Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Изменчивость рецепторной специфичности вируса ECHO11

Диссертация: Изменчивость рецепторной специфичности вируса ECHO11
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Для культивирования вируса использовали бластные клетки, выделенные из крови больного OMJI без созревания (Ml) после лейкафереза. Примесь эритроцитов из лейкоконцентрата удаляли центрифугированием в растворе фиколл-урографина (р= 1,077 г/мл) при 1500 о б./мин. в течение 15 мин. (соотношение объемов раствора и клеток 4:1). Клетки, оставшиеся над слоем фиколл-урографина, собирали пипеткой… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. 1. Клеточные’рецепторы энтеровирусов человека
      • 1. 1. 1. Рецепторная специфичность полиовирусов
      • 1. 1. 2. Рецепторная специфичность вирусов Коксаки А
      • 1. 1. 3. Рецепторная специфичность вирусов Коксаки В
      • 1. 1. 4. Рецепторная специфичность вирусов ECHO
      • 1. 1. 5. Рецепторная специфичность энтеровируса
    • 1. 2. Роль клеточных рецепторов в проникновении энтеровирусов в клетку
      • 1. 2. 1. Механизм интернетизации энтеровирусов
      • 1. 2. 2. Особенности прохоэ/сдения стадии интернетизации аффинными к DAF энтер о вирусами

Изменчивость рецепторной специфичности вируса ECHO11 (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность проблемы. Энтеровирусы являются возбудителями широкого спектра инфекционных заболеваний от ОРЗ до полиомиелита и энцефалита [1, 3]. Одним из ключевых параметров, ограничивающих круг хозяев вируса и определяющих его тканевой и органный тропизм, является рецепторная специфичность [19, 63, 96, 127]. Исследование особенностей взаимодействия с клеточными рецепторами имеет фундаментальное значение для понимания молекулярных основ тропизма этих вирусов к определённым видам клеток, а также для объяснения особенностей патогенеза и клинического течения энтеровирусных инфекций.

Консерватизм структуры клеточных рецепторов, выполняющих определенные физиологические функции, обусловливает стабильность формы вирусного антирецептора, поэтому этап специфической адсорбции энтеровирусов может рассматриваться как одна из наиболее эффективных точек приложения для разработки противовирусных препаратов. Блокирование репродукции энтеровирусов до проникновения в клетку позволило бы получить менее токсичные противовирусные препараты по сравнению с препаратами, действующими внутриклеточно [78, 79, 131]. Кроме того, формирование лекарственной устойчивости вирусов к таким препаратам должно быть затруднено по причине нежизнеспособности мутантов. Таким образом, проблема специфичности рецепторного взаимодействия энтеровирусов может быть рассмотрена в двух аспектах: в аспекте разнообразия используемых энтеровирусами клеточных рецепторов и в аспекте внутритиповой изменчивости энтеровирусов, позволяющей им использовать альтернативные клеточные рецепторы.

Многие представители рода Enterovirus (большинство вирусов ECHO и некоторые вирусы Коксаки А) в качестве основного клеточного рецептора используют белок DAF (фактор ускорения диссоциации, CD55), присутствующий на мембране ядросодержащих клеток, а также на эритроцитах и тромбоцитах. Взаимодействие энтеровирусов с эритроцитарным рецептором DAF in vitro вызывает феномен гемагглютинации [29, 71, 102, 112]. В то же время, известно, что некоторые штаммы этих вирусов могут использовать независимый от DAF путь проникновения в клетки с помощью альтернативных рецепторов [36, 37, 49, 58, 92].

Ранее было установлено, что в популяциях гемагглютинирующих (ГА) клонов вируса ECHO 11 (признак daf +) обнаруживаются негемагглютинирующие мутанты, утратившие сродство к рецептору DAF (признак daf~). Доля daf мутантов в вирусной популяции имела близкие величины в двух последовательных пассажах daf + клонов, что свидетельствовало о равновесной структуре популяции в отношении данного признака. На культуре фибробластов эмбриона человека (ФЭЧ) была экспериментально доказана нейтральность мутации, приводящей к утрате сродства к DAF. Средняя частота daf~ мутантов в составе daf+ клона (3−10−5) соответствовала вероятности возникновения нуклеотидной замены в определенной позиции у РНК-геномных вирусов (10″ 4 — 10″ 5), что позволяло высказать предположение о точковом характере мутации, приводящей к изменению рецепторной специфичности вируса ECHO 11 [70]. Было показано, что на перевиваемой культуре клеток JI-41 наблюдалось резкое ограничение инфекционной активности daf + клонов вируса ЕСН011, полученных на культуре ФЭЧ. В пассажах на клетках JI-41 было выявлено постепенное снижение ГА активности вируса, сопровождавшееся выравниванием его инфекционной активности на обеих клеточных культурах (ФЭЧ и JI-41) [12]. В то же время, оставались неизвестными локализация мутации, обусловливающей изменение рецепторной специфичности вирусов ECHO, а также причины утраты вирусом ГА активности при адаптации к клеткам JI-41.

Цель исследования. На модели вируса ECHO 11 выяснить механизм селекции энтеровирусов по признаку рецепторной специфичности при репродукции в клеточных культурах и установить молекулярно-генетические основы феномена изменчивости данного признака.

Задачи работы:

1. Картировать мутации, обусловливающие утрату вирусом ECHO 11 аффинности к рецептору DAF.

2. Оценить характер изменения рецепторной специфичности вируса ECHO 11 при адаптации с перевиваемой культуры RD (клетки рабдомиосаркомы человека) к культурам JT-41 (клетки крови больного острым моноцитарным лейкозом) и НЕр-2 (клетки карциномы гортани человека).

3. Выяснить механизм селекции мутантов с измененной рецепторной специфичностью при репродукции вируса ECHO 11 на клеточных культурах JI-41 и НЕр-2.

4. Сравнить репродуктивную активность daf+ вариантов и daf~ мутантов в бластных клетках, выделенных из крови больного острым миелоидным лейкозом (OMJI).

5. Изучить особенности репродукции вируса ECHO 11 на перевиваемой культуре клеток почки африканской зеленой мартышки BGM.

Положения, выносимые на защиту:

1) Рецепторная специфичность вируса ECHOl 1 является вариабельным признаком: существуют мутантные неаффинные к DAF формы данного вируса, использующие для адсорбции на клеточной мембране альтернативные рецепторы.

2) Утрата вирусом ECHO 11 сродства к рецептору DAF обусловлена единичными аминокислотными заменами в участке белка VP2, образующем антирецептор.

3) Адаптация вируса ECHO 11 к клеточным культурам JI-41 и НЕр-2 сопровождается селекцией по признаку рецепторной специфичности и накоплением в популяции мутантов, не имеющих сродства к DAF.

4) Селекция daf ~ мутантов на клетках JI-41 и НЕр-2 обусловлена меньшей продолжительностью периода их интернализации по сравнению с исходным daf+ вирусом.

Научная новизна работы. Обнаружены ранее не описанные мутации, приводящие к утрате вирусом ECHO 11 способности связываться с рецептором DAF.

Впервые установлено, что позитивная селекция daf ' мутантов при адаптации daf+ клонов вируса ECHOl 1 к клеточным культурам J1−41 и НЕр-2 обусловлена низкой скоростью интернализации частиц с daf+ фенотипом.

Показано, что рестрикция репродуктивной активности daf + варианта вируса ECHOl 1 на клетках обезьяны BGM не связана с этапом адсорбции.

Впервые описаны селективные свойства бластных клеток, выделенных из крови больного OMJI, в отношении daf + и daf ~ вариантов вируса ЕСНОП.

Теоретическая и практическая значимость работы. Результаты исследования дополняют современные представления об изменчивости рецепторной специфичности энтеровирусов как об адаптационном механизме, расширяющем диапазон чувствительных клеток, а также о роли данного феномена в патогенезе энтеровирусных инфекций. Результаты оценки чувствительности клеточных культур к вариантам вируса ЕСНОП могут быть использованы для оптимизации методики выделения аффинных к DAF энтеровирусов из клинического материала.

Внедрение результатов исследования и апробация работы. Материалы исследований внедрены в учебный процесс кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии ГОУ ВПО «Уральская государственная медицинская академия» Росздрава.

Основные результаты работы представлены и обсуждены на I конференции иммунологов Урала (г. Екатеринбург, 2001) — 57-й, 58-й, 59, 60-й, 61-й, 62-й и 63-й межвузовских научно-практических конференциях молодых ученых и студентов с международным участием «Актуальные вопросы современной медицинской науки и здравоохранения» (г. Екатеринбург, 2002, 2003, 2004, 2005, 2006, 2007, 2008 гг.) — IV межрегиональной научно-практической конференции с международным участием ОГМА (г. Омск, 2003 г.) — Межрегиональной научной конференции (г. Томск, 2003 г.) — конференции УрО РАН «Вирусы и иммунитет» (г. Екатеринбург, 2003 г.) — III конференции молодых ученых России с международным участием «Фундаментальные науки и прогресс клинической медицины» (г. Москва, 2004 г.), региональной научно-практической конференции «Актуальные вопросы вирусных инфекций в современный период» (г. Екатеринбург, 2007 г.).

По теме исследования опубликованы 18 научные работы, из них 3 в рецензируемых журналах.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, главы литературного обзора, 3 глав собственных исследований, обсуждения, выводов, списка литературы, включающего 13 отечественных и 154 зарубежных источника, и приложений. Диссертация имеет объем 132 страницы, иллюстрирована 17 таблицами и 14 рисунками.

ВЫВОДЫ.

1) Рецепторная специфичность вируса ECHOl 1 является вариабельным признаком: помимо основного рецептора DAF для адсорбции на клеточной мембране вирус может использовать альтернативные рецепторы. Утрата вирусом ECHO 11 сродства к DAF обусловлена точковой мутацией по ограниченному числу сайтов в участке белка VP2, образующем антирецептор.

2) Адаптация daf + вируса ECHOll, выделенного на клетках RD, к культурам JI-41 и НЕр-2 сопровождается изменением рецепторной специфичности вирусной популяции. Происходит позитивная селекция daf~ мутантов с расширенным диапазоном клеток-хозяев.

3) Ограничение репродуктивной активности исходного daf+ вируса по сравнению с daf ~ hr + мутантами на клетках JI-41 и НЕр-2 не связано с уровнем его адсорбции на клеточной мембране, а обусловлено большей продолжительностью периода интернализации на этих культурах.

4) Рестрикция инфекционной активности daf + варианта вируса ECHOll, наблюдаемая на клеточной культуре BGM, не связана с этапом адсорбции. Адаптированный к клеткам BGM вирус сохраняет аффинность к человеческому рецептору DAF.

5) Властные клетки, выделенные из крови больного OMJI, поддерживают репродукцию daf+ варианта вируса ECHOll, в то время как daf hr + мутант не проявляет репродуктивную активность на данной культуре.

1.3.

Заключение

.

На основании проведенного обзора литературы можно сделать следующее заключение:

1) В настоящее время известно более 10-ти клеточных рецепторов, используемых различными энтеровирусами. Показано, что в некоторых случаях для инфицирования клетки, необходимо взаимодействие вириона одновременно с двумя (или более) мембранными молекулами разных типов. При этом один из рецепторов фиксирует вирион на поверхности клетки, а другой участвует в запуске процесса интернализации комплекса вируса с рецептором. Однако современные сведения о рецепторной специфичности энтеровирусов недостаточно полно отражают спектр используемых ими клеточных рецепторов.

2) Основным клеточным рецептором для многих энтеровирусов (в том числе ECHOll) является белок DAF (CD55). Способность некоторых представителей рода к агглютинации эритроцитов обусловлена их сродством к этому рецептору. Наличие DAF на мембране клетки является необходимым, но недостаточным условием для ее инфицирования daf + вирусом. Проникновение вируса в цитозоль возможно только при взаимодействии с корецепторами (CD59- р2-микроглобулин и, вероятно, другими).

3) После связывания с рецептором на клеточной мембране вирион превращается в А-частицу, образующую трансмембранную пору, через которую вирусная РНК проникает в цитозоль (пустой капсид остается снаружи). Индуктором процесса трансформации вируса в А-частицу является взаимодействие рецептора с поверхностью каньона, окружающего вершину каждого пентамера капсида. Рецептор DAF связывается с капсидом южнее каньона, в то время как функцию взаимодействия с каньоном берет на себя корецептор. Аффинные и неаффинные к DAF энтеровирусы используют принципиально разные механизмы проникновения в клетку: необходимым условием для запуска интернализации daf + вируса является эндоцитоз комплекса вирус-рецептор в «липидных плотах» или кавеолах, тогда как daf вирусы используют альтернативный путь интернализации без участия кавеолина.

4) Существование феномена изменчивости рецепторной специфичности энтеровирусов можно считать доказанным. Многие вирусы Коксаки, ECHO и EV70 для инфицирования клетки могут использовать более одного клеточного рецептора. Разнообразие рецепторной специфичности для одного и того же серотипа обеспечивается за счет спонтанных мутаций в структурной части генома. Таким образом, популяции как природных, так и лабораторных штаммов указанных вирусов являются гетерогенными по признаку рецепторной специфичности. В то же время, молекулярно-генетические основы феномена изменчивости рецепторной специфичности, а также причины и механизм селекции вируса по данному признаку остаются неизученными.

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

2.1. Вирусы.

Прототипный штамм Gregory вируса ECHO 11 получен из Института полиомиелита и вирусных энцефалитов (г. Москва). Штамм 7611 вируса ECHOl 1 является клиническим изолятом от больного серозным менингитом.

Вирусные клоны ранее были выделены из исходных штаммов методом бляшек под агаровым покрытием (3−4-х кратное клонирование «из бляшки-в бляшку»). Гемагглютинирующие (daf) клоны 5.9.11.5 (штамм 7611) и G3123 (штамм Gregory) получены на первичной клеточной культуре ФЭЧ, daf «клон 111 (штамм 7611) — на перевиваемой культуре клеток рабдомиосаркомы человека RD. Негемагглготинирующие {daf «») клоны выделены на культуре ФЭЧ по схеме, представленной на рисунке 2: из клона 5.9.11.5 — 101 и 103, из клона G3123 — G28 и G70 [70]. Полученные вирусные клоны размножали в тех же культурах клеток, в которых они были выделены.

