Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Механизм ассимиляции ацетата у пурпурной несерной бактерии Rhodospirillum rubrum, не имеющей глиоксилатного шунта

Диссертация: Механизм ассимиляции ацетата у пурпурной несерной бактерии Rhodospirillum rubrum, не имеющей глиоксилатного шунта
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Ассимиляция ацетата у R. rubrum связана с функционированием нового анаплеротического цикла, в котором ацетил-КоА окисляется до глиоксилата через следующую последовательность реакций: ацетил-КоА + пируват —> цитрамалил-КоА -" цитрамалат —> мезаконат —> мезаконил-КоА -" 3-метилмалил-КоА —> глиоксилат + пропионил-КоА. Регенерация пирувата из пропионил-КоА происходит при участии пропионил-КоА… Читать ещё >

Содержание

  • 1. Обзор литературы
    • 1. 1. Общая характеристика фототрофных микроорганизмов
    • 1. 2. Углеродный метаболизм фототрофных бактерий
      • 1. 2. 1. Автотрофная ассимиляция СОг
      • 1. 2. 2. Гетеротрофный метаболизм фототрофных бактерий
      • 1. 2. 3. Анаплеротические последовательности, функционирующие при росте на ацетате
  • 2. Экспериментальная часть
    • 2. 1. Материалы и методы исследования
      • 2. 1. 1. Бактерии и условия их культивирования
      • 2. 1. 2. Ассимиляция клетками меченых субстратов
      • 2. 1. 3. Измерение дыхания клеток
      • 2. 1. 4. Выделение клетками в среду кетокислот
      • 2. 1. 5. Получение экстрактов клеток
      • 2. 1. 6. Определение активности ферментов
      • 2. 1. 7. Идентификация продуктов конденсации ацетил-КоА (пропионил-КоА) и пирувата (глиоксилата)
      • 2. 1. 8. Определение белка
      • 2. 1. 9. Реактивы
    • 2. 2. Результаты
      • 2. 2. 1. Рост R. rubrum в разных условиях
      • 2. 2. 2. Фиксация ацетата, пропионата и бикарбоната
        • 2. 2. 2. 1. Фиксация ацетата и бикарбоната суспензиями клеток R. rubrum, выросших в фототрофных анаэробных условиях на среде с ацетатом
        • 2. 2. 2. 2. Фиксация пропионата и бикарбоната суспензиями клеток R. rubrum, выросших в фототрофных анаэробных условиях на среде с ацетатом
        • 2. 2. 2. 3. Действие итаконата на фиксацию ацетата, пропионата и бикарбоната суспензиями клеток R. rubrum, выросших в фототрофных анаэробных условиях на среде с ацетатом
        • 2. 2. 2. 4. Фиксация пропионата и бикарбоната суспензиями клеток R. rubrum, выросших в фотогетеротрофных условиях на среде с пропионатом и бикарбонатом
        • 2. 2. 2. 5. Фиксация ацетата и бикарбоната суспензиями клеток Rps. palustris, выросших в фототрофных условиях на среде с ацетатом
      • 2. 2. 3. Потребление кислорода суспензиями клеток R. rubrum
      • 2. 2. 4. Выделение глиоксилата суспензиями клеток R. rubrum, выросших в фототрофных условиях на среде с ацетатом
      • 2. 2. 5. Активность ферментов в экстрактах клеток R. rubrum
      • 2. 2. 6. Действие итаконата на активность некоторых ферментов в экстрактах клеток R. rubrum
      • 2. 2. 7. Образование и взаимопревращения С5-дикарбоновых кислот (цитрамалата, мезаконата, 3-метилмалата) в экстрактах клеток R. rubrum, выросших в фототрофных условиях на среде с ацетатом
  • 3. Обсуждение результатов
  • 4. Выводы

Механизм ассимиляции ацетата у пурпурной несерной бактерии Rhodospirillum rubrum, не имеющей глиоксилатного шунта (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Особое место в природе занимают фототрофные организмы. Осуществляемый ими процесс ассимиляции углекислоты за счет световой энергии является определяющим для всех других форм жизни на Земле. Помимо высших растений и водорослей, немалый вклад в биосферу Земли вносят фототрофные бактерии. Они играют важную роль в круговоротах углерода, азота, серы и других биогенных элементов. На основании исследования фототрофных микроорганизмов были решены многие проблемы, касающиеся механизмов фотосинтеза, фиксации молекулярного азота и других важнейших биологических процессов. Перспективны работы по практическому использованию фототрофных микроорганизмов, возможности которого разнообразны. Это, в частности, получение белка кормовых добавок, биополимеров, молекулярного водорода, ряда ферментов, стимуляторов роста бактерий и некоторых лекарственных препаратов, а также очистка сточных вод. Поэтому неудивителен огромный поток публикаций, посвященных различным аспектам метаболизма фототрофных бактерий. Значительную их часть составляют работы, связанные с изучением углеродного метаболизма и механизмов его регуляции. Несмотря на это, целый ряд вопросов, касающихся использования фототрофными бактериями различных соединений углерода, в течении достаточно продолжительного времени остаётся открытым. Одним из таких вопросов является механизм ассимиляции ацетата у фототрофных бактерий, не имеющих глиоксилатного шунта (ИЦЛ—бактерий).

