Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Персистенция Mycoplasma hominis у человека

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Различные виды стрессоров индуцируют у М. hominis PG37 изменение экспрессии как специфичных, так общих белков. 44 из 53 идентифицированных стресс-реактивных белков М. hominis PG37 являются специфичными для СДС, а 9 белков (AspRS, ThrRS, TrxA, AtpD, LDH, Cel, Prs и 2 изоформы консервативного гипотетического белка (МНО0720)) проявляют изменение экспрессии в условиях ТШ и СДС. Идентифицированные… Читать ещё >

Содержание

  • СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ
  • Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Молекулярная и клеточная биология микоплазм
      • 1. 1. 1. Современные представления о таксономии и филогении микоплазм
      • 1. 1. 2. Особенности морфологии и ультраструктуры микоплазм
      • 1. 1. 3. Геном микоплазм и особенности структурной организации генетического материала Mycoplasma hominis PG
      • 1. 1. 4. Концепция «минимальной» клетки и постгеномые исследования микоплазм
    • 1. 2. Феноменология микоплазменных инфекции у человека
      • 1. 2. 1. Взаимодействие микоплазм с иммунной системой человека
      • 112. 1. 1. Цитоадгезия и генетически опосредованная антигенная вариабельность микоплазм Mycoplasma hominis
        • 1. 2. 1. 2. Прямое и опосредованное воздействие микоплазм на иммуноциты: хромосомные аберрации и анергия иммунекомпетентных клеток
        • 1. 2. 1. 3. Провоспалительные и противовоспалительные цитокины и полиморфизм генов ключевых иммуномедиаторов (IL-1, IL-10)
      • 1. 2. 2. Клинические и биохимические аспекты персистенции микоплазм: особенности инфекций, вызываемых Mycoplasma hominis
    • 1. 3. Адаптация микоплазм к неблагоприятным условиям среды и контроль микоплазменных инфекций
  • ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТ
  • Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
    • 2. 1. Культивирование М. hominis на искусственных питательных средах
    • 2. 2. Определение численности колониеобразующих единиц М. hominis PG
    • 2. 3. Трансмиссивная электронная микроскопия препаратов
    • 2. 4. Атомно-силовая микроскопия ДНК
    • 2. 5. Оценка токсичных и генотоксичных эффектов клеток М. hominis PG
    • 2. 6. Выделение и очистка ДНК
      • 2. 6. 1. Выделение ДНК из клинического материала с помощью коммерческих наборов
      • 2. 6. 2. Выделение ДНК из клеток микоплазмы, культивируемых in vitro
      • 2. 6. 3. Выделение ДНК из препаратов цельной крови
    • 2. 7. Амплификация нуклеотидных последовательностей генов полимеразной цепной реакцией
    • 2. 8. Рестрикционный анализ ампликонов
    • 2. 9. Электрофоретическое разделение фрагментов ДНК в агарозном геле
    • 2. 10. Выделение, дифференциальная окраска и разделение белков с помощью двумерного электрофореза
    • 2. 11. Идентификация белков М. hominis PG37 с помощью MALDI TOF/TOF MS
    • 2. 12. Определение нуклеотидных последовательностей ДНК
  • М. hominis PG
    • 2. 13. Анализ нуклеотидных и аминокислотных последовательностей in silico
    • 2. 14. Статистическая обработка полученных данных
  • Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
    • 3. 1. Частота встречаемости М. hominis у индивидов с отягощенным акушерским анамнезом
    • 3. 2. Распределение частоты встречаемости вариантов IL-1 (IL-1B-5110Т, IL-JB+3954C>TkIL-1RN (VNTR)) и IL-10 (IL-10−1082G>A) у инфицированных и не инфицированных М. hominis индивидов
    • 3. 3. Особенности структуры vaa-тош. у клинических изолятов
  • М. hominis
    • 3. 3. 1. Сравнительный анализ структуры vaa-rena. у клинических изолятов М. hominis с помощью ПЦР и ПДРФ
    • 3. 3. 2. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей vaa-гена у клинических изолятов М. hominis
    • 3. 4. Особенности морфологии и ультраструктуры клеток М. hominis
  • PG37, образующихся в различных условиях среды
    • 3. 5. Сравнительный анализ метрических параметров и матричных свойств ДНК клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды
    • 3. 6. Сравнительный анализ токсигенности М. hominis PG37 при культивировании микоплазмы в различных условиях среды
    • 3. 7. Сравнительный протеомный анализ клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды

Персистенция Mycoplasma hominis у человека (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Выяснение механизмов, определяющих персистенцию.

Mycoplasma hominis — одной из наиболее распространенных микоплазм, ассоциированной с социально-значимыми заболеваниями человека, являющейся также контаминантом клеточных культур, используемых в биотехнологии для производства вирусных вакцин, — представляет значительный интерес как с точки зрения фундаментальных исследований, так и практических разработок, связанных с определением молекулярно-генетических основ формирования системы «паразит-хозяин» и способов ее контроля [Борхсениус и др., 2002; Waites et al., 2005].

В организме человека М. hominis способна вызывать развитие как урогенитальных, так и экстрагенитальных острых и хронических, локальных и системных инфекций аппарантного и инаппарантного типов. Урогенитальные микоплазменные инфекции могут обусловливать осложнения беременности, патологию и гибель плода [Прозоровский и др, 1995; Поздеев, 2004; Razin, Herrmann- 2002; Waites et al., 2005; Egawa et al., 2007]. Контроль микоплазменной инфекции представляет серьезную проблему, решение которой связывают с успехами изучения молекулярных основ адаптации микоплазмы к стрессорным воздействиям и восприимчивости индивидов к персистенции М. hominis [Борхсениус и др., 2002; Razin, 2006].

Факторы, обусловливающие персистенцию патогенных бактерий у млекопитающих и человека, в значительной мере определяются особенностями биологии инфекционного) агента и организма-хозяина [Прозоровский и др., 1995; Lysnyansky et al., 2001аWise et al., 2006]. Гены иммунного ответа организма-хозяина, а также иммунодоминантных и стресс-индуцированных белков инфекционного агента имеют при этом существенное значение [Yogev et al., 2002; Rhen et al., 2003; Razin, 2006; Hamsten et al., 2008]. Показано, что восприимчивость к персистенции ряда патогенных микроорганизмов у человека может быть связана с наличием у индивидов определенных генотипов инфекционных агентов, а также полиморфных локусов генов ключевых иммуномодуляторов прои противовоспалительных реакций — IL-1 (IL-1B-511С>Т, IL-1B+3954C>T, IL-1RN (VNTR)) и IL-10 (IL-10−1082G>А) [Rad et al., 2004; Mege et al., 2006]. Изменения экспрессии генома, морфологии, ультраструктуры, пролиферации и вирулентности бактерий в ответ на воздействие стрессоров обусловливают адаптацию микроорганизмов к неблагоприятным условиям среды (НУС) и их персистенцию [Головлев, 1998; Чернов и др., 2007, 2008а, 2009, 2010; Muela et al, 2008; Madsen et al., 2006a, 2006bSchafer et al., 2007; Folmsbee et al, 2010]. Результаты комплексных исследований генов иммунного ответа организма-хозяина, а также иммунодоминантных и стресс-индуцированных белков инфекционного агента могут использоваться для определения механизмов выживания патогенов в различных условиях среды (РУС) и способов контроля их персистенции, а также разработки региональных программ и индивидуальных схем? лечения заболеваний, ассоциированных с персистенцией микроорганизмов. Однако данные о проведении соответствующих исследований в отношении М. hominis отсутствуют.

Цель данной работы- — выявление факторов восприимчивости к микоплазменнойинфекции и особенностей ответных реакцийклеток М. hominis PG37 на стрессорные воздействия.

Основные задачи исследования:

1. Протестировать клинический материал на наличие М. hominis с помощью ПЦР и определить частоту встречаемости микоплазмы у индивидов с отягощенным акушерским анамнезом (жители г. Казани).

2. Определить варианты IL-1 (IL-1B-5HOT, IL-1B+3954C>T, IL-1RN (VNTR)) и IL-10 (IL-10−1082G>A) у инфицированных и не инфицированных М. hominis индивидов и провести анализ распределения частоты их встречаемости в обследуемых группах.

3. Определить нуклеотидные последовательности vaa-гена у клинических изолятов М. hominis и выяснить особенности вариабельности гена, кодирующего фактор вирулентности микоплазмы — цитоадгезин Vaa.

4. Провести сравнительный анализ морфологии, ультраструктуры и пролиферации клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды — оптимальных и стрессовых.

5. Провести сравнительный анализ метрических параметров ДНК, а также матричных свойств молекулы в отношении амплификации нуклеотидных последовательностей генов у клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды.

6. Провести сравнительный анализ токсигенности М. hominis PG37 при культивировании микоплазмы в различных условиях среды.

7. Провести сравнительный протеомный анализ клеток М. hominis PG37, образующихся в различных условиях среды.

Научная новизна. Впервые проведены комплексные исследования факторов, определяющих персистенцию М. hominis у человека. С помощью ПЦР определенывстречаемость М. hominis у пациентов с отягощенным акушерским анамнезом (ОАА), особенности распределения генотипов полиморфных локусов генов ключевых цитокинов у инфицированных и не инфицированных микоплазмой индивидов — жителей г. Казани, а также вариабельности у клинических изолятов М. hominis vaa-гена, кодирующего фактор вирулентности микоплазмы — цитоадгезин Vaa.

Впервые выявлены молекулярно-генетические маркеры предрасположенности к инфицированию М. hominis. Установлено, что аллель IL-1B+3954*C и. генотипы IL-1B+3954*C/*C и IL-10−1082*G/*G повышают риск персистенции М. hominis, а генотипы IL-1B-511*Т/*Т/IL-1RN*1/*1 и IL-1В+3954*С/*Т / IL-lRN*l/*2 снижают вероятность микоплазменной инфекции. В нуклеотидных последовательностях vaa-гена, кодирующих сайты адгезии и иммунозначимую зону белка, установлен гипервариабельный участок.

Впервые показано, что в результате длительного пребывания М. hominis.

PG37 в стрессовых условиях происходит переход бактерии в некультивируемое состояние (НС) — в культуре микоплазмы достоверно возрастает количество ультрамикроформ (УМФ) — сферических, окруженных мембраной наноструктур (диаметр < 0,2 мкм).

Впервые установлено, что М. hominis PG37 обладает генотоксичностью, проявление которой в стрессовых условиях имеет особенности. Показано, что клетки М. hominis PG37, образующиеся при длительном культивировании в стрессовых условиях, и их культуральная жидкость не оказывают ДНК-повреждающего действия в отношении тестерного штамма Escherichia coli PQ37.

Впервые выполнен сравнительный протеомный анализ клеток М. hominis PG37, образующихся в РУС, и идентифицированы 53 белка, участвующих в ответных реакциях микоплазмы на действия стрессоров (ТШ, СДС).

Научно-практическая значимость. Полученные данные вносят вклад в понимание адаптации М. hominis PG37 к РУС, представления о молекулярно-генетических аспектах персистенции микоплазмы у человека и их региональных особенностях.

В работе выявлены генетические маркеры предрасположенности индивидов (жители г. Казани) к персистенции М. hominis — бактерии, ассоциированной с заболеваниями репродуктивной системы человека, а также являющейся контаминантом клеточных культур, использующихся, в том числе в биотехнологии для производства вирусных вакцин, и предложен диагностический зонд, позволяющий не только идентифицировать различные штаммы М. hominis, но и выявлять экспресс-методом ПЦР культивируемые и некультивируемые формы бактерии.

Идентифицированные в результате протеомного анализа стресс-реактивные белки М. hominis PG37 могут быть использованы для определения молекулярно-генетических механизмов адаптации микоплазмы к стрессовым условиям, а также способов контроля микоплазменной инфекции.

Полученные результаты могут найти применение в медицине для разработки дифференцированных программ, индивидуальных схем лечения и профилактики заболеваний, ассоциированных с М. hominis.

Данные работы могут быть использованы также в курсах лекций по микробиологии, молекулярной генетике, иммунологии инфекционных процессов и молекулярной медицине в ВУЗах.