5.9.11.5 Л.

ФЭЧ).

ФЭЧ) (ФЭЧ) (ФЭЧ) (ФЭЧ).

ФЭЧ) 103.

ФЭЧ).

KD).

RD).

ДОУ).

Gregory.

ФЭЧ).

ФЭЧ) (ФЭЧ).

G3123.

ФЭЧ).

0G28 s (ФЭЧ).

G70.

ФЭЧ).

Рисунок 2. Схема получения daf" и daf клонов из штаммов Gregory и 7611 вируса ECHOl 1. В скобках указана клеточная культура, на которой был получен штамм/клон.

2.2. Первичная культура фибробластов эмбриона человека.

Первичную культуру фибробластов эмбриона человека получали модифицированным методом холодной трипсинизации. Эмбрионы, извлеченные в результате искусственных абортов в сроке беременности 8−12 недель, помещали в раствор Хенкса с антибиотиками: пенициллином (500 ЕД/мл), гентамицином (100 мкг/мл) и нистатином (400 ЕД/мл). Кожно-мышечные ткани отмывали от сгустков крови и помещали на 30 мин. в чашку Петри с раствором Хенкса, содержащим антибиотики в высокой концентрации: пенициллин — 5000 ЕД/мл, гентамицин — 500 мкг/мл, нистатин — 2000 ЕД/мл. Отпрепарированный материал измельчали ножницами до получения гомогенной массы, заливали 0,25% раствором трипсина в соотношении объемов материала и раствора 1:5 и оставляли на 18 часов при 4 °C. После окончания инкубации материал отмывали раствором Хенкса и суспендировали его энергичным встряхиванием в среде Игла. Полученную клеточную суспензию центрифугировали в течение 30−40 сек. при 3000 об./мин. для осаждения слизи (при этом клетки оставались во взвеси), после чего разводили ее средой Игла до концентрации 300−400 тыс. клеток/мл и добавляли сыворотку крупного рогатого скота (10% от объема среды), а также антибиотики: пенициллин — 100 ЕД/мл, гентамицин — 20 мкг/мл и нистатин — 40 ЕД/мл.

Фибробласты выращивали в монослое в культуральных флаконах.

2.3. Перевиваемые клеточные культуры.

Перевиваемые клеточные культуры RD (клетки рабдомиосаркомы человека), JI-41 КД/84 (дериват линии J-96, полученной из клеток крови больного острым моноцитарным лейкозом), НЕр-2 (клетки карциномы гортани человека) и BGM (клетки почки африканской зеленой мартышки) получены из вирусологической лаборатории ФГУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Свердловской области».

Клетки выращивали в монослое в пластиковых культуральных флаконах (Corning-Costar) при 37 °C. Для культивирования клеток RD использовали смесь питательных сред Игла (MEM с двойным набором аминокислот и витаминов) и RPMI-1640 с добавлением 5% эмбриональной телячьей сыворотки (производство HyClone) или 10% коровьей сыворотки. Клеточный монослой снимали с пластика раствором Версена.

Клетки Л-41 и НЕр-2 выращивали на смеси сред Игла (MEM) и 199 с добавлением 5% эмбриональной телячьей или 10% коровьей сывороткиклетки BGM — на модифицированной по Дульбекко минимальной среде Игла (DMEM), содержащей 10% сыворотки теленка. Клетки Л-41, НЕр-2 и BGM снимали с пластика смесью растворов Версена и трипсина в соотношении 1:1.

В среды роста для перевиваемых клеточных культур добавляли антибиотики в той же концентрации, что и для первичной культуры ФЭЧ.

При пересевах суспензию клеток разводили питательной средой в 3−4 раза (культура RD) или в 5−6 раз (остальные клеточные культуры) по сравнению с исходным объемом среды.

В качестве среды поддержания во всех случаях использовали основную среду Игла с антибиотиками, но без добавления сыворотки.

2.4. Адаптация вируса к новой клеточной культуре методом неразведенных пассажей.

Клеточный монослой в культуральном флаконе заражали 200 мкл вируссодержащей жидкости и инкубировали его при 37 °C до полной дегенерации клеток. Последующие пассажи проводили по той же схеме инокуляцией материала предыдущего пассажа в новый флакон с клеточным монослоем. Изучение свойств адаптированного вируса осуществляли после 10−12 последовательных пассажей.

2.5. Культивирование вируса ECHOll в бластных клетках, выделенных из крови больного острым миелоидным лейкозом.

Для культивирования вируса использовали бластные клетки, выделенные из крови больного OMJI без созревания (Ml) после лейкафереза. Примесь эритроцитов из лейкоконцентрата удаляли центрифугированием в растворе фиколл-урографина (р= 1,077 г/мл) при 1500 о б./мин. в течение 15 мин. (соотношение объемов раствора и клеток 4:1). Клетки, оставшиеся над слоем фиколл-урографина, собирали пипеткой, двукратно отмывали раствором Эрла и ресуспендировали в смеси сред Игла и RPMI-1640 с добавлением 10% коровьей сыворотки, доводя до концентрации 150 тыс. клеток/мл среды. Полученную клеточную суспензию разливали в культуральные флаконы по 4 мл иинфицировали ее 100 мкл фотосенсибилизированного вируса (множественность заражения — около 100 БОЕ/клетку). Флаконы с клетками инкубировали при 37 °C в течение 120 часов, после чего засвечивали их лампой накаливания в течение 20 мин. для инактивации остатков фотосенсибилизированного вируса. Инфекционную активность полученного вирусного урожая определяли на той же клеточной культуре, к которой был адаптирован использованный для заражения бластных клеток вирус.

Для контроля полноты фотоинактивации вируса 100 мкл исходного препарата, использованного для заражения клеток, разводили во флаконе с 4 мл среды Игла. Содержимое флакона подвергали воздействию света и определяли его остаточную инфекционную активность.

Выживаемость клеток в питательной среде оценивали с использованием трипанового синего, смешивая равные объемы клеточной суспензии и 0,1% раствора красителя. После инкубации смеси при комнатной температуре в течение 10 мин. подсчитывали процент окрашенных клеток в камере Горяева. Непосредственно после очистки лейкоцитарной массы от эритроцитов доля погибших клеток составляла около 5%- при инкубации при.

37 °C в незараженном вирусом контроле выживаемость клеток через 72 часа составила 80%, а через 120 часов — 50%.

2.6. Постановка реакции бляшкообразования и клонирование вируса.

Для постановки реакции бляшкообразования (РБО) использовали плотный клеточный монослой в пластиковом культуральном флаконе (площадь 25см). После удаления среды роста клетки заражали соответствующим разведением вируссодержащей жидкости в объеме 200 мкл и инкубировали их при 20 °C в течение 40мин. По завершении инкубации из флакона удаляли инокулятклеточный монослой двукратно отмывали раствором Эрла и наносили на него питательное агаровое покрытие в объеме 10 мл.

Для приготовления питательного агарового покрытия использовали модифицированную пропись [54]. На 100 мл покрытия непосредственно перед использованием готовили два раствора следующего состава: Раствор А:

Бидистиллированная вода — 28,5 мл.

10-кратный концентрат раствора Эрла без фенолового красного- 10 мл (использование смеси этого ингредиента с 10-кратным концентратом среды 199 в объемном соотношении 2:1 позволяло продлить время, в течение которого клетки сохраняли жизнеспособность под агаровым покрытием) Сыворотка эмбриональная телячья — 5 мл Раствор ЗМ хлорида магния — 1 мл Раствор 3% глутамина- 1 мл Раствор 0,1% нейтрального красного- 1,5 мл Раствор 7,5% гидрокарбоната натрия — 1,2 мл Раствор бензилпенициллина 100 000 ЕД/мл — 100 мкл Раствор гентамицина сульфата 40 мг/мл — 50 мкл Спиртовый раствор нистатина 200 000 ЕД/мл — 25 мкл.

Раствор Б:

Бидистиллированная вода — 50 мл.

Агар Difco — 0,9 г.

Раствор Б нагревали до 100 °C на водяной бане в течение часа и добавляли к нему 40 мг протамина сульфата, растворенного в небольшом объеме горячей воды. Охладив раствор Б до 42 °C, его смешивали с раствором А, при температуре смеси 38 °C ее наносили на клеточный монослой. После застывания агара культуральные флаконы переворачивали вверх монослоем и инкубировали в темноте при 37 °C. Подсчет количества бляшек проводили через 72 часа.

Для выделения вирусных клонов использовали бляшки, отстоящие от соседних не менее чем на 20 мм. Небольшую пробу агара из центра бляшки отбирали пастеровской пипеткой с изогнутым концом, после чего взятый образец растворяли в 1 мл среды Игла.

2.7. Получение фотосенсибилизированного вируса.

Репродукция вируса в среде поддержания с добавлением нейтрального красного сопровождается включением в капсид молекул красителя. Под воздействием видимой части спектра света в сенсибилизированных вирусных частицах происходит разрушение РНК, вследствие чего они утрачивают инфекционность. После проникновения нуклеиновой кислоты в цитозоль клетки происходит отделение от нее красителя, в результате чего вирус становится нечувствительным к свету. Таким образом, утрата фотосенсибилизированным вирусом (ФСВ) светочувствительности свидетельствует о том, что вирусная РНК находится внутри клетки и, соответственно, является сигналом окончания интернализации [76].

Для получения ФСВ клеточный монослой заражали исходным вирусным материалом в объеме 200 мкл (титр 105 БОЕ/мл). После 30-минутной адсорбции при 20 °C клетки отмывали от несвязавшегося вируса, добавляли среду поддержания, содержащую 0,001% нейтрального красного.

ICN Pharmaceuticals, Inc.), и инкубировали при 37 °C в темноте до полной дегенерации монослоя. Для проведения экспериментов использовали вирус после двух пассажей на среде с нейтральным красным. Полученный ФСВ хранили во флаконе с непрозрачными стенками, все манипуляции с ним проводили при очень слабом освещении.

Светочувствительность ФСВ оценивали методом конечных разведений, используя его десятикратные разведения для заражения флаконов с клеточным монослоем. После инкубации при 20 °C в течение 30 мин. монослой отмывали раствором Эрла от неадсорбировавшегося вирусафлаконы подвергали засветке (контрольные оставляли в темноте) и переносили их в термостат (37°С) на 72 часа. Для фотоинактивации вируса использовали лампу накаливания мощностью 100 Вт, время засветки составляло 20 мин., расстояние между лампой и флаконами — около 50 см. Светочувствительность вируса оценивали, сравнивая показатели его ТЦД5о в контрольных «незасвеченных» и подвергшихся воздействию света флаконах. Титр ФСВ после «засветки» уменьшался на 3 порядка. Приблизительно такого же уровня фотоинактивации (в 300−400 раз) удалось ранее добиться Huang et al. [76] в работе с использованием фотосенсибилизированного полиовируса. Таким образом, ФСВ, не инактивировавшийся светом, давал погрешность менее 1% и потому не оказывал заметного влияния на результаты описанных в диссертации экспериментов.

2.8. Оценка гемагглютинирующей активности вируса.

Гемагглютинирующую активность вируса определяли микрометодом [7, 9, 13] с использованием последовательных двукратных разведений вируссодержащей жидкости в 50 мкл раствора Эрла, содержащего 0,05% человеческого сывороточного альбумина. К разведениям вируса добавляли по 50 мкл 1% взвеси эритроцитов человека. Планшеты инкубировали при 4 °C в течение часа, после чего учитывали результат реакции. ГА активность вируса выражали в гемагглютинирующих единицах (ГАЕ).

2.9. Оценка инфекционной активности вируса.

Инфекционную активность вируса оценивали методом конечных разведений, определяя величину 50% тканевой цитопатогенной дозы (ТЦД50) в 1 мл вируссодержащей жидкости, а также в РБО (в этом случае концентрацию вируса выражали в количестве бляшкообразующих единиц, содержащихся в 1мл вируссодержащей жидкости, БОЕ/мл).

Последовательные десятикратные разведения исследуемой вируссодержащей жидкости готовили в лунках пластмассового планшета, содержащих по 0,9 мл среды Игла. В первую лунку вносили 100 мкл титруемого материала и, сменив наконечник дозатора, тщательно перемешивали ее содержимое, после чего 100 мкл десятикратно разведенной вируссодержащей жидкости переносили в следующую лунку. Процедуру повторяли до получения необходимого разведения вируса.

При титровании методом конечных разведений в культуральные флаконы с клеточным монослоем вносили по 100 мкл предварительно приготовленных разведений вируса от 10″ 1 до 10″ 9 (не менее 4 флаконов для каждого разведения). Флаконы с инфицированными клетками помещали в термостат и инкубировали при 37 °C. Результат реакции учитывали на 5 день по деструкции монослоя. ТЦД5о вируса в исходном препарате вычисляли по методу Рида-Менча [9].

Инфекционную активность в РБО определяли по формуле: 10 г 1=Х.

V ' где I — инфекционная активность вируса в исходном препарате (БОЕ/мл) — X — среднее количество бляшек в флаконахV — объем инокулята (мл), использованного для заражения клетокi — показатель степени разведения исходного препарата.

Для вычисления инфекционной активности одного вирусного препарата РБО проводили минимум в четырех флаконах с клеточным монослоем, при этом общее число подсчитанных бляшек составляло не менее 80.

2.10. Оценка уровня адсорбции вируса ЕСНОП на клеточной мембране.

Клеточный монослой снимали с пластика культурального флакона раствором Версена (без добавления трипсина). Клетки (около 8млн.) осаждали центрифугированием, однократно отмывали раствором Эрла и суспендировали в 0,5 мл исследуемой вируссодержащей жидкости. Полученную взвесь инкубировали при 4 °C в течение часа, периодически ее встряхивая, затем клетки осаждали центрифугированием и определяли остаточную • инфекционную активность надосадочной жидкости. Сопоставление инфекционной активности вируса до и после инкубации с клетками позволяло оценить уровень его адсорбции на исследуемой клеточной культуре.

2.11. Оценка скорости интернализации вируса.

