Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса Гета, выделенных на территории Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии

Диссертация: Молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса Гета, выделенных на территории Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Представители антигенного комплекса Семлики, к которому относится и вирус Гета, распространены в Северои Юго-Восточной Азии, Австралии и Океании, Африке и Южной Америке. Некоторые (например вирусы Чикунгунья, Росс-Ривер и О’Ньонг-Ньонг) способны вызывать обширные эпидемические вспышки среди людей, другие имеют значение в патологии домашних и диких животных. Инфицирование человека альфавирусами… Читать ещё >

Содержание

  • Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Классификация возбудителя, характеристика семейства тогавирусов
    • 1. 2. Структура вириона
    • 1. 3. Структура генома вируса Гета
    • 1. 4. Репликация вируса
      • 1. 4. 1. Начало цикла репликации — адсорбция
      • 1. 4. 2. Проникновение вируса и раздевание
      • 1. 4. 3. Репликация вирусного генома
      • 1. 4. 4. Синтез структурных белков вируса — трансляция субгеномной РНК
      • 1. 4. 5. Сборка и почкование вируса
      • 1. 4. 6. Взаимодействие вируса с клеткой-хозяином
    • 1. 5. Биологические свойства вируса Гета
      • 1. 5. 1. Гемагглютинация
      • 1. 5. 2. Взаимодействие с клеточными рецепторами
      • 1. 5. 3. Эффект, оказываемый вирусом на клетки позвоночных
      • 1. 5. 4. Эффект, оказываемый вирусом на клетки беспозвоночных
      • 1. 5. 5. Альфавирусная суперинфекция
    • 1. 6. Патогенез инфекции вируса Гета у позвоночных
      • 1. 6. 1. Распространение вируса в организме
      • 1. 6. 2. Вирус-специфический адаптивный иммунный ответ
      • 1. 6. 3. Клинические проявления инфекции вируса Гета у млекопитающих
      • 1. 6. 4. Экспериментальная инфекция у мышей
    • 1. 7. Патогенез инфекции вируса Гета у комаров
    • 1. 8. Антигенная структура рода
    • 1. 9. Эволюция и филогенетика рода
    • 1. 10. Особенности экологии и эпидемиологии вируса Гета как представителя группы арбовирусов
      • 1. 10. 1. Значение членистоногих в экологии вируса
      • 1. 10. 2. Значение позвоночных в экологии вируса
      • 1. 10. 3. Особенности эпидемиологии инфекции вируса Гета
  • Глава 2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ
  • МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Анализируемые штаммы из базы данных GenBank
    • 2. 2. Исследуемые штаммы
    • 2. 3. Места сбора и объем полевого материала
    • 2. 4. Олигонуклеотиды использованные в экспериментах
    • 2. 5. Выделение РНК
    • 2. 6. Реакция обратной транскрипции (ОТ)
    • 2. 7. Проведение полимеразной цепной реакции
    • 2. 8. Определение 5'-концевых последовательностей геномной
    • 2. 9. Определение 3'-концевых последовательностей геномной
    • 2. 10. Клонирование фрагментов концевых областей генома
      • 2. 10. 1. Получение рекомбинантных плазмид
      • 2. 10. 2. Приготовление компетентных клеток
      • 2. 10. 3. Трансформация плазмидной ДНК
      • 2. 10. 4. Селекция плазмид, несущих последовательности концевых фрагментов генома
      • 2. 10. 5. Выделение плазмидной ДНК
    • 2. 11. Электрофорез ДНК
    • 2. 12. Приготовление ДНК для секвенирования
    • 2. 13. Секвенирование ДНК
    • 2. 14. Построение алайментов и филогенетический анализ
  • Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3. 1. Создание лабораторного варианта ОТ-ПЦР тест-системы для детекции РНК вируса Гета в биологических образцах
      • 3. 1. 1. Определение чувствительности ОТ-ПЦР тест-системы
      • 3. 1. 2. Исследование полевого материала
    • 3. 2. Филогенетический анализ исследованных штаммов вируса Гета
    • 3. 3. Определение и анализ полных нуклеотидных последовательностей штаммов вируса Гета LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR
    • 3. 4. Филогенетический анализ представителей антигенного комплекса Семлики по полной полной нуклеотидной последовательности гена Е
    • 3. 5. Филогенетический анализ представителей антигенного комплекса Семлики с использованием нуклеотидных последовательностей полного генома
    • 3. 6. Анализ функционально значимых участков генома исследованных штаммов вируса Гета
      • 3. 6. 1. Домен слияния и сайт гликозилирования поверхностного гликопротеина Е
      • 3. 6. 2. Нейтрализующие эпитопы и сайты гликозилирования поверхностного гликопротеина Е
      • 3. 6. 3. 5'- и З'-нетранслируемые области генома штаммов LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR вируса Гета
      • 3. 6. 4. Другие функционально значимые области генома исследованных штаммов вируса Гета

Молекулярно-генетическая характеристика штаммов вируса Гета, выделенных на территории Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Вирус Гета (Getah virus), относящийся к роду Alfavirus семейства Togaviridae, был впервые выделен в Малайзии в 1955 г. от комаров Culex gelidus. Многочисленные штаммы были впоследствии изолированы в странах Азиатско-Тихоокеанского региона от комаров родов Culex, Anopheles и Aedes [6, 23, 36, 127]. Антитела против вируса Гета часто обнаруживались у птиц и млекопитающих, в том числе у людей, в странах Азии и в Австралии [73, 89]. В России вирус был впервые изолирован на юге Дальнего Востока в 1972 г., антитела были обнаружены у населения Приморского края, Средней и Восточной Сибири [8, 11]. В 2000 г. были опубликованы данные о распространении вируса Гета в различных, в том числе и крайних северных, граничащих с арктической тундрой, ландшафтных поясах Северо-Восточной Азии [9].