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследование. Работа проводилась в соответствии с планом научных исследований КИББ КазНЦ РАН по теме «Взаимодействие микоплазм и эукариот: молекулярно-генетические основы образования некультивируемых форм бактерий и формированиясистемы „паразит-хозяин“» (№ гос. per. 1 200 901 965) — при финансовой поддержке РФФИ (проект № 01−04−49 008) — фонда НИОКР РТ (№= 03−3.10−163/2002;2004) — Государственных' контрактов № 35−405/06 на выполнение научно-исследовательских работ, а также № 02.740.1Г.0391* в рамках ФЦП>"Научные и научно-педагогические7 кадры инновационной' России" на 2009;2013 гг. Научные положения диссертации базируются на результатах собственных исследований автора. Синтез праймеров, секвенирование нуклеотидных последовательностей, двумерный, электрофорези идентификацию полипептидов проводили в ФГУ «НИИ физико-химической медицины» ФМБА России (г. Москва) — оценку токсических и генотоксических свойств клеток М. hominis PG37, а. также наноскопию молекул ДНК проводилив КФУ (биолого-почвенный факультет, кафедра микробиологиифизический факультет, кафедра оптики и нанофотоники)* (г. Казань).- Выражаю искреннюю благодарность сотрудникам ФГУ «НИИфизико-химической медицины» ФМБА России — д.б.н., проф. В: М. Говоруну, к.х.н. Т. А. Акопиан, М. А. Роговой, к.б.н. М. В. Серебряковой, В. А. Карпову и сотрудникам КФУд.б.н., проф. О. Н. Ильинской, к.б.н. Н. И. Акберовой, к.ф.-м.н. O.A. Коноваловой, к.б.н. А. Б. Маргулис за предоставленную возможность проведения совместных работ и помощь в экспериментах.

Положения, выносимые на защиту:

1. Аллель IL-1B+3954*C, а также генотипы IL-1B+3954*C/*C и IL-10−1082*G/*G повышают риск персистенции М. hominis, а генотипы IL-1B-511*Т/*Т / IL-1RN*!/*! и IL-1B+3954*C/*T / IL-IRN*l/*2 снижают вероятность микоплазменной инфекции.

2. Клинические изоляты М. hominis вариабельны по первичной структуре и модульной организации гена, кодирующего цитоадгезин Vaa. Нуклеотидные последовательности vaa-гена у клинических изолятов микоплазмы содержат гипервариабельный участок, ассоциированный с иммунозначимой зоной белка.

3. Условия культивирования М. hominis PG37 влияют на пролиферацию культуры, а также морфологию, ультраструктуру клеток микоплазмы и соотношение клеточных морфотипов в популяции бактерии.

4. М. hominis PG37 обладает генотоксичностью, проявление которой в стрессовых условиях имеет особенности.

5. Различные виды стрессоров индуцируют у М. hominis PG37 изменение экспрессии как специфичных, так общих белков.

Апробация работы:

Основные результаты диссертационной работы были представлены на Всероссийской научно-практической конференции «Медицинская микробиология — XXI век» (Саратов, 2004) — 10-й Международной Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология — наука XXI века» (Пущино, 2006) — Итоговой научной конференции КИББ КазНЦ РАН (Казань, 2007) — Всероссийской научно-практической конференции «Молодые ученые в медицине» (Казань, 2007) — Всероссийской конференции с международным участием «Фундаментальные аспекты исследования симбиотических систем» (Саратов, 2007) — 11-й Международной Пущинской школе-конференции молодых ученых «Биология — наука XXI века» (Пущино, 2007) — IV съезде Российского общества биохимиков и молекулярных биологов (Новосибирск,.

2008), II Международной научно-практической конференции «Постгеномная эра в биологии и проблемы в биотехнологии» (Казань, 2008), XIV Международной конференции «Ферменты микроорганизмов в биотехнологии и медицине» (Казань, 2009), Российской конференции «Актуальные проблемы современной биохимии и молекулярной биологии» (Казань, 2010).

Публикации. По теме диссертации опубликовано 15 научных работ, в том числе 4 статьи в журналах, рекомендуемых ВАК.

Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 193 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследований, результатов собственных исследований и их обсуждения, заключения, выводов, списка использованной литературы, а также приложения. В работе представлено 12 таблиц и 41 рисунок. Список цитируемой литературы содержит 363 источника, из них 93 — в отечественных изданиях.

ВЫВОДЫ.

1. Слизистые оболочки урогенитального тракта 30,95% пациентов с отягощенным акушерским анамнезом инфицированы М. hominis. У 14,53% инфицированных микоплазмой присутствуют коинфекции — U. urealyticum (76,47%), С. trachomatis (5,88%), Т. vaginalis (17,65%).

2. Восприимчивость к М. hominis связана с наличием у индивидов определенных вариантов полиморфных локусов генов ключевых иммуномедиаторов прои противовоспалительных реакций — IL-1 и IL-10. У носителей аллели IL-1B+3954*C, а также генотипов IL-1B+3954*C/*C и IL-10−1082*G/*G повышен риск персистенции М. hominis, а у носителей генотипов IL-1В-511 *Т/*Т / IL-1RN*1/*1 и / IL-IRN*l/*2 вероятность микоплазменной инфекции снижена.

3. Клинические изоляты М. hominis вариабельны, по первичной структуре и модульной организации гена, кодирующего цитоадгезин Vaaфактор вирулентности микоплазмы. Нуклеотидная последовательность vaa-гена содержит гипервариабельный участок, ассоциированный, с иммунозначимой зоной белка.

4. В культуре М. hominis PG37, помимо «типичных» клеток микоплазмы, присутствуют ультрамикроформы — сферические, окруженные мембраной наноструктуры (диаметр < 0,2 мкм). Длительное пребывание М. hominis PG37 в стрессовых условиях приводит к увеличению количества ультрамикроформ и переходу бактерии в некультивируемое состояние.

5. Длительное пребываниеклеток М. hominis PG37 в стрессовых условиях приводит к изменению метрических показателей ДНК микоплазмы, но не вызывает изменения матричных свойств молекулы в отношении амплификации генов dnaK, gyrA, gyrB, parE, parC, tuf, arcA, rrlA, rrlB, а также vaa. Праймеры для амплификации vaa-гена могут быть эффективным диагностическим зондомдля обнаружения экспресс-методом ПЦР клеток разных штаммов М. hominis, в том числе бактерии в некультивируемом.

СОСТОЯНИИ.

6. М. hominis PG37 обладает генотоксичностью, проявление которой в стрессовых условиях имеет особенности. Образующиеся при оптимальных условиях клетки М. hominis PG37 (но не их культуральная жидкость) индуцируют SOS-ответ у тестерного штамма Escherichia coli PQ37- ТШ обусловливает появление у клеток также токсических свойств, а ОС — подавление генотоксичности у клеток микоплазмы и проявление ДНК-повреждающего действия у их культуральной жидкости. Культура клеток микоплазмы в некультивируемом состоянии генотоксических свойств не проявляет.

7. Различные виды стрессоров индуцируют у М. hominis PG37 изменение экспрессии как специфичных, так общих белков. 44 из 53 идентифицированных стресс-реактивных белков М. hominis PG37 являются специфичными для СДС, а 9 белков (AspRS, ThrRS, TrxA, AtpD, LDH, Cel, Prs и 2 изоформы консервативного гипотетического белка (МНО0720)) проявляют изменение экспрессии в условиях ТШ и СДС. Идентифицированные стресс-реактивные белки участвуют в процессах трансляции, транскрипции, посттрансляционной модификации, регуляции клеточного цикла, энергообразовании, транспорте и метаболизме углеводов, аминокислот, нуклеотидов, неорганических ионов, а также вирулентности.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

.

Большой объем экспериментальных и теоретических данных, полученных в последнее время в разных лабораториях мира, существенно расширил представления о биологии и патогенности М. hominis — микоплазмы, инфицирующей человека и являющейся контаминантом клеточных культур. Однако факторы, определяющие преодоление защитных систем организма человека и выживание в НУС этой микоплазмы, размер генома которой (665 445 н.п.о.) приближается к рекордно малому среди геномов, известных для бактерий (580 076 н.п.о. у М. genitalium), способных к самостоятельному воспроизведению, пока не ясны. Исследования адаптации этой микоплазмы к стрессорам немногочисленны и до недавнего времени были в основном связаны с определением молекулярных основ реорганизации поверхностных липопротеинов микоплазмы, определяющих адгезию и ускользание бактерий от иммунного контроля. Определение в 2009 году полной нуклеотидной последовательности генома М. hominis [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/] обеспечило принципиально новые возможности для исследования молекулярно-генетических механизмов выживания микоплазмы в стрессовых условиях.

В нашей работе впервые в результате комплексных исследований факторов, определяющих персистенцию М. hominis, были выявлены молекулярно-генетические маркеры восприимчивости и устойчивости к персистенции микоплазмы и показано, что степень деструктивных процессов у инфицированных М. hominis индивидов может быть связана с особенностями генотипов ключевых цитокинов (IL-1 и IL-10) — представлены варианты у клинических изолятов М. hominis гена, кодирующего иммунодоминантный белок — цитоадгезин Vaa, и показано, что для нуклеотидных последовательностей vaa-гена, кодирующих иммунозначимую зону белка, характерна гипервариабельность. Гипервариабельность соответствующего участка vaa-гена, может определять специфичную г ассоциацию инфекционного агента и хозяина, способствующую персистенции бактерии.

Полученные нами результаты подтверждают предположения, что встречаемость М. hominis у пациентов с репродуктивной патологией, а также ассоциация генотипов полиморфных локусов генов цитокинов IL-1 (.IL-1B-5 ПОТ, IL-1B+39540T, IL-1RN (VNTR)) и IL-10 (IL-10−1082G>A) с персистенцией микоплазмы в разных регионах различаются. Эти данные определяют необходимость дифференцированного подхода при разработке схем лечения и профилактики микоплазменной инфекций.

В нашей работе также впервые представлены данные о морфологических, ультраструктурных, токсигенных и молекулярно-генетических особенностях изменений клеток М. hominis PG37 в РУС и идентифицированы стресс-реактивные белки микоплазмы.

Результаты наших исследований свидетельствуют, что воздействия стрессоров индуцируют специфичнуюреорганизацию клеточной и молекулярной биологии микоплазмы. Наличие у М. hominis PG37 механизмов для смены программы жизни в стрессовых условиях определяет необходимость поиска новых подходов для исследования взаимодействия этой микоплазмы с организмом хозяина и способов контроля микоплазменной инфекции.