У большинства бактерий катаболизм ацетата осуществляется через цикл трикарбоновых кислот (ЦТК). Рост в присутствии ацетата невозможен, если интермедиаты ЦТК, расходуемые на биосинтетические нужды, не восполняются. Как правило, их образование происходит через глиоксилатный шунт. Факт отсутствия его ключевого фермента — изоцитратлиазы — у многих фототрофов был установлен в 1960 г., однако природа анаплеротических последовательностей, функционирующих у этих бактерий при росте на ацетате, не известна до сих пор.

Целью настоящей работы было выяснение механизма ассимиляции ацетата у одного из представителей ИЦЛ—бактерий — пурпурной несерной бактерии Rhodospirillum rubrum. Для достижения указанной цели решались следующие задачи:

1. Определить, какие ферменты участвуют в ассимиляции ацетата у R. rubrum;

2. Исследовать основные закономерности ассимиляции ацетата суспензиями клеток R. rubrum.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

4. ВЫВОДЫ.

1. Ни один из известных анаплеротических механизмов ассимиляции ацетата не функционирует у Rhodospirillum rubrum.

2. Ассимиляция ацетата у R. rubrum связана с функционированием нового анаплеротического цикла, в котором ацетил-КоА окисляется до глиоксилата через следующую последовательность реакций: ацетил-КоА + пируват —> цитрамалил-КоА -" цитрамалат —> мезаконат —> мезаконил-КоА -" 3-метилмалил-КоА —> глиоксилат + пропионил-КоА. Регенерация пирувата из пропионил-КоА происходит при участии пропионил-КоА карбоксилазы: пропионил-КоА —>• метилмалонил-КоА -> сукцинил-КоА -" сукцинат —" фумарат малат -> (оксалоацетат -> ФЕП —>) пируват.

3. Основным путем утилизации синтезированного глиоксилата является его включение в цикл трикарбоновых кислот через малатсинтазную реакцию.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Р. Н. Метаболизм фототрофных бактерий в разных условиях роста: Автореф. дисс. докт. биол. наук. М., 1985. — 49 с.
  2. Р. Н., Родова Н. А. Состав и содержание цитохромов у Rhodopseudomonaspalustris в зависимости от условий роста // Микробиология. 1975. — Т. 44.-№ 1.-С. 16−20.
  3. О. И., Красильникова Е. Н. Активность ферментов цикла трикарбоновых кислот у Oscillochloris trichoides II Микробиология. 1995. — Т. 64. — № 5. — С. 714−715.
  4. О. И., Лебедева Н. В., Трошина О. Ю., Родионов Ю. В. Нитрогеназная активность нитчатой фототрофной зеленой бактерии // Микробиология. 1989.- Т. 58.- № 3,-С. 520−521.
  5. Е. Н. Фотосинтезирующие бактерии,— М.: Изд. АН СССР, 1963. 316 с.
  6. Е. Н. Способность фототрофных бактерий к хемоавтотрофии // Хемосинтез: к 100-летию открытия С. Н. Виноградским / Под. ред. М. В. Иванова, — М.: Наука, 1989. С. 139−147.
  7. Е. Н. Автотрофные прокариоты,— М.: Изд-во МГУ, 1996. 312 с.
  8. Ю.Кондратьева E.H., Гоготов И. Н. Молекулярный водород в метаболизмемикроорганизмов, — М.: Наука, 1981. 344 с.
  9. П.Кондратьева E.H., Красильникова E.H. Фототрофные бактерии как продуценты поли-Р-гидроксибутирата//Прикладная биохимия и микробиология, 1989, 25, 6, 785−789.
  10. Е. Н., Максимова И. В., Самуилов В. Д. Фототрофные микроорганизмы, — М: Изд-во МГУ, 1989. 376 с.
  11. Е. Н. Изоцитратлиазная активность фотосинтезирующих бактерий в зависимости от присутствия углекислоты // Научн. докл. высш. школы, биол. науки. -1970.-№ 12.-С. 78−81.
