Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Наноконструкции на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот

Диссертация: Наноконструкции на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Комментируя приведенную схему, можно сказать, что «инженерная техническая» нанотехнология ориентирована на решение таких задач, как: а) создание твердых тел и поверхностей с управляемой молекулярной структуройб) конструирование новых типов химических соединений с управляемыми свойствами (наноконструирование) — в) создание наноразмерных самоорганизующихся (самореплицирующихся) структург… Читать ещё >

Содержание

  • Введение: Нанотехнология и биологические молекулы
  • Глава 1. Наноконструирование на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот
  • Глава 2. Жидкокристаллические дисперсии двухцепочечных нуклеиновых кислот основа для новой стратегии наноконструирования. 1. Жидкие кристаллы (жидкокристаллические фазы) — их свойства
    • 2. Конденсированное состояние высокомолекулярных двухцепочечных ДНК
    • 3. Жидкокристаллическое состояние низкомолекулярных двухцепочечных ДНК в водно-солевых растворах
    • 4. Жидкокристаллические дисперсии низкомолекулярных двухцепочечных ДНК в водно-полимерных растворах
  • Глава 3. Свойства антибиотиков антрациклиновой группы и их комплексов с нуклеиновыми кислотами
    • 1. Химическое строение антрациклиновых антибиотиков
    • 2. Физико-химические свойства антрациклиновых антибиотиков и их комплексов с нуклеиновыми кислотами
  • Глава 4. Комплексы переходных металлов с ДНК, антрациклиновыми антибиотиками
    • 1. Структурная химия переходных металлов на примере меди
    • 2. Особеннности комплексов переходных металлов с двухцепочечными ДНК
    • 3. Комплексы переходных металлов с антибиотиками антрациклиновой группы
  • Глава 5. Материалы и методы
    • 1. Характеристика препаратов
    • 2. Приготовление растворов.'
    • 3. Спектры поглощения и кругового дихроизма
    • 4. Формирование жидкокристаллических дисперсий ДНК и поли (И) поли (Ц) в водно-солевых растворах, содержащих ПЭГ
    • 5. Создание наноконструкций на основе жидкокристаллических дисперсий нуклеиновых кислот
    • 6. Температурная стабильность холестерической ЖКД ДНК и наноконструкций
    • 7. Визуализация частиц наноконструкций
    • 8. Рентгенографический анализ жидкокристаллических фаз ДНК, сформированных из дисперсий комплекса ДНК-антибиотик и
  • ДНК-антибиотик-Си2+
    • 9. Измерение магнитных свойств меди (II) в составе наномостиков
  • Глава 6. Результаты и их обсуждение
    • 1. Комплексы антрациклинового антибиотика дауномицина (ДАУ) с жидкокристаллической дисперсией НК
    • 2. Спектры КД жидкокристаллических дисперсий комплекса [ДНК-ДАУ], обработанных раствором СиС
    • 3. Факторы, влияющие на эффективность образования и свойства наномостиков
    • 4. Рентгенографический анализ жидкокристаллических фаз ДНК и ЖКД ДНК, содержащх наномостики
    • 5. Визуализация ЖКД ДНК после сшивания их наномостиками
    • 6. Магнитные свойства ионов меди в составе наномостиков
    • 7. Гипотетическая структура наноконструкций на основе дц ДНК
    • 8. Пути практического применения наноконструкций
  • Выводы

Наноконструкции на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

На рубеже 20 и 21 веков стало очевидно, что отдельные атомы или единичные молекулы могут быть использованы в качестве «строительных блоков» для f направленного создания структур по методу «атом за атомом». При этом оказалось, что в структурах, состоящих из ограниченного числа строительных блоков, проявляются и доминируют принципиально новые физические явления такие, как квантовые эффекты, временные вариации свойств и их масштабирование в зависимости от размеров самих структур, преобладающее влияние поверхностных свойств, отсутствие дефектов в объеме, значительная энерго-насыщенность, определяющая высокую химическую реакционную способность создаваемых структур, и т. д. Новые явления приводят к тому, что у создаваемых структур появляются уникальные механические, электрические, магнитные, оптические, химические и другие свойства, которые открывают дорогу для таких манипуляций с этими структурами, которые трудно представить в обычных условиях.

Фундаментальные исследования явлений, происходящих в структурах, имеющих размеры от 1 до 1000 нм, лежат в основе развития новой области науки и техники, называемой нанотехнологией.

