Математическое моделирование генетической регуляторной системы SOS-ответа у бактерий Escherichia coli
После того, как была открыта структура молекулы ДНК и ее роль «информационного центра» клетки, в котором сосредоточена генетическая информация о биохимическом составе клетки и путях ее развития, стало очевидно, что при генетическом действии излучения мишенью является молекула ДНК. В дальнейшем оказалось, что с момента появления первичного повреждения в молекуле ДНК, которым является изменение… Читать ещё >
Содержание
- 1. Динамическая модель 1ехА-гесА-састемы
- 1. 1. Экспериментальные данные по регуляции 1ехА-гесА-сжстешы
- 1. 1. 1. Центральная роль 1ехА-гесА-системы в регуляции SOS-ответа
- 1. 1. 2. Действие продукта гена lex А
- 1. 1. 3. Действие продукта гена гесА
- 1. 1. 4. Активация продукта гена гесА
- 1. 2. Модель репрессии транскрипции продуктом гена lexA
- 1. 3. Динамика продуктов генов lexA и гесА
- 1. 3. 1. Скорости изменения концентраций
- 1. 3. 2. Уравнения модели
- 1. 3. 3. Параметры модели
- 1. 1. Экспериментальные данные по регуляции 1ехА-гесА-сжстешы
- 2. 1. Биохимические данные по индуцирующему сигналу после
- 2. 2. Динамика индуцирующего сигнала после УФ-облучения
- 2. 2. 1. Уравнения модели для клеток дикого типа
- 2. 2. 2. Уравнения модели для клеток миг-мутанта
- 2. 2. 3. Параметры модели
- 3. 1. Модель индукции гена зи1А
- 3. 2. Безразмерные уравнения
- 3. 3. Качественное исследование уравнений модели
- 3. 3. 1. Неиндуцированная 1ехА-гесА-сжстеиа,
- 3. 3. 2. Индуцированная 1ехА-гесА-система
- 3. 4. Численное исследование уравнений модели
- 3. 4. 1. Фитирование параметров
- 3. 4. 2. Устойчивость особых точек системы
- 3. 4. 3. Динамика концентрации продукта гена ЫхА
- 3. 4. 4. Динамика концентраций продуктов генов гесА и ви1А
- 3. 4. 5. Динамика концентрации активного продукта гена гесА
- 3. 4. 6. Динамика индуцирующего сигнала
- 3. 4. 7. Доза-эффект при индукции гесА и зи1А
Математическое моделирование генетической регуляторной системы SOS-ответа у бактерий Escherichia coli (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Одной из актуальных задач современной биофизики является исследование генетического действия на клетки с различной организацией генетического аппарата физических и химических факторов. То, что облучение клеток, например, ионизирующим или ультрафиолетовым излучением приводит к возникновению мутаций или к гибели клеток, известно достаточно давно. В частности, Г. А. Надсон в 1920 г. отмечал, что «действие радия передается по наследству». В начале развития радиационной биологии основное внимание при исследовании биологического действия излучения обращалось на физические аспекты взаимодействия излучения с биологическим веществом клетки. Количественные подходы к анализу особенностей реакций клеток на воздействие излучения основывались на принципах попадания, мишени и усилителя. Существо этих принципов сводится к следующему. Согласно принципу попадания, впервые сформулированному в работе [1], количественный анализ любых элементарных реакций любых биологических объектов на излучение имеет в качестве физической основы дискретный и статистический характер взаимодействия излучения с веществом. Согласно принципу мишени, впервые введенному в работах [2, 3], в клетке имеется некоторый чувствительный объем, поражение которого приводит к наблюдаемой реакции. Наконец, принцип усилителя, сформулированный в работах известного русского радиобиолога Н.В. Тимофеева-Рессовского [4], утверждает роль конвариантной редупликации (т.е. матричного самовоспроизведения биологических молекул) в реализации радиационного поражения.
После того, как была открыта структура молекулы ДНК и ее роль «информационного центра» клетки, в котором сосредоточена генетическая информация о биохимическом составе клетки и путях ее развития, стало очевидно, что при генетическом действии излучения мишенью является молекула ДНК. В дальнейшем оказалось, что с момента появления первичного повреждения в молекуле ДНК, которым является изменение химического состава или физического состояния ДНК, до проявления конечной реакции (например, генетической мутации), в клетке протекает целый ряд процессов. Повреждение гена не реализуется сразу же непосредственно в виде мутации, а образует вначале т.н. премутационное повреждение. Премутационные повреждения в дальнейшем претерпевают определенные физические и химические превращения, прежде чем закрепиться в виде мутации. Была показана роль процессов восстановления ДНК в закреплении мутаций.
