Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Молекулярно-генетические особенности Quorum Sensing систем грамотрицательных бактерий (на модели Serratia) и изучение их роли в регуляции клеточных процессов

Диссертация: Молекулярно-генетические особенности Quorum Sensing систем грамотрицательных бактерий (на модели Serratia) и изучение их роли в регуляции клеточных процессов
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Полученные в работе данные могут быть использованы в дальнейшем в прикладных целях, в частности, для разработки новых подходов для борьбы с бактериальными инфекциями в медицине и сельском хозяйстве, а также в биотехнологии для получения важных для человека штаммов бактерий на основе конструкций, использующих новые принципы регуляции. Установленные закономерности влияния препаратов нитрофурановой… Читать ещё >

Содержание

  • СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
  • I. ВВЕДЕНИЕ
  • II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
  • 1. Общая характеристика семейства Enterobacteriaceae
  • 2. QS системы типа LuxI-LuxR
    • 2. 1. Функционирование QS систем LuxI-LuxR типа на примере Vibrio fischer
    • 2. 2. АГЛ и функционирование Luxl— подобных белков
    • 2. 3. Функционирование LuxR-подобных белков
  • 3. Участие QS систем типа LuxI-LuxR в регуляции клеточных процессов
    • 3. 1. Синтез антибиотиков
    • 3. 2. Регуляция синтеза внеклеточных ферментов
    • 3. 3. Сворминг, свимминг и слайдинг
    • 3. 4. Биопленки
    • 3. 5. Синтез факторов вирулентности
    • 3. 6. Ферментация глюкозы
  • 4. QS системы, использующие аутоиндуктор АИ-2 (II тип QS систем)
  • 5. QS системы, использующие аутоиндуктор АИ
  • 6. QS и апоптоз у бактерий
  • III. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
  • 1. Среды и условия культивирования бактерий
  • 2. Штаммы, плазмиды и олигонуклеотиды
  • 3. Определение продукции АГЛ
  • 4. Определение сигнапьных молекул QS систем второго типа
  • 5. Определение АГЛ с помогцъю тонкослойной хроматографии
  • 6. Количественное определение продукции АГЛ методом жидкостной хроматографии имасс-спектрометрии (LC-MS/MS)
  • 7. Методы работы с ДНК
  • 8. Трансформация Е. col
  • 9. Электропорация
  • 10. Гибридизация ДНК по Саузерну
  • 11. Гибридизация РНК по Нозерну
  • 12. Получение инсерционных мутантов Serratiaproteamaculans 94 методом замены генов
  • 13. Анализ ферментативных активностей
  • 14. Определение способности кпеток бактерий к миграции по поверхности среды
  • 15. Анализ биопленок
  • 16. Определение действия летучих веществ Serratia proteamaculans 94 на фитопатогенные грибы
  • 17. Методика анализа состава бактериальных жирных кислот
  • 18. Метод протеомного анализа
  • IV. РЕЗУЛЬТАТЫ
    • 4. 1. Уточнение идентификации Serratia proteamaculans (с помощью секвенирования генов 16S РНК)
    • 4. 2. Определение синтеза сигнальных молекул QS систем двух типов у
  • Serratia proteamaculans
    • 4. 2. 1. Определение с помощью различных биосенсоров способности бактерий синтезировать сигнальные молекулы QS систем первого типа N-ацил-гомосеринлактоны
    • 4. 2. 2. Определение сигнальных молекул QS систем первого типа N-ацил-гомосеринлактонов с использованием тонкослойной хроматографии
    • 4. 2. 3. Определение синтеза АГЛ с помощью масс-спектрометрического анализа
    • 4. 2. 4. Определение сигнальных молекул QS систем второго типа (гомологи фуранозил-борат-диэфира, АИ-2) у S. proteamaculans
    • 4. 3. Клонирование и секвенирование генов двух типов QS систем
  • Serratia proteamaculans
    • 4. 3. 1. Идентификация, клонирование и изучение особенностей организации генов
  • QS системы первого типа
    • 4. 3. 2. Клонирование и секвенирование гена luxS QS системы второго типа
    • 4. 4. Получение мутантов с нокаутированными генами QS систем
    • 4. 4. 1. Получение мутантов с нокаутированными генами синтазы N-ацил-гомосеринлактонов и рецепторного белка
    • 4. 4. 2. Определение влияния мутаций на синтез АГЛ
    • 4. 4. 3. Получение мутанта в гене luxS (ген синтазы АИ-2 — подобных сигнальных молекул)
    • 4. 5. Изучение транскрипции генов QS системы первого типа в штамме
  • S. proteamaculans 94 и мутантных штаммах
    • 4. 6. Исследование влияния мутации в генах sprl, sprR и luxS на свойства
  • S. proteamaculans
    • 4. 6. 1. Синтез внеклеточных ферментов у штамма S. proteamaculans 94 и мутантов
    • 4. 6. 2. Синтез летучих органических соединений у штамма S. proteamaculans 94 и мутлитцых штаммов
    • 4. 6. 3. Определение способности теток штамма S. proteamaculans 94 и мутантных штаммов к миграции по поверхности среды
    • 4. 6. 4. Влияние QS систем первого типа на формирование биопленок у Serratia
    • 4. 6. 5. Анализ состава бактериальных жирных кислот
    • 4. 7. Сравнение протеомных карт клеточных культур S. proteamaculans 94 и мутантов sprI: Gmr и sprR: Gmr
    • 4. 8. Влияние нитрофуранов, доноров NO и фенольных соединений растительного происхождения на образование биопленок и QS системы бактерий
    • 4. 8. 1. Действие нитрофуранов и доноров NO на формирование биопленок
  • P. aeruginosa РАО 1 и В. cenocepacia 370. Ill
    • 4. 8. 2. Действие нитрофуранов и доноров N0 на биосенсоры на основе штаммов Escherichia coli, используемых для определения N-ацил-гомосеринлактонов
    • 4. 8. 3. Действие фенольных соединений на формирование биопленок
  • P. aeruginosa РАО 1 и A. tumefaciens С
  • V. ОБСУЖДЕНИЕ
  • VI. ВЫВОДЫ

Молекулярно-генетические особенности Quorum Sensing систем грамотрицательных бактерий (на модели Serratia) и изучение их роли в регуляции клеточных процессов (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность проблемы.

В последние 10−15 лет внимание многочисленных исследователей, работающих с микроорганизмами в различных областях биологии и медицины, как в фундаментальных, так и в прикладных направлениях, было обращено на феномен, получивший название Quorum Sensing.

Quorum Sensing (QS) — это особый тип регуляции экспрессии генов бактерий, зависящей от плотности их популяции. QS системы включают низкомолекулярные сигнальные молекулы (аутоиндукторы), легко диффундирующие из клеток в среду и обратно, и рецепторные регуляторные белки, с которыми взаимодействуют сигнальные молекулы. По мере того, как популяция бактерий увеличивается и достигает критического уровня, аутоиндукторы накапливаются до необходимого порогового значения и связываются с соответствующими рецепторными белками, что приводит к резкой активации (иногда — репрессии) транскрипции определенных наборов генов. С помощью сигнальных молекул QS систем происходит межклеточная коммуникация бактерий в популяциях, обеспечивающая скоординированный ответ бактерий на изменение условий среды.