Выявленные нами стресс-реактивные белки М. hominis PG37 и их гены могут быть мишенями для определения механизмов адаптации микоплазмы к условиям среды и способов контроля микоплазменной инфекции. Вместе с тем, очевидно, что разработка эффективных способов подавления микоплазменной инфекции у человека потребует реализации крупномасштабных исследовательских проектов по субпротеомномному анализу М. hominis, ассоциированному с мембраной и УМФ бактерии, а также транскриптомно-протеомному профилированию клеток микоплазмы и человека при их взаимодействии.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , Н.М. Цитотоксическая активность мелитина, экспрессируемого рекомбинантными векторами в клетках Acholeplasma laidlawii и Mycoplasma hominis / Н. М. Александрова, М. П. Бевова, В. М. Говорун // Генетика. 2001. — Т. 37. — С. 46−53.
  2. , А.С. Геномика и геносистематика / А. С. Антонов // Природа. -1999.-N6.-С. 19−26.
  3. , Н.А. Продукция цитокинов у больных риносинуситом при лечении циклофероном / Н. А. Арефьева, Л. Ф. Азнабаева, А. Л. Коваленко // Лечащий врач. 2000. — N 4. — С. 25−28.
  4. , И.П. Микоплазменные инфекции и инфаркт миокарда / И. П. Арлеевский, О. А. Чернова, Л. А. Танеева и др. // Российский кардиологический журнал. 2003. — N 4. — С. 17−23.
  5. , М.В. Уреаплазменная инфекция / М. В. Байцур, А'.Н. Екимов // Кремлевская медицина. Клинический вестник. — 2000. — N 3: — С. 5−1 Г.
  6. Бактериальный вагиноз: Пособие для врачей / Л. В. Кудрявцева, Е. Н. Ильина, В. М. Говорун и др. М., 2001. — 56 с.
  7. Бактериальный вагиноз: Пособие для врачей. / Под ред. В. М. Говоруна. 5-е изд.-М., 2009.-56 с.
  8. , Л.А. Биохимия процессов воспаления и поражения сосудов.
  9. Роль нейтрофилов / JI.A. Белова // Биохимия. — 1997. — Т. 62. — С. 659−668.
  10. , В.А. Роль Mycoplasma hominis в мужском бесплодии / В. А. Божедомов, JI.3. Файзуллин, М. А. Николаева и др. // Проблемы репродукции. -2004.-N2.-С. 81−86.
  11. , П.Д. Ультраструктурное и ультрацитохимическое исследование иммунокомпетентных клеток периферической крови женщин с привычным невынашиванием беременности / П. Д. Бонарцев, Е. М. Демидова // Акуш. и гин. 1987. -N 10.- С. 15−17.
  12. , С.Н. Белок теплового шока а-кристаллинового типа из микоплазмы (Acholeplasma laidlawii) / С. Н. Борхсениус, И. Е. Вишняков, Е. В. Буданцева и др. // Цитология. 2008. — Т. 50, N 7. — С. 613−618.
  13. , С.Н. Микоплазмы: молекулярная и клеточная биология, взаимодействие с иммунной системой млекопитающих, патогенность, диагностика / С. Н. Борхсениус, О. А. Чернова, В. М. Чернов, М. С. Вонский. -СПб.: Наука, 2002.-319 с.
  14. , М.Б. О наннобактериях / М. Б. Вайнштейн, Е. Б. Кудряшова // Микробиология. 2000. — Т. 69, N 2. — С. 163−174.
  15. , М.С. Экспрессия белков теплового шока у микоплазм / М. С. Вонский, Г. В. Аствацатурянц, С. Н. Борхсениус // ДАН. 1993. — Т. 331, N 3. -С. 112−115.
  16. , Л.И. Антимутагенное действие бактерий против мутагенеза, индуцируемого 4-нитро-хинолин-1-оксидом (4-НХО) у Salmonella typhimurium ТА100 / Л. И. Воробьева, Т. А. Чердынцева, С. Л. Абилев // Микробиология. 1993. — Т. 62, N 2. — С. 232−237.
  17. , В.Г. Иммунологический словарь: Учеб. пособие для студ. высш. учеб. заведений / В. Г. Галактионов. — М.: Академия, 2005. — 160 с.
  18. , И.А. Перекись водорода как сигнальная молекула / И. А. Гамалей, И. В. Клюбин // Цитология. 1996. — Т. 38, N 12. — С. 1233−1247.
  19. , М.А. Асимметричный диметиларгинин: метаболизм, аргининовый парадокс, патофизиология / М. А. Гилинский // Успехи физиологических наук. 2007. — Т. 38, N 3. — С. 21−39.
  20. , В.М. Гомологичная генетическая рекомбинация / В. М. Глазер // Соросовский образовательный журнал. — 1998. — N 7. — С. 13−21.
  21. , С. Медико-биологическая статистика: Пер. с англ. / С. Гланц / Под ред. Н. И. Бузикашвили, Д. В. Самойлова. М.: Практика, 1999. — 460 с.
  22. , E.JI. Введение в биологию стационарной фазы бактерий: механизм общего ответа на стрессы / E.JI. Головлев // Микробиология. -1999.-Т. 68, N5.-С. 623−631.
  23. , E.JI. Другое состояние неспорулирующих бактерий / Е. Л. Головлев // Микробиология. 1998. — Т. 67, N 6. — С. 725−735.
  24. , E.JI. Реакция бактериальных клеток на- холодовой шок на уровне динамики хромосомы, транскрипции и трансляции./ E.JI. Головлев // Микробиология. 2003. — Т. 72, N 1. — С. 5−13.
  25. , Б. Наглядная биохимия / Б. Гринстейн, А. Гринстейн. — М.: ГЭОТАР Медицина, 2000. 119 с.
  26. , А.Е. Роль точечных мутаций в генах топоизомеразы IV и ДНК-гиразы в формировании резистентности Mycoplasma hominis к фторхинолонам: Дис. канд. биол. наук / А. Е. Гущин. М., 1999. — 102 с.
  27. , O.K. О механизмах взаимодействия ДНК с химическими аналогами микробных аутоиндукторов анабиоза / O.K. Давыдова, Д. Г. Дерябин, А. Н. Никиян, Г. И. Эль-Регистан // Микробиология. 2005. — Т. 76, N3, — С. 306−312.
  28. , И.А. Протеом бактерии Mycoplasma gallisepticum / И. А. Демина, М. В. Серебрякова, В. Г. Ладыгина и др. // Биохимия. 2009. — Т. 74. — С. 205 215.
  29. , И.В. О роли латентных, трудно культивируемых и некультивируемых персистентных бактерий в патологии человека / И. В. Елисеева, Е. М. Бабич, Ю. Л. Волянский и др. // Анналы Мечниковского Института. -2006.-N 1.-С. 12−46.
  30. , Л.А. Популяционная биометрия / Л. А. Животовский. М.: Наука, 1991.-271 с.
  31. , Е.Ю. Диагностика микоплазменных заражений с помощью направленной амплификации / Е. Ю. Жуланова, М. С. Вонский, В. В. Лисин и др. // Молекуляр. генетика, микробиол. вирусол. 1993. — Т. 2. — С. 9−13.
  32. , Т.П. Клинические аспекты функционального состояния миометрия беременных женщин с хронической урогенитальной инфекцией / Т. П. Зефирова // Медицинский альманах. 2008. — N 5. — С. 45−48.
  33. , Т.П. Прогнозирование аномалий родовой деятельности у беременных с хронической урогенитальной инфекцией / Т. П. Зефирова, Л. И. Мальцева // Рос. вестн. акуш-ген. 2007. — Т. 2. — С. 21−26.
  34. , H.A. Избирательное ингибирование амплификации ДНК у неадгезивных культур Mycoplasma pneumoniae / H.A. Зигангирова, C.B. Соловьева, И. В. Раковская и др. // Генетика. 1995. — Т. 31, N 8. — С. 10 591 064.
  35. , В.М. Усовершенствование лабораторной диагностики урогенитальной хламидийной инфекции: Автореф. дис.. канд. мед. наук: 03.00.07 / В. М. Зоерман. Пермь, 2007. — 30 с.
  36. , Д.М. Молекулярные основы свертывания крови и тромбообразования / Д. М. Зубаиров. Казань: Фэн, 2000. — 364 с.
  37. , C.B. Распространенность заболеваний, передающихся половым путем, у различных групп населения г. Донецка и области / C.B. Зяблицев, В. Я. Уманский, В. В. Новосельская // Вестник гигиены и эпидемиологии. 2002. — T. 6, N 2. — С. 135−139.
  38. , О.Н. Влияние аутоиндукторов анабиоза бактерий на геном микробной клетки / О. Н. Ильинская, А. И. Колпаков, П. В. Зеленихин и др. // Микробиология. 2002. — Т. 71, N 2. — С. 194−199.
  39. , О.Н. Краткосрочные тест-системы для определения генотоксичности. Методическое руководство / О. Н. Ильинская, А. Б. Маргулис. Казань: Изд-во КГУ, 2005. — 31 с.
  40. , Я. Наглядная биохимия. 2-е изд.: Пер. с нем. / Я. Кольман, К.-Г. Рем. М.: Мир, 2004. 469 с.
  41. , Г. Ф. Микоплазмы в патологии животных / Г. Ф. Коромыслов, Я. Месарош, JI. Штипкович и др. М.: Агропромиздат, 1987. -256 с.
  42. , C.B. Малигнизация нормальных клеток в условиях длительного культивирования in vitro / C.B. Кузьмина. — M., 1983. — 228 с.
  43. Ли, Ю. З. Сравнительное изучение белкового состава клеток патогенной (штамм 232) и авирулентной (штамм J) форм Mycoplasma hyopneumoniae / Ю. З. Ли, Й. П. Хо, Ш. Т. Чен и др. // Биохимия. 2009. — Т. 74. — С. 264−271.
  44. , В.И. Окислительный стресс и механизмы защиты от него у бактерий / В. И. Лущак // Биохимия. 2001. Т. 66. — С. 592−609.
  45. , Б. Гены: Пер. с англ. / Б. Льюин. -М.: Мир, 1987. 544 с.
  46. , Л.И. Механизмы развития осложнений беременности и перинатальных повреждений плода при микоплазменной инфекции у женщин: Дис.. докт. мед. наук: 14.00.01. / Л. И. Мальцева. Казань, 1996. -264 с.
  47. , Л.И. Микоплазменная инфекция в акушерской и перинатальной патологии / Л. И. Мальцева, Т.П. Зефирова^ Л. А. Лобова и др. //Казанский медицинский журнал. 2005. — Т. 86, N 2.- С. 131−135.
  48. , Т. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук. — М.: Мир, 1984. 480 с.
  49. , Е.В. Окислительный стресс при воспалении / Е. В. Меньшикова, Н-К. Зенков // Успехи соврем, биологии. 1997. — Т. 117. — С. 155−171.
  50. , К.Т. Механизмы генетической нестабильности молликут (микоплазм) / К. Т. Момыналиев, В. М. Говорун // Генетика. — 2001. Т. 37, N 9,-С. 1173−1187.
  51. Музыкантов,' A.A. Адаптация микоплазм (Mycoplasma gallisepticum S6) к неблагоприятным условиям роста: Дис.. канд. биол. наук: 03.00.04- 03.00.07. / A.A. Музыкантов. Казань, 2008. — 164 с.
  52. , А.И. Микробиология / А. И. Негрусов, И. Б. Котова: М.: Академия, 2006. — 352 с.
  53. , Ю.А. Внеклеточные факторы- адаптации бактерий' к неблагоприятным условиям среды / IO.A. Николаев // Прикл. биохимия и микробиология. 20 041- Т. 40, — N 4: — С. 387−397.
  54. , E.H. Антимикробные препараты группы фторхинолонов в клинической практике / E.H. Падейская, В. П. Яковлев. М., 1998. — 205 с.
  55. , С. Дж. Основы культивирования микроорганизмов и клеток / С. Дж. Перт. М.: Мир, 1978. — 332 с.
  56. , М.Н. Руководство к практическим занятиям по микробиологии: Практическое пособие / М. Н. Пименова, H.H. Гречушкина,
  57. Л.Г. Азова и др. / Под ред. H.G. Егорова. 2-е изд. -М-: Изд-во Моск. ун-та, 1983.-215 с.
  58. , O.K. Медицинская.микробиология / O.K. Поздеев / Под ред.
  59. B.И. Покровского. М.: ГЭОТАР-МЕД, 2004. — 768 с.
  60. Показатели деятельности дерматовенерологической службы Республики Татарстан за 2007−2008 г. -Казань, 2009.- 27 с.
  61. Прозоровский- С. В. Медицинская микоплазмология / G.B. Прозоровский- И. В. Раковская, Ю. В. Вульфович. М.: Медицина, 1995. — 288 с:.- •
  62. , А. Иммунология / А. Роит, Дж. Бростофф, Д. М. Мейл. М.: Мир, 2000.-582 с.
  63. , Ю.М. Цитокины — возможные активаторы роста патогенных бактерий / Ю. М! Романова, А. Л: Гинцбург // Вестник РАМН. 2000. — N 1.1. C. 13−18.