Представители антигенного комплекса Семлики, к которому относится и вирус Гета, распространены в Северои Юго-Восточной Азии, Австралии и Океании, Африке и Южной Америке [24, 64, 88]. Некоторые (например вирусы Чикунгунья, Росс-Ривер и О’Ньонг-Ньонг) способны вызывать обширные эпидемические вспышки среди людей, другие имеют значение в патологии домашних и диких животных [39, 48]. Инфицирование человека альфавирусами из комплекса Семлики может протекать бессимптомно, либо в виде общелихорадочного заболевания (Гета, О’Ньонг-Ньонг), или сопровождаться лихорадкой, сыпью, артралгией (Росс-Ривер), геморрагическим синдромом (Чикунгунья) [8, 78]. Эти обстоятельства, а также экологическая связь вирусов антигенного комплекса Семлики с птицами, мигрирующими по восточно-азиатскому и, возможно индо-азиатскому руслу, определяют необходимость дальнейшего изучения роли вируса Гета в патологии человека и животных в Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии.

Вирионы представляют собой сферические оболочечные частицы диаметром около 70 нм. Геном представлен однонитевой РНК положительной полярности длиной -11 600 нуклеотидных оснований и имеет типичную организацию генома альфавирусов [36]. Альфавирусы, в том числе вирусы Синдбис, Семлики и Сагияма, являющийся подтипом вируса Гета, активно используются в качестве экспрессионных векторов, отличающихся высокой продуктивностью [108, 130]. С этой точки зрения анализ генома вновь изолированных штаммов вируса Гета представляет интерес в плане поиска новых кандидатов для экспрессионных систем.

Патогенез инфекции вируса Гета для позвоночных был описан в 1978 г., когда вирус был выделен во время вспышки заболевания, сопровождавшегося лихорадкой и характерной сыпью на различных участках тела у скаковых лошадей в Японии. Также вирус способен вызывать эпизоотии среди свиней и поросят, у последних возможен летальный исход [129].

Вирусу Гета, как и другим представителям арбовирусных инфекций, присущ трансмиссивный путь передачи, вызываемое им заболевание относится к природно-очаговым зоонозам. При трансстадийной и трансовариальиой передаче членистоногие служат также резервуаром вируса в природных очагах и его постоянными хозяевами. Хотя в экологии вируса Гета основную роль играют членистоногие переносчики, периодическое, кратковременное для существования вирусной популяции, включение в паразитарную систему 3-го члена — позвоночного, полезно для вирусной популяции, поскольку создает условия для обогащения ее генофонда [6].

Для диагностики заболевания и серологического мониторинга применяются различные вирусологические, серологические и молекулярно-биологические методы. В целях исследования географического распространения различных штаммов вируса используется изоляция вируса из комаров путем внутримозгового заражения мышей-сосунков.

Быстрым, чувствительным и специфичным для детекции вируса является метод ОТ-ПЦР. Геном вируса Гета полностью секвенирован, что облегчает подбор специфичных праймеров к различным участкам генома. Анализ генома штаммов вируса Гета является достоверным источником данных об их филогенетических отношениях в плане географического распространения.

Цели и задачи.

Целью настоящей работы является проведение молекулярно-генетического анализа штаммов вируса Гета, циркулирующих на территории Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии, а также определение и анализ первичной структуры полного генома штаммов, наиболее характерных для указанных регионов. Для реализации этой цели были поставлены следующие основные задачи:

1) Провести определение первичной структуры участка геномной РНК штаммов вируса Гета из коллекции ГУ НИИ Вирусологии им. Д. И. Ивановского, выделенных на территории России (Восточная Сибирь и Дальний Восток) и Монголии;

2) Разработать лабораторный вариант детекционной ОТ-ПЦР системы на основе анализа нуклеотидных последовательностей штаммов вируса Гета, депонированных в базе данных GenBank и исследованных штаммов;

3) Определить и проанализировать нуклеотидные последовательности полного генома штаммов LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR исследуемого вируса;

4) Провести филогенетический анализ штаммов вируса Гета, выделенных на территории России и Монголии, и остальных представителей комплекса Семлики по фрагменту геномной РНК, последовательности гена Е2, а также по полным геномам.

Основные положения, выносимые на защиту.

1. Разработан и апробирован лабораторный вариант ОТ-ПЦР системы для детекции РНК вируса Гета в биологических образцах.

2. На основе филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей участка геномной РЖ (1627 н.о.) оценено генетическое разнообразие штаммов вируса Гета, изолированных в различных регионах Азии, выделены три обособленные генетические группы.

3. Генетически охарактеризованы, на основе определённой нами первичной структуры полного генома, первый российский (LEIV 16 275 Маг) и монгольский (LEIV 17 741 MPR) штаммы вируса Гета.

4. Сравнение результатов филогенетического анализа по гену Е2 и полным геномам позволяет сделать заключение о правомерном использовании последовательности гена Е2 для установления филогенетических взаимоотношений штаммов в пределах антигенного комплекса Семлики.

Научная новизна и практическая значимость.

В результате проделанной работы впервые в России была создана ОТ-ПЦР система для детекции вируса Гета в биологических образцах.

В ходе выполнения настоящей работы было впервые проанализировано генетическое разнообразие штаммов вируса Гета, циркулировавших на территории Якутии, Магаданской области,.

Хабаровского края, Бурятии и Монголии, а также охарактеризованы пути заноса и распространения штаммов в Центральной, Восточной и СевероВосточной Азии. Показано наличие трех обособленных генетических групп штаммов вируса Гета, циркулирующих в различных ландшафтно-климатических зонах: тундре, лесотундре и северной тайге (1-я группа), в зоне степей и смешанных лесов (2-я группа), и исключительно в смешанных лесах (3-я группа).

Также в результате работы были впервые определены и проанализированы полные нуклеотидные последовательности штаммов вируса, выделенных на территории России и Монголии и характерных для соответствующих генетических групп (LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR). В результате филогенетического анализа последовательностей полного генома представителей антигенного комплекса Семлики и последовательностей гена поверхностного протеина Е2 сделан вывод о правомерном использовании последовательности гена Е2 для установления филогенетических взаимоотношений штаммов в пределах комплекса.