  12. Н.Красильникова Е. Н., Кеппен О. И., Горленко В. М., Кондратьева Е. Н. Рост Chloroflexus aurantiacus на средах с разными органическими соединениями и пути их метаболизма // Микробиология. 1986. — Т. 55. — № 3. — С. 425−430.
  13. А. К. Биохимические методы изучения автотрофии у микроорганизмов. -М.: Наука, 1980. 160 с.
  14. А. К. Ассимиляция углекислоты при хемоавтотрофии // Хемосинтез: к 100-летию открытия С. Н. Виноградским / Под ред. М. В. Иванова, — М.: Наука, 1989. С. 148−169.
  15. Н. В., Ивановский Р. Н. О механизме автотрофной фиксации углекислоты у Chloroflexus aurantiacus II Микробиология. 2000. — Т. 69. — № 2. — С. 175 179.
  16. Н. Н., Ивановский Р. Н. Фотометаболизм ацетата у Ectothiorhodospira shaposhnikovii // Микробиология. 1975. — Т. 44. — № 2. — С. 197−201.
  17. Дж., Уокер Д. Фотосинтез СЗ и С4 растений: механизмы и регуляция. -М.: Мир, 1986. -590 с.
  18. Albers Н., Gottschalk G. Acetate metabolism in Rhodopseudomonas gelatinosa and several other Rhodospirillaceae // Arch. Microbiol. 1976. — V. 111. — № 1. — P. 45−49.
  19. L., Fuller R. С Photosynthesis in Rhodospirillum rubrum. 3. Metabolic control of reductive pentose phosphate and tricarboxylic acid cycle enzymes // Plant Physiol. 1967. — V. 42. — № 4. — P. 497−502.
  20. Anthony C. The biochemistry of methylotrophs.- London: AP, 1982.- 431 p.
  21. Barker H. A. Citramalate lyase of Clostridium tetanomorphum II Arch. Microbiol. -1967.-V. 59.-№ 1−3.-P. 4−12.
  22. Bassham J. A., Calvin M. The path of carbon in photosynthesis.- Englewood Cliffs, NJ: Prentice Hall, 1957, — 104 p.
  23. Beatty J. T, Gest H. Biosynthetic and bioenergetic functions of citric acid cycle reactions in Rhodopseudomonas capsulata II J. Bacteriol. 1981a. — V. 148. — № 2. — P. 584−593.
  24. Beatty J. T, Gest H. Generation of succinyl-Coenzyme A in photosynthetic bacteria // Arch. Microbiol. 1981b. — V. 129. — № 5. — P. 335−340.
  25. Bellion E, Bolbot J. A, Lash T. D. Generation of glyoxylate in methylotrophic bacteria // Curr. Microbiol. 1981. — V. 6. — № 6. — P. 367−372 (uht. no: Anthony C. The biochemistry of methylotrophs. — London: AP, 1982. — p. 104).
  26. Bellion E, Kelley R. L. Inhibition by itaconate of growth of methylotrophic bacteria // J. Bacteriol. 1979. — V. 138. — № 2. — P. 519−522.
  27. Benedict C. R. Early products of 14C. acetate incorportion in resting cells of Rhodospirillum rubrum II Biochim. Biophys. Acta. 1962. — V. 56. — № 3. — P. 618−620.
  28. Berg P. Acyladenylates: an enzymatic mechanism of acetate activation // J. Biol. Chem. -1956. V. 222. — № 2. — P. 991−1013.
  29. Beuscher N, Gottschalk G. Lack of citrate lyase the key enzyme of the reductive carboxylic cycle — in Chlorobium thiosulfatophillum and Rhodospirillum rubrum II Z. Naturforsch. — 1972. — V. 27. — № 8. — P. 967−973.
  30. Blasco R, Cardenas J, Castillo F. Acetate metabolism in purple non-sulfur bacteria // FEMS Microbiol. Lett. 1989. — V. 58. — № 2−3. — P. 129−132.
  31. Blasco R, Cardenas J, Castillo F. Regulation of isocitrate lyase in Rhodobacter capsulatus E1F1 // Curr. Microbiol. 1991. — V. 22. — P. 73−76.
  32. Bowes G, Ogren W. L, Hagerman R. H. Phosphoglycolate production catalyzed by ribulose diphosphate carboxylase // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1971. — V. 45. — № 3. — P. 716−722.
  33. Bowien B. Molecular biology of carbon dioxide assimilation in aerobic chemolithotrophs // Autotrophic bacteria / Ed. by H. G. Schlegel and B. Bowien. Madison: Science Tech Publishers, 1989. P. 437−460.
