Сравнительное картирование избегающих инактивации генов Х-хромосомы человека на хромосомах пяти видов полевок рода Microtus: Arvicolinae, Rodentia
Х-хромосома плацентарных млекопитающих, будучи одной из самых изученных во многих аспектах хромосом, еще храпит в себе большое количество загадок. Ее организация, функционирование и эволюция неразрывно связаны с уникальным механизмом регуляции экспрессии генов — инактивацией одной из Х-хромосом у гомогаметных самок (Х-инактивацией). Несмотря на большой прогресс, достигнутый за последнее… Читать ещё >
Содержание
- СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
- ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 1. 1. Методы анализа организации эукариотического генома в изучении половых хромосом млекопитающих
- 1. 1. 1. Сравнительный анализ рутинно- и дифференциально-окрашенных хромосом и хромосомный пэйнтинг
- 1. 1. 2. Сравнительное генетическое картирование и сравнительный анализ первичной нуклеотидной последовательности
- 1. 2. Развитие представлений об эволюции половых хромосом
- 1. 3. Организация и эволюция половых хромосом млекопитающих
- 1. 3. 1. Консерватизм генного состава Х-хромосомы
- 1. 3. 2. Эволюционные страты и последовательность эволюционных изменений Х-хромосомы
- 1. 3. 3. Псевдоаутосомныс районы половых хромосом
- 1. 3. 4. Избегающие инактивации гены дифференцированных районов Х-хромосомы
- 1. 3. 5. Особенности дифференцированного района Y-хромосомы
- 1. 3. 6. Генетический и биологический диморфизм
- 1. 3. 7. Молекулярные механизмы инактивации Х-хромосомы
- 1. 4. Группа обыкновенных полевок рода Microtus
- 1. 1. Методы анализа организации эукариотического генома в изучении половых хромосом млекопитающих
- Итоги обзора литературы
- ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- 2. 1. Среды, стоковые растворы, ферменты
- 2. 2. Экспериментальные животные
- 2. 3. Микробиологические методы работы
- 2. 3. 1. Приготовление компетентных клеток E. col
- 2. 3. 2. Трансформация E. col
- 2. 4. Скрининг геномной фаговой библиотеки
- 2. 5. Методы выделения ДНК
- 2. 5. 1. Выделение плазмидной ДНК
- 2. 5. 2. Выделепис ДНК фагов
- 2. 6. Методы работы с рекомбинантной ДНК
- 2. 6. 1. Общие методы клонирования
- 2. 6. 2. Получение направленных делений
- 2. 7. Саузерн блот-гибридизация фаговых клонов
- 2. 8. Выделение тотальной РНК из органов животных и культур клеток
- 2. 9. Синтез первой цепи кДНК
- 2. 10. Полимеразная цепная реакция
- 2. 11. Флуоресцентная гибридизация in situ
- 2. 12. Определение нуклеотидной последовательности ДНК
- 2. 13. Контекстный анализ последовательности ДНК
- ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
- 3. 1. Получение зондов избегающих инактивации генов
- 3. 2. Флуоресцентная in situ гибридизация фаговых клонов на метафазнмх хромосомах пяти видов полевок
- 3. 3. Контекстный анализ нуклеотидных последовательностей фаговых клонов
- 3. 4. Анализ порядка расположения генов и возможных путей эволюции Х-хромосомы полевок группы 'arvalis'
- 3. 4. 1. Реорганизация Х-хромоеом пяти видов полевок рода Microtus
- 3. 4. 2. Сравнительный анализ Х-хромоеом полевок и других видов млекопитающих
- 3. 4. 3. Анализ расположения избегающих инактивации генов на Х-хромоеомах полевок
Сравнительное картирование избегающих инактивации генов Х-хромосомы человека на хромосомах пяти видов полевок рода Microtus: Arvicolinae, Rodentia (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Х-хромосома плацентарных млекопитающих, будучи одной из самых изученных во многих аспектах хромосом, еще храпит в себе большое количество загадок. Ее организация, функционирование и эволюция неразрывно связаны с уникальным механизмом регуляции экспрессии генов — инактивацией одной из Х-хромосом у гомогаметных самок (Х-инактивацией). Несмотря на большой прогресс, достигнутый за последнее десятилетие, в понимании того, как разворачивается комплексный процесс инактивации Х-хромосомы, ряд ключевых моментов все еще остается неясным. До сих пор пс известен конкретный механизм передачи сигнала инактивации от основного гена центра инактивации Х-хромосомы (XIC) — XIST (inactive X-chromosomc specific transcript) к ииактивируемым генам. Несмотря на то, что по данным секвспирования геномов человека и мыши для обоих видов установлена почти двукратная разница по составу LINE1 элементов в аутосомах и половых хромосомах, не получено пока никаких конкретных данных о том, каким образом п распространении сигнала инактивации участвуют LINE1 элементы.
Выявление избегающих инактивации генов у плацентарных млекопитающих привело к выводу, что Х-ииактивация пс носит, как предполагали раньше, тотального характера. Эти данные добавили новые акценты в картину эволюции половых хромосом и изучение моноаллельной экспрессии генов Х-хромосомы. Анализ регуляторпых областей избегающих инактивации генов и генов, подверженных ей, показал, что на данный момент не представляется возможным идентифицировать ген как избегающий инактивации, либо инактивирусмый на основе последовательностей промоторов генов. Эволюционные изменения структурной организации Х-хромосомы могут вести к изменению функциональных параметров ее генов, в том числе и статуса экспрессии генов на неактивной X-хромосоме. Однако конкретные факторы, влияющие на это, не установлены.
Для многих видов плацентарных млекопитающих характерна структура X-хромосомы человека. Являясь самой изученной не только в плане состава и порядка расположения генов, но и их транскрипционных характеристик, X-хромосома человека служит своеобразным стандартом для сравнения с X-хромосомами других видов. Второй по изученности является Х-хромосома мыши, которая имеет шансы оказаться самой перестроенной среди Х-хромосом плацентарных. По последним данным эти виды также значительно различаются по количеству гепов, избегающих инактивации. Однако не известно, насколько псрсстроенпость Х-хромосомы мыши или различие в морфологии Х-хромосом человека и мыши ответственны за отличия в статусе инактивации генов у этих видов. Поэтому необходимо привлечение новых видов в координированные исследования по изменению структурной организации Х-хромосомы и регуляции экспрессии ее генов.
Секвенирование полных геномов человека и мыши лишь оформило в некие рамки всю невообразимую сложность организации геномов высших организмов. Можно предположить, что в ближайшем будущем внимание исследователей в области сравнительной геномики будет сконцентрировано па изменениях в ipynnax близкородственных видов. Комбинация данных по локализации генов, их хромосомному окружению, нуклеотидиым последовательностям и транскрипционной информации в группах родственных видов позволит установить факторы, ответственные за тот или иной. механизм регуляции и исключительно детально проследить эволюцию регуляториых элементов генома.
В представляемой работе мы использовали группу обыкновенных полевок ('arvalis") рода Microtus, состоящую из четырех близкородственных видов, и один вид из наиболее близкой к ним группы 'agrestis' для изучения эволюционных преобразований их Х-хромосом с помощью сравнительного картирования методом флуоресцентной in situ гибридизации (FISH) на мстафазных хромоосмах. Для сравнительного картирования Х-хромосом полевок были выбраны гены, избегающие инактивации на неактивной Х-хромосоме человека и, в некоторых случаях, мыши. Картирование этих генов позволяет установить соответствие по порядку генов структуры эухроматиновых районов Х-хромосом полевок базовой структуре хромосомы человека, либо перестроенных хромосом более близких мышевидных родственников (мышь, крыса, некоторые другие грызуны) и оценить в сравнении с ними распределение в Х-хромосомах кластеров или районов, обогащенных избегающими инактивации генами.
Цели и задачи исследования. Цель данной работы — выявление степени и характера реорганизации Х-хромосом пяти близкородственных видов полевок (род Microtus) в сравнении с Х-хромосомами человека и мышевидных грызунов. Для достижения цели были поставлены следующие конкретные задачи:
1. Получить зонды генов, избегающих Х-инактивации у человека и мыши.
2. Выделить геномные клопы полевок, содержащие ортологи избегающих инактивации генов человека и мыши.
3. Осуществить с помощью FISH локализацию клонов полевок, содержащих гены, ортологичные избегающим инактивации генам человека и мыши, на метафазпые хромосомы полевок M. rossiaemeridionalis, M. arvalis, M. kirgisorum, M. transcaspicus и M.agrestis.
4. Проанализировать порядок расположения генов на Х-хромосомах пяти видов полевок и определить предковый для группы 'arvalis' тип хромосомы.
5. Провести сравнение порядка генов предковой Х-хромосомы обыкновенных полевок с порядком генов Х-хромосом человека и мышевидных грызунов (мыши, крысы). Проанализировать распределение избегающих X-инактивации генов па хромосомах этих видов.