Оценку скорости интернализации адсорбированного на поверхности клеток вируса осуществляли с использованием фотосенсибилизированных клонов в модифицированном варианте РБО. В культуральные флаконы с клеточным монослоем вносили ФСВ в соответствующем разведении и выдерживали их при 20 °C в течение 40 мин. После отмывания клеток от несвязавшегося вируса раствором Эрла флаконы разделяли на партии (не менее трех флаконов в каждой) и помещали их в термостат (температура 37°С). Флаконы, используемые для оценки. полноты фотоинактивации вируса, оставляли при 20 °C. Через определенные интервалы времени (20 мин., 45 мин., 60 мин. и 90 мин.) очередную партию флаконов извлекали из термостата и оставляли в темноте при 20 °C. После извлечения из термостата последней партии все флаконы одновременно засвечивали лампой накаливания в течение 20 мин. Вирусные частицы, проникшие в клетку за время инкубации при 37 °C, утрачивали светочувствительность вследствие отделения в цитозоле красителя от РНК, в то время как не завершившие интернализацию частицы инактивировались светом. После нанесения на клетки агарового покрытия флаконы вновь переносили в термостат и выдерживали в течение 72 часов до формирования бляшек. Контрольные флаконы, используемые для подсчета количества бляшек, формирующихся на незасвеченном монослое, не подвергали воздействию света. Сравнение количества бляшек, образовавшихся в «засвеченных» культуральных флаконах, и в контрольных, не подвергшихся воздействию света, позволяло оценить долю вирусных частиц, проникающих в клетку за время инкубации при 37 °C до момента фотоинактивации вируса.

2.12. Определение доли вирусных частиц, утрачивающих инфекционность после адсорбции на клетках.

В пластиковый культуральный флакон с клеточным монослоем (площадь монослоя 25 см", около 2,5 млн. клеток) вносили 1 мл вируссодержащей жидкости. Адсорбцию вируса на клетках проводили при 20 °C в течение 40 мин., после чего клеточный монослой трехкратно отмывали раствором Эрла.

Флаконы с адсорбированным на клетках вирусом переносили в термостат и выдерживали при 37 °C в течение 60 мин.- контрольные флаконы продолжали инкубировать при прежней температуре 20 °C. После завершения инкубации клетки соскабливали с пластика и ресуспендировали в 0,9 мл среды Игла, для увеличения степени дисперсности клеточную взвесь многократно перемешивали, набирая ее в пипетку и выпуская обратно. К полученной суспензии добавляли 100 мкл 0,25% раствора дезоксихолата натрия и инкубировали ее при 20 °C в течение 30 мин. при постоянном энергичном перемешивании для предотвращения образования клеточных конгломератов. По окончании инкубации клеточный детрит удаляли центрифугированием. Сравнение инфекционной активности элюата в контроле (20°С) и после инкубации при 37 °C позволяло определить долю вирусных частиц, не подвергающихся интернализации после адсорбции на мембране клеток.

2.13. Секвенирование генома вируса ECHOll.

Выделение вирусной РНК проводили методом сорбции на силикагеле с помощью комплекта реагентов «РИБО-сорб» (ЦНИИ Эпидемиологии, Москва). Для проведения обратной транскрипции использовали набор «PEBEPTA-L-100» того же производителя.

Структурную часть генома (около 3 тыс. оснований, кодирующих белки вирусного капсида VP1 — VP4) амплифицировали методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в виде шести перекрывающихся сегментов. Праймерные последовательности были подобраны с использованием полных нуклеотидных последовательностей генома вируса ECHOll из GenBank (AY167103, AY167104, AY167105, AY167106, AJ276224, AJ577589, AJ577590, AJ577594, Х80 059, DQ092796) с учетом высококонсервативных участков (табл. 2).

Для проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) готовили реакционную смесь, включающую следующие компоненты: 2 ед. ДНК-полимеразы («ДиаТак», ЦНИИ эпидемиологии, Москва), 0,2 шМ смеси dNTP, по 15 рМ каждого из двух праймеров, реакционный буфер (67 шМ Трис-НС1, рН 8,3, 2,5 шМ MgCb). ПЦР проводили в следующем режиме: 1-й цикл -95°С — 3 минуты- 42 цикла — 95 °C — 10 секунд, 48 °C — 10 секунд, 72 °C — 40 секундзаключительный цикл — 72 °C — 5 минут.

Анализ продуктов амплификации осуществляли методом электрофореза в 2% агарозном геле с последующим окрашиванием бромистым этидием (0,5 мг/мл) и детекцией в ультрафиолетовом трансиллюминаторе.

