alkylating agents. DNA Repair (Amst). 2007, 6(8), 1079−1099,
  122. Kim DH, Kim JS, Ji YI, Shim YM, Kim H, Han J, Park J. Hypermethylation of RASSF1A promoter is associated with the age at starting smoking and a poor prognosis in primary non-small cell lung cancer. Cancer Res. 2003, 63, 3743−3746
  123. Kim YT, Park SJ, Lee SH, Kang HJ, Hahn S, Kang CH, Sung SW, Kim JH. Prognostic implication of aberrant promoter hypermethylation of CpG islands in adenocarcinoma of the lung. J. Thorac. Cardiovasc. Surg. 2005,130(5), 1378.
  124. Kinzler K.V., Vogelstein B. Cancer-susceptibility genes. Gatekeepers and caretakers (news, comment). Nature, 1997, 386, 761−763
  125. Kioulafa M, Kaklamanis L, Mavroudis D, Georgoulias V, Lianidou ES. Prognostic significance of RASSF1A promoter methylation in operable breast cancer. Clin Biochem. 2009, 42(10−11), 970−975
  126. Ko E, Lee BB, Kim Y, Lee EJ, Cho EY, Han J, Shim YM, Park J, Kim DH. Association of RASSF1A and p63 with Poor Recurrence-Free Survival in Node-Negative Stage I-II Non-Small Cell Lung Cancer. Clin Cancer Res. 2013, 19(5), 1204−1212.
  127. Koukoura O, Sifakis S, Spandidos DA. DNA methylation in the human placenta and fetal growth (review). Mol Med Rep. 2012, 5(4), 883−889
  128. Kumar S., Walia V., Ray M., Elble R.C. p53 in breast cancer: mutation and countermeasures. Front. Biosci. 2007, 12,4168−4178
  129. Lahtz C, Pfeifer GP. J Epigenetic changes of DNA repair genes in cancer. Mol Cell Biol. 2011, 3(1), 51−58
  130. Lai JC, Cheng YW, Goan YG, Chang JT, Wu TC, Chen CY, Lee H. Promoter methylation of 0(6)-methylguanine-DNA-methyltransferase in lung cancer is regulated by p53. DNA Repair (Amst). 2008, 7(8), 1352−1363
  131. Lam TK, Ruczinski I, Helzlsouer K, Shugart YY, Li KE, Clipp S, Strickland PT, Alberg AJ. Copy number variants of GSTM1 and GSTT1 in relation to lung cancer risk in a prospective cohort study. Ann Epidemiol. 2009, 19(8), 546−552
  132. Lang A, Palmeback Wegman P, Wingren S. The significance of MDM2 SNP309 andp53 Arg72Pro in young women with breast cancer. Oncol Rep. 2009,22(3), 575−579
  133. Lavin MF, Gueven N. The complexity of p53 stabilization and activation. Cell Death Differ. 2006,13(6), 941−950
  134. Lebovic DJ, Mahmood T, Chiappori A. Lung cancer after 70: is it a different disease? Oncology (Williston Park). 2010, 24(12), 1106−11, 1114.