  34. Brock M., Fischer R., Linder D., Buckel W. Methylcitrate synthase from Aspergillus nidulans: implications for propionate as an antifungal agent // Mol. Microbiol. 2000. — V. 35. -№ 5. -P. 961−973.
  35. Brostedt E., Nordlund S. Purification and partial characterization of a pyruvate oxidoreductase from the photosynthetic bacterium Rho do spirillum rubrum grown under nitrogen-fixing conditions//Biochem. J. 1991,-V. 279,-№ l.-P. 155−158.
  36. Brune D. C. Sulfur compounds as photosynthetic electron donors // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R. E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. — P. 885−914.
  37. Buchanan B. B., Evans M. C. W., Arnon D. I. Ferredoxin-dependent carbon assimilation in Rhodospirillum rubrum II Arch. Microbiol. 1967. — V. 59. — № 1. — P. 32−40.
  38. Buckel W. Anaerobic energy metabolism // Biology of the Prokaryotes / Ed. by J. W. Lengeler, G. Drews, H. G. Schlegel. Stuttgart: Georg Thieme Yerlag, 1999. — P. 278−326.
  39. Buckel W., Barker H. A. Two pathways of glutamate fermentation by anaerobic bacteria //J. Bacteriol. 1974. -V. 117. — P. 1248−1260.
  40. Buckel W., Bobi A. The enzyme complex citramalate lyase from Clostridium tetanomorphum // Eur. J. Biochem. 1976. — V. 64. — № 1. — P. 255−262.
  41. Charon N. W., Johnson R. C., Peterson D. Amino acids biosynthesis in the spirochete Leptospira. Evidens for a novel pathway of isoleucine biosynthesis // J. Bacteriol. 1974. — V. 117.-№ l.-P. 203−211.
  42. Claassen P. A. M., Zehnder A. J. B. Isocitrate lyase activity in Thiobacillus versutus grown anaerobically on acetate and nitrate // J. Gen. Microbiol. 1986. — V. 132. — № 11. — P. 3179−3185.
  43. Cooper R. A., Kornberg H. L. The utilization of itaconate by Pseudomonas sp. // Biochem. J. 1964. — V. 91. — № l.-P. 82−91.
  44. Cooper R. A., Itiaba K., Kornberg H. L. The utilization of aconate and itaconate by Micrococcus sp. // Biochem. J. 1965. — V. 94. — № 1. — P. 25−31.
  45. Dawes E. A. Polyhydroxybutirate: an intriguing biopolymer // Bioscience Reports. -1988.-V. 8. -№ 6. -P. 537−547.
  46. Dixon G. H., Kornberg H. L. Assay methods for key enzymes of glyoxylate cycle // Biochem. J. 1959. — V. 72. — № 1. — P. 195−200.
  47. Ehrenreich A., Widdel F. Anaerobic oxidation of ferrous iron by purple bacteria, a new type of phototrophic metabolism // Appl. Environ. Microbiol. 1994. — V. 60. — № 12. — P. 45 174 526.
  48. Eikmanns B., Linder D., Thauer R. K. Unusual pathway of isoleucine biosynthesis in Methanobacterium thermoautotrophicum II Arch. Microbiol. 1983. — V. 136. — P. 111−113.
  49. Eisenreich W., Strauss G., Werz U., Fuchs G., Bacher A. Retrobiosynthesis analysis of carbon fixation in the phototrophic eubacterium Chloroflexus aurantiacus II Eur. J. Biochem. -1993. V. 215. — № 3. — P. 619−632.
  50. Ekiel I., Smith I. C. P., Sprott G. D. Biosynthesis of isoleucine in methanogenic bacteria: a 13C NMR study // Biochemistry. 1984. — V. 23. — P. 1683−1687.
  51. Evans M. C. W. The photoassimilation of succinate to hexose by Rhodospirillum rubrum 11 Biochem. J. 1965. — V. 95. — № 3. — P. 669−677.
  52. Evans M. C. W., Buchanan B. B., Arnon D. I. A new ferredoxin-dependent carbon reduction cycle in a photosynthetic bacterium // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1966. — V. 55. — № 4. — P. 928−934.
  53. Falcone D. L., Tabita F. R. Expression of endogenous and foreign ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase (RubisCO) genes in a RubisCO deletion mutant of Rhodobacter sphaeroides // J. Bacteriol. 1991. — V. 173. — № 6. — P. 2099−2108.
  54. Ferguson S. J., Jackson J. B., McEwan A. G. Anaerobic respiration in the Rhodospirillaceae: characterisation of pathways and evaluation of roles in redox balancing during photosynthesis // FEMS Microbiol. Reviews. 1987. — V. 46. — P. 117−143.
