Молекулярно-вирусологическое исследование вируса иммунодефицита человека на ранней фазе эпидемии ВИЧ/СПИД

4.4.

Заключение

.

В 1987;1988 гг. нами впервые была выявлена ВИЧ-инфекция в Ленинграде. Эти результаты относится к числу первых случаев выявления ВИЧ-инфекции в России. Первоначально основную группу лиц, инфицированных ВИЧ, составили студенты ВУЗов, приехавшие из стран центрально-африканского региона, а также женщины, имевшие сексуальные контакты с африканцами. При этом впервые были получены данные о высокой ВИЧ-инфици-рованности в Эфиопии, на что указывала высокая выявляемость ВИЧ-серопозитивных студентов, прибывших из этой страны.

Было выявлено большинство возможных путей передачи вируса, причем передача от матери ребенку — впервые в стране. Были зарегистрированы первый в стране ВИЧ-инфицированный донор и первая смерть от СПИДа.

Эти открытия сыграли важную роль в развитии всей системы противоэпидемических мероприятий и эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией как в городе, так и в стране в целом.

Была создана система лабораторной диагностики ВИЧ-инфекции в С.-Петербурге, внедрены методы подтверждающей диагностики и мониторинга ВИЧ-инфекции, включающие иммуноблоттинг, полимеразную цепную реакцию, выделение вируса и определение иммунного статуса. Это позволило получить подробные характеристики клинического материала и убедительные данные о ходе развития эпидемического процесса в городе.

Изучено качество тестирования на ВИЧ в лабораториях С.-Петербурга и России. По результатам работы, проделанной в 1992;1996 гг., выявляемость положительных контрольных сывороток в России составила 90,4%, а отрицательных — 98,2%. Абсолютно точный ответ по контрольным панелям дали 80% лабораторий. Эти цифры характеризуют качество лабораторной диагностики на ВИЧ в стране как достаточно высокое. Кроме того, качество лабораторной диагностики от года к году возрастает.

Предпринятое нами в инициативном порядке исследование качества работы скринин-говых лабораторий превратилось по существу в национальную программу контроля качества лабораторной диагностики на ВИЧ-инфекцию, в которой приняло участие 248 лабораторий. Наши данные свидетельствуют о том, что эта программа, во взаимодействии с производственниками тест-систем и скрининговыми лабораториями, способствовала повышению качества работы лабораторий и тест-систем.

Поскольку качество лабораторной диагностики на ВИЧ-инфекцию в С.-Петербурге и в России в целом находится на достаточно высоком уровне, относительно низкое число ВИЧ-инфицированных, зарегистрированных в 1987;1996 гг., отражало реальную эпидемиологическую ситуацию, а не являлось артефактом, связанным с плохой лабораторной практикой. Таким образом, эти полученные нами данные являются одним из доказательств того, что в России в 1987;1996 гг. имела место ранняя фаза эпидемии ВИЧ/СПИД.

Данные о низком числе ВИЧ-инфицированных, другие эпидемиологические данные, а также вирусологические исследования свидетельствуют о том, что в С.-Петербурге и в России в целом в 1987;1996 гг. имела место ранняя фаза эпидемии ВИЧ-инфекции. ВИЧ-1 присутствовал в С.-Петербурге уже в 1982 году, когда родилась ВИЧ-инфицированная девочка. ВИЧ мог проникнуть в С.-Петербург непосредственно из Африки, а также из США и Западной Европы. В С.-Петербурге ранняя фаза эпидемии ВИЧ/СПИД протекала с приблизительно равной представленностью гомои гетеросексуальных путей передачи, в отличие от общей ситуации в мире, где протекают по крайней мере две эпидемии ВИЧ/СПИД: одна — с гетеросексуальным путем передачи — в Африке и Азии, где инфицировано свыше 25 млн. человекдругая — с гомосексуальным путем передачи и среди наркоманов — в США и странах Западной Европы, где инфицированных приблизительно на порядок меньше.

Отсутствие до самого последнего времени широкомасштабной эпидемии ВИЧ/СПИД в С.-Петербурге и в России, при возможности достаточно раннего проникновении ВИЧ непосредственно из Африки, может свидетельствовать о наличии сдерживающих факторов, как социальных, так и биологических, в особенности в отношении африканских субтипов ВИЧ, о более позднем, чем принято думать, распространении ВИЧ в Африке и/или о более низкой инфекционности ВИЧ-инфицированных африканцев.

Серотипирование с использованием синтетических пептидов показало, что в С.-Петербурге представлены серотип В ВИЧ-1 и отличные от В серотипы ВИЧ. Серотипом В оказалось инфицированным подавляющее большинство гомосексуалистов, а (не-В)-серотипомженщины, имевшие беспорядочные половые связи. Хотя (не-В) — (предположительно, африканские) серотипы присутствовали в городе раньше серотипа В, распространение последнего в 1987;1996 гг. было более быстрым. В этот период в С.-Петербурге эпидемия ВИЧ/СПИД фактически включала два эпидемических процесса: один — вызванный серотипом В ВИЧ-1, другой — (не-В)-серотипами, причем различные серотипы ВИЧ-1 передавались разными типами сексуальных контактов (гомосексуальным и гетеросексуальным).

Серотипирование сывороток московских ВИЧ-инфицированных показало, что 75% ВИЧ-инфицированных гомосексуалистов инфицировано серотипом В ВИЧ-1, в то время как большинство ВИЧ-инфицированных наркоманов инфицированы (не-В)-серотипами ВИЧ-1.

Нынешний этап развития эпидемии ВИЧ/СПИД на Украине связан с распространением серотипа В, а также (не-В)-серотипов ВИЧ-1 и характеризуется быстрым ростом инфицирования шприцевых наркоманов. Наркоманы различных регионов инфицируются разными се-ротипами ВИЧ-1. Полученные данные свидетельствуют о независимых путях проникновения ВИЧ-1 в популяции наркоманов различных регионов Украины.

Общей закономерностью ранней фазы эпидемии ВИЧ/СПИД в России и ближнем зарубежье является множественное и независимое проникновение различных серотипов ВИЧ в различные группы риска и географические регионы. При этом в целом Ви (не-В)-серотипы ВИЧ-1 представлены в сопоставимых пропорциях. Это обстоятельство является чрезвычайно важным для разработки стратегии создания отечественной вакцины против ВИЧ.

Из клеток серопозитивных лиц нами был выделен и охарактеризован вирус иммунодефицита человека. Частота выделения ВИЧ-1 в кратковременных переживающих культурах мононуклеарных клеток периферической крови составила около 70%. В большинстве культур продукция вируса отличалась низким уровнем продукции вирусного антигена р24 в культуральной жидкости, что является характерным для медленно реплицирующихся штаммов ВИЧ-1. Нами был обнаружен также быстро реплицирующийся штамм ВИЧ-1 у пациента Бр47, характеризовавшийся высоким уровнем и большей продолжительностью продукции вирусного антигена. Все выделенные вирусы обладали способностью к заражению пермис-сивных линий клеток. Наблюдался цитопатический эффект ВИЧ-1 в культуре, который коррелировал с уровнем и продолжительностью продукции вируса.

Проведенный нами анализ аминокислотных последовательностей УЗ-петли свидетельствует о том, что с.-петербургские изоляты являются макрофаготропными вариантами ВИЧ-1, не индуцирующими образование синцитиев, и относятся к так называемым «з^у^Лошл-вариантам вирусов, характеризующимся низкой скоростью репликации. Таким образом, выводы, полученные на основе молекулярно-биологических данных, находятся в соответствии с выводами, полученными на основе вирусологических данных.

Молекулярно-филогенетический анализ с использованием различных компьютерных методов позволяет сделать вывод, что проанализированные нами нуклеотидные последовательности с.-петербургских изолятов ВИЧ-1, найденных у гомосексуалистов, соответствуют субтипу В. Этот вывод, полученный на основе молекулярно-биологических данных, находится в согласии с результатами серотипирования с использованием синтетических УЗ-пептидов.