Научная новизна. Впервые на хромосомах пяти видов полевок рода Microtus локализованы восемь избегающих Х-инактивации у человека генов Eif4c, Rab9, Zfx, Crsp2, Utxl, Xel69, Sbl.8, Napll3, и два гена второго псевдоаутосомпого района человека Sybil и Spry3. Сравнительный анализ локализации десяти новых и пяти картированных ранее генов у обыкновенных полевок позволил выявить новые перестройки и уточнить границы определенных ранее инверсий, имевших место в ходе эволюции Х-хромосом полевок. Впервые установлено, что по порядку генов Х-хромосомы M. kirgisorum и M. arvalis наиболее близки к предковому для группы 'arvalis' типу Х-хромосомы. Впервые проведено сравнение порядка генов на X-хромосомах обыкновенных нолевок с порядком генов на Х-хромосомах мыши, крысы, других грызунов. Выведена предковая Х-хромосома семейства Muridae и предложена схема возможных перестроек, разделивших Х-хромосомы человека, полевок и крысы.
Практическая ценность. Полученные в работе результаты лягут в основу для изучения статуса Х-ипактивации картированных генов и механизма осуществления регуляции экспрессии этих генов. Проведенный анализ предоставил дополнительную информацию о консервативных кластерах на X-хромосоме, и позволил более точно оценить степень реорганизации Х-хромосомы у близкородственных видов полевок, что в целом, вносит вклад в понимание закономерностей эволюции половых хромосом и всего генома.
Апробация равоты. Материалы диссертации были представлены на 6-ой Путинской школе-конференции молодых ученых «Биология — наука XXI века», Пушимо, 2002, Международном симпозиуме по проблемам мейоза, Санкг-Пстсрбург, 2003, семинарах и отчетных сессиях Института цитологии и генетики СО РАН.
Публикации. По материалам диссертации автором опубликовано две научные статьи в отечественной и зарубежной печати.
Вклад автора. Основная часть экспериментальных работ и анализ полученных данных проводился автором самостоятельно. Л. Кэррол (UMMS, Worcester, USA), М. Матараззо (IGB, Naples, Italy) и С. Павловой были выбраны и предоставлены праймеры для части генов. Скрининг геномной библиотеки, анализ полученных клопов, их субклопирование и частичное секвенировапис проводились совместно с А. И. Шевченко. Препараты для FISH получены II.B. Рубцовой. Основная часть гибридизационпых in situ экспериментов проведена II.A. Мазурок. Совместно с Н. А. Мазурок автором проводилась обработка данных FISII экспериментов. Контекстный анализ нуклеотидных последовательностей проводился совместно с Е. А. Елисафенко.
ВЫВОДЫ.
1. Выделены и ееквенировапы последовательности различных структурных элементов (экзоны, интропы, нетраислируемыс участки) 9 генов полевки M. rossiaemeridionalis: Eif4c, Zfx, Rab9, Crsp2, Utxl, Sbl.8, Napll3, Sybil, Spry3 и inlHst6st2. Степень гомологии сиквенсов кодирующих районов полевки с соответствующими районами генов человека и мыши в среднем составляет 96% по пуклеотидпым и 95.3% по аминокислотным последовательностям, некодирующих районов — в среднем 73% гомологии с последовательностями мыши.
2. Впервые установлена локализация 9 генов: Eif4c, Zfx, Rab9, Crsp2, Utxl, Sbl.8, Napll3, Sybil, Spry3 и молекулярного маркера inlHst2 в Х-хромосомах пяти видов полевок рода Microtus. Локализация гена Хе169 определена в районе Хр3.5 Х-хромосомы M.agrestis.
3. На основе сравнительного анализа локализации 14 генов и одного молекулярного маркера в Х-хромосомах четырех видов полевок группы 'arvalis' выявлены четыре новые инверсии и уточнены границы двух определенных рапсе инверсий. Выявлено 7 кластеров консервативной сиитснии в Х-хромосомах обыкновенных полевок.
4. Сравнительным анализом порядка генов Х-хромосомы M. agrestis показано, что хромосомы M. arvalis и M. kirgisorum являются наиболее близкими к предковой Х-хромосоме группы 'arvalis': от Х-хромосомы M. agrestis хромосомы M. arvalis и M. kirgisorum отделяют две или три инверсии и хромосомы M. transcaspicus и M. rossiaemeridionalis — четыре инверсии.
5. Па основе сравнительного анализа структуры Х-хромосом мышевидных грызунов и человека выведена нредковая Х-хромосома семейства Muridae и предложена схема возможных перестроек, разделивших порядок генов X-хромосом человека, полевок и крысы.
6. Установлено, что изменение расположения ортологов избегающих X-инактивации генов человека у полевок и мыши происходили независимо относительно их расположения па предковой хромосоме приматов и грызунов. Общим и отличным свойством Х-хромосом пяти близкородственных видов полевок и мыши является то, что центр инактивации Xic не отделен центромерой от районов, обогащенных ортологами избегающих X-ииактивации генов человека.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
.
Картирование и ссквенирование геномов различных организмов позволяет попять степень консервативности и динамичности геномной организации. Разнообразие экологических, морфологических и генетических характеристик современных видов млекопитающих представляет практически неисчерпаемый материал для изучения видообразования, возникновения адаптивных особенностей, молекулярной эволюции и геномной организации и других направлений (O'Brien ct al., 1999). Изучение функции генов, регуляции их экспрессии и комплексных взаимодействий всех элементов генома у разных видов необходимо для понимания процессов филогенетического и онтогенетического развития организмов.
Представленная работа направлена на решение фундаментальных проблем, связанных с эволюцией, структурно-функциональной организацией и феноменом инактивации Х-хромосомы. Половые хромосомы по многим параметрам являются уникальными в системе комплемента млекопитающих. Сложная картина эволюции половых хромосом висела свои вопросы в проблему координации и взаимосвязи эволюционных изменений на разных уровнях: уровне кодирующих последовательностей генов и их взаиморасположения в хромосоме и уровнях регуляторпых генетических и эпигенетических факторов. Привлечение в сравнительные исследования Х-хромосомы новых видов поможет ответить на некоторые актуальные па современном этапе вопросы: вызывает ли изменение положения генов в Х-хромосомс изменение статуса их экспрессии на неактивной Х-хромосомекакие генетические и эпигенетические факторы необходимы для изменения статуса экспрессии геновкакова роль гетерохроматиновых блоков в распространении инактивациив чем состоит существенное различие между конденсированным состоянием конститутивного и факультативного гстерохроматина Х-хромосомы?
Выбор модельного объекта для привлечения в сравнительные исследования Х-хромосомы будет определять степень успешности при ответе на эти вопросы. Пять близкородственных видов полевок рода Microtus — M. rossiaemeridionalis, M. arvalis, M. kirgisorum, M. transcaspicus и M. agrestis — имеют отличные по размеру и морфологии Х-хромосомы, и были выбраны нами для изучения эволюционных преобразований их Х-хромосом с помощью сравнительного картирования метолом флуоресцентной in situ гибридизации на метафазных хромосомах. Для картирования Х-хромосом полевок были выбраны гены с известными характеристиками статуса транскрипции (в основном гены, избегающие X-ннактивации) па неактивной Х-хромосоме человека и, в некоторых случаях, мыши. В качестве аупруппы был привлечен вид M. agrestis из наиболее близкой к обыкновенным полевкам группы 'agrestis'.
Скрининг геномной библиотеки M. rossiaemeridionalis и последующее частичное секвенировапие фаговых клонов, выявивших уникальные сигналы FISH на Х-хромосомах пяти видов полевок рода Microtus, позволили установить локализацию 9 генов: Eif4c, Zfx, Rab9, Crsp2, Utxl, Sbl.8, Napll3, Sybil, Spry3 и одного молекулярного маркера inlllst2 на их Х-хромосомах. Локализация гена Хе169 установлена в районе Хр3.5 Х-хромосомы M. agrestis, где также картирован ген Sbl.8. Поскольку эти два гена и у человека, и у мыши находятся в небольшом кластере размером около 370тпп, и у всех 5 видов полевок район локализации Sbl.8 выглядит практически идентично, сделано предположение о высокой вероятности солокализации генов Хе169 и Sbl.8 и в Х-хромосомах полевок группы 'arvalis'.
Удачный выбор генов для картирования Х-хромосом полевок позволил получить интересную уточняющую информацию. Анализ расположения десяти новых генных. маркеров, ияти локализованных ранее генов и четырех районспецифичсских библиотек на Х-хромосомах полевок группы 'arvalis' позволил выявить четыре дополнительные инверсии и уточнить границы двух определенных ранее инверсий в группе 'arvalis'. Впервые установлено количество предполагаемых инверсий, разделивших Х-хромосомы полевок группы 'arvalis' и M.agrestis. Это позволило прийти к выводу, что X-хромосомьг M. kirgisorum и М. arvalis являются более близкими к предковой форме Х-хромосомы ipynni. i 'arvalis'. Поскольку ранее более близкими к предковому кариогииу фуппы 'an'alis' считались кариотипы M. rossiaemeridionalis и M. transcaspicus, этот вывод приводит к заключению, что, либо темпы перестроек аутосом и половых хромосом в группе не совпадают, либо предковый кариотип группы значительно отличается от гипотетического предкового кариотипа, предложенного ранее для семейства.