  135. Lees-Murdock DJ, Walsh CP. DNA methylation reprograxnming in the germ line. Epigenetics. 2008, 3(1), 5−13
  136. Lemmon M.A. and Schlessinger, J. Cell signaling by receptor tyrosine kinases. Cell 2010, 141, 1117−1134
  137. Leu JD, Wang CY, Tsai HY, Lin IF, Chen RC, Lee YJ. Involvement of p53 R72P polymorphism in the association of MDM2-SNP309 with breast cancer. Oncol Rep. 2011, 25(6), 1755−1763
  138. Li G., Zhai X., Zhang Z., Chamberlain R.M., Spitz M.R., Wei Q. MDM2 gene promoter polymorphisms and risk of lung cancer: a case-control analysis. Carcinogenesis. 2006, 27(10), 2028−2033
  139. Li L, Choi JY, Lee KM, Sung H, Park SK, Oze I, Pan KF, You WC, Chen YX, Fang JY, Matsuo K, Kim WH, Yuasa Y, Kang D. DNA methylation in peripheral blood: a potential biomarker for cancer molecular epidemiology. J Epidemiol. 2012, 22(5), 384 394
  140. Li W, Yue W, Zhang L, Zhao X, Ma L, Yang X, Zhang C, Wang Y, Gu M. Polymorphisms in GSTM1, CYP1A1, CYP2E1, and CYP2D6 are associated with susceptibility and chemotherapy response in non-small-cell lung cancer patients. Lung. 2012,190(1), 91−98
  141. Li Y, Qiu LX, Shen XK, Lv XJ, Qian XP, Song Y. A meta-analysis of TP53 codon 72 polymorphism and lung cancer risk: evidence from 15,857 subjects. Lung Cancer. J2009, 66(1), 15−21
  142. Lin J, Lu C, Stewart DJ, Gu J, Huang M, Chang DW, Lippman SM, Wu X. Systematic evaluation of apoptotic pathway gene polymorphisms and lung cancer risk. Carcinogenesis. 2012, 33(9), 1699−1706
  143. Liu L, Wu C, Wang Y, Zhong R, Duan S, Wei S, Lin S, Zhang X, Tan W, Yu D, Nie S, Miao X, Lin D. Combined effect of genetic polymorphisms in P53, P73, and MDM2 on non-small cell lung cancer survival. J Thorac Oncol. 2011, 6(11), 1793−1800
  144. Lo H.W., Ali-Osman F. Genetic polymorphism and function of glutathione S-transferases in tumor drug resistance. Curr Opin Pharmacol. 2007, 7(4), 367−374-
  145. Lo YL, Hsiao CF, Jou YS, Chang GC, Tsai YH, Su WC, Chen KY, Chen YM, Huang MS, Hsieh WS, Chen CJ, Hsiung CA. Polymorphisms of MLH1 and MSH2 genes and the risk of lung cancer among never smokers. Lung Cancer. 2011, 72(3), 280−286.
  146. Lu Q, Ma D, Zhao S. DNA methylation changes in cervical cancers. Methods Mol Biol. 2012, 863,155−176
  147. Lu S, Wang Z, Cui D, Liu H, Hao X. Glutathione S-transferase PI Ilel05Val polymorphism and breast cancer risk: a meta-analysis involving 34,658 subjects. Breast Cancer Res Treat. 2011, 125(1), 253−259
  148. Ma Y, Bian J, Cao H. MDM2 SNP309 rs2279744 Polymorphism and Gastric Cancer Risk: A Meta-Analysis. PLoS One. 2013, 8(2), e56918
  149. Malpeli G, Amato E, Dandrea M, Fumagalli C, Debattisti V, Boninsegna L, Pelosi G, Falconi M, Scarpa A. Methylation-associated down-regulation of RASSF1A and up-regulation of RASSF1C in pancreatic endocrine tumors. BMC Cancer. 2011,11, 351
  150. Margison G.P., Povey A.C., Kaina B., Santibanez Koref M.F. Variability and regulation of 06-alkylguanine-DNA alkyltransferase. Carcinogenesis. 2003, 24(4), 625−635
  151. Marsit C, Christensen B. Blood-derived DNA methylation markers of cancer risk. Adv Exp Med Biol. 2013- 754, 233−252
  152. Matakova T, Sivonova M, Halasova E, Mistuna D, Dzian A, Berzinec P, Letkova L, Dobrota D. Gene polymorphisms of biotransforming enzymes (GSTs) and their association with lung cancer in the Slovakian population. Eur J Med Res. 2009, 14(4), 275−279