  55. Gerike U., Hough D. W., Russel N. J., Dyall-Smith M. L., Danson M. J. Citrate synthase and 2-methylcitrate synthase: structural, functional and evolutionary relationships // Microbiology. 1998. — V. 144. — № 4. — P. 929−935.
  56. Gest H. Energy conversion and generation of reducing power in bacterial photosynthesis // Adv. Microbiol. Physiol. 1972. — V. 7. — P. 243−282.
  57. Gest H., Favinger J. L. Heliobacterium chlorum, anoxygenic brownish-green phototrophic bacterium containing a «new» form of bacteriochlorophyll // Arch. Microbiol. -1983. -V. 136. -№ 1. P. 11−16.
  58. Giachetti E., Pinzanti G., Vanni P. A new continuous optical assay for isocitrate lyase // Experimentia. 1984. — V. 40. — P. 227−228.
  59. Giovannoni S. J., Revsbech N. P., Ward D. M., Castenholz R. W. Obligately phototrophic Chloroflexus: Primary production in anaerobic hot spring microbial mats // Arch. Microbiol. 1987. — V. 147. — № 1. — P. 80−87.
  60. Hallenbeck P. L., Lerchen R., Hessler P., Kaplan S. Phosphoribulokinase activity and regulation of C02 fixation critical for photosynthetic growth of Rhodobacter sphaeroides II J. Bacteriol. 1990. -V. 172. -№ 4. — P. 1749−1761.
  61. Han L., Reynolds K. A. A novel alternate anaplerotic pathway to the glyoxylate cycle in streptomycetes // J. Bacteriol. 1997. — V. 179. — № 16. — P. 5157−5164.
  62. Heda G. D., Madigan M. T. Utilization of amino acids and lack of diazotrophy in the thermophilic anoxygenic phototroph Chloroflexus aurantiacus II J. Gen. Microbiol. 1986. — V. 132. -№ 9. — P. 2469−2473.
  63. Heising S., Schink B. Phototrophic oxidation of ferrous iron by a Rhodomicrobium vannielii strain // Microbiology. 1998. — V. 144. — № 8. — P. 2263−2269.
  64. Holo H. Chloroflexus aurantiacus secretes 3-hydroxypropionate, a possible intermediate in the assimilation of C02 and acetate // Arch. Microbiol. 1989. — V. 151. — № 3. — P. 252−256.
  65. Holo H., Sirevag R. Autotrophic growth and C02 fixation of Chloroflexus aurantiacus II Arch. Microbiol. 1986. — V. 145. — № 2. — P. 173−180.
  66. Horswill A. R., Escalante-Semerena J. C. Salmonella typhimurium LT2 catabolizes propionate via the 2-methylcitric acid cycle // J. Bacteriol. 1999. — V. 181. — № 18. — P. 56 155 623.
  67. Howell D. M., Xu H., White R. H. (i?)-Citramalate synthase in methanogenic Archaea // J. Bacteriol. 1999. — V. 181.-№ 1. — P. 331−333.
  68. Ivanovsky R. N., Krasilnikova E. N., Fal Y. I. A pathway of the autotrophic C02 fixation in Chloroflexus aurantiacus // Arch. Microbiol. 1993. — V. 159. — № 3. — P. 257−264.
  69. Joshi H. M., Tabita F. R. A global two component signal transduction system that integrates the control of photosynthesis, carbon dioxide assimilation, and nitrogen fixation // Proc Natl Acad Sci USA. 1996. — V. 93. — № 25. — P. 14 515−14 520.
  70. Y., Asano Y. 3-Methylaspartate ammonia-lyase as a marker enzyme of the mesaconate pathway for (*S')-glutamat.c fermentation in Enterobacteriaceae II Arch. Microbiol. -1997. V. 168. — № 6. — P. 457−463.
  71. Kikuchi G., Tsuiki S., Muto A., Yamada H. Metabolism of carboxylic acids in non-sulfur purple bacteria under light-anaerobic conditions / Studies in microalgae and photosynthetic bacteria. Tokyo: University of Tokyo Press, 1963. — P. 547−565.
  72. Kimble L., Madigan M. Nitrogen fixation and nitrogen metabolism in heliobacteria //Arch. Microbiol. 1992. -V. 158. -№ 3. — P. 155−161.
  73. Knight M. The photometabolism of propionate by Rhodospirillum rubrum II Biochem. J. 1962.-V. 84.-№ 1.-P. 170−185.
  74. Kondratieva E. N., Ivanovsky R. N., Krasilnikova E. N. Light and dark metabolism in purple sulfur bacteria // Soviet Science Review. Vol. 2 / Ed. by V. P. Skulachev. — Guilford, England, New York: IPC Science and Technology Press, 1981. — P. 325−364.