Нано — от греческого «Nanos» — «карлик» , — величина, составляющая 10″ 9 м (нанометр), масштаб размеров единичных атомов. Нанотехнология возникла из современных достижений и открытий в области визуализации, анализа и манипуляций со структурами, имеющими нанометровые размеры, контролируемого синтеза новых функциональных материалов и создания наноразмерных устройств.

Нанотехнологию можно определить как науку о создании и использовании «структурированных» материалов, устройств и систем с такими функциями, которые связаны с геометрическими размерами или специфическими особенностями наноструктур.

Приципиальную схему «составных частей» классической нанотехнологии, сложившейся к концу 20 века, иллюстрирует табл.1.

Табл. 1. Схема «составных частей» классической нанотехнологии. «Строительные блоки» .

Наноструктуры.

ТГ.

Дисперсии и покрытия Материалы с развитой поверхностью Функциональные наноструктуры Композитные материалы.

Комментируя приведенную схему, можно сказать, что «инженерная техническая» нанотехнология ориентирована на решение таких задач, как: а) создание твердых тел и поверхностей с управляемой молекулярной структуройб) конструирование новых типов химических соединений с управляемыми свойствами (наноконструирование) — в) создание наноразмерных самоорганизующихся (самореплицирующихся) структург) разработка устройств различного назначения (компоненты наноэлектроники, нанооптики, наноэнергетики и т. д.) — д) сопряжение наноразмерных устройств с электронными системами.

Если говорить о наноматериалах на неорганической (в частности, кремниевой) основе, то можно выделить такие свойства, как механическая прочность, сверхпроводимость, развитая поверхность и т. д. Создание таких материалов и устройств, имеющих малый размер, низкую стоимость, низкое энергопотребление и т. д., открывает возможность их применения в различных областях науки и техники.

Таким образом, нанотехнологии должны обеспечивать высокий потенциал экономического роста: определять качество жизни населения, технологическую и оборонную безопасность, ресурсои энергосбережение, т. е. полностью соответствовать социальным запросам любого общества.

Следует добавить, что в табл. 1 не показана область нанотехнологии, которая возникла сравнительно недавно и которая называется наномедициной. Доказательством важности этой области нанотехнологии служит EuroNanoForum 2005, программа которого сконцентрирована на связи между нанотехнологией и здоровьем граждан стран ЕС. Идея о том, что нанотехнология поможет сделать лечение многих заболеваний более направленным, целевым, соответствует интересам как врачей-практиков, так и их пациентов. Действительно, можно изменить распределение лекарств в теле данного пациента таким образом, чтобы они достигали только места своего «действия». Эта задача может быть решена в случае применения «наноструктурных носителей», называемых также «наночастицами (наносистемами) для доставки лекарств». Поскольку уникальная особенность наночастиц состоит в их крайне развитой поверхности, по сравнению с традиционными материалами, наносистемы для доставки лекарств позволяют преодолеть плохую растворимость и плохие абсорбционные свойства (всасываемость) новейших поколений лекарств. В этой связи большое значение приобретает создание новых нанобиоматериалов на основе молекул биополимеров, совместимых с живыми организмами.

Действительно, материалы ряда семинаров и симпозиумов, проведенных в различных странах в последнее время (см. например [1]) показывают, что число исследований в областях нанотехнологии, в которых используются материалы не только на неорганической основе, но и биологические макромолекулы, стремительно увеличивается. Такой интерес к биологическим макромолекулам является вполне оправданным. В процессе эволюции биологические молекулы приобрели целый ряд таких свойств, которые делают их крайне привлекательными для применения в нанотехнологии. Среди них следует отметить следующие. Во-первых, химическое многообразие «строительных блоков», таких как аминокислоты, липиды и нуклеотиды (нуклеозиды), несравнимое по своей численности со строительными блоками на неорганической основе. Во-вторых, сами строительные блоки склонны к спонтанному, но регулируемому на молекулярном уровне, образованию сложных пространственных структур. В-третьих, существует множество путей, по которым происходит сборка (полимеризация) строительных блоков, что открывает возможность создания большого числа наноструктур. Иерархия самособирающихся биологических структур начинается с мономеров (нуклеотидов и нуклеозидов, аминокислот, Сахаров), которые образуют полимеры (такие как ДНК, РНК, белки, полисахариды), затем их ансамбли (мембраны, органеллы) и, наконец, клетки, органы и даже организмы. Можно сказать, что биология — это наука, в которой нанотехнология действительно «работает». Следует добавить, что наноматериалы, зачастую получаемые в результате самосборки, могут иметь не только улучшенные свойства, но и уникальные области применения. Сочетание химической реакционной способности биополимеров с их склонностью к созданию иерархических наноконструкций и возможность промышленного получения биополимеров делает эти молекулы удобным объектом для применения в нанотехнологии. Поэтому использование биологических молекул для создания искусственных наноструктур, на основе принципов, предлагаемых природой, выглядит вполне естественным. Более того, успехи в химическом синтезе и биотехнологии, позволяющие сочетать строительные блоки разной природы, т. е. создавать «химерные» молекулы, содержащие в своем составе, например, аминокислоты и синтетические органические цепи, открывают фантастическую возможность — они позволят создавать нанобиоматериалы и наноконструкции, которые, в принципе, отсутствуют в природе. Таким образом, можно ожидать, что по мере развития нанотехнологии будет происходить «перенос» биополимеров из мира биологии в мир техники.

