Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Генетическая структура и ключевые факторы выживания краевой популяции маньчжурского фазана Phasianus colchicus pallasi Rothschild, 1903

Диссертация: Генетическая структура и ключевые факторы выживания краевой популяции маньчжурского фазана Phasianus colchicus pallasi Rothschild, 1903
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Известно, что ископаемые кости фазанов обнаруженные в археологических памятниках и пещерах южного Приморья, датируются периодом не ранее голоцена (Алексеева, и др., 1984; Пантелеев, Алексеева, 1993; Пантелеев, 1995). Подобные находки подтверждают присутствие фазанов на данной территории 8−10 тыс. лет назад. Информация о наличии фазанов в голоцене коррелирует со сведениями о развитии сельского… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА 1. ОБЫКНОВЕННЫЙ ФАЗАН РИшіапиз соісМсш Ь., 1758: ИСТОРИЯ ИЗУЧЕНИЯ И ХАРАКТЕРИСТИКА ВИДА
    • 1. 1. История изучения фазана на Дальнем Востоке РФ, исследование генетического разнообразия
    • 1. 2. Характеристика и распространение вида
    • 1. 3. Маньчжурский фазан Рказіапт соїскісиз раНаяг Я., 1903: морфофизиологические особенности, динамика численности
  • ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Краткая характеристика используемых молекулярно-генетических методов исследования
    • 2. 2. Материалы и методы изучения генетического полиморфизма
    • 2. 3. Маршрутные учеты в окрестностях г. Уссурийска и в Уссурийском районе
  • ГЛАВА 3. ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ИЗМЕНЧИВОСТЬ ОБЫКНОВЕННОГО ФАЗАНА НА ДАЛЬНЕМ ВОСТОКЕ
    • 3. 1. Полиморфизм биохимических маркеров локальной популяции маньчжурского фазана в Приморском крае
    • 3. 2. Генетическая изменчивость контрольного региона мтДНК маньчжурского фазана
  • ГЛАВА 4. КЛЮЧЕВЫЕ ФАКТОРЫ ВЫЖИВАНИЯ ФАЗАНА В ОСЕННЕ-ЗИМНИЙ ПЕРИОД В УСЛОВИЯХ ЮЖНОГО ПРИМОРЬЯ
    • 4. 1. Сезонная динамика стациальной приуроченности фазана в окрестностях г. Уссурийска и в Уссурийском районе в 2008—2011 гг.

Генетическая структура и ключевые факторы выживания краевой популяции маньчжурского фазана Phasianus colchicus pallasi Rothschild, 1903 (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Фазан обыкновенный — Phasianus colchicus Linnaeus, 1758 — является сложно организованным политипическим видом, широко распространненым в умеренной, частично субтропической зонах Восточной, Внутренней и Западной Азии, вплоть до Кавказа (Vaurie, 1965; Козлова, 1970 и др.). Фазан обладает высокими эстетическими и гастрономическими достоинствами, что делает его крайне привлекательным объектом спортивной любительской охоты.

На юге материкового Дальнего Востока России и прилежащем северовосточном Китае обитает подвид Phasianus colchicus pallasi Rothschild, 1903, именуемый маньчжурским фазаном. Биология этой популяции в целом изучена достаточно полно (Шульпин, 1936; Воробьев, 1954; Потапов, 1987 и др.). И тем не менее один аспект биологии этого подвида требует дальнейшего выяснения: это зимняя экология популяции. Зимний период в бассейне р. Амур по своей суровости — сочетание низких температур и значительного снежного покрова — не имеет прецедентов в любых других областях обитания вида, включая северо-восточный Тибет. Поэтому имеются серьезные основания считать этот период наиболее критическим в жизни маньчжурского фазана. Более того, высказана гипотеза, что популяция маньчжурского фазана, как и значительная группа других видов птиц на восточной окраине Азии, в данном регионе полностью антропогенно зависима (Назаренко, 1999).

Включение в научный обиход современных методов и моделей популяционной молекулярной генетики открывают возможность оценить возраст и историю популяций животных в конкретных регионах (Rogers, Harpending, 1992; Ramos-Onsins, Rosas, 2002; и др.). Применительно к маньчжурскому фазану, эти временные оценки в сочетании с хорошо датированным костным материалом фазана из археологических памятников и пещерных отложений (Александрова и др., 1984; и др.) позволяют дать конкретные оценки времени заселения популяцией фазана бассейна р. Амур и юга Дальнего Востока России в целом. А современные строгие связи популяции с антропогенным (аграрным) ландшафтом (Шульпин, 1936; Глущенко, 2006; и др.) позволяют выяснить предпосылки этой территориальной экспансии.

Цель исследования — изучить генетическую изменчивость и критические факторы выживания популяции маньчжурского фазана на Дальнем Востоке России с целью реконструкции его истории.

Для достижения цели были поставлены следующие задачи:

1. Выяснить генетическое разнообразие и генетическую структуру популяции маньчжурского фазана на основе анализа последовательностей контрольного региона мтДНК.

2. Провести сопоставление родственных (филогенетических) отношений данной популяции с популяциями из прилежащих регионов восточного и центрального Китая с использованием последовательностей мтДНК из базы данных ОепВапк .

3. На основании полученных данных провести реконструкцию демографической истории популяции при помощи существующих математических моделей и сопоставить результаты с палеонтологическими датировками.

4. Выяснить и оценить связи фазанов с антропогенным ландшафтом в осенне-зимний период по данным маршрутных учетов.

5. Изучить особенности образа жизни фазана в природно-антропогенном ландшафте в холодное время года.