  64. Скрипаль, И^Г. Микоплазмы. Микроорганизмы возбудители болезней растений / И. Г. Скрипаль / Под ред. В. И. Билая. — Киев: Наук. Думка, 1988. — С. 326−372.
  65. , И.Г. Ультраструктура растительных, микоплазм- и их взаимодействие с клетками специфичных и неспецифичных хозяев / И. Г. Скрипаль, А. НЮнищенко, И. П. Алексеенко и др. // Микробиол. журн. — 1978. -Т. 40, N 1. -С. 58−63.
  66. , A.B. Некультивируемые формы бактерий: распространение в природе, индукторы некультивируемого: состояния и. реверсии / A.B. Соколенко // Соврем, наукоемкие технологии. 2006. — N 2. — С. 11−15.
  67. Тимаков, В.Д. I,-формы бактерий и- семейство Mycoplasmataceae в патологии / В. Д. Тимаков, Г. Я. Каган. М., 1973. — 329 с.
  68. , А.Г. Обмен пугресцина и калия между клеткой и средой как фактор адаптации Escherichia coli к гиперосмотическому шоку / А. Г. Ткаченко, О. Я. Салахетдинова, М. Р. Пшеничнов // Микробиология. — 1997. Т. 66, N 3. С. 329−334.
  69. , М.Б. Полиморфизм генов интерлейкинов и их рецепторов: популяционная распространенность и связь с атопической бронхиальной астмой / М. Б. Фрейдин, — В. П. Пузырев, Л. М. Огородова и др. // Генетика. -2002.-Т. 38, N 12.-G. 1710−1718.
  70. , И.С. Цитокины и межклеточные контакты в противоинфекционной защите организма / И. С. Фрейдлин // Соросовский образовательный журнал. 1996.-N 7. — С. 19−22.
  71. , И.И. Обнаружение капсулы у микоплазмы Acholeplasma laidlawii / И. И. Фридлянская, А. М. Ишов, Ф. М. Летучая и др. // ДАН. 1994. — Т. 334, N 3. -С. 375−377.
  72. , И.А. Регуляция экспрессии, бактериальных- генов- в отсутствие активного роста клеток / И. А. Хмель // Генетика. — 2005. Т. 41, N 9. — С. 1183−1202.
  73. , П. Биохимическая адаптация: Пер. с англ. / II. Хочачка, Дж. Сомеро. М.: Мир-. 1988. — 568 с:
  74. , В.М. Адаптация Mycoplasma gallisepticum S6 к неблагоприятным условиям роста: изменение морфологических и физиологических свойств / В. М. Чернов, O.A. Чернова, О. В. Горшков и др. // Микробиология. 20 086. — Т. 77, N 6. — С.777−781.
  75. , В.М. Адаптация микоплазм к биогенным и абиогенным стрессорам: наннотрансформация и мини-тела Acholeplasma laidlawii / В. М. Чернов, Ю. В. Гоголев, Н. Е. Мухаметшина и др. // ДАН. 2004. — Т. 396, N 3. -С. 417−420.
  76. Чернов, В. М- Адаптация микоплазм к неблагоприятным условиям роста: нанотрансформация и фитопатогенность Acholeplasma laidlawii PG8 / В.М.
  77. , Н.Е. Мухаметшина, Ю.В. Гоголев и др. // ДАН. 2007. — Т. 413, N 2. -С. 271−275.
  78. , В.М. Адаптация микоплазм к неблагоприятным условиям роста: морфология, ультраструктура и экспрессия генома клеток Mycoplasma gallisepticum S6 / В. М. Чернов, В. М. Говорун, И. А. Демина // ДАН. 2008а. -Т. 421, N5.-С. 701−704.
  79. , В.М. Адаптивные реакции микоплазм in vitro: «жизнеспособные, но некультивируемые формы» и наноклетки Acholeplasma laidlawii / В. М. Чернов, Н. Е. Мухаметшина, Ю. В. Гоголев, и др. // Микробиология. 2005. — Т. 75, N 4. — С. 498−504.
  80. , В.М. Ответные реакции клеток Acholeplasma laidlawii PG8 на холодовой шок и окислительный стресс: протеомный, анализ и стресс-реактивные белки*микоплазмы / В. М. Чернов, O.A. Чернова, Е. С. Медведева и др. // ДАН. 2010. — Т. 432. — С. 126−131.
  81. , В.М. Феноменология микоплазменных инфекций растений / В. М. Чернов, O.A. Чернова, И. А. Тарчевский // Физиол. раст. — 1996. Т. 43, N 5. — С.721−728.
  82. , O.A. Биохимические аспекты патогенеза при персистенции микоплазм у человека: Дис.. докт. биол. наук: 03.00.04. / O.A. Чернова. -М., 1997.-238 с.
  83. , О.А. Хромосомные аберрации, индуцированные микоплазменными инфекциями в лимфоцитах периферической крови человека / О. А. Чернова, Е. Н. Волкова, В. М. Чернов // Генетика. — 1996. — Т. 6.-С. 754−763.
  84. , Г. Общая микробиология: Пер. с нем. / Г. Шлегель. М.: Мир, 1987.-567 с.
  85. Эпидемиология и профилактика инфекций, передаваемых преимущественно половым путем (ШИШ), и чесотки: Информационный бюллетень / Под ред. Л. П. Зуевой СПб., 2004. — 36 с.
  86. , И.П. Современные подходы к оценке жизнеспособности бактерии с акцентом на феномене некультурабельности / И. П. Юдин // Annals of Mechnicov Institute. 2007. — N 3. — P. 8−16.
  87. , С.В. Клиническая химиотерапия бактериальных инфекций / С. В. Яковлев. М., 1997. — 255 с.
  88. Alonso, J.C. Purification and properties of the RecR protein from Bacillus subtilis 168 / J.C. Alonso, A.C. Stiege, B. Dobrinski, R. Lurz // J. Biol. Chem. -1993.-Vol. 268.-P. 1424−1429.
  89. Ayora, S. Bacillus subtilis RecU protein cleaves Holliday junctions and anneals single-stranded DNA / S. Ayora, B. Carrasco, E. Doncel et al. // PNAS. -2004.-Vol. 101.-P. 2452−2457.
  90. Baczynska, A. Development of real-time PCR for detection! of Mycoplasma hominis / A. Baczynska, H.F. Svenstrup, J. Fedder et al. // BMC Microbiol. -2004.-Vol. 4:35.
  91. Baczynska, A. Morphology of human Fallopian tubes after infection with Mycoplasma genitalium and Mycoplasma hominis — in vitro organ culture study / A. Baczynska, P. Funch, J. Fedder et al. // Hum. Reprod. 2007. — Vol. 22. — P. 968−979.
  92. Baczynska, A. The use of enzyme-linked immunosorbent assay for detectionof Mycoplasma hominis antibodies in infertile women serum samples / A. Baczynska, H.F. Svenstrup, J. Fedder et al. // Hum. Reprod. — 2005. — Vol. 20. — P. 1277−1285.
  93. Bai, X. AY-WB Phytoplasma secretes a protein that targets plant cell nuclei / X. Bai, V.R. Correa, T.Y. Toruno et al. // Mol. Plant-Microbe Interact. 2009. -Vol. 22.- P: 18−30.
  94. Barile- M.F. Immunization against mycoplasma infections / M.F. Barile // In: The mycoplasmas / M.F.Barile, Sh. Razin (eds). Orlando. 1985. — Vol. 4. — P. 452−492.
  95. Bebear, C. M: Alterations in topoisomerase IV and DNA gyrase in quinolone-resistant mutants of Mycoplasma hominis obtained in vitro / C.M. Bebear, H. Renaudin, A. Charron et al. // Antimicrob. Agents Chemother. — 1997. Vol. 42. -P. 2304−2311.
  96. Bendtzen, K. Immune hormones (cytokines): pathogenic role in autoimmune rheumatic and endocrine diseases / K. Bendtzen // Autoimmunity. — 1989. Vol. 2. -P. 177−189.
  97. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology / G.M. Garrity et al. (eds). -NY.: Springer-Verlag, 2004, 2nd edition. 401 p.
  98. Bidwell, J. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases / J, Bidwell, L. Keen, G. Gallagher et al. II Genes Immun. 1999. — Vol. 1. -P. 319.
  99. Bidwell, J. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases, Supplement 1 / J. Bidwell, L. Keen, G. Gallagher et al. // Genes Immun: — 2001. — Vol. 2.-P. 61−70.
  100. Blanchard, A. Sexyally transmitted mycoplasmas in humans / A. Blanchard- L.D. Olson, M.F. Barile // In: Molecular and cell biology of sexually transmitted* dieseases /D: Wright, L. Archard (eds). 1992.-P. 55−85.
  101. Blum- PI. Silver staining of proteins in Polyacrylamide gels / I I. Blum, M. Beier, I I.J. Gross // Electrophoresis. 1987. — Vol. 8. — P. 93−99.
  102. Boesen, — T. Molecular design of Mycoplasma hominis Vaa adhesin / T. Boesen, N. Fedosova, M. Kjeldgaard et al. II Protein Science. — 2001. -Voh 10. -P. 2577−2586.
  103. Boesen, T. The Mycoplasma hominis vaa .gene displays s mosaic gene structure / T. Boesen, J. Emmersen,.E.T. Jensen et all // Mol. Microbiol. — 1998. -Vol. 29.-P. 97−110.
  104. Boesen, T. The vaa locus of Mycoplasma hominis contains a divergent genetic islet encoding a putative membrane- protein / T. Boesen,. J. Emmersen- A. Baczynska et al.//BMC Microbiol-- 2004v -Vol. 4:37.. «
  105. Boorstein, W.R. Molecular evolution- of the HSP70 multigene. family// W.R. Boorstein, T. Ziegelhoffer, E.A. Craig // X: Mol- Evol. 1994.-Vol. 38.-P- 1−17.
  106. Braga- P.C. Atomic force microscopy: biomedical methods and applications./ P.C. Braga, D- Ricci. Totowa: Iiumana Press, 20 041- 394 p.
  107. Brown, D: R. Revised minimal^^standards- for^?description:of new species of the class Mollicutes (division Tenericutes) / D.R. Brown, R.F. Whitcomb, J.M. Bradbury // Int. J. Syst. Bacteriol. 2007. — Vol. 57. — P. 2703−2719.
  108. Brunner, H. Chemotherapy of mycoplasmas / H. Brunner, G. Laber // In: The Mycoplasmas. Oplando, 1985. — Vol. 4. — P. 403−451.
  109. Bustard, K. The sequences of heat shock protein 40 (DnaJ) homologs provide evidence for a close evolutionary relationship between the Deinococcus thermos group and cyanobacteria / K. Bustard, R.S. Gupta // J. Mol. Evol. 1997. — Vol. 45.-P. 193−205.
  110. Cecchini, K.R. Transcriptional responses of Mycoplasma gallisepticum strains
  111. R in association with eukaryotic cells / K.R. Cecchini, T.S. Gorton, S J. Geary // J. Bacteriol. 2007. — Vol. 189. — P. 5803−5807.
  112. Chassard, C. Interaction between H2-producing and non-H2-producing cellulolytic bacteria from the human colon / C. Chassard, B. Gaillard-Martinie, A. Bernalier-Donadille // FEMS Microbiol. Lett. 2005. — Vol. 242. — P. 339−344.
  113. Chena, S.Y. Morphological changes of Vibrio parahaemolyticus under cold-and starvation-stresses / S.Y. Chena, W.N. Janeb, Y.S. Chena, H.C. Wong // Int. J: Food Microbiol. 2009. — Vol. 129.-P. 157−165.V
  114. Chiancone, E. Role of Dps (DNA-binding proteins from- starved cells) aggregation on DNA / E. Chiancone, P. Ceci // Front. Biosci. 2010: — Vol. 15. -P. 122−131. -
  115. Christiansen, G. Genetic variation in natural populations / G. Christiansen // In Mycoplasmas: molecular, biology andi pathogenesis / J. Maniloff et al. (eds). Washington: ASM- 1992. P. 561−574.
  116. Cole, R.M. Transmission electron microscopy. Basic techniques / R.M. Cole // In: Methods in Mycoplasmology / Sh. Razin, J.G. Tully (eds). NY.: Academic Press, 1983. Vol. 1. — P. 43−50.
  117. Cordwell- S.J. Proteome analysis of Spiroplasma melliferum (A56) and protein characterisation across species boundaries / S.J. Cordwell, D.J. Basseal, I. Humpheiy-Smitlr// Electrophoresis. 1997^ - Vol. 18- - P- 1335−1346.
  118. Deckers-Hebesreit- G- The- F0 comp lex of the proton-translocating F-type ATFase of Escherichia coli / G. Deckers-Hebesreit, K., Altendorf// J. Exp. Biol: -1992.-Vol. 172.-P. 451−459.