Большинство работ, посвященных исследованию генетического действия излучения, было выполнено на бактериях Escherichia coli. Уже в первой работе, посвященной явлению фотореактивации [5], было показано, что освещение видимым светом клеток Е. coli, облученных ультрафиолетовым (УФ) светом, уменьшает число мутаций. В дальнейшем было обнаружено, что эффективность индукции мутаций у бактерий Е. coli при действии УФ-излучения зависит от активности генов lexA и гесА [6]. На основе этих и других наблюдений в дальнейшем было сделано предположение о том, что мутагенез у Е. coli, индуцированный.
УФ-излучением, также как и некоторые другие индуцибельные клеточные реакции (называемые в совокупности SOS-ответом), находится под контролем генетической регуляторной системы, состоящей из генов lexA и гесА (/ежЛ-гееЛ-системы) [7].
Таким образом, у бактерий Е. coli генетическое действие излучения находится под контролем генетической регуляторной 1ехА-гесА-системы. Для того, чтобы понять механизм генетического действия излучения, необходимо разобраться в механизме регуляции и функционирования генетической регуляторной 1ехА-гесА-системы. Особенность 1ехА-гесА-системы у Е. coli состоит в том, что в ходе ее индукции проявляются метаболически различные реакции, тогда как большинство генетических регуляторных систему прокариот, организованных в виде оперона или регулона, контролируют гены, продукты которых участвуют в одном и том же метаболическом пути. Эта особенность сближает структуру lexA-гесА-системы с генетическими регуляторными системами в эукариоти-ческих клетках, которые контролируют процессы клеточного развития или дифференциации. Кроме того, существуют данные, указывающие на существование подобных генетических регуляторных систем в эукарио-тических клетках, контролирующих клеточные реакции на излучение, в том числе и радиационно-индуцированный мутагенез. Итак, исследование генетической регуляторной lex А-г ее А-системы важно, во-первых, потому, что это прольет свет на структурно-функциональную организацию и механизмы регуляции 1ехА-гесА-системы и подобных генетических регуляторных систем как у прокариот, так и у эукариотво-вторых, потому, что это прояснит механизмы радиационно-индуцированного мутагенеза у прокариот, и намекнет на объяснение подобных мезанизмов у эукариотических клеток.
К настоящему времени накоплено достаточно много молекулярно-биологических и генетических данных, касающихся организации и функционирования 1ехА-гесА-системы. Одним из способов изучения динамики сложных многокомпонентных регуляторных систем, таких, как lexA-гесА-система, является построение математических моделей, описывающих структуру и функционирование этих систем. Математическое моделирование регуляторных систем необходимо для решения следующих задач.
1. Идентифицировать принципы структурного устройства генетических регуляторных систем.
2. Проанализировать динамику ответа нормальных (дикого типа) и мутантных клеток на внешнее индуцирующее воздействие.
3. Предсказать количественные эффекты мутаций в компонентах системы на регуляторные выходы.
4. Проверить состоятельность и полноту лежащей в основе модели гипотетической схемы регуляторной системы.
Целью настоящей работы является: разработать динамическую модель генетической регуляторной /егЛ-гес/1-системыразработать модель, описывающую динамику уровня индуцирующего сигнала после облучения УФ-светомна основе предложенных моделей проанализировать динамическое поведение 1ехА-гесА-системы и индуцирующего сигнала после действия УФ-излучения в клетках Е. coli дикого типа и иуг-мутанта с дефектом в системе эксцизионной репарациина основе полученных результатов проанализировать динамику SOS-ответа.
Для решения поставленных задач изучения генетической регулятор-ной 1ехА-гесА-системы в работе использовался обычный метод изучения биологических систем, состоящий в построении динамической модели и ее описание дифференциальными уравнениями, т. е. в построении системы уравнений и исследование их решений.
Диссертационная работа состоит из введения, трех глав и заключения. В начале каждой главы приводится постановка задачи и краткое изложение результатов.