Научная новизна и практическая ценность работы:

Получены новые данные о трофических связях и динамике численности фазана в осенне-зимний период в Южном Приморье. Выявлены особенности поведения и экологии вида, обеспечивающие его выживание в зимний сезон и поддержание достаточно высокой численности в природно-антропогенных и антропогенных биотопах.

Впервые исследована генетическая изменчивость популяции фазана маньчжурского на Дальнем Востоке России с помощью анализа нуклеотидных последовательностей контрольного региона митохондриальной ДНК. Проведен ряд анализов для изучения структуры контрольного региона мтДНК, генетической структуры современной популяции, характер филогенетических взаимоотношений гаплотипов внутри популяции, а также ее демографической истории. Данные, полученные с помощью анализа распределения попарных различий (mismatch distributions), модели внезапного расселения и тестов на популяционную стабильность свидетельствуют о молодости популяции на исследованной территории, быстром популяционном росте и быстрой экспансии в постледниковый период. Результаты исследования свидетельствуют об однородности популяции по всей территории Дальнего Востока РФ. Впервые обнаруженные в данном исследовании гаплотипы депонированы в базу данных GenBank EMBL/NCBI.

Полученные данные могут быть использованы сотрудниками филиала ФГУ «Россельхозцентр» по Приморскому краю и Управления по охране, контролю и регулированию использования объектов животного мира Приморского края в целях сохранения и рационального использования маньчжурского фазана как компонента регионального биоразнообразия России.

Апробация работы. Результаты изложены на 3-х международных и 2-х всероссийских конференциях.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 9 работ, в том числе 2 в журналах из списка ВАК.

Благодарности. Автор выражает благодарность д.б.н. Ю. Н. Журавлеву за предоставленные образцы и материально-техническую базук.б.н. О. Г. Корень за помощь в освоении метода аллозимного анализак.б.н. М. М Козыренко за помощь в освоении метода секвенирования ДНКсотрудников лаб. Эволюционной зоологии и генетики БПИ ДВО РАН, а в особенности д.б.н. А. П. Крюкову, д.б.н. И. В. Картавцевой и к.б.н. И. Н. Шереметьевой за всестороннюю помощь и поддержкуза критические замечания и консультативную помощь искренне признателен к.б.н. Ю. Н. Глущенко, д.б.н. В. А. Нечаеву и д.б.н. Г. Н. Челоминойблагодарен директору БСИ к.б.н. О. В. Жилину за помощь в сборе образцов в Амурской области. Я искренне признателен моим родителям, П. П. Фисенко и В. Ф. Фисенко, а также благодарю М. В. Ромашову и Н. В. Мацишину за неоценимую поддержку и глубокую убежденность в силы автора.

ВЫВОДЫ.

1. Популяция маньчжурского фазана, обитающая на Дальнем Востоке РФ, является генетически однородной. Показан низкий уровень генетической дифференциации выборок (Рб1=0.2 049) и высокий уровень обмена генами (№п= 13.96).

2. Полученные данные свидетельствуют о молодости современной популяции на исследуемой территории. Это подтверждается соотношением высокого гаплотипического (0.884−0.913) и низкого нуклеотидного (0.160.0022) разнообразия контрольного региона мтДНК и тестами на демографическую структуру.

3. Дальневосточная популяция фазана, обитающая на территории России, не имеет значительных генетических отличий от подвидов, обитающих на востоке и северо-востоке КНР {Рк. с. раПаьч, Рк. с. кагрош, Рк. с. Ющисйш, Рк. с. йесоИаЫБ, Рк. с. е^ат).

4. Современная популяция фазана маньчжурского на Дальнем Востоке РФ находится в состоянии экспансии. Это подтверждают результаты тестов на популяционную стабильность и унимодальное распределение попарных нуклеотидных различий.

5. При наступлении неблагоприятных условий среды и отсутствии доступа к пище в зимний период плотность населения фазана в сельскохозяйственных местообитаниях и залежах уменьшается, птицы смещаются в зону застройки.

6. Зимнее распределение фазана зависит от доступности пищи. При снежной зиме и наличии доступа к пищевым растениям (плоды диких яблонь, боярышника) фазан может оставаться в местах их произрастания в поймах рек и на склонах сопок. В качестве убежищ используются полости под снегом, образованные травянистой и кустарниковой растительностью.

7. Широкая связь фазана с антропогенными местообитаниями, включая зону застройки, в течение годового цикла, а особенно в холодное время года, позволяет считать его гемисинантропным видом.

8. Результаты нашего исследования (молодость современной популяции, отсутствие генетической подразделенности, связь с антропогенными местообитаниями) подтверждают гипотезу о недавнем расселении маньчжурского фазана на север в результате хозяйственной деятельности человека.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

Полученные нами данные молекулярно-генетического анализа свидетельствуют о недавней экспансии фазана на территорию Дальнего Востока. Показатели времени демографических изменений, полученные нами значительно отличаются от сведений, приведенных в литературе (Jiangyong Qu, et. al., 2009; Liu, et. al., 2010). Это свидетельствует о том, что изученные нами особи несут в своем геноме следы позднейших демографических изменений на северо-восточной оконечности ареала. Порядок распределения попарных нуклеотидных различий указывает на значительные демографические изменения популяции в прошлом, с последующей масштабной экспансией вида.

Известно, что ископаемые кости фазанов обнаруженные в археологических памятниках и пещерах южного Приморья, датируются периодом не ранее голоцена (Алексеева, и др., 1984; Пантелеев, Алексеева, 1993; Пантелеев, 1995). Подобные находки подтверждают присутствие фазанов на данной территории 8−10 тыс. лет назад. Информация о наличии фазанов в голоцене коррелирует со сведениями о развитии сельского хозяйства в данный период. Согласно археологическим находкам, зачатки земледелия на территории современного Приморского края относятся к III-II тысячелетиям до н.э., то есть 4−5 тыс. лет назад (Окладников, 1959), а по спорово-пыльцевым данным — не менее 8 тыс. лет назад (Урусов, Чипизубова, 2009). Наибольшего расцвета распространения сельское хозяйство на Дальнем Востоке достигло, вероятно, во времена государства Бохай (698−926 гг. н.э.) и Золотой империи Чжурдженей (Цзинь) (1115−1234 гг. н.э.) (Окладников, 1959).