Arvicolidae. Проведение сравнительного хромосомного пэйнтинга у представителей разных групп рода Micriotus могло бы прояснить ситуацию. Анализ реорганизации Х-хромосомы в группе 'ar>alis' подтвердил вывод, сделанный на основе других цитогепетичсских данных, об объединении М. transcaspicus и M. rossiaemeridionalis в общую эволюционную линию (Mazurok et al., 2001). Паши данные органично дополняют спектр имеющейся на сегодня зоологической, цитогснстичсской и молекулярной информации о полевках группы 'arvalis', и заставляют более внимательно отнестись к несовпадению для группы филогенетических построений при разных подходах (Mazurok et al., 2001; Shevchenko et al., 2002; Малыгин, Луиш Паптслсйчук, 2003). На наш взгляд одной из самых интересных и перспективных гипотез является предположение об осуществлении в прошлом гибридизации между симнатричсскими видами M. arvalis и M.rossiaemeridionalis.
Картирование 10 новых генов на Х-хромосомах пяти близкородственных видов полевок позволило более точно соотнести порядок гепов эухроматиновых районов Х-хромосом полевок с порядком генов на базовой Х-хромосоме человека и перестроенных хромосомах представителей семейства Muridae и предложить схему возможных перестроек, разделивших Х-хромосомы человека, обыкновенных полевок и некоторых мышевидных грызунов. Х-хромосомы полевок, в целом, перестроены в меньшей степени, чем Х-хромосома мыши, по по крайней мерс три вида — M. rossiaemeridionalis, M. transcaspicus и M. agrestis имеют значительно перестроенные Х-хромосомы и характеризуются наличием инверсий, уникальных для каждого вида. Поскольку по взаиморасположению генов Napll3 и Gla не удалось определить, у каких видов полевок M. kirgisorum, M. arvalis или M. agrestis произошли перестройки в этом районе по сравнению с предковой хромосомой группы 'arvalis', локализация большего количества генов на этом участке у полевок могла бы ответить на этот вопрос.
Семь картированных в нашей работе генов (Eif4c, Zfx, Utxl, Sbl.8, Crsp2, Rab9, Xel69) представляют гены короткого плеча Х-хромосомы человека, обогащенного избегающими Х-ипактивании генами. Проведенный сравнительный анализ реорганизации Х-хромосомы у мышевидных грызунов позволяет прийти к выводу о том, что по отношению к положению избегающих Х-ипактивации генов человека в иредковой Х-хромосоме приматов и грызунов, изменения в расположении их ортологов у полевок и мыши происходили независимо. На X-хромосомах пяти исследованных видов полевок представлен довольно широкий спектр вариантов взаиморасположения ортологов избегающих Х-инактивации генов человека с одной стороны и центра инактивации Xic, центромер и блоков С-гетерохроматипа с другой. Общим и отличным свойством Х-хромосом пяти близкородственных видов полевок и мыши является то, что центр инактивации Xic, содержащий геи Xist, не отделен центромерой от района обогащенного генами, избегающими Х-инактивации у человека. Положение гена Napll3 (одного из немногих генов большого плеча Х-хромосомы человека, избегающих X-инактивации) на Х-хромосомс M. kirgisorum может оказаться сходным с его расположением у человека, но отношению к гену Xist. Поэтому изучение его экспрессии у полевок является исключительно интересным. Кластер генов Sbl.8 и Хе169, детально охарактеризованный у человека и мыши и имеющий отличия в статусе Х-инактивации входящих п него генов, также заслуживает пристального внимания.
Анализ реорганизации Х-хромосом пяти исследованных видов полевок, а также ряда других грызунов (в частности, Сирийского хомячка и Индийской игольчатой мыши) выявил довольно распространенные перестройки в районе гена Xist у мышевидных грызунов. На наш взгляд, это свидетельствует о том, что, либо такие преобразования не критичны для системы Х-инактивации, либо нарушения каким-то образом компенсируются у разных видов. Реорганизация Х-хромосом грызунов также может отражать более гомогенный профиль инактивации их X-хромосом (но типу мыши). С другой стороны, перестройки в районе гена Xist и в целом, но хромосоме могут вызывать возникновение у особей специфическиех отличий, которые, в свою очередь, могут способствовать обособлению нового вида.
Анализ литературных данных позволяет прийти к выводу об иерархичности задействованных в инактивации Х-хромосомы механизмов. Эти механизмы могут включать факторы уникальные для каждого индивидуального гена, а также факторы, координировано контролирующие экспрессию гепов в пределах доменов Х-хромосомы, и комбинацию этих факторов. Данные, полученные на Х-хромосомс человека, указывают на то, что рефляция избегания инактивации возможна на доменном уровне (Carrel et al., 1999; Miller, Willard, 1998; Tsuchiya,. Willard, 2000). I la основе последовательностей промоторов генов в настоящий момент идентифицировать ген как избегающий инакгивации или подверженный ей не представляется возможным. Не получено пока и конкретных данных о том, каким образом в распространении сигнала инактивации участвуют LINE-1 элементы.
Выделенные в ходе скрининга геномной библиотеки M. rossiaemeridionalis фаговые клопы, содержащие фрагменты картированных генов позволят в дальнейшем определить последовательность и структуру интересующего гена и его регуляторных областей. Эти данные, дополненные известной для четырех видов обыкновенных полевок структурой гена Xist, ответственного за распространение инактивации по Х-хромосоме (Nesterova et al., 2001), помогут установить дополнительные факторы, объясняющие механизм передачи сигнала инактивации от основного гена центра инактивации к инактивируемым генам.
Выбранная нами для изучения эволюции Х-хромосомы группа близкородственных видов обыкновенных полевок, несмотря на свой эволюционно молодой возраст, характеризуется значительной степенью дивергенции кариотипов входящих в нее видов. Высокий темп эволюции установлен в целом у арвиколип и на уровне последовательности ДИК (Britten, 1986; Catzeflis et al., 1987). Эти свойства делают группу видов обыкновенных полевок особенно привлекательной для изучения целого ряда вопросов, связанных с эволюцией хромосом, механизмами хромосомных перестроек, эволюцией механизмов регуляции экспрессии генов и регуляторных элементов.
Таким образом, полученные в работе результаты создали основу для изучения статуса Х-инактивации картированных генов и поиска механизмов регуляции их экспрессии.
Список литературы
- Лхвердян М.Р. Особенности поведения половых хромосом в мейозе у серого хомячка (Cricetulus Migratorius Pallas, 1770) // Генетика. 1993. Т. 29. №. 6. С. 950−957.
- Бородин П.М., Саблина О. В., Закиян С. М., Нестерова Т. Е., Мейер М. Н. Морфология и поведение в мейозе половых хромосом у четырех видов полевок рода Microtus // Генетика. 1991. Т. 27. №. 6. С. 1059−1065.
- Гершензон С.М. Основы современной генетики. Киев: Наук, думка. 1991. 111с.
- Графодатский А.С., Раджабли С. И. Хромосомы сельскохозяйственных и лабораторных млекопитающих. Новосибирск: Наука. 1988. 128с.
- Малыгин В.М., Луиш Пантелейчук Т.М. Эффективное!" механизмов репродуктивной изоляции у шести видов обыкновенных полевок (Microtus, Rodentia) // Сборник научных трудов «Проблемы эволюции». Владивосток: Дальнаука. 2003. 304с.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сомбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. Москва: Мир. 1984. 397с.
- Мейер М.Н., Раджабли С. И., Булатова Н.Ш, Голенищев Ф. Н. Кариологичсскис особенности и вероятные родственные связи полевок группы «arvalis» (Rodcntia, Cricetidac) // Зоол. журн. 1985. Т. 64. С. 417−428.
- Мейер М.Н., Голенищев Ф. Н., Радэ/сабли С.И., Саблина О. Л. Серые полевки фауны России и сопредельных территорий. Санкт-Петербург: Труды Зоологического института. 1996. Т. 232. 320с.
- Нестерова Т.Е., Закиян С. М. Инактивация Х-хромосомы у млекопитающих // Генетика. 1994. Т. 30. №. 3. С. 293−317.
- Орлов D. IL, Булатова Н. Ш. Сравнительная цитогенетика и кариосисгематика млекопитающих. Москва: Наука. 1983. 405с.
- Adkins R.M., Gelke E.L., Roue D., Honeycutt R.L. Molecular phylogeny and divergence time estimates for major rodent groups: evidence from multiple genes // Mol. Biol. Evol. 2001. V. 18.№. 5. P. 777−791.
- Adler D.A., Bressler S.L., Chapman V.M., Page D.C., Disteche CM. Inactivation of the Zfx gene on the mouse X chromosome. // Proc Natl Acad Sci USA. 1991. V. 88. №. 11. P. 4592−4595.
- Agulnik A.I., Mitchell M.J., Mattel M.G., Borsani G., Avner P.A., Lerner J.L., Bishop C.E. A novel X gene with a widely transcribed Y-linkcd homologue escapes X-inactivation in mouse and human // Hum Mol Genet. 1994. V.6. P.879−884.
- Amar L.C., Danadalo L., Hanauer A., et al. Conservation and reorganization of loci on the mammalian X chromosome: A molecular framework for the identification of homologous subchromosomal regions in man and mouse. // Genomics. 1988. V. 22. P. 220−230.
- Anderson C.L., Brown C.J. Polymorphic X-chromosomc inactivation of the human T1MP1 gene // Am J Hum Genet. 1999. V. 65. №. 3. P. 699−708.