Определение генетических дистанций между нуклеотидными последовательностями с.-петербургских изолятов ВИЧ-1 показало, что средняя величина генетической дистанции между ними составляет 12,4%, что сопоставимо с аналогичной величиной в США (10−11%) при очевидном отличии в степени развития эпидемии. Молекулярно-филогенетический анализ нуклеотидных последовательностей изолятов ВИЧ-1, циркулирующих в С.-Петербурге, и нуклеотидных последовательностей различных известных изолятов ВИЧ-1 субтипа В показал, что наши последовательности образуют группы с последовательностями субтипа В ВИЧ-1 из различных регионов мира, в том числе из Северной Америки и Африки, и широко распределены по филогенетическому древу. Высокий уровень генетической вариабельности с.-петербургских изолятов ВИЧ-1 субтипа В и их широкое распределение по филогенетическому древу изолятов субтипа В ВИЧ-1 различного географического происхождения свидетельствуют о множественном и независимом проникновении различных вариантов субтипа В ВИЧ-1 в С.-Петербург. Это позволяет сформулировать гипотезу о различном происхождении разнообразия субтипа В ВИЧ-1 на ранней и развитой стадиях эпидемии ВИЧ/СПИД.

Разнообразие найденных в Санкт-Петербурге изолятов ВИЧ-1 на уровне нуклеотидных и аминокислотных последовательностей характеризуется наличием как общих закономерностей с уже описанными в литературе, так и некоторых отличий, к которым относятся впервые обнаруженные нами последовательности вершины УЗ-петли — АРОБ (изолят 8р88), АРОв (изолят 8р72) и НМОРООТР (изолят 8р42) — ранее не описанные в литературе ни для одного из известных изолятов ВИЧ-1.

При культивировании мононуклеарных клеток пациента 8р17 с помощью электронной микроскопии впервые нами был обнаружен вирус размером 125−160 нм с характерной для Негрезушс1ае морфологией, однако отличающийся от всех описанных до этого герпесвиру-сов. Этот новый герпесвирус может играть роль в патогенезе ВИЧ/СПИД, в т. ч. в патогенезе саркомы Капощи.

На основе полученных нами и имеющихся в литературе данных можно заключить, что принятый в России эпидемиологический подход к проблеме ВИЧ/СПИД, существенной частью которого является широкое направленное лабораторное тестирование в сочетании с лечением и консультированием, являлся эффективным для борьбы с эпидемией ВИЧ/СПИД на ее ранней стадии и в соответствующих социально-экономических условиях.

Вместе с тем, имеющиеся данные заставляют сформулировать негативный прогноз развития эпидемии ВИЧ/СПИД в России [200] в случае, если не будет реализована стратегия активного профилактического вмешательства [19], в первую очередь предусматривающая разработку вакцины против ВИЧ.

1. Асеев М. В., Шауи А., Дин М., Баранов В. С. Популяционные особенности частот мутации гена хемокинового рецептора CCR-5, определяющего чувствительность к вирусу СПИДа // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1997. — Т. 1, № 1. — С. 128.

2. Анджапаридзе О. Г., Мацевич Г. Р., Маренникова С. С. Иммуноферментный анализ для выявления антигенов ВИЧ (применение, возможности, ограничения) // Вопр. вирусол. -1991.-Т. 36,№ 3,-С. 180−181.

3. Богач В. В., Троценко О. Е. ВИЧ-инфекция на Дальнем Востоке России // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1998. — N. 2, № 2. — С. 36.

4. Боев Б. В., Франк К. Д., Шашков В. А. Математическое моделирование и прогнозирование массовых эпидемических процессов // Проблемы инфектологии / ред. С. В. Прозоровский. -М.: Медицина, 1991. С. 314−322.

5. Васильева В. И., Сероэпидемиологический контроль в системе эпидемиологического надзора за инфекционными заболеваниями // Проблемы инфектологии / ред. С. В. Прозоровский. М.: Медицина, 1991. — С. 306−314.

6. Вейр Б. Анализ генетических данных. М.: Мир, 1997. — 400 с.

7. Голосова Т. В., Хаитов Р. М., Лиознер А. Л. Итоги серологического исследования на СПИД в СССР в 1986;1986 гг. // Иммунология. 1987. — № 6. — С. 87−89.

8. Демидов А. Законодательство в области ВИЧ/СПИД и немедицинского потребления наркотических и психотропных веществ // Русский журнал ВИЧ/СПИД. 1997. — Т. 1, № 1. — С. 69−78.

9. Евтушенко В. И., Плюснин А. 3,. Козлов А. П., Сейц И. Ф. Изучение субклеточной локализации и прочности связи с клеточными структурами низкомолекулярных РНК // Цитология.-1979.-Т. 21, № 10.-С. 1175−1180.

10. Евтушенко В. И., Курбатова Т. В., Козлов А. П. Гибридизация низкомолекулярных ядерных РНК с ядерной РНК и рестрикционными фрагментами ДНК // Молекулярная биология. 1984. — Т. 18, № 5. — С. 1424−1431.

11. Елов А. А., Козлова А. В., Медников Б. Н., Корнилаева Г. В., Папуашвили М. Н., Прокопенко В. Д., Карамов Э. А. Детекция провируса в ДНК лимфоцитов. Мониторинг ВИЧ-инфекции на генетическом уровне // Вопр. вирусол. 1994. — Т. 39, № 3- С. 107— 110.

12. Исхаков А. Т., Алексеев Л. П., Бачурин П. С., Яздовский В. В. Комплементзависимый микролимфоцитолиз для количественного анализа субпопуляций лимфоцитов // Иммунология. 1988. -№ 6. — С. 75−76.

13. Карамов Э. В., Богомолов Б. П., Жданов В. М. Выделение ВИЧ от пациента с лимфо-аденопатией // Обзор центров ВОЗ. М., 1986. — С. 45⁴⁷.

14. Козлов А. П., Решетников В. Л., Корж В. П., Нейфах А. А. Чужеродная ДНК в развивающихся зародышах вьюна Misgurnus /оязШя II Молекулярная биология. 1988. -Т. 22, № 6.-С. 1614−1622.

15. Козлов А. П. На пути к эффективной стратегии против ВИЧ/СПИД: опыт России // Тезисы 3-ей Международной конференции «СПИД, рак и родственные проблемы», Санкт-Петербург, Россия, 1995.

16. Козлов А. П. Активное профилактическое вмешательство стратегия борьбы с эпидемией ВИЧ/СПИД на новом этапе ее развития в России // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. — 1998.-Т. 2., № 1. — С. 3−10.

17. Кондрусев А. И., Наркевич М. И. Основные итоги и направления деятельности Минздрава СССР в борьбе против СПИДа // Профилактика и борьба со СПИДом в СССР. Тез. докл. 1-й Всес. науч.-практ. конф. JI., 1990. — С. 3−5.

18. Момот О. Ф., Смольская Т. Т., Ташкинова И. П., Шилова Э. А., Терентьева Ж. В., Луб-кина М. О., Райская В. А. Развитие эпидемии ВИЧ-инфекции среди наркоманов // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1997. — Т. 1, № 1. — С. 125.

19. Онищенко Г. Г., Наркевич М. И., Голиусов, А. Т. ВИЧ-инфекция, развитие эпидемии в Российской Федерации // Ж. микробиол. эпидемиол. иммунобиол. 1997. — № 6 -С. 47−50.

20. Петров Р. В., Хаитов Р. М., Сидорович И. Г. и др. Пути расширения диагностических возможностей синтетических детерминант белков HIV // Иммунология. 1988. — № 4 -С. 20−23.

21. Покровский А. Г., Плясунова О. А., Сандахчиев Л. С., Киселев О. И., Чупахин О. Н., Чарушин В. Н., Понизовский М. Г., Дубур Г. Я., Бисениекс Э. А. Анти-ВИЧ-активность сложных эфиров изоборнеола // ДАН. 1992. — Т. 326 — С. 376−379.

22. Покровский В. И., Покровский В. В. Синдром приобретенного иммунодефицита. М.: Медицина, 1988.

23. Покровский В. И., Анджапаридзе О. Г., Урываев JI. В., Решетникова JI. Н. О научных исследованиях по проблеме СПИД в Российской Федерации // Вопр. вирусол. 1993. -Т. 38, № 2.-С. 50−53.

24. Рытик П. Г., Кучеров И. И., Подольская И. А., Коржев, М. О, Глазовский В. А., Фирсо-ва, Н. П. ВИЧ-инфекция в Беларуси (1987;1997 гг.) // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. -1998.-Т. 2,№ 2.-С. 38.