Полученные нами, на основе наблюдений и маршрутных учетов, данные так же свидетельствуют о том, что используя результаты хозяйственной и бытовой деятельности человеческой цивилизации, фазаны способны выживать даже в неблагоприятных условиях. Синантропное поведение фазана является одним из важнейших адаптаций этого вида для выживания в суровых условиях российского Дальнего Востока (наряду с высокой плодовитостью и развитым перьевым покровом). Известно, что человек, помимо негативного воздействия (истребление) своей хозяйственной деятельностью создает приемлемые для существования биотопы и кормовую базу (Иванов, 1951; Назаренко, 1999). При наступлении наименее благоприятных условий внешней среды (холодное время года, сплошной снежный покров), фазаны активно посещают селитебные территории и другие антропогенные ландшафты, такие как парки, кладбища, пустыри. Несмотря на подверженность маньчжурского фазана неблагоприятным условиям внешней среды в осенне-зимний период, на отдельных территориях численность может оставаться на относительно высоком уровне. Глубокий снежный покров на высокотравных лугах, в кустарниковых и ивовых зарослях по долинам рек и в сельскохозяйственных угодьях создает различные убежища в переплетениях трав и низкорослых кустарников. Урожай дикой яблони, а так же близость частного сектора, садовых и дачных участков обеспечивают достаточную кормовую базу для выживания фазана на исследуемой территории. Строгая связь фазана с культурным ландшафтом позволяет предположить наличие зависимости между расселением фазана на северо-запад и хозяйственной деятельностью человека. Вероятно, северная граница ареала фазана неоднократно изменялась под действием ряда факторов. Антропогенное воздействие на природу в данном случае, на наш взгляд, является одним из важнейших факторов, что позволило этому типично южному виду осваивать новые территории и расширять свой ареал на север.

Данные, полученные с помощью молекулярно-генетических методов, изучения осенне-зимней биологии и динамики численности фазана в природно-антропогенных биотопах, а также анализ палеонтологических данных, позволяют сделать вывод влиянии хозяйственной деятельности человека на особенности расселения и экологии фазана.