  153. Meng X, Zhong J, Liu S, Murray M, Gonzalez-Angulo AM. A new hypothesis for the cancer mechanism. Cancer Metastasis Rev. 2012, 31(1−2), 247−268
  154. Minelli C, Granell R, Newson R, Rose-Zerilli MJ, Torrent M, Ring SM, Holloway JW, Shaheen SO, Henderson JA. Glutathione-S-transferase genes and asthma phenotypes: a
  155. Human Genome Epidemiology (HuGE) systematic review and meta-analysis including unpublished data. Int J Epidemiol. 2010, 39(2), 539−562
  156. Moura Gallo CV de, Azevedo E Silva Mendonca G, de Moraes E, Olivier M, Hainaut P. TP53 mutations as biomarkers for cancer epidemiology in Latin America: current knowledge and perspectives. Mutat Res. 2005, 589(3), 192−207
  157. Nebert DW, Vasiliou V. Analysis of the glutathione S-transferase (GST) gene family. Hum Genomics. 2004,1(6), 460−464
  158. Negrini S., Gorgoulis V.G. and Halazonetis T.D. Genomic instability an evolving hallmark of cancer. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2010, 11, 220−228
  159. Nehru GA, Pai R, Samuel P, Chacko AG, Chacko G. Status of 0(6) -methylguanine-DNA methyltransferase MGMT. gene promoter methylation among patients with glioblastomas from India. Neurol India. 2012, 60(5), 481−486
  160. Neto JC, Ikoma MM, Carvalho KC, Vassallo J, De Brot M, Gobbi H, Soares FA, Rocha RM. MGMT and PTEN as potential prognostic markers in breast cancer. Exp Mol Pathol. 2012, 92(1), 20−26.
  161. Neves Filho EH, Cordeiro DE, Vieira AP, Rabenhorst SH. TP53 codon 72 and intron 3 polymorphisms and mutational status in gastric cancer: an association with tumor onset and prognosis. Pathobiology. 2012, 79(6), 323−328
  162. Nii T, Marumoto T, Tani K. Roles of p53 in various biological aspects of hematopoietic stem cells. J Biomed Biotechnol. 2012,2012,903 435
  163. Palakurthy R. K., Wajapeyee N., Santra M. K., Gazin C., Lin L., Gobeil S., Green M. R. Epigenetic silencing of the RASSF1A tumor suppressor gene through HOXB3-mediated induction of DNMT3B expression. Molec. Cell. 2009, 36,219−230
  164. Palmero EI, Achatz MI, Ashton-Prolla P, Olivier M, Hainaut P. Tumor protein 53 mutations and inherited cancer: beyond Li-Fraumeni syndrome. Curr Opin Oncol. 2010, 22(1), 64−69.
  165. Park S.H., Choi J.E., Kim E.J., Jang J.S., Han H.S., Lee W.K., Kang Y.M., Park J.Y. MDM2 309T>G polymorphism and risk of lung cancer in a Korean population. Lung Cancer. 2006, 54(1), 19−24
  166. Park SK, Yim DS, Yoon KS, Choi IM, Choi JY, Yoo KY, Noh DY, Choe KJ, Ahn SH, Hirvonen A, Kang D. Combined effect of GSTM1, GSTT1, and COMT genotypes in individual breast cancer risk. Breast Cancer Res Treat. 2004, 88(1), 55−62
  167. Parl FF. Glutathione S-transferase genotypes and cancer risk. Cancer Letters. 2005, 221, 123−129
  168. Pavicic WH, Laguens M, Richard SM. Analysis association between mitochondrial genome instability and xenobiotic metabolizing genes in human breast cancer. Mol Med. 2009, 15(5−6), 160−165
  169. Pei D, Zhang Y, Zheng J. Regulation of p53: a collaboration between MDM2 and Mdmx. Oncotarget. 2012, 3(3), 228−235
  170. Peklak-Scott C, Smitherman PK, Townsend AJ, Morrow CS. Role of glutathione S-transferase Pl-1 in the cellular detoxification of cisplatin. Mol Cancer Ther. 2008, 7(10), 3247−3255
