Π”ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, курсовая, ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Π°Ρ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Π°
ΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² написании студСнчСских Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚

ΠŸΡ€ΠΎΡΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½Π°Ρ структура Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы ΠΈΠ· Thermus thermophilus Π² комплСксС с Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΌ Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄ΠΎΠΌ

Π”ΠΈΡΡΠ΅Ρ€Ρ‚Π°Ρ†ΠΈΡΠŸΠΎΠΌΠΎΡ‰ΡŒ Π² Π½Π°ΠΏΠΈΡΠ°Π½ΠΈΠΈΠ£Π·Π½Π°Ρ‚ΡŒ ΡΡ‚ΠΎΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΠΌΠΎΠ΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹

ΠœΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ аминоацилирования являСтся ΡΡ‚ΠΎΠ»ΡŒ слоТным, ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ спСцифичноС ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠ΅ родствСнной Ρ‚Π ΠΠš, ΠΏΠΎ-Π²ΠΈΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠΌΡƒ, Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚ Π² ΡΠ΅Π±Ρ ΠΊΠΎΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹Π΅ пСрСстройки ΠΊΠ°ΠΊ самой синтСтазы, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Ρ‚Π ΠΠš, происходящиС Π² Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ связывания ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π½ΠΎΡΠ° Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚Π°. Π₯отя Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΈΠ½ΡΡ‚Π²ΠΎ ΠΈΠ· ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π½Π° Π½Π°ΡΡ‚оящий дСнь структур ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‚ Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ взаимодСйствия с Π°Π½Ρ‚ΠΈΠΊΠΎΠ΄ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹ΠΌ Ρ‚Ρ€ΠΈΠΏΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΌ Ρ‚Π ΠΠš для Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ… Π§ΠΈΡ‚Π°Ρ‚ΡŒ Π΅Ρ‰Ρ‘ >

Π‘ΠΎΠ΄Π΅Ρ€ΠΆΠ°Π½ΠΈΠ΅

  • 1. ΠžΠ‘Π—ΠžΠ  Π›Π˜Π’Π•Π ΠΠ’Π£Π Π«
    • 1. 1. Аминоацил-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы: ΠΊΡ€Π°Ρ‚ΠΊΠΈΠΉ ΠΎΠ±Π·ΠΎΡ€ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΉ
    • 1. 2. Аминоацил-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы: Π΄Π²Π° класса, сСмь подклассов
    • 1. 3. АминоацилированиС: активация Ρ‚Π ΠΠš
    • 1. 4. ВзаимодСйствиС Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз с Ρ‚Π ΠΠš
    • 1. 5. Π˜Π½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз: ΠΏΠΎΡ‚Π΅Π½Ρ†ΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Π΅ эффСктивныС Π°Π½Ρ‚ΠΈΠ±ΠΈΠΎΡ‚ΠΈΠΊΠΈ
    • 1. 6. Аминоацил-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы: происхоТдСниС ΠΈ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΡ
    • 1. 7. Π€Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаза
      • 1. 7. 1. Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° ΠΈ ΡΠ²ΠΎΠΉΡΡ‚Π²Π°
      • 1. 7. 2. НСканоничСскиС Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΈ
      • 1. 7. 3. КомплСкс с Ρ‚Π ΠΠšΠ Π¬Π΅
      • 1. 7. 4. ΠšΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΡ‹ с Phe ΠΈ PheOH-AMP
  • 2. Π­ΠšΠ‘ΠŸΠ•Π Π˜ΠœΠ•ΠΠ’ΠΠ›Π¬ΠΠΠ― ЧАБВ
    • 2. 1. ΠœΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹ ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄Ρ‹
      • 2. 1. 1. Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΎΡ‡ΠΈΡΡ‚ΠΊΠ° Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы
      • 2. 1. 2. ΠšΡ€ΠΈΡΡ‚Π°Π»Π»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΡ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы
      • 2. 1. 3. ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ комплСкса PheRS-Phe-AMP
      • 2. 1. 4. ΠŸΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… рСнтгСновской Π΄ΠΈΡ„Ρ€Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ
    • 2. 2. ΠžΠ±Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ²
      • 2. 2. 1. ΠŸΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½Π°Ρ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΊΠ° Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… рСнтгСновской Π΄ΠΈΡ„Ρ€Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ
      • 2. 2. 2. ΠŸΠΎΡΡ‚Ρ€ΠΎΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ ΡƒΡ‚ΠΎΡ‡Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ пространствСнной ΠΌΠΎΠ΄Π΅Π»ΠΈ
  • 3. РЕЗУЛЬВАВЫ Π˜Π‘Π‘Π›Π•Π”ΠžΠ’ΠΠΠ˜Π―
    • 3. 1. Π’Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅, очистка ΠΈ ΠΊΡ€ΠΈΡΡ‚аллизация Π³ΠΎΠΌΠΎΠ³Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°
    • 3. 2. РСакция аминоацилирования Π² ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ствии Π΄ΠΈΠ²Π°Π»Π΅Π½Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ²
    • 3. 3. ΠžΠ±Π·ΠΎΡ€ структуры Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ комплСкса
    • 3. 4. БвязываниС ΠΈ Ρ€Π°ΡΠΏΠΎΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠ΅ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚Π°
    • 3. 5. РаспознаваниС Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½Π° Π² Ρ€ΡΠ΄Ρƒ ароматичСских аминокислот
    • 3. 6. Ион ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π»Π»Π° Π² ΠΎΠ±Π»Π°ΡΡ‚ΠΈ взаимодСйствия Π°- ΠΈ Π -ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ† Π³Π΅Ρ‚Π΅Ρ€ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π°
    • 3. 7. Ион ΡΡƒΠ»ΡŒΡ„Π°Ρ‚Π° Π½Π° ΠΏΠΎΠ²Π΅Ρ€Ρ…ности Π”ΠΠš-ΡΠ²ΡΠ·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½Π°
  • 4. ΠžΠ‘Π‘Π£Π–Π”Π•ΠΠ˜Π• Π Π•Π—Π£Π›Π¬Π’ΠΠ’ΠžΠ’
  • Π’Π«Π’ΠžΠ”Π«

ΠŸΡ€ΠΎΡΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½Π°Ρ структура Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы ΠΈΠ· Thermus thermophilus Π² комплСксС с Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΌ Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄ΠΎΠΌ (Ρ€Π΅Ρ„Π΅Ρ€Π°Ρ‚, курсовая, Π΄ΠΈΠΏΠ»ΠΎΠΌ, ΠΊΠΎΠ½Ρ‚Ρ€ΠΎΠ»ΡŒΠ½Π°Ρ)

ΠΠΊΡ‚ΡƒΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Ρ‚Π΅ΠΌΡ‹

Врансляция гСнСтичСского ΠΊΠΎΠ΄Π° являСтся ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠΌ ΠΈΠ· ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»ΡΡŽΡ‰ΠΈΡ… свойств ΠΆΠΈΠ²Ρ‹Ρ… систСм, ΠΈ ΡΡ‚Π° функция Π²ΠΎ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎΠΌ базируСтся Π½Π° Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΎΠΌ сСмСйствС Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² — Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз. Π‘ΠΎΠ»Π΅Π΅ Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, соврСмСнныС исслСдования продСмонстрировали ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Ρ€ΠΈΠ±ΠΎΡΠΎΠΌΠ°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ РНК ΡΠ°ΠΌΠΎΡΡ‚ΠΎΡΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎ ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ†Π΅Π»Ρ‹ΠΉ ряд химичСских Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΉ, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Π΅ ΠΏΡ€Π΅ΠΆΠ΄Π΅ ΡΡ‡ΠΈΡ‚Π°Π»ΠΈΡΡŒ ΠΏΡ€Π΅Ρ€ΠΎΠ³Π°Ρ‚ΠΈΠ²ΠΎΠΉ Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ², Π² Ρ‚ΠΎΠΌ числС Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ аминокислот Π² Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš ΠΈ Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠ»ΠΈΠ· Π΅Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΎΠ³ΠΎΠ² (Noller et al., 1992), Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π΅Ρ‰Π΅ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‡Π΅Ρ€ΠΊΠΈΠ²Π°Π΅Ρ‚ Π²Π°ΠΆΠ½ΡƒΡŽ Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ этих Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ². ПослС образования ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»Ρ‹ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš (ΠΈΠ½Π°Ρ‡Π΅ Π½Π°Π·Ρ‹Π²Π°Π΅ΠΌΠΎΠ³ΠΎ «Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π°Ρ†ΠΈΠ΅ΠΉ Ρ‚Π ΠΠš»), ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ синтСза Π²ΠΎ ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΎΠΌ зависит ΠΎΡ‚ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Ρ€Π½Ρ‹Ρ… взаимодСйствий ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρƒ ΠΏΠ°Ρ€Π°ΠΌΠΈ оснований, ΠΈ Π΄Π°Π»ΡŒΠ½Π΅ΠΉΡˆΠΈΠΉ химичСский ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ· ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π±Ρ‹Ρ‚ΡŒ осущСствлСн прСдставитСлями «ΠΌΠΈΡ€Π° РНК» (Carter Π‘., 1993). Однако ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ самого синтСза Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš Ρ‚Ρ€Π΅Π±ΡƒΠ΅Ρ‚ участия Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ². Π­Ρ‚Π° ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ Π½Π°ΡΡ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ высока, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΡ€ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎ Π½Π° 10 ООО Π²Π΅Ρ€Π½Ρ‹Ρ… Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΉ аминоацилирования происходит лишь ΠΎΠ΄Π½Π° ΠΎΡˆΠΈΠ±ΠΎΡ‡Π½Π°Ρ (Yamane & Hopfield, 1977). РСакция, Π½Π° ΡΠ°ΠΌΠΎΠΌ Π΄Π΅Π»Π΅, базируСтся Π½Π° ΡΡ‚СрСоспСцифичСском ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠΈ ΠΌΠ΅ΠΆΠ΄Ρƒ синтСтазой, аминокислотой ΠΈ Ρ‚Π ΠΠš Π² Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ двухстадийного процСсса аминоацилирования:

1. aaRS + аа + АВР <-> aaRS (aa-AMP) + PPi.

