Роль мажорного белка мРНП р50 в регуляции трансляции, обеспечении стабильности и локализации мРНК в клетках эукариот

ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

Содержание

Обзор литературы
ФУНКЦИИ МАЖОРНЫХ БЕЖОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С мРНК В КЛЕТКАХ ЭУ КАРИОТ
1. Роль мажорных белков в структурной организации мРНП
- 1. 1. РАВР и его роль в структурной организации мРНП
- 1. 3. Структурные и функциональные свойства р50 и родственных YB белков
- 1. 4. р5 0 как структурный белок мРНП
2. Роль РАВР и р50 в регуляции трансляции
- 2. 1. РАВР как неканонический фактор инициации трансляции
- 2. 2. р50 и родственные YB белки как репрессоры трансляции
- 2. 3. р50 как неканонический фактор инициации трансляции
- 2. 4. Возможная модель участия РАВР и р50 в регуляции трансляции мРНК
3. Механизмы обеспечения стабильности мРНК в клетках эукариот
- 3. 1. Поли (А)-хвост и РАВР — общие детерминанты стабильности мРНК
- 3. 2. Специфические регуляторные белки и детерминанты стабильности мРНК
- 3. 3. YB белки — ключевой компонент системы маскирования мРНК в клетке
4. Трансляция и цитоскелет

Роль мажорного белка мРНП р50 в регуляции трансляции, обеспечении стабильности и локализации мРНК в клетках эукариот (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

В настоящеее время не вызывает сомнения тот факт, что некоторые белки, ассоциированные с эукариотическими мРНК, определяют фундаментально различные пути их трансляционной судьбы. Несмотря на открытие множества белков, специфичных к определенным типам мРНК и ответственных за селективную регуляцию трансляции, были найдены только два мажорных белка, ассоциированных с большинством мРНК в клетках эукариот и осуществляющих общую регуляцию трансляции. Один из них — белок с молекулярным весом 70 кДа, хорошо известен как поли (А)-связывающий белок (poly (A)-binding protein, РАВР), обладающий преимущественной аффинностью к 3'-концевым поли (А) — последовательностям эукариотических мРНК. К настоящему времени РАВР является наиболее хорошо изученным белком мРНПпоказано его участие в инициации трансляции, обеспечении стабильности мРНК и жизнеобеспечении клетки в целом (Sachs and Davis, 1989; Jackson and Standart, 1990; Munroe and Jacobson, 1990; Gallie, 1991; Tarun and Sachs, 1995; Sachs et al., 1997; Tarun et al., 1997). Другой белок, p50, имеющий молекулярный вес около 35 кДа, но движущийся при SDS-электрофорезе как белок с молекулярным весом 50 кДа, был описан более 20 лет назад как доминантный компонент цитоплазматических мРНП млекопитающих, однако до настоящего времени функции р50 остаются неясными. Множество фактов говорит о том, что содержание этих двух белков в составе мРНП варьирует в зависимости от функционального состояния мРНК Так, РАВР был найден преимущественно в активных полирибосомных мРНП (Van Venrooij et al., 1977; Vincent et al, 1981; Minich and Ovchinnikov, 1992). В противоположность РАВР, р50 является мажорным компонентом как трансляционно неактивных, так и активных полирибосомных глобиновых мРНП, причем содержание р50 на моль мРНК в полирибосомных мРНП вдвое ниже, чем в свободных неактивных мРНП. Более того, оказалось также, что при невысоком соотношении р50: мРНК, соответствующем таковому в полирибосомных мРНП, р50 стимулирует трансляцию, тогда как увеличение количества р50 приводит к полной остановке белкового синтеза. Таким образом, переход мРНК из неактивного состояния в активное сопровождается уменьшением количества р50, связанного с мРНК, и появлением РАВР, и наоборот, инактивация мРНК сопряжена с увеличением количества р50 и вытеснением РАВР из состава мРНП. Основываясь на этих данных мы предположили, что изменение количества этих двух мажорных белков, связанных с мРНК, является ключевым фактором общей регуляции трансляционной активности мРНК. Решению этого вопроса и была посвящена первая часть настоящей работы.

Вторым важным аспектом этой работы явилось изучение влияния р50 на стабильность мРНК. Действительно, известно, что р50 и гомологичные белки являются мажорными компонентами неактивных мРНП, содержащих функционально активную мРНК в запасенном состоянии. Отсюда было предположено, что связывание избытка р50 с мРНК приводит не просто к ингибированию трансляции, но также и к стабилизации мРНК в форме неактивных мРНП.

Третьим направлением наших исследований явился поиск белков, взаимодействующих с р50. Недавние исследования, проведенные в нашей лаборатории, показали, что р50 принадлежит к семейству мультифункциональных белков, найденных почти во всех живых организмах, от бактерий до млекопитающих, и регулирующих различные аспекты биогенеза мРНК, репликацию и репарацию ДНК, клеточный рост и пролиферацию, а также участвующих в механизмах передачи стрессовых сигналов в клетках млекопитающих (Grant and Deeley, 1993; Lee et al, 1994; Wolffe, 1994; Ladomery and Sommerville, 1995; Graumann and Marahiel, 1996bOhga et al., 1996; Swamynathan et al., 1998). В связи с этим поиск молекулярных партнеров р50 представляет особый интерес, позволяющий пролить свет на различные стороны функционирования р50 и на его место в жизнеобеспечении клетки в целом.

В результате проделанной работы оказалось, что р50 обладает такой же аффинностью к поли (А)-полинуклеотидам, как РАВР и, следовательно, может конкурировать с РАВР за связывание с поли (А)-хвостом мРНК. Используя бесклеточные системы трансляции и мРНК, меченную по поли (А)-хвосту, мы показали, что добавление р50 приводит к вытеснению РАВР и инактивации мРНК, и, в то же время, РАВР может восстанавливать трансляцию путём вытеснения р50. Следовательно, количество р50 и РАВР, связанных с мРНК, является важным фактором, определяющим трансляционную активность мРНК и обеспечивающим переход мРНК из неактивного в активное состояние и наоборот.

Было показано также, что р50 удлиняет время жизни мРНК в 5−10 раз, полностью предотвращая её деградацию. Более того, удаление р50 из различных клеточных экстрактов приводило к усилению деградации мРНК, тогда как добавленный р50 полностью восстанавливал стабильность мРНК. Экспрессия р50 в клетках НеЬа привела к ингибированию трансляции и полной стабилизации репортерной мРНК. Важно отметить также, что р50 обеспечивает защиту любых мРНК, независимо от последовательности и наличия элементов нестабильности. Таким образом, р50 является универсальным белком, отвечающим за стабилизацию и хранение эукариотических мРНК.