Секвенирование ДНК проводили на автоматическом генетическом анализаторе ABI Prism 310 (Applied Biosystems, США) с использованием реакционной смеси ABI Prism BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit v.3.0 (Applied Biosystems, США) по прямой (праймеры IS, 2S, 3S, 4S, 5S, 6S) и обратной (праймеры 1A, 2A, ЗА, 4A, 5A, 6A) последовательностям.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , Э.И. Этиология серозного менингита (по материалам г. Омска) Текст. / Э. И. Архангельская, Т. Г. Змейкова, С. Ф. Скубенко // Вирусные инфекции: Респ. сб. научн. трудов — Свердловск: СНИИВИ, 1991- С.48−50.
  2. , И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях Текст. / И. П. Ашмарин, А. А. Воробьев Л.: Медгиз, 1962.-180 с.
  3. , М.К. Энтеровирусные инфекции человека Текст. / М.К. Ворошилова-М.: Медицина, 1979.-360 с.
  4. , М.Я. Справочник по элементарной математике Текст. / М.Я. Выгодский-М.: Наука, 1979.-335 с.
  5. , Ю.З. Генетика вирусов человека и животных Текст. / Ю. З. Гендон.- М.: Наука, 1967, — 356 с.
  6. С.А. Медико-биологическая статистика Текст. / С. А. Гланц, -М.: Практика, 1999. — 459 с.
  7. , А.А. К методике выявления гемагглютинирующей активности энтеровирусов Текст. / А. А Егоров, Н. В. Амбарцумова // Микробиол. ж.- 1989.- Т.51, № 4.- С. 95−97.
  8. В.И. Изучение и оценка генетических признаков штаммов вируса полиомиелита, выделенных в период применения живой полиомиелитной вакцины Текст.: автореферат дисс.. канд. мед. наук.: 03.00.06 /В.И. Злобин Свердловск, 1976.-26 с.
  9. , А.Ф. Руководство по практической вирусологии Текст. / А. Ф. Карышева, В.Н. Сюрин-Кишинев: Штиинца, 1980.-212 с.
  10. , Г. Ф. Биометрия: учеб. пособие для биол. спец. вузов Текст. / Г. Ф. Лакин-М.: Высш. шк., 1990.-352 с.
  11. , В.А. О статистической оценке результатов титрования инфекционности некоторых вирусов методом бляшек Текст. / В.А.
  12. , Г. Х. Кодкинд, А.А. Мискин // Вопр. Виру со л, — 1980 № 5 — С. 563−566.
  13. , А.В. Генетический анализ гемагглютинирующих свойств энтеровирусов (на модели вируса ECHO 11) Текст.: автореферат дисс.. канд. мед. наук: 03.00.06 / А.В. Новоселов-М., 1994.-23 с.
  14. Справочник по микробиологическим и вирусологическим методам исследования Текст. / под ред. М. О. Биргера М.: Медицина, 1982.— 464 с.
  15. A monoclonal antibody specific for the cellular receptor for the group В coxsackieviruses Text. / K.H. Hsu, K. Lonberg-Holm, B. Alstein, R.L. Crowell //J. Virol.- 1988.-Vol.62 (5).-P. 1647−1652.
  16. A novel cell entry pathway for DAF-using human enterovirus is dependent on lipid rafts Text. / A.D. Stuart, H.E. Eustace, T.A. McKee, T.D.K. Brown //J. Virol.- 2002.-Vol. 76 (18).-P. 9307−9332.
  17. Alexander, D.A. Sialic acid functions in enterovirus 70 binding and infection Text. / D.A. Alexander, K. Dimock .// J. Virol.- 2002.- Vol.76 (22).-P.l 1265−11 272.
  18. Baranowski, E. Evolution of cell recognition by viruses Text. / E. Baranowski, C.M. Ruiz-Jarabo, E. Domingo // Science 2001 — Vol.292.-P. 1102−1105.
  19. Binding to decay-accelerating factor is not required for infection of human leukocyte cell lines by enterovirus 70 Text. / A. Haddad, M.R. Nokhbeh, D.A. Alexander, S J. Dawe, C. Grise, N. Gulzar, K. Dimock // J. Virol -2004.-Vol.78 (6).-P.2674−2681.
  20. Bubeck, D. Cryo-electron microscopy reconstruction of a poliovirus-receptor-membrane complex Text. / D. Bubeck, D.J. Filman, J.M. Hogle // Nat. Struct. Mol. Biol.- 2005.- Vol.12 (7).-P.615−618.
  21. Canyon rim residues, including antigenic determinants, modulate serotype-specific binding of polioviruses to mutants of the poliovirus receptor Text. / J. Harber, G. Bernhardt, H.H. Lu, J.Y. Sqro, E. Wimmer. // Virology.-1995.- Vol.214 (2).-P.559−570.
  22. Cardiovirulent coxsackieviruses and the decay-accelerating factor (CD55) receptor Text. / T.A. Martino, M. Petric, M. Brown, K. Aitken, C. Gauntt, C.D. Richardson, L.H. Chow, P.P. Liu // Virology.- 1998.- Vol.244.- P. 302−314.
  23. Carson, S.D. Coxsackievirus and adenovirus receptor (CAR) binds immunoglobulins Text. / S.D. Carson, N.M. Chapman // Biochemistry — 2001.-Vol.40.-P. 14 324−14 329.
  24. Cell recognition and entry by rhino- and enteroviruses Text. / M.G. Rossmann, J. Bella, P.R. Kolatkar, Y. He, E. Wimmer, R.J. Kuhn, T.S. Baker // Virology.- 2000.- Vol.269.- P. 239−247.
  25. Characterization of a 100-kilodalton binding protein for the six serotypes of coxsackie В viruses Text. / U.R. de Verdugo, H.-S. Selinka, M. Huber, B. Kramer, J. Kellermann, P.H. Hofshneider, R. Kandolf// J. Virol.- 1995 -Vol. 69 (11).-P. 6751−6757.
  26. Characterization of the echovirus 7 receptor: domains of CD55 critical for virus binding Text. / N.A. Clarkson, R. Kaufman, D.M. Lublin, T. Ward, P.A. Pipkin, P.D. Minor, D.J. Evans, J.W. Almond // J. Virol.- 1995, — Vol. 69 (9).-P. 5497−5501.
  27. Chothia, C. The molecular structure of cell adhesion molecules Text. / C. Chothia, E.Y. Jones // Annu. Rev. Biochem.- Vol.66.- P. 823−862.
  28. Cohen, C.J. The coxsackievirus and adenovirus receptor is a transmembrane component of the tight junction Text. / C.J. Cohen // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.-2001.-Vol.98.-P. 15 191−15 196.
  29. Colston, E.M. Poliovirus variants selected on mutant receptor-expressing cells identify capsid residues that expand receptor recognition Text. / E.M. Colston, V.R. Racaniello // J. Virol.- 1995.- Vol.69 (8).- P.4823−4829.
  30. Colston, E.M. Soluble receptor-resistant poliovirus mutants identify surface and internal capsid residues that control interaction with the cell receptor Text. / E. Colston, V.R. Racaniello // EMBO J.- 1994.- Vol.13.- P. 58 555 862.
  31. Comparative analysis of virus-host interactions of hemagglutinating and non-hemagglutinating strains of Coxsackievirus B3 Text. / A. Pasch, J.-H.Kiipper, A. Wolde, R. Kandolf, H.-C. Selinka // J.Gen.Virol.- 1999.-Vol.80 P.3153−3158.
  32. Complexes of poliovirus serotypes with their common cellular receptor, CD 155 Text. / Y. He, S. Mueller, P.R. Chipman, C.M. Bator, X. Peng, V.D. Bowman, S. Mukhopadhyay, E. Wimmer // J. Virol.- 2003.- Vol.77 (8).- P. 4827−4835.
  33. Coxsackie В viruses that use human DAF as a receptor infect pig cells via pig CAR and do not use pig DAF Text. / O.B. Spiller, I.G. Goodfellow, D.J. Evans, SJ. Hinchliffe, B.P. Morgan // J. Gen. Virol.- 2002.- Vol.83.-P. 45−52.
  34. Coxsackievirus A21 binds to decay-accelerating factor but requires intercellular adhesion molecule 1 for cell entry Text. / D.R. Shafren, D.J. Dorahy, R.A. Ingham, G.F. Burns, R.D. Barry // J. Virol.- 1997.- Vol.71 (6).-P.473 6−4743.
  35. Coxsackievirus B3 adapted to growth in RD cells binds to decay-accelerating factor (CD55) Text. / J.M. Bergelson, J.G. Mohanty, R.L. Crowell, N.F. St. John, D.M. Lublin, R.W. Finberg // J. Virol. 1995.-Vol.69 (3).-P. 1903−1906.
  36. Coxsackieviruses Bl, B3 and B5 use decay-accelerating factor as a receptor for cell attachment Text. / D.R. Shafren, R.C. Bates, M.V. Agrez, R.L. Herd, G.F. Burns, R.D. Barry // J. Virol.- 1995.- Vol. 69 (6).- P. 38 733 877.
  37. Crowell, R.L. Specific alterations of coxsackievirus B3 eluted from HeLa cells Text. / R.L. Crowell, L. Philipson // J. Virol.- 1971.- Vol.8.- P. 509 515.
  38. Curry, S. The poliovirus 135S particle is infectious Text. / S. Curry, M. Chow, J.M. Hogle //J. Virol.- 1996.-Vol.70 (10).-P. 7125−7131.
  39. Decay-accelerating factor CD55 is identified as the receptor for echovirus 7 using CELICS, a rapid immuno-focal cloning method Text. / T. Ward, P.A. Pipkin, N.A. Clarkson, D.M. Stone, P.D. Minor, J.W. Almond // EMBO J.-1994.-Vol.13.-P. 5070−5074.
  40. Distinct cellular receptor interactions in poliovirus and rhinoviruses Text. / L. Xing, K. Tjarnlund, B. Lindqvist, G.G. Kaplan, D. Feigelstock, R.H. Cheng, J.M. Casanovas // EMBOJ.- 2000.-Vol.19 (6).-P. 1207−1216.
  41. Domingo, E. Quasispecies and the implications for virus persistence and escape Text. / E. Domingo // Clin. Diagn. Virol.- 1998.- Vol.10.- P. 97 101.
  42. Domingo, E. RNA virus mutations and fitness for survival Text. / E. Domingo, J.J. Holland // Annu. Rev. Microbiol.- 1997, — Vol.51.- P. 151 178.
  43. Dove, A.W. Cold-adapted poliovirus mutants bypass a postentry replication block Text. / A.W. Dove, V.R. Racaniello // J. Virol.- 1997.- Vol.71 (6).-P. 4728−4735.
  44. Dulbecco R. Plaque formation and isolation of pure lines with poliomyelitis viruses Text. / R. Dulbecco, M. Vogt // J. Exp. Med.- 1954.- V.99.- P. 167 182.
  45. Dulbecco R. A study of the basic aspects of neutralization of two animal viruses, Western equine encephalitis virus and poliomyelitis virus Text. / R. Dulbecco, M. Vogt, A.G.R. Strickland // Virology.- 1956.- V.2.- P. 162 205.
  46. Echovirus 1 interaction with the human very late antigen-2 (integrin a2Pi) I domain Text. / S.L. King, T. Kamata, J.A. Cunningham, J. Emsley, R.C. Liddington, Y. Takada, J.M. Bergelson // J. Biol. Chem.- 1997.- Vol.272 (45).- P.28 518−28 522.
  47. Echovirus infection of rhabdomyosarcoma cells is inhibited by antiserum to the complement control protein CD59 Text. / I.G. Goodfellow, R.M. Powell, T. Ward, O.B. Spiller, J.W. Almond, D.J. Evans // J. Gen.Virol.-2000.- Vol.81.- P.1393−1401.
  48. Echoviruses bind heparan sulfate at the cell surface Text. / I.G. Goodfellow, A.B. Sioofy, R.M. Powell, D.J. Evans // J. Virol.- 2001.-Vol.75(10).-P.4918−4921.
  49. Enhanced cellular receptor usage by a bioselected variant of coxsackievirus A21 Text. / E.S. Johansson, L. Xing, R.H. Cheng, D.R. Shafren // J. Virol.-2004.- Vol.78 (22).-P. 12 603−12 612.
  50. Enterovirus receptor and virus replication in human leukocytes Text. / T. Vuorinen, R. Vainionpaa, J. Heino, T. Hyypia // J. Gen. Virol 1999 — Vol. 80.-P. 921−927.
  51. Entry of poliovirus type 1 and mouse Elberfeld (ME) virus into HEp-2 cells: receptor-mediated endocytosis and endosomal or lysosomal uncoating Text. / H. Zeinhhardt, K. Wetz, P. Willingmann, K.O. Habermehl // J. Gen. Virol.-Vol.66.-P. 483−492.
  52. Evans, D.J. Cell receptors for picornaviruses as determinants of cell tropism and pathogenesis Text. / D.J. Evans, J.W. Almond // Trends in microbiology.- 1998.-Vol.6 (5).-P. 198−202.