Результаты исследования могут оказать содействие развитию системы экологического надзора, сопровождающегося систематическим обследованием кровососущих членистоногих и позвоночных вирусологическими, серологическими и молекулярно-биологическими методами, для определения условий, предшествующих развитию эпизоотической ситуации, что даст возможность принять специфические и неспецифические меры профилактики.

ВЫВОДЫ.

1. Установлено, что разработанный лабораторный вариант ОТ-ПЦР системы для детекции РНК вируса Гета является эффективным и чувствительным при исследовании биологических образцов.

2. В результате анализа первичной структуры участков геномной РНК (1627 н.о.) 21 исследованного штамма вируса Гета, циркулировавших на территории Северо-Восточной Азии, выявлен низкий уровень вариабельности генома вируса (до 98% гомологии нуклеотидных последовательностей).

3. Установлено наличие трех обособленных генетических групп штаммов вируса Гета, циркулировавших в различных ландшафтно-климатических поясах России и Монголии на основе филогенетического анализа по участку геномной РНК.

4. В результате исследования впервые определенных полных нуклеотидных последовательностей штаммов вируса, выделенных на территории России и Монголии показано, что они являются характерными для соответствующих генетических групп (LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR).

5. Показана правомерность использования последовательности гена Е2 для установления филогенетических взаимоотношений штаммов в пределах антигенного комплекса Семлики на основе филогенетического анализа последовательностей полного генома представителей комплекса и последовательностей гена поверхностного протеина Е2.

Благодарности.

Считаю своим долгом выразить глубочайшую признательность директору Института вирусологии им. Д. И. Ивановского РАМН академику Д. К. Львову, предоставившему возможность выполнения данной работы. Хочу выразить глубокую благодарность и признательность своему научному руководителю к.б.н. А. Г. Прилипову за постоянную помощь и неослабленное внимание к работе, критическую оценку и ценную помощь при оформлении диссертации.

Отдельно хочу поблагодарить к.б.н. В. JI. Громашевского д. б. н. А. А. Шилова, к.б.н. Е. И. Самохвалова, М. М. Гараева, В. Г. Лунина, Л. В. Урываева и весь коллектив лаборатории молекулярной генетики, за неоценимую помощь в выполнении и обсуждении работы и доброжелательное отношение. Хотелось также поблагодарить всех сотрудников Института вирусологии им. Д. И. Ивановского РАМН с кем мне посчастливилось общаться в ходе выполнения работы.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

На первом этапе настоящей работы была разработана ОТ-ПЦР система для детекции вируса Гета в биологических образцах. Для амплификации фрагментов ДНК штаммов вируса Гета, пассированных в мозге мышей-сосунков, применялся однораундовый вариант ПЦР. Для детекции вируса Гета в пробах полевого материала с очень низким содержанием вирусной РНК применялся двухраундовый «гнездовой» вариант ПЦР. Чувствительность «гнездового» варианта системы составила порядка 100 БОЕ/мл или 20 БОЕ в ПЦР пробирке. Таким образом, разработанный лабораторный вариант ОТ-ПЦР системы для детекции РНК вируса Гета является эффективным и чувствительным при исследовании инфекционного материала.

С использованием созданной системы была определена первичная структура участка геномной РНК (1627 н.о.) для 21 исследованного штамма вируса Гета, циркулировавших на территории Северо-Восточной Азии. Далее, по результатам филогенетического анализа полученных последовательностей, было впервые проанализировано генетическое разнообразие штаммов вируса Гета, циркулировавших на территории Якутии, Магаданской области, Хабаровского края, Бурятии и Монголии, а также охарактеризованы пути заноса и распространения штаммов в Северо-Восточной Азии. Показано наличие трех обособленных генетических групп штаммов вируса Гета, циркулирующих в различных ландшафтно-климатических условиях: тундре, лесотундре и северной тайге (1-я группа), в зоне степей и смешанных лесов (2-я группа), и исключительно в смешанных лесах (3-я группа).

Штаммы внутри первой группы (из Якутии и Магаданской области) обнаруживали высокую степень идентичности, но были достаточно удалены от остальных групп, что наводит на мысль об однократном заносе вируса Гета и формировании изолированного очага инфекции. Наличие третьей группы штаммов, относительно сильно удаленных от других, изолированных на той же территории (Хабаровский край), также указывает на факты заноса вновь возникающих вариантов вируса Гета из Юго-Восточной Азии. Приведенные данные указывают на возможность формирования географически разобщенных очагов инфекции, образованных генетически различными штаммами вируса Гета, на обширной территории Центральной, Восточной и Северо-Восточной Азии.

Также в результате работы были впервые определены и проанализированы полные нуклеотидные последовательности штаммов вируса Гета, выделенных на территории России и Монголии и характерных для соответствующих генетических групп (LEIV 16 275 Маг и LEIV 17 741 MPR). Нуклеотидные и предсказанные аминокислотные последовательности исследованных штаммов были опубликованы в международной базе данных «GenBank» (Accession Numbers: EF631998, EF631999).

В ходе работы был выполнен анализ функционально значимых участков генома исследованных штаммов в сравнении с эталонным штаммом вируса Гета, Сагияма и ближайшим соседом в пределах антигенного комплекса — вирусом Росс-Ривер. Структура домена слияния гликопротеина Е1, нейтрализующих эпитопов гликопротеина Е2, сайтов гликозилирования ЕЗ, Е2, 6К и Е1, консервативных регуляторных последовательностей в пределах нетранслируемых областей генома, была идентична или весьма близка среди исследованных и эталонных штаммов вируса Гета и Росс-Ривер.

По результатам филогенетического анализа с использованием последовательностей полного генома исследованных штаммов и других представителей комплекса Семлики, в пределах серокомплекса штаммы вируса Гета оказались наиболее удалены в генетическом плане от вирусов Чикунгунья и О’Ньонг-Ньонг, гомология в нуклеотидной последовательности не превышала 63% целого генома. Наиболее близким к исследованным штаммам является вирус Росс-Ривер, здесь процент гомологии доходит до 75% полного генома. Гомология нуклеотидных последовательностей полных геномов среди исследованных и ранее описанных штаммов вируса Гета и Сагияма составляла не менее 98%.

