Заключение. 
Использование информационных технологий в молекулярной биологии

Современную науку трудно себе представить без информационных технологий. В данной работе были рассмотрены методы использования ИТ в молекулярной биологии. Постановка многих экспериментов в молекулярной биологии была бы крайне затруднительна без использования компьютерных устройств и программного обеспечения. Такие программы как Vector NTI, SQ позволяют изучать, визуализировать, манипулировать и конструировать биологические молекулы, разрабатывать стратегии клонирования молекул, тем самым в большой степени повышая продуктивность работы молекулярного биолога. Также при помощи целого ряда программ, таких RasWin, Modeller, AutoDock возможно не только 3D моделирование макромолекул, но процессов, идущих на молекулярном уровне.

Список литературы

• 1. Николайчик Е. А., Валентович Л. Н. SQкомпьютерная программа для редактирования и анализа биологических последовательностей // Труды Белорусск. гос. ун-та. Сер.: Физиологические, биохимические и молекулярные основы функционирования биосистем. 010. -Т.5. -Ч.1. -с.57−67.
• 2. Rice, P., Longden, I., & Bleasby, A. EMBOSS: the European Molecular Biology Open Software Suite // Trends in Genetics: TIG — 2000. — Vol. 16. — P. 276−277.
• 3. Sequence Manipulation Suite [Electronic resource] / University of Alberta. — Canada, 2004. — Mode of access: http://sherb.lin.irk.ru/sms2/index.html. — Date of access: 10.12.2010.
• 4. Хмелько, И. Приложения в составе Vector NTI Suite / Практическая молекулярная биология [Электронный ресурс]. — 2007. — Режим доступа: http://molbiol.ru/protocol/09_09a.html. — Дата доступа: 10.12.2010.
• 5. Хмелько, И. Конструирование молекул / Практическая молекулярная биология [Электронный ресурс]. — 2007. — Режим доступа: http://molbiol.edu.ru/review/03_02c.html. — Дата доступа: 15.12.2010.
• 6. С. Бондаренко, М. Бондаренко. Microsoft Word 2003 в теории и на практике.- Минск: Новое знание, 2004.-336с., ил.
• 7. М. В. Спека. Microsoft PowerPoint 2003: самоучитель. — Москва, Санкт-Петербург, Киев: Диалектика, 2004.-363 с., ил.
• 8. М. С. Шибут Технологии работы с текстами и электронными таблицами: Word, Excel. Минск: общественное объединение «Молодежное научное общество», 2000.-142 с.
• 9. Genetic Sequence Data Bank NCBI-GenBank Flat File Release 180.0 [Electronic resource] / National Center for Biotechnology Information — USA, 2010. — Mode of access: ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/gbrel.txt.- Date of access: 12.12.2010.
• 10. Elzanowski, A., Ostell, J. The Genetic Codes // National Center for Biotechnology Information [Electronic resource] - 2010. — Mode of access: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Utils/wprintgc.cgi?mode=c. — Date of access: 12.12.2010.
• 11. Roberts, R. J., Vincze, T., Posfai, J., & Macelis, D. REBASE-a database for DNA restriction and modification: enzymes, genes and genomes // Nucleic Acids Research — 2010. — Vol. 38. — P. D234−236.
• 12. SQ: редактор биологических последовательностей для молекулярных биологов // Биологический факультет Белорусск. гос. ун-та [Электронный ресурс]. — 2003. — Режим доступа: http://www.bio.bsu.by/sq/about.html. — Дата доступа: 10.12.2010.
• 13. A Resource for Studying Biological Macromolecules // Protein Data Bank [Electronic resource] - 2008. — Mode of access: http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do. — Date of access: 19.12.2010.
• 14. Программа Modeller — что это и для чего? // Биоинформатика и познания [Электронный ресурс]. — 2009. — Режим доступа: http://www.bioinformatix.ru/modeller/programma-modeller-chto-eto-i-dlya-chego.html. — Дата доступа: 19.12.2010.
• 15. Mollder [Electronic resource] / Departments of Biopharmaceutical Sciences and Pharmaceutical Chemistry, California Institute for Quantitative Biomedical Research, 2010. — Mode of access: http://salilab.org/modeller/download_installation.html. — Date of access: 19.12.2010.
• 16. Энгелевский Н. Докинг: определение, виды, методы, проблемы и решения. Программы для докинга / Биоинформатика и познания [Электронный ресурс]. — 2009. — Режим доступа: http://www.bioinformatix.ru/drugie-programmyi/doking-opredelenie-vidyi-metodyi-problemyi-i-resheniya.-programmyi-dlya-dokinga.html. — Дата доступа: 19.12.2010.
• 17. Мартынюк А. Молекулярный докинг: понятие, применение, программы для докинга / Биоинформатика и познания [Электронный ресурс]. — 2009. — Режим доступа: http://www.bioinformatix.ru/drugie-programmyi/molekulyarnyiy-doking-ponyatie-sut-programmyi-dlya-dokinga.html. — Дата доступа: 19.12.2010.
• 18. http://www.molbiol.edu.ru/ Практическая молекулярная биология. Сайт является незаменимым для биохимиков, генетиков, микробиологов и молекулярных биологов. Это крупнейшая биологическая база данных. Сайт содержит подробный справочник, который состоит из наиболее важных разделов. Здесь можно найти руководства и рекомендации по выполнению тех или иных операций, подробное описание методов исследования (работа с бактериями, бактериофагами, эукариотическими организмами, дигибридные системы, методы выделения и анализа ДНК прои эукариотических организмов, работа с белками), методики и расчеты для приготовления растворов, подбор необходимых для исследования ферментов и реактивов. Можно следить за свежими публикациями. Имеются обзоры различных биологических ресурсов и программ, а также ссылки на биологические журналы и гранты биологического профиля. Внимание уделяется также образованию и образовательным ресурсам. Имеются сведения о компаниях и русскоязычных институтах биологического профиля, а также ссылки на полезные web-ресурсы. Также пользователи могут разместить на сайте используемые ими протоколы экспериментов, обзоры и дополнения к уже опубликованным материалам.