  53. Evolution of fitness in experimental populations of vesicular stomatitis virus Text. / S.F. Elena, F. Gonzalez-Candelas, I.S. Novella, E.A. Duarte, D.K. Clarke, E. Domingo, J.J. Holland, A. Moya // Genetics 1996.- Vol.142 (3).-P. 673−679.
  54. Fatty acid-depleted albumin induces the formation of echovirus A particles Text. / T. Ward, R.M. Powell, Y. Chaudhry, J. Meredith, J.W. Almond, W. Kraus, B. Nelsen-Salz, H.J. Eggers, D.J. Evans // J. Virol 2000.- Vol.74 (7).-P. 3410−3412.
  55. Freistadt, M.S. Mutational analysis of the cellular receptor for poliovirus Text. / M.S. Freistadt, V.R. Racaniello // J. Virol.- 1991.- V.65 (7). P. 3873−3876.
  56. Fricks, C.E. Cell-induced conformational change in poliovirus: externalization of the amino terminus of VP1 is responsible for liposome binding Text. / C.E. Fricks, J.M. Hogle // J. Virol.- 1990.- Vol. 64 (5).- P. 1934−1945.
  57. Frisk, G. Persistence of coxsackievirus B4 infection in rhabdomyosarcoma cells for 30 months Text. / G. Frisk, M.A. Lindberg, H. Oiderholm // Arch. Virol.- 1999.-Vol. 144.-P. 2239−2245.
  58. Genetic analysis of echovirus 11 variability in adsorption to human erythrocytes Text. / A.G. Sergeev, Novoselov A.V., Bubenschikov A.V., Kondrashova Z.N. //Arch. Virol.- 1994.- Vol.134 (2).-P.129−139.
  59. Goldfield, M. Hemagglutinins associated with certain human enteric viruses Text. / M. Goldfield, S. Srihongse, J.P. Fox // Proc. Soc. Exp. Biol. Med.-1957.- Vol.96.- P. 788−791.
  60. Heparan sulfate and coxsackievirus-adenovirus receptor: each one mediates coxsackievirus B3 PD infection Text. / A.E. Zautner, U. Korner, A. Henke, C. Badorff, M. Schmidtke // J. Virol.- 2003.-Vol.77 (18).-P. 10 071−10 077.
  61. Hogle, J.M. Poliovirus cell entry: common structural themes in viral cell entry pathways Text. / J.M. Hogle // Annu. Rev. Microbiol- 2002-Vol.56 P.677−702.
  62. Hogle, J.M. Three-dimensional structure of poliovirus at 2.9 A resolution Text. / J.M. Hogle, M. Chow, D.J. Filman // Science.- 1985.- Vol.229.- P. 1358−1365.
  63. Huang, Y. Is the 135S poliovirus particle an intermediate during cell entry? Text. / Y. Huang, J.M. Hogle, M. Chow // J. Virol.- 2000.- Vol. 74 (18).-P. 8757−8761.
  64. Identification of the integrin VLA-2 as a receptor for echovirus 1 Text. / J.M. Bergelson, M.P. Shepley, M.C. Chan, M.E. Hemler, R.W. Finberg // Science.- 1992.-Vol.275.-P. 1718−1720.
  65. In vitro activity of pirodavir (R 77 975), a substituted phenoxy-pyridazinamine with broad-spectrum antipicornaviral activity Text. / K.
  66. Andries, В. Dewindt, J. Snoeks, R. Willebrords, K.V. Eemeren, R. Stokbroekx, P.A.J. Janssen // Antimicrobial agents and chemotherapy — 1992.-Vol.36 (1).-P. 100−107.
  67. In vitro and in vivo activities of WIN 54 954, a new broad-spectrum antipicornavirus drug Text. / M.G. Woods, G.D. Diana, M.C. Rogge, M.J. Otto, F.J. Dutko, M.A. McKinlay // Antimicrobial agents and chemotherapy.- 1989.-Vol.33 (12).-P.2069−2074.
  68. Inhibition of coxsackie В infection by soluble forms of its receptors: binding affinities, altered particle formation, and competition with cellular receptors Text. / I.G. Goodfellow, D.J. Evans, A.M. Blom, D. Kerrigan, J.S. Miners,
  69. B.P. Morgan, O.B. Spiller // J. Virol.-2005.-Vol.79 (18).-P.12 016−12 024.
  70. Integrin avp6 is an RGD-dependent receptor for coxsackievirus A9 Text. /
  71. C.H. Williams, T. Kajander, T. Hyypia, T. Jackson, D. Sheppard, G. Stanway // J. Virol.- 2004.- Vol.78 (13).- P.6967−6973.
  72. Interaction of coxsackievirus A21 with its cellular receptor, ICAM-1 Text. / C. Xiao, C.M. Bator, V.D. Bowman, E. Rieder, Y. He, B. Hebert, J. Bella, T.S. Baker, E. Wimmer, R.J. Kuhn, M.G. Rossman // J. Virol 2001 -Vol.75 (5).-P. 2444−2451.
  73. Interaction of poliovirus with its purified receptor and conformation alteration in the virion Text. / M. Arita, S. Koike, J. Aoki, H. Horie, A. Nomoto // J. Virol.- 1998.- Vol.72 (5).- P. 3578−3586.
  74. Interaction of the poliovirus receptor with poliovirus Text. / Y. He, V.D. Bowman, St. Mueller, C.M. Bator, J. Bella, X. Peng, T.S. Baker, E. Wimmer, RJ. Kuhn, M.G. Rossmann // Proc. Natl. Acad. Sci. USA-2000.-Vol.97 (l).-P. 79−84.
  75. Involvement of p2-microglobulin and integrin avp3 molecules in the coxsackievirus A9 infectious cycle Text. / M. Triantafilou, K. Triantafilou, K.M. Wilson, Y. Takada, N. Fernandez, G. Stanway // J. Gen. Virol.-1999.- Vol.80.- P.2591−2600.
  76. Isolation and molecular characterization of a poliovirus type 1 mutant that replicates in the spinal cord of mice Text. / Q. Jia, S. Ohka, K. Iwasaki, K. Tohyama, A. Nomoto // J. Virol.- 1999.- Vol.73 (7).- P.6041−6047.
  77. Johnson, K.M. Separation of hemagglutinating and non-hemagglutinating variants of coxsackie A-21 virus Text. / K.M. Johnson, D.J. Lang // Proc. Soc. Exp. Biol. Med.- 1962.-Vol.110.-P.653−657.
  78. Kinetic analysis of the effect of poliovirus receptor on viral uncoating: the receptor as a catalyst Text. / S.K. Tsang, B.M. McDermott, V.R. Racaniello, J.M. Hogle // J. Virol.-2001.-Vol.75 (11).-P. 4984−4989.
  79. Kumar, S. MEGA3: Integrated software for molecular evolutionary genetics analysis and sequence alignment Text. / S. Kumar, К Tamura, M. Nei // Briefings in Bioinformatics. 2004. — Vol. 79. — P. 1707−1713.
  80. La Monica, N. Mapping of sequences required for mouse neurovirulence of poliovirus type 2 Lansing Text. / N. la Monica, C. Meriam, V.R. Racaniello //J. Virol.- 1986.-Vol.57 (2).- P.515−525.
  81. Lentz, T.L. Viral tropism and target cell receptors Text. / T.L. Lentz // Molecular mimicry in health and disease: Proc. 2nd Nord Insulin Symposium.-Amsterdam, 1988-P. 185−195.
  82. Liao, S. Allele-specific adaptation of poliovirus VP1 B-C loop variants to mutant cell receptors Text. / S. Liao, V.R. Racaniello // J. Virol 1997-Vol.71.- P. 9770−9777.
  83. Lonberg-Holm, K. Physical and metabolic requirements for early interaction of poliovirus and human rhinovirus with HeLa cells Text. / K. Lonberg-Holm, N.M. Whiteley // J. Virol.- 1976.- Vol.19 (3).- P. 857−870.
  84. Lublin, D.M. Decay-accelerating factor biochemistry, molecular biology, and function Text. / D.M. Lublin, J.P. Atkinson // Annu. Rev. Immunol.-1989.-Vol.7.-P. 35−58.
  85. Mapping CD55 function. The structure of two pathogen-binding domains at 1.7 A Text. / P. Williams, Y. Chaudhry, I.G. Goodfellow, J. Billington, R. Powell, O.B. Spiller, D.J. Evans, S. Lea // J. Biol. Chem.- 2003.- Vol.278-P. 10 691−10 696.
  86. Mapping of the RD phenotype of the Nancy strain of coxsackievirus B3 Text. / A.M. Lindberg, R.L. Crowell, R. Zell, R. Kandolf, U. Pettersson // Virus Res.- 1992.- V.24.-P. 187−196.
  87. Molecular evolution of the human enteroviruses: correlation of serotype with VP1 sequence and application to picornavirus classification Text. / M.S. Oberste, K. Maher, D.L. Kilpatrick, M.A. Pallansch // J. Virol.- 1999-Vol.73 (3).-P.1941−1948.
  88. Molecular tectonic model of vims structural transitions: the putative cell entry states of poliovirus Text. / D.M. Belnap, D.J. Filman, B.L. Trus, N. Cheng, F.P. Booy, J.F. Conway, St. Curry, C.N. Hiremath // J. Virol-2000.- Vol.74 (3).-P.1342−1354.
  89. Molecular typing of enteroviruses: current status and future requirements Text. / P. Muir, U. Kammerer, K. Korn, M.N. Mulders, Т. Poyry, B. Weissbrich, R. Kandolf, G.M. Cleator, A.M. van Loon // Clin. Microbiol. Rev.- 1998.-Vol.11 (l).-P. 202−227.
  90. Mouse adaptation determinants of poliovirus type 1 enhance viral uncoating Text. / T. Couderc, F. Delpeyroux, H. le Blay, F. Horaud, B. Blondel // J. Virol.- 1996.- Vol.70 (1).-P.305−312.
  91. Mouse cells expressing human intercellular adhesion molecule-1 are susceptible to infection by coxsackievirus A21 Text. / D.R. Shafren, D.J. Dorahy, S.J. Greive, G.F. Burns, R.D. Barry // J. Virol.- 1997.- Vol.71 (1).-P.785−789.
  92. Nelsen-Salz, B. Integrin ауРз (vitronectin receptor) is a candidate receptor for the virulent echovirus 9 strain Barty Text. / B. Nelsen-Salz, H.J. Eggers, H. Zimmermann//J. Gen. Virol.- 1999.- Vol.80.-P.2311−2313.
  93. Newcombe, N.G. Cellular receptor interactions of C-cluster human group A coxsackieviruses Text. / N.G. Newcombe, P. Andersson, E. S Johansson // J. Gen. Virol.- 2003.- Vol.84.- P.3041−3050.
  94. Newcombe, N.G. Enterovirus capsid interactions with decay-accelerating factor mediate lytic infection Text. / N.G. Newcombe, E.S. Johansson, G. Au//J. Virol.- 2004.- Vol.78 (3).-P. 1431−1439.
  95. Nichols, B.J. Endocytosis without clathrin coats Text. / B.J. Nichols, J. Lippincott-Schwartz // Trends in Cell Biol.- 2001.- Vol.11.- P. 406−412.
  96. Nicholson-Weller, A. Structure and function of decay-accelerating factor CD55 Text. / A. Nicholson-Weller, C.E. Wang // J. Lab. Clin. Med.-1994.-Vol. 123.-P. 485−491.
  97. Pathogenesis of coxsackievirus A9 in mice: role of the viral arginine-glycine-aspartic acid motif Text. / H. Harvala, H. Kalimo, G. Stanway, T. Hyypia // J. Gen. Virol.- 2003.- Vol.84.- P.2375−2379.
  98. Perez, L. Entry of poliovirus into cells does not require a low-pH step Text. / L. Perez, L. Carrsaco // J. Virol.- 1993.- Vol. 67 (8).- P. 4543−4548.
  99. Pulli, T. Cell-surface interactions of echovirus 22 Text. / T. Pulli, E. Koivunen, T. Hyypia // J. Biol. Chem.- 1997.- Vol.272 (34).- P.21 176−21 180.
  100. Racaniello, V.R. Early events in poliovirus infection: virus-receptor interactions Text. / V.R. Racaniello //Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1996-Vol.93.-P. 11 378−11 381.
  101. Razani, B. Caveolins and caveolae: molecular and functional relationships Text. / B. Razani, M.P. Lisanti // Experimental Cell Research.- 2001 -Vol.271.-P. 36−44.
  102. Reagan, K.J. Altered receptor specifity of Coxsackievirus B3 after growth in rhabdomyosarcoma cells Text. / K.J. Reagan, B. Goldberg, R.L. Crowell // J. Virol.- 1984.- V.49 (3).-P.635−640.
  103. Ren, R. Human poliovirus gene expression and poliovirus tissue tropism in transgenic mice Text. / R. Ren, V.R. Racaniello // J. Virol 1992-Vol.66 (l).-P. 296−304.
  104. Role for-microglobulin in echovirus infection of rhabdomyosarcoma cells Text. / T. Ward, R.M. Powell, P.A. Pipkin, D.J. Evans. P.D. Minor, J.W. Almond // J. Virol.- 1998.- Vol.72 (7).- P.5360−5365.
  105. Rossmann, M.G. Conservation of the putative receptor attachment site in' picornaviruses Text. / M.G. Rossmann, A.C. Palmenberg // Virology — 1988.-Vol.164.-P. 373−382.