- Arnason U., Adegoke J.A., Bodin K., Born E.W., Esa Y.B., Gullberg A., Nilsson M., Short R.V., Xu X, Janke A. Mammalian mitogenomic relationships and the root of the euthcrian tree // PNAS. 2002. V. 99. №. 12. P. 8151 -8156.
- Ashley Т., Fredga K. The curious normality of the synaptic association between the sex chromosomes of two arvicoline rodents: Microtus oeconomus and Clcthrionomys glarcolus // Hercditas. 1994. V. 120. P. 105−111.
- Ashley Т., Jaarola M" Fredga K. The behavior during pachynema of a normal and an inverted Y chromosome in Microtus agrestis // Hcreditas. 1989. V. 111. №. 3. P. 281−294.
- Ashley Т., Moses M.J., Solari A.J. Fine structure and behaviour of a pericentric inversion in the sand rat, Psammomys obesus // J Cell Sci. 1981. V. 50. P. 105−119.
- Ashworth A., Rcistan S., Lovell-Badge R., Kay G. X-chromosomc inactivation may explain the difference in viability of XO humans and mice // Nature. 1991. V. 351. №. 6325. P. 406−408.
- Avner P., Heard E. X-chromosomc inactivation: counting, choice and initiation // Nat Rev Genet. 2001. V. 2. №. 1. P. 59−67.
- Bailey J.A., Gu Z., Clark R.A., Reinert K., Samonte R.V., et al. Recent segmental duplications in the human genome // Scicncc. 2002. V. 297. №. 5583. P. 945−947.
- Ballabio A., Willard H.F. Mammalian X-chromosome inactivation and the XIST gene // Curr Opin Genet Dev. 1992. V. 2. №. 3. P. 439−447.
- Band M.R., Larson J.II., Rebeiz M., et al. An ordered comparative map of the cattlc and human genomes // Genome Res. 2000. V. 10. P. 1359−1368.
- Bartolomei M.S., Zemel S., Tilghntan S.M. Parental imprinting of the mouse H19 gene//Nature. 1991. V. 351. №. 6322. P. 153−155.
- Bashaw G.J., Baker B.S. Dosage compensation and chromatin structure in Drosophila // Curr Opin Genet Dev. 1996. V. 6. №. 4. P. 496−501.
- Berend S.A. Ilale D.W. Engstrom M.D. and Greenbaum I.F. Cytogenetics of collarcd lemmings (Dicrostonyx groenlandicus). I. Mciotic behavior and evolution of the nco-XY sex-chromosome system // Cytogcnct Cell Genet. 1997. V. 79. P. 288−292.
- Blair H.J., Reed V., Laval S.H., Boyd Y. New insights into the man-mouse comparative map of the X chromosome// Genomics. 1994. V. 19. P. 215−220.
- Boyd Y., Blair 11. J., Cunliffe P., Masson W.K., Reed V. A phenotypc map of the mouse X chromosome: models for human X-linked disease // Genome Res. 2000. V. 10. №. 3. P. 277−292.
- Britten R.J. Rates of DNA sequence evolution differ between taxonomic groups // Science. 1986. V. 231. P. 1393−1398.
- Brockdorff N. X-chromosome inactivation: closing in on proteins that bind Xist RNA // Trends Genet. 2002. V. 18. №. 7. P. 352−358.
- Brown C.J., Ballabio A., Rupert J.L., Lafreniere R.G., Grompe M" Tonlorenzi R., Willard H.F. A gene from the region of the human X inactivation ccntrc isexpressed exclusively from the inactive X chromosome // Nature. 1991. V. 349. №. 6304. P. 38−44.
- Brown C.J., Carrel L., Willard H.F. Expression of genes from the human active and inactive X chromosomes // Am J Hum Genet. 1997. V. 60. №. 6. P. 1333−1343.
- Brown C.J., Willard H.F. Noninactivation of a selectable human X-Iinked gene that complements a murine temperature-sensitive cell cycle defect // Am J Hum Genet. 1989. V. 45. №. 4. P. 592−598.
- Bull J.J. Evolution of sex determining mechanisms (Benjamin Cummings, Menlo Park, CA). 1983.
- Carrel L., Cottle A.A., Goglin K.C., Willard H.F. A first-generation X-inactivation profile of the human X chromosome // Proc Natl Acad Sci USA. 1999. V. 96. №. 25. P. 14 440−1444.
- Carrel L., Willard H.F. Heterogeneous gene expression from the inactive X chromosome: an X-linked gene that escapes X inactivation in some human cell lines but is inactivated in others // Proc Natl Acad Sci USA. 1999. V. 96. №. 13. P. 7364−7369.
- Carver E.A., Stubbs L. Zooming in on the human-mouse comparative map: genome conservation re-examined on a high-resolution scale // Genome Res. 1997. V. 7. №. 12. P. 1123−1137.
- Cattanach B.M., Pollard C.E., Perez J.N. Controlling elements in the mouse X-chromosome. I. Interaction with the X-linkcd genes. Genet Res. 1969 Dec- 14(3): 223−35.
- Cattanach B.M., Beechey C.V. Autosomal and X-chromosome imprinting // Dev Suppl. 1990. P. 63−72.
- Catzejlis F.M., Sheldon F.H., Ahlquist J.E., Sibley C.G. DNA-DNA hybridization evidence of the rapid rate of muroid rodent DNA evolution // Mol Biol Evol. 1987. V. 4. P. 242−253.
- Cavagna P., Stone G., Stanyon R. Black rat (Rattus rattus) genomic variability characterized by chromosome painting // Mamm Genome. 2002. V. 13. P. 157−163.
- Choline J., Graf J.-D. Phylogeny of the Arvicolidae (Rodcntia): biochemical and palcontological evidence//J. Mammal. 1988. V. 69. P. 22−33.
- Chandra H.S. Is human X chromosomc inactivation a scx-dctcrmining dcvice? // Proc Natl Acad Sci USA. 1985. V. 82. №. 20. P. 6947−6949.
- Charchar F. J, Svartman M., El-Mogharbel N., etn al. Complex events in the evolution of the human pscudoautosomal region 2 (PAR2) // Genome Research. 2003. V. 13. P. 281−286.
- Charlesworth B. The evolution of sex chromosomes // Science. 1991. V. 251. №. 4997. P. 1030−1033.
- Charlesworth B. The evolution of chromosomal sex determination and dosage compensation // Curr Biol. 1996. V.l.№. 6. P. 149−162.
- Chomczynski P., Sacchi N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction // Anal Biochcm. 1987. V. 162. №. 1. P. 156−159.
- Ciccodicola A., D’Esposito M., Esposito Т., Gianfrancesco F., et al. Differentially regulated and evolved genes in the fully sequenced Xq/Yq pscudoautosomal region // Hum. Mol. Genet. 2000. V. 9. №. 3. P. 395−401.
- Cline T.W., Meyer B.J. Vive la difference: males vs females in flies vs worms // Annu Rev Genet. 1996. V. 30. P. 637−702.
- Clumg C.T. et al. II Biochemistry. 1989. V.86. P. 2172−2175.
- Cooper D.W., Johnston P.G., Watson J.M., Graves J.A.M. X-inactivation in marsupials and monotrcmes//Dev Biol. 1993. V. 4. P. 117−128
- Cremer Т., Lichter P., Borden J., Ward D.C., Manuelidis L. Detection of chromosome aberrations in metaphase and interphase tumor cells by in situ hybridization using chromosome-specific library probes // Hum Genet. 1988. V. 80. №. 3. P. 235−246.
- Csankovszki G., Nagy A., Jaenisch R. Synergism of Xist RNA, DNA mcthylation, and histone hypoacetylation in maintaining X chromosomc inactivation // J Cell Biol. 2001. V. 153. №. 4. P. 773−784.
- D’Erchia A.M., Gissi C" Pesole G., Saccone C., Arnason U. The guinea pig is not a rodent // Nature. 1996. V.381 P.597−599.
- Davisson M.T. X-linkcd genetic homologies between mouse and man // Genomics. 1987. V. 1. №. 3. P. 213−227.
- DeBry R. W., Seldin M.F. Human/mouse homology relationships // Genomics. 1996. V. 33. P. 337−351.
- Delbridge M.L., Ma K., Subbarao M.N., Cooke H.J., Bhasin S., Graves J.A. Evolution of mammalian HNRPG and its relationship with the putative azoospermia factor RBM // Mamm Genome. 1998. V. 9. №. 2. P. 168−170.
- D’Esposito M., Matarazzo M.R., Ciccodicola A., et ai Differential expression pattern of XqPAR-linked genes SYBL1 and IL9R correlates with the structure and evolution of the region. // Hum Mol Genet. 1997. V. 6. N 11. P. 1917−1923.
- Dinulos M.B., Bassi M.T., Rugarli E.I., Chapman V., Ballabio A., Disteche С.М. A new region of conservation is defined between human and mouse X chromosomes // Genomics. 1996. V. 35. №. 1. P. 244−247.
- Disteche C.M., Zacksenhaus E., Adler D.A., Bressler S.L., Kcitz B.T., Chapman V.M. Mapping and expression of the ubiquitin-activating enzyme El (Ubel) gene in the mouse // Mamm Genome. 1992. V.3. N.3. P. 156−161.