Настоящая диссертация посвящена исследованию возможности создания напоконструкций на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот, фиксированных в пространственной структуре частиц их жидкокристалличесих дисперсий. Стратегия этого подхода принципиально отличается от стратегии известного подхода к созданию наноструктур, основанного на последовательной модификации исходных молекул нуклеиновых кислот. Для решения поставленной задачи необходимо было определить основные параметры и условия, характеризующие процесс образования наноконструкций (НаК) (природа молекул НК, антибиотиков, ионов металлов, а также температура и т. д.).

Диссертация состоит из двух частей. В первой из них (литературной) дан обзор литературы, касающейся известной стратегии наноконструирования, описаны некоторые свойства жидких кристаллов и жидкокристаллических дисперсий нуклеиновых кислот и сформулированы основные положения, лежащие в основе новой стратегии наноконструирования. В главах 3 и 4 рассмотрено строение антибиотиков антрациклиновой группы, их комплексов с дц НК и ионами металлов. Во второй части (экспериментальной) описаны использованные в работе препараты и методы, а также изложены и обсуждены результаты формирования наноконструкций на основе дц НК.

Выводы:

1. Исходя из молекулярно-биологических представлений о структуре молекул нуклеиновых кислот и особенностях их жидкокристаллического состояния, предложена новая стратегия создания наноконструкций на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот, фиксированных в пространственной структуре частиц холестерической жидкокристаллической дисперсии.

2. Пользуясь предложенной стратегией наноконструирования, на основе двухцепочечных молекул нуклеиновых кислот созданы наноконструкции, определены их морфологические и рентгенографические параметры.

3. Определены факторы (рН, ц, Т°С, структрурные особенности нуклеиновых кислот и т. д.), влияющие на эффективность формирования наноконструкций нуклеиновых кислот.

4. Впервые получены кривые «плавления» наноконструкций и показана специфическая зависимость формы кривых «плавления» и величины температуры «плавления» от числа наномостиков в структуре наноконструкции.

5. Предложена гипотетическая модель наноконструкции на основе молекул двухцепочечных нуклеиновых кислот, фиксированных в структуре частиц их жидкокристаллических дисперсий. Отмечен уникальный характер созданной наноконструкции.

6. Предпринята попытка использовать наноконструкцию на основе двухцепочечной ДНК в качестве интегрального биодатчика для определения химических соединений.