25. Смольская Т. Т., Коровина Г. И., Новикова В. А., Власов H. Н., Сизова Н. В., Бурова Н. В. Изучение генотипов ВИЧ-1, циркулирующих в России (1987;1996 гг.) // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1997. — Т. 1, № 1. — С. 132.

26. Смольская Т. Т., Лиитсола К., Салминен М., Лейникки П., Ташкинова И. П., Момот О. Ф., Коровина Г. И., Кевлова Н. А. Рекомбинантный штамм ВИЧ-1, вызвавший эпидемию в Калининграде // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1998. — Т. 2, № 2. — С. 39.

27. Хаитов Р. М., Игнатьева Г. А. СПИД. М., 1992.

28. Хаитов Р М., Сидорович И. Г., Павликов С. П. Использование синтетических пептидов в диагностике ВИЧ-инфекции // Иммунология. 1990. — № 2. — С. 15−20.

29. Щербинская А. М., Бочкова Л. В., Круглов Ю. В., Федорук Н. И. Некоторые эпидемиологические характеристики больных СПИДом на Украине // Русский Журнал ВИЧ/СПИД. 1997. — Т. 1, № 1. — С. 128.

30. A World Bank Policy Research Report. Confronting AIDS. Oxford University Press, 1997. -353 p.

31. Albert J., Fenyo E. M. Simple, sensitive, and specific detection of human immunodeficiency virus type I in clinical specimens by polymerase chain reaction with nested primers // J. Clin. Microbiol. 1990. -V. 28. — P. 1560−1564.

32. A., Lee T. H., Essex N. Major glycoprotein antigens that induces antibodies in AIDS patients are encoded by HTLV-III // Science. 1985. — V. 228. — P. 1091−1093.

33. Arvanitakis L., Geras-Raaka E., Varma A., Gershengorn M. C., Cesarman E.. Human herpesvirus KSHV encodes a constitutively active G-protein-coupled receptor linked to cell proliferation // Nature. 1997. — V. 385. — P. 347−350.

34. Ayenuine S., Johanson B., Salminen M., Leinikki P., Sonnerborg A., Zewdie D-W., Britton S., Strannegard O. HIV-I in Ephiopia: Phylogenetic divergence from other HIV-I strains // Virus Genes. 1991. — V. 5. — N. 4. — P. 359−366.

35. Barabitskaya O., Malykh A., Emeljanov A., Kurbatova T., Yaroslavtseva N., Karamov E., Farzadegan H., Reitz M. S., Kozlov A. Molecular epidemiology of HIV-1 in St. Petersburg, Russia//AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1995. -V. 11, Suppl. 1. -P. S145.

36. Barin F., Courouce A. M., Pillonel J., Buzelay L., Increasing diversity of HIV-1M serotypes in French blood donors over a 10-year period (1985;1995) // AIDS. — 1997. — V. 11. -P. 1503−1508.

37. Beardsley T. Dispute over AIDS patent priority // Nature. 1984. — V. 310. — P. 174.

38. Benko D. M., Schwartz S., Pavlakis G. N., Felberg B. K. A novel human immunodeficiency virus type 1 protein, tev, shares sequences with tat, env, and rev proteins // J. Virology. -1990. V. 64, N. 6. — P. 2505−2518.

39. Berger E. A., Doms R. W., Fenyo E. M., Korber B. T. M., Littman D. R, Moore J. P., Sattentau H., Schuitemaker H., Sodroski J., Weiss R. A. A new classification for HIV-1 // Nature. 1998. — V. 391. — P. 240.

40. Blazig C., Zietz C., Haar B., Nepel F., Esser S., Brockmeyer N. H., Tschachler E., Colombini S., Ensoli B., Sturzl M. Monocytes in Kaposi’s sarcoma lesions are productively infected by Human Herpervirus 8 // J. Virol. 1997. — V. 71. — P. 7963−7968.

41. Bobkov A., Cheingsong-Popov R., Selimova L., Ladnaya N., Kazennova E., Kravchenko A., Pokrovsky V., Weber J. HIV type 1 subtype E in Russia //AIDS Res. Human Retroviruses. -1997.-V. 13.-P. 725−727.

42. Boyum A. Separation of lymphocytes from blood // Nature. 1964. — V. 204. — P. 793−795.

43. Briggs S. D., Sharkey M., Stevenson M., and Smithgall T. E. SH3-mediated Hek tyrosine kinase activation and fibroblast transformation by the Nef protein of HIV-1 // J. Biol. Chem. -1997. V. 272. — P. 17 899−17 902.

44. Bruce C., Clegg C., Featherstone A., Smith J., Oram J. Sequence analysis of the gpl20 of the env gene of Ugandan human immunodeficiency proviruses from a single individual // AIDS Res. Human Retroviruses. 1993. — V. 9, N. 4. — P. 357−361.

45. Bruce C., Clegg C., Featherstone A., Smith J., Biryahawaho B., Dowing R., Oram J. Presence of multiple genetic subtypes of Human Immunodeficiency Virus type 1 proviruses in Uganda // AIDS Res. Human Retroviruses-1994. V. 10, N. 11. — P. 1543−1550.

46. Caldwell J. C., Caldwell P. The African AIDS Epidemic // Scientific American. 1996. -No. 3,-P. 62−68.

47. Caruso M. Gene therapy against cancer and HIV infection using the gene encoding herpes simplex virus thymidine kinase // Molecular Medicine Today. 1996. — V. 2. — P. 212−217.

48. Chadburn A., Cesarman E., Nador R. G., Liu Y. F., Knowles D. M. Kaposi’s sarcoma-associated herpesvirus sequences in benign lymphoid proliferations not associated with human immunodeficiency virus // Cancer. 1997. — V. 80. — P. 788−797.

49. Chaisson R. E., Stanton D. L., Gallant J. E., Rucker S., Bartlett J. G., and Moore R. D. Impact of the 1993 revision of the AIDS case definition on the prevalence of AIDS in a clinical setting // AIDS. 1993. — V. 7. — P. 857−862.

50. Chang Y., Cesarman E., Pessin M. S., Lee F., Culpepper J., Knowles D. M., Moore P. S. Identification of herpesvirus-like DNA sequences in AIDS-associated Kaposi’s sarcoma // Science. 1994. — V. 266. — P. 1865−1869.

51. Cheingsong-Popov R., Lister S., Callow D., Kaleebu P., Beddows S., Weber J. Serotyping HIV-I by antibody binding to V3 loop: Relationship to viral genotype // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1994. — V. 10, N. 11. -P. 1379−1386.

52. Chen B. K., Feinberg M. B., and Baltimore D. The (kappa)B sites in the human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeates enhance virus replication yet are not absolutely required for viral growth // J. Virol. 1997. — V. 71 (7). — P. 5495−5505.

53. Cichutek K., Merget H., Norley S., Linde R., Kreuz W., Gahr M., Kurth R. Development of a quasispecies of Human Immunodeficiency Virus type 1 in vivo // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1992. — V. 89. — P. 7365−7369.

54. Clapham P. R., Weiss R. A. Immunodeficiency virus: spoilt for choice of co-receptors // Nature. 1997. — V. 388. — P. 230−231.

55. Cochrane A. W., Perkins A., Rosen C. Identification of sequence important in the nucleolar localisation of human immunodeficiency virus rev: Relevance of nucleolar localisation to function//J. Virology. 1990.-V. 64, N. 2.-P. 881−885.

56. Cohen E. A., Denni G., Sodorski J. G., Haseltine W. A. Human immunodeficiency virus vpr product is a virion-associated regulatory protein // J. Virology. 1990. — V. 64, N. 6 -P.3097−3099.

57. Collins K. L., Chen B. J., Kalams S. A., Walker B. D., and Baltimore D. HIV-1 Nef protein protects infected primary cells against killing by cytotoxic T-lymphocytes // Nature. 1998. -V. 391.-P. 397—401.

58. Connor R. J., Sheridan K. E., Ceradini D., Choe S. Change in coreceptor use correlates with disease progression in HIV-1 infected individuals // J. Exper. Med. 1997. — V. 185. -P. 621−628.

59. Courtier M., Damond F., Simon F., Fleury H., and the AC 11 laboratory network. Prevalence of HIV-1 subtypes in France, 1996;1997 // 12th World AIDS Conference Geneva June 28-July3 1998. 1998,-Abstr. 13 199.