Полученные данные показали, что исследуемые и эталонные штаммы вируса Гета образуют собственный кластер и достаточно удалены от остальных представителей комплекса, в частности от весьма близкого им в антигенном отношении вируса Росс-Ривер. Гомология нуклеотидных последовательностей гена Е2 вирусов Гета и Росс-Ривер не превышает 71%, аминокислотных — 81%.

В результате филогенетического анализа последовательностей полного генома представителей антигенного комплекса Семлики и последовательностей гена поверхностного протеина Е2 сделан вывод о правомерном использовании последовательности гена Е2 для установления филогенетических взаимоотношений штаммов в пределах комплекса.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Н. Г., Корешкова Г. В., Погодина В. В. Изучение сочетанных очагов арбовирусных инфекций, передаваемых комарами. // Вопр Вирусол -1981. -№ 5. С. 611−615.
  2. Вирусология, в 3-х Т./ Ред. Б. Филдс, Д. Найп. М.: Мир, 1989. Т. 2. С. 343−359.
  3. В. К., Чугункин С. П. Сравнительная характеристика репродукции вируса Гета и Западный Нил в культурах клеток комаров трех видов. // Мед Паразитол 1980. — Вып. 49. — № 4. — С. 34−37.
  4. В. М., Королев М. Б., Чунихин С. П., Изотов В. К. Сравнительный анализ морфогенеза вируса Гета в клетках культур позвоночных животных и комаров. // Вопр Вирусол 1979. — № 2. — С. 137−142.
  5. Д. К., Ильичев В. Д. Миграции птиц и перенос возбудителей инфекции-М.: Наука, 1979. С. 5−101.
  6. Д. К., Клименко С. М., Гайдамович С. Я. и др. Арбовирусы и арбовирсные инфекции М.: Медицина, — 1989. — С 95−110.
  7. Д. К., Лебедев А. Д. Экология арбовирусов М.: Медицина, -1974. С. 3−106.
  8. С. Д. Эколого-эпидемиологические закономерности циркуляции арбовирусов на севере Евразии: Дис.. док. мед. наук. М., 1994. — С. 51−280.
  9. С. Д., Громашевский В. Л., Аристова В. А., Морозова Т. Н., Скворцова Т. М., Гущина Е. А., Петорва Е. С., Львов Д. К. Изоляция штаммов вируса Гета (Togaviridae, Alfavirus) в Северо-Восточной Азии. // Вопр вирусол 2000. — № 5. — С. 14−18.
  10. В. В., Медведева Г. С. Межвидовые взаимодействия арбовирусов. III. Конкуренция за вирусспецифические суперкапсидные белки в смешанных популяциях вирусов Гета и Синдбис. // Acta Virol -1978. Вып. 22. — № 4. — С. 270−277.
  11. Aaskov, J. G., Davies С. E., Tucker M., Dalglish D. Effect on mice of infection during pregnancy with three Australian arboviruses. // Am J Trap Med Hyg 1981. — Vol. 30(1). — P. 198−203.
  12. Ando K., Kitamura S. Plaque formation by alphavirus (Getah) in Culex Mosquito cells. // Acta Virol 1977. — Vol. 21(2). — P. 168−169.
  13. Anthony R. P., Brown D. T. Protein-protein interactions in an alphavirus membrane. //J Virol 1991. — Vol. 65. — P. 1187−1194.
  14. Anthony R. P., Paredes A. M., Brown D. T. Disulfide bonds are essential for the stability of the Sindbis virus envelope. // Virology 1993. — Vol. 190. -P. 330−336.
  15. Asai Т., Shibata I., Uruno K. Susceptibility of pregnant hamster, guinea pig, and rabbit to the transplacental infection of Getah virus. // J Vet Med Sci1991.-Vol. 53(6).-P. 1109−1111.
  16. Barth B. U., Suomalainen M., Liljestrom P., Garoff H. Alphavirus assembly and entry: role of the cytoplasmic tail of the El spike subunit. // J Virol1992.-Vol. 66.-P. 7560−7564.
  17. Beltzer J. P., Fiedler K., Fuhrer C., Geffen I., Handschin C., Wessels H. P., Spiess M. Charged residues are major determinants of the transmembraneorientation of a signal-anchor sequence. // J Biol Chem 1991. — Vol. 266. -P. 973−978.
  18. Berge Т.О., Getah. // International catalogue of Arboviruses, Including Certain Other Viruses of Vertebrates, 2nd Edition. US Department of Health, Education and Welfare 1975. — P. 278−279.
  19. Boughton C. R., Hawkes R. A., Nairn H. M., Wild J., Chapman B. Arbovirus infections in humans in New South Wales. Seroepidemiology of the alphavirus group of togaviruses. // Med J Aust 1984. — Vol. 141(11). -P. 700−704.
  20. Bron R., Wahlberg J. M., Garoff H., Wilschut J. Membrane fusion of Semliki Forest virus in a model system: correlation between fusion kinetics and structural changes in the envelope glycoprotein. // EMBO J 1993. -Vol. 12.-P. 693−701.
  21. Brown С. M., Timoney P. J. Getah virus infection of Indian horses. // Trop Anim Health Prod 1998.-Vol. 30(4).-P. 241−252.
  22. Bryant J. E, Crabtree M. В., Nam V. S., Yen N. Т., Due H. M., Miller B. R. Isolation of arboviruses from mosquitoes collected in northern Vietnam. // Am J Trop Med Hyg 2005. — Vol. 73(2). — P. 470−473.
  23. Calisher С. H., Karabatsos N. Arbovirus serogroups: definition and geographic distribution. // The arboviruses: epidemiology and ecology. / Ed. P. Monath, Boca Raton, Fla, 1988. — Vol. 1. — P. 19−57.