Показать весь текст

Список литературы

  1. NST1.Nanotech 2005 Conference. — 2005. — Vol. 1, 2, 3
  2. N. C. Seeman. DNA in a material world // Nature. 2003. — Vol. 421. — P. 427−431
  3. A. A. Podtelezhnikov, С. Mao, N. C. Seeman and A. Vologodskii. Multimerisation-cyclization of DNA fragments as a method of conformational analysis // Biophysical Journal. 2000'. — Vol. 79. — P. 2692−2704
  4. J. Chen & N. C. Seeman. The synthesis from DNA of a molecule with the connectivity of a cube // Nature. 1991. — Vol. 350. — P. 631−633
  5. N. C. Seeman. Nucleic acid junctions and lattices // J. Theor. Biol. 1982. — Vol. 99. -P. 237−247
  6. J. Shi, D. E. Bergstrom. Assembly of novel DNA cycles with rigid tetrahedral linkers // Angew. Chem., Int. Ed. 2003. — Vol. 36. — P. 111−113
  7. D. Bethell and D. J. Schiffrin. Nanotechnology and nucleotides //Nature. 1996. -Vol. 382.-P. 581
  8. D.B. Lukatsky and D. Frenkel. Phase behaviour and selectivity of DNA-linked nanoparticle assemblies // Phys. Rev. Lett. 2004. — Vol. 92. — No. 6 — P. 302−305
  9. R.L. Lestinger, R. Elghanian, G. Viswanadham, C.A. Mirkin Use of a Steroid Cyclic Disulfide Anchor in Constructing Gold Nanoparticle-Oligonucleotide Conjugates // Bioconjugate Chem. 2000. — Vol. 11 — P. 289−291
  10. C.M. Niemeyer. Progress in «engineering up» nanotechnology devices utilizing DNA as a construction material // Appl. Phys. 1999. — Vol. 68. — P. 119−124
  11. R. F. Service. DNA ventures into the world of designer materials // Science. 1997. -Vol. 277.-P. 1036−1037
  12. C.B. Murray, C.R. Kagan, M.G. Bawendi Self-Organization of CdSe Nanocrystallites into Three-Dimensional Quantum Dot Superlattices // Science. 1995. — Vol. 270. -P.1335−1338
  13. T. Vossmeyer, G. Reck, L. Katsikas, E.T.K. Haupt, B. Schulz, H. Weller A «Double Diamond Superlattice» Built Up of CdiyS^SCfkCfbOH^ Clusters // Science. -1995.-Vol. 267.-P. 1476−1479
  14. A. Sashchiuk, E. Lifshitz, R. Reisfeld, T. Saraidarov, M. Zelner, A. Willenz // J. Sol-Gel Sci. Technol. 2002. — Vol. 24. — P. 31−38
  15. S.A. Davis, M. Breulmann, K.H. Rhodes, B. Zhang, S. Mann // Chem. Mater. 2001. -Vol. 13.-P. 3218−3226
  16. E. Winfree. On the computational power of DNA annealing and ligation. // DIMACS Series in Discrete Mathematics and Theoretical Computer Science. 1996. — Vol. 27. -P. 199−221
  17. K. A. Williams, P.T.M. Veenhuizen, B. G. De la Torre, R. Eritja, C. Dekker. Carbon nanotubes with DNA recognition // Nature. 2002. — Vol. 420. — P. 761
  18. M. J. Heller, B. Sullivan, D. Dehlinger. Fabrication of photonic transfer DNA-quantum dot nanostructures // NSTI-Nanotech 2005. 2005. — Vol. 1
  19. Ю.М. Евдокимов, В. И. Саляиов, С. Г. Скуридин. Молекулярное конструирование для усиления оптического сигнала, генерируемого жидкокристаллической дисперсией ДНК. // Доклады академии наук. 1994. — Т. 338. — № 6. — С. 827−829
  20. D. Demus, Н. Demus, Н. Zaschke. Flissige Kristalle in Tabellen. // VEB Deutscher Verlag fir Grundstoffindustrie. Leipzig 1974. — Vol. 2. — P. 1984
  21. N.A. Plate, V.G. Kulichikhin and R.V. Talroze. Mesophase polymers in the coming decade: problems and trends // Pure & Appl. Chem. 1991. — Vol. 63. — No. 7. — P. 925−940
  22. С. Чандрасекар. Жидкие кристаллы // Мир. 1980. — С. 10−22
  23. В.А. Беляков, А. С. Сонин. Оптика холестерических жидких кристаллов // М. Наука. 1982. — С. 13−121
  24. Е. Iizuka, S.T. Yang. Formation of the liquid crystals of polyribonucleotide complexes. // Liquid crystals and oredered fluids. 1977. — Plenum Press. — P. 187 207
  25. C. Robinson. Liquid crystalline structures in polypeptide solutions // Tetrahedron. -1961.-Vol. 13.-No. 1−3.-P. 219−234
  26. H. Torumi, K. Yahagi, I. Uematsu. Cholesteric structure of liotropic Poly (-benzyl-L-glutamate) liquid crystals. // Mol. Cryst. Liq. Cryst. 1983. — Vol. 94. No. 2. — P. 267 284