  106. Rossmann, M.G. Picornavirus-receptor interactions Text. / M.G. Rossmann, Y. He, R.J. Kuhn // Trends in Microbiol.- 2002.- Vol.10 (7).- P. 324−331.
  107. Rossmann, M.G. The canyon hypothesis Text. / M.G. Rossmann // J. Biol. Chem.- 1989.-Vol.264 (25).-P. 14 587−14 590.
  108. Rossmann, M.G. Viral cell recognition and entry Text. / M.G. Rossmann // Protein Sci.- 1994.-Vol.3 .-P. 1712−1725.
  109. Sabin A.B. Present position of immunization against poliomyelitis with live virus vaccines Text. / A.B. Sabin // British Med. J.- 1959.- V. 5123.- P. 663−680.
  110. Schneider, W.L. Genetic diversity in RNA virus quasispecies is controlled by host-virus interactions Text. / W.L. Schneider, M.J. Roossinck // J. Virol.-2001.-Vol. 75 (14).-P. 6566−6571.
  111. Schneider-Schaulies J. Cellular receptors for viruses: links to tropism and pathogenesis Text. / J. Schneider-Schaulies // J. Gen. Virol- 2000.-Vol.81- P.1413−1429.
  112. Secrotory pathway function, but not cytoskeletal integrity, is required in poliovirus infection Text. / J. Doedens, L.A. Maynell, M.W. Klymlowsky, K. Kirkegaard//Arch. Virol. Suppl.- 1994.-Vol.9.-P. 159−172.
  113. Serum albumin inhibits echovirus uncoating Text. / T. Ward, R.M. Powell, D.J. Evans, J.W. Almond // J. Gen Virol.- 1999.- Vol. 80.- P. 283−290.
  114. Shafren, D.R. Viral cell entry induced by cross-linked decay-accelerating factor Text. / D.R. Shafren // J. Virol.- 1998.- Vol.72 (11).- P.9407−9412.
  115. Shin, J.-S. Caveolae as portals of entry for microbes Text. / J.-S. Shin, S.N. Abraham // Microbes and infection.- 2001.- Vol.3.- P. 755−761.
  116. Short consensus repeat domain 1 of decay-accelerating factor is required for enterovirus 70 binding Text. / T.M. Karnauchow, S. Dawe, D.M. Lublin, K. Dimock//J. Virol.- 1998.-Vol.72 (11).-P.9380−9383.
  117. Sialidase-sensitive erythrocyte receptor for enterovirus type 70 Text. / E.T. Utagava, K. Miyamura, A. Mukoyama, R. Kono // J. Gen. Virol 1982-Vol.63.-P. 141−148.
  118. Steinhauer, D.A. Rapid evolution of RNA viruses Text. / D.A. Steinhauer, J.J. Holland // Annu. Rev. Microbiol.- 1987.- Vol. 41.- P. 409−433.
  119. Structural and functional insights into the interaction of echo viruses and decay-accelerating factor Text. / D.M. Pettigrew, D.T. Williams, D. Kerrigan, D.J. Evans, S.M. Lea, D. Bhella // J. Biol. Chem. 2006. -Vol.281 (8).-P. 5169−5177.
  120. Structural studies of two rhinovirus serotypes complexed with fragments of their cellular receptor Text. / P.R. Kolatkar, J. Bella, N.H. Olson, C.M. Bator, T.S. Baker,. M.G. Rossmann // EMBO J.- 1999.- Vol.18.- P. 62 496 259.
  121. Susceptibility of human bone marrow cells and hematopoietic cell lines to coxsackievirus B3 infection Text. / T. Vuorinen, R. Vainionpaa, F. Vanharanta, T. Hyypia// J. Virol.- 1996.- Vol.70 (12).-P. 9018−9023.
  122. The coxsackievirus A9 RGD motif is not essential for virus viability Text. / P.J. Hughes, C. Horsnell, T. Hyypia, G. Stanway // J. Virol.- 1995.- Vol.69 (12).-P. 8035−8040.
  123. The evolution of RNA viruses: a population genetics view Text. / A. Moya, S.F. Elena, A. Bracho, R. Miralles, E. Barrio // Proc. Natl. Acad. Sci. USA -2000.-Vol. 97 (13).- P.6967−6973.
  124. The HeLa cell receptor for enterovirus 70 is decay-accelerating factor (CD55) Text. / T.M. Karnauchow, D.L. Tolson, B.A. Harrison, E. Altman, D.M. Lublin, K. Dimock // J. Virol.- 1996.- Vol.70 (8).- P.5143−5152.
  125. The human poliovirus receptor related 2 protein is a new hematopoietic/endothelial homophilic adhesion molecule Text. / M. Lopez, M. Aoubala, F. Jordier, D. Isnardon, S. Gomez, P. Dubreuil // Blood-1998.-Vol.92 (12).- P.4602−4611.
  126. The murine CAR homolog is a receptor for coxsackie В viruses and adenoviruses Text. / J.M. Bergelson, A. Krithivas, L. Celi, G. Droguett, M.S. Horwitz, T. Wickham, R.L. Crowell, R.W. Finberg // 1998.- J. Virol.-Vol.72(l).-P. 415−419.
  127. The poliovirus receptor CD155 mediates cell-to-matrix contacts by specifically binding to vitronectin Text. / R. Lange, X. Peng, E. Wimmer, M. Lipp, G. Bernhardt//Virology.- 2001.-Vol. 218.-P. 218−227.
  128. Tomko, R.P. HCAR and mCAR: the human and mouse cellular receptors for subgroup С adenoviruses and group В coxsackieviruses Text. / R.P. Tomko, R. Xu, L. Philipson // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1997.- Vol.94.-P.3352−3356.
  129. Tosteson, M.T. Characterization of the ion channels formed by poliovirus in planar lipid membranes Text. / M.T. Tosteson, M. Chow // J. Virol— 1997.-Vol.71 (l).-P. 507−511.
  130. Transformation of a human poliovirus receptor gene into mouse cells Text. / C. Mendelsohn, B. Johnson, K.A. Lionetti, P. Nobis, E. Wimmer, V.R. Racaniello //Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 1986.-Vol.83.-P.7845−7849.
  131. Transgenic mice carrying the human poliovirus receptor: new animal model for study of poliovirus neurovirulence Text. / H. Horie, S. Koike, T. Kurata, Y. Sato-Yoshida, I. Ise, Y. Ota, S. Abe, K. Hioki // J. Virol.- 1994.- V.68 (2).-P. 681−688.
  132. Uptake of poliovirus into the endosomal system of HeLa cells Text. / P. Kronenberger, D. Schober, E. Prchla, O. Ofori-Anyinam, R. Vrijsen, B. Rombaut, D. Blaas, R. Fuchs, A. Boeye // Arch. Virol 1998.-Vol. 143-P. 1417−1424.
  133. Van der Goot, F.G. Raft membrane domains: from a liquid-ordered membrane phase to a site of pathogen attack Text. / F.G. Van der Goot, T. Harder // Seminars in immunology-2001 Vol.13 — P. 89−97.
  134. Wang, X. Coxsackievirus and adenovirus receptor cytoplasmatic and transmembrane domains are not essential for coxsackievirus and adenovirus infection Text. / X. Wang, J.M. Bergelson // J. Virol.- 1999.- Vol.73 (3).-P.2559−2562.
  135. Xing, L. Structural analysis of human rhino virus complexed with ICAM-1 reveals the dynamics of receptor-mediated virus uncoating Text. / L. Xing, J.M. Casasnovas, R.H. Cheng // J. Virol.- 2003.- Vol.77 (11).- P. 61 016 107.
  136. Yoshii, T. Replication of enterovirus 70 in non-primate cell cultures Text. / T. Yoshii, K. Natori, R. Kono // J. Gen. Virol.- 1977.- Vol.36 (3).- P.377−384.
  137. Zhang, S. Persistent echovirus infection of mouse cells expressing the viral receptor VLA-2 Text. / S. Zhang, V.R.Racaniello // Virology.- 1997.-Vol.235.-P. 293−301.штамм Gregory)
  138. Белок Последовательность нуклеотидов
  139. VP4 ATGGGAGCGC AAGTATCAAC ACAAAAGACC GGTGCGCATG AAACCGGCTT GAACGCCAGT GGTAGTTCTA ТААТССАСТА САССААСАТА AACTACTATA AAGATGCAGC ATCCAACTCG GCAAATAGGC AAGAATTTTC ACAAGACCCT GGTAAGTTCA CCGAACCAGT GAAGGATATC ATGGTGAAGT CACTACCTGC1. АСТТААС
  140. GTTTGAGGCT СТСААССТСА TTGCAA
  141. CTCACTATAG GTTGGTGCAG CAGGACGAGT ACACAAGCGC
  142. TGGCAATGTC ACATGCTGGT ATCAGACTGG AATAGTCGTC
  143. CCGGCGGGCA CTCCGACATC GTGCTCCATC ATGTGTTTTG
  144. TATCGGCATG CAATGATTTC TCTGTGAGAT TACTAAAGGA
  145. CACGCCATTT ATAGAACAAA CTGCAATACT GCAA
  146. VP1 GGTGATGTGG TAGAAGCTGT AGAGAACGCC GTTGCACGTG
  147. TGGCAGATAC AATTGGTAGT GGGCCGTCAA ATTCGCAAGC
  148. AGTGCCTGCT TTAACAGCAG TTGAGACAGG GCACACATCT
  149. CAGGTGACAC CCAGTGATAC CATGCAAACC AGGCATGTCA
  150. AGAACTACCA TTCCAGATCT GAGTCCAGCA TTGAAAACTT
  151. CCTCAGCAGA TCTGCCTGCG TTTATATGGG AGGATACTGC
  152. АСААССААСА CTGACCAGAC ААААТТАТТТ GCCTCATGGA
  153. CTATTAGTGC ACGACGCATG GTTCAAATGA GACGCAAGCT
  154. AGAGATCTTC ACTTACGTCC GTTTTGATGT GGAGGTGACT
  155. TTTGTGATTA CCAGCAAGCA GGACCAGGGC AACCGATTGG
  156. GCCAAGACAT GCCACCCCTG ACTCACCAGA TCATGTATAT
  157. CCCACCAGGG GGGCCCATTC CAAAGTCTGT CACTGACTAT
  158. GCATGGCAAA ССТССАССАА CCCCAGCATT TTCTGGACTG
  159. AGGGGAACGC GCCACCCAGA ATGTCTATCC CATTCATTAG
  160. CATTGGTAAC GCCTACAGTA ATTTTTACGA CGGGTGGTCT
  161. CACTTCTCGC AAAACGGGGT GTATGGCTAC ААСАСАСТСА
  162. ACCACATGGG ТСАААТТТАТ GTTAGACACG TGAATGGATC
  163. АТСАССАСТС CCTATGACTA GCACTGTTAG AATGTACCTC
  164. AAGCCGAAGC ATGTTAAAGC ATGGGTCCCG CGGCCTCCTA
  165. GGCTATGCCA ATACGAAAAT GCATCCACGG TGAACTTTAC
  166. АСССАСАААС GTCACCGACA AGCGAACCAG САТСААСТАС
  167. ATTCCTGAGA CGGTCAAACC AGACCTATCA ААСТАС
  168. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU443626.
  169. Аминокислотная последовательность структурных белков клона G3123штамм Gregory)1. Белок
  170. Аминокислотная последовательность1. VP4 MGAQVSTQKT ANRQEFSQDP1. GAHETGLNAS GKFTEPVKDI1. GSSIIHYTNI MVKSLPALN1. NYYKDAASNS
  171. VP2 SPSAEECGYS YLKDNEATAE KFPDALKDMG CLLVVCVPEA NGTNTVQTIV VMPYINNVPM ITVTVAPMCA
  172. DRVRSITLGN DQPTHPDVAT LFGQNMYYHY EMGCSQVDGT TNAGMGVGVG DNMFRHHNFT EYNGLRLSTS
  173. STITTQESAN CRFYTLESVT LGRAGYTLHV VNEHGLSEGE NLTIYPHQWI LMIIPFVPLD LQ
  174. VVVGYGRWPE WERDSPGWWW QCNASKFHQG TAKKFSSTST NLRTNNCATI YSSDSSTYVP
  175. VP3 GLPVMNTPGS QNLMEIAEVD QVFGFQVQPG CGSAMATGKF QSSCVLCVPW PAGTPTSCSI
  176. NQFLTSDDFQ SVVPVNNVEG LDSVFKHTLL LLAYAPPGAN ISQTHYRLVQ MCFVSACNDF
  177. SPSAMPQFDV KLDTMEVYRI GEILNYYAHW APKNRKDAML QDEYTSAGNV SVRLLKDTPF
  178. TPELNIPGEV PVQSGNHQSD SGSIKLTFVF GTHIIWDVGL TCWYQTGIVV IEQTAILQ
  179. УР1 GDVVEAVENA QVTPSDTMQT TTNTDQTKLF FVITSKQDQG AWQTSTNPSI HFSQNGVYGY KPKHVKAWVP IPETVKPDLS
  180. VARVADTIGS RHVKNYHSRS ASWTISARRM NRLGQDMPPL FWTEGNAPPR NTLNHMGQIY RPPRLCQYEN NY
  181. GPSNSQAVPA ESSIENFLSR VQMRRKLEIF THQIMYIPPG MSIPFISIGN VRHVNGSSPL ASTVNFTPTN
  182. AVETGHTS SACVYMGGYC TYVRFDVEVT GPIPKSVTDY AYSNFYDGWS PMTSTVRMYL VTDKRTSINYштамм Gregory)
  183. Белок Последовательность нуклеотидов
  184. VP4 ATGGGAGCGC AAGTATCAAC ACAAAAGAC С GGTGCGCATG
  185. AAACCGGCTT GAACGCCAGT GGTAGTTCTA TAATCCACTA
  186. САССААСАТА ААСТАСТАТА AAGATGCAGC ATCCAACTCG
  187. GCAAATAGGC AAGAATTTTC ACAAGACCCT GGTAAGTTCA
  188. CCGAACCAGT GAAGGATATC ATGGTGAAGT CACTACCTGC1. АСТТААС
  189. VP2 TCGCCGTCTG CTGAAGAGTG TGGGTACAGT GACAGAGTGC
  190. GATCCATAAC ACTAGGTAAC TCTACCATCA CAACACAAGA
  191. AAGTGCAAAT GTAGTAGTGG GGTATGGTCG ATGGCCTGAG
  192. TACCTGAAAG ACAATGAGGC CACTGCTGAA GATCAACCAA
  193. CCCACCCTGA TGTAGCAACA TGTAGGTTTT ACACCCTGGA
  194. ATCGGTCACG TGGGAAAGAG ATTCACCCGG GTGGTGGTGG
  195. AAATTCCCGG ACGCCCTAAA AGATATGGGG CTCTTCGGCC
  196. AAAACATGTA СТАССACTAT CTAGGAAGAG CCGGTTACAC
  197. ATTGCATGTA CAATGTAATG CATCTAAATT CCATCAGGGA
  198. TGCTTGCTAG TGGTCTGTGT ACCGGAAGCA GAGATGGGAT
  199. GCAGCCAAGT GGATGGTACT GTAAATGAGC ATGGATTGAG
  200. TGAGGGGGAG ACCGCTAAGA AATTCTCTTC TACCAGCACA
  201. AATGGGACCA ACATGGTACA GACGATTGTG ACAAATGCCG
  202. GTATGGGAGT GGGAGTGGGC AATCTCACTA TATACCCACA