Скрининг двухгибридной экспрессируемой библиотеки кДНК из мышц человека привёл к обнаружению актина как белка, взаимодействующего с р50. Использование делеционных мутантов р50 позволило локализовать участок, отвечающий за связывание с актином в 1М-концевом домене р50, богатом аланином и пролином и обнаружить характерный актин-связывающий консенсус. Дальнейшие эксперименты показали, что р50 локализуется преимущественно вдоль актиновых микрофибрилл в №Н ЗТЗ фибробластах мыши. Оказалось также, что константа взаимодействия р50 с актином сравнима с таковыми для наиболее прочно актин-связывающих белков. Кроме того, связывание р50 с актином приводит к изменению структуры актиновых фибрилл, что указывает на активный характер этого взаимодействия. Поскольку р50 является мажорным белком мРНП и, одновременно, актин-связывающим белком, можно предположить, что р50 играет важную роль в локализации мРНК в клетках эукариот.

Таким образом, полученные данные позволяют по-новому осмыслить роль р50 в регуляции активности, обеспечении стабильности и локализации эукариотических мРНК. В целом, описанные в этой работе результаты не имеют аналогов в литературе и являются очередным шагом в изучении функций р50 в клетках эукариот.

Обзор литературы.

ФУНКЦИИ МАЖОРНЫХ БЕЖОВ, АССОЦИИРОВАННЫХ С мРНК В КЛЕТКАХ ЭУКАРИОТ.

Одним из ключевых звеньев реализации генетической информации в клетках эукариот является пост-транскрипционная регуляция экспрессии генов. Так, множество важных событий, происходящих при развитии организма, дифференцировке клеток, да и в жизни клетки вообще, контролируется пост-транскрипционными механизмами, регулирующими процессинг мРНК в ядре, а также её трансляцию, локализацию и стабильность в цитоплазме.

Одним из наиболее хорошо изученных моментов функционирования мРНК является регуляция инициации белкового синтеза (см. обзор Pain, 1996; Day and Tuite, 1998; Gray and Wickens, 1998; Preiss and Hentze, 1999). В частности, показана важная роль в этом процессе фактора eIF4G, который является платформой для сборки 48 S преинициаторного комплекса на мРНК. eIF4G может связывать кэп-связывающий белок eIF4E, РНК-хеликазу eIF4A и поддерживать тем самым мультимерный комплекс названный eIF4 °F. Этот комплекс необходим для узнавания кэп-структуры и сканирования мРНК до инициаторного кодона. Кроме того eIF4G может связывать eEF3 и обеспечивать посадку 43 S преинициаторного комплекса на мРНК (см. обзор Pain, 1996; Day and Tuite, 1998; Gray and Wickens, 1998; Preiss and Hentze, 1999). Самым неожиданным открытием явилось обнаружение взаимодействия eIF4G с РАВР, приводящее к циркуляризации мРНК и облегчению реинициации (Gallie and Tanguay, 1994; Wells et al., 1998). Совершенно новый механизм внутренней инициации, ранее описанный у пикорнавирусных мРНК, был обнаружен у множества эукариотических мРНК, кодирующих, в основном, регуляторные белки (Nanbru et al., 1997; Pyronnet et al., 2000). Были также детально изучены механизмы глобальной регуляции трансляции путем фосфорилирования ключевых факторов инициации eIF2a, eIF4E и 4Е-связывающих белков, а также расщепления eIF4Gпоказана роль этих модификаций в модуляции клеточного ответа на различные физиологические стимулы и стрессовые условия (см. обзор Pain, 1996; Day and Tuite, 1998; Gray and Wickens, 1998; Gingras et al., 1999; Preiss and Hentze, 1999).

Кроме того, появилось множество примеров того, что c/s-регуляторные сигналы, сосредоточенные в 5'- и 3'- нетранслируемых областях, и узнающие их регуляторные белки могут определять особенности функционирования определённых классов мРНК. Была показана важность этих специфических РНК-белковых взаимодейтсивй в регуляции локализации, трансляции и стабильности множества мРНК регуляторных белков, а также мРНК, ассоциированных с ростом и развитием организма (см. обзор Spirin, 1994; Gray and Wickens, 1998). Вместе с тем, появляется всё больше данных о том, что существует группа белков, сопровождающих мРНК на всех этапах её биогенеза и обеспечивающих функциональную связь между «ядерной историей» мРНК и её дальнейшей судьбой в цитоплазме. Три различных семейства белков: белки гетерогенных ядерных РНП (гяРНП), Y-box связывающие белки (YB белки) и РАВР, были описаны как ключевые факторы контролирующие процессинг мРНК в ядре, а также транспорт и локализацию, трансляционную активность и стабильность большинства эукариотических мРНК (см. обзор Caponigro and Parker, 1995; Sommerville and Ladomery, 1996bSpirin, 1996; Matsumoto and Wolffe, 1998; Sommerville, 1999; Shyu and Wilkinson, 2000). Эти белки являются мажорными компонентами мРНП и обладают способностью изменять пространственную структуру мРНК. По-видимому, именно это свойство лежит в основе их функционирования.

В этом обзоре мы ограничились кратким перечислением наиболее важных направлений исследований путей регуляции метаболизма мРНК и сконцентрировались в основном на функциях мажорных белков мРНП, определяющих структурную организацию, трансляционную активность и стабильность мРНК в клетках эукариот.

Выводы.

1. Показано, что р50 и РАВР обладают одинаковым сродством к поли (А) и конкурируют за связывание с поли (А)-хвостом мРНК. Связывание р50 с поли (А)-хвостом приводит к трансляционной инактивацию мРНК. В свою очередь, РАВР может вытеснять р50 и восстанавливать трансляцию полиаденилированной мРНК. Более того, репрессия трансляции в клетках млекопитающих сопровождается увеличением количества р50 в составе мРНП. Таким образом, изменение соотношения двух мажорных белков, р50 и РАВР, в составе мРНП может являться механизмом глобального трансляционного контроля в клетках эукариот.

2. Обнаружено, что р50 удлиняет время жизни мРНК in vitro и in vivo более, чем в 100 раз, тогда как его удаление из клеточных экстрактов приводит к дестабилизации мРНК. Показано, что две специфические активности, стабилизация мРНК и ингибирование трансляции, локализованы в разных доменах р50: домен холодового шока обеспечивает стабилизацию мРНК, в то время как С-концевой домен отвечает за ингибирование трансляции. р50 избирательно защищает поли (А)-хвост, но не «тело» мРНК от действия эндорибонуклеаз, обеспечивая, по-видимому, защиту мРНК от деаденилирования и последующей деградации. Таким образом, р50 может являться универсальным фактором, обеспечивающим общую стабилизацию и хранение мРНК в клетках эукариот.