  24. С. H., Shope R. H., Brandt W., Casals J., Karabatsos N., Murphy F. A., Tesh R. В., Wiebe M. E. Proposed antigenic classification of registeredarboviruses. I. Togaviridae, Alphavirus. // Intervirology 1980. — Vol. 14. -P. 229−232.
  25. Chanas A. C., Johnson В. K., Simpson D. I. H. A comparative study of related alphaviruses a naturally occurring model of antigenic variation in the Getah sub-group. // J gen Virol — 1977. — Vol. 35. — P. 455−462.
  26. Chomzcynski P., Sacchi N. Single step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. // Anal Biochem -1987. V.162.-P.156−159.
  27. Chung Y. S. Propagation of Sindbis virus, Murray Valley encephalitis virus and Getah virus. // J Comp Pathol 1969. — Vol. 79(2). — P. 245−249.
  28. Chung Y. S. Susceptibility of chickens, mice and chick embryos to sindbis, Murray Valley encephalitis and Getah viruses. // J Comp Pathol 1969. -Vol. 79(3).-P. 335−339.
  29. Cloonan M. J., O’Neill B. J., Vale T. G., Carter I. W., Williams J. E. Ross River virus activity along the south coast of New South Wales. // Aust J Exp Biol Med Sci 1982. — Vol. 60(6). — P. 701−706.
  30. Dalgarno L., Rice С. M., Strauss J. H. Ross River virus 26S RNA: complete nucleotide sequence and deduced sequence of the encoded structural proteins.//Virology- 1983.-Vol. 129.-P. 170−187.
  31. Faragher S. G., Dalgarno L. Regions of conservation and divergence in the 3' untranslated sequences of genomic RNA from Ross River virus isolates. // JMol Biol- 1986.-Vol. 190(2).-P. 141−148.
  32. Faragher S. G., Meek A. D. J., Rice С. M., Dalgarno L. Genome sequences of a mouse-avirulent and a mouse-virulent strain of Ross River virus. // Virology- 1988. Vol. 163. — P. 509−526.
  33. Fukunaga Y., Kumanomido Т., Imagawa H., Ando Y., Kamada M., Wada R., Akiyama Y. Isolation of picornavirus from horses associated with Getah virus infection. // Nippon Juigaku Zasshi 1981. — Vol. 43(4). — P. 569−572.
  34. Fukunaga Y, Kumanomido T, Kamada M. Getah virus as an equine pathogen. // Vet Clin North Am Equine Pract 2000. — Vol 16(3). — P. 605 617.
  35. Garoff H., Frischauf A. M., Simons K., Lehrach H., Delius H. Nucleotide sequence of cDNA coding for Semliki Forest virus membrane glycoproteins. // Nature 1980. — Vol. 288. — P. 236−241.
  36. Greiser-Wilke I., Moenning V., Kaaden O. R., Figueiredo L. T. Most alphaviruses share a conserved epitopic region on their nucleocapsid protein. // J Gen Virol 1989. — Vol. 70. — P. 743−748.
  37. Griffin D. E. Alphaviruses // Fields Virology / Eds. D. M. Knipe, P. M. Howley. 4-th Ed. — Philadelphia, 2001. — P. 890−922.
  38. Griffin D. E. Alphavirus pathogenesis and immunity. // The Togaviridae and Flaviviridae. / Eds. S. Schlesinger, M. J. Schlesinger Plenum Publishing Corp, N. Y. — 1986. — P. 209−250.
  39. Harrison S. C. Alphavirus structure. // The Togaviridae and Flaviviridae. / Eds. S. Schlesinger, M. J. Schlesinger Plenum Publishing Corp, N. Y. -1986.-P. 21−34.
  40. Hiruma M, Ide S, Hohdatsu T, Yamagishi H, Tanaka Y, Fujisaki Y. Polymyositis in mice experimentally inoculated with Getah virus. // Nippon Juigaku Zasshi 1990. — Vol. 52(4). — P. 767−772.
  41. Hohdatsu T, Ide S, Yamagishi H, Eiguchi Y, Nagano H, Maehara N, Tanaka Y, Fujisaki Y, Yago K, Taguchi K. Enzyme-linked immunosorbent assay for the serological survey of Getah virus in pigs. // Nippon Juigaku Zasshi 1990. — Vol. 52(4). — P. 835−837.
  42. Hohdatsu T, Takahasi N, Ide S, Yamagishi H, Saito H, Fujisaki Y, Koyama H. The relation between pathogenicity and plaque size of Getah virus Kanagawa strain in suckling mice. // Nippon Juigaku Zasshi 1990. -Vol. 52(3).-P. 519−526.
  43. Igarashi A., Buei K., Ueba N., Yoshida M., Ito S., Nakamura H., Sasao F., Fukai K. Isolation of viruses from female Culex tritaeniorhynchus in Aedes albopictus cell cultures. // Am J Trop Med Hyg 1981. — Vol. 30(2). — P. 449−460.
  44. Imagawa H., Ando Y., Kamada M., Sugiura Т., Kumanomido Т., Fukunaga Y., Wada R., Hirasawa K., Akiyama Y. Seroepizootiological survey on Getah virus infection in light horses in Japan. // Nippon Juigaku Zasshi -1981.-Vol. 43(6).-P. 797−802.
  45. Izumida A., Takuma H., Inagaki S., Kubota M., Hirahara Т., Kodama K., Sasaki N. Experimental infection of Getah virus in swine. // Nippon Juigaku Zasshi -1988. Vol. 50(3). — P. 679−684.
  46. Johnson В. K. O’nyong-nyong virus disease. // The arboviruses: epidemiology and ecology. / Ed. P. Monath, Boca Raton, Fla, 1988. — Vol. 3.-P. 217−223.
  47. Johnston R. E., Peters C. J. Alphaviruses. // Fields Virology. / Eds. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley 3rd Ed. — Lippincott-Raven, N.Y., 1996.-P. 843−898.
  48. Justman J., Klimjack M. R., Kielian M. Role of spike protein conformational changes in fusion of Semliki Forest virus. // J Virol 1993. -Vol. 67.-P. 7597−7607.