• 19. http://www.cellbiol.ru/ Информационный сайт-справочник по биологии и медицине. Он включает в себя образовательные материалы, которые могут быть полезны как школьникам, так и студентам биологических факультетов. Помимо образовательной информации, на сайте публикуются биографии известных ученых в области биологии, генетики, физиологии, медицины и многих других.
• 20. http://www.molbiol.ru/ Информационный проект, поддерживаемый русскоязычным биологическим сообществом. Здесь можно найти руководства и рекомендации по выполнению тех или иных операций, подробное описание методов исследования (работа с бактериями, бактериофагами, эукариотическими организмами, дигибридные системы, методы выделения и анализа ДНК прои эукариотических организмов, работа с белками), методики и расчеты для приготовления растворов, подбор необходимых для исследования ферментов и реактивов. Можно следить за свежими публикациями. Имеются обзоры различных биологических ресурсов и программ, а также ссылки на биологические журналы и гранты биологического профиля. На этом сайте есть форум для его пользователей, в котором можно получить ответы на многие интересующие вопросы, касающиеся материалов представленных на данном сайте.
• 21. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?DB=pubmed PubMed — текстовая база данных медицинских публикаций на английском языке, на основе раздела биотехнология национальной медицинской библиотеки США (National Library of Medicine, NLM). База данных была разработана национальным центром биотехнологической информации (National Center for Biotechnology Information, NCBI). PubMed является бесплатной версией базы данных MEDLINE. PubMed документирует медицинские статьи из специальной литературы, а также дает ссылки на полнотекстовые статьи. PubMed включает в себя данные из разделов медицина, стоматология, ветеринария, общее здравоохранение, психология, биология, генетика, биохимия, цитология, биотехнология, биомедицина и т. д. Документированно около 3.800 биомедицинских изданий. Ежегодно база данных PubMed увеличивается на 500.000 документов. Поиск в базе данных журналов можно осуществлять по предмету или по названию журнала, по сокращенному названию, аббревиатуре ISO и другим параметрам.
• 22. http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/ Search Launcher организован Baylor College of Medicine. Сайт предоставляет возможность проводить различные молекулярно-биологические анализы или поиски со стандартного и очень простого интерфейса. На сервере можно выполнять простые преобразования последовательностей. Есть возможность организовать анализ многих последовательностей одновременно. Ресурс просто незаменим для тех, кто не чувствует себя большим мастером по анализу последовательностей.
• 23. http://www.sciencekomm.at/ Более 4000 ссылок на биологические и медицинские журналы содержится на «science.komm» (там же удобные ссылки на полнотекстовые источники, словари, базы данных по абстрактам и т. п.). По web-ссылке вы попадаете на сайт конкретного журнала. На многих журналах можно подписаться на рассылку оглавления по E-mail.
• 24. http://www.sherb.lin.irk.ru/sms2/ Web-приложение Sequence Manipulation Suite, включающее в себя ряд полезных программ для работы молекулярного биолога. Сайт предоставляет возможность проводить различные молекулярно-биологические анализы.
• 25. http://www.bioinformatix.ru/ Сайт, посвященный биоинформатике, геномике, протеомике. На сайте публикуются статьи по этим тематикам. Кроме того, на данном сайте можно найти описание различных программ, используемых в биологии.
• 26. http://www.scirus.com/ Scirus — наиболее полная поисковая система для ученых в Интернете. Основанный на последних поисковых технологиях, он ищет более, чем в 300 миллионах определенных для науки Web-страницах, позволяя пользователям быстро находить: научные, медицинские и технические сведения; последние публикации; рецензируемые журналы; патенты и журналы, которые обычно пропускают другие поисковые системы. Эта поисковая система обращает внимание только на те Web-страницы, которые содержат научную информацию.
• 27. http://highwire.stanford.edu/ Этот сайт секции библиотеки Стэнфордского университета предлагает вниманию пользователей огромную базу материалов, которые можно загру-зить бесплатно в полном объеме. Источниками предлагаемых статей являются 975 журналов. Читатели имеют возможность доступа к полным текстам почти 1 435 924 статей, которые перед публикацией получили рецензию экспертов. Возможен быстрый поиск и расширенный поиск (по авторам статей, названи-ям, цитатам, ключевым словам и т. д.).

Специальность «биология».

Тестовые вопросы по основам информационных технологий

01 Каким тегом определяет абзац текста:

p.

n.

a.

br.

02 Программа, с помощью которой нельзя рестрикционный анализ нуклеотидной последовательности:

Restriction Summary.

Visual Cloning 2000.

SQ.

RasWin.

Презентация магистерской диссертации