  119. Dessi, D. Mycoplasma hominis and Trichomonas vaginalis: a unique case of symbiotic relationship between two obligate human- parasites / D. Dessi, P. Rappelli, N. Diaz et al. // Frontiers in Bioscience. 2006. — Vol. 11. — P. 20 282 034:
  120. Di Giovine, F.S. Single base polymorphism at -511 in the human interleukin-1 beta gene (IL1 beta) / F.S. Di Giovine, E. Takhsh, A.I. Blakemore, G.D. Duff// Hum. Mol. Gen. 1992. — Vol. 1. — P. 450.
  121. Diaz-Garcia, F.J. Mycoplasma hominis attaches to and locates intracellularly in human spermatozoa / F.J. Diaz-Garcia, A.P. Herrera-Mendoza, S. Giono-Cerezo, F.M. Guerra-Infante // Hum. Reprod. 2006. — Vol. 21. — P. 1591−1598.
  122. Dinarello, C.A. Biologic basis for interleukin-1 in disease / C.A. Dinarello // Blood. 1996. — Vol. 87. — P. 2095−2147.
  123. Dowds, B.C.A. Regulation of the oxidative stress response by the hpr gene in Bacillus subtilis / B.C.A. Dowds, J.A. Hoch // J1 Gen. Microbiol. 1991. — Vol. 137. — P. 1121−1125.
  124. Duncan, S. Luminescence-based detection of activity of starved and viable but nonculturable bacteria / S. Duncan, L.A. Glover, K. Killham, J.I. Prosser // Appl. Environ. Microbiol. 1994. — Vol. 60. — P. 1308−1616.
  125. Dvorakova, H. Detection of mycoplasma contamination in cell cultures and bovine sera / H. Dvorakova, L. Valicek, M. Reichelova // Vet. Med. Czech.2005.-Vol. 6.-P. 262−268.
  126. Dybvig, K. Genome of Mycoplasma arthritidis / K. Dybvig, C. Zuhua, P. Lao et al. // Infect. Immun. 2008. — Vol. 76. — P. 4000−4008.
  127. Dybvig, K. Molecular biology of mycoplasmas / K. Dybvig, L. Voelker // Annu. Rev. Microbiol. 1996. — Vol. 50. — P. 25−27.
  128. Edward, D.G. Recommendations on nomenclature of the order Mycoplasmatales / D.G. Edward, E.A. Freundt, R.M. Chanock // Science. 1967. — Vol. 155. -P. 1964−1966.
  129. Egawa, T. Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis presence in umbilical cord is associated with pathogenesis of funisitis / T. Egawa, I. Morioka, T. Morisawa et al. // Kobe J. Med. Sei. 2007. — Vol. 53. — P. 241−249.
  130. Eisen, J.A. The RecA protein as a model molecule for molecular systematic studies of bacteria: comparison of trees of RecAs and 16S rRNAs from the same species / J.A. Eisen // J. Mol. Evol. 1995. — Vol. 41. — P. 1105−1123.
  131. El-Omar, E.M. Interleukin-1 polymorphisms associated with increased risk of gastric cancer / E.M. El-Omar, M. Carrington, W. H. Chow et al. // Nature. 2000. -Vol. 404.-P. 398−402.
  132. Erova, T.E. Cold shock exoribonuclease R (VacB) is involved in Aeromonas hydrophila pathogenesis / T.E. Erova, V.G. Kosykh, A.A. Fadl et al. // J. Bacteriol. 2008, — Vol. 190. — P. 3467−3474.
  133. Eskdale, J. Mapping of the human IL-10 gene and further characterization of the* 5' flanking sequence / J. Eskdale, D. Kube, H. Tesch, G. Gallagher // Immunogenet. 1997. — Vol. 46. — P. 120−128.
  134. Falah, M. Phylogenetic analysis of mycoplasmas based on Hsp70 sequences: Cloning of the dnaK (hsp70) gene region of Mycoplasma capricolum / M. Falah, R.S. Gupta // Int. J. Syst. Bacteriol. 1997. — Vol. 47. — P. 38−45.
  135. Fehri, L.F. Resistance to antimicrobial peptides and stress response in Mycoplasma pulmonis / L.F. Fehri, P. Sirand-Pugnet, G. Gourgues et al. // Antimicrob. Agents Chemother. 2005. — Vol. 49. — P. 4154−4165.
  136. Feldmann, R.C. Decreased metabolism and viability of Mycoplasma hominis induced by monoclonal antibody-mediated agglutination / R.C. Feldmann, B. Henrich, V. Kolb-Bachofen, U. Hadding // Infect. Immun. 1992. — Vol. 60. — P. 166−174.
  137. Ferrer-Navarro, M. Proteome of the bacterium Mycoplasma penetrans / M. Ferrer-Navarro, A. Gomez, O. Yanes et al. // J. Proteome Res. 2006. — Vol. 5. -P. 688−694'.
  138. Folmsbee, M. Nutritional effects of culture media on mycoplasma cell size and removal by filtration / M. Folmsbee, G. Howard, M. McAlister // Biologicals. 2010. — Vol. 38. — P. 214−217.
  139. Fox, G.E. The phylogeny of prokaryotes / G.E. Fox, E. Stackebrandt, R.B. Hespell et al. // Science. 1980. — Vol. 209. — P. 457−463.
  140. Fraser, C.M. The minimal gene complement of Mycoplasma genitalium / C.M. Fraser, J.D. Gocayne, O. White et al. // Science. 1995. — Vol. 270. — P. 397 403.
  141. Freundt, E.A. Indentification of mycoplasmas / E.A. Freundt, H. Erno, R.M. Lemcke // In: Methods in microbiology / T. Norris, J.R. Bergan (eds.). London: Academic Press, Inc., 1979. Vol. 13. — P. 377−434.
  142. Freundt, E.A. The classification of the pleuropneumonia group of organisms (Borrelomycetales) / E.A. Freundt // Intern. Bull. Bacteriol. Nomencl. Taxon. -1955.-Vol. 5.-P. 67−78.
  143. Furuta, T. Interleukin l? polymorphisms increase risk of hypochlorhydria and atrophic gastritis and reduce risk of duodenal^ulcer recurrence in Japan. / T. Furuta, E.M. El-Omar, F. Xiao et al. // Gastroenterology. 2002. — Vol. 123. — P. 92−105.
  144. Garcia-Gonzalez, M.A. Association of interleukin 1 gene family polymorphisms with duodenal» ulcer disease / M.A. Garcia-Gonzalez, A. Lanas, P.H.M. Savelkouhet al. // Clin. Exp. Immunol. 2003. — Vol. 134. — P. 525−531.
  145. Garland, S.M. Absence of significant cellulase activity in microbial flora of the female genital tract / S.M. Garland, Y-C. Tsai, M.I. Kendrick, E.H. Kass // Infect. Immun. 1987. — Vol. 55. — P. 414−419.
  146. Geourjon, C. SORM: a self-optimized method for protein secondary structure prediction / C. Geourjon, G. Deleage // Protein Eng. 1994. — Vol. 7. — P. 157 164.
  147. Gibson, A.W. Novel single nucleotide polymorphisms in the distal IL-10 promoter affect IL-10 production' and enhance the risk of systemic lupus erythematosus / A.W. Gibson, J.C. Edberg, J. Wu et al. // J. Immun. 2001. — Vol. 166.-P. 3915−3922.
  148. Glass, J.I. Essential genes of a minimal bacterium / J.I. Glass, N. Assad-Garcia, N. Alperovich et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2006. — Vol. 103. — P. 425−430.
  149. Glass, J.I. The complete sequence of the mucosal pathogen Ureaplasma urealyticum / J.I. Glass, E.J. Lefkowitz, J.S. Glass // Nature. 2000. — Vol. 407. -P. 757−762.
  150. Goldsmith, M. Plasmid-encoded MucB protein is a DNA polymerase (pol RI) specialized for lesion bypass in the presence of MucA', RecA, and SSB / M. Goldsmith, L. Sarov-Blat, Z. Livneh- // PNAS. 2000. — Vol. 97. — P. 1 122 711 231.
  151. Golshani, M. Detection of Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis and! Ureaplasma" urealyticum by multiplex PGR' in semen sample of infertile men / M. Golshani, G. Eslami, S.M. Ghobadloo et al. // Iranian J. Publ. Health. 2007. -Vol. 36.-P. 50−57.
  152. Guell, M: Transcriptome complexity in a genome-reduced bacterium / M. Guell, V. van Noort, E. Yus et al. // Science. 2009. — Vol. 326. — P. 1268−1271.
  153. Gupta, R.S. HSP70 phylogeny and the relationship between archaebacteria, eubacteria, and eukaryotes /R.S. Gupta, G.B. Golding, B. Singh // J. Mol. Evol. -1994. Vol. 39. — P. 537−540.
  154. Halliwell, B. Hydrogen peroxide in human body / B. Halliwell, M.V. Clement, L.H. Long // FEBS Lett. 2000. — Vol. 486. — P. 10−13.
  155. Hamsten, C. Expression and immunogenicity of six putative variable surfaceproteins in Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC / C. Hamsten, J. Westberg, G. Bolske et al. // Microbiology. 2008. — Vol. 154. — P. 539−549.
  156. Han, M.J. The Escherichia coli proteome: past, present, and future prospects / M.J. Han, S.Y. Lee // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2006. — Vol. 70. — P. 362−469.
  157. Hausmann, C.D. Aminoacyl-tRNA synthetase complexes: molecular multitasking revealed / C.D. Hausmann, M. Ibba // FEMS Microbiol. Rev. 2008. -Vol. 32.-P. 705−721.
  158. Heim, S. The viable but nonculturable state and starvation are different stress responses of Enterococcus faecalis, as determined by proteome analysis / S. Heim, M. Del Mar Lleo, B. Bonato et al. // J. Bacteriol. 2002. — Vol. 184. — P. 67 396 745.
  159. Helminen, M.E. Susceptibility to primary Epstein-Barr virus infection is associated with interleukin-10 gene promoter polymorphism / M.E. Helminen, S. Kilpinen, M. Vitra, M. Hurme // J. Infect. Dis. 2001. — Vol. 184. — P. 777−780.
  160. Henrich, B: Repetitive elements of the Mycoplasma hominis adhesin p50 can be differentiated by monoclonal antibodies / B. Henrich, A. Kitzerow, R.-C. Feldmann et al. // Infect. Immun. 1996. — Vol. 64. — P. 4027−4034.
  161. Henrich, B. Truncation as a novel form of variation of the p50 gene in Mycoplasma hominis / B. Henrich, K. Lang, A. Kitzerow et al // Microbiology. — 1998. Vol. 144. — P. 2979−2985.
  162. Herrmann, R. Genome structure and organization / R. Herrmann // In: Mycoplasmas: molecular biology and pathogenesis / J. Maniloff et al. (eds). Washington: ASM, 1992. P. 157−168.
  163. Himmelreich, R. Comparative analysis of the genomes of the bacteria Mycoplasma pneumoniae and Mycoplasma genitalium / R. Himmelreich, H. Plagens, H. Hilbert et al. //Nucleic Acids Res. 1997. — Vol. 25. -P. 701−712.
  164. Himmelreich, R. Complete sequence analysis of the genome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae / R. Himmelreich, H. Hilbert, H. Plagens et al. // Nucleic Acids Res. 1996. — Vol. 24. — P. 4420−4449.
  165. Hjelle, J.T. Endotoxin and nanobacteria in polycystic kidney disease / J.T. Hjelle, M.A. Miller-Hjelle, I.R. Poxton et al. // Kidney Int. 2000. — Vol. 57. — P. 2360−2374.
  166. Hollegaard, M.V. Cytokine gene polymorphism in human disease: on-line databases, Supplement 3 / M.V. Hollegaard, J.L. Bidwell // Genes Immun. 2006. -P. 1−8.
  167. Hoper, D. Salt stress adaptation of Bacillus subtilis: a physiological proteomics approach / D. Hoper, J. Bernhardt, M. Hecker // Proteomics. 2006. -Vol. 6.-P. 1550−1562.
  168. Hopfe, M. OppA, the ecto-ATPase of Mycoplasma hominis induces ATP release and cell death in HeLa cells / M. Hopfe, B. Henrich // BMC Microbiol. -2008.-Vol. 8:55.