  171. Perez-Losada J, Castellanos-Martin A, Mao JH. Cancer evolution and individual susceptibility. Integr Biol (Camb). 2011, 3(4), 316−328
  172. Petitjean A, Achatz M, Borresen-Dale A. TP53 mutations in human cancers: functional selection and impact on cancer prognosis and outcomes. Oncogene 2007, 26(15), 21 572 165
  173. Pfeifer GP, Dammann R, Tommasi S. RASSF proteins. Curr Biol. 2010, 20(8), 344−345
  174. Pietsch EC, Humbey O, Murphy ME. Polymorphisms in the p53 pathway. Oncogene. 2006, 25(11), 1602−1611
  175. Proestling K, Hebar A, Pruckner N, Marton E, Vinatzer U, Schreiber M. The Pro allele of the p53 codon 72 polymorphism is associated with decreased intratumoral expression of BAX and p21, and increased breast cancer risk. PLoS One. 2012, 7(10), e47325
  176. Qiu LX, Yuan H, Yu KD, Mao C, Chen B, Zhan P, Xue K, Zhang J, Hu XC. Glutathione S-transferase Ml polymorphism and breast cancer susceptibility: a meta-analysis involving 46,281 subjects. Breast Cancer Res Treat. 2010,121(3), 703−708
  177. Raica M., Cimpean A.M. and Ribatti D. Angiogenesis in pre-malignant conditions. Eur. J. Cancer. 2009,45,1924−1934
  178. Ramakrishnan V, Kushwaha D, Koay DC, Reddy H, Mao Y, Zhou L, Ng K, Zinn P, Carter B, Chen CC. Post-transcriptional regulation of 0(6)-methylguanine-DNA methyltransferase MGMT in glioblastomas. Cancer Biomark. 2011−2012, 10(3−4), 185 193
  179. Ramalhinho AC, Fonseca-Moutinho JA, Breitenfeld Granadeiro LA. Positive association of polymorphisms in estrogen biosynthesis gene, CYP19A1, and metabolism, GST, in breast cancer susceptibility. DNA Cell Biol. 2012, 31(6), 1100−1106
  180. Ramalhinho AC, Fonseca-Moutinho JA, Breitenfeld L. Glutathione S-transferase Ml, Tl, and PI genotypes and breast cancer risk: a study in a Portuguese population. Mol Cell Biochem. 2011, 355(1−2), 265−271
  181. Rodier F, Campisi J, Bhaumik D. Two faces of p53: aging and tumor suppression. Nucleic Acids Res. 2007, 35(22), 7475−7484
  182. Ronaghi M, Shokralla S, Gharizadeh B. Pyrosequencing for discovery and analysis of DNA sequence variations. Pharmacogenomics. 2007, 8(10), 1437−1441
  183. Ross J.S., Cronin M. Whole cancer genome sequencing by next-generation methods. Am. J. Clin. Pathol. 2011, 136, 527−539
  184. Rotunno M, Lam TK, Vogt A, Bertazzi PA, Lubin JH, Caporaso NE, Landi MT. GSTM1 and GSTT1 copy numbers and mRNA expression in lung cancer. Mol Carcinog. 2012, 51(1), 142−150
  185. Sunami E, Shinozaki M, Sim MS, Nguyen SL, Vu AT, Giuliano AE, Hoon DS. Estrogen receptor and HER2/neu status affect epigenetic differences of tumor-related genes in primary breast tumors. Breast Cancer Res. 2008,10(3), 46
  186. Surekha D, Sailaja K, Rao DN, Padma T, Raghunadharao D, Vishnupriya S. Codon 72 and G13964C intron 6 polymorphisms of TP53 in relation to development and progression of breast cancer in India. Asian Pac J Cancer Prev. 2011- 12(8), 1893−1898
  187. Talmadge J.E. and Fidler IJ. AACR centennial series: the biology of cancer metastasis: historical perspective. Cancer Res. 2010, 70, 5649−5669-
  188. Tamura G. Alterations of tumor suppressor and tumor-related genes in the development and progression of gastric cancer. World J Gastroenterol. 2006,12(2), 192−198
  189. Tang D, Xu S, Zhang Q, Zhao W. The expression and clinical significance of the androgen receptor and E-cadherin in triple-negative breast cancer. Med Oncol. 2012, 29(2), 526−533.