- Disteche C.M., Brannan C.I., Larsen A., Adler D.A., Schorderet D.F., Gearing D., Copeland N.G., Jenkins N.A., Park L.S. The human pseudoautosomal GM-CSF receptor alpha subunit gene is autosomal in mouse // Nat Genet. 1992. V.l. N.5. P.333−336.
- Disteche C.M. Escape from X inactivation in human and mouse // Trends Genet. 1995. V. 11. №. l.P. 17−22.
- Disteche C.M. Escapees on the X chromosome И Proc Natl Acad Sci USA. 1999. V. 96. P. 14 180−14 182.
- Disteche C.M., Filippova G.N., Tsuchiya K.D. Escape from X inactivation // Cytogcnct Genome Res. 2002. V. 99. №. 1−4. P. 36−43.
- Eichler E.E. Recent duplication, domain accretion and the dynamic mutation of the human genome // Trends Genet. 2001. V. 17. P. 661−669.
- Ellison J.W., Li X., Francke U., Shapiro L.J. Rapid evolution of human pseudoautosomal genes and their mouse homologs // Mamm Genome. 1996. V. 7. №. 1. P. 25−30.
- Ellison J. IV., Salido E.C., Shapiro L.J. Genetic mapping of the adenine nucleotide translocasc-2 gene (Ant2) to the mouse proximal X chromosome // Genomics. 1996. V. 36. №.2. P. 369−371.
- Everts R.E., van Wolferen M.E., Versteeg S.A., Zijlstra C., Engelen J.J., Bosnia Л.Л., Rothuizen J., van Oost B.A. A radiation hybrid map of the X-chromosomc of the dog (Canis familiaris) II Cytogenet. Cell Genet. 2002. V.98. P.86−92.
- Fisher R.A. II Am. Nat. 1935. V. 69. P. 446.
- Foster J.W., Graves J.A. An SRY-rclatcd sequence on the marsupial X chromosome: implications for the evolution of the mammalian tcstis-determining gene// Proc Natl Acad Sci USA. 1994. V. 91. №. 5. P. 1927−1931.1.
- Franco В., Guioli S., Pragliola A., et al. A gene deleted in kallmann’s syndrome shares homology with neural cell adhesion and axonal path-finding molcculcs // Nature. 1991. V. 353. P. 529−536.
- Fredga K. Aberrant sex chromosome mechanisms in mammals // Evolutionary aspccts. Differentiation. 1983. V. 23. P. 23−30.
- Fredga K., Santensson B. Male mciosis in the Syrian, Chinese and European hamsters // Hcrcditas. 1964. V. 52. №. 1. P. 36−48.
- Fridolfsson A.K., Cheng H., Copeland N.G., et al. Evolution of the avian sex chromosomes from an ancestral pair of autosomes // Proc Natl Acad Sci USA. 1998. V. 95. №. 14. P. 8147−8152.
- Fronicke L., Wienberg J. Comparative chromosome painting defines the high rate of karyotype changes between pigs and bovids // Mamm Genome. 2001. V. 12. №. 6. P. 442−449.
- Gianfrancesco F., Sanges R., Esposito Т., et al. Differential divergence of three human pseudoautosomal genes and their mouse homologs: implications for sex chromosome evolution//Genome Res. 2001. V. 11.№. 12. P. 2095−2100.
- Golenishchev F.N., Meyer M.N., Bulatova N.Sh. The hybrid zone between two karyomorphs of Microtus arvalis (Rodentia, Arvicolinae) // Proceedings of the Zoological Institute RAS, 2001. V.289. P. 89−94.
- Goodfellow P., Banting G., Sheer D., Ropers H.H., Caine A., Ferguson-Smith M.A., Povey S., Voss R. Genetic evidence that a Y-linkcd gene in man is homologous to a gene on the X chromosome // Nature. 1983. V. 302. №. 5906. P. 346−349.
- Graphodatsky A., Perelman P., Alkalaeva E., Trifonov V., et al. Karyotype evolution in mammals: a reappraisal by comparative chromosome painting // Proceedings third int conf BGRS. 2002. V. 4. P. 78.
- Graphodatsky A.S. Conserved and variable elements of mammalian chromosomes // In Hainan CRE (ed). Cytogenetics of Animals. 1989. P. 95−123.
- Graves J.A. The evolution of mammalian sex chromosomes and the origin of sex determining genes // Philos Trans R Soc Lond В Biol Sci. 1995. V.350. N.1333. P.305−311.
- Graves J.A.M., Disteche C.M. and Toder R. Gene dosage in the evolution and function of mammalian sex chromosomes // Cytogenet Cell Genet. 1998a. V. 80. P. 94−103.
- Graves J.A.M., Wakefield M.J. and Toder R. The origin and evolution of the pseudoautosomal regions of human sex chromosomes // Hum Mol Genet. 1998b. V. 7. №. 13. P. 1991−1996.
- Greenfield A., Carrel L., Pennisi D., et al. The UTX gene escapes X inactivation in mice and humans. Hum Mol Genet. 1998 Apr- 7(4): 737−42.
- Hall I.M., Shankaranarayana G.D., Noma K., Ayonb N. Cohen A., Grewal S.I. Establishment and maintenance of a heterochromatin domain // Sciencc. 2002. V. 297. №. 5590. P. 2232−2237.
- Hannon GJ. RNA interference // Nature. 2002. V. 418. P. 244−250.
- Hassanane M.S., Chaudhary R., Chowdhary B.P. Microdisscctcd bovine X chromosome segment delineates homocologous chromosomal regions in sheep, goat and buffalo // Chromosome Res. 1998. V. 6. №. 3. P. 213−217.
- Hayes H. Chromosome painting with human chromosome-speific DNA libraries reveals the extent and distribution of conserved segments in bovine chromosomes // Cytogenet. Cell Genet. 1995. V. 71. P. 168−174.
- Horvath J.E., Bailey J.A., Locke D.P., Eichler E.E. Lessons from the human genome: transitions between cuchromatin and heterochromatin // Hum Mol Genet. 2001. V. 10. P. 2215−2223.
- Human Genome Sequencing Consortium. Initial sequencing and analysis of human genome // Nature. 2001. V. 409. P. 860−921.
- Jaenisch R., Bird A. Epigenetic regulation of gene expression: how the genome integrates intrinsic and environmental signals // Nat Genet Suppl. 2003. V. 33. P. 245−254.
- Jauch A., Wienberg J., Stanyon R., et al. Recostruction of genomic rearrangements in the great apes and gibbons by chromosomc painting // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1992. V. 89. P. 8611−8615.
- Jegalian K., Page D.C. A proposed path by which genes common to mammalian X and Y chromosomes evolve to bccomc X inactivated // Nature. 1998. V. 394. №. 6695. P. 776−780.
- Johnston P.G., Cattanacli B.M. Controlling elements in the mouse. IV. Evidence of non-random X-inactivation.//Genet Res. 1981. V.37. N.2. P.151−160.
- Joseph A.M., Chcinilley A.C. The morphological sequence of XY pairing in the Norway rat Rattus norvegicus // Chromosoma. 1984. V. 89. P. 381−386.
- Jouvenot Y., Poirier F., Jaini J., Paldi A. Biallclic transcription of Igf2 and H19 in individual cells suggests a post-transcriptional contribution to genomic imprinting // Curr Biol. 1999. V. 9. №. 20. P. 1199−1202.
- Just IV., Rau IV., Vogel IV., Akhverdian M., Fredga K., Graves J.A., Lyapunova E. Absence of Sry in species of the vole Ellobius // Nat Genet. 1995. V. 11. №. 2. P. 117−118.
- Kaslow D. C, Migeon B.R. DNA mcthylation stabilizes X chromosome inactivation in cuthcrians but not in marsupials: evidence for multistcp maintenance of mammalian X dosage compensation // Proc Natl Acad Sci USA. 1987. V. 84. №. 17. P. 6210−6214.
- Kay G.F., Ashworth A., Penny G.D., Dunlop M., Swift S., Brockdorff N., Rastan S. A candidate spermatogenesis gene on the mouse Y chromosome is homologous to ubiquitin-activating enzyme El // Nature. 1991. V. 354. №. 6353. P. 486−489.
- Kay G.F., Penny G.D., Patel D., Ashworth A., Brockdorff N. Rastan S. Expression of Xist during mouse development suggests a role in the initiation of X chromosome inactivation//Cell. 1993. V. 72. №. 2. P. 171−182.
- Keitges E., Rivest M" Siniscalco M., Gartler S.M. X-linkage of steroid sulphatase in the mouse is evidence for a functional Y-linkcd allele // Nature. 1985. V. 315. №. 6016. P. 226−227.
- Koehler U., Bigoni F., Wienberg J., Stanyon R. Genomic reorganization in the concolor gibbon (Ilylobatcs concolor) revealed by chromosome painting // Genomics. 1995. V. 30. №. 2. P. 287−292.
- Koopinan P., Gubbay J., Vivian N. Goodfellow P., Lovell-Badge R. Male development of chromosomally female mice transgenic for Sry // Nature. 1991. V. 351. №. 6322. P. 117−121.
- Kntglyak S., Tang II. Regulation of adjacent yeast genes. // Trends Genet. 2000. V. 16. №.3. P. 109−111.