Показать весь текст

Список литературы

  1. Ю.П. Генетические процессы в популяции. М.: ИКЦ «Академкнига», 2003. 431 с.
  2. Ю.П. Генетический мониторинг популяций в связи с состоянием окружающей среды // Генетика и благосостояние человечества. М.: Наука, 1981. С. 205−220
  3. Ю.П. Концепция адаптивной нормы популяций и проблема аутбридинга // Вестн. АМН СССР, 1984, № 7. С. 16−21
  4. Л.М. Охотничье-промысловые птицы Амурской области. Благовещенск: Амурское книжное издательство, 1964. С. 74−80.
  5. Л.М. Миграции маньчжурских фазанов в Амурской области. // Миграции птиц и млекопитающих. М.: Наука, 1965. С. 125−132.
  6. A.C. Лукин, А.Ю. Юдин М. С. Морфологическая характеристика дальневосточного фазана России.// Вопросы лесного и охотничьего хозяйства на юге Дальнего Востока. Уссурийск, 2003. С. 231−240
  7. A.C., Литвиненко Н. С., Косяк H.A. Размножение дальневосточного фазана Phasianus colchicus pallasi Rothch. // Экологические проблемы дальнего востока — Уссурийск, 2004. С. 21−26.
  8. Г. Ф., Нечаев В. А. О влиянии палов на птиц и млекопитающих в Приморском крае // Наземные млекопитающие Дальнего Востока СССР, ДВНЦ АН СССР, 1976. С. 136−148.
  9. В.Н. О расселении фазана в Нижнем Приамурье. // Сборник трудов «Природные ресурсы и экологические проблемы ДВ». Хабаровск: изд-во ДВГГУ, 2007. С. 74−75.
  10. К.А. Птицы Уссурийского края. М.: Изд-во АН СССР, 1954. 360 с.
  11. H.A. Род фазаны Phasianus L., 1758 //Птицы Советского Союза, Т. IV, М.: Советская Наука, 1952. С. 199−226.
  12. Ю.Н., Губарев А. Б. Новая угроза популяции фазана -Phasianus colchicus в Приморском крае // Животный и растительный мир Дальнего востока. Вып. 6. Серия: Экологий и систематика животных. Уссурийск: УГПИ, 2002. С. 121−124.
  13. Ю.Н., Липатова Н. Н., Мартыненко А. Б. Птицы города Уссурийска: фауна и динамика населения. Владивосток: изд-во ТИНРО-центра, 2006. 264 с.
  14. Э.Н. Птицы над полями. Л.: Гидрометеоиздат, 1989. 232 с.
  15. Г. Г., Падутов В. Е., Потенко В. В. Руководство по исследованию хвойных видов методом электрофоретического анализа изоферментов. Гомель: Полеспечать, 1989. 163 с.
  16. А.Г. Промысловая охота в дельте Волги. / Русский орнитологический журнал 2009, Том 18. С. 1030−1035
  17. М.И. Птицы уничтожают семена амброзии. // Природа 1972, № 8. С. 123
  18. А.И. Отряд Galliformes Куринные. Определители по фауне СССР, изд. Зоол. Инст. Ан СССР. Вып. 39 Птицы СССР, 4.1. 1951. С.205−240.
  19. B.C., Потапов Р. Л. Экология тетерева Lyrurus tetrix и изменения его численности в Гатчинском районе Ленинградской области за последние полвека. // Русский орнитол. журн. 2008, Т. 17. С. 1532−1538.
  20. М. Тацит. Толкования. Ленинград.: Лениздат, 1984. 348 с.
  21. С.П. Об изменчивости величины и сложения глухарей. // Орнитология, 1960, вып. 3. С. 38−47.
  22. Е.В. Расселение фазана Phasianus colchicus L. в пустыни центральной Азии // Труды зоологического института. Том XLVII, Ленинград.: Наука, 1970. С. 9−18
  23. М.М., Фисенко П. В., Журавлев Ю. Н. Генетическая изменчивость фазана маньчжурского (Phasianus colchicus pallasi Rothschild, 1903) по данным секвенирования контрольного региона митохондриальной ДНК. // Генетика, 2009 том 45, № 4. С. 526−535.
  24. A.M., Караул ова Л.П., Троицкая Т. С. Четвертичные отложения Приморья. Стратиграфия и палеогеография. Новосибирск: Наука, 1980.234 с.
  25. A.M., Гребенщикова Т. А., Пушкарь B.C., Разжигаева Н. Г., Волков В. Г., Ганзей Л. А., Мохова Л. М., Базарова В. Б., Макарова Т. Р. Климатические смены на территории юга Дальнего Востока в позднем кайнозое (миоцен-плейстоцен). Владивосток, 1996. 57 с.
  26. М.А. Тетеревинные и фазановые СССР. Алма-Ата: Наука, 1977. 295 с.
  27. В.Д. Отчет по разделу: Изучение современного состояния популяций перелетных птиц, находящихся под угрозой исчезновения. 1985.
  28. Е.В. Генетика изоферментов растений. Новосибирск: Наука, 1986. 144 с.
  29. Ю.А., Колесников Б. П. Природа южной половины Советского Дальнего Востока. М.: 1949. С. 320−321
  30. В.А. Маньчжурский фазан в Приморье. М.: Просвещение, 1948. 57 с.
  31. Р. Путешествие по долине реки Уссури. Том 1. Спб. 1861. С. 171.
  32. Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М.: Наука, 1984.480 с.
  33. С.Г. Сельское хозяйство и охрана фауны. М.: Агропромиздат, 1990. 112 с.
  34. Э. Зоологический вид и эволюция. М.: Мир, 1968. 597 с.
  35. А.П. Состояние ресурсов зимующих куриных птиц России: продолжение мониторинга. // Орнитологические исследования в Северной
  36. Евразии: тез. XII междунар. орнитол. конф. Северной Евразии. Ставрополь: Изд-во СГУ, 2006. С. 345−346.
  37. С.П. Динамика численности куриных на территории с интенсивным антропогенным воздействием. // Ресурсы животного мира Сибири. Охотничье-промысловые звери и птицы: сб. науч. тр. -Новосибирск: Наука, 1990. С. 91−93.
  38. A.A. Причины динамики границ ареала и численности фазанов в СССР. // «Охрана природы» 1950, № 2. С. 94−105.
  39. В.А., Николаев И. Г. Питание фазана {Phasianus colchicus) в Приморском крае // Экология и зоогеография некоторых позвоночных суши Дальнего Востока: Сб. науч. тр. АН СССР ДВНЦ БПИ. Владивосток, 1978. С. 72−78.
  40. E.H. Птицы Южного Приморья. Новосибирск: Наука, 1973. 376 с. Пржевальский Н. П. Путешествие в Уссурийском крае, 1867−1869. -СПб.: 1870. 298 с.