2. aaRS (aa-AMP) + tRNA <-> aaRS + aa-tRNA + AMP.

Π’Π°ΠΊΠΈΠΌ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠΌ, ΠΏΠΎΠ½ΠΈΠΌΠ°Π½ΠΈΠ΅ структуры ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ° функционирования этих Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ Π΄Π°Ρ‚ΡŒ ΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚Ρ‹ Π½Π° ΠΌΠ½ΠΎΠ³ΠΈΠ΅ ΠΈΠ· Π²Π°ΠΆΠ½Ρ‹Ρ… вопросов, стоящих ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π΄ молСкулярной Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠ΅ΠΉ. А Π±Π»Π°Π³ΠΎΠ΄Π°Ρ€Ρ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Ρ€ΠΎΠ»ΠΈ aaRS Π² Ρ‚рансляции гСнСтичСского ΠΊΠΎΠ΄Π°, ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΡŽ синтСтаз ΠΈ ΠΈΡ… Ρ‚Π ΠΠš Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ Ρ€Π°ΡΡΠΌΠ°Ρ‚Ρ€ΠΈΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π² Ρ‚Ссной связи с ΠΏΡ€ΠΎΠ±Π»Π΅ΠΌΠΎΠΉ происхоТдСния ΠΆΠΈΠ·Π½ΠΈ (Schimmel Π ., 1991; Moras D., 1992).

ΠšΠ°ΠΆΠ΄Ρ‹ΠΉ Π±Π΅Π»ΠΎΠΊ спСцифичСн для ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠΉ аминокислоты ΠΈ ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ ΠΈΠ»ΠΈ Π½Π΅ΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΈΡ… ΠΈΠ·ΠΎΠ°ΠΊΡ†Π΅ΠΏΡ‚ΠΎΡ€Π½Ρ‹Ρ… Ρ‚Π ΠΠš (см. ΠΎΠ±Π·ΠΎΡ€Ρ‹ Delarue, 1995; Cusack, 1995, 1997; Arnez & Moras, 1997). Π’ Π½Π°ΡΡ‚оящСС врСмя Ρ‡Π΅Ρ‚ΠΊΠΎ ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Ρ‹ основныС взаимосвязи Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈ сСмСйства Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз. Π‘Ρ€Π°Π²Π½Π΅Π½ΠΈΠ΅ структур Π½Π° Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… уровнях — ΠΎΡ‚ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠΉ Π΄ΠΎ Ρ‚Ρ€Π΅Ρ‚ΠΈΡ‡Π½ΠΎΠΉ — позволяСт Ρ€Π°Π·Π΄Π΅Π»ΠΈΡ‚ΡŒ сСмСйство синтСтаз Π½Π° Π΄Π²Π° класса (Eriani et al., 1990), Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈ ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹Ρ… Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π°ΡŽΡ‚ 7 подклассов. Π’Π°ΠΆΠ½Π΅ΠΉΡˆΠΈΠΌ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡ΠΈΠ΅ΠΌ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π΄Π²ΡƒΡ… классов являСтся конСчная Ρ‚ΠΎΡ‡ΠΊΠ° аминоацилирования Π½Π° 3'-ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π²ΠΎΠΌ Π°Π΄Π΅Π½ΠΎΠ·ΠΈΠ½Π΅ Ρ‚Π ΠΠš: синтСтазы класса I ΠΏΡ€ΠΎΠΈΠ·Π²ΠΎΠ΄ΡΡ‚ присоСдинСниС ΠΏΠΎ 2'-Π³ΠΈΠ΄Ρ€ΠΎΠΊΡΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΠ΅ Ρ€ΠΈΠ±ΠΎΠ·Ρ‹, Ρ‚ΠΎΠ³Π΄Π° ΠΊΠ°ΠΊ синтСтазы класса П ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π½ΠΎΡΡΡ‚ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚ Π½Π° Π—'-гидроксил (Freist W., 1988). Π Π°Π·Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π½Π° Π΄Π²Π° класса подтвСрТдаСтся ΠΈ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Π°ΠΌΠΈ кристаллографичСских исслСдований, ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π²ΡˆΠΈΡ… Π΄Π²Π΅ Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Ρ… Π°Ρ€Ρ…ΠΈΡ‚Π΅ΠΊΡ‚ΡƒΡ€Ρ‹ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹Ρ… сайтов, которая остаСтся постоянной срСди практичСски всСх Ρ‡Π»Π΅Π½ΠΎΠ² ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ класса. Π‘ΠΎΠ»Π΅Π΅ Ρ‚ΠΎΠ³ΠΎ, Π² Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½Ρ‹Ρ… сайтах синтСтаз ΠΎΠ±Π½Π°Ρ€ΡƒΠΆΠ΅Π½Ρ‹ высоко консСрвативныС аминокислотныС ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΠΎΠ²Π°Ρ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ (Perona etal., 1991), ΠΈ ΠΈΡ… Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΄Π΅Π½Π° кинСтичСскими исслСдованиями ΠΌΡƒΡ‚Π°Π½Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² (Wilkinson et al., 1983).

ΠœΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ аминоацилирования являСтся ΡΡ‚ΠΎΠ»ΡŒ слоТным, ΠΏΠΎΡΠΊΠΎΠ»ΡŒΠΊΡƒ спСцифичноС ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠ΅ родствСнной Ρ‚Π ΠΠš, ΠΏΠΎ-Π²ΠΈΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠΌΡƒ, Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚ Π² ΡΠ΅Π±Ρ ΠΊΠΎΠ½Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠ°Ρ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹Π΅ пСрСстройки ΠΊΠ°ΠΊ самой синтСтазы, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ Ρ‚Π ΠΠš, происходящиС Π² Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ связывания ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π½ΠΎΡΠ° Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚Π°. Π₯отя Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΈΠ½ΡΡ‚Π²ΠΎ ΠΈΠ· ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π½Π° Π½Π°ΡΡ‚оящий дСнь структур ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‚ Π²Π°ΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ взаимодСйствия с Π°Π½Ρ‚ΠΈΠΊΠΎΠ΄ΠΎΠ½ΠΎΠ²Ρ‹ΠΌ Ρ‚Ρ€ΠΈΠΏΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΠΌ Ρ‚Π ΠΠš для Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π΅Π΅ ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΡ, Ρ€Π°Π·Π»ΠΈΡ‡Π½Ρ‹Π΅ aaRS Π²ΠΎΠ²Π»Π΅ΠΊΠ°ΡŽΡ‚ Π²ΠΎ Π²Π·Π°ΠΈΠΌΠΎΠ΄Π΅ΠΉΡΡ‚Π²ΠΈΠ΅ ΠΈ ΠΈΠ½Ρ‹Π΅ сайты Ρ‚Π ΠΠš, ΠΈΠ·ΠΌΠ΅Π½ΡΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ΡΡ ΠΎΡ‚ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π° ΠΊ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Ρƒ (Carter Π‘., 1993). Π’ΠΈΠ΄ΠΈΠΌΠΎ, Ρ‚Π ΠΠš-ΡΠ²ΡΠ·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½Ρ‹ Π±Ρ‹Π»ΠΈ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΏΠΎΠ΄Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΅Π½Ρ‹ ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½Ρ‹ΠΌ измСнСниям, Π½Π΅ΠΆΠ΅Π»ΠΈ каталитичСскиС. Π’ΠΎ Π΅ΡΡ‚ΡŒ, Π΄Π²Π΅ каталитичСскиС Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΈ синтСтаз — активация аминокислоты ΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Π½ΠΎΡ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚Π° Π½Π° ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»Ρƒ Ρ‚Π ΠΠš — ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π»ΠΈ ΠΈ Ρ€Π°Π·Π²ΠΈΠ²Π°Π»ΠΈΡΡŒ Π² Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΡ‚Π΅Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ ΠΌΠ΅Ρ€Π΅ нСзависимо Π΄Ρ€ΡƒΠ³ ΠΎΡ‚ Π΄Ρ€ΡƒΠ³Π°.