  49. Karabatsos N. Antigenic relationships of group A arboviruses by plaque reduction neutralization testing. // Am J Trop Med Hyg 1975. — Vol. 24(3). -P. 527−532.
  50. Kamada M., Ando Y., Fukunaga Y., Kumanomido Т., Imagawa H., Wada R., Akiyama Y. Equine Getah virus infection: isolation of the virus from racehorses during an enzootic in Japan. // Am J Trop Med Hyg 1980. -Vol. 29(5).-P. 984−988.
  51. Kamada M., Kumanomido Т., Ando Y., Fukunaga Y., Imagawa H., Wada R., Akiyama Y. Studies on Getah virus: some biological, physicochemical and antigenic properties of the MI-110 strain. // Nippon Juigaku Zasshi -1982.-Vol. 44(1).-P. 89−96.
  52. Kamada M., Kumanomido Т., Wada R., Fukunaga Y., Imagawa H., Sugiura T. Intranasal infection of Getah virus in experimental horses. // J Vet Med Sci- 1991.-Vol. 53(5). P. 855−858.
  53. Kamada M., Wada R, Kumanomido Т., Imagawa H., Sugiura Т., Fukunaga Y. Effect of viral inoculum size on appearance of clinical signs in equine Getah virus infection. // J Vet Med Sci 1991. — Vol. 53(5). — P. 803−806.
  54. Kanamitsu M., Taniguchi K., Urasawa S., Ogata Т., Wada Y., Wada Y., Saroso J. S. Geographic distribution of arbovirus antibodies in indigenous human populations in the Indo-Australian archipelago. // Am J Trop Med Hyg- 1979.-Vol. 28(2).-P. 351−363.
  55. Kawamura H., Yago K., Narita M., Imada Т., Nishimori Т., Haritani M. A fatal case in newborn piglets with Getah virus infection: pathogenicity of the isolate. // Nippon Juigaku Zasshi -1987. Vol. 49(6). — P. 1003−1007.
  56. Kerr P. J., Fitzgerald S., Tregear G. W., Dalgarno L., Weir R. C. Characterization of a major neutralization domain of Ross River virus using anti-viral and anti-peptide antibodies. // Virology 1992. — Vol. 187. — P. 338−342.
  57. Khan A. H., Morita K., Parquet M.C., Hasebe F., Mathenge E. G. M., Igarashi A. Complete nucleotide sequence of chikungunya virus and evidence for an internal polyadenylation site. // J of Gen Virol. 2002. -Vol. 83.-P. 3075−3084.
  58. Kimura Т., Ueba N. Some biological and serological properties of large and small plaque variants of Getah virus. // Arch Virol 1978. — Vol. 57(3). — P. 221−229.
  59. Kimura Т., Ueba N., Minekawa Y. Studies on the mechanism of antibody-mediated enhancement of Getah virus infectivity. // Biken J 1981. — Vol. 24(1−2).-P. 39−45.
  60. Kono Y., Getah virus disease. // The Arboviruses. Epidemiology and Ecology. I Ed T.P. Monath, Boca Raton, 1988. — P. 21−36.
  61. Kono Y., Sentsui H., Ito Y. An epidemic of Getah virus infection among racehorses: properties of the virus. // Res Vet Sci 1980. — Vol. 29(2). — P. 162−167.
  62. Ksiazek T. G., Trosper J. H., Cross J. H., Basaca-Sevilla V. Isolation of Getah virus from Nueva Ecija Province, Republic of the Philippines. // Trans R Soc Trop Med Hyg 1981. — Vol. 75(2). — P. 312−313.
  63. Kuhn R. J., Niesters H. G. M., Zhang H., Strauss J. H. Infectious RNA transcripts from Ross River virus cDNA clones and the construction and characterization of defined chimeras with Sindbis virus. // Virology 1991. -Vol. 182.-P. 430−441.
  64. Kumanomido Т., Fukunaga Y., Kamada M., Imagawa H., Ando Y., Wada R., Nitta M., Akiyama Y. Getah virus isolations from mosquitoes in an enzootic area in Japan. // Nippon Juigaku Zasshi 1986. — Vol. 48(6). — P. 1135−1140.
  65. Kumanomido Т., Fukunaga Y., Kamada M., Imagawa H., Ando Y., Wada R., Nitta M., Akiyama Y. Getah virus isolations from mosquitoes collected at two horse habitations in the western areas of Japan. // Nippon Juigaku Zasshi -1986.-Vol. 48(6).-P. 1191−1197.
  66. Kumanomido Т., Kamada M., Wada R., Kenemaru Т., Sugiura Т., Akiyama Y. Pathogenicity for horses of original Sagiyama virus, a member of the Getah virus group. // Vet Microbiol 1988. — Vol. 17(4). — P. 367−373.
  67. Kumanomido Т., Wada R., Kanemaru Т., Kamada M., Akiyama Y., Matumoto M. Transplacental infection in mice inoculated with Getah virus. //Vet Microbiol- 1988.-Vol. 16(2).-P. 129−136.
  68. Kumanomido Т., Wada R., Kanemaru Т., Kamada M., Hirasawa K., Akiyama Y. Clinical and virological observations on swine experimentally infected with Getah vims. // Vet Microbiol 1988. — Vol. 16(3). — P. 295 301.
  69. Kumar S, Tamura K, Nei M. MEGA3: Integrated software for Molecular Evolutionary Genetics Analysis and sequence alignment. // Brief Bioinform. -2004.-Vol 5(2).-P. 150−63.
  70. Leake C. J., Ussery M. A., Nisalak A., Hoke С. H., Andre R. G., Burke D. S. Virus isolations from mosquitoes collected during the 1982 Japanese encephalitis epidemic in northern Thailand. // Trans R Soc Trop Med Hyg -1986.-Vol. 80(5).-P. 831−837.
  71. Li X. D., Qiu F. X., Yang H. et al. Isolation of Getah virus from mosquitos collected on Hainan Island, China, and results of a serosurvey. // Southeast Asian J Trop Med Public Health 1992. — Vol. 23(4). — P. 730−734.