Изучение биологической значимости регуляторных систем типа QS показало, что эти системы играют ключевую роль в регуляции большого количества процессов бактериальной клетки. Они участвуют во взаимодействии многих бактерий с высшими организмами, животными и растениями, в регуляции вирулентности бактерий, формировании биопленок, регуляции экспрессии генов, связанных с синтезом различных экзоферментов, токсинов, антибиотиков и других вторичных метаболитов, конъюгации, опухолеобразовании у растений, вызванном, агробактериями,споруляции у бактерий и др. Использование в последние годы методов транскриптомного и протеомного анализа показало, что QS системы функционируют как глобальные факторы регуляции, т. е. они участвуют в контроле большого количества клеточных процессов, относящихся к различным сторонам метаболизма бактерий.

Исследование QS систем регуляции, их роли в метаболизме и взаимодействии бактерий определяет совершенно новый подход к изучению поведения бактерий в природных условияхэти исследования могут иметь огромное прикладное значение.

Тот факт, что QS может быть важнейшим фактором регуляции вирулентности бактерий, обусловил новое направление исследований, связанное с использованием QS регуляции в качестве потенциальной мишени для борьбы с инфекционными заболеваниями. В настоящее время этот подход рассматривается как новая перспективная стратегия антимикробной терапии. В большом количестве лабораторий проводится поиск и изучение веществ, подавляющих QS.

Таким образом, изучение QS регуляции относится к числу актуальных направлений современной молекулярной биологии, генетики и микробиологии, чрезвычайно важных в фундаментальном и прикладном отношении.

Цель работы и задачи исследования.

Данная работа посвящена детальному изучению QS систем грамотрицательных бактерий на примере бактерий рода Serratia — исследованию общих принципов организации и экспрессии генов QS систем этих бактерий, природы сигнальных молекул этих систем, роли QS систем в регуляции ряда метаболических процессов, существенных для жизнедеятельности бактерий.

В соответствии с этим в работе были поставлены следующие задачи.

1. Исследовать гены QS систем и сигнальные молекулы, участвующие в их функционировании, у бактерий рода Serratia.

2. Выяснить принципы организации и особенности регуляции экспрессии генов QS систем Serratia.

3. Определить роль этих систем в регуляции различных клеточных процессов.

4. Исследовать действие антибактериальных веществ, производных нитрофурана, доноров N0 и растительных веществ фенольной природы на образование биопленок и QS регуляцию.

Научная новизна и практическая значимость.

Результаты, полученные в работе Зайцевой Ю. В., содержат новую информацию о QS системах грамотрицательных бактерий — о генах, участвующих в функционировании QS систем, регуляции их экспрессии и роли в контроле клеточных процессов.

У исследуемого штамма S. proteamaculans 94 идентифицированы QS системы двух типов, использующие в качестве аутоиндукторов N-ацилгомосеринлактоны (АГЛ) и АИ-2. Впервые у бактерий рода Serratia был проведен точный количественный масспектрометрический анализ АГЛ.

В ходе работы были идентифицированы, клонированы и секвенированы гены двух типов QS систем S. proteamaculans: ген синтазы АГЛ sprl, ген регуляторного рецепторного белка sprR и ген luxS, кодирующий синтазу АИ-2 — сигнальную молекулу QS систем второго типаполучены мутации, инактивирующие эти гены. Было показано, что указанные гены QS систем первого типа кластеризованы, они транскрибируются конвергентно и перекрываются в терминальных областях.

С помощью Нозерн-гибридизации впервые изучена транскрипция генов QS системы 1 типа в штамме Serratia proteamaculans дикого типа и инсерционных мутантах с нокаутированными генами sprl и sprR. Установлены тонкие механизмы регуляции транскрипции генов QS системы. Предложена модель экспрессии генов QS системы первого типа S. proteamaculans. Согласно этой модели, белок SprR связывается с ДНК в spr-боксе и репрессирует собственную транскрипциюсвязывание его с АГЛ приводит к дерепрессии транскрипциибелок SprR не обязателен для синтеза АГЛ.

Проведен сравнительный протеомный анализ клеток исходного штамма и мутантов. Показано, что экспрессия более 30 белков находится под влиянием SprlR QS-системы. Эти данные свидетельствуют о глобальной роли QS системы в регуляции клеточных процессов. Впервые проведена идентификация белков Serratia proteamaculans, у которых наблюдаются отличия в уровне экспрессии в штамме дикого типа и мутантах. Предполагаемые функции этих белков рассмотрены в свете их клеточных функций и участия в метаболических путях.

Получены данные о роли QS систем двух типов в регуляции клеточных процессов, относящихся к различным сторонам метаболизма S. proteamaculans (синтез внеклеточных протеаз, хитиназ, липаз, гемолизинов, жирных кислот, летучих органических соединений, образование биопленок и др.).

В ходе работы было исследовано действие различных лекарственных веществ и соединений растительного происхождения на QS и зависящий от этого типа регуляции процесс формирования биопленок. Впервые было показано, что производные нитрофурана, доноры оксида азота и фенольные соединения растительного происхождения в субингибиторных концентрациях увеличивают образование биопленок у бактерий.

Результаты работы могут найти применение в последующих фундаментальных исследованиях молекулярных механизмов коммуникации бактерий.

Полученные в работе данные могут быть использованы в дальнейшем в прикладных целях, в частности, для разработки новых подходов для борьбы с бактериальными инфекциями в медицине и сельском хозяйстве, а также в биотехнологии для получения важных для человека штаммов бактерий на основе конструкций, использующих новые принципы регуляции. Установленные закономерности влияния препаратов нитрофурановой и фенольной природы могут представлять интерес для медицинской практики при разработке рациональной антибактериальной терапии.

II. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

Бактерии способны чувствовать повышение плотности популяции и отвечать на него быстро и скоординированно индукцией определенных наборов генов. Этот тип регуляции получил название Quorum Sensing (QS) — он основан на действии низкомолекулярных сигнальных молекул различной природы, аутоиндукторов, которые накапливаются в культуре при высоких плотностях популяции бактерий и взаимодействуют с рецепторными регуляторными белками. QS системы являются глобальными факторами экспрессии бактериальных генов, они играют ключевую роль в регуляции многих метаболических процессов клетки.

В настоящем обзоре основное внимание будет уделено QS системам бактерий семейства Enterobacteriaceae. Выяснение особенностей, молекулярных механизмов функционирования QS регуляции и ее роли в контроле клеточного метаболизма бактерий этого семейства представляет большой интерес в связи с важностью изучения этих бактерий, вызывающих различные заболевания человека, животных и растений.

VI. выводы.

1. У штамма S. proteamaculans 94 идентифицированы Quorum Sensing (QS) системы двух типов, использующие в качестве аутоиндукторов ацилгомосеринлактоны (АГЛ) и АИ-2.

2. Штамм S. proteamaculans 94 продуцирует 2 основных типа АГЛ (N-3-оксо-гексаноил-гомосеринлактон и N-3-гидроксо-гексаноил-гомосеринлактон), а также несколько минорных типов АГЛ (N-гексаноил-гомосеринлактон, N-октаноил-гомосеринлактон и N-бутаноил-гомосеринлактон).

3. Клонированы и секвенированы гены QS системы I типа: ген синтазы АГЛ sprl и ген рецепторного регуляторного белка sprR. Эти гены транскрибируются с противоположных цепей ДНК навстречу друг другу и частично перекрываются в 3'-концевых областях. В промоторной области гена sprR обнаружен spr-бокс, гомологичный /кх-боксу Vibrio fischeri.

4. Результаты анализа транскрипции генов sprl и sprR в клетках исходного штамма и полученных инсерционных мутантов с нокаутированными генами sprl и sprR позволяют предположить, что белок R является ауторегулятором и репрессирует собственную транскрипциюсвязывание его с АГЛ приводит к дерепрессии транскрипции.

5. Сравнительный протеомный анализ клеток исходного штамма и мутантов показал, что экспрессия более 30 белков находится под влиянием SprIR QS-системы.