60. Dalgleish A. G., Beverly P. C. L., Clapham P. R., Crawford D. H., Greaves M. F., Weiss R. A. The CD4 (T4) Antigene is an essential component of the receptor for the AIDS retrovirus //Nature. 1984. -V. 312. — P. 763−767.

61. Delwart E. L., Shepard H. W., Walker B. D., Goudsmit J., Mullins J. I. Human Immunodeficiency Virus type I evolution in vivo tracked by DNA heteroduplex mobility assays // J. Virol. 1994. -V68, N. 10. — P. 6672−6683.

62. Delwart E. L., Pang H., Sheppard H. W., Wolpert D., Newmann A. U., Korber B., Mullins J. I. Slower evolution of human immunodeficiency virus type 1 quasispecies during progresion to AIDS // J. Virol. 1997. — V. 71. — P. 7498−7508.

63. Demarchi F., D’Adda di Fagagna F., Falaschi A., Giacca M. Activation of transcription factor NF-kappaB by the Tat protein of human immunodeficiency virys Type 1 // J. Virol. 1996 a. — V. 70 — P. 4227−4237.

64. Demarchi F., Bovenzi P., Di Luca D., Giacca M. (1996). Transcriptional activation of human immunodeficiency virus type 1 by herpesvirus infection: an in vivo footprinting study // In-tervirology. 1996 b. — V. 39. — P. 236−241.

65. Dezutter-Dambuyant, C. Schmitt, D. Epidermal Langerhans cells and HIV-1 infection // Immunol. Letters. 1993. — V. 39. — P. 33−37.

66. Downs A. M., Heisterkamp S. H., Brunet J. B., Hamers F. F. Reconstruction and prediction of the HIV/AIDS epidemic among adults in the European Union and in low prevalence countries of cenral and eastern Europe // AIDS. 1997. — V. 11. — P. 649−662.

67. Echarri A., Gonzalez M. E., and Carrasco L. The N-terminal Arg-rich region of human immunodeficiency virus types 1 and 2 and simian immunodeficiency virus Nef is involved in RNA binding // Eur. J. Biochem. 1997. — V. 246. — P. 38⁴.

68. Eigen M., McCaskill J., and Schuster P. Molecular quasi-species // J. Phys. Chem. 1988. -V. 92.-P. 6881−6891.

69. Ensoli B., Nakamura S., Salachuddin S. Z., Biberfeld P., Larson L., Beaver B., Wong-Staal F., Gallo R. C. AIDS Kaposi’s sarcoma derived-cells express cytokines with autokrine and paracrine growth effects // Science. 1989. — V. 243. — P. 223−226.

70. Essex M" McLane M. F" Lee T. H., Falk L" Howe C. W., Mullins J. I., Cabradilla C., Francis D. P. Antibodies to cell membrane antigens associated with human T-cell leukemia virus in patients with AIDS // Science. 1983. — V. 220. — P. 859−862.

71. Essex, M., Soto-Ramirez, L. E., Renjifo, E., Wang, W. K., Lee, T. H. Genetic variation within human immunodeficiency viruses generates rapid changes in tropism, virulence, and transmission // Leukemia. 1997. — V. 11 (Suppl. 3). — P. 93−94.

72. Feinberg M. B., Baltimore D., Frankel A. D. The role of tat in the human immunodeficiency virus life cycle indicates a primary effect on transcriptional elongation // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. — V. 88. — P. 4045^1049.

73. Felsenstein J. Evolutionary trees from DNA sequences: a maximum likelihood approach // J. Molec. Evolution. 1981. -V. 17. — P. 368−376.

74. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenesis: An approach using the bootstrap // Evolution. 1985. — V. 39. — P. 783−791.

75. Felsenstein J. Phylogenies from molecular sequences: inference and reliability //Annu. Rev. Genet. 1988. — V. 22. — P. 521−565.

76. Felsenstein, J. (1991) «PHYLIP Manual», 3. 4 ed // University Herbarium, University of Cali-fronia, Berckley, California.

77. Fenyo E. M., Albert J., Asjo B. Replicative capacity cytopathic effect and cell tropism of HIV // AIDS. 1989. -Suppl 1. — P. 5−12.

78. Fitch W. M., Margoliash E. Construction of phylogenetic trees // Science. 1967. — V. 155. -P. 279−284.

79. Gallaher W. R. Detection of a fusion peptide sequence in the transmembrane protein of human immunodeficiency virus // Cell. 1987. — V. 50. — P. 327−328.

80. Gallay P., Hope T., Chin D., Trono D. HIV infection of nondividing cells through the recognition og integrase by the importin/karyopherin patway //Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997. -V. 94.-P. 9825−9830.

81. Gallo R. C. Mechanism of disease induction by HIV // J. AIDS. 1990. — V3. — P. 380−389.

82. Gelderblom H. R., Hausmann E. H., Ozel M., Pauli G., Koch M. A., Fine structure of human immunodeficiency virus (HIV) and immunolocalization of structural proteins // Virology. -1987.-V. 156.-P. 171−176.

83. Goldman N., Barton N. H. Human origins. Genetics and geography // Nature. 1992. — V. 357-P. 440¹⁴¹.

84. Goodenow M., Huet T., Saurin W., Kwok S., Sninsky J., Wain-Hobson S. HIV-1 isolates are rapidly evolving quasispecies: evidence for viral mixtures and preferred nucleotide substitutions // J. AIDS. 1989. — V. 2. — P. 344−352.

85. Gostin L. O., Ward J. W., and Baker C. A. National HIV case reporting a defining moment in the history of the epidemic // N. Engl. J. Med. — 1997. — V. 337. — P. 1162−1167.

86. Gottlieb M. S., Schroff R., Schanker H. Pneumacistis carini pneumonia and mucosal candidiasis in preiously healthy homosexual men// N. Engl. J. Med. 1981. — V. 305. — P. 14 251 430.

87. Goudsmit J., Kuiken C. L., Nara P. L. Linear versus conformatonal domains of HIV-I during experimental and natural infection //AIDS.- 1989.-V. 3.-P. 5119−5123.

88. Goudsmit J., Back N. K. T., Nara P. L. Genomic diversity and anigenic variation of HIV-I: links between pathogenesis, epidemiology, and vaccine development // FASEB J. 1991. -V. 5.-P. 2427−2436.

89. Greenberg M. E., Ostapenko D. A., and Mathews M. B. Potentiation of human immunodefi-" ciency virus type 1 Tat by human cellular proteins // J. Virol. 1997. — V. 71 (9). — P. 71 407 144.

90. Greenland S. Historical HIV incidence modelling in regional subgroups: use of flexible discrete models with penalized splines based on prior curves // Statistics in Medicine. 1996. -V. 15.-P. 513−525.

91. Greenway A. Azad A., Mills J., Mc Phee D. Human immunodeficiency virus type 1 Nef binds directly to Lck and mitogen-activated protein kinase, inhibiting kinase activity // J. Virol. -1996. V. 70(10). — P. 6701−6708.

92. Gu J., Emerman M., Sandmeyer S. Small heat shock protein suppression of Vpr-induced cy-toskeletal defects in budding yeast // Mol. Cell. Biol. 1997. — V. 17. — P. 4033^1042.

93. Guo H-G., Reitz M. S., Gallo R. C., Ko Y. C., Chang K. S. S. A new subtype of HIV-1 gag sequences detected in Taiwan // AIDS Res. Human Retroviruses. 1993. — V. 9. — P. 925 927.

94. Gurtler L., Eberle J., von Brunn A., Knapp S., Hauser H-P., Zekeng L., Tsague J. M., Se-legny E., Kaptue L. A new subtype of human immunodeficiency virus type I (MVP5180) from Cameroon//J. Virol. 1994.-V. 68.-P. 1581−1585.

95. Hahn B. H., Shaw G. M., Arya S. U., Popovic M., Gallo R. C., Wong-Staal F. Molecular cloning and characterization of the HTLV-III virus associated with AIDS // Nature. 1984. -V.312.-P. 166−169.

96. Hailu K., Butto S., Bekura D., Verani P., Titti F., Sernicola L., Rapicetta M., et al. Serological survey of human immunodeficiency virus (HIV) in Ethiopia // J. Med. Virol. 1989. — V. 28. -P. 21−24.