Результаты работы можно сформулировать в следующих основных положениях, которые и выносятся на защиту.
1. Разработана модель и получены соответствующие дифференциальные уравнения, описывающие динамику генетической регуляторной системы SOS-ответа у бактерий Е. coli.
2. В рамках модели регуляторной системы формально описано явление репрессии продуктом гена lex А, одним из регуляторов SOS-ответа, транскрипции регуляторных и других генов SOS-ответа. Показано влияние эффекта кооперативности связывания продукта гена lexA с операторной ДНК на динамику регуляции SOS-ответа.
Впервые количественно оценена кооперативность связывания продукта гена 1ехА с операторной ДНК генов 1ехА и гесА.
3. Разработана математическая модель, описывающая динамику индуцирующего сигнала для регуляторной системы 808-ответа, после действия УФ-излучения. Уравнения модели получены для клеток дикого типа и шг-мутанта с дефектом в системе эксцизионной репарации.
4. С помощью численного расчета по уравнениям моделей впервые предсказана динамика продукта гена гесА в активированной кон-формации, одного из регуляторов БОВ-ответа, после действия УФ-из лучения.
5. Показано, что эксцизионная репарация оказывает влияние на динамику регуляции и индукции БОБ-ответа после У Ф-из лучения, модулируя распределение продукта гена гесА между его нормальной и активированной конформацией.
6. Рассчитаны и проанализированы динамические кривые всех ре-гуляторных компонент БОБ-ответа после действия УФ-излучения для случая клеток дикого типа и миг-мутанта: уровня индуцирующего сигнала, продуктов генов 1ехА и гесА (в нормальной и активированной конформациях), а также продукта гена зи1А.
7. Рассчитаны и проанализированы дозовые зависимости максимальных концентраций (в ходе индукции после действия УФ-излучения) продуктов генов гесА и зи1А. для случая клеток дикого типа и шг-мутанта.
Считаю своим приятным долгом выразить искреннюю благодарность своему научному руководителю профессору Е. А. Красавину за постоянное внимание и помощь при выполнении работы, а также кандидату биологических наук О. В. Комовой за многочисленные обсуждения и внимание в ходе выполнения работы.
Заключение
.
Данная диссертационная работа посвящена математическому моделированию генетической регуляторной системы SOS-ответа бактерий Е. coli. В работе предложена математическая модель генетической регуляторной системы SOS-ответа, модель, описывающая динамику индуцирующего сигнала для регуляторной системы SOS-ответа для случая воздействия на бактерии УФ-светом. На основе предложенных моделей проанализирована динамика регуляторных компонент SOS-ответа, и белков SOS-ответа. Исследовано влияние эксцизионной репарации на динамику регуляции и индукции SOS-ответа.
Список литературы
- F. Dessauer. Uber einige Winkungen der Strahlen 1. Z. Physik, 12:38, 1922.
- A. Crowter. A theory of the action of X-rays on living cells. Proc. Camb. phil. Soc., 23:284, 1927.
- F. Holveck and A. Lacassagne. Sur le mechanisme de Taction cytocaustique des radiations. C. R. Soc. Biol., 103:814, 1930.
- N. W. Timofeef-Ressovsky, K. G. Zimmer, and M. Delbruck. Uber die Natur der Genmutationen und Genstruktur. Nachr. Ges. Wiss. Gottingen, 6:1, 1935.
- A. Keiner. Photoreactivation of ultraviolet-irradiated Escherichia coli, with special reference to the dose-reduction principle and to ultraviolet-induced mutation. J. Bacteriol, 58:511, 1949.
- E. M. Witkin. Ultraviolet mutagenesis and inducible DNA repair in Escherichia coli. Bacteriol. Rev., 40:869, 1976.
- J. W. Little and D. W. Mount. The SOS regulatory system of Escherichia coli. Cell, 29:11, 1982.
- C.B. Аксенов и Е. А. Красавин. Модель SOS-ответа бактерий Escherichia coli при УФ-облучении. 1. Закономерности SOS-ответа. Сообщения ОИЯИ, Р19−95−485, 1995.
- С.В. Аксенов, Е. А. Красавин и A.A. Литвин. Модель SOS-ответа бактерий Escherichia coli при УФ-облучении. 2. Уравнения и параметры модели. Сообщения ОИЯИ, Р19−95−486, 1995.