6. Обнаружена продукция сигнальной молекулы АИ-2 у штамма S. proteamaculans 94. Клонирован и секвенирован ген синтазы АИ-2 QS системы II типа luxS.

7. Обе QS системы участвуют в регуляции различных клеточных процессов бактерий рода Serratia (синтез ферментов, жирных кислот, летучих соединений, образование биопленок и др.).

8. Производные нитрофурана и доноры оксида азота в субингибиторных концентрациях стимулируют образование биопленок у бактерий. Фенольные соединения растительного происхождения в концентрациях, не подавляющих или слабо подавляющих рост бактерий, также оказывали стимулирующее действие на формирование биопленок. Указанные вещества не активировали экспрессию генов синтаз АГЛ в биосенсорах.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , А. С., Завильгельский, Г.Б., Хмель, И. А. Влияние мутаций в генах глобальных регуляторов транскрипции на продукцию аутоиндуктора АИ-2 Quorum Sensing системы Escherichia coli. II Генетика. 2008. — № 44. — С. 1184−1190.
  2. , В. Г., Григорьев, Н.Б. Оксид азота N0. Новый путь к поиску лекарств. Москва: Вузовская книга, 2004.
  3. , Т. С., Романова, Ю.М., Гинцбург, АЛ. Биопленки как способ существования бактерий в окружающей среде и организме хозяина, феномен, генетический контроль и системы регуляции их развития // Генетика. 2004. -Т. 40, № 11. — С. 1445−1456.
  4. , Т., Фрич, Э., Сэмбрук, Д. Молекулярное клонирование. Москва Изд. «Мир», 1984.
  5. , Д. Эксперименты в молекулярной генетике. Москва: Изд. «Мир», 1976.
  6. , В. Д., Олескин, А.В., Лагунова, Е. М. Программируемая клеточная смерть // Биохимия,-2000.-№ 65.-С. 1029—1046.
  7. , И. А., Метлицкая, А.З. Quorum Sensing регуляция экспрессии генов -перспективная мишень для создания лекарств против патогенности бактерий // Молекулярная биология. 2006. -Т. 40, № 2. — С. 195−210.
  8. Achtman, М., Zurth, К., Morelli, G., Torrea, G., Guiyoule, A., Carniel, E. Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis И Proc Natl Acad Sci USA.- 1999. Vol. 96, № 24. — P. 14 043−14 048.
  9. Ahmer, В. M. Cell-to-cell signalling in Escherichia coli and Salmonella enterica 11 Mol Microbiol. 2004. — Vol. 52, № 4. — P. 933−945.
  10. Akatsuka, H., Kawai, E., Omori, K., Shibatani, T. The three genes lipB, lipC, and lipD involved in the extracellular secretion of the Serratia marcescens lipase which lacks an N-terminal signal peptide//J Bacteriol. 1995.-Vol. 177, № 22.-P. 6381−6389.
  11. Allison, C., Lai, H. C., Hughes, C. Co-ordinate expression of virulence genes during swarm-cell differentiation and population migration of Proteus mirabilis II Mol Microbiol. 1992. -Vol. 6, № 12.-P. 1583−1591.
  12. Allison, C., Emody, L., Coleman, N., Hughes, C. The role of swarm cell differentiation and multicellular migration in the uropathogenicity of Proteus mirabilis II J Infect Dis. 1994. -Vol. 169, № 5.-P. 1 155−1158.
  13. Arner, E. S., Holmgren, A. Physiological functions of thioredoxin and thioredoxin reductase // Eur J Biochem. 2000. — Vol. 267, № 20. — P. 6102−6109.
  14. Atkinson, S., Throup, J. P., Stewart, G. S., Williams, P. A hierarchical quorum-sensing system in Yersinia pseudotuberculosis is involved in the regulation of motility and clumping // Mol Microbiol. 1999. — Vol. 33, № 6. — P. 1267−1277.
  15. Atkinson, S., Chang, C. Y., Sockett, R. E., Camara, M., Williams, P. Quorum sensing in Yersinia enterocolitica controls swimming and swarming motility // J Bacteriol. 2006. -Vol. 188, № 4. — P. 1451−1461.
  16. Atkinson, S., Sockett, R. E., Camara, M., Williams, P. Quorum sensing and the lifestyle of Yersinia II Curr Issues Mol Biol. 2006. — Vol. 8, № 1. — P. 1−10.
  17. Balestrino, D., Haagensen, J. A., Rich, C., Forestier, C. Characterization of type 2 quorum sensing in Klebsiella pneumoniae and relationship with biofilm formation // J Bacteriol. 2005. — Vol. 187, № 8. — P. 2870−2880.
  18. Bassler, B. L., Wright, M., Showalter, R. E., Silverman, M. R. Intercellular signalling in Vibrio harveyi: sequence and function of genes regulating expression of luminescence // Mol Microbiol. 1993. — Vol. 9, № 4. — P. 773−786.
  19. Bassler, B. L., Wright, M., Silverman, M. R. Multiple signalling systems controlling expression of luminescence in Vibrio harveyi: sequence and function of genes encoding a second sensory pathway // Mol Microbiol. 1994. — Vol. 13, № 2. — P. 273−286.
  20. Beck von Bodman, S., Farrand, S. K. Capsular polysaccharide biosynthesis and pathogenicity in Erwinia stewartii require induction by an N-acylhomoserine lactone autoinducer // J Bacterid. 1995.-Vol. I77,№ 17.-P. 5000−5008.
  21. Binet, R., Letoffe, S., Ghigo, J. M., Delepelaire, P., Wandersman, C. Protein secretion by Gram-negative bacterial ABC exporters—a review // Gene. 1997. — Vol. 192, № 1. — P. 7−11.
  22. Bobrov, A. G., Bearden, S. W., Fetherston, J. D., Khweek, A. A., Parrish, K. D., Perry, R. D. Functional quorum sensing systems affect biofilm formation and protein expression in Yersinia pestis II Adv Exp Med Biol. 2007. — Vol. 603. — P. 178−191.
  23. Burston, S. G., Clarke, A. R. Molecular chaperones: physical and mechanistic properties // Essays Biochem.- 1995,-Vol. 29.-P. 125−136.
  24. Busse, H. J., Denner, E. B., Lubitz, W. Classification and identification of bacteria: current approaches to an old problem. Overview of methods used in bacterial systematics // J Biotechnol. 1996. — Vol. 47, № 1.-P. 3−38.
  25. Campas, C., Dalmau, M., Montaner, B., Barragan, M., Bellosillo, B., Colomer, D., Pons, G., Perez-Tomas, R., Gil, J. Prodigiosin induces apoptosis of B and T cells from B-cell chronic lymphocytic leukemia // Leukemia. 2003. — Vol. 17, № 4. — P. 746−750.
  26. Carlier, A. L., von Bodman, S. B. The rcsA promoter of Pantoea stewartii subsp. stewartii features a low-level constitutive promoter and an EsaR quorum-sensing-regulated promoter // J Bacteriol. 2006. — Vol. 188,№ 12. — P. 4581−4584.
  27. Celli, J., Deng, W., Finlay, B. B. Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) attachment to epithelial cells: exploiting the host cell cytoskeleton from the outside // Cell Microbiol. 2000. -Vol. 2, № l.-P. 1−9.