  169. Hopfe, M. OppA, the substrate-binding subunit of the oligopeptide permease, is the major ecto-ATPase of Mycoplasma hominis / M. Hopfe, B. Henrich // J. Microbiol. 2004. — Vol. 186.-P. 1021−1028.
  170. Howard, C.J. Serological comparison and hemoagglutinating activity of Mycoplasma dispar / C.J. Howard, R.N. Gourlay, J. Collins // J. Hyg. (Cambridge). 1974. — Vol. 73. — P. 457−466.
  171. Howell, W.M. Cytokine gene polymorphism, cancer subsceptibility, and prognosis / W.M. Howell, M.J. Rose-Zerilli // J. Nutr. 2007. — Vol. 137. — P. 194S-199S.
  172. Hu, J. The Xanthomonas oryzae pv. oryzae eglXoB endoglucanase gene is required for virulence to rice / J. Hu, W. Qian, C. He // FEMS Microbiol. Lett. -2007. Vol. 269. — P. 273−279.
  173. Jaffe, J. D: The complete genome and proteome of Mycoplasma mobile / I.D. Jaffe, N. Stange-Thomann, G. Smith et al. // Genome Res. 2004. — Vol. 14. — P- 1447−1461.
  174. Jeremias, J: Relationship- between Ureaplasma urealyticum vaginal colonization and< polymorphism in the interleukin-1 receptor antagonist gene / J. Jeremias, P. Giraldo, S. Durrant et al. //J. Infect. Dis. 1999. — Vol. 180. — P: 912 914.
  175. Jin, P. Polymorphism in clinical immunology. — From HLA typing to immunogenetic profiling / P. Jin- E. Wang// J. Transl. Med. 2003- - VoL 1:8.
  176. Kahane, I. Pathogenic mycoplasmas cause oxidative stress ins host cells / I. Kahane // The VI Intern. Congr. of the IOM. Birmingham (Alabama), 1986. P. 70.
  177. Kahane, L Synthesis andJ turnover of membrane protein- and lipid in Mycoplasma laidlawii / I. Kahane, Sh. Razin // Biochim. biophys. acta. 1969: -Vol. 183.-P. 79−89.
  178. Kajander, E.O. Nanobacteria: An alternative mechanism for pathogenic intra-and extracellular calcification and stone formation / E. O- Kaj ander, N. Qifi^ioglu // Proc. Nath Acad. Sei. USA. 1998.-Vol. 95. — P: 8274−8279-.
  179. Kamla, V. Phylogeny based on elongation factor Tu reflects the phenotypic leatures of mycoplasma better than that based on 16S rRNA / V. Kamla- B. Henrich, U. I-Iadding // Gene. 1996. — Vol. 171. — P. 83−87.
  180. Kaprelyants, A.S. Dormancy in non-sporulating bacteria / A.S. Kaprelyants,
  181. J.C. Gottschal, D.B. Kell // FEMS Microbiol. Rev. 1993. — Vol. 140. — P. 271 286.
  182. Karhukorpi, J. The search for links between immunogenetic factors and recurrent miscarriage: Academic Dissertation / J. Karhukorpi- University of Oulo. Oulo, 2005. — 75 p.
  183. Kasper, D.L. Bacterial capsules. Old dogmas and new tricks / D.L. Kasper // J. Infect. Dis. 1986. — Vol. 153. — P. 407−415.
  184. Kaushik, D.K. Developing antibacterial vaccines in genomics and proteomics era / D.K. Kaushik, D. Sehgal // Scand. J. Immunol. 2008. — Vol. 67. — P. 544 552.
  185. Kim, K.S. Use of rpoB sequences for phylogenetic study of Mycoplasma species / K.S. Kim, K.S. Ko, M.W. Chang et al. // FEMS Microbiol. Lett. 2003. -Vol. 226.-P. 299−305.
  186. Koonin, E.V. Horizontal gene transfer in prokaryotes: quantification and classification / E.V. Koonin, K.S. Makarova, L. Aravind // Annu. Rev. Microbiol. -2001. -Vol. 55.-P. 709−742.
  187. Kube, M. The linear, chromosome of the plant-pathogenic Mycoplasma Candidatus Phytoplasma mali / M. Kube, B. Schneider, H. Kuhl et al. // BMC Genomics. 2008. — Vol. 9:306.
  188. Kuhner, S. Proteome organization in a genome-reduced bacterium / S. Kuhner, V. Van Noort, M.J. Betts et al. // Science. 2009. — Vol. 326. — P. 12 351 240.
  189. Madsen, M.L. Transcriptional profiling of Mycoplasma hyopneumoniae during heat shock using microarrays / M.L. Madsen, D. Nettleton, E: L. Thacker et al. // Infect. Immun. 2006a- - Vol. 74. — P. 160−166.
  190. Madsen, M.L. Transcriptional profiling of Mycoplasma hyopneumoniae during iron depletion using microarrays / M.L. Madsen, D. Nettleton, E.L. Thacker, F.G. Minion // Microbiology. 2006b. — Vol. 152. — P: 937−944.
  191. Madsen, M.L. Transcriptome changes in Mycoplasma hyopneumoniae during infection / M.L. Madsen, S. Puttamrcddy, E.L. Thacker et al. // Infect. Immun. -2008. Vol. 76. — P. 658−663.
  192. Maeda- H. Paradigm shift in microbal pathogenesis: an alternative to: thetVi
  193. Koch-Pasteur paradigm on the new- millennium / 11: Maeda // Abst. 13 Int. Gong, of IOMl-Fukuoka, Japan, 2000: P: 35:
  194. Maniloff, J: Evolution of wall-less prokariotes / J. Maniloff // Annu. Rev. Microbiol. 1983.- Vol. 37.-P. 477−499*-
  195. Maniloff, J. Phylogeny of Mycoplasmas / J. Maniloff// In: Mycoplasmas: molecular biology and pathogenesis / J. Maniloff, R.N. McElhaney, L. Finch- J.B. Baseman (eds). Washington: ASM, 1992. -P: 549−560:
  196. Maniloff, Jl. Reconstructing the timing: and- selective events of mycoplasma evolution / J. Maniloff // Abst. 13, h Int. Cong, of IOM. Fukuoka, Japan, 2000: P. 65.
  197. Marini, H- Mycoplasma hominis wound infection after a vascular allograft / H. Marini, V. Merle, N. Frebourg et al: // J. Infect. 2008. — Vol. 57. — P. 272−274.
  198. Markham, P.F. Expression of two members of the pMGA gene family of Mycoplasma gallisepticum oscillates and is influenced by pMGA-specific antibodies / P.F. Markham, M.D. Glew, G.F. Browning et al. // Infect. Immun.1998. Vol. 66. — P. 2845−2853.
  199. Masalma, M.A. The expansion of the microbiological spectrum of brain abscesses with use of multiple 16S ribosomal DNA sequencing / M.A. Masalma, F. Armougom, W. M. Scheid et al. // Clin. Infect. Dis. 2009. — Vol. 48. — P. 1169−1178.
  200. Mashburn-Warren, L.M. Special delivery: vesicle trafficking in prokaryotes / L.M. Mashburn-Warren, M. Whiteley // Mol. Microbiol. 2006. — Vol. 61. — P. 839−846.
  201. McAuliffe, L. 16S rDNA PCR and denaturing gradient gel electrophoresis- a single generic test for detecting and differentiating Mycoplasma species / L. McAuliffe, R.J. Ellis, J. R: Lawes et al. // J. Medical Microbiol. 2005. — Vol. 54. -P. 731−739.
  202. McElhaney, R.N. Membrane structure/ R.N. McElhaney // In: Mycoplasmas, molecular biology and pathogenesis / J. Maniloff, R.N. McElhaney, L. Finch, J.B. Baseman (eds). Washington: ASM, 1992. — P. 113−155.
  203. McGarrity, G.J. Cytogenetic effects of mycoplasmal infection of cell cultures / G.J. McGarrity, V. Vanaman, J. Sarama // In Vitro. 1984. — Vol. 20. — P. 1−19.
  204. Mege, JL. The two faces of interleukin 10 in human infectious diseases / JL. Mege, S. Meghari, A. Honstettre et al. // Lancet Infect. Dis. 2006. — Vol. 6. — P. 557−569.
  205. Mersch-Sundermann, V. Genotoxicity of nitrated polycyclic aromatic hydrocarbons and related structures on Escherichia coli PQ37 (SOS-chromotest) / V. Mersch-Sundermann, S. Kern, F. Wintermann // Environ. Molec. Mutagen. -1991'.-Vol. 18.-P. 41−50.
  206. Methods in mycoplasmology / J.G. Tully, Sh. Razin (eds). NY., 1983. -Vol. 1. 504 p.--Vol. 2. 440 p.
  207. Michalik, S. Proteolysis during long-term glucose starvation in Staphylococcus aureus COL / S. Michalik, M. Liebeke, D. Zuhlke et al. // Proteomics. 2009. — Vol. 9. — P. 4468−4477.
  208. Minion, F.C. The genome sequence of Mycoplasma hyopneumoniae strain232, the agent of swine mycoplasmosis / F.C. Minion, F. Chris, E.J. Lefkowitz et al. // J. Bacteriol. -2004. Vol. 186. — P. 7123−7133.
  209. Miranda, C. Isolation of Mycoplasma hominis from extragenital cultures / C. Miranda, E. Camacho, G. Reina et al. //¦ Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. -2005. Vol. 24. — P. 334−337.
  210. M0ller, B.R. Serological, evidence that chlamydiae and mycoplasmas are involved in infertility of women / B.R. M0ller, D. Taylor-Robinson, P.M. Furr et al. //J. Reprod. Fertil. 1985. — Vol. 73. — P. 237−240.
  211. Muela, A. Changes in Escherichia coli outer membrane subproteome under environmental conditions inducing the viable but nonculturable state / A. Muela, C. Seco, E. Camafeita // FEMS Microbiol. Ecol. 2008. — Vol. 64. — P. 28−36.
  212. Munday, P.E. The prevalence of Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis in the cervix and anal canal of women / P.E. Munday, P.M. Furr, D: Taylor-Robinson // J. Infect. 1981. — Vol. 3. — P. 253−257.
  213. Murillo- L.S. Interleukin-1B (IL-1B) and interleukin-1 receptor antagonist (IL-1RN) gene polymorphisms are not associated with tubal pathology and
  214. Chlamydia trachomatis-velated tubal factor subfertility /L.S. Murillo, J.A. Land, J. i
  215. Pleijster et al. // Hum. Reprod. 2003. — Vol. 18. — P. 2309−2314.
  216. Musatovova, O. Transcriptional heat shock response in the smallest known self-replicating cell, Mycoplasma genitalium / O. Musatovova, S. Dhandayuthapani, JIB. Baseman // J. Bacteriol. 2006. — Vol. 188. — P! 28 452 855.
  217. Mushegian, A.R. A minimal gene set for cellular life derived1 by comparison of complete bacterial genomes / A.R. Mushegian, E.V. Koonin // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1996. — Vol. 93. — P. 10 268−10 273.
  218. Nilsson, A.C. Polymerase chain reaction is superior to serology for the diagnosis of acute Mycoplasma pneumonia infection and reveals a high rate of persistent infection / A.C. Nilsson, P. Bjorkman, K. Persson // BMC Microbiol. -2008.-Vol. 8:93.
  219. Nishigawa, H. A plasmid fronva non-insect-transmissible line of a phytoplasma lacks two open reading frames that exist in the plasmid from the wild-type line / H. Nishigawa, K. Oshima, S. Kakizawa et al. // Gene. 2002. — Vol. 298. — P. 195−201.
  220. Ohkubo, S. The ribosomal protein gene cluster of Mycoplasma capricolum / S. Ohkubo, A. Muto, Y. Kawauchi et al. // Mol. Gen. Genet. 1987. — Vol. 210. -P. 314−322.
  221. Ohmori, H. The Y-family of DNA polymerases / H. Ohmori, E.C. Friedberg, R.P. Fuchs et al. //Mol. Cell. 2001. — Vol. 8. — P. 7−8.
  222. Ohniwa, R.L. Dynamic state of DNA topology is essential for genome condensation in bacteria / R.L. Ohniwa, K. Morikawa, J. Kim et al. // EMBO J. -2006. Vol. 25. — P. 5591−5602.
  223. Oliver, J.D. The viable but nonculturable state in bacteria / J.D. Oliver // J. Microbiol. 2005. — Vol. 43. — P. 93−100.
  224. Olson, L.D. Monoclonal antibodies to surface antigens of a pathogenic Mycoplasma hominis strain / L.D. Olson, S.W. Shane, A.A. Karpas // Infect. Immun. 1991.-Vol. 59.-P. 1683−1689.