- Kuroiwa A., Tsuchiya K., Watanabe Т., Hishigaki II., et al. Conservation of the rat
- X chromosomc gene order in rodent specics. // Chromosomc Res. 2001. V.9. P.61−67.
- Kuroiwa A., Watanabe Т., Hishigaki H., et al. Comparative FISH mapping of mouse and rat homologues of twenty-five human X-linked genes // Cytogenet. Cell Genet. 1998. V.81. P.208−212.
- Kvaloy K., Galvagni F., Brown W.R.A. The sequence organization of the long arm pscudoautosomal region of the human sex chromosomes // Hum Mol Genet. 1994. V. 3. P. 771−778.
- Lahn B.T., Page D.C. Functional coherence of the human Y chromosome // Science. 1997. V. 278. №. 5338. P. 675−680.
- Lahn B.T., Page D.C. Four evolutionary strata on the human X chromosomc // Scicncc. 1999a. V. 286. №. 5441. P. 964−967.
- Lahn B.T., Page D.C. Retroposition of autosomal mRNA yielded testis specific gene family on human Y-chromosome // Nature Genet. 1999b. V. 21. P. 429−433.
- Lee J.T. Molecular links between X-inactivation and autosomal imprinting: X-inactivation as a driving force for the evolution of imprinting? // Current Biology. 2003. V. 13. P. 242−254.
- Lercher M.J., Urrutia A.O., Hurst L.D. Clustering of housekeeping genes provides a unified model of gene order in the human genome // Nat Genet. 2002. V. 31. №. 2. P. 180−183.
- Li E. Chromatin modification and epigenetic reprogramming in mammalian development // Nat Rev Genet. 2002. V. 3. №. 9. P. 662−673.
- Li X.M., Salido E.C., Gong Y., Kitada K., Serikawa Т., Yen P.H., Shapiro L.J., 1996.
- Lichter P., Cremer Т., Borden J., Manuelidis L., Ward D.C. Delineation of individual human chromosomes in metaphasc and interphase cells by in situ suppression hybridization using recombinant DNA libraries // Hum Genet. 1988. V. 80. P. 224−34.
- Lingenfelter P.A., Adlcr D.A., Poslinski D., Thomas S., Elliott ЯIV., Chapman V.M., Distechc CM. Escape from X inactivation of Smcx is preceded by silencing during mouse development // Nat Genet. 1998. V. 18. №. 3. P. 212−213.
- Lucchesi J.C. Dosage compensation in flies and worms: the ups and downs of X-chromosome regulation // CurrOpin Genet Dev. 1998. V. 8. №. 2. P. 179−184.
- Luoh S.IV., Jegalian K., Lee A., Chen E.Y., Ridley A., Page D.C. CpG islands in human ZFX and ZFY and mouse Zfx genes: sequence similarities and methylation differences // Genomics. 1995. V. 29. №. 2. P. 353−363.
- Lyon M.F. Gene action in the X-chromosome of the mouse (Mus museulus L.) II Nature. 1961. V. 190. P. 372−373.
- Lyon M.F. X-chromosomc inactivation // Curr Biol. 1999. V. 9. №. 7. P. R235-R237.
- Lyon M.F. X-chromosome inactivation: a repeat hypothesis // Cytogenet Cell Genet. 1998. V. 80. P. 133−137.
- Makalowski IV., Mitchell G.A., Labuda D. Alu sequcnccs in the coding regions of mRNA: a source of protein variability// Trends Genet. 1994. V. 6. №. 188−193.
- Makalowski IV, Boguski M.S. Evolutionary parameters of the transcribed mammalian genome: an analysis of 2820 orthologous rodent and human sequences // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 9407−9412.
- Martin Y., Gerlach G., Schlotterer Ch., Meyer A. Molccular phylogeny of European Muroid Rodents based on complete cytochromo b sequences // Mol Phylogcnct and Evol. 2000. V. 16. N.l. P. 37−47.
- Matthey R. The chromosome formulae of cutherian mammals. In Chirclli AB & Capanna F., eds. Cytotaxonomy and vertebrate evolution. Academic Press: London and New York. P. 531−616.
- Mazeyrat S. Saut N. Mattei M.G., Mitchell M.J. RBMY evolved on the Y chromosomc from a ubiquitously transcribed X-Y identical gene 11 Nat Genet. 1999. V. 22. №. 3. P. 224−226.
- Mazurok N.A., Rubtsova N.V., Isaenko A.A., Pavlova M.E., et al. Comparative chromosome and mitochondrial DNA analyses and phylogenetic relationships within common voles (Microtus, Arvicolidae) // Chromosomc Res. 2001. V. 9. P. 107−120.
- McQueen H.A., McBride D., Miele G., Bird A.P., Clinton M. Dosage compensation in birds // Curr Biol. 2001. V. 11. №. 4. P. 253−257.
- Milatovich A., Kitaniura Т. Miyajima A., Francke U. Gene for the alpha-subunit of the human intcrlcukin-3 receptor (IL3RA) localized to the X-Y pseudoautosomal region // Am J Hum Genet. 1993. V. 53. №. 5. P. 1146−1153.
- Miller A.P., Willard II.F. Chromosomal basis of X chromosome inactivation: identification of a multigene domain in Xpl 1.21-pi 1.22 that escapes X inactivation // Proc Natl Acad Sci USA. 1998. V. 95. №. 15. P. 8709−8714.
- Millwood I. Y., Bihoreau M.T., Gauguier D., Hyne G., Levy E.R., KreutzR., Lathrop G.M., Monaco A.P. A gene-based genetic linkage and comparative map of the rat X chromosome // Genomics. 1997. V. 40. №. 2. P. 253−261.
- Mitchell M.J., Woods D.R., Tucker P.K., Opp J.S., Bishop C.E. Homology of a candidate spcrmatogenic gene from the mouse Y chromosomc to the ubiquitin-activating enzyme El //Nature. 1991. V. 354. №. 6353. P. 483−486.
- Modi W.S. Phylogcnctic analyses of chromosomal banding patterns among the nearctic Arvicolidae (Mammalia, Rodentia) // Syst. Zool. 1987. V. 36. P. 109−136.
- Modi W.S. Sex chromosomes and sex determination in Arvicolid rodents. // Chrom. Today. 1990. V.10. P.233−242.
- Modi W.S. Comparative analyses of hcterochromatin in Microtus: sequence heterogeneity and localized expansion and contraction of satellite DNA arrays // Cytogenct. Cell Genet. 1993. V. 62. P. 142−148.
- Moses M.J. Synaptonemal complex karyotyping in spermatocytes of the Chinese hamster (Cricetulos griseus). II. Morphology of the XY pair in sprcd preparation // Chromosoma. (Berl.). 1977. V. 60. P. 127−137.
- Mouse Genome Sequence Consortium Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome // Nature. 2002. V. 420. №. 5. P. 520−562.
- Ми J, Skurat AV, Roach PJ. Glycogenin-2, a novel sclf-glucosylating protein involved in liver glycogen biosynthesis // J Biol Chcm. 1997 Oct 31- 272(44): 27 589−97.
- Midler H.J. Bearing of the «Drosophila» work on systcmatics. In «The new systematics» (J. Huxleyd, ed.), Clarendon Press, Oxford. 1940. PP. 185−268.
- Midler II.J. //J ExpZool. 1914. V. 17. P. 325−336.
- Murphy W.J., Eizirik E., Johnson W.E., Zhang Y.P., Ryder O.A., O’Brien S.J. Molecular phylogenetics and the origins of placental mammals // Nature. 2001a. V. 409 P. 614−618.
- Murphy W.J., Staynon R., O’Brien S.J. Evolution of mammalian genome organization inferred from comparative gene mapping // Genome Biology. 2001b. V.2.N.6. P. 1−8.
- Murphy W.J., Sun S., Chen Z. t Yuhki N., Hirschmann D., Menotti-Raymond M., O’Brien S.J. A radiation hybrid map of the cat genome: implications for comparative mapping // Genome Res. 2000. V. 10. №. 5. P. 691−702.
- Muscatelli F., Strom T.M., Walker A.P., et al. Mutations in the DAX-1 gene give rise to both X-linked adrenal hypoplasia congenita and hypogonadotropic hypogonadism // Nature. 1994. V. 372. P. 672−676.
- Nash W.G., Menninger J.C., Wienberg J., Padilla-Nash H.M., O’Brien SJ. The pattern of phylogenomic evolution of the Canidac // Cytogenet Cell Genet. 2001. V. 95. P. 210−224.
- Nesterova T.B., Duthie S.M., Mazurok N.A., Isaenko A.A., Rubtsova N. V, Zakian S.M., BrockdorffN: Comparative mapping of X chromosomes in vole species of the genus Microtus И Chrom. Res. 1998. V. 6. P. 41−48.
- Nie W., Rens W., Wang J., Yang F. Conserved chromosome segments in Hylobates hoolock revealed by human and H. lcucogenys paint probes // Cytogenet. Cell Genet. 2001. V. 92. P. 248−253.
- O’Brien S.J., Menotti-Raymond M., Murphy W.J., et al. The promise of comparative genomics in mammals // Science. 1999. V. 286. №. 5439. P. 458−462.