Π€Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаза — Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΊΡ€ΡƒΠΏΠ½Ρ‹ΠΉ ΠΈ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½Ρ‹ΠΉ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ Π³Ρ€ΡƒΠΏΠΏΡ‹, ΠΏΡ€ΠΈΠ½Π°Π΄Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΠΉ ΠΊΠΎ II классу ΠΈ ΠΎΠ±Ρ‹Ρ‡Π½ΠΎ выдСляСмый Π² ΠΎΡ‚Π΄Π΅Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΉ подкласс d. Π•Π³ΠΎ ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ‡Π½Π°Ρ организация (сф)2 Π±Ρ‹Π»Π° установлСна для Π±Π΅Π»ΠΊΠ°, Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· Thermus thermophilus НВ8 (Mosyak et al., 1995). ΠšΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΡ‚ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΠΈΠΉ Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½, Ρ…Π°Ρ€Π°ΠΊΡ‚Π΅Ρ€Π½Ρ‹ΠΉ для синтСтаз II класса, Π²Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π² Π°-ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Ρ‹ (350 аминокислотных остатков), Π° Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ крупная Π -ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Π° (785 аминокислотных остатков) Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚, ΠΏΠΎΠΌΠΈΠΌΠΎ ΠΏΡ€ΠΎΡ‡ΠΈΡ…, Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½, структурно вСсьма схоТий с ΠΊΠ°Ρ‚алитичСским, Π½ΠΎ Π½Π΅ ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΉ каталитичСской Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ. Наряду с ΡΡ‚ΠΈΠΌ, Π -ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ†Π° Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚ ΠΈ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΈΠ΅ элСмСнты, Π² Ρ‚ΠΎΠΌ числС ΠΎΠ»ΠΈΠ³ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄-ΡΠ²ΡΠ·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‰ΠΈΠΉ Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½ ΠΈ Ρ€ΠΈΠ±ΠΎΠ½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΠΏΡ€ΠΎΡ‚Π΅ΠΈΠ΄Π½Ρ‹ΠΉ Π΄ΠΎΠΌΠ΅Π½. Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° PheRS Π² ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ΅ с Ρ‚Π ΠΠšΠ Π¬Π΅ установлСна ΠΏΡ€ΠΈ Π½ΠΈΠ·ΠΊΠΎΠΌ Ρ€Π°Π·Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΈ (Goldgur et al., 1997). Π’ Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ Π°Π½Π°Π»ΠΈΠ·Π° этих структурных Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… Π±Ρ‹Π» продСмонстрирован Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ‹Ρ‡Π½Ρ‹ΠΉ способ связывания Ρ‚Π ΠΠš, Π² ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΌ ΠΏΡ€ΠΈΠ½ΠΈΠΌΠ°ΡŽΡ‚ участиС ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ²Ρ€Π΅ΠΌΠ΅Π½Π½ΠΎ ΠΎΠ±Π° Π³Π΅Ρ‚Π΅Ρ€ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π° Π±Π΅Π»ΠΊΠ°.

Π’ΠΎΠΎΠ±Ρ‰Π΅, Ρ‚Ρ€ΠΈ аспСкта изучСния Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз ΠΏΡ€Π΅Π΄ΡΡ‚Π°Π²Π»ΡΡŽΡ‚ особый интСрСс. Π­Ρ‚ΠΎ — ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹ спСцифичСского узнавания ΠΈ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π°Ρ†ΠΈΠΈ ΡΠΎΠΎΡ‚Π²Π΅Ρ‚ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‰Π΅ΠΉ аминокислоты, ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠ΅ ΠΈ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ Ρ‚Π ΠΠš ΠΈ, Π½Π°ΠΊΠΎΠ½Π΅Ρ†, ΡΠ²ΠΎΠ»ΡŽΡ†ΠΈΡ ΠΈ Π΄ΠΈΠ²Π΅Ρ€Π³Π΅Π½Ρ†ΠΈΡ 20 ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»-синтСтаз ΠΎΡ‚ Π΄Ρ€Π΅Π²Π½ΠΈΡ… ΠΏΡ€Π΅Π΄ΡˆΠ΅ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½ΠΈΠΊΠΎΠ². ΠžΡ‚Π²Π΅Ρ‚Ρ‹ Π½Π° ΡΡ‚ΠΈ вопросы способна Π΄Π°Ρ‚ΡŒ атомная структура ΠΊΠ°ΠΊ самих синтСтаз, Ρ‚Π°ΠΊ ΠΈ ΠΈΡ… ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠΎΠ² с Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΌΠΈ субстратами.

ЦСль ΠΈ Π·Π°Π΄Π°Ρ‡ΠΈ: ЦСль исслСдования — ΡƒΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½ΡƒΡŽ структуру Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы Π² ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ΅ с Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹ΠΌ Π»ΠΈΠ³Π°Π½Π΄ΠΎΠΌ — Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚ΠΎΠΌ — ΠΈ Π²Ρ‹ΡΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ молСкулярныС ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΠ΅ Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ распознавания субстратов ΠΈ ΠΏΡ€ΠΎΡ…оТдСния ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠ³ΠΎ этапа Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования.

Для достиТСния поставлСнной Ρ†Π΅Π»ΠΈ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎ Π±Ρ‹Π»ΠΎ Ρ€Π΅ΡˆΠΈΡ‚ΡŒ ΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π·Π°Π΄Π°Ρ‡ΠΈ:

1. Найти способ прСодолСния нСвозмоТности протСкания Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования Π² ΠΊΡ€ΠΈΡΡ‚Π°Π»Π»Π°Ρ… Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΉ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы, Ρ‡Ρ‚ΠΎ связано с ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ствиСм Π² ΠΌΠ°Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠΌ Π±ΡƒΡ„Π΅Ρ€Π΅ высокой ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π°Ρ†ΠΈΠΈ соли аммония, с ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠΉ стороны Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠ³ΠΎ для стабилизации кристаллов, Π° Ρ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΎΠΉ — ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ строго Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠ΅ для Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ взаимодСйствиС с ΠΈΠΎΠ½Π°ΠΌΠΈ магния.

2. ΠŸΡ€ΠΎΠ²Π΅Π΄Ρ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΡƒΡŽ ΡΡ‚Π°Π΄ΠΈΡŽ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ Π² ΠΊΡ€ΠΈΡΡ‚Π°Π»Π»Π°Ρ… Π½Π°Ρ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΉ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы, ΡƒΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΡ€ΠΎΡΡ‚Ρ€Π°Π½ΡΡ‚Π²Π΅Π½Π½ΡƒΡŽ структуру ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Π°Π²ΡˆΠ΅Π³ΠΎΡΡ комплСкса ΠΏΡ€ΠΈ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ большСм Ρ€Π°Π·Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΈ.

3. На ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ…, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ² ΠΏΡ€Π΅Π΄Ρ‹Π΄ΡƒΡ‰ΠΈΡ… исслСдований ΡƒΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ молСкулярныС ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΠ΅ Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ„Π°Π·Ρ‹ ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΠΎΠΉ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ, ΠΎΠ±ΡŠΡΡΠ½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ Π² Π½ΠΈΡ… ΠΊΠ°Ρ‚ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² Mg2+, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ ΠΎΠ±ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π²Ρ‹ΡΠΎΠΊΡƒΡŽ ΡΠΏΠ΅Ρ†ΠΈΡ„ΠΈΡ‡Π½ΠΎΡΡ‚ΡŒ распознавания субстратов ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ„Π°Π·Ρ‹ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ — ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ» АВЀ ΠΈ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½Π°.

Научная Π½ΠΎΠ²ΠΈΠ·Π½Π°. Π’ Ρ…ΠΎΠ΄Π΅ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π΄ΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π½Π° Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΡŒ ΡƒΡΠΏΠ΅ΡˆΠ½ΠΎΠ³ΠΎ прохоТдСния Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования Π² ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ствии ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² Mn2+, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ установлСна структура Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы Π² ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ΅ с Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚ΠΎΠΌ, ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠΌ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ стадии ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΠΎΠΉ этим Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠΌ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ. Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π° ΠΏΡ€ΠΈ высоком Ρ€Π°Π·Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΈ 2.6 А, Ρ‡Ρ‚ΠΎ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΠΈΠ»ΠΎ ΡƒΡΡ‚Π°Π½ΠΎΠ²ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΡ‹, Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΠ΅ Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ высокоспСцифичСского распознавания Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠΌ субстратов — АВЀ ΠΈ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½Π°.

2+ 9.

ВыявлСно присутствиС Π² ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π΅ ΠΊΠ°Ρ‚ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² Мп ΠΈ Π°Π½ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² S04 Π²Ρ‹Π΄Π²ΠΈΠ½ΡƒΡ‚Π° Π³ΠΈΠΏΠΎΡ‚Π΅Π·Π° ΠΎΠ± ΠΈΡ… Ρ€ΠΎΠ»ΠΈ Π² Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»ΠΎΠ²ΠΎΠΉ систСмы, стабилизации пространствСнной структуры Π³Π΅Ρ‚Π΅Ρ€ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠ΅Ρ€Π½ΠΎΠ³ΠΎ Π±Π΅Π»ΠΊΠ° ΠΈ, Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎ, спСцифичСском связывании с Π”ΠΠš.

На ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ структурных Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Ρ… установлСна молСкулярная схСма прохоТдСния ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ стадии Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования.