  28. Cha, C., Gao, P., Chen, Y. C., Shaw, P. D., Farrand, S. K. Production of acyl-homoserine lactone quorum-sensing signals by gram-negative plant-associated bacteria // Mol Plant Microbe Interact. 1998.-Vol. 11, № 11. — P. 1119−1129.
  29. Chen, Y., Cai, J., Murphy, T. J., Jones, D. P. Overexpressed human mitochondrial thioredoxin confers resistance to oxidant-induced apoptosis in human osteosarcoma cells // J Biol Chem.2002. Vol. 277, № 36. — P. 33 242−33 248.
  30. Chernin, L. S. Detection of bacterial homoserine lactone quorum sensing signals. // Molecular Microbial Ecology Manual.-: Kluwer Academic, 2004.-P. 1629−1650.
  31. Choi, S. H., Greenberg, E. P. The C-terminal region of the Vibrio fischeri LuxR protein contains an inducer-independent lux gene activating domain // Proc Natl Acad Sci U S A. -1991,-Vol. 883№ 24 -P 11 115−11 119
  32. Choi, S. H., Greenberg, E. P. Genetic dissection of DNA binding and luminescence gene activation by the Vibrio fischeri LuxR protein // J Bacteriol. 1992. — Vol. 174, № 12. -P. 4064−4069.
  33. Christensen, A. B., Riedel, K., Eberl, L., Flodgaard, L. R., Molin, S., Gram, L., Givskov, M. Quorum-sensing-directed protein expression in Serratiaproteamaculans B5a // Microbiology.2003. Vol. 149, № Pt 2. — P. 471−483.
  34. Clarke, M. B., Hughes, D. T., Zhu, C., Boedeker, E. C. Sperandio, V. The QseC sensor kinase: a bacterial adrenergic receptor // Proc Natl Acad Sci USA.- 2006. Vol. 103, № 27. -P. 10 420−10 425.
  35. Cook, M. A., Lopez, J. J., Jr. Serratia odorifera biogroup I: an emerging pathogen // J Am Osteopath Assoc. 1998. — Vol. 98, № 9. — P. 505−507.
  36. Costerton, J. W., Lewandowski, Z., Caldwell, D. E., Korber, D. R., Lappin-Scott, H. M. Microbial biofilms // Annu Rev Microbiol. 1995. — Vol. 49. — P. 711−745.
  37. Costerton, J. W., Stewart, P. S., Greenberg, E. P. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections // Science. 1999. — Vol. 284, № 5418. — P. 1318−1322.
  38. Coulthurst, S. J., Barnard, A. M., Salmond, G. P. Regulation and biosynthesis of carbapenem antibiotics in bacteria // Nat Rev Microbiol. 2005. — Vol. 3, № 4. — P. 295−306.
  39. Coulthurst, S. J., Lilley, K. S., Salmond, G. P. Genetic and proteomic analysis of the role of luxS in the enteric phytopathogen, Erwinia carotovora II Mol Plant Pathol. 2006. — Vol. 7, № 1. — P.31−45.
  40. Coulthurst. S. J. Clare. S Evans T I Fnnlrk I T Robins K. J., Welch, M" Douaan G' } - - 7 — -----7 — ¦ - *? * ~ ' «J ' „5 ' „C 5 5
  41. Salmond, G. P. Quorum sensing has an unexpected role in virulence in the model pathogen Citrobacter rodentium II EMBO Rep. 2007. — Vol. 8, № 7. — P. 698−703.
  42. Cronan, J. E., Jr. Phospholipid modifications in bacteria // Curr Opin Microbiol. 2002. -Vol. 5, № 2.-P. 202−205.
  43. Danhorn, T., Fuqua, C. Biofilm formation by plant-associated bacteria // Annu Rev Microbiol. -2007.-Vol. 61.-P. 401−422.
  44. Daniels, R., Vanderleyden, J., Michiels, J. Quorum sensing and swarming migration in bacteria // FEMS Microbiol Rev. 2004. — Vol. 28, № 3. — P. 261−289.
  45. Davies, D. G., Parsek, M. R., Pearson, J. P., Iglewski, B. H., Costerton, J. W., Greenberg, E. P. The involvement of cell-to-cell signals in the development of a bacterial biofilm // Science. -1998. Vol. 280, № 5361. — P. 295−298.
  46. DeLisa, M. P., Wu, C. F., Wang, L., Valdes, J. J., Bentley, W. E. DNA microarray-based identification of genes controlled by autoinducer 2-stimulated quorum sensing in Escherichia coli IIJ Bacteriol. 2001. — Vol. 183, № 18. — P. 5239−5247.
  47. Dennis, J. J., Zylstra, G. J. Plasposons: modular self-cloning minitransposon derivatives for ranid genetic analvsis of PTflm-nftPfltivft bflrtftrifll opnnmp“ // Annl Fnvlrnn Mirrnhiril — 1998 —1 u J-----C------------O „O w „f I. * - v ¦ .
  48. Vol. 64, № 7.-P. 2710−2715.
  49. Devine, J. H., Shadel, G. S., Baldwin, T. O. Identification of the operator of the lux regulon from the Vibrio fischeri strain ATCC7744 // Proc Natl Acad Sci USA.- 1989. Vol. 86, № 15.-P. 5688−5692.
  50. Dufour, A., Furness, R. B., Hughes, C. Novel genes that upregulate the Proteus mirabilis flhDC master operon controlling flagellar biogenesis and swarming // Mol Microbiol. 1998. -Vol. 29, № 3,-P. 741−751.
  51. Eberl, L., Christiansen, G., Molin, S., Givskov, M. Differentiation of Serratia liquefaciens into swarm cells is controlled by the expression of theflhD master operon // J Bacteriol. 1996. -Vol. 178, № 2.-P. 554−559.
  52. Eberl, L., Molin, S., Givskov, M. Surface motility of Serratia liquefaciens MG1 // J Bacteriol. -1999.-Vol. 181, № 6.-P. 1703−1712.
  53. Engelberg-Kulka, H., Sat, B., Reches, M., Amitai, S., Hazan, R. Bacterial programmed cell death systems as targets for antibiotics // Trends Microbiol. 2004. — Vol. 12, № 2. — P. 66−71.
  54. Engelberg-Kulka, H., Hazan, R., Amitai, S. mazEF: a chromosomal toxin-antitoxin module that triggers programmed cell death in bacteria // J Cell Sci. 2005. — Vol. 118, № Pt 19. — P. 43 274 332.
  55. Frankel, G., Phillips, A. D., Rosenshine, I., Dougan, G., Kaper, J. B., Knutton, S. Enteropathogenic and enterohaemorrhagic Escherichia coli: more subversive elements // Mol Microbiol. 1998. — Vol. 30, № 5. — P. 911−921.
  56. Fraser, G. M., Hughes, C. Swarming motility // Curr Opin Microbiol. 1999. — Vol. 2, № 6. -P. 630−635.
  57. Fuqua, C., Winans, S. C., Greenberg, E. P. Census and consensus in bacterial ecosystems: the LuxR-LuxI family of quorum-sensing transcriptional regulators // Annu Rev Microbiol. 1996. -Vol. 50.-P. 727−751.
  58. Fuqua, C., Greenberg, E. P. Self perception in bacteria: quorum sensing with acylated homoserine lactones//Curr Opin Microbiol. 1998.-Vol. 1,№ 2.-P. 183−189.
  59. Fuqua, C., Greenberg, E. P. Listening in on bacteria: acyl-homoserine lactone signalling // Nat Rev Mol Cell Biol. 2002. — Vol. 3, № 9. — P. 685−695.
  60. Fuqua, W. C., Winans, S. C., Greenberg, E. P. Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators // J Bacteriol. 1994. — Vol. 176, № 2.-P. 269−275.