- Ohlsson R., Paldi A., Graves J.A. Did genomic imprinting and X chromosome inactivation arise from stochastic expression? // Trends Genet. 2001. V. 17. №. 3. P. 136−141.
- Oluio S. Conservation of ancient linkage groups in evolution and some insight into the genetic regulatory mechanism of X-inactivation // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1973. V. 38. P. 155−164.
- Ohno S. Evolution of sex chromosomes in mammals // Annu. rev. Genet. 1969. V. 3. P. 495−524.
- Ohno S. Sex chromosomes and sex-linked genes // Springer. Berlin. Heidelberg. New York. 1967.
- Ohno S., Becak W" Becak M.Z. X-autosome ratio and the behavior pattern of individual X-chromosomes in placental mammals // Chromosoma. 1964. V. 15. P. 14.
- Page D.C., Disteche СМ., Simpson E.M., et al. Chromosomal localization of ZFX a human gene that escapes X inactivation — and its murine Homologs // Genomics. 1990. V. 7. P. 37−46.
- Page D.C., Harper M.E., Love J., Botstein D. Occurrence of a transposition from the X-chromosome long arm to the Y-chromosomc short arm during human evolution//Nature. 1984. V. 311. №. 5982. P. 119−123.
- Palmer S., Perry J., Ashworth A. A contravention of Ohno’s law in mice // Nat Genet. 1995. V. 10. №. 4. P. 472−476.
- Palmer S., Perry J., Kipling D., Ashworth A. A gene spans the pscudoautosomal boundary in mice // Proe Natl Acad Sci USA. 1997. V. 94. №. 22. P. 1 203 012 035.
- Pathak S., Stock A.D. The X chromosomes of mammals: karylogical homology as revealed by banding techniques // Genetics. 1974. V. 78. №. 2. P. 703−714.
- Perry J., Palmer S., Gabriel A., Ashworth A. A short pseudoautosomal region in laboratory mice // Genome Res. 2001. V. 11. №. 11. P. 1826−1832.
- Perry J., Ashworth A. Evolutionary rate of a gene affected by chromosomal position // Curr Biol. 1999. V. 9. №. 17. P. 987−989.
- Pinkel D., Straume Т., Gray J. W. Cytogenetic analysis using quantitative, high-sensitivity, fluorescence hybridization // Proe Natl Acad Sci USA. 1986. V. 83. №. 9. P. 2934−2938.
- Rabin M, Ferguson-Smith A, Hart CP, Ruddle FH. Cognate homco-box loci mapped on homologous human and mouse chromosomes // Proc Natl Acad Sci U S A. 1986. V. 83. P. 9104−8.
- Rappold G.A. The pscudoautosomal regions of the human sex chromosomes // Hum Genet. 1993. V. 92. №.4. P. 315−324.
- Rasmussen T.P., Wutz A.P., Pehrson J.R., Jaenisch R.R. Expression ofXist RNA is sufficient to initiate macrochromatin body formation // Chromosoma. 2001. V. 110. №.6. P. 411−420.
- Rastan S. Non-random X-chromosome inactivation in mouse X-autosome translocation embryos-location of the inactivation centcr // J. Embeyol. Exp. Morphol. 1983. V. 78. P. 1−22.
- Raudsepp Т., Kata S.R., Piumi F., Swinburne J., Womack J.E., Skow L.C., Chowdhary B.P. Conservation of Gene Order between Horse and Human X Chromosomes as Evidenced through Radiation Hybrid Mapping // Genomics. 2002. V. 79. №.3. P. 451−457.
- Reyes A., Pesole G., Saccone C. Long-branch attraction phenomenon and the impact of among-site rate variation on rodent phylogeny // Gene. 2000. V. 259. P. 177−187.
- Robinson M., Catzeflis F., Briolay J., Mouchiroud D. Molecular phylogeny of rodents, with special emphasis on murids: evidcncc from nuclear gene LCAT // Molecular phylogenetics and evolution. 1997. V.8. P.423−434.
- Rofe R., I layman D. G-banding evidence for a conserved complement in the Marsupialia // Cytogenet Cell Genet. 1985. V. 39. №. 1. P. 40−50.
- Ronne M. Putative fragile sites in the horse karyotype // Hercditas. 1992. V. 117. №. 2. P. 127−136.
- Ropers H.H., Wiberg U. Evidence for X-linkage and non-inactivation of steroid sulfatase locus in wood lemming // Nature. 1982. V. 296. P. 766−767.
- Rugarli E.I., Adler D.A., Borsani G., Tsuchiya K., Franco В., Hauge X., Disteche C., Chapman V., Ballabio A. Different chromosomal localization of the Clcn4 gene in Mus sprctus and C57BL/6J mice II Nat Genet. 1995. V. 10. №. 4. P. 466−471.
- Russel L.B. and Mongomery C.S. The use of X-autosome translocation in locating the X-chromosome inactivation center// Genetics. 1965. V. 52. P. 470−471.
- Rozcn S., Skaletsky II., Marszalek J.D., Minx P.J., Cordum H.S., Waterston R.H., Wilson R.K., Page D.C. Abundant gene conversion between arms of palindromes in human and ape Y chromosomes // Nature. 2003. V. 423. №. 6942. P. 873−876.
- Rubtsov N.B., Rubtsova N.V., Anopriyenko O.V., Karamysheva T.V., Shevchenko A.I., Mazurok N.A., Nesterova T.B. and Zakian S.M. Reorganization of the X chromosome in voles of the genus Microtus II Cytogenct Genome Res. 2002. V. 99. P. 323−329.
- Saifi G.M., Chandra U.S. An apparent excess of sex- and reproduction-related genes on the human X chromosome // Proc R Soc Lond В Biol Sci. 1999. V. 266. №. 1415. P. 203−209.
- Salido E.C., Li X.M., Yen P.H., Martin N. Mohandas Т.К., Shapiro LJ. Cloning and expression of the mouse pseudoautosomal steroid sulphatase gene (Sts) // Nat Genet. 1996. V. 13. №. 1. P. 83−86.
- Samonte R.V., Eichler E.E. Segmental duplications and the evolution of the primate genome II Nat. Rev. Genet. 2002. V.3. N.l. P.65−72.
- Sano Y., Shimada Т., Nakashima H., Nicholson R. I I., Eliason J.F., Kocarek T.A., Ко M.S. Random monoallelic expression of three genes clustered within 60 kb of mouse t complex genomic DNA // Genome Res. 2001. V. 11. №. 11. P. 1833−1841.
- Saxena R., Brown L.G., Hawkins Т., et al. The DAZ gene cluster on the human Y chromosome arose from an autosomal gene that was transposed, repeatedly amplified and pruned // Nat Genet. 1996. V. 14. №. 3. P. 292−299.
- Schibler L, Vaiman D, Oustry A, Giraud-Delville C, Cribiu EP. Comparative gene mapping: a fine-scale survey of chromosome rearrangements between ruminants and humans. Genome Res. 1998 Sep-8(9):901−15.
- Schmid C.W. Alu: structure, origin, evolution, significance and function of one-tenth of human DNA // Prog Nucleic Acid Res Mol Biol. 1996. V. 53. P. 283−319.
- Schncider-Gadicke A., Iieer-Romero P., Brown L.G., Nussbaum R., Page D.C. ZFX has a gene structure similar to ZFY, the putative human sex determinant, and escapes X inactivation // Cell. 1989. V. 57. №. 7. P. 1247−1258.
- Serikawa Т., Cui Z., Yokoi N. Kuramoto Т., Kondo Y., Kitada K., Guenet J.L. A comparative genetic map of rat, mouse and human genomes // Exp Anim. 1998. V. 47. №. 1. P. 1−9.
- Serov O.L., Pacj S.D., Sokolova O. Conserved regions of syntcnic genes and G-banding homologies in human, mouse and mink. International Workshop on human gene mapping//Cytogenet Cell Genet. 1991. V. 58. P. 1917.
- Shapiro L.J., Mohandas Т., Weiss R., Romeo G. Non-inactivation of an X-chromosome locus in man // Science. 1979. V. 204. №. 4398. P. 1224−1226.
- Sharp P. Sex chromosome pairing during male meiosis in marsupials // Chromosoma. 1982. V. 86. №. 1. P. 27−47.
- Shevchenko A.I., Slobodianiuk S.Ia., Zakiian S.M. Variability in DNA repeats in four species of common voles // Mol Biol (Mosk). 1999. V. 33. №. 4. P. 700−705.
- Shevchenko Л.Т., Mazurok N.A., Slobodyanyuk S.Y., Zakian S.M. Comparative analysis of the MSAT-160 repeats in four species of common vole (Microtus, Arvicolidac) // Chromosome Res. 2002. V. 10. P. 117−126.
- Skaletsky H., Kuroda-Kawaguchi Т., Minx P.J., et al. The male-specific region of the human Y chromosome is a mosaic of discrete sequence classes // Nature. 2003. V. 423. P. 6942. P. 825−837.
- Smith MJ., Goodfellow P.N. MIC2R: a transcribed MIC2-related sequence associated with a CpG island in the human pseudoautosomal region // Hum Mol Genet. 1994. V. 3. №. 9. P. 1575−1582.
- Souciet .J, Aigle M., Artiguenave F., Blandin G., Bolotin-Fukuhara M., et al. Genomic exploration of the hemiascomycctous yeasts: 1. A set of yeast species for molecular evolution studies // FEBS Lett. 2000. V. 487. №. 1. P. 3−12.