97. Hamouda T., McPhee R" Hsia S. C" Read G. S., Holland T. C" King S. R. Inhibition of human immunodeficiency virus replication by the herpes simplex virus virion host shutoff protein//J. Virol. 1997,-V. 71.-P. 5521−5527.

98. Hanahan D. Studies on transformation of Escherichia coli with plasmids // J. Mol. Biol. -1983.-V. 166.-P. 557−580.

99. Handen J. S. Rosenberg H. F. Suppression of HIV-1 transcription by beta-chemokines RAN-TES, MIP-1 alpha, and MlP-lbeta is not mediated by the NFAT-1 enhancer element // FEBS Lett. 1997. — V. 410. — P. 301−302.

100. Haseltine W. A. Molecular biology of the AIDS virus: ten years of discovery hope for the future // Science Challenging AIDS / Ed. G. Giraldo. — Bazel, Switzerland, 1991. — P. 71 106.

101. Hashimoto S., Fukutomi K., Morio S., Ichikawa S., Soda K., Yamamoto N., Naemura, M. Prediction of future trends of HIV infection and AIDS in Japan // Jap. J. Public Health. -1993.-V. 40.-P. 926−933.

102. Hirt B. Selective extraction of polyoma DNA from infected mouse cell cultures // J. Mol. Biol. 1967. — V. 26. — P. 365−369.

103. Hiscott J., Beauparlant P., Crepieux P., DeLuca C., Kwon H., Lin R., Petropoulos L. Cellular and viral protein interactions regulating I kappa B alpha activity during human retrovirus infection // J. Leukocyte Biol. 1997. — V. 62. — P. 82−92.

104. Hizi A., McGill C., Hughes S. H. Expressiobn of soluble, enzymatically active, human immunodeficiency virus reverse transcriptase in Escherichia coli and analysis of mutants // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 1988. — V. 85. — P. 1218−1222.

105. Houweling H. Public Health Surveillance of AIDS and HIV in the Netherlands and Europe // Eburon Publishers, Delft. 1996. — P. 13−85.

106. Hua J. and Cullen B. R. Human immunodeficiency virus types 1 and 2 and simian immunodeficiency virus Nef use distinct but overlapping target sites for downregulation of cell surface CD4 // J. Virol. 1997. — V. 71. — P. 6742−6748.

107. Ichimura H., Kliks S. C., Visrutaratna S., Ou C-Y., Kalish M., Levy J. A. Biological, serological, and genetic characterization of HIV-1 subtype E isolates from Northern Thailand // AIDS Res. Human Retroviruses. 1994. — V. 10, N. 3. — P. 263−269.

108. Jaffe H. W., Bregman D. J., Selik R. M. Aquired immune deficiency syndrome in the United States: the first 1000 cases // J. Infec. Diseases. 1983. — V. 148. — P. 339−345.

109. Janssens W., Heyndrickx L., Fransen K., Temmerman M., Leonares A., Ivens T., Motte J., Piot P., van der Groen G. Genetic variability of HIV type 1 in Kenia // AIDS Res. Human Retroviruses.-1994.-V. 10, N. 11.-P. 1577−1579.

110. Jeang K. T. HIV and cellular factors // Human Retroviruses and AIDS. — 1996. — Pt. IV. -P. 1−13.

111. Kahn J. G., Gurvey J., Pollack L. M., Binson D., Catania J. A. How many HIV infections cross the bisexual bridge? An estimate from the United States // AIDS. 1997. — V. 11. -P. 1031−1037.

112. Kaleebu P., Bobkov A., Cheingson-Popov R., Bieniasz P., Garaev M., Weber J. Identification of subtype G from Uganda//AIDS Res. Hum. Retroviruses.- 1995,-V. 11, N. 5.-P. 657 659.

113. Kalish M. L., Luo C-C., Weniger B. G., Limpakarnjanarat K., Young N., Ou C-Y., Scho-chetman G. Early HIV type I strains in Thailand were not responsible for the current epidemic // AIDS Res. Human Retroviruses. 1994. — V. 10, N. 11. — P. 1573−1575.

114. HIV-1 envelope subtypes in injecting drug users in Bangkok, Thailand: implications for HIV vaccine trials // AIDS. 1995. — V. 9. — P. 851−857.

115. Kalyanaraman V. S., Sarngadharan M. G., Robert-Guroff M., Miyoshi I., Golde D., Gallo R. C. A new subtype of human T-cell leukemia virus (HTLV-II) associated with a T-cell variant of hairy cell leukemia // Science. 1982. — V. 218. — P. 571−573.

116. Karp J. E., Broder S. The pathogenesis of AIDS lymphomas: a foundation for addressing the challenges of therapy and prevention // Leukemia Lymphoma. 1992. — V. 8. — P. 167−188.

117. Katsumoto T., Hattori N., Kurimura T. Maturation of human immunodeficiency virus, strain LAV, in vitro // Intervirology. 1987. — V. 27. — P. 148−153.

118. Kihara M., Ichikawa S., Soda K., Hasimoto S., Shinmura K., Analysis of cause of recent rise in number of foreigners reported to HIV/AIDS surveillance in Japan // Jap. J. Public Health. -1995.-V. 42.-P. 569−578.

119. Kihara M., Ichikawa S., Yamasaki S. Descriptive epidemiology of HIV/AIDS in Japan, 19 851 994 // J. Acquired Immune Deficiency Syndromes Human Retrovirol. 1997. — V. 14, Suppl 2.-P. S3-S12.

120. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitution through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. Biol. 1980. — V. 16. — P. 111−120.

121. Kissler S., Susal C., Opelz G. Anti-MIP-1 alpha and anti-RANTES antibodies: new allies of HIV-1? // Clin. Immunol. Immunopathol. 1997. — V. 84. — P. 338−341.

122. Klevens R. M., Fleming P. L., Li J., Karon J. Impact of laboratory-initiated reporting of CD4+ T lymphocytes on U. S. AIDS surveillance // J. Acquired Immune Deficiency Syndromes Human Retrovirol. 1997. — V. 14. — P. 56−60.

123. Klimkait T., Strebel K., Hoggan M. D., Martin M. A., Orenstein J. M. The Human immunodeficiency virus type 1-specific protein vpu is required for efficient virus maturation and release // J. Virol. 1990. — V. 64, N. 2. — P. 621−629.

124. Farzadegan H. New features of HIV/AIDS epidemic in Russia // Abstracts X-th International Conference on AIDS. 1994, 7−12 August, Yokohama, Japan.

125. Krayevsky A. A., Alexandrova L. A., Dyatkina N. B., Kukhanova M. K., Shirokova E. A. Modified substrates of DNA polymerases and design of antivirals. // Acta Biochim. Pol. -1996.-V. 43-P. 125−32.

126. Kunawararak P., Beyrer C., Natpratan C., Feng W., Celentano D. D., de Boer M. — et al. The epidemiology of HIV and syphilis among male commercial sex workers in northern Thailand //AIDS. 1995,-V. 9.-P. 517−521.

127. Laure F., Courgnaud V., Rouzioux C., Blanche S., Veber F., Burgard M., Jacomet C., Gris-celli C., Brechot C. Detection of HIV-I DNA in infants and children by means of polymerase chain reaction // Lancet. 1988. — V. 2. — P. 538−541.

128. Lee R., Beauparlant P., Elford H., Ponka P., Hiscott J. Selective inhibition of I kappa B alpha phosphorylation and HIV-1 LTR-directed gene expression by novel antioxidant compounds // Virology. 1997. — V. 234. — P. 277−290.

129. LeGuern M., Shioda T., Levy J. A., Cheng-Mayer C. Single amino acid change in Tat determines the different rates of replication of two sequential HIV-1 isolates // Virology. 1993. -V. 195. — P. 441−447.

130. H., Skalka A. M., Temin H. M., Vogt V. Standardired and simplified nomenclature for proteins common to all retroviruses // J. Virol. 1988. — V. 62. — P. 1808−1809.

131. Leitner T. Genetic subtypes of HIV-1 // Human Retroviruses and AIDS. 1996. — Pt. Ill — P. 28¹⁰.

132. Levy J. A., Hoffman A. D., Kramer S. M., Lanois J. A., Shimabukuro J. M., Obkiro B. S. Isolation of lymphocytopathic retroviruses from San-Francisco patients with AIDS // Science. 1984. — V. 225.-P. 840−842.