3. Актин был идентифицирован и охарактеризован как белок, взаимодействующий с р50. Показано, что р50 содержит характернный актин-связывающий мотив и локализуется в №НУЗТЗ фибробластах вдоль актиновых микрофиламентов. р50 обладает высоким сродством к полимерному актину и его связывание приводит к значительному изменению структуры актина. Принимая во внимание, что р50 является мажорным компонентом мРНП и, одновременно, актин-связывающим белком, можно предположить, что р50 играет важную роль в локализации мРНК в клетках эукариот.

Благодарности.

Эта работа была сделана с помощью многих людей, их энтузиазм, интерес, идеи лежат в основе этой диссертации.

Прежде всего, я благодарен своей любимой жене и замечательному коллеге Вале Евдокимовой, совмесно с которой были сделаны практически все эксперименты, результаты которых описаны в этой работе. Я могу с уверенностью сказать, что без её помощи эта работа никогда бы не была сделана и написана, по крайней мере — в том виде, в каком она сейчас находится.

Я также благодарен моему руководителю, Льву Павловичу Овчинникову, за школу научных исследований и школу жизни. Он создал в лаборатории атмосферу взаимного внимания, поддержки и свободы творчества, без чего выполнение работы было бы невозможным. Я также благодарен всему коллективу лаборатории Льва Павловича.

Также хочу поблагодарить своего брата, Максима Рузанова за неоценимую помощь в подготовке к печати автореферата моей диссертационной работе и за помощь в оформлении множества бумаг, необходимых для процесса защиты.

Часть этой работы была выполнена в лаборатории Наума Зоненберга в монреальском университете Мс (ЗгШ. Я признателен ему за предоставленную возможность работать в его лаборатории. Благодарю студентов лаборатории Зоненберга, за консультации и помощь в работе.