- Stanyon R., Yang F., Cavagna P., O’Brien P.C., et al. Reciprocal chromosome painting shows that genomic rearrangement between rat and mouse proceeds tentimes faster than between humans and cats // Cytogenct Cell Genet. 1999. V. 84. P. 150−155.
- Stitou S., Burgos A/., Zurita F., Jimenez R., Sanchez A., Diaz de la Guardia R. Reccnt evolution of NOR-bearing and sex chromosomes of the North African rodent Lemniscomys barbarus // Chromosome Res. 1997. V. 5. №. 7. P. 481−485.
- Swanson W.J., Vacquier V.D. The rapid evolution of reproductive proteins // Nature Reviews Genet. 2002. V. 3. P. 137−144.
- Takagi N. Sugawara O., Sasaki M. Regional and temporal changes in the pattern of X-chromosome replication during the early post-implantation development of the female mouse // Chromosoma. 1982. V. 85. №. 2. P.275−286.
- Toder R., Glaser В., Schiebel К., Wilcox S.A., Rappold G., Graves J.A.M. Schempp W. Genes located in and near the human pscudoautosomal region arc located in the X-Y pairing region in dog and sheep // Chromosome Res. 1997. V. 5. P. 301−306.
- Toder R., Graves J.A. CSF2RA, ANT3, and STS are autosomal in marsupials: implications for the origin of the pseudoautosomal region of mammalian sex chromosomes // Mamm Genome. 1998. V. 9. №. 5. P. 373−376.
- Toder R., Rappold G.A., Schiebel K" Schempp W. ANT3 and STS are autosomal in prosimian lemurs: implications for the evolution of the pseudoautosomal region // Hum Genet. 1995. V.95. N.l. P.22−28.
- Toder R., Wakefield M.J., Graves J.A. The minimal mammalian Y chromosomc -the marsupial Y as a model system // Cytogenet Ccll Genet. 2000. V. 91. №. 1−4. P. 285−292.
- Tsuchiya K.D., Willard H.F. Chromosomal domains and escape from X inactivation: comparative X inactivation analysis in mouse and human // Mamm Genome. 2000. V. 10. P. 849−854.
- Van Etten W. J, Steen R.G., Nguyen II., et al. Radiation hybrid map of the mouse genome // Nat. Genet. 1999. V. 22. №. 4. P. 384−387.
- Ventura M, Arcliidiaacono N. Rocchi M. Centromere emergence in evolution // Genome Res. 2001. V. 11. P. 595−599.
- Venter J.C. et al. The sequence of the human genome. // Scicncc. 2001. V. 291. №. 5507. P. 1304−1351.
- Vistorin G., Gamperl R., Rosenkranz W. Studies on sex chromosomes of four hamster species: Cricctus cricctus, Cricctulus griseus, Mesocricetus auratus, and Phodopus sungorus И Cytogenet Cell Genet. 1977. V. 18. №. 1. P. 24−32.
- Vogel Т., Dechend F., Manz E., Jung C., Jakubiczka S., Fehr S., Schmidtke J., Sclinieders F. Organization and expression of bovine TSPY // Mamm Genome. 1997. V. 8.№. 7. P. 491−496.
- Vollrath D., Foote S., Hilton A., Brown L. G, Beer-Romero P., Bogan J.S., Page D.C. The human Y chromosome: a 43-intcrval map based on naturally occurring deletions // Scicncc. 1992. V. 258. №. 5079. P. 52−59.
- Wakefield M.J., Graves J.A. Comparative maps of vertebrates. // Mamm Genome. 1996. V.7. N.10. P.715−716.
- Wang J., Mager J., Chen Y., Schneider E., Cross J.C., Nagy A., Magnuson T. Imprinted X inactivation maintained by a mouse Polycomb group gene // Nat Genet. 2001. V. 28. №. 4. P. 371−375.
- Wareham K.A., Lyon M.F., Glenister P.H., Williams E.D. Age related reactivation of an X-linked gene II Nature. 1987. V. 327. №. 6124. P. 725−727.
- Watanabe M., Zinn A.R., Page D.C., Nishimoto T. Functional equivalence of human X- and Y-cncodcd isoforms of ribosomal protein S4 consistent with a role in Turner syndrome//Nat Genet. 1993. V. 4. №. 3. P. 268−271.
- Welle г Р.Л., Criteher R., Goodfellow P.N., German J., Ellis N.A. The human Y chromosome homologue of XG: transcription of a naturally truncated gene // Hum Mol Genet. 1995. V. 4. №. 5. P 859−868.
- Westergaard, M. 1958. The mechanism of sex determination in dioecious flowering plants // Adv. Genet. V. 9. P. 217−281.
- Wiberg U.H., Fredga K. Steroid sulfatasc levels are higher in males than in females of the root vole (Microtus oeconomus) // Hum. Genet. 1987. V. 77. P. 6−11.
- Wienberg J., Stanyon R., Nash W.G., O’Brien P.C., Yang F., O’Brien S.J., Ferguson-Smith M.A. Conservation of human vs. feline genome organization revealed by reciprocal chromosome painting // Cytogenct Cell Genet. 1997. V. 77. №. 3−4. P. 211−217.
- Wilcox S.A., Watson J.M., Spencer J.A., Graves J.A. Comparative mapping identifies the fusion point of an ancient mammalian X-autosomal rearrangement // Genomics. 1996. V. 35. P. 66−70.
- Williams D., Hagen A., Runayan J., Lafferty D. A method for the differentiation of male mciotic chromosome stages // J.Heredity. 1971. V.62. P. l 17−122.
- Wolfe K.H., Li W.-H. Molecular evolution meets the genomic revolution // Nature Gcnctics Suppl. 2003. V. 33. P. 255−265.
- Wriglcy J.M., Graves J.A. Sex chromosome homology and incomplete, tissue-specific X-inactivation suggest that monotremes represent an intermediate stage of mammalian sex chromosomc evolution//J Hcrcd. 1988. V. 79. №. 2. P. 115−118.
- Wrigley J.M., Graves J.A. Karyotypic conservation in the mammalian order monotremata (subclass Prototheria) I I Chromosoma. 1988. V. 96. №. 3. P. 231−247.
- Wu Ch.-I., Xu E. Y. Sexual antagonism and X inactivation the SAXI hypothesis // Trends in Gcnctics. 2003. V. 19. P. 243−247.
- Wu J., Ellison J., Salido E., Yen P., Mohandas Т., Shapiro L.J. Isolation and charactcrization of ХП169, a novel human gene that escapes X-inactivation // Hum Mol Genet. 1994a. V. 3. P. 153−160.
- Wu J., Salido E.C., Yen P.H., Mohandas Т.К., et al. The murine Xcl69 gene escapes X-inactivation like its human homologue // Nat Genet. 1994b. V. 7. P. 491 496.
- Wutz A., Rasmussen T.P., Jacnisch R. Chromosomal silcncing and localization arc mediated by different domains of Xist RNA // Nat Genet. 2002. V. 30. №. 2. P. 167−174.
- Xu J., Burgoyne P. S., Arnold A.P. Sex differences in sex chromosomc gene expression in mouse brain// Hum Mol Genet. 2002. V. 11. N. 12. P. 1409−1419.
- Yang F., O’Brien P., Milne В., Graphodatsky., et al., A complete comparative chromosome map for the dog, red fox, and human and its integration with canine genetic maps // Genomics. 1999. V. 62. P. 189−202.
- Yang F., O’Brien P.C.M., Ferguson-Smith M.A. Comparative chromosome map of the laboratory mouse and Chinese hamster defined by reciprocal chromosome painting// Chromosome Research. 2000. V. 8. P. 219−227.
- Yen P.H., Ellison J., Salido E.C., Mohandas Т., Shapiro L. Isolation of a new gene from the distal short arm of the human X chromosome that escapes X-inactivation // Hum Mol Genet. 1992. V. 1. №. 1. P. 47−52.
- Zakian S.M., Kulbakina N.A., Meyer M.N., Semenova L.A., Bochkarev M.N., Radjabli S.I., Serov O.L. Non-random inactivation of the X-chromosomc in interspecific hybrid voles // Genet Res. 1987. V. 50. №. 1. P. 23−27.
- Zakiian S.M., Nesterova T.B., Cheriaukene О. V., Bochkarev M.N. Heterochromatin as a factor influencing X-chromosome inactivation in hybrids of the common vole (Microtinae, Rodcntia) // Genctika. 1991. V. 27. №. 3. P. 425−433.
- Zhdanova N.S., Larkin D.M., Kuznetsov S.B. et al. The order of genes on porcine chromosome 12 // Animal Genomics: Synthesis of Past, Present, and Future Directions. 2000. P. 52.
- Zinn A.R., Bressler S.L., Beer-Romero P., Adler D.A., Chapman V.M., Page D.C., Disteche CM. Inactivation of the Rps4 gene on the mouse X chromosome // Genomics. 1991. V. 11. №. 4. P. 1097−1101.
- Zinn A.R., Page D.C., Fisher E.M. Turner syndrome: the case of the missing sex chromosomc //Trends Genet. 1993 V. 9. №. 3. P. 90−93.