  27. К. M. McGrath, P. Kekicheff and M. Kleman. Spiral textures in lyotropic liquid crystals: first order transition between normal hexagonal and lamellar gel phases // J. Phys. II France. 1993. Vol. 3. — P. 903−926
  28. L. Lerman. A transition of DNA condensates induced by poly (ethylene oxide) and polylysine. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1971. — Vol. 68. — P. 1886 — 1890
  29. Yu.M. Evdokimov, A.L. Platonov, A.S. Tikhonenko et al. A compact form of double-stranded DNA in solution // FEBS Letters. Vol. 23. — P. 180−184
  30. V.V. Vasilevskaya, A.R. Khokhlov, Y. Matsuwaza et al. Collapse of single DNA molecule in poly (ethylene glycol) solutions // J.Chem.Phys. 1995. — Vol. 102. — P. 6595−6602
  31. K.van Holde. Structure and function of DNA. A physical approach. // Internatl. Interdisciplinary Workshop, Abbay du Sainte-Odile, Elsace (France). Sept. 30,1996.
  32. Yu. M. Yevdokimov, S.G. Skuridin, V.I. Salyanov. The liquid-crystalline phases of double-stranded nucleic acids in vitro and in vivo // Liquid Crystals. 1988. — Vol. 3. -No. 11.-P. 1443−1459
  33. R. Holyst, M. Blazejczyk, K. Burdzy, G. Goralsky, L. Bocquet. Reduction of dimensionality in a diffusion search process and kinetics of gene expression // Physica A. 2000. — Vol. 277. — P. 71−82
  34. D. Grasso, S. Fasone, V.I. Salyanov. A calorimetric study of the different thermal behaviour of DNA in the isotropic and liquid-crystalline states. // Liquid Cryst. -1991. Vol. 9. — No. 2. — P. 299−305t
  35. Ю.М.Евдокимов. Жидкокристаллические формы ДНК и их биологическая роль // Жидкие кристаллы и их практическое применение. 2003.- Вып. — 3. — С. 10 -47
  36. Yu. M. Yevdokimov, V.I. Salyanov, S.V. Semenov. Analytical capacity of the DNA liquid crystalline dispersions as biosensing units // Biosensors & Bioelectronics. Vol. 11.-No. 9.-P. 889−901
  37. Y. Ichiba, K. Yoshikawa. Single Chain Observation on Collapse Transition in Giant DNA Induced by Negatively-Charged Polymer // Biochem. Biophys. Res. Communs.- 1998.-Vol. 242.-P. 441−445
  38. R. Podgornik, H.H. Strey, D.C. Rau, V.A. Parsegian. Watching molecules crowd: DNA double helices under osmotic stress // Biophys. Chem. 1995. — Vol. 57. — P. 111−121
  39. G. Giannini. Fluorinated Anthracyclines: Synthesis and biological Activity // Medical chemistry reviews online. — 2004. — Vol. 1. — P. 47−71
  40. D. Marco, F. Arcamone, F. Zunino. Daunomycin and Adriamycin and structural analogues: Biological Activity and Mechanism of action // Antibiotics. Berlin-New-York: Springer Verlag. 1975. — Vol. 3. — P. 101 — 128
  41. W. Fleck, D. Straub, H. Prauser. Violamycin, a New Red -Pigment Antibiotic. // Zeitscrift fur Allg. Microbiologic.- 1974. Vol. 14.-No. 7.-P. 551−558
  42. T. Oki, Yu. Matsuzawa, A. Yoshimoto. New Antitumor Antibiotics Aclacinomycin A and B. // J. Antibiot. 1975. — Vol. 28. — No. 10. — P. 830−834
  43. S. Neidle, G. Taylor. The crystal Structure of the Anticancer Agent Daunomycin. // Biochim. Biophys. Acta. 1977. — Vol. 479. — No. 4. — P. 450−459
  44. G. Lober, V. Kleinwachter, Z. Balzarova, H. Fritzche, D.G. Strauss. Spectroscopic Properties of Violamycin BI. //Biophys. 1978. — Vol. 71. — No. 3. — P. 203−204
  45. A. Walter, H. Schutz, E. Stutter. Interaction of Anthracycline Antibiotics with Biopolymers. Equilibrium Binding Studies on the Interaction of Iremycin and DNA. // Int. J. Biol. Macromol. 1983. — Vol. 5. — No.12. — P. 351−355
  46. E.J. Gabbay, D. Grier, R.E. Fingerle, R. Remier, R. Lewy, S.W. Pearce, W.D. Wilson. Interactiom specificity of the Anthracyclines with Deoxyribonucleic acid. // Biochemistry. 1976. — Vol. 15. — No. 10. — P. 2062−2070.