  61. Gao, Y., Song, J., Hu, B., Zhang, L., Liu, Q., Liu, F. The luxS gene is involved in AI-2 production, pathogenicity, and some phenotypes in Erwinia amylovora II Curr Microbiol. -2009.-Vol. 58, № l.-P. 1−10.
  62. Garrido, C., Gurbuxani, S., P. avagnan, L., Kroemer, G. Heat shock proteins: endogenous modulators of apoptotic cell death // Biochem Biophys Res Commun. 2001. — Vol. 286, № 3. — P. 433−442.
  63. Gospodarek, E., Bogiel, T., Zalas-Wiecek, P. Communication between microorganisms as a basis for production of virulence factors // Pol J Microbiol. 2009. — Vol. 58, № 3. — P. 191 198.
  64. Gould, T. A., Herman, J., Krank, J., Murphy, R. C., Churchill, M. E. Specificity of acyl-homoserine lactone synthases examined by mass spectrometry // J Bacteriol. 2006. -Vol. 188, № 2.-P. 773−783.
  65. Grogan, D. W., Cronan, J. E., Jr. Cyclopropane ring formation in membrane lipids of bacteria // Microbiol Mol Biol Rev. 1997. — Vol. 61, № 4. — P. 429−441.
  66. Hayes, F. Toxins-antitoxins: plasmid maintenance, programmed cell death, and cell cycle arrest //Science.-2003.-Vol. 301, № 5639. P. 1496−1499.
  67. Hazan, R., Sat, B., Engelberg-Kulka, H. Escherichia coli mazEF-mediated cell death is triggered by various stressful conditions // J Bacteriol. 2004. — Vol. 186, № 11. — P. 36 633 669.
  68. Heermann, R., Fuchs, T. M. Comparative analysis of the Photorhabdus luminescens and the Yersinia enterocolitica genomes: uncovering candidate genes involved in insect pathogenicity // BMC Genomics. 2008. — Vol. 9. — P. 40.
  69. Henrichsen, J. Bacterial surface translocation: a survey and a classification // Bacteriol Rev. -1972. Vol. 36, № 4. — P. 478−503.
  70. Hentzer, M., Givskov, M. Pharmacological inhibition of quorum sensing for the treatment of chronic bacterial infections//J Clin Invest. 2003. — Vol. 112, № 9.-P. 1300−1307.
  71. Hof, H., Stroder, J., Buisson, J. P., Royer, R. Effect of different nitroheterocyclic compounds on aerobic, microaerophilic, and anaerobic bacteria // Antimicrob Agents Chemother. 1986. -Vol. 30, № 5. -P. 679−683.
  72. Hoffman, L. R., D’Argenio, D. A., MacCoss, M. J., Zhang, Z., Jones, R. A., Miller, S. I. Aminoglycoside antibiotics induce bacterial biofilm formation // Nature. 2005. — Vol. 436, № 7054. — P. 1171−1175.
  73. Hofmann, B., Hecht, H. J., Flohe, L. Peroxiredoxins // Biol Chem. 2002. — Vol. 383, № 3−4. -P. 347−364.
  74. Hueck, C. J. Type III protein secretion systems in bacterial pathogens of animals and plants // Microbiol Mol Biol Rev. 1998. — Vol. 62, № 2. — P. 379−433.
  75. Hunt, S., Green, J., Artymiuk, P. J. Hemolysin E (HlyE, ClyA, SheA) and related toxins // Adv Exp Med Biol. 2010. — Vol. 677. — P. 116−126.
  76. Janda, J. M., Abbott, S. L. The genus Hafnia: from soup to nuts // Clin Microbiol Rev. 2006. -Vol. 19, № l.-P. 12−18.
  77. Johansen, L., Bryn, K., Stormer, F. C. Physiological and biochemical role of the butanediol pathway in Aerobacter (Enterobacter) aerogenes II J Bacteriol. 1975. — Vol. 123, № 3. -P. 1124−1130.
  78. Johnson, D. C., Ishihama, A., Stevens, A. M. Involvement of region 4 of the sigma70 subunit of RNA polymerase in transcriptional activation of the lux operon during quorum sensing // FEMS Microbiol Lett. 2003. — Vol. 228, № 2. — P. 193−201.
  79. Joshua, G. W“ Karlyshev, A. V., Smith, M. P., Isherwood, K. E., Titball, R. W“ Wren, B. W. A Caenorhabditis elegans model of Yersinia infection: biofilm formation on a biotic surface // Microbiology. 2003. — Vol. 149, № Pt 11. — P. 3221−3229.
  80. Katsev, A. M., Wegrzyn, G., Szpilewska, H. Effects of hydrogen peroxide on light emission by various strains of marine luminescent bacteria // J Basic Microbiol. 2004. — Vol. 44, № 3. -P. 178−184.
  81. Kolodkin-Gal, I., Hazan, R., Gaathon, A., Carmeli, S., Engelberg-Kulka, H. A linear pentapeptide is a quorum-sensing factor required for waz^F-mediated cell death in Escherichia coli II Science. 2007. — Vol. 318, № 5850. — P. 652−655.
  82. Kolodkin-Gal, I., Engelberg-Kulka, H. The extracellular death factor: physiological and genetic factors influencing its production and response in Escherichia coli II J Bacteriol. 2008. -Vol. 190, № 9.-P. 3169−3175.
  83. Laasik, E., Andresen, L., Mae, A. Type II quorum sensing regulates virulence in Erwinia carotovora ssp. carotovora II FEMS Microbiol Lett. 2006. — Vol. 258, № 2. — P. 227−234.
  84. Labbate, M., Queck, S. Y., Koh, K. S., Rice, S. A., Givskov, M., Kjelleberg, S. Quorum sensing-controlled biofilm development in Serratia liquefaciens MG1 // J Bacteriol. 2004. -Vol. 186, № 3,-P. 692−698.
  85. Law, D. Virulence factors of Escherichia coli OX51 and other Shiga toxin-producing E. coli II J Appl Microbiol. 2000. — Vol. 88, № 5. — P. 729−745.
  86. Lee, J., Jayaraman, A., Wood, T. K. Indole is an inter-species biofilm signal mediated by SdiA // BMC Microbiol. 2007. — Vol. 7. — P. 42.
  87. Lefebre, M. D., Valvano, M. A. Construction and evaluation of plasmid vectors optimized for constitutive and regulated gene expression in Burkholderia cepacia complex isolates // Appl Environ Microbiol. 2002. — Vol. 68, № 12. — P. 5956−5964.
  88. Lerat, E., Moran, N. A. The evolutionary history of quorum-sensing systems in bacteria // Mol Biol Evol. 2004. — Vol. 21, № 5. — P. 903−913.
  89. Levine, M. M. Escherichia coli that cause diarrhea: enterotoxigenic, enteropathogenic, enteroinvasive, enterohemorrhagic, and enteroadherent // J Infect Dis. 1987. — Vol. 155, № 3. -P. 377−389.
  90. Lewis, K. Programmed death in bacteria // Microbiol Mol Biol Rev. 2000. — Vol. 64, № 3. -P.503−514.
  91. Liao, C. H., Revear, L., Hotchkiss, A., Savary, B. Genetic and biochemical characterization of an exopolygalacturonase and a pectate lyase from Yersinia enterocolitica II Can J Microbiol. -1999. Vol. 45, № 5. — P. 396−403.
  92. Linares, J. F., Gustafsson, I., Baquero, F., Martinez, J. L. Antibiotics as intermicrobial signaling agents instead of weapons // Proc Natl Acad Sci USA.- 2006. Vol. 103, № 51. — P. 1 948 419 489.