  190. Thaler S, Schmidt M, Schad A, Sleeman JP. RASSF1A inhibits estrogen receptor alpha expression and estrogen-independent signalling: implications for breast cancer development. Oncogene. 2012, 31(47), 4912−4922.
  191. Tian Y, Hou Y, Zhou X, Cheng H, Zhou R. Tumor Suppressor RASSF1A Promoter: p53 Binding and Methylation. PLoS ONE. 2011, 6(2), el7017.
  192. Tilak AR, Kumar S, Pant MC, Mathur N, Kumar A. Polymorphism Arg72Pro of p53 confers susceptibility to squamous cell carcinoma of lungs in a North Indian population. Cell Biol. 2013, 32(2), 66−72
  193. Timofeeva M., Jager B., Rosenberg A. et al. A multiplex real-time PCR method for detection of GSTM1 and GSTT1 copy number. Clin. Biochem. 2009, 42, 500−509
  194. Tischoff I, Tannapfe A. DNA methylation in hepatocellular carcinoma. World J Gastroenterol. 2008,14(11), 1741−1748.
  195. Toledo F, Wahl GM. MDM2 and MDM4: p53 regulators as targets in anticancer therapy. Int J Biochem Cell Biol. 2007, 39(7−8), 1476−1482
  196. Tommasi S., Dammann R., Zhang Z., Wang Y., Liu L., Tsark W.M., Wilczynski S.P., Li J., You M., Pfeifer G.P. Tumor susceptibility of Rassfla knockout mice. Cancer Res. 2005,65, 92−98
  197. Toy BC, Agron E, Nigam D, Chew EY, Wong WT. Longitudinal analysis of retinal hemangioblastomatosis and visual function in ocular von Hippel-Lindau disease. Ophthalmology. 2012, 119(12), 2622−2630.
  198. Tserga A, Michalopoulos NV, Levidou G, Korkolopoulou P, Zografos G, Patsouris E, Saetta AA. Association of aberrant DNA methylation with clinicopathological features in breast cancer. Oncol Rep. 2012, 27(5), 1630−1638
  199. Verbeek B, Southgate TD, Gilham DE, Margison GP. 06-Methylguanine-DNA methyltransferase inactivation and chemotherapy. Br Med Bull. 2008, 85,17−33
  200. Vlerken LE van, Hurt EM, Hollingsworth RE. The role of epigenetic regulation in stem cell and cancer biology. JMol Med (Berl). 2012,90(7), 791−801
  201. Vogelstein B., Kinzler K. Cancer genes and the pathways they control. Nature Medicine, 2004,10, 789−799
  202. Wagner KJ, Roberts SG. Transcriptional regulation by the Wilms' tumour suppressor protein WT1. Biochem Soc Trans. 2004, 32(6), 932−935.
  203. Wang J, Wang B, Chen X, Bi J. The prognostic value of RASSF1A promoter hypermethylation in non-small cell lung carcinoma: a systematic review and metaanalysis. Carcinogenesis. 2011, 32(3), 411−416.
  204. Wang L, Luhm R, Lei M. SNP and mutation analysis. Adv Exp Med Biol. 2007, 593,105 116
  205. Wang QE, Han C, Zhang B, Sabapathy K, Wani AA. Nucleotide excision repair factor XPC enhances DNA damage-induced apoptosis by downregulating the antiapoptotic short isoform of caspase-2. Cancer Res. 2012, 72(3), 666−675.