  47. D.J. Patel, L.L. Canuel. Anthracycline Antitumor Antibiotic Nucleic Acid Interactions. Structural aspects of the Daunomycin-Poly (dA-dT) Complex in Solution. // Eur. J. Biochem. — 1978. — Vol. 90. — No. 2. — P. 274−254
  48. A.K. Krey, F.E. Hahn. Studies on the complex of Distamycin A with calf Thymus DNA.//FEBS lett.- 1970.-Vol. I0.-No.3.-P. 175−178
  49. E. Calendi, A. Di Marko, M. Reggiani, В. Scarpinato and L. Valentini. On physico-chemical interactions between daunomycin and nucleic acids. // Biochemica et biophysica acta. 1965. — Vol. 103. — P. 25−49
  50. F. Quadrifoglio and V. Crescenzi. On the binding of actinomycin and daunomycin to DNA: a calorimetric and spectroscopic investigation. // Biophysical chemistry. 1974. -Vol. 2.-P. 64−69
  51. M. Misumi, H. Yamaki, T. Akiyama, N. Tanaka. Mechanism of Action of Aclacinomycin A. The Interaction with DNA and with Tubulin. // J. Antibiot. 1979. -Vol. 32.-No. l.-P. 48−52
  52. K.E. Reinert. Anthracycline Binding induced DNA Stiffening, Bending and elongation- Stereochemical Implication from Viscometric Invesigations.// Nucleic Acids Res. — 1983. — Vol. 11. — P. 3411−3430
  53. J.M. Saucier, B. Festy, J. Le Pecq. I. The Change of the Torsion of the DNA Helix Caused by Intercalation. II. Measurement of the Relative Change of Torsion Induced by Various Intercalating drugs. // Biochimie. 1971. — Vol. 53. — No. 11. — P. 973−980
  54. J.C. Wang. The Degree of Unwinding of the DNA Helix by Ethidium // J. Mol. Biol. -1974.-Vol. 89.-P. 783−801
  55. H. Triebel, K.E. Reinert, H. Bar, H. Shutz, M. Hartmann. DNA Conformational Change Induced by the Strongly Bindning Anthracycline Antibiotic Violamycin Bl- Hydrodinamic studies. // Stud. Biophys. 1980. — Vol. 81. — No. 2/3. P. 79−80
  56. L. F. Lin, J.C. Wang. On the Degree of unwinding of the DNAHelix by Ethidium. II. Studies by Electron Microscopy. // Biochim. Biophys. Acta. 1975. — Vol. 395. — No. 4.-P. 405−412
  57. H. Berg, G. Horn, U. Luthardt. Interaction of Anthracycline Antibiotics with Biopolymers. V. Polarographic Behavior and Complexes with DNA. // J. Electroanal. Chem. 1981. — Vol. 128. — No. 8. — P. 537−553
  58. F. Dall’acqua, D. Vedaldi, A. Gennaro. Studies on the Interaction Between Steffimycin and DNA // Chem. Biol. Interact. 1979. — Vol. 25. — No. 1. — P. 59−70,
  59. G.J. Quigley, A.H.-J. Wang, G. Ugnetto, G. Van der Marel, J.H. Boom, A. Rich. Molecular Structure of Anticancer Drug-DNA Complex: daunomycin Plus d (CpGpTpApCpG). // Proc. Nat. Acad. Sci. 1980. — Vol. 77. — No. 12. — P. 72 047 208
  60. H. Fritzsche, M. Richter, A. Rupprecht. Restriction of Conformational transition of DNA in Films Induced by Intercalating and Non-intercalating Antibiotics.//X Jena Symposium on Biophysical Chemistry. 1984. — P. 21
  61. С. C. Wan, R.H. Knop, J.S. Cohen. Adriamycin Inhibits the В to Z transition of Poly (dGm5 dC) poly (dGm5 dC). // Biochemistry. 1983. — Vol. 22. — No. 24. — P. 5468−5471
  62. D.C. Ward, E. Reich, I.H. Goldberg. Base Specificity in the Interaction of Polynucleotides with Antibiotic Drugs. // Science. 1965. — Vol. 149. — No. 3689. -P. 1259- 1263
  63. V. Barthalemey-Clavay, J.C. Maurizot, P.J. Sicard. Etude spectrophotometrique du Complexe DNA-Daunorubicine. // Biochemie. 1973. — Vol. 55. — No. 10. — P. 859 868
  64. T.W. Plumbridge, L.J. Aarons and J.R. Brown. Problems, associated with analysis and interpretation of small molecule/macromolecule binding data // J. Pharm. Pharmac. -1978.-Vol. 30.-P. 69
  65. A.R. Peacocke and J.H.N. Skerret. The interaction of aminoacridines with nucleic acids // Trans. Faraday Soc. 1956. — Vol. 52. — P. 261
  66. A. Blake and A.R. Peacocke. The interaction of aminoacridines with nucleic acids. // Biopolymers. 1968. — Vol. 6. — P. 1225