  72. Marchette N. J, Rudnick A, Garcia R. Alphaviruses in Peninsular Malaysia: II. Serological evidence of human infection. // Southeast Asian J Trop Med Public Health 1980. — Vol. 11(1). — P. 14−23.
  73. Marchette N. J, Rudnick A, Garcia R, MacVean D. W. Alphaviruses in Peninusular Malaysia: I. Virus isolations and animal serology. // Southeast Asian J Trop Med Public Health 1978. — Vol. 9(3). — P. 317−329.
  74. Marshall I. D, Miles J. A. R. Ross River virus and epidemic polyarthritis. // Curr Top Vector Res 1984. — Vol. 2. — P. 31−56.
  75. Mathiot С. C, Grimaud G, Garry P, Bouquety J. C, Mada A, Daguisy A. M, Georges A. J. An outbreak of human Semliki Forest virus infections in Central African Republic. // Am J Trop Med Hyg 1990. — Vol. 42. — P. 386−393.
  76. Matsumura Т., Goto H, Shimizu K, Ando Y, Imagawa H, Sugiura T, Akiyama Y, Taya Y. Prevalence of antibodies against Getah virus in horses raised in Hokkaido. // Nippon Juigaku Zasshi 1981. — Vol. 43(5). — P. 783 786.
  77. Mitchell C. J, Lvov S. D, Savage H. M, Calisher С. H, Smith G. C, Lvov D. K, Gubler D. J. Vector and host relationships of California serogroup viruses in western Siberia. // Am J Trop Med Hyg 1993. — Vol. 49(1). — P. 53−62.
  78. Morita K., Igarashi A. Oligonucleotide fingerprint analysis of strains of Getah virus isolated in Japan and Malaysia. // J Gen Virol 1984. — Vol. 65(11).-P. 1899−1908.
  79. Morrison Т., Portner A. Structure, function, and intracellular processing of the glycoproteins of Paramyxoviridae. II The paramyxoviruses. // Ed. Kingsbury D. W. Plenum Publishing Corp., New York. 1991. — P. 347 382.
  80. J. S., Amerasinghe P. H., Amerasinghe F. P., Calisher С. H., Perera L. P., Arunagiri С. K., Munasingha N. В., Karunaratne S. H. Viruses isolated from mosquitoes collected in Sri Lanka. // Am J Trop Med Hyg 1994. -Vol. 51(2).-P. 154−161.
  81. Pfeffer M., Kinney R. M., Kaaden 0. R. The alphavirus З'-nontranslated region: size heterogeneity and arrangement of repeated sequence elements. // Virology-1998. Vol.240.-P. 100−108.
  82. Pinheiro F. P., LeDuc J. W. Mayaro virus disease. // The arboviruses: epidemiology and ecology. / Ed. P. Monath, Boca Raton, Fla, 1988. — P. 137.
  83. Powers A. M., Brault A. C., Shirako Y. et al. Evolutionary Relationships and Systematics of the Alphaviruses. // J of Virol 2001. — Vol. 75(21). — P. 10 118−10 131.
  84. A. M., Brault A. C., Tesh R. В., Weaver S. C. Reemergence of Chikungunya and O’nyong-nyong viruses: evidence for distinct geographical lineages and distant evolutionary relationships. // J Gen Virol 2000. — Vol. 81.-P. 471−479.
  85. Scherer W. F., Funkenbusch M., Buescher E. L., Izumi Т., Sagiyama virus, a new group A arthropodborne virus from Japan. I. Isolation, immunologicclassification, and ecological observations. // Am J Trop Med Hyg 1962. -Vol. 11.-P. 255−268.
  86. Scherer W. F., Izumi Т., McCown J., Hardy J. L. Sagiyama virus. II. Some biologic, physical, chemical and immunologic properties. // Am J of Trop Med Hyg 1962. — Vol. 11. — P. 269−282.
  87. Schlesinger S., Schlesinger M. J. Togaviridae: the viruses and their replication. // Fields Virology. / Eds. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley 3rd Ed. — Raven Press, N.Y., 1996. — P. 825−842.
  88. Sentsui H., Kono Y. An epidemic of Getah virus infection among racehorses: isolation of the virus. // Res Vet Sci 1980. — Vol. 29(2). — P. 157−161.
  89. Sentsui H., Kono Y. Survey on antibody to Getah virus in horses in Japan. // Natl Inst Anim Health Q (Tokyo) 1980. — Vol. 20(2). — P. 39−43.
  90. Sentsui H., Kono Y. Pathogenicity of Getah virus for mice. //Natl Inst Anim Health Q (Tokyo) 1981. — Vol. 21(1). — P. 7−13.
  91. Sentsui H., Kono Y. Reappearance of Getah virus infection among horses in Japan. // Nippon Juigaku Zasshi 1985. — Vol. 47(2). — P. 333−335.
  92. Sjoberg M., Garoff H. Interactions between the transmembrane segments of the alphavirus El and E2 proteins play a role in virus budding and fusion. // J of Virol 2003. — Vol. 77(6). — P. 3441−3450.
  93. Shibata I., Hatano Y., Nishimura M., Suzuki G., Inaba Y. Isolation of Getah virus from dead fetuses extracted from a naturally infected sow in Japan. // Vet Microbiol 1991. — Vol. 27(3−4). — P. 385−91.
  94. ShirakoY., Yamaguchi Y. Genome structure of Sagiyama virus and its relatedness to other alphaviruses. // J of Gen Virol 2000, — Vol.81, — P. 1353−1360.
  95. Shortridge К. F., Mason D. K" Watkins K. L., Aaskov J. G. Serological evidence for the transmission of Getah virus in Hong Kong. // Vet Rec -1994. Vol. 134(20). — P. 527−528.
  96. Srivastava A. K., Igarashi A. Structural proteins of Getah virus isolates from Japan and Malaysia. // Acta Virol 1986. — Vol. 30(2). — P. 126−130.