  225. Oshima, K. Phylogenetic relationships among mycoplasmas based on the whole genomic information / K. Oshima, H. Nishida // J. Mol. Evol. 2007. — Vol. 65.-P. 249−258.
  226. Ozawa, K. Evidence for the presence of an F-type ATP synthase involved in sulfate respiration in Desulfovibrio vulgaris / K. Ozawa, T. Meikari, K. Motohashi et al. // J. Bacteriol. 2000. — Vol. 182. — P. 2200−2206.
  227. Pastural, M. Mycoplasma hominis infection- in renal transplantation / M. Pastural, V. Audard, M.-P. Bralet et al. //Nephrol'. Dial. Transplant. 2002. — Vol. 17.-P. 495−496.
  228. Pereyre, S. Life on arginine for Mycoplasma hominis: clues from its minimal genome and comparison with other human urogenital mycoplasmas / S. Pereyre, P. Sirand-Pugnet, L. Beven et al. // PLoS Genetics. 2009. — Vol. 5(10).
  229. Pericone, C.D. Inhibitory and bactericidal effects of Streptococcus pneumoniae on other inhabitants of the upper respiratory tract / C.D. Pericone, K.
  230. Overweg, P.W.M. Hermans, J.N. Weiser // Infect. Immun. 2000. — Vol. 68. — P. 3990−3997.
  231. Pociot, F. A TaqI polymorphism in the human interleukin-1 beta (IL-1 beta) gene correlates with IL-1 beta secretion in vitro / F. Pociot, J. M0lving, L. Wogensen et al. // Eur. J. Clin. Invest. 1992. — Vol. 22. — P. 396−402.
  232. Pollack, J. D: Comparative metabolism of Mesoplasma, Entomoplasma, Mycoplasma, and Acholeplasma / J.D. Pollack, M.V. Williams, J. Banzon et al. // Int. J. Syst. Bacteriol. 1996. — Vol. 46. — P. 885−890.
  233. Pollack, J.D. The metabolic pathways of Acholepalsma and Mycoplasma: an overiew / J. D! Pollack,.V.V. Tryon, K.D. Basemann // Yale J: Biol. Med. 1983. -Vol. 56.-P. 709−716:
  234. Potasman, I. Isolation of Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis from public toilet bowls / L Potasman, A. Oren, I. Srugo // Infect. Control Hosp. Epidemiol. 1999. — Vol. 20. — P. 66−68:
  235. Quillardet, P. SOS-chromotest, a direct assay of a SOS-function in Escherichia coli K12 to measure genotoxity / P: Quillardet, O. Huisman, R. D: Ari, M. Hofnung // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1982. — Vol-. 79. — P. 5971−5975:
  236. Quillardet, P. The screening, diagnosis and evaluation of genotoxic agents with batteries of bacterial tests / P. Quillardet, M. Hofnung // Mutat. Res. 1988. -Vol. 205.-P. 107−118.
  237. Rad, R. Cytokine gene polymorphisms influence mucosal cytokine expression, gastric inflammation, and host specific colonization during Helicobacter pylori infection / R. Rad, A. Dossumbekova, B. Neu et al. // Gut. -2004. Vol. 53. -P. 1082−1089.
  238. Rawadi, G. Advances in PCR-based detection of mycoplasmas contaminating cell cultures / G. Rawadi, O. Dussurget // Genome Res. 1995. — Vol. 4. — P. 199 208.
  239. Razin, Sh. Highlights of mycoplasma research — An historical perspective / Sh. Razin, L. Hayflick//Biological. -2010. Vol. 38. — P. 183−190.
  240. Razin, Sh. Isolation and characterization of mycoplasma membranes / Sh. Razin // In: The mycoplasmas / J.G. Tully, R.F. Whitcomb (eds). NY.: Academic Press, 1979. — Vol. 2. — P. 213−229.
  241. Razin, Sh. Molecular biology and genetics of mycoplasmas (Mollicutes) / Sh. Razin // Microbiol. Rev. 1985. — Vol. 49. — P. 419−455.
  242. Razin, Sh. Molecular biology and pathogeneity of mycoplasmas / Sh. Razin, O. Yogev, Y. Naot // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1998. — Vol. 62. — P. 10 941 156.
  243. Razin, Sh. Molecular Biology and Pathogenicity of Mycoplasmas / Sh. Razin, R. Herrmann. — NY.: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 2002. 572 p.
  244. Razin, Sh. The Genus Mycoplasma and Related Genera (Class Mollicutes) / Sh. Razin // Prokaryotes. 2006. — Vol. 4. — P. 836−904.
  245. Regula, J.T. Towards a two-dimensional proteome map of Mycoplasma pneumoniae / J.T. Regula, B. Ueberle, G. Boguth et al. // Electrophoresis. — 2000. -Vol. 21.-P. 3765−3780.
  246. Rensing, S.A. The SecY protein" family: comparative analysis and phylogenetic relationships / S.A. Rensing, U.G. Maier // Mol. Phylogenet. 1994. -Vol.3.-P. 187−191.
  247. Repine, J.E. Hydrogene peroxide kills Staphylococcus aures by reacting with staphylococcal iron to form hydroxyl radical / J.E. Repine, R.B. Fox, E.M. Berger // J. Biol. Chem. 1981. — Vol. 256. — P. 7094−7096.
  248. Rhen, M. The basis of persistent bacterial infections / M. Rhen, S. Eriksson,
  249. M. Clements et al. // Trends Microbiol. 2003. — Vol. 11. — P. 80−86.
  250. Rice, K.C. Molecular control of bacterial death and lysis / K.C. Rice, K.W. Bayles // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 2008. Vol. 72. — P. 85−109.
  251. Rivera, A. Cell cultures contaminations by mycoplasmas / A. Rivera, E. Rivera, S. Giono et al. // Afr. J. Microbiol. Res. 2009. — Vol. 3. — P. 637−640.
  252. Roberts, S.R. Characterization of Mycoplasma gallisepticum infection in captive house finches {Carpodacus mexicanus) in 1998' / S.R. Roberts, P.M. Nolan, G.E. Hill // Avian Dis. 2001. — Vol. 45. — P. 70−75:
  253. Robertson, J.A. Human ureaplasmas show deverse size by pulsed-field gel electrophoresis / J.A. Robertson, L.E. Pyle, G.W. Stemke, L.R. Finch // Nucleic Acids Res. -1990.-Vol. 18.-P. 1451−1455.
  254. Rocha, E.P.C. Analisys of long repeats in bacterial genomes reveals alternative evolutionary mechanisms in Bacillus subtilis and other competent prokaryotes / E.P.C. Rocha, A. Danchin, A. Viari // Мок Biol. Evol. 1999. — Vol. 16.-P. 1219−1230.
  255. Rocha, E.P.C. Genomic repeats, genome plasticity and the dynamics of Mycoplasma evolution / E.P.C. Rocha, A. Blanchard // Nucleic Acids Res. 2002. -Vol. 30.-P. 2031−2042.
  256. Rogers, M.J. Construction of the mycoplasma evolutionary tree from 5S rRNA sequence data / M.J. Rogers, J. Simmons, R.T. Walker et al. // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. 1985. — Vol. 82. — P. 1160−1164.
  257. Rohwer, F. The phage proteomic tree: a genome-based1 taxonomy for phage / F. Rohwer, R. Edwards // J. Bacteriol. 2002. — Vol. 184. — P. 4529−4535.
  258. Rosenbuch- R.F., Minion, C. // In: Mycoplasmas: molecular biology and pathogenesis / J. Maniloff, R.N. McElhaney, L. Finch, J.B. Baseman (eds). Washington: ASM, 1992. P. 73−78.
  259. Ross, J.D.C. Mycoplasma genitalium as a sexually transmitted' infection: implications for screening, testing, and treatment / J.D.C. Ross, J.S. Jensen // Sex. Transm. Infect. 2006. — Vol. 82. — P. 269−271.
  260. Rottem, S. Beware of mycoplasmas / S. Rottem, M. Barile // Trends BiotechnoL- 1993.-Vol. 11.-P. 143−151.
  261. Rottem, S. Interaction of mycoplasma with host cells / S. Rottem // Physiol. Rev.-2003.-Vol. 83.-P. 417−432.
  262. Rottem, S. Invasion of mycoplasmas into and- fusion with host cells / S. Rottem // In: Molecular Biology and Pathogenicity of Mycoplasmas / Sh. Razin, R. Herrmann (eds). NY.: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 2002. — P. 391 401.
  263. Rys, P. Preventing false positives: quantitative evaluation of three protocols for inactivation of polymerase chain reaction amplification products / P. Rys, D.H. Persing//J. Clinic. Microbiol. 1993. — Vol. 31. — P. 2356−2360.
  264. Sachidanandham, R. Monitoring of active but non-culturable bacterial cells by flow cytometry / R. Sachidanandham, K.Y. Gin, C.L. Poh // BiotechnoL Bioeng. 2005. — Vol. 89. — P. 24−31.
  265. Sachse, K. Epitope mapping of immunogenic and adhesive structures in repetitive domains of Mycoplasma bovis variable surface lipoproteins / K. Sachse, J.H. Helbig, I. Lysnyansky et al. // Infect. Immun. 2000. — Vol. 68. — P. 680−687.
  266. Salari, M.H. The rate of Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis and Ureaplasma urealyticum in females with habitual abortion and its comparison with control group / M.H. Salari, N. Badami // Acta Medica Iranica. 2002. — Vol. 40. — P. 79−82.
  267. Salyers, A.A. Laminarinase (?-Glucanase) activity in Bacteroides from the human colon / A.A. Salyers, J.K. Palmer, T.D. Wilkins // Appl. Environ. Microbiol. 1977.-Vol. 3.-P. 1118−1124.
  268. Sanei, B. Experimental infection of chickens and turkeys with Mycoplasma gallisepticum reference strain S6 and North Carolina field isolate RAPD type B / B. Sanei, H.J. Barnes, J.P. Vaillancourt, D.H. Leye // Avian Dis. 2007. — Vol. 51. -P. 106−111.
  269. Santtila, S. Presence of the IL-IRA allele 2(IL1RN*2) is associated with enhanced IL-lbeta production in vitro / S. Santtila, K. Savinainen, M. Hurme //
  270. Scand. J. Immunol. 1998. — Vol. 47. — P. 195−198.
  271. Schafer, E.R. Global transcriptional analysis of Mycoplasma hyopneumoniae following exposure to hydrogen peroxide / E.R. Schafer, M.J. Oneal, M.L. Madsen, F.C. Minion // Microbiology. 2007. — Vol. 153. — P. 3785−3790.
  272. Schrauzer, G.N. Selenomethionine: a review of its nutritional significance, metabolism and toxicity / G.N. Schrauzer // J. Nutrition. 2000. — Vol. 130. — P. 1653−1656.
  273. Sirand-Pugnet, P. Being pathogenic, plastic, and sexual while living with a nearly minimal bacterial genome / P. Sirand-Pugnet, C. Lartigue, M. Marenda et al. // PLoS Genet. 2007. — Vol. 3. — P. 0744−0758.
  274. Skamrov, A. Gene re-arrangement and fusion in Mycoplasma gallisepticum thyA-nrdFEI locus / A. Skamrov, E. Feoktistova, M. Goldman, R. Beabealashvilli //FEMS Microbiol. Lett. -2001. Vol. 200. — P. 31−35.
  275. Sladelc, T.L. Mycoplasma restriction: identification of a new type of restriction specificity for DNA containing 5-methylcytosine / T.L. Sladek, J.A. Nowak, J. Maniloff// J. Bacteriol. 1986. — Vol. 165. — P. 219−225.
  276. Smirnova, G.V. The role of antioxidant systems in the cold stress response of Escherichia coli / G.V. Smirnova, O.N. Zakirova, O.N. Oktyabrskii // Microbiology. 2001. — Vol. 70. — P. 55−60.
  277. Sriramulu, D.D. Small heat shock proteins produced by Pseudomonas aeruginosa clonal variants isolated from diverse niches / D.D. Sriramulu // Proteomics Insights. 2009. — Vol. 2. — P. 39−47.