Показать весь текст

Список литературы

Ainger, К., Avossa, D., Morgan, F., Hill, S. J., Barry, C., Barbarese, E. and Carson, J. H. (1993) Transport and localization of exogenous myelin basic protein mRNA microinjected into oligodendrocytes. J. Cell Biol, 123, 431−441.
Amrani, N., Minet, M., Le Gouar, M., Lacroute, F. and Wyers, F. (1997) Yeast Pabl interacts with Rnal5 and participates in the control of the poly (A) tail length in vitro. Mol. Cell Biol, 17, 3694−3701.
Antic, D. and Keene, J. D. (1998) Messenger ribonucleoprotein complexes containing human ELAV proteins: interactions with cytoskeleton and translational apparatus. J. Cell Sci., Ill, 183 197.
Audic, Y., Omilli, F. and Osborne, H. B. (1997) Postfertilization deadenylation of mRNAs in Xenopus laevis embryos is sufficient to cause their degradation at the blastula stage. Mol Cell Biol, 17, 209−218.
Baer, B. W. and Kornberg, R. D. (1980) Repeating structure of cytoplasmic poly (A)-ribonucleoprotein. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 77, 1890−1892.
Barabese, E., Koppel, D. E., Deutcher, M. P., Smith, C. L. and Ainger, K. (1995) Protein translation components are colocalized in granules in oligodendrocytes. J. Cell Sci., 108, 27 812 790.
Bassel, G. and Singer, R. H. (1997) mRNA and cytosceletal filaments. Curr. Opin. Cell. Biol, 9, 109−115.
Bassel, G. J. (1993) High resolution distribution of mRNA within the cytoskeleton. J. Cell Biochem., 52, 127−133.
Bassel, G. J., Powers, C. M., Taneja, K. L. and Singer, R. H. (1994a) Single mRNAs visualized by ultrastructural in situ hybridization are principally localized at actin filament intersections in fibroblasts. J. Cell Biol., 126, 863−876.
Bassel, G. J., Singer, R. F. and Kosik, K. S. (1994b) Association of poly (A) mRNA with microtubules in cultured neurons. Neuron, 12, 571−582.
Bektas, M., Nurten, R., Gurel, Z., Sayers, Z. and Bermek, E. (1994) Interactions of eukaryotic factor 2 with actin: a possible link between protein synthetic machinery and cytoskeleton. FEES Lett., 12, 89−93.
Bernstein, P., Peltz, S. W. and Ross, J. (1989) The poly (A)-poly (A)-binding protein complex is a major determinant of mRNA stability in vitro. Mol Cell Biol, 9, 659−670.
Bernstein, P. and Ross, J. (1989) Poly (A), poly (A)-binding protein and the regulation of mRNA stability. Trends Biochem. Sci., 14, 373−377.
Bershadsky, A. D. and Vasiliev, J. M. (1988) Cytoskeleton, 1st Ed.,. Plenum Press, New York, .
Beutler, B. and Brown, T. (1991) A CAT reporter construct allows ultrasensitive estimation of TNF synthesis, and suggests that the TNF gene has been silenced in non-macrophage cell lines. J. Clin. Invest., 87, 1336−1344.
Bi, X. and Goss, D. J. (2000) Wheat germ poly (A)-binding protein increases the ATPase and the RNA helicase activity of translation initiation factors eIF4A, eIF4B, and eIF-iso4 °F. J. Biol Chem., 275, 17 740−17 746.
Biegel, D. and Pachter, J. S. (1992) mRNA association with the cytoskeletal framework likely represents a physiologival binding event. J. Cell. Biochem., 48, 98−106.
Blattner, C., Kannouche, P., Litfin, M., Bender, K., Rahmsdorf, H. J., Angulo, J. F. and Herrlich, P. (2000) UV-induced stabilization of c-fos and other short-lived mRNAs. Mol. Cell Biol., 20, 3616−3625.
Blobel, G. (1972) Proteins tightly bound to globin mKNA. Biochem. Biophys. Res. Commun., 47, 88−95.
Blobel, G. (1973) A protein of molecular weight 78.000 bound to the polyadenylate region of eukaryotic messenger RNAs. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 70, 924−928.
Bonneau, A. M., Darveau, A. and Sonenberg, N. (1985) Effect of viral infection on host protein synthesis and mRNA association with the cytoplasmic cytoskeletal structure. J. Cell Biol, 100, 1209−1218.
Bonnerot, C., Boeck, R. and Lapeyre, B. (2000) The two proteins Patlp (Mrtlp) and Spb8p interact in vivo, are required for mRNA decay, and are functionally linked to Pablp. Mol Cell Biol, 20, 5939−5946.
Bouget, F.-Y., Gerttula, S. and Quatrano, R. S. (1995) Spatial redistribution of poly (A)+RNA during polarization of the Fucus zygote is dependent upon microfilaments. Dev. Biol, 171, 258 261.
Bouvet, P., Matsumoto, K. and Wolffe, A. P. (1995) Sequence-specific RNA recognition by the Xenopus Y-box proteins. J. Biol Chem., 270, 28 297−28 303.
Bouvet, P. and Wolffe, A. P. (1994) A role for transcription and FRGY2 in masking maternal mRNA within Xenopus oocytes. Cell, 77, 931−941.
Broadus, J. and Doe, C. D. (1997) Extrinsic cues, intrinsic cues and microfilaments regulate asymmetric proteins localization inDrosophila neuroblasts. Curr. Biol., 7, 827−835.
Brown, C. E. and Sachs, A. B. (1998) Poly (A) tail length control in Saccharomyces cerevisiae occurs by message-specific deadenylation. Mol. Cell Biol., 18, 6548−6559.
Burd, C. G. and Dreyfuss, G. (1994) Conserved structures and diversity of functions of RNA-binding proteins. Science, 265, 615−621.
Burd, C. G., Matunis, E. L. and Dreyfuss, G. (1991) The multiple RNA-binding domains of the mRNA poly (A)-binding protein have different RNA-binding activities. Mol Cell Biol., 11, 34 193 424.
Bycroft, M., Hubbard, T. G. P., Proctor, M., Fleund, S. M. V. and Murzin, A. G. (1997) The solution structure of the SI RNA binding domain: a member of an ancient nucleic acid-binding fold. Cell, 88, 235−242.
Caponigro, G. and Parker, R. (1995) Multiple functions for the poly (A)-binding protein in mRNA decapping and deadenylation in yeast. Genes Dev., 9, 2421−2432.
Caponigro, G. and Parker, R. (1996) Mechanisms and control of mRNA turnover in Saccharomyces cerevisiae. Microbiol. Rev., 60, 233−249.
Carpousis, A. J., Vanzo, N. F. and Raynan, L. C. (1999) mRNA degradation a tale of poly (A) and multiprotein machines. Trends in Genetics, 15, 24−28.
Cervera, M., Dreyfuss, G. and Penman, S. (1981) Messenger RNA is translated when associated with the cytoskeletal framework in normal and VSV-infected HeLa cells. Cell, 23, 113 120.
Chan, Y.-L., Gutell, R, Noller, H. F. and Wool, I. G. (1984) The nucleotide sequence of a rat 18S ribosomal ribonucleic acid gene and a proposal for the secondary structure of 18S ribosomal ribonucleic acid. J. Biol. Chem., 259, 224−230.
Chen, C.-Y. A., Chen, T.-M. and Shyu, A.-B. (1994) Interplay of two functionally and structurally distinct domains of the c-fos AU-rich element specifies its mRNA-destabilizing function. Mol.Cell. Biol., 14, 416−426.