  93. Lindsay, A., Ahmer, B. M. Effect of sdiA on biosensors of N-acylhomoserine lactones // J Bacteriol. 2005. — Vol. 187, № 14. — P. 5054−5058.
  94. Liu, X., Matsumura, P. The FlhD/FlhC complex, a transcriptional activator of the Escherichia coli flagellar class II operons // J Bacteriol. 1994. — Vol. 176, № 23. — P. 7345−7351.
  95. Liu, X., Jia, J., Popat, R., Ortori, C. A., Li, J., Diggle, S. P., Gao, K., Camara, M.
  96. C.hprar.terination of two miorum cpncincr cvctf^mc in thp f"nHr"r*V"/tir'owntiri ctfoir"--------------------- ~. -j--------------. fSVJ’lltl’IH Jl’WIII
  97. G3: differential control of motility and biofilm formation according to life-style // BMC Microbiol.-2011.-Vol. 11,№ l.-P. 26.
  98. Lonon, M. K., Woods, D. E., Straus, D. C. Production of lipase by clinical isolates of Pseudomonas cepacia IIJ Clin Microbiol. 1988. — Vol. 26, № 5. — P. 979−984.
  99. Lukjancenko, O., Wassenaar, T. M., Ussery, D. W. Comparison of 61 sequenced Escherichia coli genomes // Microb Ecol. 2010. — Vol. 60, № 4. — P. 708−720.
  100. Lyte, M., Arulanandam, B. P., Frank, C. D. Production of Shiga-like toxins by Escherichia coli 0157: H7 can be influenced by the neuroendocrine hormone norepinephrine // J Lab Clin Med. 1996.-Vol. 128, № 4. -P. 392−398.
  101. Mahlen, S. D. Serratia infections: from military experiments to current practice // Clin Microbiol Rev.-2011.-Vol. 24, № 4.-P. 755−791.
  102. Maitra, S. K., Nachum, R., Pearson, F. C. Establishment of beta-hydroxy fatty acids as chemical marker molecules for bacterial endotoxin by gas chromatography-mass spectrometry // Appl Environ Microbiol. 1986.-Vol. 52, № 3,-P. 510−514.
  103. Mattinen, L., Tshuikina, M., Mae, A., Pirhonen, M. Identification and characterization of Nip, necrosis-inducing virulence protein of Erwinia carotovora subsp. carotovora II Mol Plant Microbe Interact.-2004.-Vol. 17,№ 12.-P. 1366−1375.
  104. Mayer, D., Schlensog, V., Bock, A. Identification of the transcriptional activator controlling the butanediol fermentation pathway in Klebsiella terrigena II J Bacteriol. 1995. — Vol. 177, № 18.-P. 5261−5269.
  105. Mayer, M. P., Bukau, B. Hsp70 chaperones: cellular functions and molecular mechanism // Cell Mol Life Sci. 2005. — Vol. 62, № 6. — P. 670−684.
  106. Salmond, G. P. Analysis of bacterial carbapenem antibiotic production genes reveals a novel beta-lactam biosynthesis pathway // Mol Microbiol. 1996. — Vol. 22, № 3. — P. 415−426.
  107. Meighen, E. A., Dunlap, P. V. Physiological, biochemical and genetic control of bacterial bioluminescence // Adv Microb Physiol. 1993. — Vol. 34. — P. 1 -67.
  108. Description of Pantoea stewartii subsp. indologenes subsp. nov. // International journal of systematic bacteriology. 1993. — Vol. 43, № l.-P. 162−173.
  109. Michael, B., Smith, J. N., Swift, S., Heffron, F., Ahmer, B. M. SdiA of Salmonella enterica is a LuxR homolog that detects mixed microbial communities // J Bacteriol. 2001. — Vol. 183, № 19.-P. 5733−5742.
  110. Miller, M. B., Bassler, B. L. Quorum sensing in bacteria // Annu Rev Microbiol. 2001. -Vol. 55.-P. 165−199.
  111. Mittenhuber, G. Occurrence of mazEF-Yike antitoxin/toxin systems in bacteria // J Mol Microbiol Biotechnol. 1999. — Vol. 1, № 2. — P. 295−302.
  112. Molina, L., Rezzonico, F., Defago, G., Duffy, B. Autoinduction in Erwinia amylovora:
  113. P.viHftnr.P- nf an flfvl-linmOQprinf“ lartnnp cicrnal in flip firf» hlirrlit nothnrrpn // I Rcx^tprirJ TAQ^- ----------------- -------J'---------------------------- --------, V-Vol. 187, № 9.-P. 3206−3213.
  114. Montaner, B., Perez-Tomas, R. The prodigiosins: a new family of anticancer drugs // Curr Cancer Drug Targets. 2003. — Vol. 3, № 1. — P. 57−65.
  115. Moons, P., Van Houdt, R., Vivijs, B., Michiels, C. W., Aertsen, A. Integrated regulation of acetoin fermentation by quorum sensing and pH in Serratia plymuthica RVH1 // Appl Environ Microbiol.-2011.-Vol. 77, № 10.-P. 3422−3427.
  116. More, M. I., Finger, L. D., Stryker, J. L., Fuqua, C., Eberhard, A., Winans, S. C. Enzymatic synthesis of a quorum-sensing autoinducer through use of defined substrates // Science. 1996. -Vol. 272, № 5268.-P. 1655−1658.
  117. Morohoshi, T., Inaba, T., Kato, N., Kanai, K., Ikeda, T. Identification of quorum-sensing signal molecules and the LuxRI homologs in fish pathogen Edwardsiella tarda II J Biosci Bioeng. -2004. Vol. 98, № 4. — P. 274−281.
  118. Morohoshi, T., Yokoyama, Y., Ouchi, M., Kato, N., Ikeda, T. Motility and the expression of the flagellin protein FliC are negatively regulated by quorum sensing in Edwardsiella tarda II J Biosci Bioeng.-2009.-Vol. 108,№ 4.-P. 314−318.
  119. Morohoshi, T., Ogata, Y., Ikeda, T. Cell aggregation is negatively regulated by N-acylhomoserine lactone-mediated quorum sensing in Pantoea ananatis SK-1 // J Biosci Bioeng. -2011.-Vol. 112, № 6.-P. 566−569.
  120. Nakamoto, H., Vigh, L. The small heat shock proteins and their clients // Cell Mol Life Sci. -2007. Vol. 64, № 3. — P. 294−306.
  121. Nasser, W., Bouillant, M. L., Salmond, G., Reverchon, S. Characterization of the Erwinia chrysanthemi expI-expR locus directing the synthesis of two N-acyl-homoserine lactone signal molecules // Mol Microbiol. 1998. — Vol. 29, № 6. — P. 1391 -1405.
  122. Nesse, L. L., Berg, K., Vestby, L. K., Olsaker, I., Djonne, B. Salmonella Typhimurium invasion of HEp-2 epithelial cells in vitro is increased by N-acylhomoserine lactone quorum sensing signals // Acta Vet Scand. 2011. — Vol. 53. — P. 44.
  123. Nivens, D. E., Ohman, D. E., Williams, J., Franklin, M. J. Role of alginate and its O acetylation in formation of Pseudomonas aeruginosa microcolonies and biofilms // J Bacteriol. 2001. -Vol. 183, № 3,-P. 1047−1057.
  124. O’Toole, G. A., Kolter, R. Flagellar and twitching motility are necessary for Pseudomonas aeruginosa biofilm development // Mol Microbiol. 1998. — Vol. 30, № 2. — P. 295−304.