133. Levy J. A. Three new human herpesviruses (HHV6, 7, and 8) // Lancet. 1997. — V. 349. — P. 558−563.

134. Li C. J., Ueda Y., Shi B., Borodyansky L., Huang L., Li Y. Z., Pardee A. B. Tat protein induces self-perpetuating permissivity for productive HIV-1 infection // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. — V. 94. — P. 8116−8120.

135. Li W. H., Tanimura M., Sharp P. M. Rates and dates of divergence between AIDS virus nucleotide sequences // Mol. Biol. Evolution. — 1988. — V. 5. — P. 313−330.

136. Loche M., Mach B. Identification of HIV-infected seronegative individuals by direct diagnostic test based on hybridization to amplified viral DNA // Lancet. 1988. — V. 2. — P. 418 421.

137. Loetscher P., Uguccioni M., Bordoli L., Baggioloni M., Moser B., Chizzolini C., and Dayer J. M. CCR5 is characteristic of Thl lymphocytes // Nature. 1998. — V. 391. — P. 244−345.

138. Loomans E. E. M. G., Nijholt L. J., Cremers A. J. H. F., Paulij W. P., Schielen W. J. C. Epitope mapping and serodiagnostics using Ataand (Lys)7-peptides // Biochim. Biophys. Acta. 1998.-V. 1379.-P. 273−281.

139. Louwagie J., Delwart E. L., Mullins J. I., McCutchan F. E., Eddy G., Burke D. S. Genetic analysis of HIV-I isolates from Brasil reveals presence of two distinct genetic subtypes // AIDS Res. Human Retroviruses. 1994. — V. 10. — P. 561−567.

140. Low-Beer D., Stoneburner R. L. An ageand sex-structured HIV epidemiological model: features and applications // Bull. WHO. 1997. — V. 75. — P. 213−221.

141. Lukashov V. V., Goudsmit J. HIV heterogeneity and disease progression in AIDS: a model of continuous virus adaptation // AIDS. 1998. — V. 12 (Suppl. A). — P. S43-S52.

142. Luppi M., Barozzi P., Ferrari M. G., Torelli G. Human herpesvirus 8 strain variability in clinical conditions other than Kaposi’s sarcoma // J. Virol. 1997. — V. 71. — P. 8082−8083.

143. Macreadie I. G., Thorburn D. R., Kirby D, M., Castelli L. A., de Rozario N. L., and Azad A. A. HIV-1 protein Vpr causes gross mitochondrial dysfunction in the yeast Saccharomyces cerevisiae // FEBS Lett. 1997. — V. 410. — P. 145−149.

144. Maddon P. J., Dalgleish A. G., McDougal J. S., Clapham P. R, Neiss R. A., Axel R. The T4 gene encodes the AIDS virus receptor and is expressed in the immune system and the brain // Cell. 1986. — V. 47. — P. 333−348.

145. Malamud D. Oral diagnostic testing for detecting human immunodeficiency virus-1 antibodies: a technology whose time has come // Am. J. Med. 1997. — V. 102. — P. 9−14.

146. Marx J. L. Strong new candidate for AIDS agent // Science. 1984. — V. 224. — P. 475−477.

147. Marx P. A., Munn R. J., Joy K. I. Computer simulation of thin section electron microscopy predicts an envelope-associated icosadeltahedral capsid for Human Immunodeficiency virus // Lab. Invest. 1988. — V. 58. — P. 112−118.

148. Masur H., Michelis M. A., Green J. B. An outbreak of community-acquired Pneumacistis ca-rini pneumonia//N. Engl. J. Med. 1981.-V. 305. — P. 1431−1438.

149. McCune J. M., Rabin L. B., Feinberg M. B., Lieberman M., Kosek J. C., Reyes G. R., Weissman I. L. Endoproteolytic cleavage of gpl60 is required for the activation of human immunodeficiency virus // Cell. 1988. — V. 53. — P. 55−67.

150. McCutchan F., Hegerich P., Brennan T. P., Phanuphak P., Singharaj P., Jugsudee A., Berman P. W., Gray A. M., Fowler A. K., Burke D. S. Genetic variants of HIV-1 in Thailand // AIDS Res. Hum. Retroviral. 1992 a. — V. 8, N. 11. — P. 1887−1895.

151. McDougal J. S., Mawle A., Cort S. P., Nicholson J. K. A., Cross G. D., Scheppler-Campbell J. A., Hicks D., Sligh J. Cellular tropism of the human retrovirus HTLV-III/LAV // J. Immunol. 1985. — V. 135.-P. 3151−3162.

152. McDougal J. S., Kennedy M. S., Sligh J. M., Cort S. P., Mawle A., Nicholson J. K. A. Binding of HTLV-III/LAV to T4+ T-cells by a complex of the llOkD viral protein and the T4 molecule// Science. 1986. -V. 231. — P. 382−385.

153. McGrath B. J., Newman C. L. Genital herpes simplex infections in patients with the acquired immunodeficiency syndrome // Pharmacotherapy. 1994. — V. 14. — P. 529−542.

154. McKeating J. A., Gow J., Goudsmit J., Pearl L. H., Mulcher C., Weis R. A. Characterization of HIV-I neutralizaton escape mutants // AIDS. 1989. — V. 3. — P. 777−784.

155. Meyerhans A., Cheynier R., Albert J., Seth M., Kwok S., Sninsky J., Mordfeldt-Manson L., Asjo B., Wain-Hobson S. Temporal fluctuations of HIV quasispicies in vivo are not reflected by sequential HIV isolations // Cell. 1989. — V. 58. — P. 901−910.

156. Milich L., Margolin B., Swansfrom R. V3 loop of the human immunodeficiency virus type 1 env protein: interpreting sequence varuability // J. Virol. 1993. — V. 67, N9. — P. 5623−5634.

157. Miller M. D., Warmerdam M. T., Ferrell S. S., Benitez R., and Greene W. C. Intravirion generation of the C-terminal core domain of HIV-1 Nef by the HIV-1 protease is insufficient to enhance viral infectivity // Virology. 1997. — V. 234. — P. 215−225.

158. Miyazaki M., Naemura M. Epidemiological characteristics on human immunodeficiency virus infection and acquired immunodeficiency syndrome in Japan // Int. J. STD AIDS. 1994. -V. 5.-P. 273−278.

159. Monroe J. E., Andrews C., Sullivan J. L., Mulder C. Use of cytoplasmic dot-blot hybridization to detect human immunodeficiency virus RNA sequences in cultures of peripheral blood // J. Infec. Diseases. 1987. — V. 155. — P. 320−322.

160. Montano M. A., Novitsky V. A., Blackard J. T., Cho N. C., Katzenstein D. A., and Essex M. Divergent transcriptional regulation among expanding human immunodeficiency virus type 1 subtypes // J. Virol. 1997. — V. 71(11). — P. 8657−8665.

161. Morgan D. A., Ruscetti F. W., Gallo R. Selective in vitro growth of T lymphocytes from normal human bone marrows // Science. 1976. -V. 193. — P. 1007−1008.

162. Murphy G., Belda F. J., Clewely J. P., Parry J. Discordance between peptides serotyping and HMA genotyping in distinguishing HIV subtype B from nonB // 12th World AIDS Conference. Geneva, June 28-July 3,1998. 1998. — Abstr. No. 11 193.

163. Myers G. Tenth annyversary perspectives on AIDS. HIV: between past and future // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1994 a. — V. 10, N. 11. — P. 1317−1324.

164. Myers G., Wein-Hobson S., Smith R. F., Korber B., Pavlakis G., N. (Eds.) Human retroviruses and AIDS: a compilation of nucleic acid and amino acid sequences // Los Alamos Natl. Lab., Los Alamos. New Mexico. 1994 b.

165. Nara P. L., Garrity R. R., Goudsmit J. Neutralization of HIV-I: a paradox of humoral proportions // FASEB J. 1991. — V. 5. — P. 2437−2455.

166. Nelson G. W., Perelson A. S. A mechanism of immune escape by slow-replicating HIV strains // J. AIDS. 1992. — V. 5. — P. 82−93.