Chen, C.-Y. A. and Shyu, A.-B. (1995) AU-rich elements: characterization and importance in mRNA degradation. TIBS, 20, 465−470.
Coller, J. M., Gray, N. K. and Wickens, M. P. (1998) mRNA stabilization by poly (A) binding protein is independent of poly (A) and requires translation. Genes Dev., 12, 3226−3235.
Condeelis, J. (1995) Elongation factor la, translaion and the cytosceleton. TIBS, 20, 169−170.
Cummings, A. and Sommerville, J. (1988) Protein kinase activity associated with stored messenger ribonucleoprotein particles of Xenopus oocytes. J Cell Biol, 107, 45−56.
Darnborough, C. H. and Ford, P. J. (1981) Identification in Xenopus laevis of class of oocyte-specific proteins bound to messenger RNA. Eur. J. Biochem., 113, 415−424.
Davydova, E. K., Evdokimova, V. M., Ovchinnikov, L. P. and Hershey, J. W. B. (1997) Overexpression in COS cells of p50, the major core protein associated with mRNA, results in translation inhibition. Nucleic Acids Res., 25, 2911−2916.
Day, D. A. and Tuite, M. F. (1998) Post-transcriptional gene regulatory mechanisms in eucaryotes: an overview. J. of Endocrinology, 157, 361−371.
Deardorff, J. A. and Sachs, A. B. (1997) Differential effects of aromatic and charged residue substitutions in the RNA binding domains of the yeast poly (A)-binding protein. J. Mol. Biol., 269, 67−81.
Decker, C. J. and Parker, R. (1993) A turnover pathway for both stable and unstable mRNAs in yeast: evidence for a requirement for adenylation. Genes Dev., 7, 1632−1643.
Dehlin, E., Wormington, M., Korner, C. G. and Wahle, E. (2000) Cap-dependent deadenylation of mRNA. EMBO J., 19, 1079−1086.
Deo, R. C., Bonanno, J. B., Sonenberg, N. and Burley, S. K. (1999) Recognition of polyadenylate RNA by the poly (A)-binding protein. Cell, 98, 835−845.
Deschamps, S., Viel, A., Garrigos, M., Denis, H. and le Maire, M. (1992) mRNP4, a major mRNA-binding protein from Xenopus oocytes is identical to transcription factor FRGY2. J.Biol.Chem., 267, 13 799−13 802.
Didier, D. K., Schiffenbauer, J., Woulfe, S. L., Zaceis, M. and Schwartz, B. D. (1988) Characterization of the cDNA encoding a protein binding to the major histocompatibility complex class II Y-box. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 85, 283−287.
Dreyfuss, G. (1986) Structure and function of nucleolar and cytoplasmic ribonucleoprotein particles. Ann. Rev. Cell Biol, 2, 459−498.
Evdokimova, V. M., Kovrigina, E. A., Nashchekin, D. V., Davydova, E. K., Hershey, J. W. B. and Ovchinnikov, L. P. (1998) Major core mRNP protein p50 promotes initiation of protein biosynthesis in vitro. J. Biol. Chem., 273, 3574−3581.
Evdokimova, V. M. and Ovchinnikov, L. P. (1999) Translational regulation by Y-box transcription factor: involvement of the major mRNA-associated protein, p50. The Int. J. of Biochem.& Cell Biol., 139−149.
Ford, L. P., Watson, J., Keene, J. D. and Wilusz, J. (1999) ELAV proteins stabilize deadenylated intermediates in a novel in vitro mRNA deadenylation/degradation system. Genes Dev., 13, 188−201.
Ford, L. P. and Wilusz, J. (1999) An in vitro system using HeLa cytoplasmic extracts that reproduces regulated mRNA stability. Methods, 17, 21−27.
Fox, C. A. and Wickens, M. (1990) Poly (A) removal during oocyte maturation: a default reaction selectively prevented by specific sequences in the 3' UTR of certain maternal mRNAs. Genes Dev., 4, 2287−2298.
Fuerst, T. R. and Moss, B. (1989) Structure and stability of mRNA synthesized by vaccinia virus-encoded bacteriophage T7 polymerase in mammalian cells. Importance of the 5' untranslated leader. J. Mol. Biol, 206, 333−348.
Fuerst, T. R., Niles, E. G., Studier, F. W. and Moss, B. (1986) Eukaryotic transient-expression system based on recombinant vaccinia virus that synthesizes bacteriophage T7 RNA polymerase. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83, 8122−8126.
Gallie, D. R. (1991) The cap and poly (A) tail function synergistically to regulate mRNA translational efficiency. Genes and Dev., 5, 2108−2116.
Gallie, D. R. and Tanguay, R. (1994) Poly (A) binds to initiation factors and increases Cap-dependent translation in vitro. J. Biol Chem., 269, 17 166−17 173.
Gao, M., Fritz, D. T., Ford, L. P. and Wilucz, J. (2000) Interaction between a poly (A)-specific ribonuclease and the 5' cap influences mRNA deadenylation rates in vitro. Mol. Cell, 5, 479−488.
Gavrilova, L. P., Rutkerth, N. M., Gelfand, V. I., Motuz, L. P., Stahl, J., Bommer, U. A. and Bielka, H. (1987) Immunofluorescent localization of protein synthesis components in mouse embryo fibroblasts. Cell Biol Int.Rep., 11, 745−753.
Geoghegan, T., Cereghini, S. and Brawerman, G. (1979) Inactive mRNA-protein complexes from mouse sarcoma-180 ascites cells. Proc. Natl Acad Sci. USA, 76, 5587−5591.
Gingras, A.-C., Raught, B. and Sonenberg, N. (1999) eIF4 initiation factors: effectors of mRNA recruitment to ribosomes and regulators of translation. Annu. Rev. Biochem., 68, 913−963.
Goldstein, J., Pollitt, N. S. and Inouye, M. (1990) Major cold shock protein of Escherichia coli. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 87, 283−287.
Gorlach, M., Burd, C. G. and Dreyfuss, G. (1994) The mRNA poly (A)-binding protein: localization, abundance, and RNA-binding specificity. Exp. Cell Res., 211, 400−407.
Gorlach, M., Burd, C. G., Portman, D. S. and Dreyfuss, G. (1993) The hnRNP proteins. Mol. Biol Reports, 18, 73−78.
Grant, C. E. and Deeley, R. G. (1993) Cloning and characterization of chicken YB-1: Regulation of expression in the liver. Mol. Cell Biol, 13, 4186−4196.
Graumann, P. and Marahiel, A. (1996a) A case of convergent evolution of nucleic acid binding modules. BioEssays, 18, 309−315.
Graumann, P. and Marahiel, M. A. (1994) The major cold shock protein of Bacillus subtilis CspB binds with high affinity to the ATTGG- and CCAAT sequences in single stranded oligonucleotides. FEBSLett., 338, 157−160.
Graumann, P. and Marahiel, M. A. (1996b) Some like it cold: response of microorganisms to cold shock. Arch. Microbiol, 166, 293−300.
Graves, R. A., Pandey, N. B., Chodchoy, N. and Marzluff, W. B. (1987) Translation is required for regulation of histone mRNA degradation. Cell, 48, 615−626.
Gray, N. K., Coller, J. M., Dickson, K. S. and Wickens, M. (2000) Multiple portions of poly (A)-binding protein stimulate translation in vivo. EMBO J., 19, 4723−4733.
Gray, N. K. and Wickens, M. (1998) Control of translation initiation in animals. Annu. Rev. Cell Dev. Biol., 14, 399−458.