ΠŸΡ€Π°ΠΊΡ‚ΠΈΡ‡Π΅ΡΠΊΠ°Ρ Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒ. Π‘ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΎΠΉ практичСской Π·Π½Π°Ρ‡ΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ ΠΎΠ±Π»Π°Π΄Π°ΡŽΡ‚ исслСдования ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ² всСх этапов синтСза Π±Π΅Π»ΠΊΠ°, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ структуры ΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»ΡΡ€Π½Ρ‹Ρ… ΠΏΡ€ΠΈΠ½Ρ†ΠΈΠΏΠΎΠ² функционирования Π²ΠΎΠ²Π»Π΅Ρ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Π² ΡΡ‚ΠΎΡ‚ процСсс Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ². Π Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ ΠΏΠΎΠ΄ΠΎΠ±Π½Ρ‹Ρ… Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ Π½Π΅ Ρ‚ΠΎΠ»ΡŒΠΊΠΎ ΡΠΏΠΎΡΠΎΠ±ΡΡ‚Π²ΡƒΡŽΡ‚ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Π³Π»ΡƒΠ±ΠΎΠΊΠΎΠΌΡƒ пониманию ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΈΠ· Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ Ρ„ΡƒΠ½Π΄Π°ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… ΠΆΠΈΠ·Π½Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… процСссов, Π½ΠΎ ΠΈ ΠΏΠΎΠΌΠΎΠ³Π°ΡŽΡ‚ ΠΌΠΎΠ΄ΡƒΠ»ΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ Π΅Π³ΠΎ, ΡΠΎΠ·Π΄Π°Π²Π°Ρ‚ΡŒ Π°Π½Ρ‚ΠΈΠ±ΠΈΠΎΡ‚ΠΈΠΊΠΈ, спСцифичСски ΠΈΠ½Π³ΠΈΠ±ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰ΠΈΠ΅ Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ²Ρ‹ΠΉ синтСз. ΠœΠ½ΠΎΠ³ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΈΠ΅ Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΉ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаз — Π² Ρ‚ΠΎΠΌ числС, рСгуляторных, — позволяСт Π³ΠΎΠ²ΠΎΡ€ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΈ ΠΎ Π²ΠΎΠ·ΠΌΠΎΠΆΠ½ΠΎΡΡ‚ΠΈ использования ΠΈΡ… Π² Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΈ самых Ρ€Π°Π·Π½ΠΎΠΎΠ±Ρ€Π°Π·Π½Ρ‹Ρ… Π·Π°Π΄Π°Ρ‡, связанных с Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΡΡ‚ΡŒΡŽ рСгуляции Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈΠΊΠ»Π΅Ρ‚ΠΎΡ‡Π½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π±ΠΎΠ»ΠΈΠ·ΠΌΠ°. Π‘ Π΄Ρ€ΡƒΠ³ΠΎΠΉ стороны, отсутствиС Ρ‡Π΅Ρ‚ΠΊΠΈΡ… Π·Π½Π°Π½ΠΈΠΉ ΠΎ ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π΅, ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠ°Ρ… рСгуляции ΠΈ Ρ„ункционирования этих Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π½Π΅ ΠΏΠΎΠ·Π²ΠΎΠ»ΡΡŽΡ‚ ΠΏΠΎΠΊΠ° Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎ ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Ρ‚ΡŒ эти возмоТности Π² ΠΌΠ΅Π΄ΠΈΡ†ΠΈΠ½ΡΠΊΠΈΡ… цСлях.

ΠžΡΠΎΠ±Ρ‹ΠΉ интСрСс ΠΏΡ€ΠΈ этом прСдставляСт собой Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаза, ΠΎΠ΄ΠΈΠ½ ΠΈΠ· Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΊΡ€ΡƒΠΏΠ½Ρ‹Ρ… ΠΈ ΡΠ»ΠΎΠΆΠ½Ρ‹Ρ… Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² Π΄Π°Π½Π½ΠΎΠ³ΠΎ класса, для ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ³ΠΎ продСмонстрировано спСцифичСскоС связываниС с ΠΎΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π½Ρ‹ΠΌΠΈ участками Π”ΠΠš, располоТСнными Π² Ρ€Π°ΠΉΠΎΠ½Π΅ 5-ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π° Π³Π΅Π½Π° pheST, ΠΊΠΎΠ΄ΠΈΡ€ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ этот Π±Π΅Π»ΠΎΠΊ (Lechler & Kreutzer, 1998), осущСствляя Π°Π²Ρ‚ΠΎΡ€Π΅Π³ΡƒΠ»ΡΡ†ΠΈΡŽ транскрипции. НСкоторыС Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ говорят ΠΈ Π² ΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·Ρƒ возмоТности участия этого Π±Π΅Π»ΠΊΠ° Π² Ρ€Π°ΠΊΠΎΠ²Ρ‹Ρ… процСссах, Ρ‡Ρ‚ΠΎ Π΅Ρ‰Π΅ Π±ΠΎΠ»Π΅Π΅ ΠΏΠΎΠ²Ρ‹ΡˆΠ°Π΅Ρ‚ Π·Π½Π°Ρ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ Π΄Π΅Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ изучСния ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌΠΎΠ², Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΡ… Π² ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ функционирования этого Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°.

Π’ ΡΠ²ΡΠ·ΠΈ с ΡΡ‚ΠΈΠΌ, Ρ†Π΅Π»ΡŒΡŽ настоящСй Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ явилось установлСниС пространствСнной структуры комплСкса Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы с.

V Πž 1 ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠΌ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ стадии ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·ΠΈΡ€ΡƒΠ΅ΠΌΠΎΠΈ Сю Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ — Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚ΠΎΠΌ. На ΠΎΡΠ½ΠΎΠ²Π΅ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Π½Ρ‹Ρ… Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ² ΠΌΡ‹ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π»ΠΈ Π½Π°ΠΈΠ±ΠΎΠ»Π΅Π΅ вСроятный ΠΌΠ΅Ρ…Π°Π½ΠΈΠ·ΠΌ спСцифичСского распознавания субстратов, АВЀ ΠΈ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½Π°, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ прохоТдСния ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠ³ΠΎ этапа Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования.

ΠœΠ΅ΡΡ‚ΠΎ выполнСния Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹. Π Π°Π±ΠΎΡ‚Π° Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½Π° Π½Π° ΠΊΠ°Ρ„Π΅Π΄Ρ€Π΅ ΠΌΠΈΠΊΡ€ΠΎΠ±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ Казанского государствСнного унивСрситСта. Ряд ΡΠΊΡΠΏΠ΅Ρ€ΠΈΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°Π»ΡŒΠ½Ρ‹Ρ… исслСдований (Π²Ρ‹Π΄Π΅Π»Π΅Π½ΠΈΠ΅ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы, ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½ΠΈΠ΅ кристаллов Π±Π΅Π»ΠΊΠ° ΠΈ ΠΊΠΎΠΌΠΏΠ»Π΅ΠΊΡΠ°) Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½Π΅Π½Ρ‹ Π½Π° ΠΊΠ°Ρ„Π΅Π΄Ρ€Π΅ структурной Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ Π˜Π½ΡΡ‚ΠΈΡ‚ΡƒΡ‚Π° Π’Π°ΠΉΡ†ΠΌΠ°Π½Π° (Π³. Π Π΅Ρ…ΠΎΠ²ΠΎΡ‚, Π˜Π·Ρ€Π°ΠΈΠ»ΡŒ).

Апробация Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹. ΠžΡΠ½ΠΎΠ²Π½Ρ‹Π΅ Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π΄ΠΎΠ»ΠΎΠΆΠ΅Π½Ρ‹ Π½Π° II ΠΈ IV Π½Π°ΡƒΡ‡Π½Ρ‹Ρ… конфСрСнциях ΠΌΠΎΠ»ΠΎΠ΄Ρ‹Ρ… ΡƒΡ‡Π΅Π½Ρ‹Ρ…, аспирантов ΠΈ ΡΡ‚ΡƒΠ΄Π΅Π½Ρ‚ΠΎΠ² «ΠœΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»Ρ‹ ΠΈ Ρ‚Π΅Ρ…Π½ΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ XXI Π²Π΅ΠΊΠ°» (Казань, 2001, 2003), Π½Π° III съСздС биохимичСского общСства (Π‘Π°Π½ΠΊΡ‚-ΠŸΠ΅Ρ‚Π΅Ρ€Π±ΡƒΡ€Π³, 2002), Π½Π° ΠΎΡ‚Ρ‡Π΅Ρ‚Π½Ρ‹Ρ… Π½Π°ΡƒΡ‡Π½ΠΎ-практичСских конфСрСнциях ΠΊΠ°Ρ„Π΅Π΄Ρ€Ρ‹ Π‘Ρ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π½ΠΎΠΉ Π±ΠΈΠΎΠ»ΠΎΠ³ΠΈΠΈ унивСрситСта Π’Π°ΠΉΡ†ΠΌΠ°Π½Π° (Π Π΅Ρ…ΠΎΠ²ΠΎΡ‚, Π˜Π·Ρ€Π°ΠΈΠ»ΡŒ, 2000, 2001).

ΠŸΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠ°Ρ†ΠΈΠΈ. По Ρ‚Π΅ΠΌΠ΅ настоящСй диссСртации ΠΎΠΏΡƒΠ±Π»ΠΈΠΊΠΎΠ²Π°Π½Ρ‹ 4 Π½Π°ΡƒΡ‡Π½Ρ‹Π΅ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹. Из Π½ΠΈΡ… 1 — Π² Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ Π·Π°Ρ€ΡƒΠ±Π΅ΠΆΠ½ΠΎΠΉ ΠΏΠ΅Ρ‡Π°Ρ‚ΠΈ, 2 прСдставлСны Π² ΡΠ±ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΊΠ΅ тСзисов Π΄ΠΎΠΊΠ»Π°Π΄ΠΎΠ² российских ΠΊΠΎΠ½Ρ„Π΅Ρ€Π΅Π½Ρ†ΠΈΠΉ ΠΈ 1 — Π² ΡΠ±ΠΎΡ€Π½ΠΈΠΊΠ΅ тСзисов ΠΎ Π½Π°ΡƒΡ‡Π½ΠΎ-практичСских Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Π°Ρ… Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚Ρ‹ Π»Π°Π±ΠΎΡ€Π°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΈΠΉ синхротрона NSLS (БША).

ОбъСм ΠΈ ΡΡ‚Ρ€ΡƒΠΊΡ‚ΡƒΡ€Π° диссСртации. ДиссСртация ΠΈΠ·Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Π° Π½Π° 98 страницах машинописного тСкста, содСрТит 4 Ρ‚Π°Π±Π»ΠΈΡ†Ρ‹, 14 рисунков, Π²ΠΊΠ»ΡŽΡ‡Π°Π΅Ρ‚ Π²Π²Π΅Π΄Π΅Π½ΠΈΠ΅, ΠΎΠ±Π·ΠΎΡ€ Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹, описаниС ΠΌΠ°Ρ‚Π΅Ρ€ΠΈΠ°Π»ΠΎΠ² ΠΈ ΠΌΠ΅Ρ‚ΠΎΠ΄ΠΎΠ² исслСдования, ΠΈΡ… Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Ρ‹, обсуТдСниС Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚ΠΎΠ², Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹ ΠΈ ΡΠΏΠΈΡΠΎΠΊ Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹.