  41. Приморский край социально экономические показатели. Федеральная служба государственной статистики. Территориальный орган Федеральной статистики по Приморскому краю. 2009. 342 с.
  42. Производственно-экономические показатели развитияагропромышленного комплекса России. Министерство сельского хозяйства и продовольствия Российской федерации. М.: Информагробизнес, 1996. 300 с.
  43. P.JI. Семейство Фазановые Phasianidae // Птицы СССР (Курообразные, Журавлеобразные). JL, Наука, 1987. С. 119−135.
  44. А.И., Бессарабов Б. Ф. Фазановые: содержание и разведение. М.: Агропромиздат, 1991. 173 с.
  45. Г. Д. Роль снежного покрова в физико-географическом процессе. «Труды Института географии АН СССР», 1948. С. 171−174.
  46. А.П. Мультилокусный ДНК-фингерпринтинг в генетико-популяционных исследованиях биоразнообразия. // Молекуляр. биология. Т. 33, № 6, 1999. С. 997−1011.
  47. И.А. Влияние механизации и химизации сельского хозяйства на численность тетеревиных птиц Енисейской равнины // Вестник КрасГАУ. 2009, № 4. С. 125−130.
  48. H.H., Лобанов В. А. Птицы и пестициды. // Мат-лы 6-й Всесоюз. орнитол. конф. (Москва, 1−5 февраля 1974 г.). М.: Изд-во МГУ, 1974. — 4.2. С. 358−359.
  49. М.М., Горчаковская H.H. К экологии уссурийского фазана // Бюллетень М. о-ва исп. Биологии, 1952 T. LVII (3). С. 27−31.
  50. A.A. Роль стихийных бедствий в динамике численности птиц в Казахстане. Новости орнитологии. Алма-Ата, 1965.
  51. В.Е., Шатуновский М. И. Можно ли сохранить биологическое разнообразие // Вестн. РАН. 1995, Т. 66, № 5. С. 422−424.
  52. Е.П. Наблюдения над распространением и биологией птиц в низовьях р. Иман // Тр. Моск. зоопарка, Т. 1. 1940. С. 77−136.
  53. Л.С. Конспект орнитологической фауны России и сопредельных территорий, Изд-во. ИКЦ «Академкнига», М.: 2003. 807 с.
  54. И.Д. Анатомо-физиологические основы видообразования позвоночных. Л: Наука, 1970. 367 с.
  55. А.Л., Богачев A.C. К экологии фазана в свете проблем биоразнообразия // V Дальневосточная конф. По заповедному делу. -Владивосток, 2001. С. 273−274.
  56. В.Г. К динамике численности тетеревиных птиц в Томской области. // Мат-лы 6-й Всесоюз. орнитол. конф. (Москва, 1−5 февраля 1974 г.). М.: МГУ, 1974. — 4.2. С. 297−298.
  57. A.A. Зимняя орнитофауна кладбищ и парков города Тирасполя. // Русский орнитологический журнал. Том 15, 2006. С. 363−371.
  58. В.М., Чипизубова М. Н. К особенностям динамики растительных формаций приморья в голоцене. // Бюллетень Ботанического сада-института ДВО РАН, 2009. Вып. 3. С. 52−58.
  59. П.В., Мацишина Н. В. Особенности питания фазана в условиях Приморского края // Животный и растительный мир Дальнего востока. Вып. 13. Серия: Экологий и систематика животных. Уссурийск: УГПИ, 2009. С. 46−49.
  60. П.В. Полиморфизм биохимических маркеров фазана маньчжурского (Phasianus colchicus pallasii Rothschild) // Животный и растительный мир Дальнего Востока. № 13 Уссурийск. 2009. С. 40−45
  61. А.Н. Снежный покров в Жизни млекопитающих и птиц СССР. М., 1946. 152 с.
  62. А.Н. О значении структуры снежного покрова в экологии и географии млекопитающих и птиц. Роль снежного покрова в природных процессах. М., 1961. 141 с.
  63. А.Н., Бичеров А. П., Мельгунов И. J1. Колорадский жук в питании птиц // Защита растений. № 11.- М.- Колос, 1983. С. 38−39.
  64. A.B., Ахунов Э. Д., Вахитов В. А. Секвенирование ДНК. М.: Наука, 1999. 429 с.
  65. Н.М. Некоторые вопросы влияния ядохимикатов и минеральных удобрений на птиц. // Проблемы орнитологии: тр. 3-й Всесоюз. орнитол. конф. Львов, 1964. С. 120−124.
  66. H.A. Регуляция теплообмена у птиц (эколого-физиологический очерк). М., 1968.
  67. JI.M. Промысловые, охотничьи и хищные птицы Приморья. ДВФ АН СССР. Владивосток, 1936. С. 278−287.
  68. Arbogast В., Kenagy G.J. Comparative phylogeography as an integrative pproach to history biogeography. J. Biogeogr., 2001. 28, P. 819−825.
  69. Aurelle D., Berrebi P. Genetic structure of brown trout (Salmotrutta L.) populations from south-western France: data from mitochondrial control region variability. Mol. Ecol. 2001. 10, P. 1551−1561.
  70. Austin O., Kuroda N. The birds of the japan their status and distribution. // Bulletin of the Meseum of Comparative Zoology 1953. Vol. 109, № 4. P 392−393.
  71. Avise J.C. Molecular Markers, Natural History and Evolution. Chapman and Hall, New York. 1994.
  72. Avise J.C. Phylogeography: The History and Formation of Species. Harvard University Press, Cambridge. 2000.
  73. Aquadro C.F., Greenberg B.D. Human mitochondrial DNA variation and evolution: Analysis of nucleotide sequences from seven individuals. // Genetics 1983. 103. P. 287−312.
  74. Arber W. Promotion and limitation of genetic exchange. // Science. 1979. Vol. 205. P. 361−365.
  75. Baines D., Hudson P.J. The decline of Black Grouse in Scotland and northern England. Bird Study 1995. 42. P. 122−131.
  76. Baker A.J., Marshall H.D. Mitochondrial control region sequences as tools for understanding evolution. In: Mindell, DP. (Ed.), // Avian Molecular Evolution and Systematics. Academic Press, San Diego. 1997. P. 51−82.
  77. Barrowclough G.F., Groth J.G., Mertz L.A., Gutierrez R.J. Phylogeographic structure, gene flow and species status in blue grouse (Dendragapus obscurus) // Mol. Ecol. 2004. 13: P. 1911−1922.