  97. Strauss E. G., benches E. M., Strauss J. H. Molecular genetic evidence that the hydrophobic anchors of glycoproteins E2 and El interact during assembly of alphaviruses. // J of Virol 2002. — Vol. 76(20). — P. 1 018 810 194.
  98. Strauss E. G., Strauss J. H. Structure and replication of the alphavirus genome. // The Togaviridae and Flaviviridae. / Eds. Schlesinger S., Schlesinger M. J. Plenum Publishing Corp., N. Y. — 1986. — P. 35−90.
  99. Strauss J. H., Strauss E. G. The alphaviruses: gene expression, replication, and evolution. // Microbiol Rev 1994. Vol. 58. — P. 491−562.
  100. Sugiura Т., Ando Y., Imagawa H., Kumanomido Т., Fukunaga Y., Kamada M., Wada R., Hirasawa K, Akiyama Y. An epizootiological study of Getah virus among light horses in Japan in 1979. // Bull Equine Res Inst — 1981. — Vol. 18.-P. 103−109.
  101. Sugiura Т., Fukunaga Y., Hirasawa K. Epizootics of Getah virus infection in horses in the Kanto region of Japan 1983. // Bull Equine Res Inst 1984. -Vol. 21.-P. 19−27.
  102. Sugiura Y., Ohta C., Goto H. A dot-immunobinding assay for the detection of antibody to Getah virus in horses. // Aust Vet J 1989. — Vol. 66(10). — P. 340−341.
  103. Sugiura Т., Shimada K. Seroepizootiological survey of Japanese encephalitis virus and Getah virus in regional horse race tracks from 1991 to 1997 in Japan. // J Vet Med Sci 1999. — Vol. 61 (8). — P. 877−881.
  104. Takashima I., Hashimoto N. Getah virus in several species of mosquitoes. // Trans R Soc Trop Med Hyg 1985. — Vol. 79(4). — P. 546−550.
  105. Takashima I., Hashimoto N., Arikawa J., Matsumoto K. Getah virus in Aedes vexans nipponii and Culex tritaeniorhynchus: vector susceptibility and ability to transmit. 11 Arch Virol 1983. — Vol. 76(4). — P. 299−305.
  106. Takkinen K. Complete nucleotide sequence of the nonstructural protein genes of Semliki Forest virus. // Nucleic Acids Research 1986. — Vol. 14. -P. 5667−5682.
  107. R. В., Watts D. M., Russell K. L., Damodaran C., Calampa C., Cabezas C., Ramirez G., Vasquez В., Hayes C. G., Rossi C. A., Powers A. M., Hice C. L., Chandler L. J., Cropp В. C., Karabatsos N., Roehrig J. Т.,
  108. Gubler D. J. Mayaro virus disease: an emerging mosquito-borne zoonosis in tropical South America. // Clin Infect Dis 1999. — Vol. 28. — P. 67−73.
  109. Ueba N, Kimura T. Polykaryocytosis induced by certain arboviruses in monolayers of BHK-21−528 cells. // J Gen Virol 1977. — Vol. 34(2). — P. 369−373.
  110. Van Regenmortel M. H, Mahy B. W. Emerging issues in virus taxonomy. // Emerg Infect Dis 2004. — Vol. 10(1). — P. 8−13.
  111. Venien-Bryan C., Fuller S.D. The organization of the spike complex of Semliki Forest virus. // J Mol Biol 1994. — Vol. 236(2). — P. 572−583.
  112. Vrati S., Faragher S. G, Weir R. C, Dalgarno L. Ross River virus mutant with a deletion in the E2 gene: properties of the virion, virus-specific macromolecule synthesis, and attenuation of virulence for mice. // Virology -1986.-Vol. 151.-P. 222−232.
  113. Vrati S, Fernon C. A, Dalgarno L, Weir R. C. Location of a major antigenic site involved in Ross River virus neutralization. // Virology 1988. -Vol. 162.-P. 346−353.
  114. Wada R, Kamada M, Fukunaga Y, Ando Y, Kumanomido T, Imagawa H, Akiyama Y, Oikawa M. Equine Getah virus infection: pathological study of horses experimentally infected with the MI-110 strain. // Nippon Juigaku Zasshi 1982. — Vol. 44(3). — P. 411−418.
  115. S. С. Evolution of alphaviruses. // Molecular basis of virus evolution. / Eds. A. J. Gibbs, С. H. Calisher, F. Garcia-Arenal Cambridge University Press, Cambridge, 1995.-P. 501−530.
  116. Wekesaa S. N., Inoshimaa Y., Murakamia K., Sentsui H. Genomic analysis of some Japanese isolates of Getah virus. // Vet Microbiol 2001. — Vol. 83. -P. 137−146.
  117. W. R., Kaluza G., Boschek С. В., Barrier H., Hager H., Schutz H. J., Feistner H. Semliki Forest virus: cause of a fatal case of human encephalitis. // Science 1979. — Vol. 203. — P. 1127−1129.
  118. Yago K., Hagiwara S., Kawamura H., Narita M. A fatal case in newborn piglets with Getah virus infection: isolation of the virus. // Nippon Juigaku Zasshi 1987. — Vol. 49(6). — P. 989−994.
  119. Yamaguchi Y., Shirako Y. Engineering of a Sagiyama alphavirus RNA-based transient expression vector. // Microbiol Immunol 2002. — Vol. 46(2).-P. 119−129.
  120. Yoshinaka Y., Okada S., Shiomi T. Hemolytic activity of a togavirus, Getah. // Microbiol Immunol 1979. — Vol. 23(2). — P. 95−103.
  121. Zhao H., Garoff H. Role of cell surface spikes in alphavirus budding. // J of Virol 1992. — Vol. 66(12). — P. 7089−7095.
  122. Международная база данных NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Заполнить форму текущей работой

На отлично!