  75. Kondratieva E. N., Ivanovsky R. N., Krasilnikova E. N. Carbon metabolism in Chloroflexus aurantiacusll FEMS Microbiol. Lett. 1992. — V. 100. — P. 269−272.
  76. Kornberg H. L., Gotto A. M. The metabolism of C2 compounds in microorganisms. 6. Synthesis of cell constituents from glycollate by Pseudomonas sp. // Biochem. J. 1961. — V. 78. -№ 1. — P. 69−82.
  77. Kornberg H. L., Lascelles J. The formation of isocitratase by the Athiorhodaceae // J. Gen. Microbiol. 1960. -V. 23. — № 3. — P. 511−517.
  78. Kortstee G. J. J. The homoisocitrate-glyoxylate cycle in pink, facultative methylotrophs // FEMS Microbiol. Lett. 1980 — V. 8. — № 1. — P. 59−65.
  79. Liebergesell M., Hustede E., Timm A., Steinbuchel A., Fuller R. C., Lenz R. W., Schlegel H. G. Formation of poly (3-hydroxyalkanoates) by phototrophic and chemolithotrophic bacteria//Arch. Microbiol. 1991. — V. 155. — № 5. — P. 415−421.
  80. Loken O., Sirevag R. Evidence for the presence of the glyoxulate cycle in Chloroflexus II Arch. Microbiol. 1982. — V. 132. — № 3. — P. 276−279.
  81. London R. E., Allen D. L., Gabel S. A., DeRose E. F. Carbon-13 nuclear magnetic resonance study of metabolism of propionate by. Escherichia coli II J. Bacteriol. 1999. — V. 181. -№ 11.-P. 3562−3570.
  82. Losada M, Trebst A. V, Ogata S, Arnon D. I. Equivalence of light and adenosine triphosphate in bacterial photosynthesis // Nature. 1960. — V. 186. — № 4727. — P. 753−760.
  83. Lowry O. H, Rosenbrough M. S, Farr A. L, Randall R. S. Protein measurement with the Folin phenol reagent // J. Biol. Chem. 1951. — V. 193. — № 1. — P. 265−275.
  84. Madigan M. T, Martinko J. M, Parker J. Brock biology of microorganisms. Upper Saddle River (NJ): Prentice Hall, 2000. — 986 p.
  85. Madigan M. T, Ormerod J. G. Taxonomy, physiology and ecology of heliobacteria // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R. E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. -Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. P. 17−30.
  86. Mas J, Van Gemerden H. Storage products in purple and green sulfur bacteria // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R, E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. -Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. P. 973−990.
  87. McFadden B. A, Purohit S. Itaconate, an isocitrate lyase-directed inhibitor in Pseudomonas indigofera II J. Bacteriol. 1977. — V. 131. — № 1. — P. 136−144.
  88. McFadden B. A, Shively J. M. Bacterial assimilation of carbon dioxide by the Calvin cycle // Variations in autotrophic life / Ed. by J. M. Shively, L. L. Barton. London: Acad. Press, 1991.-P. 25−49.
  89. Merrick J. M. Metabolism of reserve materials // The photosynthetic bacteria / Ed. by R. K. Clayton, W. R. Sistrom. N.Y.: Plenum Press, 1978. — P. 199−222.
  90. Morgan P, Kelly D. J, Dow C. S. The tricarboxylic acid cycle of heterogeneous and swarmer cell populations of Rhodomicrobium vannielii Rm5 // J. Gen. Microbiol. 1986. — V. 132. — P. 931−938.
  91. Moskowitz G. J, Merrick J. M. Metabolism of poly-P-hydroxy-butyrate. Enzymatic synthesis of D-(-)-P-hydroxybutyryl coenzyme A by an enoyl hydrase from Rhodospirillum rubrum II Biochemistry. 1969. — V. 8. — P. 2748−2755.
  92. Payne J., Morris J. G. Acetate utilisation by Rhodopseudomonas spheroides II FEBS Letters. 1969. — V. 4. — № 1. — P. 52−54.
  93. Pfennig N. Multicellular filamentous green bacteria // Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 3 / Ed. by J. T. Staley, M. P. Bryant, N. Pfennig, J. G. Holt. — Baltimore: Williams & Wilkins, 1989. — P. 1697−1707.
  94. Pickett M. W., Williamson M. R., Kelly D. G. An enzymes and 13C-NMR study of carbon metabolim in heliobacteria // Photosynth. Res. 1994. — V. 41. — № 1. — P. 75−88.