  78. Bouzat J.L., Lewin H.A., Paige K.N. The ghost of genetic diversity past: historical DNA analysis of the Greater Prairie Chicken. American Naturalist 1998. 152 p.
  79. Brazil M. Birds of East Asia (China, Taiwan, Korea, Japan and Russia). Princeton and Oxford, 2009. 529 p.
  80. Brown W.M., George M.Jr., Wilson A.C. Rapid evolution of animal mitochondrial DNA. // Acad. Natl. Sei. USA. 1979. 76, P. 1967−1971.
  81. Brown G.G., Gadaleta G., Pepe G., Saccone C, Sbisa E. Structural conservation and variation in the D-loop containing region of vertebrate mitochondrial DNA. // J. Mol. Biol. 1986. 192, P. 503−511.
  82. Chang D., Clayton D. A novel endoribonuclease cleaves at a priming site of mouse mitochondrial DNA replication. // EMBO J. 1987. 6. P. 409−117.
  83. Chen M.-H., Yuan H.-W., Lin Y.-S. Genetic diversity and population genetic structure of the ring-necked pheasant (Phasianus colchicus) in Taiwan // Jour. Exp. For. Nat. Taiwan Univ. 2004. V. 18. № 2. P. 65−75
  84. Cheng T.H. Fauna Sinica. Aves. Galliformes, vol 4. Science Press, Beijing, China. 1978
  85. Clement M, Posada D, Crandall K. TCS: a computer program to estimate gene genealogies. Molecular Ecology 2000. 9(10): 1657−1660.
  86. Christisen D.M. National status and management of Greater Prairie Chicken. Transaction of the North America Wildlife Conference 1969. 34:207−212.
  87. Datta U., Datta P., Mandal R.K. Cloning and characterization of highly repeatitive fish nucleotide sequence. // Gene. 1988. Vol. 62. P. 331−336.
  88. Desjardins. P., Morais R. Sequence and gene organisation of «the chutken mitochondrial genome: A novel gens order in higher vertebrates. // J. Mol. Biol. 1990.212, P. 599−634.
  89. Evans, P.G.H. Electrophoretic variability of gene prodacts. In: Avian Genetics (eds F. Cooke and P. AJ Buckley), Academic Press, New York, 1987. P. 105−162.
  90. Excoffier L., Laval G., Schneider S. Arlequin version 3.0: an integrated software package for population genetics data analysis. Evolutionary Bioinformatics 2005. Online 1, P. 47−50.
  91. Felsenstein J. Numerical methods for inferring evolutionary trees // Quart. Rev. Biol. 1982. V. 57. P. 379−404.
  92. Felsenstein J. Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap //Evolution. 1985. V. 39. P. 783−791.
  93. Ford E., Polymorphism and Taxonomy // The new systematics. Oxford: Clarendon Press, 1940. P. 493−513.
  94. Fry A.J., Zink R.M. Geographic analysis of nucleotide diversity and song sparrow (Aves: Emberizidae) population history // Mol. Ecol. 1998. 7: P. 13 031 313.
  95. Fu Y.X., Li W.H. Statistical tests of neutrality of mutations // Genetics. 1993. 133: P. 693−709.
  96. Fu Y.-X. Statistical tests of neutrality of mutations against population growth, hitchhiking and background selection. Geneticsl997. 147. P. 915−925.
  97. Galtier N., Gouy M., Gautier C. SEAVIEW and PHYLOWIN: two graphic tools for sequence alignment and molecular phylogeny // Comput. Appl. Biosci. 1996. V. 12. P. 543−548.
  98. Glenn T.C., Stephan W., Braun M. Effects of a population bottleneck on whooping crane mitochondrial DNA variation // Conservation Biology. 1999. V. 13. No. 5. P. 1097−1107.
  99. Godoy J.A., Negro J.J., Hiraldo F., Donazar J.A. Phylogeography, genetic structure and diversity in the endangered bearded vulture (Gypaetus barbatus, L.) as revealed by mitochondrial DNA // Mol. Ecol. 2004. 13: P. 371−390.
  100. Heath D.D., Iwama G.K., Delvin R.H. DNA fingerprinting used to test for family effects on precocious sexual maturation in two populations of Oncorhynchus tchawytscha (chinook salmon) // Heredity. 1994. Vol. 73. P. 616 624.
  101. Hasegawa M, Kishino H, Yano T. Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA // J. Mol. Evol. 1985. V. 22. № 2. P. 160 174.
  102. Hewitt G.M., The genetic legacy of the Quaternary ice ages. Nature 405, 2000. P. 907−913.
  103. Hill D., Robertson P. The pheasant ecology, management and conservation. Oxford: BSP Professional Books, 1988. 282 p.
  104. Hood L.E., Hunkapiller M.W., Smith L.M. Automated DNA sequencing and analysis of the human genome // Genomics. 1987. V. 1. № 3. P. 201−212.
  105. Jeffreys A.J., Wilson V., Lay Thein S. Hypervariable «minisatellite» region in human DNA. // Ibid. 1985. Vol. 314. P. 67−73.
  106. Johnsgard P.A. The pheasants of the world: biology and natural history. Second edition. Smithsonian Institution Press, Washington, DC, USA. 1999
  107. Kan Y.W., Dozy A.M. Polymorphism of DNA sequence adjacent to the ?-globin structural gene. Its relation to the sickle mutation. // Proc. Nat. Acad. Sei. US. 1978. Vol. 75. P. 5631−5635.
  108. Kashi Y., Soller M. Functional roles of microsatellites. // Microsatellites/ Evolution and application / Eds D.B. Goldstein, C. Schlotterer. N.Y.: Oxford Univ. press Inc., 1999. P. 10−23.
  109. Kimura M., Crow J.F. The number of alleles that can be maintained in a finite population // Genetics. 1964. V. 49. № 4. P. 725−738.
  110. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences // J. Mol. Evol. 1980. V. 16. № 2. P. 111−120.
  111. Krutovskii K.V., Vollmer S. S., Sorensen F. C. et al. RAPD genome map of Douglas-fir. // J. Heredity. 1998. 89. P. 197−205.