Gregorio, E. D., Preiss, T. and Hentze, M. W. (1999) Translation driven by an eIF4G core domain in vivo. EMBOJ., 18,4865−4874.
Gu, W., Tekur, S., Reinbold, R., Eppig, J. J., Choi, Y.-C, Zheng, J. Z. and Murray, M. T. (1998) Mammalian male and female germ cells express a germ cell-specific Y-box protein, MSY2. Biol. Reprod, 59, 1266−1274.
Gunkel, N, Braddock, M., Thorburn, A. M., Muckenthaler, M., Kingsman, A. J. and Kingsman, S. M. (1995) Promoter control of translation in Xenopus oocytes. Nucleic Acids Res., 23, 405−412.
Hanson, J. (1972) Evidence from electron microscope studies on actin paracrystals concerning the origin of the cross-striation in the thin filaments of vertebrate skeletal muscle. Proc. R. Soc. Lond. B., 183, 39−58.
Hayes, R., Kudla, J. and Gruissem, W. (1999) Degrading chloroplast mRNA: the role of polyadenylation. TIBS, 199−202.
Hesketh, J. (1991) Association of ribosomes with myofibrils and microfilaments: a role in the spatial organization of protein synthesis. Biochem Soc Trans., 19, 1103−1107.
Hesketh, J. E. (1996) Sorting of messenger RNAs in the Cytoplasm: mRNA localization and cytoskeleton. Exp. Cell Res., 225, 219−236.
Heuijerjans, J. H., Pieper, F. R., Ramaekers, F. C., Timmermans, L. J., Kuijpers, H., Bloemendal, H. and van Venrooij, W. J. (1989) Association of mRNA and eIF-2 alpha with the cytoskeleton in cells lacking vimentin. Exp. Cell Res., 181, 317−330.
Horwitz, E., Maloney, K. and Ley, T. (1994) A human protein containing a «cold shock» domain binds specifically to H-DNA upstream from the human y-globin genes. J. Biol. Chem., 269, 14 130−14 139.
Howe, J. G. and Hershey, J. W. (1984) Translational initiation factor and ribosome association with the cytoskeletal framework fraction from HeLa cells. Cell, 37, 85−93.
Hu, K. H., Liu, E., Dean, K., Gingras, M., DeGraff, W. and Trun, N. J. (1996) Overproduction of three genes leads to camphor resistance and chromosome condensation in Escherichia coli. Genetics, 143, 1521−1532.
Iizuka, N., Najita, L., Franzusoff, A. and Sarnow, P. (1994) Cap-dependent and cap-independent translation by internal initiation of mRNA in cell extracts prepared from Saccharomyces cerevisiae. Mol. Cell Biol, 14, 7322−7330.
Imataka, H., Gradi, A. and Sonenberg, N. (1998) A newly identified N-terminal amino acid sequence of human eIF4G binds poly (A)-binding protein and functions in poly (A)-dependent translation. EMBO J., 17, 7480−7489.
Ito, K., Tsutsumi, K., Kuzumaki, T., Gomez, P., Otsu, K. and Ishikawa, K. (1994) A novel growth-inducible gene that encodes a protein with a conserved cold-shock domain. Nucleic Acids Res., 22, 2036−2041.
Jackson, R. J. and Standart, N. (1990) Do the poly (A) tail and 3' untranslated region control mRNA translation? Cell, 62, 15−24.
Jacobs, J. S., Anderson, A. R. and Parker, R. P. (1998) The 3' to 5' degradation of yeast mRNAs is a general mechanism for mRNA turnover that requires the SKI2 DEVH box protein and 3' to 5' exonucleases of the exosome complex. EMBOJ., 17, 1497−1506.
Jacobson, A. and Favreau, M. (1983) Possible involvment of poly (A) in protein synthesis. Nucleic Acid Research, 11, 6353−6368.
Jansen, R. P. (1999) RNA-cytoskeletal associations. FASEBJ., 13, 455−466.
Jiang, W., Hou, Y. and Inouye, M. (1997) CspA, the major cold-shock protein of Escherichia coli, is an RNA chaperone. J. Biol Chem., 272, 196−202.
Jindal, S. and Young, R. A. (1992) Vaccinia virus infection induces a stress response that leads to association of Hsp70 with viral proteins. J. Virol., 66, 5357−5362.
Johnston, D. S. (1995) The intracellular localization of messenger RN As. Cell, 81, 161−170.
Jones, P. G. and Inouye, M. (1994) The cold-shock response a hot topic. Mol. Microbiol, 11, 811−818.
Jones, P. G., Krah, R., Tafuri, S. R. and Wolffe, A. P. (1992) DNA gyrase, CS7.4, and the cold shock response in Escherichia coli. J. Bacteriol., 174, 5798−5802.
Jones, P. G., VanBogelen, R. A. and Neidhardt, F. C. (1987) Induction of proteins to low temperature in Escherihia coli. J. Bacteriol., 169, 2092−2095.
Kedersha, N. L., Gupta, M., Li, W., Miller, I. and Anderson, P. (1999) RNA-binding proteins TIA-1 and TIAR link the phosphorylation of eIF-2 alpha to the assembly of mammalian stress granules. J Cell Biol, 147, 1431−1442.
Kessler, S. H. and Sachs, A. B. (1998) RNA recognition motif 2 of yeast Pablp is required for its functional interaction with eukaryotictranslation initiation factor 4G. Mol Cell Biol, 18, 51−57.
Kick, D., Barret, P., Cummings, A. and Sommerville, J. (1987) Phosphorylation of a 60 kDa polypeptide from Xenopus oocytes blocks messenger RNA translation. Nucleic Acids Res., 15, 4099−4109.
King, M. L. (1996) Molecular basis for cytoplasmic localization. Dev.Genet., 19, 183−189.
Kolluri, R, Torrey, T. A. and Kinniburgh, A. J. (1992) A CT promoter element binding protein: definition of a double-strand and a novel single-strand DNA binding motif. Nucleic Acids Res., 20, 111−116.
Korneeva, N. L. and Jockusch, B. M. (1996) Light microscopic analysis of ligand-induced actin filament suprastructures. Eur. J. Cell Biol, 71, 351−355.
Korner, C. G. and Wahle, E. (1997) Poly (A) shortening by a mammalian poly (A)-specific 3'-exoribonuclease. J. Biol Chem., 272, 10 448−10 456.
Korner, C. G., Wormington, M., Muckenthaler, M., Schneider, S., Dehlin, E. and Wahle, E. (1998) The deadenylating nuclease (DAN) is involved in poly (A) tail removal during the meiotic maturation of Xenopus oocytes. EMBO J., 17, 5427−5437.
Kovrigina, E. A., Nashchekin, D. V., Evdokimova, V. M. and Ovchinnikov, L. P. (1996) Major core protein of the cytoplasmic mRNP, p50, required for translation mRNA in vitro. Biochemistry (Moscow), 61, 1575−1581.
Kraemar, D. and Blobel, G. (1997) mRNA binding protein mrnp41 localizes to both nucleus and cytoplasm. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 94, 9119−9124.
Kruys, V., Marinx, O., Shaw, G., Deschamps, J. and Huez, G. (1989) Translational blockade imposed by cytokine-derived UA-rich sequences. Science, 245, 852−855.
Kiihn, U. and Pieler, T. (1996) Xenopus poly (A) binding protein: functional domain in RNA binding and protein-protein interaction. J. Mol. Biol, 256, 20−30.
Kwon, Y. K., Murray, M. and Hechte, N. (1993) Proteins gomologous to the Xenopus germ cell-specific RNA-binding proteins p54/p56 are temporally expressed in mouse male germ cells. Dev. Biology, 158, 90−100.