  125. Ovadis, M., Liu, X., Gavriel, S., Ismailov, Z., Chet, I., Chernin, L. The global regulator genes from biocontrol strain Serratia plymuthica 1C1270: cloning, sequencing, and functional studies // J Bacteriol. 2004. — Vol. 186, № 15. — P. 4986−4993.
  126. Pandey, D. P., Gerdes, K. Toxin-antitoxin loci are highly abundant in free-living but lost from host-associated prokaryotes // Nucleic Acids Res. 2005. — Vol. 33, № 3. — P. 966−976.
  127. Parker, W. L., Rathnum, M. L., Wells, J. S., Jr., Trejo, W. H., Principe, P. A., Sykes, R. B. SQ 27,860, a simple carbapenem produced by species of Serratia and Erwinia II J Antibiot (Tokyo). 1982. — Vol. 35, № 6. — P. 653−660.
  128. Parsek, M. R., Val, D. L., Hanzelka, B. L., Cronan, J. E., Jr., Greenberg, E. P. Acyl homoserine-lactone quorum-sensing signal generation // Proc Natl Acad Sci USA.- 1999. -Vol. 96, № 8. -P. 4360−4365.
  129. Parsek, M. R., Greenberg, E. P. Acyl-homoserine lactone quorum sensing in gram-negative bacteria: a signaling mechanism involved in associations with higher organisms // Proc Natl Acad Sci USA.- 2000. Vol. 97, № 16. — P. 8789−8793.
  130. Pearson, J. P., Van Delden, C., Iglewski, B. H. Active efflux and diffusion are involved in transport of Pseudomonas aeruginosa cell-to-cell signals H J Bacteriol. — 1999. — Vol. 181, № 4.-P. 1203−1210.
  131. Perez-Tomas, R., Montaner, B., Llagostera, E., Soto-Cerrato, V. The prodigiosins, proapoptotic drugs with anticancer properties // Biochem Pharmacol. 2003. — Vol. 66, № 8. — P. 14 471 452.
  132. Persson, T., Givskov, M., Nielsen, J. Quorum sensing inhibition: targeting chemical communication in gram-negative bacteria // Curr Med Chem. 2005. — Vol. 12, № 26. -P. 3103−3115.
  133. Rasmussen, T. B., Givskov, M. Quorum sensing inhibitors: a bargain of effects // Microbiology. 2006. — Vol. 152, № Pt 4. — P. 895−904.
  134. Reisner. A., Haagensen. J. A., Schembri. M. A., Zechner, E. L., Molin, S. Development and maturation of Escherichia coli K-12 biofilms // Mol Microbiol. 2003. — Vol. 48, № 4. -P.933−946.
  135. Ren, D., Sims, J. J., Wood, T. K. Inhibition of biofilm formation and swarming of Escherichia coli by (5Z)-4-bromo-5-(bromomethylene)-3-butyl-2(5H)-furanone // Environ Microbiol. -2001.-Vol. 3, № 11.-P. 731−736.
  136. Rezzonico, F., Duffy, B. The role of luxS in the fire blight pathogen Erwinia amylovora is limited to metabolism and does not involve quorum sensing // Mol Plant Microbe Interact. -2007. Vol. 20, № 10. — P. 1284−1297.
  137. Rezzonico, F., Duffy, B. Lack of genomic evidence of AI-2 receptors suggests a non-quorum sensing role for luxS in most bacteria // BMC Microbiol. 2008. — Vol. 8. — P. 154.
  138. Rice, S. A., Koh, K. S., Queck, S. Y., Labbate, M., Lam, K. W., Kjelleberg, S. Biofilm formation and sloughing in Serratia marcescens are controlled by quorum sensing and nutrient cues//J Bacteriol.-2005.-Vol. 187, № 10.-P. 3477−3485.
  139. Riedel, K., Ohnesorg, T., Krogfelt, K. A., Hansen, T. S., Omori, K., Givskov, M., Eberl, L. N-acyl-L-homoserine laetone-mediated regulation of the lip secretion system in Serratia liquefaciens MG1 //J Bacteriol. 2001. — Vol. 183, № 5.-P. 1805−1809.
  140. Salmond, G. P., Bycroft, B. W., Stewart, G. S., Williams, P. The bacterial 'enigma': cracking the code of cell-cell communication // Mol Microbiol. 1995. — Vol. 16, № 4. — P. 615−624.
  141. Schaefer, A. L., Hanzelka, B. L., Eberhard, A., Greenberg, E. P. Quorum sensing in Vibrio fischeri: probing autoinducer-LuxR interactions with autoinducer analogs // J Bacteriol. 1996. — Vol. 178, № 10. — P. 2897−2901.
  142. Schauder, S., Bassler, B. L. The languages of bacteria // Genes Dev. 2001. — Vol. 15, № 12. -P. 1468−1480.
  143. Schauder, S., Shokat, K., Surette, M. G., Bassler, B. L. The LuxS family of bacterial autoinducers: biosynthesis of a novel quorum-sensing signal molecule // Mol Microbiol. -2001. Vol. 41, № 2. — P. 463−476.
  144. Schneider, R., Lockatell, C. V., Johnson, D., Belas, R. Detection and mutation of a luxS-encoded autoinducer in Proteus mirabilis II Microbiology. 2002. — Vol. 148, № Pt 3. -P. 773−782.
  145. Sharma, V. K., Bearson, S. M., Bearson, B. L. Evaluation of the effects of sdiA, a luxR homoloaue. on adherence and motilitv of Escherichia r. nli 0157 • H7 // Mir. rnhinlnov — 2f>10------j -------------------. ----Vol. 156, № Pt 5. P. 1303−1312.
  146. Sinensky, M. Homeoviscous adaptation—a homeostatic process that regulates the viscosity of membrane lipids in Escherichia coli II Proc Natl Acad Sci USA.- 1974. Vol. 71, № 2. -P. 522−525.
  147. Sjoblom, S., Brader, G., Koch, G., Palva, E. T. Cooperation of two distinct ExpR regulators controls quorum sensing specificity and virulence in the plant pathogen Erwinia carotovora H Mol Microbiol. 2006. — Vol. 60, № 6. — P. 1474−1489.
  148. Slock, J., VanRiet, D., Kolibachuk, D., Greenberg, E. P. Critical regions of the Vibrio fischeri luxR protein defined by mutational analysis // J Bacteriol. 1990. — Vol. 172, № 7. — P. 39 743 979.
  149. Smadja, B., Latour, X., Faure, D., Chevalier, S., Dessaux, Y., Orange, N. Involvement of N-acylhomoserine lactones throughout plant infection by Erwinia carotovora subsp. atroseptica II Mol Plant Microbe Interact. 2004. — Vol. 17,№ ll.-P. 1269−1278.
  150. Smith, J. L., Fratamico, P. M., Yan, X. Eavesdropping by bacteria: the role of SdiA in Escherichia coli and Salmonella enterica serovar Typhimurium quorum sensing // Foodborne PathogDis.-2011.-Vol. 8, № 2.-P. 169−178.
  151. Smith, J. N., Ahmer, B. M. Detection of other microbial species by Salmonella-, expression of the SdiA regulon//J Bacteriol.-2003.-Vol. 185,№ 4.-P. 1357−1366.
  152. Snaidr, J., Amann, R., Huber, I., Ludwig, W., Schleifer, K. H. Phylogenetic analysis and in situ identification of bacteria in activated sludge // Appl Environ Microbiol. 1997. — Vol. 63, № 7. -P. 2884−2896.
  153. Sperandio, V., Torres, A. G., Giron, J. A., Kaper, J. B. Quorum sensing is a global regulatory mechanism in enterohemorrhagic Escherichia coli 0157: H7 // J Bacteriol. 2001. — Vol. 183, № 17.-P. 5187−5197.
