Анализ профилей метилирования локусов генома человека, содержащих видоспецифические ретроэлементы
Robertson, K.D., Ait-Si-Ali, S., Yokochi, Т., Wade, P.A., Jones, P.L. and Wolffe, A.P. (2000) Nat Genet, 25, 338−342. Billard, L.M., Magdinier, F., Lenoir, G.M., Frappart, L. and Dante, R. (2002) Oncogene, 21,2704−2712. Woodcock, D.M., Crowther, P.J. and Diver, W.P. (1987) Biochem Biophys Res Commun, 145, 888−894. Verona, R.I., Mann, M.R. and Bartolomei, M.S. (2003) Annu Rev Cell Dev Biol… Читать ещё >
Содержание
- I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ. Роль метилирования ДНК в регуляции экспрессии генов эукариот
Введение 5 Клеточный аппарат метилирования ДНК и ремоделирования хроматина 7 Механизмы регуляции экспрессии генов с помощью метилирования ДНК 11 Влияние метилирования ДНК на тканеспецифичность экспрессии генов 13 Клеточные процессы, регулируемые с помощью метилирования ДНК
Метилирование ДНК при опухолеобразовании
Генетические изменения: точечные мутации
Эпигенетические изменения: гипометилирование
Эпигенетические изменения: гиперметилирование
Метилирование импринтируемых генов
Метилирование ДНК при инактивации хромосомы X
Метилирование мобильных элементов
Анализ профилей метилирования локусов генома человека, содержащих видоспецифические ретроэлементы (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
выводы.
1. По результатам анализа ортологичных локусов геномов приматов идентифицировано 34 интеграции ЬТЯ НЕКУ-К (НМЬ-2) элементов, специфичных для генома человека, и определено их генное окружение.
2. Разработан метод крупномасштабного определения профилей метилирования геномных ДНК, основанный на использовании повторяющихся элементов генома в качестве маркеров статуса метилирования. Метод успешно применен для идентификации и сравнительного анализа метилирования областей внедрения 50 видоспецифичных ЬТЯ НЕКУ-К (НМЬ-2) в ДНК двух тканей и десяти клеточных линий человека.
3. Показан тканеспецифичный характер метилирования использованного набора ЬТЯ-маркеров и доказана его применимость для целей эпигенетического типирования клеточных линий человека.
БЛАГОДАРНОСТИ.
Автор выражает благодарность своему научному руководителю Юрию Борисовичу Лебедеву, без чьего постоянного присмотра и чуткого руководства ^ написание этой работы вряд ли было бы возможным. Автор глубоко признателен.
Евгению Давидовичу Свердлову за помощь и дельные советы, предоставляемые в процессе всей работы. Спасибо всем аспирантам комнаты 665, и вообще всем молодым сотрудникам Лаборатории Структуры и Функций Генов Человека, которые поддерживали мое душевное равновесие во время рабочей деятельности и не только. Отдельное спасибо Имаму и Пупсику за все все все. Я выражаю благодарность всем сотрудникам ЛСФГЧ за плодотворное сотрудничество и участие в обсуждении различных аспектов моей работы. В завершение хочу поблагодарить всех родственников и друзей, без чьей заботы и участия в моей жизни не было бы никакой кандидатской диссертации и работал бы я сейчас менеджером в офисе.
1. Jaenisch, R. and Bird, A. (2003) Nat Genet, 33 SuppI, 245−254.
2. Laird, P.W. and Jaenisch, R. (1996) Annu Rev Genet, 30,441−464.
3. Macleod, D., Ali, R.R. and Bird, A. (1998) Mol Cell Biol, 18,4433−4443.
4. Adachi, N. and Lieber, M.R. (2002) Cell, 109, 807−809.
5. Woodcock, D.M., Crowther, P.J. and Diver, W.P. (1987) Biochem Biophys Res Commun, 145, 888−894.
6. Clark, S.J., Harrison, J. and Frommer, M. (1995) Nat Genet, 10,20−27.
7. Li, E., Bestor, Т.Н. and Jaenisch, R. (1992) Cell, 69,915−926.
8. Jain, P.K. (2003) Ann N YAcad Sci, 983, 71−83.
9. Marahrens, Y. (1999) Genes Dev, 13,2624−2632.
10. Verona, R.I., Mann, M.R. and Bartolomei, M.S. (2003) Annu Rev Cell Dev Biol, 19,237−259.
11. Walsh, C.P., Chaillet, J.R. and Bestor, Т.Н. (1998) Nat Genet, 20,116−117.
12. Wilson, G.G. and Murray, N.E. (1991) Annu Rev Genet, 25, 585−627.
13. Versteeg, R., van Schaik, B.D., van Batenburg, M.F., Roos, M., Monajemi, R., Caron, H., Bussemaker, H.J. and van Kampen, A.H. (2003) Genome Res, 13, 1998;2004.
14. Bird, A. (1999) Science, 286, 2287−2288.
15. Kass, S.U., Goddard, J.P. and Adams, R.L. (1993) Mol Cell Biol, 13,7372−7379.
16. Peters, J. and Beechey, C. (2004) Brief Funct Genomic Proteomic, 2, 320−333.
17. Okano, M., Bell, D.W., Haber, D.A. and Li, E. (1999) Cell, 99,247−257.
18. Nguyen, C.T., Gonzales, F.A. and Jones, P.A. (2001) Nucleic Acids Res, 29, 4598−4606.
19. Newell-Price, J., Clark, A.J. and King, P. (2000) Trends Endocrinol Metab, 11, 142−148.
20. Boyes, J. and Bird, A. (1991) Cell, 64, 1123−1134.
21. Billard, L.M., Magdinier, F., Lenoir, G.M., Frappart, L. and Dante, R. (2002) Oncogene, 21,2704−2712.
22. Robertson, K.D., Ait-Si-Ali, S., Yokochi, Т., Wade, P.A., Jones, P.L. and Wolffe, A.P. (2000) Nat Genet, 25, 338−342.
23. Attwood, J.T., Yung, R.L. and Richardson, B.C. (2002) Cell Mol Life Sci, 59, 241−257.24.