  67. T.W. Plumbridge and J.R. Brown. Spectrophotometric and flourescence polarization studies of the binding of ethidium, daunomycin and mepacrine to DNA and poli (I.C.) // Biochim. Biophys. Acta. 1977. — Vol. 479. — P. 441
  68. J. Doscocil and I. Fric. Complex formation of daunomycin with double stranded RNA. // FEBS letters. 1973. Vol. 37. — P. 55−58
  69. T.W. Plumbridge and J.R. Brown. The interaction of adriamycin and adriamycin analogues with nucleic acids in the A and В conformation. // Biochim. Biophys. Acta. 1979.-Vol. 563.-P. 181
  70. Химическая энциклопедия. // Изд-во Советская энциклопедия, М., Т. 3. С. 479
  71. Ф. Басоло, Р. Пирсон. Механизмы неорганических реакций // Издательство Мир, Москва. 1971
  72. С. Chabers, А. К. Holiday. Modern inorganic chemistry. // Butterworth & Co (Publishers), Ltd. 1975. — P. 1−447
  73. H. Scouloudi. The crystal structure of mercury tetrathiocyanate-copper diethylenediamine // Acta cryst. 1953. — Vol. 6. — P. 651−656
  74. С. Chabers, А. К. Holiday. Modern inorganic chemistry. // Butterworth & Co (Publishers), Ltd. 1975. — P. 1−447
  75. А. Уэллс. Структурная неорганическая химия // Изд-во «МИР, М. 1988. — Т. 3
  76. P. G. Jones, Н. Rumpel, Е. Schwarzmann, G. М. Sheldrick and Н. Paulus. Gold (III) oxide // Acta cryst. 1979. — Vol. 35. — P. 1435−1437
  77. J. Granot, D.R. Kearns. Interactions of DNA with divalent metal ions. // Biopolymers.- 1982. Vol. 21. — No. 1. — P. 203−232
  78. C.Jl. Давыдова. Природные макромолекулы в комплексообразовании. Ионы металлов в биологических системах. // Под ред. X. Зигеля. М. Мир. — 1982. — С. 147−165
  79. P.I. Hagerman. Investigation of the flexibility of DNA using transient electric birefringence. // Ibid. 1981. — Vol. 20. — No. 7. — P. 1503−1535
  80. S.V. Kornilova, Yu.P. Blagoi, I.P. Moskalenko et. al. Effect of metal ions on DNA conformation and their biological action on genetic structures of cells // Stud. Biophys.- 1988. Vol. 123. — No. 2. — P. 77−84
  81. В.Г. Брегадзе. Интерпретация ультрафиолетовых дифференциальных спектров в комплексе с некоторыми ионами первого переходного ряда. // Биофизика. -1974.-Т. 19.-№ 1.-С. 179−181
  82. S. Hanlon, В. Wolf, S. Berman et al. The conformational sensitivity of DNA to ionic interactions in aqueous solutions. Metal-ligand interactions in Organic chemistry and biochemistry. // Dordrecht: Holland D. Reidel Publ. 1977. — Vol. 1. — P. 77−106
  83. Л. И. Тихонова, Русак А. Ф. Изучение взаимодействия дезоксирибонуклеиновой кислоты с некоторыми ионами металлов методом кругового дихроизма. // Журн. физ. Химии. 1978. Т. 52.-№ 10.-С. 2683−2685.
  84. Petri, W. Foster, G. Lober. Application of matrix rank analysis to the binding of copper (II) ions with DNA and acridine orange with a polyphosphate. // Stud. Biophys. 1974. — Vol. 43. — No. 1. — P. 61−74
  85. H. Fritzsche. New results about the copper (II) DNA complex. // Ibid. — 1970. — Vol. 5.-P. 315−320
  86. Ю.П. Благой, B.JI. Галкин и др. Металлокомплексы нуклеиновых кислот в растворах, // Киев, Наук. Думка. 1991. — С. 200−234
  87. V.A. Sorokin, Yu.P. Blagoi, V.A. Valeev et. al. Studies of formation of bivalent copper complexes with native and denatured DNA. // J. Inorg. Biochem. 1987. Vol. 30.-No. 2.-P. 87−101
  88. N. Shirai, Y. Iton, A. Kurose et al. Formation of complexes of deoxyribonucleic acid (DNA) with copper (II) and other bivalent metal ions. // Polym. J. 1984. — Vol. 16. -No. 3.-P. 207−215
  89. H. Richard, I.P. Screiber, M. Daune. Interactions of metallic ions with DNA. V. DNA renaturation mechanism in the presence of Cu2+. // Biopolymers. 1973. — Vol. 12. -No. l.-P. 1−10
  90. W. Forster, E. Bauer, H. Schutz et al. Thermodynamics and kinetics of the interaction of copper (II) ions with native DNA. // Biopolymers. 1979. — Vol. 18. — No. 3. — P. 625−661