La Teana, A., Brandi, A., Falconi, M., Spurino, R., Pon, C. L. and Gualerzi, C. O. (1991) Identification of a cold shock transcriptional enchancer of the Escherichia coli gene encoding nucleoid protein H-NS. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 88, 10 907−10 911.
Ladomery, M. and Sommerville, J. (1995) A role for Y-box proteins in cell proliferation. BioEssay, 17, 9−11.
Laemmli, U. (1970) Cleavage proteins during the assembly of head of bacteriophage T4. Nature, 227, 680−685.
Laird-Offringa, I. A., de Wit, C. L., Elfferich, P. and van der EB, A. J. (1990) Poly (A) shortening is the translation-dependent step in c-myc mRNA degradation. Mol Cell Biol, 10, 6132−6140.
Landsman, D. (1992) RNP-1, an RNA-binding motif is conserved in the DNA-binding cold shock domain. Nucl. Acids Res., 20, 2861−2864.
Lenk, R. and Penman, S. (1979) The cytoskeletal framework and poliovirus metabolism. Cell, 10, 67−78.
Lenk, R., Ransom, L., Kaufmann, Y. and Penman, S. (1977) A cytoskeletal structure with associated polyribosomes obtained from HeLa cells. Cell, 10, 67−78.
Li, W. W., Hsiung, Y., Wong, V., Galvin, K., Zhou, Y., Shi, Y. and Lee, A. S. (1997) Suppression of grp78 core promoter element-mediated stress induction by the dbpA and dbpB (YB-1) cold-shock domain proteins. Mol. Cell. Biol, 17, 61−68.
Lindquist, S. (1981) Regulation of protein synthesis during heat shock. Nature, 293, 311−314.
Liu, G., Tang, J., Edmonds, B, T., Murray, J, Levin, S. and Condeelis, J. (1996) F-actin sequesters elongation factor la from interaction with aminoacyl-tRNA in a pH-dependent reaction. J. Cell Biology, 135, 953−963.
Long, R. M., Singer, R. H., Meng, X., Gonzalez, I., Nasmyth, K. and Jansen, R.-P. (1997) Mating type switching in yeast controlled by asymmetric localization of ASH1 mRNA. Science, 111, 383−387.
MacDonald, P. M. (1990) Bicoid mRNA localization signal: phylogenetic conservation of function and RNA secondary structure. Developmnet, 110, 161−171.
Marello, K., La Rovere, J. and Sommerville, J. (1992) Binding of Xenopus oocyte masking proteins to mRNA sequences. Nucleic Acids Res., 20, 5593−5600.
Matsumoto, K., Meric, F. and Wolffe, A. P. (1996) Translational repression dependent on the interaction of the Xenopus Y-box protein FRGY2 with mRNA. J. Biol. Chem., 271, 22 706−22 712.
Matsumoto, K., Wassarman, K. M. and Wolffe, A. P. (1998) Nuclear history of a pre-mRNA determinates the translational activity of cytoplasmic mRNA. EMBOJ., 17, 2107−2121.
Matsumoto, K. and Wolffe, A. (1998) Gene regulation by Y-box proteins: coupling control of transcription and translation. Trends Cell Biol., 8, 318−323.
Menkel, A. R, Kroemker, M., Bubeck, P., Ronsiek, M., Nikolai, G. and Jockusch, B. M. (1994) Characterization of an F-actin-binding domain in the cytoskeletal protein vinculin. J. Cell Biol, 126, 1231−1240.
Meric, F., Matsumoto, K. and Wolffe, A. P. (1997) Regulated unmasking of in vivo synthesized maternal mRNA at oocyte maturation. J. Biol. Chem., 272, 12 840−12 846.
Meric, F., Searfoss, M., Wormington, M. and Wolffe, A. P. (1996) Masking and unmasking maternal mRNA. J. Biol Chem., 271, 30 804−30 810.
Minich, W. B., Korneyeva, N. L., Berezin, Y. V. and Ovchinnikov, L. P. (1989a) A special repressor/activator system controls distribution of mRNA between translationally active and inactive mRNPs in rabbit reticulocytes. FEBSLett., 258, 227−229.
Minich, W. B., Korneyeva, N. L. and Ovchinnikov, L. P. (1989b) Translational active mRNPs from rabbit reticulocytes are qualitatively different from free mRNA in their translatability in cellfree system. FEBSLett., 257, 257−259.
Minich, W. B., Maidebura, I. P. and Ovchinnikov, L. P. (1993) Purification and characterization of the major 50 kDa repressor protein from cytoplasmic mRNP of rabbit reticulocytes. Eur. J. Biochem., 212, 633−638.
Minich, W. B. and Ovchinnikov, L. P. (1992) Role of cytoplasmic mRNP proteins in translation. Biochimie, 74, 477−483.
Minich, W. B., Volyanik, E. V., Korneyeva, N. L., Berezin, Y. V. and Ovchinnikov, L. P. (1990) Cytoplasmic mRNP proteins affect mRNA translation. Mol. Biol. Rep., 14, 65−67.
Mitchell, P. and Tollervey, D. (2000) mRNA stability in eucaryotes. Curr. Opin. Genet. Dev., 10, 193−198.
Moor, C. H. and Richter, J. D. (1999) Cytoplasmic polyadenilation elements mediate masking and unmasking of cyclin B1 mRNA. EMBO J., 18, 2294−2303.
Morrissey, J. P., DeardorfF, J. A., Hebron, C. and Sachs, A. B. (1999) Decapping of stabilized, polyadenylated mRNA in yeast pabl mutants. Yeast, 15, 687−702.
Moss, E., Lee, R. C. and Ambos, V. (1997) The cold shock domain protein LIN-28 controls developmental timing in C. elegans and is regulated by the lin-4 RNA. Cell, 88, 637−646.
Muckenthailer, M., Gunkel, N., Stripecke, R. and Hentze, M. W. (1997) Regulated poly (A) tail shortening in somatic cells mediated by cap-proximal translation repressor proteins and ribosome association. RNA, 3, 983−995.
Munro, T. P., Magee, R. J., Kidd, G. J., Carson, J. H., Barbarese, E., Smith, L. M. and Smith, R. (1999) Mutational analysis of a heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2 response element for RNA trafficking. JBiolChem., 274, 34 389−34 395.
Munroe, D. and Jacobson, A. (1990) mRNA poly (A) tail, a 3' enhancer of translation initiation. M?/. Cell. Biol, 10, 3441−3455.
Munroe, S. H. and Dong, X. (1992) Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1 catalyzes RNA annealing. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 895−899.
Murray, M. (1994) Nucleic acid-binding properties of the Xenopus oocyte Y box protein mRNP 3−4. Biochemistry, 994, 13 910−13 917.
Murray, M., Schiller, D. and Franke, W. (1992) Sequence analysis of cytoplasmic mRNA-binding protein of Xenopus oocytes identifies a family of RNA-binding proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 11−15.
Nagai, K. (1996) RNA-protein complexes. Curr. Opin. Struct. Biol., 6, 53−61.
Nanbru, C., Lafon, I., Audigier, S., Gensac, M. C., Vagner, S., Huez, G. and Prats, A. C. (1997) Alternative translation of the proto-oncogene c-myc by an internal ribosome entry site. J. Biol. Chem., 272, 32 061−32 066.
Nasmyth, K. and Jansen, R.-P. (1997) The cytoskeleton in mRNA localization and cell differentiation. Curr. Opin. Cell Biol., 9, 396−400.
Negrutskii, B. S., Stapulionis, R. and Deutscher, M. P. (1994) Supramolecular organization of the mammalian translation system. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 91, 964−968.