  203. TCAGTGGATA AATTTGCGCA CCAATAACTG CGCCACCATC
  204. GTCATGCCAT ACATAAACAA CGTACCGATG GACAACATGT
  205. TCAGACACCA CAATTTCACA CTAATGATTA TTCCCTTTGT
  206. ACCATTAGAC TATTCTTCAG ATTCATCCAC GTACGTGCCC
  207. ATAACAGTGA CAGTCGCTCC AATGTGTGCT GAGTATAATG
  208. GTTTGAGGCT CTCAACCTCA TTGCAA
  209. VP3 GGATTACCTG TCATGAATAC ACCGGGTAGC AACCAGTTTC
  210. TGACATCGGA CGACTTCCAG TCACCATCTG CCATGCCACA
  211. ATTTGATGTC ACCCCAGAGT TAAATATACC AGGGGAGGTA
  212. СААААССТСА TGGAAATTGC TGAAGTCGAC TCGGTGGTGC
  213. CAGTCAACAA CGTGGAAGGG AAACTCGACA CAATGGAGGT
  214. CTACCGGATT CCAGTGCAGA GTGGTAATCA CCAAAGTGAC
  215. CAAGTCTTCG GTTTTCAAGT GCAACCTGGG CTAGATAGCG
  216. ТТТТСАААСА CACGCTACTG GGGGAGATTT TGAACTACTA
  217. TGCACACTGG TCTGGTAGTA TAAAACTAAC ATTTGTTTTC
  218. TGTGGTTCCG CTATGGCTAC GGGTAAATTC CTACTAGCCT
  219. ACGCCCCGCC CGGAGCGAAC GCTCCTAAGA ATAGGAAAGA
  220. TGCAATGCTG GGCACACACA TTATCTGGGA TGTTGGACTG
  221. CAGTCATCGT GTGTCTTATG TGTGCCTTGG ATTAGTCAAA
  222. CTCACTATAG GTTGGTGCAG CAGGACGAGT ACACAAGCGC
  223. TGGCAATGTC ACATGCTGGT ATCAGACTGG AATAGTCGTC
  224. CCGGCGGGCA CTCCGACATC GTGCTCCATC ATGTGTTTTG
  225. TATCGGCATG CAATGATTTC TCTGTGAGAT TACTAAAGGA
  226. CACGCCATTT ATAGAACAAA CTGCAATACT GCAA
  227. VP1 GGTGATGTGG TAGAAGCTGT AGAGAACGCC GTTGCACGTG
  228. TGGCAGATAC AATTGGTAGT GGGCCGTCAA ATTCGCAAGC
  229. AGTGCCTGCT TTAACAGCAG TTGAGACAGG GCACACATCT
  230. CAGGTGACAC CCAGTGATAC CATGCAAACC AGGCATGTCA
  231. AGAACTACCA TTCCAGATCT GAGTCCAGCA TTGAAAACTT
  232. CCTCAGCAGA TCTGCCTGCG TTTATATGGG AGGATACTGC
  233. АСААССААСА CTGACCAGAC ААААТТАТТТ GCCTCATGGA
  234. CTATTAGTGC ACGACGCATG GTTCAAATGA GACGCAAGCT
  235. AGAGATCTTC ACTTACGTCC GTTTTGATGT GGAGGTGACT
  236. TTTGTGATTA CCAGCAAGCA GGACCAGGGC AACCGATTGG
  237. GCCAAGACAT GCCACCCCTG ACTCACCAGA TCATGTATAT
  238. CCCACCAGGG GGGCCCATTC CAAAGTCTGT CACTGACTAT
  239. GCATGGCAAA ССТССАССАА CCCCAGCATT TTCTGGACTG
  240. AGGGGAACGC GCCACCCAGA ATGTCTATCC CATTCATTAG
  241. CATTGGTAAC GCCTACAGTA ATTTTTACGA CGGGTGGTCT
  242. CACTTCTCGC AAAACGGGGT GTATGGCTAC ААСАСАСТСА
  243. ACCACATGGG ТСАААТТТАТ GTTAGACACG TGAATGGATC
  244. АТСАССАСТС CCTATGACTA GCACTGTTAG AATGTACCTC
  245. AAGCCGAAGC ATGTTAAAGC ATGGGTCCCG CGGCCTCCTA
  246. GGCTATGCCA ATACGAAAAT GCATCCACGG TGAACTTTAC
  247. АСССАСАААС GTCACCGACA AGCGAACCAG САТСААСТАС
  248. ATTCCTGAGA CGGTCAAACC AGACCTATCA ААСТАС
  249. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU443625.
  250. Аминокислотная последовательность структурных белков клона G28 (штамм1. Gregory)
  251. Белок Аминокислотная последовательность
  252. VP4 MGAQVSTQKT GAHETGLNAS GSSIIHYTNI NYYKDAASNS
  253. ANRQEFSQDP GKFTEPVKDI MVKSLPALN
  254. VP2 SPSAEECGYS DRVRSITLGN STITTQESAN VVVGYGRWPE
  255. YLKDNEATAE DQPTHPDVAT CRFYTLESVT WERDSPGWWW
  256. KFPDALKDMG LFGQNMYYHY LGRAGYTLHV QCNASKFHQG
  257. CLLVVCVPEA EMGCSQVDGT VNEHGLSEGE TAKKFSSTST
  258. NGTNMVQTIV TNAGMGVGVG NLTIYPHQWI NLRTNNCATI
  259. VMPYINNVPM DNMFRHHNFT LMIIPFVPLD YSSDSSTYVP1. VTVAPMCA EYNGLRLSTS LQ
  260. VP3 GLPVMNTPGS NQFLTSDDFQ SPSAMPQFDV TPELNIPGEV
  261. QNLMEIAEVD SVVPVNNVEG KLDTMEVYRI PVQSGNHQSD
  262. QVFGFQVQPG LDSVFKHTLL GEILNYYAHW SGSIKLTFVF
  263. CGSAMATGKF LLAYAPPGAN APKNRKDAML GTHIIWDVGL
  264. QSSCVLCVPW ISQTHYRLVQ QDEYTSAGNV TCWYQTGIVV
  265. PAGTPTSCSI MCFVSACNDF SVRLLKDTPF IEQTAILQ
  266. VP1 GDVVEAVENA VARVADTIGS GPSNSQAVPA LTAVETGHTS
  267. QVTPSDTMQT RHVKNYHSRS ESSIENFLSR SACVYMGGYC
  268. TTNTDQTKLF ASWTISARRM VQMRRKLEIF TYVRFDVEVT
  269. FVITSKQDQG NRLGQDMPPL THQIMYIPPG GPIPKSVTDY
  270. AWQTSTNPSI FWTEGNAPPR MSIPFISIGN AYSNFYDGWS
  271. HFSQNGVYGY NTLNHMGQIY VRHVNGSSPL PMTSTVRMYL
  272. KPKHVKAWVP RPPRLCQYEN ASTVNFTPTN VTDKRTSINY1. ETVKPDLS NY штамм Gregory)
  273. Белок Последовательность нуклеотидов
  274. VP 4 ATGGGAGCGC AAGTATCAAC ACAAAAGACC GGTGCGCATG
  275. AAACCGGCTT GAACGCCAGT GGTAGTTCTA ТААТССАСТА
  276. САССААСАТА AACTACTATA AAGATGCAGC ATCCAACTCG
  277. GCAAATAGGC AAGAATTTTC ACAAGACCCT GGTAAGTTCA
  278. CCGAACCAGT GAAGGATATC ATGGTGAAGT CACTACCTGC1. АСТТААС
  279. VP2 TCGCCGTCTG CTGAAGAGTG TGGGTACAGT GACAGAGTGC
  280. GATCCATAAC ACTAGGTAAC ТСТАССАТСА CAACACAAGA
  281. AAGTGCAAAT GTAGTAGTGG GGTATGGTCG ATGGCCTGAG
  282. TACCTGAAAG ACAATGAGGC CACTGCTGAA GATCAACCAA
  283. CCCACCCTGA TGTAGCAACA TGTAGGTTTT ACACCCTGGA
  284. ATCGGTCACG TGGGAAAGAG ATTCACCCGG GTGGTGGTGG
  285. AAATTCCCGG ACGCCCTAAA AGATATGGGG CTCTTCGGCC
  286. AAAACATGTA СТАССАСТАТ CTAGGAAGAG CCGGTTACAC
  287. ATTGCATGTA CAATGTAATG САТСТАААТТ CCATCAGGGA
  288. TGCTTGCTAG TGGTCTGTGT ACCGGAAGCA GAGATGGGAT
  289. GCGGCCAAGT GGATGGTACT GTAAATGAGC ATGGATTGAG
  290. TGAGGGGGAG ACCGCTAAGA ААТТСТСТТС TACCAGCACA
  291. AATGGGACCA ACACGGTACA GACGATTGTG ACAAATGCCG
  292. GTATGGGAGT GGGAGTGGGC ААТСТСАСТА ТАТАСССАСА
  293. TCAGTGGATA AATTTGCGCA CCAATAACTG CGCCACCATC
  294. GTCATGCCAT АСАТАААСАА CGTACCGATG GACAACATGT
  295. ТСAGАСАССА СААТТТСАСА CTAATGATTA TTCCCTTTGT
  296. ACCATTAGAC TATTCTTCAG ATТCATССАС GTACGTGCCC
  297. ATAACAGTGA CAGTCGCTCC AATGTGTGCT GAGTATAATG
  298. GTTTGAGGCT СТСААССТСА TTGCAA
  299. VP3 GGATTACCTG TCATGAATAC ACCGGGTAGC AACCAGTTTC
  300. TGACATCGGA CGACTTCCAG TCACCATCTG CCATGCCACA
  301. ATTTGATGTC ACCCCAGAGT ТАААТАТАСС AGGGGAGGTA
  302. СААААССТСА TGGAAATTGC TGAAGTCGAC TCGGTGGTGC
  303. CAGTCAACAA CGTGGAAGGG AAACTCGACA CAATGGAGGT
  304. CTACCGGATT CCAGTGCAGA GTGGTAATCA CCAAAGTGAC
  305. CAAGTCTTCG GTTTTCAAGT GCAACCTGGG CTAGATAGCG
  306. ТТТТСАААСА CACGCTACTG GGGGAGATTT TGAACTACTA
  307. TGCACACTGG TCTGGTAGTA ТААААСТААС ATTTGTTTTC
  308. TGTGGTTCCG CTATGGCTAC GGGTAAATTC CTACTAGCCT
  309. ACGCCCCGCC CGGAGCGAAC GCTCCTAAGA ATAGGAAAGA
  310. TGCAATGCTG GGCACACACA TTATCTGGGA TGTTGGACTG
  311. CAGTCATCGT GTGTCTTATG TGTGCCTTGG ATTAGTCAAA
  312. CTCACTATAG GTTGGTGCAG CAGGACGAGT ACACAAGCGC
  313. TGGCAATGTC ACATGCTGGT ATCAGACTGG AATAGTCGTC
  314. CCGGCGGGCA CTCCGACATC GTGCTCCATC ATGTGTTTTG
  315. TATCGGCATG CAATGATTTC TCTGTGAGAT TACTAAAGGA
  316. CACGCCATTT ATAGAACAAA CTGCAATACT GCAA
  317. VP1 GGTGATGTGG TAGAAGCTGT AGAGAACGCC GTTGCACGTG
  318. TGGCAGATAC AATTGGTAGT GGGCCGTCAA ATTCGCAAGC
  319. AGTGCCTGCT TTAACAGCAG TTGAGACAGG GCACACATCT
  320. CAGGTGACAC CCAGTGATAC CATGCAAACC AGGCATGTCA
  321. AGAACTACCA TTCCAGATCT GAGTCCAGCA TTGAAAACTT
  322. CCTCAGCAGA TCTGCCTGCG TTTATATGGG AGGATACTGC
  323. АСААССААСА CTGACCAGAC ААААТТАТТТ GCCTCATGGA
  324. CTATTAGTGC ACGACGCATG GTTCAAATGA GACGCAAGCT
  325. AGAGATCTTC ACTTACGTCC GTTTTGATGT GGAGGTGACT
  326. TTTGTGATTA CCAGCAAGCA GGACCAGGGC AACCGATTGG
  327. GCCAAGACAT GCCACCCCTG ACTCACCAGA TCATGTATAT
  328. CCCACCAGGG GGGCCCATTC CAAAGTCTGT CACTGACTAT
  329. GCATGGCAAA ССТССАССАА CCCCAGCATT TTCTGGACTG
  330. AGGGGAACGC GCCACCCAGA ATGTCTATCC CATТCATTAG
  331. CATTGGTAAC GCCTACAGTA ATTTTTACGA CGGGTGGTCT
  332. CACTTCTCGC AAAACGGGGT GTATGGCTAC ААСАСАС ТСA
  333. ACCACATGGG ТСАААТТТАТ GTTAGACACG TGAATGGATC
  334. АТСАССАСТС CCTATGACTA GCACTGTTAG AATGTACCTC
  335. AAGCCGAAGC ATGTTAAAGC ATGGGTCCCG CGGCCTCCTA
  336. GGCTATGCCA ATACGAAAAT GCATCCACGG TGAACTTTAC
  337. АС С САСАААС GTCACCGACA AGCGAACCAG CATCAACTAC
  338. ATTCCTGAGA CGGTCAAACC AGACCTATCA AACTAC
  339. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU443623.
  340. Аминокислотная последовательность структурных белков клона G3123штамм Gregory)
  341. Белок Аминокислотная последовательность
  342. VP4 MGAQVSTQKT GAHETGLNAS GSSIIHYTNI NYYKDAASNS
  343. ANRQEFSQDP GKFTEPVKDI MVKSLPALN
  344. VP2 SPSAEECGYS DRVRSITLGN STITTQESAN VVVGYGRWPE
  345. YLKDNEATAE DQPTHPDVAT CRFYTLESVT WERDSPGWWW
  346. KFPDALKDMG LFGQNMYYHY LGRAGYTLHV QCNASKFHQG
  347. CLLVVCVPEA EMGCGQVDGT VNEHGLSEGE TAKKFSSTST
  348. NGTNTVQTIV TNAGMGVGVG NLTIYPHQWI NLRTNNCATI
  349. VMPYINNVPM DNMFRHHNFT LMIIPFVPLD YSSDSSTYVP1. VTVAPMCA EYNGLRLSTS LQ
  350. VP3 GLPVMNTPGS NQFLTSDDFQ SPSAMPQFDV TPELNIPGEV
  351. QNLMEIAEVD SVVPVNNVEG KLDTMEVYRI PVQSGNHQSD
  352. QVFGFQVQPG LDSVFKHTLL GEILNYYAHW SGSIKLTFVF
  353. CGSAMATGKF LLAYAPPGAN APKNRKDAML GTHIIWDVGL
  354. QSSCVLCVPW ISQTHYRLVQ QDEYTSAGNV TCWYQTGIVV
  355. PAGTPTSCSI MCFVSACNDF SVRLLKDTPF IEQTAILQ
  356. VP1 GDVVEAVENA VARVADTIGS GPSNSQAVPA LTAVETGHTS
  357. QVTPSDTMQT RHVKNYHSRS ESSIENFLSR SACVYMGGYC
  358. TTNTDQTKLF ASWTISARRM VQMRRKLEIF TYVRFDVEVT
  359. FVITSKQDQG NRLGQDMPPL THQIMYIPPG GPIPKSVTDY
  360. AWQTSTNPSI FWTEGNAPPR MSIPFISIGN AYSNFYDGWS
  361. HFSQNGVYGY NTLNHMGQIY VRHVNGSSPL PMTSTVRMYL
  362. KPKHVKAWVP RPPRLCQYEN ASTVNFTPTN VTDKRTSINY1. ETVKPDLS NY штамм 7611)
  363. Белок Последовательность нуклеотидов
  364. VP4 ATGGGAGCTC AAGTGTCGAC ACAAAAGACT GGAGCGCATG AGACCGGTTT GAGTGCCAGC GGGAACTCAA ТТАТАСАТТА САССААСАТС AACTACTATA AGGATGCCGC GTCAAACTCA GCAAACAGGC AAGACTTCTC CCAAGATCCC GGGAAGTTCA CAGAACCGGT GAAAGATATA ATGGTGAAAT CACTACCTGC1. ТСТАААС
  365. GCTTGAGATT GGCGACTTCG TTGCAA
  366. CGCACTATAG AGGAAATGTC CCAGCAGGCA TTTCAGCATG TACACCATTT
  367. ACTAGTGCAA ACTTGTTGGT CTCCAACATC CAATGACTTC ATAGAGCAAA
  368. CAAGATGAGT ATCAGACAGG GTGCTCCATC TCGGTGCGCT CTGCCCTCCT
  369. ACACCAGTGC GATTGTGGTT ATGTGTTTTG TGCTAAAAGA GCAA
  370. VP1 GGTGATGTGG TGGCAGACAC TGTGCCTGCT CAAGTAACCC ACAACTACCA TCTTTGTAGG ACAACCAATA CCATCAACGC CGAGATGTTC TTTGTGATTA GCCAAGATAT ACCACCAGGG ACGTGGCAAA AGGGAAATGC TATTGGCAAT CATTTCTCTC ATCGTATGGG CTCACCACTA AAGCCAAAGC GGTTGTGCCA ACCCACCAAC ATACCAGAGA
  371. TGGAGGCAGT CATTAGCAGT CTGACCGCTG CCAGTGACAT CTCTAGATCA TCGGCATGCG CCGATGCCTC ACGGCGTATG ACGTACGTTA CCAGTAAACA GCCACCACTG GGCCCTATAC CATCCACCAA ACCACCCAGG GCCTACAGTA AAAATGGTGT CCAAATTTAC CCTATGACAA ACGTGAAAGT GTACGTGAAT ATCACTGAGA CAGTCAAACC
  372. CGAAAATGCC GGGCCATCAA TGGAGACGGG СATACAGACС GAATCCAGTA TCTACATGGG CAAGTTGTTT GTACAAATGA GGTTTGACGT AGATCAAGGG ACACACCAAA CGAAGTCAGT CCCGAGTATC ATGTCCATCC ATTTCTATGA GTACGGTTAC GTCAGGCACG GCACAGTTAG GTGGGTCCCA GCATCAACTG AGAGAACAAG TGATGTTTCA
  373. GTTGCACGCG ATTCACAAGC ACACACGTCT AGGCACGTGC TTGAGAACTT AGAATACCAC GCGTCATGGA GGCGCAAACT GGAAGTGACA ACCAAACTGG TTATGTATAT AACGGACTAC TTTTGGACTG CTTTCATTAG CGGCTGGTCA AATACGCTCA TGAACGGATC GATGTACTTC CGCCCGCCTA TCAACTTCAA CATTAACTAC AC AT AC
  374. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU167520.
  375. Аминокислотная последовательность структурных белков клона 5.9.11.5штамм 7611)
  376. Белок Аминокислотная последовательность
  377. VP 4 MGAQVSTQKT GAHETGLSAS GNSIIHYTNI NYYKDAASNS
  378. ANRQDFSQDP GKFTEPVKDI MVKSLPALN
  379. VP2 SPSAEECGYS DRVRSITLGN STITTQESAN VVVAYGRWPE
  380. YLKDDEATAE DQPTQPDVAT CRFYTLESVT WEKDSPGWWW