Бписок Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹

содСрТит 135 источников, ΠΈΠ· Π½ΠΈΡ… 132 Π·Π°Ρ€ΡƒΠ±Π΅ΠΆΠ½Ρ‹Ρ….

Π²Ρ‹Π²ΠΎΠ΄Ρ‹.

1. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ для Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы ΠΈΠ· Thermus thermophilics Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ ΡΠ»Π΅ΠΊΡ‚Ρ€ΠΎΡ„ΠΈΠ»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΠ°Ρ‚Π°Π»ΠΈΠ·Π°Ρ‚ΠΎΡ€Π° Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ способны Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡ‚ΡŒ ΠΊΠ°Ρ‚ΠΈΠΎΠ½Ρ‹ ΠΌΠ°Ρ€Π³Π°Π½Ρ†Π°. Π—Π°ΠΌΠ΅Π½Π° Π² Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π½ΠΎΠΉ смСси ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² Mg2+ Π½Π° ΠΈΠΎΠ½Ρ‹ Мп2+ позволяСт ΠΏΡ€ΠΎΠ²ΠΎΠ΄ΠΈΡ‚ΡŒ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΡƒΡŽ ΡΡ‚Π°Π΄ΠΈΡŽ Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования Π² ΠΏΡ€ΠΈΡΡƒΡ‚ствии ΡΡƒΠ»ΡŒΡ„Π°Ρ‚Π° аммония, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ являСтся строго Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΡ‹ΠΌ для сохранСния кристаллов PheRS.

2. Π’ΠΏΠ΅Ρ€Π²Ρ‹Π΅ ΠΏΠΎΠ»ΡƒΡ‡Π΅Π½Ρ‹ кристаллы Ρ„ΡƒΠ½ΠΊΡ†ΠΈΠΎΠ½Π°Π»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ комплСкса Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы с ΠΏΡ€ΠΎΠ΄ΡƒΠΊΡ‚ΠΎΠΌ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ„Π°Π·Ρ‹ аминоацилирования — Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚ΠΎΠΌ. Π‘ΠΎΠ±Ρ€Π°Π½Ρ‹ Π΄Π°Π½Π½Ρ‹Π΅ рСнтгСноструктурной Π΄ΠΈΡ„Ρ€Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ Π½Π° ΠΊΡ€ΠΈΡΡ‚Π°Π»Π»Π°Ρ… ΠΈ ΠΏΠΎΠ΄Ρ‚Π²Π΅Ρ€ΠΆΠ΄Π΅Π½ΠΎ Π²ΠΎΠ·Π½ΠΈΠΊΠ½ΠΎΠ²Π΅Π½ΠΈΠ΅ комплСкса PheRS-Phe-AMP.

3. ΠžΠΏΡ€Π΅Π΄Π΅Π»Π΅Π½Π° пространствСнная структура комплСкса ΠΏΡ€ΠΈ Ρ€Π°Π·Ρ€Π΅ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠΈ Π΄ΠΎ 2,6 А. Показано, Ρ‡Ρ‚ΠΎ свСрхспСцифичСскоС ΡƒΠ·Π½Π°Π²Π°Π½ΠΈΠ΅ Ρ„Π΅Π½ΠΎΠ»ΡŒΠ½ΠΎΠΉ части Π² ΡΠΎΡΡ‚Π°Π²Π΅ Phe-AMP происходит Π² Ρ€Π΅Π·ΡƒΠ»ΡŒΡ‚Π°Ρ‚Π΅ взаимодСйствия Ρ„Π΅Π½ΠΎΠ»ΡŒΠ½ΠΎΠ³ΠΎ ΠΊΠΎΠ»ΡŒΡ†Π° с Π΄Π²ΡƒΠΌΡ Π±Π»ΠΈΠ·Π»Π΅ΠΆΠ°Ρ‰ΠΈΠΌΠΈ консСрвативными аминокислотными остатками Π² Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΌ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π΅ Ρ„Π΅Ρ€ΠΌΠ΅Π½Ρ‚Π°, Phea258 ΠΈ Phea260, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ Π·Π° ΡΡ‡Π΅Ρ‚ стСричСских особСнностСй строСния субстрат-ΡΠ²ΡΠ·Ρ‹Π²Π°ΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ «ΠΏΠ°ΠΊΠ΅Ρ‚Π°».

4. Π’ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΌ сайтС Π½Π΅ ΠΎΠ±Π½Π°Ρ€ΡƒΠΆΠ΅Π½ΠΎ ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² ΠΌΠ°Ρ€Π³Π°Π½Ρ†Π°Ρ€ΠΎΠ»ΡŒ ΠΊΠ°Ρ‚ΠΈΠΎΠ½ΠΎΠ² ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π»Π»Π° Π² ΡΡ‚Π°Π±ΠΈΠ»ΠΈΠ·Π°Ρ†ΠΈΠΈ Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΠΎΠ³ΠΎ для Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ ΠΏΠ΅Ρ€Π΅Ρ…ΠΎΠ΄Π½ΠΎΠ³ΠΎ состояния АВЀ Π²Ρ‹ΠΏΠΎΠ»Π½ΡΡŽΡ‚ остатки полярных аминокислот ΠΈ ΠΌΠΎΠ»Π΅ΠΊΡƒΠ»Ρ‹ Π²ΠΎΠ΄Ρ‹, связанныС Π² Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΌ сайтС. РасчСт аномальной ΠΊΠ°Ρ€Ρ‚Ρ‹ Π€ΡƒΡ€ΡŒΠ΅ ΠΏΠΎΠΊΠ°Π·Π°Π» присутствиС ΠΈΠΎΠ½Π° ΠΌΠ΅Ρ‚Π°Π»Π»Π° Π½Π° ΠΈΠ½Ρ‚СрфСйсС Π°ΠΈ Ρ€-ΡΡƒΠ±ΡŠΠ΅Π΄ΠΈΠ½ΠΈΡ† Π±Π΅Π»ΠΊΠ°, поблизости ΠΎΡ‚ Π²Ρ‹ΡΠΎΠΊΠΎ консСрвативного ΠΌΠΎΡ‚ΠΈΠ²Π° 3, ΠΏΡ€ΠΈΠ½ΠΈΠΌΠ°ΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ участиС Π² Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΠΈΡ€ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠΈ Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ²ΠΎΠ³ΠΎ комплСкса. На ΠΏΠΎΠ²Π΅Ρ€Ρ…ности Π±Π΅Π»ΠΊΠ° ΠΎΠ±Π½Π°Ρ€ΡƒΠΆΠ΅Π½ Π°Π½ΠΈΠΎΠ½ S042″, ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€Ρ‹ΠΉ ΠΌΠΎΠΆΠ΅Ρ‚ ΡΠ»ΡƒΠΆΠΈΡ‚ΡŒ ΠΎΠ΄Π½ΠΈΠΌ ΠΈΠ· ΠΌΠ΅Π΄ΠΈΠ°Ρ‚ΠΎΡ€ΠΎΠ² взаимодСйствия синтСтазы с Π”ΠΠš.

5. ΠŸΡ€Π΅Π΄Π»ΠΎΠΆΠ΅Π½Π° ΠΏΡ€ΠΈΠ½Ρ†ΠΈΠΏΠΈΠ°Π»ΡŒΠ½Π°Ρ схСма прохоТдСния Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ†ΠΈΠΈ аминоацилирования для PheRS, Π² Ρ€Π°ΠΌΠΊΠ°Ρ… ΠΊΠΎΡ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΉ связываниС Π½Π΅Π±ΠΎΠ»ΡŒΡˆΠΈΡ… Ρ€Π΅Π°ΠΊΡ‚Π°Π½Ρ‚ΠΎΠ² — Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ½Π° ΠΈ ΠΠ’Π€, Π° Ρ‚Π°ΠΊΠΆΠ΅ ΡƒΡΠΏΠ΅ΡˆΠ½ΠΎΠ΅ Π·Π°Π²Π΅Ρ€ΡˆΠ΅Π½ΠΈΠ΅ ΠΏΠ΅Ρ€Π²ΠΎΠΉ Ρ„Π°Π·Ρ‹ аминоацилирования ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Π°Π΄Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Ρ‚Π° Π² Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠΌ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π΅ синтСтазы являСтся Π½Π΅ΠΎΠ±Ρ…ΠΎΠ΄ΠΈΠΌΡ‹ΠΌ условиСм для ΠΏΠΎΡΠ»Π΅Π΄ΡƒΡŽΡ‰Π΅Π³ΠΎ эффСктивного взаимодСйствия с Ρ‚Π ΠΠšΠ Π¬Π΅. Π’ Ρ€Π°ΠΌΠΊΠ°Ρ… этого взаимодСйствия ΠΈ ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΡ Ρ‚Ρ€ΠΎΠΉΠ½ΠΎΠ³ΠΎ комплСкса PheRS-Phe-AMP-TPHKFhe Π²Π·Π°ΠΈΠΌΠ½ΠΎΠ΅ располоТСниС участников Π²Ρ‚ΠΎΡ€ΠΎΠΉ стадии аминоацилирования Π²Π½ΡƒΡ‚Ρ€ΠΈ Π°ΠΊΡ‚ΠΈΠ²Π½ΠΎΠ³ΠΎ Ρ†Π΅Π½Ρ‚Ρ€Π° Π±Π΅Π»ΠΊΠ° стабилизируСтся ΠΎΠ±Ρ€Π°Π·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ Π΄Π²ΡƒΡ… ароматичСских «Ρ‚Ρ€ΠΈΠ°Π΄».