  112. Kumar S., Tamura K., Nei M. MEGA3: Integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment // Brief Bioinform. 2004. V. 5. P. 150−163.
  113. Kvist L., Ruokonen M., Thessing A., Lumme J., Orell M. Mitochondrial control region polymorphism reveal high amount of gene flow in Fennoscandian willow tits (Parus montanus borealis) // Hereditas. 1998. 128. P. 133−143.
  114. Kvist L., Ruokonen M., Lumme J., Orell M. The colonization history and present-day population structure of the European great tit (Parus major major) // Heredity. 1999. V. 82. P. 495−502.
  115. Milot E., Gibbs H.L., Hobson K.A. Phylogeography and genetic structure of northern populations of the yellow warbler (Dendroica petechia) // Mol. Ecol. 2000. 9. P. 667−681.
  116. Mindell D.P., Sorenson M.D., Dimcheff D.E. Multiple independent origins of mitochondrial gene order in birds. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA 1998. 95, P. 10 693−10 697.
  117. Moore W.S. Inferring phylogenies from DNA variation: Mitochondrial-gene trees versus nuclear-gene trees. // Evolution. 1995. 49. P. 718−726.
  118. Mourn T., Arnason E. Genetic diversity and population history of two related seabirds based on mitochondrial DNA control region sequences // Mol. Ecol. 2001. 10. P. 2463−2478
  119. Mullis K., Faloona F., Scharf S., Saiki R.K., Horn G.T., Erich H.A. Specific enzymatic amplification of DNA in vitro: the polymerase chain reaction // Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 1986. V. 51. № 1. P. 263−273.
  120. Nei M. Molecular evolutionary genetics. N. Y.: Columbia Univ. press, 1987. 512 p.
  121. Page R.D.M., Holmes E.C. Molecular Evolution: A phylogenetic approach // Ed. M.A. Maiden. USA: Blackwell Science. 1998. — 346 p.
  122. Paglia G., Morgante M. PCR-based multiplex DNA fingerprinting techniques for the analisis of conifer genomes. // Mol. Breed. 1998. Vol. 4. P. 173−177.
  123. Pavlova A., Zink R.M., Rohwer S., Koblik E.A., Red’kin Y.A., Fadeev I.V., Nesterov E.V. Mitochondrial DNA and plumage evolution in the white wagtail Motacilla alba // Journal of Avian Biology. 2005. 36. P. 322−336.
  124. Prober J.M., Trainor G.L., Dam R.J., Hobbs F.W., Robertson C.W., Zagursky R.J., Cocuzza A.J., Jensen M.A., Baumeister K. A system for rapid DNAsequencing with fluorescent chain-terminating dideoxynucleotides // Science. 1987. V. 238. P. 336−341.
  125. Qian H., Ricklefs R.E., White P. S., Beta diversity of angiosperms in temperate floras of east Asia and east North America. Ecol. Lett. 2005. 8. P. 1522.
  126. Qu J., Liu N., Bao X., Wang X. Phylogeography of the ring-necked pheasant (Phasianus colchicus) in China // Molecular Phylogenetics and Evolution 2009 52 P.125−132
  127. Qu Y.H., Ericson P.G.P., Lei F.M., Li S.H. Postglacial colonization of the Tibetan plateau inferred from the matrilineal genetic structure of the endemic rednecked snow finch, Pyrgilauda ruficollis // Molecular Ecology. 2005. 14. P. 17 671 781.
  128. Ramos-Onsins S.E., Rosas J. Statistical properties of new neutrality tests against population growth // Molecular Biology and Evolution. 2002. 19. P. 20 922 100.
  129. Randi E., Tabarroni C., Rimondi S., Lucchini V., Sfougaris A. Phylogeography of the rock partridge (Alectoris graeca) // Molecular Ecology. 2003. 12. P. 2201−2214.
  130. Ridley M.W., Hill D.A. Social organization in the pheasant (Phasianus colchicus): harem formation, mate selection and the role of mate guarding // J. Zool. 1987. V. 21 l.P. 619−630.
  131. Rohlf F.J. A probabilistic minimum spanning tree algotithm // Inf. Proc. Letters. 1973. V. 7. № 1. P. 44−48.
  132. Rogers A.R., Harpending H. Population growth makes waves in the distribution of pairwise genetic differences // Mol. Biol. Evol. 1992. 9(3): 552−569.
  133. Rogers A.R. Genetic evidence for a Pleistocene population explosion // Evolution. 1995. V. 49. № 4. P. 608−615.
  134. Rozas J., Sanchez-DelBarrio J.C., Messequer X., Rozas R. DnaSP, DNA polymorphism analyses by the coalescent and other methods/ Bioinformatics. 2003. 19. P. 2496−2497.
  135. Ruiz-Martinez M.C., Berka J., Belenkii A., Foret F., Miller A.W., Karger B.L. DNA sequencing by capillary electrophoresis with replaceable linear Polyacrylamide and laser-induced fluorescence detection // Anal. Chem. 1993. V. 65. P. 2851−2858.
  136. Ruokonen M., Kvist L., Lumme J. Close relatedness between mitochondrial DNA from seven Anser goose species // J. Evol. Biol. 2000. 13. P. 532−540.
  137. Ruokonen M., Kvist L. Structure and evolution of the avian mitochondrial control region. // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2002. P. 422−432.
  138. Saccone C, Pesole G., Sbisa E. The main regulatory region of mammalian mitochondrial DNA: structure-function model and evolutionary pattern. I. // Mol. Evol. 1991. 33. P. 83−91.
  139. Saccone C., Attimonelli M., Sbisa E. Structural elements highly preserved during the evolution of the D-loop-containing region in vertebrate mitochondrial DNA // J. Mol. Evol. 1987. V. 26. P. 205−211.,
  140. Saiki R.K., Gelfand D.H., Stoffel S., et al. Premier-directed enzymatic amplification of DNA with termostable DNA polymerase. // Science. 1988. Vol. 239. P. 487−491.