167. Nishimoto S., Inagi R., Yamanishi K., Hosokawa K., Kakibuchi M., Yoshikawa K. Prevalence of human herpesvirus-8 in skin lesions // Brit. J. Dermatol. 1997. — V. 137. — P. 179— 184.

168. Orenstein J. M., Alkan S., Blauvelt A., Jeang K. T., Weinstein M. D., Ganem D., Herndier B. Visualization of human herpesvirus type 8 in Kaposi’s sarcoma by light and transmission electron microscopy // AIDS. 1997. — V. 11. — P. F35-F45.

169. Osmanov S., Heyward W. L., Esparza J. The World Health Organization Network for HIV isolation and characterization: Summary of pilot study // AIDS Res. Human. Retroviruses. -1994.-V. 10, N. 11.-P. 1325−1326.

170. Pal R., Garzino-Demo A., Markham P. D., Burns J., Brown M., Gallo R. C., DeVico A. L. Inhibition of HIV infection by the Beta chemokine MDC // Science. 1997. — V. 278. — P. 695−698.

171. Panda S., Sarkar S., Mandal B. K., Singh T. B., Singh K. L" Mitra D. K., Sarkar K., Tripathy S. P., Deb B. C. Epidemic of herpes zoster following HIV epidemic in Manipur, India // J. Infection. 1994. — V. 28. — P. 167−173.

172. Papsidero L. D., Shen M., Ruscetti F. W. Human immunodeficiency virus type 1 neutralizing monoclonal antibodies which react with pl7 core protein: chracterization and epitope mapping // J. Virol. — 1989. — V. 63. — P. 267−272.

173. Ping Y. H., Liu Y., Wang X., Neenhold H. R., and Rana T. M. Dynamics of RNA-protein interactions in the HIV-1 Rev-RRE complex visualized by 6-thioguanosine-mediated photo-crosslinking // RNA. 1997. — V. 3. — P. 850−860.

174. Piot P., Plummer F. A., Mhalu F. S., et al. AIDS: an international perspective // Science. -1988;V. 239.-P. 573−579.

175. Pleskoff O., Treboute C., Brelot A., Heveker N., Seman M., Alizon M. Identification of a chemokine receptor encoded by human cytomegalovirus as a cofactor for HIV-1 entry // Science. 1997. — V. 276. — P. 1874−1878.

176. Poiesz B. J., Ruscetti F. W., Mier J. W., Woods A. M., Gallo R. C. T-cell lines established from human T-lymphocytic neoplasias by direct response to T-cell growth factor // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1980. -V. 77. — P. 6815−6819.

177. Popovic M., Sarin P. S., Robert-Gurroff M., Kalyanaraman V. S., Mann D., Minowada J., Gallo R. C. Isolation and transmission of human retrovirus (human T-cell leukemia virus) // Science. 1983. — V. 219. — P. 856−859.

178. Popovic M., Sarngadharan M. G., Read E., Gallo R. C. Detection, isolation, and continious production of cytopathic retroviruses (HTLV-III) from patient with AIDS and pre-AIDS // Science. 1984. — V. 224. — P. 497−500.

179. Profy A. T., Salinas P. A., Eckler L. I., Dunlop N. M., Nara P. L., Putney S. Epitopes recognized by the neutralizing antibodies of an HIV-I infected individual // J. Immunol. 1990. -V. 144.-P. 4641^1648.

180. Reitz M. S., Wilson C., Gallo R. C. Generation of neutralization-resistant variants of HIV-I is due to selection for a point mutation in the envelope gene // Cell. 1988. — V. 54. — P. 57−63.

181. Robert-Guroff M., Brown M., Gallo R. C. HTLV-III neutralizing antibodies in patients with AIDS and AIDS-related complex // Nature. 1985. — V. 316. — P. 72−74.

182. Root-Bernstein R. S. Merrill S. J. The necessity of cofactors in the pathogenesis of AIDS: a mathematical model // J. Theor. Biol. 1997. — V. 187. — P. 135−146.

183. Saag M. S" Hahn B. H., Gibbons J., Li Y" Parks E. S" Parks W. P., Shaw G. M. Extensive variation of human immunodeficiency virus type 1 in vivo // Nature. 1988. — V. 334. — P. 313−330.

184. Saiki R. K., Scharf S., Faloona F., Mullis K. B., Horn G. T., Erlich H. A., Arnheim N. Enzi-matic amplification of ?-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of side cell anemia //Science.- 1985. -V. 230. -P. 1350−1354.

185. Saitou N., Nei M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phyloge-netic trees // J. Mol. Evol. 1987. — V. 4. — P. 406−425.

186. Salminen M., Nykanen A., Brummer-Korvenkontio H., Kantanen M. L., Liitsola K., Leinikki P. T. I. Molecular epidemiology of HIV-1 based on phylogenetic analysis of in vivo gag p7/p9 direct sequences // Virology. 1993. — V. 195. — P. 185−94.

187. Sanger F., Niklen S., Coulson A. R. Sequencing of the DNA eliminating the compression artifacts // Proc. Natl. Acad. Sci. 1977. — V. 74. — P. 5463−5467.

188. Sarngadharan M. G., Popovic M., Bruch L., Schupbach J., Gallo R. C. Antibodies reactive with human T-lymphotropic retroviruses (HTLV-III) in the serum of patients with AIDS // Science. 1984. — V. 224. — P. 506−508.

189. Schupbach J., Popovic M., Gilden R. V., Gonda M. A., Sarngadharan M. G., Gallo R. C. Serological analysis of a subgroup of human T-lymphotropic retroviruses (HTLV-III) associated with AIDS // Science. 1984. -V. 224. — P. 503−505.

190. Sharp M. P. Understanding the origins of AIDS virus //Nature. 1988. — V. 336. — P. 315.

191. Sharpe S. A., Whatmore A. M., Hall G. A., Cranage M. P. Macaques infected with attenuated simian immunodeficiency virus resist superinfection with virulence-revertant virus // J. Gen. Virol. 1997. — V. 78. — P. 1923;1927.

192. Shaw G. M., Hahn B. H., Arya S. K., Groopman J. E., Gallo R. C., Wong-Stall F. Molecular characterization of human T-cell leukemia (lymphotropic) virus type III in the acquired immune deficiency syndrome // Science. 1984. — V. 226. — P. 1165−1171.

193. Sherefa K., Sallberg M., Sormerborg A. Evidence of no change in V3 loop antibody recognition pattern in HIV type Iinfected ethiopians between 1988 and 1993 // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1994;V. 10. — P. 1551−1556.

194. Sinkovics J. G. Kaposi’s sarcoma: its «oncogenes» and growth factors // Crit. Rev. Oncol. Hematol. 1991. — V. 11. — P. 87−107.

195. Siwka W., Schwinn A., Baczko K., Pardowitz I., Mhalu F., Shao J., Rethwilm A., ter Meulen V. vpu and env sequence variability of HIV-I from Tanzania // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1994. — V. 10, N. 12. — P. 1753−1754.

196. Smith T. F., Srinivasan A., Schochetmann G., Marcus M., Myers G. The phylogenetic history of Immunodeficiency viruses // Nature. 1988. — V. 333. — P. 573−575.

197. Sonnerborg A., Durdevic S., Giesecke J., Sallberg M. Dynamics of the HIV-1 subtype distribution in the Swedish HIV-1 epidemic during the period 1980 to 1993 // AIDS Res. Human Retroviruses. 1997. — V. 13. — P. 343−345.

198. Spira A., Marx P. A., Patterson B. K., Mahoney J., Kemp R. A., Wolinsky S. M., Ho D. D. Cellular targets of infection and route of viral dissemination of Simian immunodeficiency virus in Rhesus Macaques // J. Exper. Med. 1996. — V. 183. — P. 215−225.

199. Strebel K., Daugherty D., Clouse K., Cohen D., Folks T., Martin M. The HIV «A» (sor) gene product is essential for virus infectivity // Nature. 1987. — V. 328. — P. 728−730.

200. Strieker R. B., Eiswood B. F. Polio vaccine and the origin of AIDS: an update // Medical Hypotheses. 1997. — V. 48. — P. 193.

201. Sutthent R., Chaisilwattana P., Roongpisuthipong A., Wirachsilp P., Samrangsarp K., Chai-yakul P., Puthavathana P., and Wasi C. Shedding of HIV-1 subtype E in semen and cervico-vaginal fluid //J. Med. Assoc. Thailand. 1997. — V. 80. — P. 348−357.