  206. Wang X, Huang K, Xu L. Interaction among Rb/pl6, Rb/E2F1 and HDAC1 proteins in gallbladder carcinoma. J Huazhong Univ Sci Technolog Med Sci. 2009, 29(6), 729−731.
  207. Wang Y, Yang H, Li L, Wang H. Glutathione S-transferase T1 gene deletion polymorphism and lung cancer risk in Chinese population: a meta-analysis. Cancer Epidemiol. 2010, 34(5), 593−597
  208. Wang Z, Xue L, Chong T, Li H, Chen H, Wang Z. Quantitative assessment of the association between glutathione S-transferase PI Ilel05Val polymorphism and bladder cancer risk. Tumour Biol. 2013, 34(3), 1651−1657.
  209. Whibley C., Pharoah P.D., Hollstein M. p53 polymorphisms: cancer implications. Nat. Rev. Cancer. 2009, 9(2), 95−107.
  210. Wilkening S., Bermejo J.L., Hemminki K. MDM2 SNP309 and cancer risk: a combined analysis. Carcinogenesis. 2007, 28(11), 2262−2267
  211. Xu Z, Zhu H, Luk JM, Wu D, Gu D, Gong W, Tan Y, Zhou J, Tang J, Zhang Z, Wang M, Chen J. Clinical significance of SOD2 and GSTP1 gene polymorphisms in Chinese patients with gastric cancer. Cancer. 2012,118(22), 5489−5496.
  212. Yang D, Khan S, Sun Y, Hess K, Shmulevich I, Sood AK, Zhang W. Association of BRCA1 and BRCA2 mutations with survival, chemotherapy sensitivity, and gene mutator phenotype in patients with ovarian cancer. JAMA. 2011, 306(14), 1557−1565.
  213. Yang J, Xu Z, Li J, Zhang R, Zhang G, Ji H, Song B, Chen Z. XPC epigenetic silence coupled with p53 alteration has a significant impact on bladder cancer outcome. J Urol. 2010, 184(1), 336−343.
  214. Yin JY, Huang Q, Zhao YC, Zhou HH, Liu ZQ. Meta-analysis on pharmacogenetics of platinum-based chemotherapy in non small cell lung cancer (NSCLC) patients. PLoS One. 2012, 7(6), e38150
  215. Yu Y, Wu BL, Wu J, Shen Y. Exome and whole-genome sequencing as clinical tests: a transformative practice in molecular diagnostics. Clin Chem. 2012, 58(11), 1507−1509
  216. Zhang BL, Sun T, Zhang BN, Zheng S, Lu N, Xu BH, Wang X, Chen GJ, Yu DK, Lin DX. Polymorphisms of GSTP1 is associated with differences of chemotherapy response and toxicity in breast cancer. Chin Med J (Engl). 2011, 124(2), 199−204
  217. Zhang Y, Liu C. The interaction between smoking and GSTM1 variant on lung cancer in the Chinese population. Tumour Biol. 2013, 34(1), 395−401
  218. Zhang ZY, Jin XY, Wu R, Wu LN, Xing R, Yang SJ, Xie Y. Meta-analysis of the association between GSTM1 and GSTT1 gene polymorphisms and cervical cancer. Asian Pac J Cancer Prev. 2012, 13(3), 815−819
  219. Zhao E, Cui D, Yuan L, Lu W. MDM2 SNP309 polymorphism and breast cancer risk: a meta-analysis. Mol Biol Rep. 2012,39(4), 3471−3477
  220. Zheng SY, Hou JY, Zhao J, Jiang D, Ge JF, Chen S. Clinical outcomes of downregulation of E-cadherin gene expression in non-small cell lung cancer. Asian Pac J Cancer Prev. 2012, 13(4), 1557−1561.
  221. Zochbauer-Muller S., Gazdar A.F. and Minna J.D. Molecular pathogenesis of lung cancer. Annu. Rev. Physiol. 2002, 64, 681−708
Заполнить форму текущей работой

На отлично!