  95. Pierson B. K., Castenholz R. W. Taxonomy and physiology of filamentous anoxygenic phototrophs // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R. E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. — P. 31−47.
  96. Porter J., Merrett M. J. Formation of glyoxylate from a-hydroxyglutarate by Rhodospirillum rubrum II FEBS Letters. 1970. — V. 7. — № 3. — P. 271−273.
  97. Porter J., Merrett M. J. Influence of light intensity on reductive pentose phosphate cycle activity during photoheterotrophic growth of Rhodospirillum rubrum II Plant Phisiol. 1972. — V. 50.-№ l.-P. 252−255.
  98. Pronk J. T., van der Linden-Beuman A., Verduyn C., Scheffers W. A., van Dijken J. P. Propionate metabolism in Saccharomyces cerevisiae: implications for the metabolon hypothesis // Microbiology. 1994. — V. 140. — № 4. — P. 717−722.
  99. Quayle J. R., Fuller R. C., Benson A. A., Calvin M. Enzymatic carboxylation of ribulose diphosphate // J. Am. Chem. Soc. 1954. — V. 76. — P. 3610−3611.
  100. Rao G. R., McFadden B. A. Isocitrate lyase from Pseudomonas indigofera, IV. Specificity and inhibition // Arch. Biochem. Biophys. 1965. — V. 112. — № 2. — P. 294−303.
  101. Reed L. J., Mukherjee B. B. a-Ketoglutarate dehydrogenase complex from Escherichia coli II Methods Enzymol. 1969. — V. 13. — P. 55−61.
  102. Sasaki T., Motokawa Y., Kikuchi G. Occurrence of both a-type and o-type cytochromes as the functional terminal oxidases in Rhodopseudomonas spheroides II Biochim. Biophys. Acta. 1970. -. V. 197. — № 2. — P. 284−291.1 3
  103. Schafer S., Paame T., Vilu R., Fuchs G., JC-NMR study of acetate assimilation in Thermoproteus neutrophilias II Eur. J. Biochem. 1989. — V. 186. — № 3. -P. 695−700.
  104. Schauder R., Widdel F., Fuchs G. Carbon assimilation pathways in sulfate-reducing bacteria II. Enzymes of a reductive citric acid cycle in the autotrophic Desulfobacter hydrogenophilus II Arch. Microbiol. 1987. — V. 148. — № 3. — P. 218−225.
  105. Shimada K. Aerobic anoxygenic phototrophs // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R. E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995. — P. 105−122.
  106. Sirevag R. Carbon metabolism in green bacteria // Anoxygenic photosynthetic bacteria / Ed. by R. E. Blankenship, M. T. Madigan, C. E. Bauer. Dordrecht: Kluwer Academic Publishers, 1995.-P. 871−883.
  107. Sirevag R., Castenholz R. Aspects of carbon metabolism in Chloroflexus 11 Arch. Microbiol. 1979.-V. 120.-№ 2.-P. 151−154.
  108. Smillie R. M., Rigopoulos N., Kelly H. Enzymes of the reductive pentose phosphate cycle in the purple and in the green photosynthetic sulfur bacteria // Biochim. Biophys. Acta. -1962.-V. 56. -№ 3. -p. 612−614.
  109. Smith R. E., MacQuarrie R. The role of cysteine residues in the catalytic activity of glycerol-3-phosphate dehydrogenase // Biochim. Biophys. Acta. 1979. — V. 567. — № 2. — P. 269 277.
  110. Stackebrandt E., Murray R. G. E., Truper H. G. Proteobacteria classic nov., a name for the phylogenetic taxon that includes the purple bacteria and their relatives // Int. J. Syst. Bacteriol. 1988. — V. 38. — № 3. — P. 321−325.
  111. Stern J. R. Enzymic activation and cleavage of D- and L-malate // Biochim. Biophys. Acta. 1963. — V. 69. — № 2. — P. 435−437.
  112. Straub K. L., Rainey F. A., Widdel F. Rhodovulum iodosum sp. nov. and Rhodovulum robiginosum sp. nov., two new marine phototrophic ferrous-iron-oxidizing purple bacteria // Int. J. Syst. Bacteriol. 1999. — V. 49. — № 2. — P. 729−735.
  113. Strauss G., Fuchs G. Enzymes of a novel autotrophic C02 fixation pathway in the phototrophic bacterium Chloroflexus aurantiacus, the 3-hydroxypropionate cycle // Eur. J. Biochem. 1993. — V. 215. — № 3. — P. 633−643.
  114. Suzuki S., Osumi T., Katsuki H. Properties and metabolic role of mesaconate hydratase of an aerobic bacterium // J. Biochem. 1977. — V. 81. — № 6. — P. 1917−1925.