  91. K.K. Deb. Ultraviolet spectroscopic study of Cu2+ induced DNA melting at room temperature. // Spectroscop. Lett. 1981. — Vol. 14. — No. 5. — C. 385−393
  92. H. Beraldo, A. Garnier-Suillerot, L. Tosi and F. Lavelle. Iron (III) — adriamycin and Iron (Ill)-daunorubicin copmlexes. Physicochemical Characteristics, interaction with DNA, and antitumor activity. // Biochemistry. 1985. — Vol. 24. — P. 284−289
  93. F.T. Greenaway and J.C. Dabrowiak. The bindning of copper ions to daunomycin and adriamycin. // J. Inorg. Biochem. 1986. — Vol. 16. — P. 91−107.
  94. H. D. Coble and H. F. Holtzclaw Jr. Chelate polymers of copper (II) with various dihydroxyquinoid ligands. // J. Inorg. Nucl. Chem. 1974. — Vol. 36. — P. 1049−1053
  95. E. Hodgson, J. R. Bend. Reviews in Biochemical toxicology. 1983. — Vol. 5. — P. 179
  96. T. Maniatis, J. Sambrock, F. Fritsche // Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor- N.Y., Cold Spring Harbor Press. 1989. — P. 133−138
  97. Ю.М. Евдокимов, С. Г. Скуридин, H.M. Акименко. Жидкокристаллические микрофазы низкомолекулярных двухцепочечных нуклеиновых кислот и синтетических полинуклеотидов. // Высокомол. Соед. 1984. — Т. 26. — № 2. — С. 2403−2410
  98. В. Samori, М.А. Osipov, I. Domini, A. Bartolini. Transverse dipole added to DNA chains by drug binding can induce inversion of the long-range chirality of DNA condenstates. // Int. J. Biol. Macromol. 1993. — Vol. 15. — P. 353−359
  99. M. Spinelli, J.C. Dabrowiak. Interaction of copper (II) ions with the daunomycin-calf thymus deoxyribonucleic acid complex. // Biochemistry. 1982. — Vol. 23. — P. 5862−5870.
  100. V. Malatesta, A. Gervasini, F. Morazzoni. Chelation of copper (II) ions by doxorubicin and 4'-epidoxorubicin: ESR evidence for a few complex at high anthacycline/ copper molar ratios. // Inorg. Chim. Acta. 1987. — Vol. 136. — P. 81−85
  101. Ю.Д. Нечипуренко, В. Ф. Рябоконь, С. В. Семенов, Ю. М. Евдокимов Термодинамические модели, описывающие образование «мостиков» между молекулами нуклеиновых кислот в жидких кристаллах.// Биофизика. 2003. — Т. 48. — С. 635−643
  102. Yu. М. Yevdokimov, S.G. Skuridin, V.I. Salyanov. Effect of platinum (II) chmotherapeutic agents on properties of DNA liquid crystals. // Biophysical Chemistry. 1990. — Vol. 35. — P. 143−153
  103. М. Рит. «Наноконструирование в науке и технике». Москва. — 2005. с. 159
  104. В. Зенгер. Принципы структурной организации нуклеиновых кислот. Москва «Мир» 1987,584 с
  105. F. Livolant, A. Leforestier. Condensed phases of DNA: structures and phase transitions//Prog. Polym. Sci.- 1996.-Vol. 21. P. 1115−1164
  106. Yu. M. Yevdokimov, S. G. Skuridin, G. B. Lortkipanidze. Liquid-crystalline dispertions of nucleic acids.// Liquid crystals. 1992. — Vol. 12. — No. 1. — P. 1−16
  107. Yu.M. Yevdokimov, V.I. Salyanov & M.A. Zakharov. A novel type of microscopic size chip based on double-stranded nucleic acids // Lab on a Chip. -2001. Vol. l.-P. 35−41
  108. B. Mattiasson and B. Danielson. Calorimetric analysis of sugars and sugar derivatives with aid of an enzyme transistor. // Carbohydr. Res. 1982. — Vol. 102. -P. 273−282
  109. Искренне благодарен В. И. Салянову и С. Г. Скуридину за помощь в выполнении диссертационной работы, а также за готовность оказать как физическую, так и моральную поддержку.
  110. Весьма признателен В. В. Петухову за помощь в технической поддержке и ремонте научного оборудования.
  111. Отдельные слова благодарности В. А. Боковому и А. И. Клещу за помощь в решении информационных проблем и задач.
  112. Благодарю всех сотрудников лаборатории Конденсированного состояния нуклеиновых кислот за интерес к работе и полезное обсуждение полученных результатов.
Заполнить форму текущей работой

На отлично!