  154. Sperandio, V., Torres, A. G., Jarvis, B., Nataro, J. P., Kaper, J. B. Bacteria-host communication: the language of hormones // Proc Natl Acad Sci USA.- 2003. Vol. 100, № 15.-P. 8951−8956.
  155. Stankowska, D., Czerwonka, G., Rozalska, S., Grosicka, M., Dziadek, J., Kaca, W. Influence of quorum sensing signal molecules on biofilm formation in Proteus mirabilis 018 // Folia Microbiol (Praha). 2011.
  156. Stevens, A. M., Fujita, N., Ishihama, A., Greenberg, E. P. Involvement of the RNA polymerase alpha-subunit C-terminal domain in LuxR-dependent activation of the Vibrio fischeri luminescence genes // J Bacteriol. 1999. — Vol. 181, № 15. — P. 4704−4707.
  157. Su, L. H., Chiu, C. H. Salmonella: clinical importance and evolution of nomenclature // Chang GungMed J.-2007.-Vol. 30, № 3,-P. 210−219.
  158. Surette, M. G., Bassler, B. L. Quorum sensing in Escherichia coli and Salmonella typhimurium II Proc Natl Acad Sci USA.- 1998. Vol. 95, № 12. — P. 7046−7050.
  159. Surette, M. G., Miller, M. B., Bassler, B. L. Quorum sensing in Escherichia coli, Salmonella typhimurium, and Vibrio harveyv. a new family of genes responsible for autoinducer production // Proc Natl Acad Sci USA.- 1999. Vol. 96, № 4. — P. 1639−1644.
  160. Syu, M. J. Biological production of 2,3-butanediol // Appl Microbiol Biotechnol. 2001. -Vol. 55, № l.-P. 10−18.
  161. Szpilewska, H., Czyz, A., Wegrzyn, G. Experimental evidence for the physiological role of bacterial luciferase in the protection of cells against oxidative stress // Curr Microbiol. — 2003. — Vol. 47, № 5. -P. 379−382.
  162. Taga, M. E., Semmelhack, J. L., Bassler, B. L. The LuxS-dependent autoinducer AI-2 controls the expression of an ABC transporter that functions in AI-2 uptake in Salmonella typhimurium II Mol Microbiol. 2001. — Vol. 42, № 3. p. 777−793.
  163. Taga, M. E., Miller, S. T., Bassler, B. L. Lsr-mediated transport and processing of AI-2 in Salmonella typhimurium II Mol Microbiol. 2003. — Vol. 50, № 4. — P. 1411−1427.
  164. Thomson, N. R., Crow, M. A., McGowan, S. J., Cox, A., Salmond, G. P. Biosynthesis of carbapenem antibiotic and prodigiosin pigment in Serratia is under quorum sensing control // Mol Microbiol. 2000. — Vol. 36, № 3. — P. 539−556.
  165. Tomlin, K. L., Malott, R. J., Ramage, G., Storey, D. G., Sokol, P. A., Ceri, H. Quorum-sensing mutations affect attachment and stability of Burkholderia cenocepacia biofilms // Appl Environ Microbiol.-2005.-Vol. 71, № 9.-P. 5208−5218.
  166. Toth, I. K., Bell, K. S., Holeva, M. C., Birch, P. R. Soft rot erwiniae: from genes to genomes // Mol Plant Pathol. 2003. — Vol. 4, № 1. — P. 17−30.
  167. Toth, 1. K., Pritchard, L., Birch, P. R. Comparative genomics reveals what makes an enterobacterial plant pathogen // Annu Rev Phytopathol. 2006. — Vol. 44. — P. 305−336.
  168. Tsai, C. S., Winans, S. C. The quorum-hindered transcription factor YenR of Yersinia enterocolitica inhibits pheromone production and promotes motility via a small non-coding RNA//Mol Microbiol.-2011.-Vol. 80, № 2.-P. 556−571.
  169. Val, D. L., Cronan, J. E., Jr. In vivo evidence that S-adenosylmethionine and fatty acid synthesis intermediates are the substrates for the Luxl family of autoinducer synthases // J Bacteriol. 1998. — Vol. 180,№ 10.-P. 2644−2651.
  170. Walters, M., Sircili, M. P., Sperandio, V. AI-3 synthesis is not dependent on luxS in Escherichia coli IIJ Bacteriol. 2006. — Vol. 188, № 16. — P. 5668−5681.
  171. Walters, M., Sperandio, V. Quorum sensing in Escherichia coli and Salmonella II Int J Med Microbiol. 2006. — Vol. 296, № 2−3. — P. 125−131.
  172. Wang, L., Li, J., March, J. C., Valdes, J. J., Bentley, W. E. /"x^-dependent gene regulation in Escherichia coli K-12 revealed by genomic expression profiling // J Bacteriol. 2005. -Vol. 187, № 24. — P. 8350−8360.
  173. Waters, C. M., Bassler, B. L. Quorum sensing: cell-to-cell communication in bacteria // Annu Rev Cell Dev Biol. 2005. — Vol. 21. — P. 319−346.
  174. Watson, W. T., Minogue, T. D., Val, D. L., von Bodman, S. B., Churchill, M. E. Structural basis and soecificitv of aevl-homoserine lactone s i sns! product ion in bsc tcnsl cj vioruiTi sensing1 J J O r n O
  175. Mol Cell. 2002. — Vol. 9, № 3. — P. 685−694.
  176. Weisburg, W. G., Barns, S. M., Pelletier, D. A., Lane, D. J. 16S ribosomal DNA amplification for phylogenetic study // J Bacteriol. 1991. — Vol. 173, № 2. — P. 697−703.
  177. Welch, M., Todd, D. E" Whitehead, N. A., McGowan, S. J., Bycroft, B. W., Salmond, G. P. N-acyl homoserine lactone binding to the CarR receptor determines quorum-sensing specificity in Erwinia II Embo J. 2000. — Vol. 19, № 4. — P. 631 -641.
  178. Xavier, K. B., Bassler, B. L. Interference with AI-2-mediated bacterial cell-cell communication // Nature. 2005. — Vol. 437, № 7059. — P. 750−753.
  179. Xavier, K. B., Bassler, B. L. Regulation of uptake and processing of the quorum-sensing autoinducer AI-2 in Escherichia coli IIJ Bacteriol. 2005. — Vol. 187, № 1. — P. 238−248.
  180. Yoo, J. S" Jung, Y. J., Chung, S. Y., Lee, Y. C., Choi, Y. L. Molecular cloning and characterization of CMCase gene (ce/C) from Salmonella typhimurium UR // J Microbiol. -2004. Vol. 42, № 3. — P. 205−210.
  181. Young, G. M., Badger, J. L., Miller, V. L. Motility is required to initiate host cell invasion by Yersinia enterocolitica H Infect Immun. 2000. — Vol. 68, № 7. — P. 4323−4326.
  182. Zhang, Y., Zhang, J., Hoeflich, K. P., Ikura, M., Qing, G., Inouye, M. MazF cleaves cellular mRNAs specifically at ACA to block protein synthesis in Escherichia coli II Mol Cell. 2003. -Vol. 12, № 4.-P. 913−923.
  183. Zhang, Y., Zhang, J., Hara, H., Kato, I., Inouye, M. Insights into the mRNA cleavage mechanism by MazF, an mRNA interferase // J Biol Chem. 2005. — Vol. 280, № 5. — P. 31 433 150.
  184. Zhu, H., Sun, S. J., Dang, H. Y. PCR detection of Serratia spp. using primers targetingpfs and luxS genes involved in AI-2-dependent quorum sensing // Curr Microbiol. 2008. — Vol. 57, № 4.-P. 326−330.
Заполнить форму текущей работой

На отлично!