ΠŸΠΎΠΊΠ°Π·Π°Ρ‚ΡŒ вСсь тСкст

Бписок Π»ΠΈΡ‚Π΅Ρ€Π°Ρ‚ΡƒΡ€Ρ‹

  1. И. А., Анкилова Π’. Н., Π›Π°Π²Ρ€ΠΈΠΊ О. И., ΠœΠΎΠΎΡ€ Н. А. ВзаимодСйствиС Ρ„Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтазы Thermus thermophilus с Π—'-ΠΊΠΎΠ½Ρ†Π΅Π²Ρ‹ΠΌ Π½ΡƒΠΊΠ»Π΅ΠΎΡ‚ΠΈΠ΄ΠΎΠΌxPHKPhe Биохимия? 2000, Π’. 65, Π‘. 13 681 379.
  2. К.А., ΠœΠΎΠΎΡ€ Н. А., Анкилова Π’. Н., Π›Π°Π²Ρ€ΠΈΠΊ О. И. Π€Π΅Π½ΠΈΠ»Π°Π»Π°Π½ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš-синтСтаза взаимодСйствуСт с Π”ΠΠš: исслСдованиС активности с ΠΈΡΠΏΠΎΠ»ΡŒΠ·ΠΎΠ²Π°Π½ΠΈΠ΅ΠΌ дСзоксирибоолигонуклСотидов. Биохимия. 2000. Π’. 65. Π‘. 515−521.
  3. Π›.Π›., Π€Π°Π²ΠΎΡ€ΠΎΠ²Π° О. О., Π›Π°Π²Ρ€ΠΈΠΊ О. И. БиосинтСз Π±Π΅Π»ΠΊΠΎΠ² ΠΎΡ‚ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠΊΠΈΡΠ»ΠΎΡ‚ Π΄ΠΎ Π°ΠΌΠΈΠ½ΠΎΠ°Ρ†ΠΈΠ»-Ρ‚Π ΠΠš. 1984. Москва. Изд-Π²ΠΎ Наука. 408 с.
  4. Aberg A., Yaremchuk A., Tukalo М., Rasmussen Π’., Cusack S. Crystal structure analysis of activation of histidine by Thermus thermophilus histidine-tRNA synthetase. //Biochem. 1997. — Vol. 36. — P. 3084−3094.
  5. Airas K.R. Differences in the magnesium dependences of the class I and class II aminoacyl-tRNA synthetases from E.coli. II Eur. J. Biochem. -1996.-Vol. 240.-P. 223−231.
  6. Ankilova V.N., Reshetnikova L.S., Chernaya M.M., Lavrik O.I. Phenylalanyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus HB8: purification and properties of the crystallizing enzyme. // FEBS Lett. 1988. -Vol. 227.-P. 9−13.
  7. Arnez J.G., Augustine J., Moras D., Franklyn C.S. The first step in aminoacylation st the atomic level in histidine-tRNA synthetase. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997. — Vol. 94. — P. 7144−7149.
  8. Arnez J., Dock-Bregeon A.-C., Moras D. Glycyl-tRNA Synthetase Uses a. Negatively Charged Pit for Specific Recognition and Activation of Glycine.
  9. J. Mol. Biol. 1999. — Vol. 286. — P. 1449−1459.
  10. Logan D., Mazauric M.-H., Kern D., Moras D., Crystal structure of glycyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus // EMBO J. 1995. — Vol. 14.-P. 4156−4167.
  11. Arnez J.G. and Moras D. Structural and functional considerations of the aminoacylation reaction. // Trends Biochem. Sci. 1997. — Vol.22. -P. 189−232.
  12. Artymiuk P. J., Rice D. W., Poirette A.R., Willet P. A tale of two synthetases. // Nature Struct. Biol. 1994. — Vol. 1. — P. 758−760.
  13. Belrhali H., Yaremchuk A., Tukalo M., Berthet-Colominas C., Rasmussen Π’., Bosecke P., Diat O., Cusack S. The structural basis for seryl-adenylate and Ap4A synthesis by seryl-tRNA synthetase. // Structure 1995. — Vol. 3. -P. 341−352.
  14. Biou V., Yaremchuk A., Tukalo M., Cusack, S. The 2,9 A Crystal Structure of T. thermophilus Seryl-tRNA Synthetase Complexed with tRNA (Ser). // Science 1994. — Vol. 263. — P. 1404−1410.
  15. Blow D.M., Bhat T.N., Metcalfe A., Risler J.L., Brunie S. Structural homology in the amino-terminal domains of two aminoacyl-tRNA synthetases. // JMB 1983. — Vol. 171. — P. 571−576.
  16. Bochkarev A., Pfuetzner R., Edwards A., Frappier L Structure of the single-stranded-DNA-binding domain of replication protein A bound to DNA. // Nature 1997. — Vol. 385.-P. 176−181.
  17. Bock A., Forchhammer K., Heider J., Baron Π‘ Selenoprotein synthesis: an expansion of the genetic code. // Trends Biol. Sci. 1991. — Vol. 16.1. P. 463−467.
  18. Branden Π‘. and Tooze J. in Introduction to protein structure. 1991, New York, Garland.
  19. Brick P. and Blow D. Crystal structure of a deletion mutant of tyrosyl-tRNA synthetase complexed with tyrosine. // JMB 1987. — Vol. 194. — P. 287 297.
  20. Brick P., Bhat Π’., Blow D. Structure of tyrosyl-tRNA synthetase refined at 2.3 A resolution: interaction of the enzyme with the tyrosyl adenylate. // JMB 1988. — Vol. 208. — P. 83−98.
  21. Brown J. and Doolittle W. Root of the universal tree of life based on ancient aminoacyl-tRNA synthetase gene duplications. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. — Vol. 92. — P. 2441−2445.
  22. Brown J., Doolittle W. Archaea and the prokaryote-to-eukaryote transition. // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 1997. — Vol. 61. — P. 456−502.
  23. Brown J., Zhang J., Hodgson J. A bacterial antibiotic resistance gene with eukaryotic origins. // Π‘ΡˆΡ‚. Biol. 1998. — Vol. 8. — P. 365−367.
  24. Burbaum J.J., Starzyk R.M., Shimmel P. Understanding structural relationships in proteins of unsolved three-dimensional structure. // Proteins: Struct. Func. Genet. 1990. — Vol. 7. — P. 99−111.
  25. Burbaum J.J. and Shimmel P. Structural relationships and the classification of aminoacyl-tRNA synthetases. // J. Biol. Chem. 1991. — Vol. 266. -P. 16 965−16 968.
  26. Bycroft M., Hubbard Π’., Proctor M., Freund S., Murzin A. The solution structure of the SI RNA binding domain: a member of an ancient nucleic acid-binding fold. // Cell 1997. — Vol. 88. — P. 235−242.-Vol. Π—.-Π . 39−44.
  27. Cusack S. Eleven down and nine to go. // Nat. Struct. Biol. 1995. — Vol. 2. -P. 824−831.
  28. Cusack S. Aminoacyl-tRNA synthetases. // Curr. Op. In Struct. Biol. 1997. -Vol. 7.-P. 881−889.
  29. Cusack S., Yaremchuk A., Tukalo M. tRNA recognition by aminoacyl-tRNA synthetases. // in «The many faces of RNA» ed. Eggleston D., London, Ac. Press 1997. — P. 55−64.
  30. Cusack S., Yaremchuk A., Krikliviy I., Tukalo M. tRNAPro anticodon recognition by Thermus thermophilus prolyl-tRNA synthetase. // Structure -1998, — Vol. 6.-P. 101−108.
  31. Delarue M., Poterszman A., Nikonov S., Garber M., Moras D., Thierry J. Crystal structure of a procaryotic aspartyl-tRNA synthetase. // EMBO J.1994. Vol. 14. — P. 3219−3229.
  32. Delarue M. Aminoacyl-tRNA synthetases. // Curr. Opin. In Struct. Biol.1995,-Vol. 5.-P. 48−55.
  33. De Pauplana R., Turner R., Steer Π’., Schimmel, P. Genetic code origins: tRNAs older than their synthetases? // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. -Vol. 95.-P. 11 295−11 300.
  34. DePrat Gay G., Duckworth H., Fersht A. Modification of the amino acid specificity of tyrosyl-tRNA synthetase by protein engineering. // FEBS Lett. -1993.-Vol. 318.-P. 167−171.
  35. Desogus G., Todone F., Brick P., Onesti S. Active Site of Lysyl-tRNA Synthetase: Structural Studies of the Adenylation Reaction. // Biochemistry 2000. — Vol. 39. — P. 8418−8425.
  36. Dou X., Limmer S., Kreutzer R. DNA-binding of Phenylalanyl-tRNA Synthetase is Accompanied by Loop Formation of the Double-stranded DNA. // J. Mol. Biol. 2001. — Vol. 305. — P. 451−458.
  37. Doublie S., Bricogne G., Gilmore C., Carter C. Tryptophanyl-tRNA synthetase crystal structure reveals an unexpected homology to tyrosyl-tRNA synthetase. // Structure 1995. — Vol. 3. — P. 17−32.
  38. Eriani G., Delarue M., Poch O., Gangloff J., Moras D. Partition of tRNA synthetases into two classes based on mutually exclusive sets of sequence motifs. // Nature 1990. — Vol. 347. — P. 203−206.
  39. Eriani G., Dirheimer G., Gangloff J. Cysteinyl-tRNA synthetase: determination of the last E. coli aminoacyl-tRNA synthetase primary structure. // Nucleic Acids Res. 1991. — Vol. 19 — P. 265−269.
  40. Fersht A.R. DNA replication fidelity. // Proc. R. Soc. London 1981. -Vol. B212-P. 351−379.
  41. A.R. // in Accuracy in Molecular Biology, ed. Kirkwood T.B., Rosenberger R.F., Galas D.J. 1986, London, Chapman & Hall — P. 67−82.
  42. W. // in Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1988. — Vol. 27. — P. 773−778.
  43. Gilbart J., Perry C., Slocombe B. High-level mupirocin resistance in Staphylococcus aureus: evidence for two distinct isoleucyl-tRNA synthetases. Antimicrob. // Agents Chemother. 1993. — Vol. 37. — P. 3238.