  278. Steinkasserer, A. The human IL-1 receptor antagonist gene (IL1RN) maps to chromosome 2ql4-q21, in the region of the IL-1 alpha and IL-1 beta loci / A. Steinkasserer, N.K. Spurr, S. Cox et al. // Genomics. 1992. — Vol. 13. — P. 654 657.
  279. Subramaniam, S. Species identification of Mycoplasma bovis and Mycoplasma agalactiae based on the uvrC genes by PCR / S. Subramaniam, D. Bergonier, F. Poumarat et al. // Molec. Cell. Probes. 1998. — Vol. 12. — P. 161 169.
  280. Tam, T.L. Proteome signatures for stress and starvation in Bacillus subtilis as revealed by a 2-D gel image color coding approach / L.T. Tam, H. Antelmann, C. Eymann et al. // Proteomics. 2006. — Vol. 6. — P. 4565−4585.
  281. Taylor-Robinson, D. Update on sexually transmitted mycoplasmas / D. Taylor-Robinson, P.M. Furr // Lancet. 1998. — Vol. 351. — P. 12−15.
  282. Topanurak, S. Proteomics viewed on stress response of thermophilic bacterium* Bacillus stearothermophilus TLS33 / S. Topanurak, S. Sinchaikul, S. Phutrakul et-al. // Proteomics. 2005. — Vol. 5. — P. 3722−3730.
  283. Touati, A. Evaluation of five commercial real-time PCR assays for detection of Mycoplasma pneumoniae in respiratory tract specimens / A. Touati, A. Benard, A. Ben Hassen et al. // J. Clin. Micrbiol. 2009. — Vol. 47. — P. 2269−2271.
  284. Townsend, R. Morphology and ultrastructure of helical and nonhelical strains of Spiroplasma citri / R. Townsend, J. Burgess, K.A. Plaskitt // J. Bacteriol. -1980.-Vol. 142.-P. 973−981.
  285. Turner, D.M. An investigation of polymorphism in the interleukin-10 genejpromoter / D.M. Turner, D.M. Williams', D. Sankaran et al. // Eur. J. Immunogenet. -1997.-Vol. 24.-P. 1−8.
  286. Ueberle, B. The proteome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae: comparing predicted open reading frames to identified gene products / B. Ueberle, R. Frank, R. Herrmann // Proteomics. 2002. — Vol. 2. — P. 754−764.
  287. Van Belkum, A. Short-sequence DNA repeats in procaryotic genomes / A. Van Belkum, S. Scherer, L. Van Alphen, H. Verbrugh // Microbiol. Mol- Biol. Rev. 1998. — Vol. 62.- P. 275−293.
  288. VanBogelen, R.A. Differential induction of heat shock, SOS, and oxidation stress regulons and accumulation of nucleotides in Escherichia coli / R.A. VanBogelen, P.M. Kelley, F.C. Neidhardt // J. Bacteriol. 1987. — Vol. 169. — P. 26−32.
  289. Vancini, R: G. Trichomonas vaginalis, harboring: Mycoplasma* hominis increases cytopathologenicity in vitro / R: G. Vancini- A. Pereira-Neves, R. Borojevic, M. Benchimol // Eur. J. Clin: Microbiol: Infect. Dis. 2008- - Vol: 27. — P. 259−269.
  290. VanDemark, P.J. Evidence for, a: tricarboxylic acid? cycle in Mycoplasma hominis J P. J: VanDemark, P: F. Smith?// J- Bacteriol: 1964: — Vol. 88, — P. 16 021 607.
  291. Vasilieva, S. SOS-chromotest methodology for fundamental, genetic research / S. Vasilieva.// Res. Microbioll- 2002. VolL 153: — Bi 435−4401
  292. Veilleux, C. Detection of mycoplasma infection by PCR / C. Veilleux, S. Razin, L.H. May //In: Molecular and diagnostic procedures on mycoplasmology / J.G. Tally, S. Razin (eds). NY., 1996. — Vol. 2. — P. 431−438.
  293. Vervloet, L.A. Infection by Mycoplasma pneumoniae and Its importance as an etiological agent in childhood community-acquired pneumonias / L.A. Vervloet, C. Marguet, P.A.M. Camargos II BJID. 2007. — Vol. 11. — Pi 507−514.177 .
  294. Viale, A.M. Evolutionary relationships among eubacterial groups as. inferred from GroEL (shaperoniri) sequence comparisons / A.M. Viale, A.K. Arakaki, F.C. Soncini, R.G. Ferreyra // Int. J. Syst. Bacteriol. 1994. — Vol. 44. — P. 527−533 .
  295. Viswanathan, S. Two-dimensional, difference- gel electrophoresis / S. Viswanathan, Mi Unlii, J.S. Minden //Nat. Protoc. 2006.- Vol. 1. — P. 13 511 358.
  296. Voelker, L.L. Association of lysogenic bacteriophage M A V1 with- virulence of Mycoplasma arthritidis /L.L. Voelker, K.E. Weaver, L.J. Ehlc, L.R. Washburn // Infect. Immun. 1995. — Vol. 63. — P. 4016−4023.
  297. Waites, K.B. Mycoplasmas, and Ureaplasmas as neonatal pathogens / K. B' Waites, B: Katz, R L. Schelonka // Clim Biol. Rev. 2005: Vol. 18. P: 757 789. •• '¦.¦"'.'¦.¦¦.'.
  298. Warner, J.M. Randomly amplified polymorphic DNA analysis of clinical-andt environmental isolates of Vibrio vulnificus, and other Vibrio species / J.M. Warner, J.D. Oliver // Appl. Envir. Microbiol. 1999. — Vol: 65. — P. 1141−1144.
  299. Wasinger, V.C. Progress with gene-product mapping of the Mollicutes: Mycoplasma genitalium / V.G. Wasinger, S.J. Gordwell, A. Gerpa-Poljafeetrak II Electrophoresis. 1995. — Vol. 16. — P. 1090−1094.
  300. Wasinger, V.C. The: proteome of Mycoplasma genitalium. Chaps-soluble component / V.C. Wasinger, J! D. Pollack, L Humphery-Smith // Eur. JtBiochem. -2000. Vol. 267. — P. 1571−1582.
  301. Watson, S.P. Characterization of the starvation-survival response: of Staphylococcus aureus / S .P. Watson^ M.O. Clements, S J. Foster // J. Bacteriol. — 1998.-Vol. 180.-P. 1750−1758.
  302. Weiner 3rd, J. Transcription profiles of the bacterium: Mycoplasma pneumoniae grown at different temperatures / J. Weiner 3rd, C.-U. Zimmerman,
  303. H.W.H. Gohlmann, R. Herrmann // Nucleic Acids Res. 2003. — Vol. 31. — P. 6306−6320.
  304. Weisburg, W.C. A phylogenetic analysis of the mycoplasmas: basis for their classification / W.C.Weisburg, J.G. Tully, D.L. Rose et al. // J. Bacteriol. 1989. -Vol. 171.-P. 6455−6467.
  305. Wen, Z.T. Trigger factor in Streptococcus mutans is involved in stress tolerance, competence development, and biofilm formation / Z.T. Wen, P. Suntharaligham, D.G. Cvitkovitch, R.A. Burne //Infect. Immun. 2005. — Vol. 73. -P. 219−225.
  306. Westberg, J. The genome sequence of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC type strain PG1T, the causative agent of contagious bovine pleuropneumonia (CBPP) / J. Westberg, A. Persson, A. Holmberg et al. // Genome Res. 2004. -Vol. 14.-P. 221−227.
  307. Wilkins, J.C. Effect of acidic pH on expression of surface-associated proteins of Streptococcus oralis / J.C. Wilkins, D. Beighton, K.A. Homer // Appl. Environ. Microbiol. 2003. — Vol. 69. — P. 5290−5296.
  308. Williams, M. A Mollicute DNA purification (Mycoplasma) — repair enzyme: and characterization uracil-DNA of glycosylase / M. Williams, J.D. Pollack // J. Bacteriol. 1990. — Vol. 172 — P. 2979−2985.
  309. Mycoplasma capricolum subsp. capricolum of the Mycoplasma mycoides phylogenetic cluster / K.S. Wise, M.F. Foecking, K. Roske et al. // J. Bacteriol. -2006.-Vol. 188.-P. 4926−4941.
  310. Woese, C.R. Phylogenetic analysis of the mycoplasmas / C.R. Woese, J.
  311. Maniloff, L. B: Zoblen // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1980. — Vol. 77. — P. 494 498.
  312. Wood, N.C. In situ hybridization of interleukin-1 in CD 14-positive cells in rheumatoid arthritis / N.C. Wood, E. Dickens, J.A. Symons // Clin. Immunol. Immunopathol. 1992. — Vol. 62. — P. 295−300.
  313. Wu, H.J. Discovery of virulence factors of pathogenic bacteria / H.J. Wu, A.H. Wang, M.P. Jennings // Curr. Opin. Chem. Biol. 2008. — Vol. 12. — P. 93 101.
  314. Xiao, J.C. Simbiosis of Mycoplasma hominis in Trichomonas vaginalis may link metronidazole resistance in vitro / J.C. Xiao, L.F. Xie, S.L. Fang et al. // Parasitol. Res. 2006. — Vol. 100.-P. 123−130.
  315. Yamao, F. UGA is read as tryptophan in Mycoplasma capricolum / F. Yamao, A. Muto, Y. Kawauchi et al. // Proc. Nat. Acad. Sei. USA. 1985. — Vol. 82. — P. 2306−2309.
  316. Yogev, D. Genetic mechanisms of surface variation / D. Yogev, G.F. Browning, K.S. Wise // In: Molecular Biology and Pathogenicity of Mycoplasmas / S. Razin, R. Herrmann (eds). NY.: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 2002.-P. 417−443.
  317. Young, C.C. Elongation factor Tu is methylated in. response to nutrient deprivation in Escherichia coli / C.C. Young, R.W. Bernlohr // J. Bacteriol. -1991.-Vol. 173.-P. 3096−3100.
  318. Yuan, C. Proteomic study of Mycoplasma suis using the gel-based shotgun strategy / C. Yuan, X. Yang, Z. Yang et al. // Vet. Microbiol. 2010. — Vol. 142. -P. 303−308.
  319. Yus, E. Impact of genome reductionon bacterial metabolism and its regulation / E. Yus, T. Maier, K. Michalodimitrakis et al. // Science. 2009. — Vol. 326. — P. 1263−1268.
  320. Zambon, C-F. Pro- and anti-inflammatory cytokines gene polymorphisms and Helicobacter pylori infection: interactions influence outcome / C-F. Zambon, D. Basso, F. Navaglia et al. // Cytokine. -2005. Vol. 29. — P. 141−152.
  321. Zdrodowska-Stefanow, B. Ureaplasma urealyticum and Mycoplasma hominis infection in women with urogenital diseases / B. Zdrodowska-Stefanow, WM.
  322. Klosowska, I. Ostaszewska-Puchalska // Advances in Medical Sciences. 2006. -Vol. 51.-P. 250−253.
  323. Zeller, T. Thioredoxins in bacteria: functions in oxidative stress response and regulation of thioredoxin genes / T. Zeller, G. Klug // Naturwissenschaften. 2006. -Vol. 93.-P. 259−266.
  324. Zhang, Q. Localized reversible frameshift mutation in a adhesin gene confers a phase-variable adherence phenotype in mycoplasma / Q. Zhang, K.S. Wise // Mol. Microbiol. 1997. — Vol. 25. — P. 856−859.
  325. Zhang, Q. Molecular basis of size and antigenic variation of a Mycoplasma hominis adhesin encoded by divergent vaa genes / Q. Zhang, K.S. Wise // Infect. Immun. 1996. — Vol. 64. — P. 2737−2744.
  326. Zheng, X. Isolation of Mycoplasma hominis from a brain abscess / X. Zheng, D.A. Olson, J.G. Tully et al. // J. Clinic. Microbiol. 1997. — Vol. 35. — P. 992 994.
  327. Zimmerman, C-U.R. Transcriptome analysis of Mycoplasma pneumoniae subtypes Ml29 and FH during hydrogen peroxide induced oxidative stress / C-UR. Zimmerman, R. Herrmann // Abst. 16th Int. Cong, of IOM. Cambridge, UK, 2006.-P. 99.
  328. Zou, N. DNA replication, repair and stress response / N. Zou, K. Dybvig // In: Molecular Biology and Pathogenicity of Mycoplasmas / Sh. Razin, R. Herrmann (eds). NY.: Kluwer Academic / Plenum Publishers, 2002. — P. 303−321.
Заполнить форму текущей работой