- С.В. Аксенов, Е. А. Красавин и A.A. Литвин. Модель SOS-ответа бактерий Escherichia coli при УФ-облучении. 3. Кинетика процессов регуляции SOS-ответа. Сообщения ОИЯИ, Р19−95−499, 1995.
- S. V. Aksenov, Е. A. Krasavin, and A. A. Litvin. Mathematical model of the SOS response regulation of an excision repair deficient mutant of Escherichia coli after ultraviolet irradiation. J. Theor. Biol., 186:251,1997.
- S.V. Aksenov and E.A. Krasavin. Mathematical model of the SOS response regulation in Escherichia coli. Abstracts of the International Conference «Deterministic and Stochastic Modelling of Biointeraction», Sofia, Bulgaria, 1997.
- S.V. Aksenov and E.A. Krasavin. Modeling regulation of the SOS response in Escherichia coli bacteria. Abstracts of the International Conference «Nonlinear Phenomena in Biology», Pushchino, Russia, 1998.
- S. V. Aksenov. Dynamics of the inducing signal for the SOS regulatory system in Escherichia coli after ultraviolet irradiation. Math. Biosci., 157:269, 1999.
- S. V. Aksenov. Induction of the SOS response in ultraviolet-irradiated Escherichia coli analyzed by dynamics of LexA, RecA and SulA proteins. J. Biol. Phys., 25:263, 1999.
- H. H. McAdams and A. Arkin. Simulation of prokaryotic genetic circuits. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 27:199, 1998.
- F. Jacob and J. Monod. On the regulation of gene activity. In Symp. Cell. Regul. Mech., page 193. Cold Spring Harbor Lab. Press, NY: Cold Spring Harbor, 1962.
- R. Rosen. Recent developments in the theory of control and regulation of cellular processes. In International Review of Cytology, page 25. Academic, New York, 1968.
- M. Defais, P. Fauquet, M. Radman, and M. Errera. Ultraviolet reactivation and ultraviolet mutagenesis of lambda in different genetic systems. Virology, 43:495, 1971.
- M. Radman. Bhenomenology of an inducbile mutagenic BNA repair pathway in Escherichia coli: SOS repair hypothesis. In Molecular and environmental aspects of mutagenesis, page 128. Charles C. Thomas Publisher, Springfield, 111., 1974.
- M. Radman. SOS repair hypothesis: phenomenology of an inducible BNA repair which is accompanied by mutagenesis. In Molecular mechanisms for repair of BNA, volume Part A, page 355. Plenum Press, New York, 1975.
- G. C. Walker. Mutagenesis and inducible responses to deoxyribonucleic acid damage in Escherichia coli. Microbiol. Rev., 48:60, 1984.
- L. J. Gudas and A. B. Pardee. Model for regulation of Escherichia coli DNA repair functions. Proc. Natl. Acad. Sei., 72:2330, 1975.
- L. J. Gudas and A. B. Pardee. DNA synthesis inhibition and the induction of protein X in Escherichia coli. J. Mol. Biol., 101:459, 1976.
- L. J. Gudas. The induction of protein X in DNA repair and cell division in Escherichia coli. J. Mol. Biol., 104:567, 1976.
- P. T. Emmerson and S. C. West. Identification of protein X of Escherichia coli as the recA+tif+ gene product. Mol. Gen. Genet., 155:77, 1977.
- L. J. Gudas and D. W. Mount. Identification of the recA (tif) gene product of Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sei., 74:5280, 1977.
- J. W. Little and D. G. Kleid. Escherichia coli protein X is the recA gene product. J. Biol. Chem., 252:6251, 1977.
- K. McEntee. Protein X is the product of the recA gene of Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sei., 74:5275, 1977.
- R. Brent and M. Ptashne. Mechanism of action of the lexA gene product. Proc. Natl. Acad. Sei., 78:4204, 1981.
- J. W. Little, D. W. Mount, and C. R. Yanisch-Perron. Purified lexA protein is a repressor of the recA and lexA genes. Proc. Natl. Acad. Sei., 78:4199, 1981.
- G. C. Walker. The SOS response of Escherichia coli. In Escherichia coli and Salmonella typhimurium: Cellular and molecular biology, page 1346. Am. Soc. Microbiol., Washington, DC, 1987.
- R. Brent. Regulation and autoregulation by LexA protein. Biochimie, 64:565, 1982.