202. Tu X. M., Litvak E., and Pagano M. Studies of AIDS and HIV surveillance. Screening tests: can we get more by doing less? // Statistics in Medicine. 1994. — V. 13. — P. 1905;1919.

203. Tyndall M. W., Nasio J., Agoki E., Malisa W., Ronald A. R, Ndinya-Achola J. O., Plummer, F. A. Herpes zoster as the initial presentation of human immunodeficiency virus type 1 infection in Kenya//Clin. Infec. Diseases.- 1995.-V. 21.-P. 1035−1037.

204. UNAIDS. Report on the Global HIV/AIDS Epidemic June 1998 // WHO, Geneva, 1998. -73 p.

205. Vartanian J. P., Meyerhans A., Asjo B., Wain-Hobson S. Selection, recombination and G==>A hypermutation of HIV-1 genomes // J. Virol. 1990. — V. 65. — P. 1779−1788.

206. Vella S., Chiesi A., Volpi A., Giuliano M., Floridia M., Dally L. G., and Binkin N. Differential survival of patients with AIDS according to the 1987 and 1993 CDC case definitions // JAMA. 1994.-V. 271.-P. 1197−1199.

207. Vives E., Brodin P., and Lebleu B. A truncated HIV-1 Tat protein basic domain rapidly translocates through the plasma membrane and accumulates in the cell nucleus //J. Biol. Chem. 1997. — V. 272. — P. 16 010−16 017.

208. Wain-Hobson S., Sonigo P., Danos O., Cole S., Alizon M. Nucleotide sequence of the AIDS virus, LAV // Cell. 1985. — V. 40. — P. 9−17.

209. Weiss R. A., Clapham P. R., Cheiningsong-Popov R., Dalgleish A. G., Carne C. A., Weller I. V. D., Tedder R. S. Neutralization of Human T-lymphotropic virus type III by sera of AIDS and AIDSrisk patients // Nature. 1985. — V. 316. — P. 69−72.

210. Whitaker R. E. Re-assessing the virological approach to HIV pathogenesis: can it explain AIDS as an immunological disease? // J. Theor. Biol. 1997. — V. 187. — P. 45−56.

211. Willey R. W., Rutledge R. A., Dias S., Folks T., Theodore T., Buckler C. E., Martin M. A. The identification of conserved and divergent domains within the envelop gene of AIDS retrovirus // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1986., V. 83. — P. 5038−5042.

212. Wong-Staal F., Shaw G. M., Hahn B. H., Salahuddin S. Z., Popovic M., Markham P. D., Redfield R., Gallo R. C. Genomic diversity of human T-lymphotropic virus type III // Science. 1985. — V. 229. — P. 759−762.

213. Wortley P. M., Fleming P. L. AIDS in women in the United States // JAMA. 1997. — V. 278.-P. 911−916.

214. Yoo S., Myszka D. G., Yeh C., McMurray M., Hill C. P., and Sundquist W. I. Molecular recognition in the HIV-1 capsid/cyclophilin A complex //J. Mol. Biol. 1997. — V. 269. — P. 780−795.

215. Yoshida M., Miyoshi I., Hinuma Y. Isolation and characterization of retrovirus from cell lines of human adult T-cell leukemia and its implication in the disease // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1982. — V. 79. — P. 2031;2035.

216. Zazzi M., Romano L., Brassini A., Valensin P. E. Nested polymerase chain reaction for detection of human immunodeficiency virus type I in clinical specimens // J. Med. Virol. -1992.-V. 38.-P. 172−174.

217. Zhu T., Korber B. T., Nahmias A. J., Hooper E., Sharp P. M., and Ho D. D. An African HIV-1 sequence from 1959 and implications for the origin of the epidemic // Nature. 1998. — V. 391.-P. 594−597.

218. Нуклеотидные последовательности клонированных ВИЧ-специфичных фрагментов пациента Sp-26.

219. Rus-Sp26 — консенсусная последовательность;

220. Sp26-(l-6) — нуклеотидные последовательности различных плазмидных клонов Нуклеотидные замены выделены полужирным шрифтом.

221. Точками обозначены нуклеотиды в последовательностях отдельных клонов, совпадающие с Rus-Sp26.1 11 21 31 41 51 60.

222. Rus-Sp26 ATTAGATCTG ААААТТТСАС GGACAATGTT ААААССАТАА TAGTGCAGCT GAATGAATCT1. Sp2 6−1 .1. Sp26−2. AA.A.. A.1. Sp2 6−3. .1. Sp2 6−4 .1. Sp2 6−5 .1. Sp2 6−6 .61 71 81 91 101 120.

223. Rus-Sp26 ATACAAATTA ATTGTACAAG ACCCAACAAC AATACAAGAA AAAGTATACA TATAGGACCG1. Sp2 6−1 .1. Sp2 6−2 .1. Sp26−3 .1. Sp26−4 .T .1. Sp2 6−5 .T .1. Sp2 6−6 .121 131 141 151 161 171 180.

224. Rus-Sp26 GGGAGAGCAT TTTATGCAAC AGATATAGTA GGAAATATAA GACAAGCACA TTGTAACCTT1. Sp2 6−1. С.

225. Sp26−2 .A.. .AC.C... .G... .1. Sp2 6−3 .G.С.1. Sp2 6−4 .G.1. Sp2 6−5 .G.1. Sp26−6 .A.181 191 201 211 221 231 240.

226. Rus-Sp26 AGTAGAGCAC AATGGAATAA CACTTTAAAA CAGATAGTTA CAAAATTAAG AGAACAATTT1. Sp2 6−1 .С.1. Sp2 6−2 .1. Sp2 6−3 .С.1. Sp26−4. T.1. Sp2 6−5. T.1. Sp2 6−6 .241 251 261 271 281 291 300.

227. Rus-Sp26 AAGAATAAAA CAATAGTCTT TAATCAATCC TCAGGAGGGG ACCCAGAAAT TATTGCACAG Sp26−1 Sp2 6−2 Sp2 6−31. Sp2 6−4 .1. Sp2 6−5 .1. Sp2 6−6 .G.ATG.C.

228. Аминокислотные последовательности env-специфичных фрагментов ВИЧ-1 пациента Sp-26.

229. Аминокислотные последовательности env-специфичных фрагментов ВИЧ-1 пациента Sp1. С2 облаешь V3 петля-24 -14 +1 7 17.

230. Rus-Sp26 IRSENFTDNV KTIIVQLNES IQINCTRPNN NTRKSIHIGP GRAFYATDIV1. Sp2 6−1 .1. Sp26−2. .N.T1. Sp26−3 .G1. Sp2 6−4 .G.1. Sp26−5 .G... .1. Sp26−6 .1.

231. V3 петля ^^ V3-V4 область 27 +34 37 47.

232. Rus-Sp26 GNIRQAHCNL SRAQWNNTLK QIVTKLREQF1. Sp26−6.

233. Консенсусные нуклеотидные последовательности фрагментов ВИЧ-1, амплифицированных из различных пациентов.

234. RusSp — консенсусная нуклеотвдная последовательность env-специфичных фрагментов для всех пациентов. Мутации типа замены нуклеотидов выделены полужирным шрифтом. Мутации типа делеций/вставок в Rus-Sp выделены подчеркиванием.

235. Rus-Sp86 Rus-Sp83 Rus-Sp80 Rus-Sp93.

236. Rus-Sp74 CGCGTTCGTA GCTTGTTCGG ATTCCTGCTG TTAAATGGCA GTCTGGC1. Rus-Sp1. Rus-Sp841. Rus-Sp861. Rus-Sp831. Rus-Sp801. Rus-Sp931. Rus-Sp741. Rus-Sp421. Rus-Sp901. Rus-Sp261. Rus-Spl021. Rus-Spl0351* * * *** ** *** * * *** ** * 100.

237. AGAAGAGGTA GTAATTAGAT CTGAAAATTT CTCGGACAAT GCTAAAACCA1. A. .A.• A. .A.1. G. .G.• A.A.• A.A. .A.A.• A.A.1. CG.С.1. A. .A.1. T. G. T.CG.C.AG.1. A. A.1. T. • T.G.