  44. Goldgur Y., Mosyak L., Reshetnikova L., Ankilova V., Lavrik O., Khodyreva S., Safro M. The crystal structure of phenylanalil-tRNA synthetase from Th. thermophilics complexed with cognate tRNAphe. // Structure 1997. — Vol. 5. — P. 59−68.
  45. Heck J.D. and Hatfield G.W. Valyl-tRNA synthetase gene of Escherichia coli K12. // J. Biol. Chem. 1988. — Vol. 263. — P. 868−877.
  46. Henkin T. tRNA-directed transcription antitermination. // Mol. Microbiol. -1994.-Vol. 13.-P. 381−387.
  47. Herschlag D. RNA chaperones and the RNA folding problem. // J. Biol.
  48. Chem. 1996. — Vol. 270. — P. 20 871−20 874.
  49. Himeno H., Hasegawa Π’., Ueda Π’., Watanabe K., Shimizu H. Conversion of aminoacylation specificity from tRNATyr to tRNASer in vitro. II Nuc. Ac. Res.-1991.-Vol. 18.-P. 6815−6819.
  50. Ibba M., Curnow A.W., Soil D. Aminoacyl-tRNA synthesis: divergent routes to a common goal. // Trends in Biol. Sci. 1997. — Vol. 22. — P. 3942.
  51. Ibba M. Eyeing up tryptophanyl-tRNA synthetase. // Trends in Biochem. Sci.-2002-Vol. 27.-P. 227.
  52. Ibba M., Morgan S., Curnow A., Pridmore D., Vothknecht U., Gardner W., Lin W., Woese C., Soil D. A eurearchaeal lysyl-tRNA synthetase: resemblance to class I synthetases. // Science. 1997. — Vol. 278. — P. 11 191 122.
  53. Illangasekare M., Sanchez G., Nickles Π’., Yarns M. Aminoacyl-tRNA synthesis catalyzed by an RNA. // Science 1995. — Vol. 267. — P. 643−647.
  54. Jones Π’., Zou J.-Y., Cowan S., Kjeldgaard M. Improved Methods for Building Protein Models in Electron Density Maps and the Location of Errors in these Models. // Acta Cryst. 1991. — Vol. A47. — P. 110−119.
  55. Khodyreva S., Moor N., Ankilova V., Lavrik O. Phenylalanyl-tRNA synthetase from E. coli MRE-600: analysis of the active site distribution on the enzyme subunits by affinity labelling. // Bioch. Biophys. Acta 1985. -Vol. 830.-P. 206−212.
  56. Kholod N., Pan’kova N., Mayorov S., Krutilina A., Shlyapnikov M., Kisselev L., Ksenzenko V. Transfer RNAPhe isoacceptors possess non-identical set of identity elements at high and low Mg2+ concentrations. // FEBS Lett. 1997. — Vol. 411. — P. 123−127.
  57. Kim Y., Shin J., Li R., Cheong C., Kim K., Kim S. A novel anti-tumor cytokine contains a RNA binding motif present in aminoacyl-tRNA synthetases. // J. Biol. Chem. 2000. — Vol. 275. — P. 27 062−27 068.
  58. Koch C.A., Anderson D., Moran M., Ellis C" Pawson T. SH2 and SH3domains: elements that control interactions of cytoplasmic signalling proteins. // Science 1993. — Vol. 252. — P. 668−674.
  59. Krauss G., Reisner D., Maass G. Mechanism of discrimination between cognate and non-cognate tRNAs by phenylalanyl-tRNA synthetase from yeast. // Eur. J. Biochem. 1976. — Vol. 68. — P. 81−93.
  60. Lamour V., Quevillon S., Diriong S., N’gyuen V., Lipinski M., Mirande M. Evolution of the Glx-tRNA synthetase family: The glutaminyl enzyme as a case of horizontal gene transfer. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. -Vol. 91.-P. 8670−8674.
  61. Laskowski R., MacArthur M., Moss D., Thornton J. PROCHECK: a program to chek the stereochemical quality of protein structure. // J. Appl. Cryst. 1993. — Vol. 26. — P. 283−291.
  62. Leatherbarrow R.J., Fersht A.R., Winter G. Transition-state stabilization in the mechanism of tyrosyl-tRNA synthetase revealed by protein engineering. //Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1985. — Vol. 82. — P. 7840−7844.
  63. Lechler A. and Kreutzer R. The phenylalanyl-tRNA synthetase specifically binds DNA. // J.M.B. 1998. — Vol. 278. — P. 897−901.
  64. Liu D., Magliery Π’., Pastrnak M., Schlutz P. Engineering a tRNA and aminoacyl-tRNA synthetase for the site-specific incorporation of unnatural amino acids into proteins in vivo. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. -Vol. 94. — P. 10 092−10 097.
  65. Logan D. Mazauric M.-H., Kern D., Moras D., Crystal structure of glycyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus // EMBO J. 1995. — Vol. 14. -P. 4156−4167.
  66. Majerfeld I. and Yarns M. An RNA pocket for an aliphatic hydrophobe. // Nat. Struct. Biol. 1994. — Vol. 1. — P. 287−292.
  67. Martinis S., Plateau P., Cavarelli J., Florenz C. Aminoacyl-tRNA synthetases: A new image for a classical family. // Biochimie 1999. -Vol. 81.-P. 683−700.
  68. McClain W. and Foss K. Nucleotides that contribute to the identity of
  69. Escherichia coli tRNAPhe. // J.M.B. 1988. — Vol. 202. — P. 697−709.
  70. McClain W., Foss K., Jenkins R., Schneider J. Four sites in the acceptor helix and one site in the variable pocket of tRNAAla determine the molecule’s acceptor identity. //Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991. — Vol. 88. — P. 92 729 276.
  71. Miller W., Hill K., Shimmel P. Evidence for a «Cys-Lys box» metal binding site in an E. coli aminoacyl-tRNA synthetase. I I Biochem. 1991. — Vol. 30. -P. 6970−6976.
  72. Moras D. Aminoacyl-tRNA synthetases. // Curr. Opin. Struct. Biol. 1992. -Vol. 2.-P. 138−142.
  73. Mosyak L., Safro M. Phenylalanyl-tRNA synthetase from Thermus thermophilus has four antiparallel folds of which only two are catalytically functional. // Biochimie 1993. — Vol. 75. — P. 1091−1098.
  74. Mosyak L., Reshetnikova L., Goldgur Y., Delarue M., Safro M. Structure of phenylalanyl-tRNA synthetase from Th. thermophilus. II Nat. Struct. Biol. -1995.-Vol. 2.-P. 537−547.
  75. Nicholls A., Sharp K., Honig B. Protein Folding and Association: Insights from the Interfacial and Thermodynamic Properties of Hydrocarbons. // Proteins 1991. — Vol. 11. — P. 281−286.
  76. Noller H.F., Hoofarth V., Zimniak L. Unusual resistance of peptidyl transferase to protein extraction procedures. // Science 1992. — Vol. 256. -P. 1416−1419.
  77. Normalny J., Ogden R., Horvath S., Abelson J. Changing the identity of a transfer RNA. // Nature 1986. — Vol. 321. — P. 213−219.
  78. Onesti S., Miller A., Brick P. The crystal structure of the lysyl-tRNA synthetase (LysU) from Escherichia coli. // Structure 1995. — Vol. 3. -P. 163−176.
  79. Otani A., Slike Π’., Dorrell M., Hood J., Kinder K., Ewalt K., Cheresh D., Schimmel P., Friedlander M. A fragment of human TrpRS as a potent antagonist of ocular angiogenesis. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002.
  80. Caprara M.G., Mohr G. and Lambowitz A.M. A tyrosyl-tRNA synthetase protein induces tertiary folding of the group I intron catalytic core. // J.M.B. 1996.-Vol. 257.-P. 512−531.
  81. M. // in Methods Enzymol., ed. Abelson J., Simon M. 1997. -Vol. 277.-P. 493−505.
  82. Carter C.W. Cognition, mechanism and evolutionary relationships in aminoacyl-tRNA synthetases. // Annu. Rev. Biochem. 1993. — Vol. 62. -P. 715−748.
  83. Cavarelli J., Rees Π’., Ruff M., Thierry J.-C., Moras D. Yeast tRNAAsp recognition by its class II aminoacyl-tRNAsynthetase. // Nature 1993. -Vol. 362.-P. 181−184.
  84. Cech T.R. Self-splicing of group I introns. // Annu. Rev. Biochem. 1990. -Vol. 59.-P. 543−568.
  85. Chernaya M., Reshetnikova L, Korolev S, Safro M. Preliminary crystallographic study of the phenylalanil-tRNA synthetase from Th. themophilus HB8. // J.M.B. 1987. — Vol. 198. — P. 555−556.
  86. Collaborative Computational Project, Number 4. // Acta Cryst. 1994. -Vol. D60.-P. 760−763.
  87. Condon C., Grunberg-Manago M., Putzer, H. Aminoacyl-tRNA synthetase gene regulation in Bacillus subtilis. II Biochimie. 1996. — Vol. 78. -P. 381−389.