- M. Schnarr, J. Pouyet, M. Granger-Schnarr, and M. Daune. Large-scale purification, oligomerization equilibria, and specific interaction of the LexA repressor of Escherichia coli. Biochemistry, 24:2812, 1985.
- B. Kim and J. W. Little. Dimerization of a specific DNA-binding protein on the DNA. Science, 255:203, 1992.
- M. Schnarr, P. Oertel-Buchheit, M. Kazmaier, and M. Granger-Schnarr. DNA binding properties of the LexA repressor. Biochimie, 73:423, 1991.
- J. W. Roberts and C. W. Roberts. Proteolytic cleavage of bacteriophage lambda repressor in induction. Proc. Natl. Acad. Sei., 72:147, 1975.
- J. W. Roberts, C. W. Roberts, and D. W. Mount. Inactivation and proteolytic cleavage of phage lambda repressor in vitro in an ATP-dependent reaction. Proc. Natl. Acad. Sei., 74:2283, 1977.
- J. W. Roberts, C. W. Roberts, and N. L. Craig. Escherichia coli recA gene product inactivates phage lambda repressor. Proc. Natl. Acad. Sei., 75:4714, 1978.
- T. Horii, T. Ogawa, T. Nakatani, T. Hase, H. Matsubara, and H. Ogawa. Regulation of SOS functions: purification of E. coli LexA protein and determination of its specific site cleaved by the RecA protein. Cell, 27:515, 1981.
- J. W. Little, S. H. Edmiston, L. Z. Pacelli, and D. W. Mount. Cleavage of the Escherichia coli lexA protein by the recA protease. Proc. Natl. Acad. Sei., 77:3225, 1980.
- J. W. Little. Autodigestion of LexA and phage lambda repressor. Proc. Natl. Acad. Sci., 81:1375, 1984.
- M. Takahashi, M. Daune, and M. Schnarr. Fluorescence study of the RecA-dependent proteolysis of LexA, the repressor of the SOS system in Escherichia coli. FEBBS Letts., 196:215, 1986.
- M. Sassanfar and J. W. Roberts. Nature of the SOS-inducing signal in E. coli. the involvement of DNA replication. J. Mol. Biol, 212:79, 1990.
- A. J. Clark. recA operator mutations and their usefulness. Biochirnie, 64:669, 1982.
- P. Quillardet, P. L. Moreau, H. Ginsburg, D. W. Mount, and R. Devoret. Cell survival, UV-reactivation and induction of prophage lambda in Escherichia coli K12 overproducing recA protein. Mol. Gen. Genet., 188:37, 1982.
- S. Casaregola, R. D’Ari, and 0. Huisman. Role of DNA replication in the induction and turn-off of the SOS response in Escherichia coli. Mol. Gen. Genet., 185:440, 1982.
- J. W. Little. The SOS regulatory system: control of its state by the level of recA protease. J. Mol. Biol., 167:791, 1983.
- J. W. Roberts and R. Devoret. Lysogenic induction. In Lambda II, page 123. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY, 1983.
- N. L. Craig and J. W. Roberts. E. coli recA protein-directed cleavage of phage lambda repressor requires polynucleotide. Nature (London), 283:26, 1980.
- N. L. Craig and J. W. Roberts. Function of nucleoside triphosphate and polynucleotide in Escherichia coli recA protein-directed cleavage of phage lambda repressor. J. Biol. Chem., 256:8093, 1981.
- M. Chabbert, C. Cazenave, and C. Helene. Kinetic studies of RecA protein binding to fluorescent single-stranded polynucleotide. Biochemistry, 26:2218, 1987.
- S. W. Morrical and M. M. Cox. Light scattering studies of the recA protein of Escherichia coli: relationship between free recA filaments and the recA x ssDNA complex. Biochemistry, 24:760, 1985.
- P. E. Lavery and S. C. Kowalczykowski. Biochemical basis of the constitutive repressor cleavage activity of recA730 protein, a comparison to recA441 and recA803 proteins. J. Biol. Chem., 267:20 648, 1992.
- V. Darby and I. B. Holland. A kinetic analysis of cell division, and induction and stability of recA protein in U.V. irradited lon+ and lon~ strains of Escherichia coli K12. Mol. Gen. Genet., 176:121, 1979.