  381. KFPDALKDMG LFGQNMYYHY LGRAGYTIHV QCNASKFHQG
  382. CLMVVCVPEA EMGCSQIDGT VNEHSLSEGE TAKKFAATST
  383. NGTNTVQSIV TNAGMGVGVG NLTIFPHQWI NLRTNNCATI
  384. VMPYINNVPM DNMFRHHNFT LMIIPFVPLD YSSDSSTYVP1. VTVTVAPMCA EYNGLRLATS LQ
  385. VP3 GLPVMITPGS NQFLTSDDFQ SPSAMPQFDV TPELNIPGEV
  386. QNLMEIAEVD SVVPVNNVEG KLDTMDIYRI PVQSGNHQST
  387. QVFGFQVQPG LDNVFKHTLL GEILNYYAHW SGSIKLTFVF
  388. CGSAMATGKF LLAYAPPGAN APKSRKDAML GTHIIWDVGL
  389. QSSCVLCIPW ISQTHYRLVQ QDEYTSAGNV TCWYQTGIVV
  390. PAGTPTSCSI MCFVSACNDF SVRLLKDTPF IEQTALLQ
  391. VP1 GDVVEAVENA VARVADTISS GPSNSQAVPA LTAVETGHTS
  392. QVTPSDIIQT RHVHNYHSRS ESSIENFLCR SACVYMGEYH
  393. TTNTDASKLF ASWTINARRM VQMRRKLEMF TYVRFDVEVT
  394. FVITSKQDQG TKLGQDMPPL THQIMYIPPG GPIPKSVTDY
  395. TWQTSTNPSI FWTEGNAPPR MSIPFISIGN AYSNFYDGWS
  396. HFSQNGVYGY NTLNRMGQIY VRHVNGSSPL PMTSTVRMYF
  397. KPKHVKVWVP RPPRLCQYVN ASTVNFKPTN ITEKRTSINY1. ETVKPDVS TY штамм 7611)
  398. Белок Последовательность нуклеотидов
  399. VP 4 ATGGGAGCTC AAGTGTCGAC ACAAAAGACT GGAGCGCATG
  400. AGACCGGTTT GAGTGCCAGC GGGAACTCAA TTATACATTA
  401. САССААСАТС ААСТАСТАТА AGGATGCCGC GTCAAACTCA
  402. GCAAACAGGC AAGACTTCTC CCAAGATCCC GGGAAGTTCA
  403. CAGAACCGGT GAAAGATATA ATGGTGAAAT CACTACCTGC1. ТСТАААС
  404. VP2 TCACCATCTG CCGAGGAGTG CGGTTATAGC GACAGAGTGC
  405. GTTCCATCAC ACTTGGTAAT ТССАССАТАА CAACCCAGGA
  406. GAGCGCCAAC GTGGTGGTGG CATATGGCAG ATGGCCCGAG
  407. TACTTGAAGG ACGATGAGGC CACCGCCGAG GACCAACCAA
  408. CCCAGCCGGA TGTAGCTACA TGTAGGTTCT ACACATTGGA
  409. GTCAGTCACA TGGGAGAAAG ACTCACCAGG ATGGTGGTGG
  410. AAGTTTCCAG ACGCTCTGAA GGACATGGGC TTATTTGGGC
  411. AGAATATGTA СТАТСАСТАС CTAGGTAGGG CTGGATACAC
  412. TATACACGTG CAGTGCAACG CCTCCAAATT CCACCAGGGC
  413. TGCCTGATGG TTGTCTGCGT GCCAGAGGCG GAAATGGGCT
  414. GTAGTCAGAT TGATGGTACA GTAAATGAGC ACAATCTGAG
  415. TGAAGGAGAG ACTGCTAAGA AATTTGCAGC CACTTCCACT
  416. AACGGAACAA ATACAGTCCA ATCAATCGTG ACGAATGCAG
  417. GCATGGGAGT GGGTGTGGGC AACTTAACCA TTTTCCCACA
  418. TCAATGGATT AACTTGCGAA CAAACAATTG TGCCACTATA
  419. GTGATGCCAT АСАТСААСАА TGTGCCTATG GACAACATGT
  420. ТTAGАСАССА СААТТТТАСА CTGATGATCA TACCCTTTGT
  421. GCCATTGGAT TACTCGTCAG ATTCATCTAC ATATGTACCA
  422. GTTACAGTCA CGGTGGCCCC GATGTGCGCA GAATACAATG
  423. GCTTGAGATT GGCGACTTCG TTGCAA
  424. УРЗ GGTTTGCCTG TAATGATCAC CCCAGGAAGT AACCAGTTCT
  425. TGACCTCAGA CGATTTTCAA TCACCATCAG CCATGCCACA
  426. GTTTGATGTA АСАССAGAGТ TGAACATACC TGGTGAAGTG
  427. CAGAACCTCA TGGAGATTGC AGAGGTCGAC TCCGTGGTTC
  428. CAGTAAACAA TGTGGAAGGG AAGCTGGACA CGATGGATAT
  429. CTATCGAATT CCTGTACAGA GTGGCAACCA CCAGAGTACA
  430. CAAGTGTTTG GCTTCCAGGT GCAGCCAGGG TTGGACAATG
  431. TGTTCAAGCA CACATTATTG GGGGAAATAC TGAACTACTA
  432. TGCACACTGG TCAGGGAGCA TCAAACTCAC GTTCGTCTTC
  433. TGCGGTTCAG CCATGGCCAC CGGGAAGTTC CTACTTGCGT
  434. ATGCACCACC AGGGGCGAAT GCCCCGAAGA GCAGGAAGGA
  435. TGCAATGCTG GGCACGCACA TCATCTGGGA TGTGGGGTTG
  436. CAGTCATCAT GCGTCTTGTG TATACCTTGG ATTAGTCAGA
  437. CGCACTATAG ACTAGTGCAA CAAGATGAGT ACACCAGTGC
  438. AGGAAATGTC ACTTGTTGGT ATCAGACAGG GATTGTGGTT
  439. CCAGCAGGCA СТССААСАТС GTGCTCCATC ATGTGTTTTG
  440. TTTCAGCATG CAATGACTTC TCGGTGCGCT TGCTAAAAGA
  441. ТАСАССАТТТ ATAGAGCAAA CTGCCCTCCT GCAA
  442. VP1 GGTGATGTGG TGGAGGCAGT CGAAAATGCC GTTGCACGCG
  443. TGGCAGACAC CATTAGCAGT GGGCCATCAA ATTCACAAGC
  444. TGTGCCTGCT CTGACCGCTG TGGAGACGGG ACACACGTCT
  445. CAAGTAACCC CCAGTGACAT CATACAGACC AGGCACGTGC
  446. АСААСТАССА CTCTAGATCA GAATCCAGTA TTGAGAACTT
  447. TCTTTGTAGG TCGGCATGCG TCTACATGGG AGAATACCAC
  448. АСААССААТА CCGATGCCTC CAAGTTGTTT GCGTCATGGA
  449. CCATCAACGC ACGGCGTATG GTACAAATGA GGCGCAAACT
  450. CGAGATGTTC ACGTACGTTA GGTTTGACGT GGAAGTGACA
  451. TTTGTGATTA CCAGTAAACA AGATCAAGGG ACCAAACTGG
  452. GCCAAGATAT GCCACCACTG ACACACCAAA TTATGTATAT
  453. ACCACCAGGG GGCCCTATAC CGAAGTCAGT AACGGACTAC
  454. ACGTGGCAAA САТССАССАА CCCGAGTATC TTTTGGACTG
  455. AGGGAAATGC ACCACCCAGG ATGTCCATCC CTTTCATTAG
  456. TATTGGCAAT GCCTACAGTA ATTTCTATGA CGGCTGGTCA
  457. САТТТСТСТС AAAATGGTGT GTACGGTTAC AATACGCTCA
  458. ATCGTATGGG ССАААТТТАС GTCAGGCACG TGAACGGATC
  459. СТСАССАСТА CCTATGACAA GCACAGTTAG GATGTACTTC
  460. AAGCCAAAGC ACGTGAAAGT GTGGGTCCCA CGCCCGCCTA
  461. GGTTGTGCCA GTACGTGAAT GCATCAACTG TCAACTTCAA
  462. АСССАССААС ATCACTGAGA AGAGAACAAG CATTAACTAC
  463. ATACCAGAGA CAGTCAAACC TGATGTTTCA ACATAC
  464. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU167521.
  465. Аминокислотная последовательность структурных белков клона 101 (штамм7611)
  466. Белок Аминокислотная последовательность
  467. VP4 MGAQVSTQKT GAHETGLSAS GNSIIHYTNI NYYKDAASNS
  468. ANRQDFSQDP GKFTEPVKDI MVKSLPALN
  469. VP2 SPSAEECGYS DRVRSITLGN STITTQESAN VVVAYGRWPE
  470. YLKDDEATAE DQPTQPDVAT CRFYTLESVT WEKDSPGWWW
  471. KFPDALKDMG LFGQNMYYHY LGRAGYTIHV QCNASKFHQG
  472. CLMVVCVPEA EMGCSQIDGT VNEHNLSEGE TAKKFAATST
  473. NGTNTVQSIV TNAGMGVGVG NLTIFPHQWI NLRTNNCATI
  474. VMPYINNVPM DNMFRHHNFT LMIIPFVPLD YSSDSSTYVP1. VTVTVAPMCA EYNGLRLATS LQ
  475. VP3 GLPVMITPGS NQFLTSDDFQ SPSAMPQFDV TPELNIPGEV
  476. QNLMEIAEVD SVVPVNNVEG KLDTMDIYRI PVQSGNHQST
  477. QVFGFQVQPG LDNVFKHTLL GEILNYYAHW SGSIKLTFVF
  478. CGSAMATGKF LLAYAPPGAN APKSRKDAML GTHIIWDVGL
  479. QSSCVLCIPW ISQTHYRLVQ QDEYTSAGNV TCWYQTGIVV
  480. PAGTPTSCSI MCFVSACNDF SVRLLKDTPF IEQTALLQ
  481. VP1 GDVVEAVENA VARVADTISS GPSNSQAVPA LTAVETGHTS
  482. QVTPSDIIQT RHVHNYHSRS ESSIENFLCR SACVYMGEYH
  483. TTNTDASKLF ASWTINARRM VQMRRKLEMF TYVRFDVEVT '
  484. FVITSKQDQG TKLGQDMPPL THQIMYIPPG GPIPKSVTDY
  485. TWQTSTNPSI FWTEGNAPPR MSIPFISIGN AYSNFYDGWS
  486. HFSQNGVYGY NTLNRMGQIY VRHVNGSSPL PMTSTVRMYF
  487. KPKHVKVWVP RPPRLCQYVN ASTVNFKPTN ITEKRTSINY1. ETVKPDVS TY штамм 7611)
  488. Белок Последовательность нуклеотидов
  489. VP4 ATGGGAGCTC AAGTGTCGAC ACAAAAGACT GGAGCGCATG
  490. AGACCGGTTT GAGTGCCAGC GGGAACTCAA TTATACATTA
  491. САССААСAT С AACTACTATA AGGATGCCGC GTCAAACTCA
  492. GCAAACAGGC AAGACTTCTC CCAAGATCCC GGGAAGTTCA
  493. CAGAACCGGT GAAAGATATA ATGGTGAAAT CACTACCTGC1. ТСТАААС
  494. VP2 TCACCATCTG CCGAGGAGTG CGGTTATAGC GACAGAGTGC
  495. GTTCCATCAC ACTTGGTAAT ТССАССАТАА CAACCCAGGA
  496. GAGCGCCAAC GTGGTGGTGG CATATGGCAG ATGGCCCGAG
  497. TACTTGAAGG ACGATGAGGC CACCGCCGAG GACCAACCAA
  498. CCCAGCCGGA TGTAGCTACA TGTAGGTTCT ACACATTGGA
  499. GTCAGTCACA TGGGAGAAAG ACTCACCAGG ATGGTGGTGG
  500. AAGTTTCCAG ACGCTCTGAA GGACATGGGC TTATTTGGGC
  501. AGAATATGTA СТАТСАСТАС CTAGGTAGGG CTGGATACAC
  502. TATACACGTG CAGTGCAACG ССТССАААТТ CCACCAGGGC
  503. TGCCTGATGG TTGTCTGCGT -GCCAGAGGCG GAAATGGGCT
  504. GTAGTCAGAT TGATGGTACA GTAAATGAGC ACAGTCTGAG
  505. TGAAGGAGAG ACTGCTAAGA AATTTGCAGC CACTTCCACT
  506. AACGAAACAA ATACAGTCCA ATCAATCGTG ACGAATGCAG
  507. GCATGGGAGT GGGTGTGGGC AACTTAACCA TTTTCCCACA
  508. TCAATGGATT AACTTGCGAA CAAACAATTG TGCCACTATA
  509. GTGATGCCAT АСАТСААСАА TGTGCCTATG GACAACATGT
  510. TTAGACACCA СААТТТТАСА СTGATGATСA TACCCTTTGT
  511. GCCATTGGAT TACTCGTCAG ATTCATCTAC ATATGTACCA
  512. GTTACAGTCA CGGTGGCCCC GATGTGCGCA GAATACAATG
  513. GCTTGAGATT GGCGACTTCG TTGCAA ¦
  514. VP3 GGTTTGCCTG TAATGATCAC CCCAGGAAGT AACCAGTTCT
  515. TGACCTCAGA CGATTTTCAA TCACCATCAG CCATGCCACA
  516. GTTTGATGTA ACACCAGAGT TGAACATACC TGGTGAAGTG
  517. CAGAACCTCA TGGAGATTGC AGAGGTCGAC TCCGTGGTTC
  518. CAGTAAACAA TGTGGAAGGG AAGCTGGACA CGATGGATAT
  519. CTATCGAATT CCTGTACAGA GTGGCAACCA CCAGAGTACA
  520. CAAGTGTTTG GCTTCCAGGT GCAGCCAGGG TTGGACAATG
  521. TGTTCAAGCA CACATTATTG GGGGAAATAC TGAACTACTA
  522. TGCACACTGG TCAGGGAGCA TCAAACTCAC GTTCGTCTTC
  523. TGCGGTTCAG CCATGGCCAC CGGGAAGTTC CTACTTGCGT
  524. ATGCACCACC AGGGGCGAAT GCCCCGAAGA GCAGGAAGGA
  525. TGCAATGCTG GGCACGCACA TCATCTGGGA TGTGGGGTTG
  526. CAGTCATCAT GCGTCTTGTG TATACCTTGG ATTAGTCAGA
  527. CGCACTATAG ACTAGTGCAA CAAGATGAGT ACACCAGTGC
  528. AGGAAATGTC ACTTGTTGGT ATCAGACAGG GATTGTGGTT
  529. CCAGCAGGCA СТССААСАТС GTGCTCCATC ATGTGTTTTG
  530. TTTCAGCATG CAATGACTTC TCGGTGCGCT TGCTAAAAGA
  531. ТАСАССАТТТ ATAGAGCAAA CTGCCCTCCT GCAA
  532. VP1 GGTGATGTGG TGGAGGCAGT CGAAAATGCC GTTGCACGCG
  533. TGGCAGACAC CATTAGCAGT GGGCCATCAA ATTCACAAGC
  534. TGTGCCTGCT CTGACCGCTG TGGAGACGGG ACACACGTCT
  535. CAAGTAACCC CCAGTGACAT CATACAGACC AGGCACGTGC
  536. АСААСТАССА CTCTAGATCA GAATCCAGTA TTGAGAACTT
  537. TCTTTGTAGG TCGGCATGCG TCTACATGGG AGAATACCAC
  538. АСААССААТА CCGATGCCTC CAAGTTGTTT GCGTCATGGA
  539. CCATCAACGC ACGGCGTATG GTACAAATGA GGCGCAAACT
  540. CGAGATGTTC ACGTACGTTA GGTTTGACGT GGAAGTGACA ¦
  541. TTTGTGATTA CCAGTAAACA AGATCAAGGG ACCAAACTGG
  542. GCCAAGATAT GCCACCACTG АС АС АС С AAA TTATGTATAT
  543. ACCACCAGGG GGCCCTATAC CGAAGTCAGT AACGGACTAC
  544. ACGTGGCAAA САТССАССАА CCCGAGTATC TTTTGGACTG
  545. AGGGAAATGC ACCACCCAGG ATGTCCATCC CTTTCATTAG
  546. TATTGGCAAT GCCTACAGTA ATTTCTATGA CGGCTGGTCA
  547. САТТТСТСТС AAAATGGTGT GTACGGTTAC AATACGCTCA
  548. ATCGTATGGG ССАААТТТАС GTCAGGCACG TGAACGGATC
  549. СТСАССАСТА ССТАТGACAA GCACAGTTAG GATGTACTTC
  550. AAGCCAAAGC ACGTGAAAGT GTGGGTCCCA CGCCCGCCTA
  551. GGTTGTGCCA GTACGTGAAT GCATCAACTG ТСААСТТСАА
  552. АСССАССААС ATCACTGAGA AGAGAACAAG САТТААСТАС
  553. ATACCAGAGA CAGTCAAACC TGATGTTTCG АСАТАС
  554. Примечание: данная последовательность была депонирована в GenBank под регистрационным номером EU167522.7611)
  555. Белок Аминокислотная последовательность
  556. VP4 MGAQVSTQKT GAHETGLSAS GNSIIHYTNI NYYKDAASNS
  557. ANRQDFSQDP GKFTEPVKDI MVKSLPALN
  558. VP2 SPSAEECGYS DRVRSITLGN STITTQESAN VVVAYGRWPE
  559. YLKDDEATAE DQPTQPDVAT CRFYTLESVT WEKDSPGWWW
  560. KFPDALKDMG LFGQNMYYHY LGRAGYTIHV QCNASKFHQG
  561. CLMVVCVPEA EMGCSQIDGT VNEHSLSEGE TAKKFAATST
  562. NETNTVQSIV TNAGMGVGVG NLTIFPHQWI NLRTNNCATI
  563. VMPYINNVPM DNMFRHHNFT LMIIPFVPLD YSSDSSTYVP1. VTVTVAPMCA EYNGLRLATS LQ
  564. УРЗ GLPVMITPGS NQFLTSDDFQ SPSAMPQFDV TPELNIPGEV
  565. QNLMEIAEVD SVVPVNNVEG KLDTMDIYRI PVQSGNHQST
  566. QVFGFQVQPG LDNVFKHTLL GEILNYYAHW SGSIKLTFVF
  567. CGSAMATGKF LLAYAPPGAN APKSRKDAML GTHIIWDVGL
  568. QSSCVLCIPW ISQTHYRLVQ QDEYTSAGNV TCWYQTGIVV
  569. PAGTPTSCSI MCFVSACNDF SVRLLKDTPF IEQTALLQ
  570. VP1 GDVVEAVENA VARVADTISS GPSNSQAVPA LTAVETGHTS
  571. QVTPSDIIQT RHVHNYHSRS ESSIENFLCR SACVYMGEYH
  572. TTNTDASKLF ASWTINARRM VQMRRKLEMF TYVRFDVEVT
  573. FVITSKQDQG TKLGQDMPPL THQIMYIPPG GPIPKSVTDY
  574. TWQTSTNPSI FWTEGNAPPR MSIPFISIGN AYSNFYDGWS
  575. HFSQNGVYGY NTLNRMGQIY VRHVNGSSPL PMTSTVRMYF
  576. KPKHVKVWVP RPPRLCQYVN ASTVNFKPTN ITEKRTSINY1. ETVKPDVS TY
Заполнить форму текущей работой

На отлично!