  115. Tabita F. R. Molecular and cellular regulation of autotrophic carbon dioxide fixation in microorganisms // Microbiol. Rev. 1988. — V. 52. — № 2. -P. 155−189.
  116. Tabita F. R, McFadden B. A, Pfennig N. D-Ribulose-l, 5-bisphosphate carboxylase in Chlorobium thiosulfatophilum Tassajara // Biochim. Biophys. Acta. 1974. — V. 341. — № 1. — P. 187−194.
  117. Tabuchi T, Serizawa N, Uchiyama H. A novel pathway for the partial oxidation of propionyl-CoA to pyruvate via seven-carbon tricarboxylic acids in yeasts // Agr. Biol. Chem. -1974. V. 38. — № 12. — P. 2571−2572.
  118. Takabe T, Akazawa T. A comparative study of the effect O2 on photosynthetic carbon metabolism by Chlorobium thiosulfatophilum and Chromatium vinosum II Plant Cell Physiol. -1977.-V. 18,-№ 4.-P. 753−765.
  119. Textor S, Wendisch V. F, De Graaf A. A, Muller U, Linder M. I, Linder D, Buckel W. Propionate oxidation in Escherichia coli: evidence for operation of a methylcitrate cycle in bacteria II Arch. Microbiol. 1997. — V. 168. — № 5. — P. 428−436.
  120. Thauer R. K, Rupprecht E, Jungermann K. Glyoxylate inhibition of clostridial pyruvate synthase // FEBS Lett. 1970. — V. 9, — № 5. — P. 271−273.
  121. Tuboi S, Kikuchi G. Enzymic cleavage of malate to glyoxylate and acetyl-coenzyme A // Biochim. Biophys. Acta. 1962. — V. 62. — P. 188−190.
  122. Ueda S, Sato K, Shimizu S. Glyoxylate formation from mesaconyl-CoA and its related reactions in a methanol-utilising bacterium, Protaminobacter ruber 11 Agr. Biol. Chem. -1981. -V. 45.- № 4. -P. 823−830.
  123. Valentine W. N, Tanaka K. R. Pyruvate kinase: clinical aspects // Methods Enzymol. -1966.-V. 9, — P. 468−473.
  124. Vermaas W. F. J. Evolution of heliobacteria: implications for photosynthetic reaction center complexes//Photosynth. Res. 1994. — V. 41. — № 1. — P. 285−294.
  125. Watson G. M. F., Yu J.-P., Tabita F. R. Unusual ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase of anoxic Archae // J. Bacteriol. 1999. — V. 181. — № 5. — P. 1569−1575.
  126. Wegener W. S., Reeves H. C., Rabin R., Ajl S. J. Alternate pathways of metabolism of short-chain fatty acids // Bacteriol. Rev. 1968. — V. 32. — № 1. — P. 1−26.
  127. Williams J. O., Roche T. E., McFadden B. A. Mechanism of action of isocitrate lyase from Pseudomonas indigoferaH Biochemistry. 1971. — V. 10. — № 8. — P. 1384−1390.
  128. Willison J. C. Pyruvate and acetate metabolism in the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus II J. Gen. Microbiol. 1988. — V. 134. — № 9. — P. 2429−2439.
  129. Willison J. C. Biochemical genetics revisited: the use of mutants to study carbon and nitrogen metabolism in the photosynthetic bacteria // FEMS Microbiol. Reviews. 1993. — V. 104. -№ 1. — P. 1−38.
  130. Wood H. G., Ragsdale S. W., Pezacka E. The acetyl-CoA pathway of autotrophic growth // FEMS Microbiol. Reviews. 1986. — V. 39. — P. 345−362.
  131. Yakunin A. F., Hallenbeck P. C. Regulation of synthesis of pyruvate carboxylase in the photosynthetic bacterium Rhodobacter capsulatus II J. Bacteriol. 1997. — V. 179. — № 5. — P. 1460−1468.
  132. Yamada T., Kikuchi G. Inhibition of the metabolism of carboxylic acids and amino acids by citramalate and other related compounds in Rhodopseudomonas spheroides II J. Biochem. 1968. — V. 63. — № 4. — P. 462−471.
  133. Yoshida A. L-Malate dehydrogenase from Bacillus subtilis II Methods Enzymol. -1969. -V. 13. P. 141−145.
  134. Zeikus J. G., Fuchs G., Kenealy W., Thauer R. K. Oxidoreductases involved in cell catbon synthesis of Methanobacterium thermoautotrophicum 11 J. Bacteriol. 1977. — V. 132. — № 2.-P. 604−613.
Заполнить форму текущей работой

На отлично!