- Э. Фершт. Структура и механизм действия ферментов. Издательство «Мир», Москва, 1980.
- S. Y. Wang. In Photochemistry and Photobiology of Nucleic Acids, volume 1, page 295. Academic Press, New York, 1976.
- J. Cadet and P. Vigny. In Bioorganic Photochemistry, volume 1, page 1. John Wiley k Sons, New York, 1990.
- E. M. Witkin. Radiation-induced mutagenesis and their repair. Science, 152:1345, 1966.
- С. S. Rupert. Enzymatic photo reactivation: overview. In Molecular mechanisms for repair of DNA, volume Part A, page 73. Plenum Press, New York, 1975.
- A. Sancar and G. B. Sancar. DNA repair enzymes. Annu. Rev. Biochem., 57:29, 1988.
- W. D. Rupp and P. Howard-Flanders. Discontinuities in the DNA synthesized in an excision-defective strain of Escherichia coli following ultraviolet irradiation. J. Mol. Biol., 31:291, 1968.
- T. A. Baker and S. H. Wickner. Genetics and enzymology of DNA replication in Escherichia coli. Annu. Rev. Genet., 26:447, 1992.
- P. Moore, К. K. Bose, S. D. Rabkin, and B. S. Strauss. Sites of termination of in vitro DNA synthesis on ultraviolet- and N-acetylaminofluorene-treated фХ174 templates by prokaryotic and eukaryotic DNA polymerases. Proc. Natl. Acad. Sei., 78:110, 1981.
- К. С. Smith, T.-C. V. Wang, and R С. Sharma. recA-dependent DNA repair in UV-irradiated Escherichia coli. J. Photochem. Photobiol, B, 1:1, 1987.
- В. T. Smith and G. C. Walker. Mutagenesis and more: umuDCand the Escherichia coli SOS response. Genetics, 148:1599, 1998.
- Г. Ю. Данков. Математические модели в радиобиологии. Издательство Московского государственного университета, Москва, 1992.
- С. Е. Helmstetter and S. Cooper. DNA synthesis during the division cycle of rapidly growing Escherichia coli B/r. J. Mol. Biol., 31:507, 1968.
- F. C. Neidhardt, J. L. Ingraham, and M. Schaechter. Physiology of a Bacterial Gell. Sinauer Associates, Sunderland, MA, 1990.
- I. Husein, B. Van Houten, D. C. Thomas, M. Abdel-Monem, and A. Sancar. Effect of DNA polymerase I and DNA helicase II on the turnover rate of UvrABC excision nuclease. Proc. Natl. Acad. Sei., 82:6774, 1985.
- Z. Livneh and I. R. Lehman. Recombinational bypass of perimidine dimers promoted by the recA protein of Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Set., 79:3171, 1982.
- A. Bailone, A. Levine, and R. Devoret. Inactivation of prophage A repressor in vivo. J. Mol. Biol., 131:553, 1979.
- J. M. Weisemann, C. Funk, and G. M. Weinstock. Measurement of in vivo expression of the recA gene of Escherichia coli by using lacZ gene fusions. J. Bacterioi, 160:112, 1984.
- P. Quillardet and M. Hofnung. Induction by UV light of the SOS function sfiA in Escherichia coli strains deficient and proficient in excision repair. J. Bacterioi., 157:35, 1984.
- S. T. Cole. Characterisation of the promoter for the LexA regulated sulA gene of Escherichia coli. Mol. Gen. Genet., 189:400, 1983.
- А. Б. Рубин. Лекции no биофизике. Издательство МГУ, 1994.
- Н. Poincare. Oeuvres, volume 1. Paris, 1928.
- Т. N. L. Patterson. Optimal addition of abscissas to quadrature formulas. Mathematics of Computation, 28:344, 1974.
- G. Byrne and A. Hindmarsh. EPISODE: an experimental package for the integration of systems of ordinary differential equations with banded Jacobians. Lawrence Livermore National Laboratory report UCID-30 132, Livermore, CA, 1976.
- M. J. D. Powell. A FORTRAN subroutine for solving systems of nonlinear algebraic equations. In Numerical Methods for Nonlinear Algebraic Equations, page Chapter 7. Gordon & Breach Scientific Publishers, New York, 1970.
- B. Salles and C. Paoletti. Control of UV induction of recA protein. Proc. Natl. Acad. Sci., 80:65, 1983.