  88. Cusack S., Berthet-Colominas C., Hartlein M., Nassar N., Leberman R. A second class of synthetase structure revealed by X-ray analysis of Escherichia coli seryl-tRNA synthetase at 2.5 A. // Nature 1990. -Vol. 347.-P. 249−255.
  89. Cusack S. Aminoacyl-tRNA synthetases. // Curr. Op. In Struct. Biol. 1993.1. Vol. 99.-P. 178−183.
  90. Z. // in «Proceedings of the CCP4 Study Weekend. Data Collection and Processing», eds. Sawyer L., Isaacs N., Bailey S., Warrington: Daresbury Laboratory. 1993. — P. 56−62.
  91. Oubridge C., Ito N., Evans P.R., Teo C.-H. Nagai K. Crystal structure at 1.92 A resolution of the RNA-binding domain of the U1A spliceosomal protein complexed with an RNA hairpin. // Nature 1994. — Vol. 372. -P. 432−438.
  92. R. & Okaya Y. Determination of crystal structures by means of anomalously scattered X-rays. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1956. -Vol. 42.-P. 286−292.
  93. Perona J.J., Rould M., Steitz T. The structural basis of transfer RNA aminoacylation by E. coli glutaminyl-tRNA synthetase. // Biochem. 1993. -Vol. 32.-P. 8758−8771.
  94. Poterszman A., Delarue M., Thierry J., Moras D. Synthesis and recognition of aspartyl-adenylate by Thermus thermophilus aspartyl-tRNA synthetase. // JMB 1994. — Vol. 244. — P. 158−164.
  95. Putney S., Schimmel P. An aminoacyl-tRNA synthetase binds to a specific DNA sequence and regulates its gene transcription. // Nature 1981. -Vol. 306,-P. 441−447.
  96. Putzer H., Grunberg-Manago M., Springer M. Bacterial aminoacyl-tRNA synthetases: genes and regulation of expression. // in Soli D., RajBhandary U. (eds.) tRNA: Structure, Biosynthesis and Function. ASM Press. Washington, DC — 1995. — P. 293−333.
  97. Rao S.T. and Rossmann M.G. Comparison of super-secondary structures in proteins. // J. Mol. Biol. 1973. — Vol. 76. — P. 241−256.
  98. Read R. Improved Fourier coefficients for maps using phases from partial structures with errors. // Acta Cryst. 1986. — Vol. A42. — P. 140−149.
  99. Regan L., Bowie J., Shimmel P. Polypeptide sequebce essential for RNA recognition by an enzyme. // Science 1987. — Vol. 235. — P. 1651−1653.
  100. Renaud M., Bollak C., Ebel J.P. Interpretation of incomplete aminoacylation of yeast tRNAPhe: evidence for a phenylalanyl-tRNA synthetase catalyzed transconformation of tRNAphe. // Biochimie 1974. — Vol. 56. — P. 12 031 209.
  101. Reshetnikova L., Khodyreva S., Lavrik O., Ankilova V., Frolow F. and Safro M. Crystals os the phenylalanyl-tRNA synthetase from Thermus thernophilus HB8 complexed with tRNAphe. // J.M.B. 1993. — Vol. 231. -P. 927−929.
  102. Reshetnikova L., Moor N., Lavrik O., Vassylyev D.G. Crystal structures of phenylalanyl-tRNA synthetase complexed with phenylalanine and phenylalanyl-adenylate analogue. // J.M.B. 1999. — Vol. 287. — P. 555−568.
  103. Rhodova M., Ankilova V., Safro M.G., Human phenylalanyl-tRNA synthetase reveals different tRNA binding mode and non-canonical cellular functions. //Biochem. Biophys. Res. Commun. 1999. — Vol. 255. — P. 765 778.
  104. Richardson J. The anatomy and taxonomy of protein structure. // Advances of protein chemistry 1981. — Vol. 34. — P. 167−339.
  105. Rould M.A., Perona J.J., Soil D., Steitz T.A. Structure of E. coli glutaminyl-tRNA synthetase complexed with tRNAGln and ATP at 2.8 A resolution. // Science 1989. — Vol. 246. — P. 1135−1142.
  106. Rould M.A., Perona J.J., Steitz T.A. High resolution crystal structure of
  107. E. coli glutaminyl-tRNA synthetase eomplexed with its cognate tRNA. // Biophys. J. 1989. — Vol. 55. — P. 49.
  108. Ruff M., Krishnaswamy S., Boeglin M., Potterszman A., Mitschler A. Class II aminoacyl transfer RNA synthetases: crystal structure of yeast aspartyl-tRNA synthetase eomplexed with tRNAAsp. // Science 1991. — Vol. 252. -P. 1682−1689.
  109. M. & Mosyak L. Structural similarities in the noncatalytic domains of phenylalanyl-tRNA and biotin synthetases. // Protein Sci. 1995. — Vol. 4. -P. 2429−2432.
  110. Saks M., Sampson J., Abelson J. The transfer RNA identity problem: a search for rules. // Science 1994. — Vol. 263. — P. 191−197.
  111. Sanni A., Walter P., Boulanger Y., Ebel J.P., fasiolo F. Evolution of aaRS quaternary structure and activity: S. cerevisiae mitochondrial PheRS. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991. — Vol. 88. — P. 8387−8391.
  112. Sassanfar M., Kranz J., Gallant P., Schimmel P., Shiba K. A eubacterial Mycobacterium tuberculosis tRNA synthetase is eukaryote-like and resistant to eubacterial-speciflc antisynthetase drug. // Biochemistry 1996. -Vol. 35.-P. 9995−10 003.
  113. Schmidt E. and Shimmel P. Mutational isolation of a sieve for editing in a transfer RNA synthetase. // Science 1994. — Vol. 264. — P. 265−267.
  114. Schweins Π’., Langen R., Warshel A. Why have mutagenesis studies not located the general base of ras p21? // Nat. Struct. Biol. 1994. — Vol. 1. -P. 476−484.
  115. Shimmel P. Classes of aminoacyl-tRNA synthetases and the establishment of the genetic code. // Trends Biol. Sci. 1991. — Vol. 16. — P. 1−3.
  116. Shimmel P. and De Pouplana R.L. Tranfer RNA: from minihelix to genetic code. // Cell 1995. — Vol. 81. — P. 983−986.
  117. Schimmel P., Tao J., Hill J. Aminoacyl-tRNA synthetases as targets for new anti-infectives. // FASEB J. -1998 Vol. 12. — P. 1599−1609.
  118. Schimmel P. and De Pouplana R. Genetic code origins: experiments confirm phylogenetic predictions and may explain a puzzle. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999. — Vol. 96. — Pp 327−328.
  119. , E. & Schimmel, P. Mutational Isolation of a Sieve for Editing in a Transfer RNA Synthetase. // Science 1994. — Vol. 264 — P. 265−267.
  120. Shulman L. Recognition of tRNAs by aminoacyl-transfer RNA synthetases. // Prog. Nuc. Acid Res. Mol. Biol. 1991. — Vol. 41. — P. 23−87.
  121. Schultz S., Shields G., Steitz T. Crystal Structure of a CAP-DNA Cmplex: The DNA Is Bent by 90Β° // Science 1991. — Vol. 253. — P. 1001−1007.
  122. Siatecka M., Rozek M., Barciszewski J., Mirande M. Modular evolution of the Glx-RNA synthetase family rooting of the evolutionary tree between the bacteria and archaea/eukarya branches. // Eur. J. Biochem — 1998. -Vol. 256.-P. 80−87.
  123. Schultz S.C., Shields G.C., Steitz T.A. Crystal structure of a CAP-DNA complex: the DNA is bent by 90Β°. // Science 1991. — Vol. 253. — P. 10 011 007.
  124. Steitz J.A. and Tycowski K.T. Small RNA chaperones for ribosome biogenesis. // Science 1995. — Vol. 270. — P. 1626−1627.
  125. Toth M, Shimmel P. Internal structural features of E. coli glycyl-tRNA synthetase examined by subunit polipeptide chain fusions. // J. Biol. Chem. 1986. — Vol. 261. — P. 6643−6646.
  126. Ueda Π’., Yotsumoto Y., Ikeda K., Watanabe K. The T-loop region of animalmitochondrial tRNASer (AGY) is a main recognition site for homologous seryl-tRNA synthetase. // Nuc. Ac. Res. 1992. — Vol. 20. — P. 475−478.
  127. Wilkinson A.J., Fersht A.R., Blow D.M., Winter G. Site-directed mutagenesis as a probe of enzyme structure and catalysis: tyrosyl-tRNA synthetase cysteine-35 to glycine-35 mutation. // Biochemistry 1983. -Vol. 22.-P. 3581−3586.
  128. Wakasugi K., Slike Π’., Hood J., Otani A., Ewalt K., Frielander M" Schimmel P. A human aminoacyl-tRNA synthetase as a regulator of angiogenesis. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002. — Vol. 99. — P. 173−177.
  129. T. & Hopfield J., Experimental evidence for kinetic proofreadings in the aminoacylation of tRNA by synthetase. // Proc. Natl. Acad. Sci. -1977. Vol. 74. — P. 2246−2250.-J' I'1. Π“ΠžΠ‘Π£Π¬'* Β¦ Π‘Π›Π•Π›ΠšΠž! f, F/y
Π—Π°ΠΏΠΎΠ»Π½ΠΈΡ‚ΡŒ Ρ„ΠΎΡ€ΠΌΡƒ Ρ‚Π΅ΠΊΡƒΡ‰Π΅ΠΉ Ρ€Π°Π±ΠΎΡ‚ΠΎΠΉ