  141. Sakane T. Jn the food habits of some Chinese birds. On the food habits of the Ring-necked Pheasant (Phasianus colchicus). «Tori», 1975. v. XXIII, № 97, p. 45−52.
  142. Sbisa E., Tanzariello F., Reyes A., Pesole G., Saccone C. Mammalian mitochondrial D-loop region structural analysis: Identification of new conservedsequences and their functional and evolutionary implications. 11 Gene 1997. 205. P. 125−140.
  143. Slatkin M. A measure of population subdivision based on microsatellite allele frequencies. // Genetics. 1995. Vol. 139. P. 457−462.
  144. Smith L.M., Sanders J.Z., Kaiser R.J., Hughes P., Dood C., Connell C.R., Heiner C., Kent S.B.H., Hood L.E. Fluorescence detection in automated DNA sequences analysis //Nature. 1986. V. 321. P. 674−679.
  145. Sneath P.H.A., Sokal R.R. Numerical Taxonomy San Francisco: Freeman, 1973.-573 p.
  146. Southern E.M. Detection of specific DNA fragments separated by gel electrophoresis // J. Mol. Biol. 1975. Vol. 98. P. 503−517.
  147. Southern, S.O., Southern, P.J., Dizon, A.E. Molecular characterisation of cloned dolphin mitochondrial genome. // J. Mol. Evol. 1988. 28. P. 32−42.
  148. Staden R., Beal K.F., Bonfield J.K. The Staden Package 1998 // Comput. Meth. Mol. Biol. 1999. V. 132. P. 115−130.
  149. Starling-Westerberg, A. The habitat use and diet of Black Grouse Tetrao tetrix in the Pennine hills of northern England. Bird Study 2001. 48. P. 76−89.
  150. Swerdlow H., Gesteland R. Capillary gel electrophoresis for rapid, high resolution DNA sequencing//Nucl. Acids Res. 1990. V. 18. № 6. P. 1415−1419.
  151. Swofford D.L., Olsen G.J., Waddel P.J., Hillis D.M. Phylogenetic inference // Molecular Systematics / Eds. Hillis D. M. et al. USA: Sinauer. Assoc. Inc., 1996.-P. 407−514.
  152. Tajima F. Evolutionary relationship of DNA sequences in finite populations // Genetics. 1983. V. 105. № 2. P. 437−460.
  153. Tajima F. The effect of change in population size on DNA polymorphism. Genetics. 1989. 125. P. 597−601.
  154. Tsukada M. Late Pleistocene Vegetation and Climate in Taiwan (Formosa) // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1966. V. 55. P. 543−548.
  155. Uimaniemi L., Orell M., Kvist L., Jokimaki J., Lumme J. Genetic variation of the Siberian tit Parus cinctus populations at the regional level: a mitochondrial sequence analysis // Ecography. 2003. V. 26. P. 98−106.
  156. Vogel F., Motulsky A.G. Human genetics. 3rd ed. B. etc.: Springer, 1997. 8511. P
  157. Ward R.D., Woodwark M., Skibinski D.O.F. A comparison of genetic diversity levels in marine, freshwater and anadromose fishes. // J. Fish Biol. 1994. Vol. 44. P. 213−232.
  158. Weber J.L., Wong C. Mutation of human short tandem repeats. // Hum. Mol. Genet. (US). 1993. Vol. 2. P. 1123−1128.
  159. Weir B.S., Cockerham C.C. Estimating F-statistics for the analysis of population structure //Evolution. 1984. V. 38. № 6. P. 1358−1370.
  160. Wenink P.W., Baker A.J. Mitochondrial DNA lineages in composite flocks of migratory and wintering dunlins (Calidris alpine) The Auk. 1996. 113(4). P. 744 756.
  161. Westemeier R.L., Edwards W.R. Prairie-Chickens: survival in the midwest. In H. Kallman, editor. Restoring America’s wildlife 1937−1987. U.S. Fish and Wildlife Service, Washington, D.C. 1987.
  162. Westmeier R.L., Simpson S. A, Cooper D.A. Successful exchange of Prairie-Chicken eggs between nests in two remnant populations. Wilson Bulletin 1991.103. P. 717−720.
  163. Westerskov K. Winter food and feeding habits of the partridge (Perdix perdix) in the Canadian prairie. // Canad. J. Zool., 1966, 44, № 2.
  164. Wolfe T. Inventory of Prairie Chicken booming grounds. Minnesota Prairie Chicken Society Newsletter. 1995. 21. P. 114−138.
  165. Williams J.G.K., Hanafey M.K., Rafalski J.A., Tingey S.V. Genetic analysis using random amplified polymorphic DNA markers: Methods in Enzymology. // Recombinant DNA. San Diego: Academic Press, 1993. Vol. 218.P. 704−740.
  166. Willis K.J., Whittaker R.J., Species diversity-scale matters. // Science, 2002. 295. P. 1245−1248.
  167. Wright J.M. Mutation at VNTRs: Are minisatellites the evolutionary progeny of microsatellites? // Genome. 1994. Vol. 37. P.345−347.
  168. Yeater R.E. The Prairie Chicken in Illinois. // Illinois Natural History Survey Bulletin, 1943.22. P. 377−416.
  169. Zhan X.-J., Zhang Z.-W. Molecular phylogeny of avian genus Sirmaticus based on the mitochondrial cytochrome b gene and control region // Zool. Sci. 2005. V. 22. P. 427−435
  170. Zink R.M., Blackwell R.C. Molecular systematics and biogeography of aridland gnatcatchers (genus Polioptila) and evidence supporting species status of the California gnatcatcher (Polioptila californica). II Mol. Phylogenet. Evol. 1998. 9. P. 26−32.
  171. Zink R.M., Drovetski S.V., Questiau S., Fadeev I.V., Nesterov E.V., Westberg M.C., Rohwer S. Recent evolutionary history of the bluethroat (Luscinia svecica) across Eurasia // Mol. Ecol. 2003. 12. P. 3069−3075.
  172. Zink R.M., Rohwer S., Drovetski S.V., Blackwell-Rago R.C., Farrell S.L. Holarctic phylogeography and species limits of three-toed woodpeckers // Condor. 2002. V. 104. № i.p. 167−170.
Заполнить форму текущей работой

На отлично!