Электрофорез. 
Изучение биоразнообразия популяции крупного рогатого скота с использованием генотипирования по полиморфным локусам

Молекулярный вес продуктов ПЦР и их фрагментов, полученных после рестрикции, определяли с помощью электрофореза в агарозном (1,5 — 2,5 процентном) геле, с использованием трис-боратного буфера (54 г трис; 27,5 г борная кислота; 2 мл 0,5 M ЭДТА, рН 8,0 доводят дистиллированной водой до 1 литра) (Б. Уильямс, К. Уилсон, 1978) и полиакриламидном геле (6 — 12%) (С.Херрингтон и др., 1999).

Образцы ДНК смешивали с буфером для нанесения проб, содержащим (50% глицерина, 50% 1 Х ТВЕ буфера и 0,025% бромфенолового синего). Пробы вносили в лунки геля под электрофорезный буфер. Электрофорез обычно вели при постоянном напряжении 100 V (А. В. Мазин, А. С. Краев, В. А. Потапов, 1990).

Гели окрашивали в растворе этидиум бромида (1 мкг/мл) и просматривали в ультрафиолетовых лучах, при этом краситель, интеркалирующий в молекулу, испускал излучение в красно-оранжевой области видимого спектра (590 нм). После просмотра гели фото-графировали в ультрафиолетовых лучах.

Статистическая обработка данных

Статистическая обработка результатов производилась как по стандартным методикам Н. А. Плохинского и Т. Ф. Лакина, так и с использованием программных возможностей Microsoft Exel.

Первичная обработка данных производилась в программе на основе шаблона Microsoft Exel (BoLA — статистика), разработанной лабораторией биотехнологии СКНИИЖ. Программа требует внесения данных по генотипам быков и коров и автоматически определяет частоты встречаемости генотипов (в абсолютных и относительных значениях), аллелей (по группам и разновидностям), позволяет сортировать животных по генотипам и определять достоверность числовых различий с использованием критерия Стьюдента.