Nilsson, A. and Nygard, O. (1995) Phosphorylation of eukaryotic elongation factor 2 in differentiating and proliferating HL-60 cells. Biochim Biophys Acta, 1268, 263−268.
Ornelles, D. A., Fey, E. G. and Penman, S. (1986) Cytochalasin releases mRNA from the cytoskeletal framework and inhibits protein synthesis. Mol. Cell. Biol., 6, 1650−1662.
Otero, L. J., Ashe, M. P. and Sachs, A. B. (1999) The yeast poly (A)-binding protein Pablp stimulates in vitro poly (A)-dependent and cap-dependent translation by distinct mechanisms. EMBOJ., 18, 3153−3163.
Ozer, J., Faber, M., Chalkley, R. and Sealy, L. (1990) Isolation and characterization of a cDNA clone for the CCAAT transcription factor EFIA reveals a novel structural motif. J. Biol.Chem., 265, 22 143−22 152.
Pain, V. M. (1996) Initiation of protein synthesis in eucaryotic cells. Eur.J.Biochem., 236, 747−771.
Panniers, R. and Henshaw, E. C. (1984) Mechanism of inhibition of polypeptide chain initiation in heat-shocked Ehrich ascites cells. Eur. J. Biochem., 140, 209−214.
Paris, J., Swenson, K., Piwinica-Worms, H. and Richter, J. D. (1991) Maturation-specific polyadenylation: in vitro activation by p34cdc2 and phosphorylation of a 58-kD CPE-binding protein. Genes and Dev., 5, 1697−1708.
Peng, S. S.-Y., Chen, C.-Y. A., Xu, N. and Shyu, A.-B. (1998) RNA stabilization by AU-rich element binding protein, HuR, an ELAV protein. EMBO J., 17, 3461−3470.
Piron, M., Vende, P., Cohen, J. and Poncet, D. (1998) Rotavirus RNA-binding protein NSP3 interacts with eIF4GI and evicts the poly (A) binding protein from eEF4 °F. EMBO J., 17, 5811−5821.
Preiss, T. and Hentze, M. W. (1998) Dual function of the messenger RNA cap structure in poly (A)-tail-promoted translation in yeast. Nature, 392, 516−520.
Preiss, T. and Hentze, M. W. (1999) From factors to mechanisms: translation and translational control in eucaryotes. Cur. Opinion in Gen. & Dev., 9, 515−521.
Preiss, T., Muckenthaler, M. and Hentze, M. W. (1998) Poly (A)-tail-promoted translation in yeast implications for translational control. RNA, 4, 1321−1331.
Pyronnet, S., Pradayrol, L. and Sonenberg, N. (2000) A cell cycle-dependent internal ribosome entry site. Mol Cell., 5, 607−616.
Ranjan, M., Tafuri, S. R. and Wolffe, A. P. (1993) Masking mRNA from trasnlation in somatic cells. Genes and Development, 1, 1725−1736.
Richter, J. D. (1999) Cytoplasmic polyadenilation in development and beyond. Microbiol AndMol. Biol. Reviews, 63, 446−456.
Richter, J. D. and Smith, L. D. (1984) Reversible inhibition of translation by Xenopus oocyte-specific proteins. Nature, 309, 378−380.
Ross, A. F., Oleynikov, Y., Kislauskis, E. H., Taneja, K. L. and Singer, R. H. (1997) Characterization of a p-actin mRNA zipcode-binding protein. Mol.Cell.Biol., 17, 2158−2165.
Ross, J. (1995) mRNA stability in mammalian cells. Microbiol. Rev., 59, 423−450.
Ross, J. (1997) A hypotesis to explain why translation inhibitors stabilize mRNAs in mammalian cells: mRNA stability and mitosis. Bioessays, 19, 527−529.
Ross, J., Kobs, G., Brewer, G. and Peltz, S. W. (1987) Properties of the exonuclease activity that degrades H4 histone mRNA. J.Biol.Chem., 262, 9374−9381.
Ross, J., Peltz, W., Kobs, G. and Brewer, G. (1986) Histone mRNA degradation in vivo: the first detectable step occurs at a near 3-terminus. Mol. Cell Biology, 6, 4362−4371.
Rubin, H. N. and Halim, M. N. (1993) Why, when and how does the poly (A) tail shorten during mRNA translation? Biochemistry, 25, 287−295.
Ruzanov, P. V., Evdokimova, V. M., Korneeva, N. L., Hershey, J. W. and Ovchinnikov, L. P. (1999) Interaction of the universal mRNA-binding protein, p50, with actin: a possible link between mRNA and microfilaments./. CellSci., 112, 3487−3496.
Sachs, A. and Davis, R. (1990) The poly (A)-binding protein is required for translation initiation and poly (A) tail shortening. Mol. Biol. Rep., 14, 73.
Sachs, A. B. and Davis, R. W. (1989) The poly (A)-binding protein is required for poly (A) shortening and 60 S ribosomal subunit-dependent translation initiation. Cell, 58, 857−867.
Sachs, A. B., Davis, R. W. and Romberg, R. D. (1987) A single domain of yeast poly (A)-binding protein is necessary and sufficient for RNA binding and cell viability. Mol Cell Biol, 1, 3268−3276.
Sachs, A. B. and Deardorff, J. A. (1992) Translation initiation requires the PAB-dependent poly (A) ribonuclease in yeast. Cell, 70, 961−973.
Sachs, A. B., Sarnow, P. and Hentze, M. W. (1997) Starting at the beginning, middle, and end: translation initiation in eukaryotes. Cell, 89, 831−838.
Sakura, I., Maekawa, T., Imamoto, F., Yasuda, K. and Ishii, S. (1988) Two human genes isolated by a novel method encode DNA-binding proteins containing a common region of gomology. Gene, 73, 499−507.
Salvetti, A., Batistoni, R., Deri, P., Rossi, L. and Sommerville, J. (1998) Expression of DjYl, a protein containing a cold shock domain and RG repeat motifs, is targeted to sites of regeneration in planarians. Dev. Biol, 201, 217−229.
Samarina, O. P., Krichevskaya, A. A. and Georgiev, G. P. (1966) Nuclear ribonucleoprotein particles containing messenger ribonucleic acid. Nature, 210, 1319−1321.
Schindelin, H., Marahiel, M. A. and Heinemann, U. (1993) Universal nucleic acid-binding domain revealed by crystal structure of the B. subtilis major cold-shock protein. Nature, 364, 164 168.
Schoenenberger, C. A., Steinmetz, M. 0., Stoffler, D., Mandinova, A. and Aebi, U. (1999) Structure, assembly, and dynamics of actin filaments in situ and in vitro. Microsc Res Tech., 47, 38−50.
Schuster, G., Lisitsky, I. and Klaff, P. (1999) Polyadenylation and degradation of mRNA in the chloroplast. Plant Physiology, 120, 937−944.
Schwartz, D. C. and Parker, R. (1999) Mutations in translation initiation factors lead to increased rates of deadenylation and decapping of mRNAs in Saccharomyces cerevisiae. Mol Cell Biol, 19, 5247−5256.
Searfoss, A. M. and Wickner, R. B. (2000) 3' poly (A) is despensable for translation. Proc. Natl Acad. Sci. USA, 97, 9133−9137.
Shaw, G. and Kamen, R. (1986) A conserved AU sequence from 3' untranslated region of GM-CSF mRNA mediates selective mRNA degradation. Cell, 46, 659−667.
Sheets, M. D., Fox, C. A., Hunt, T., Vande Wounde, G. and Wickens, M. (1994) The 3'-untranslated regions of c-mos and cyclin mRNAs stimulate translation by regulating cytoplasmic polyadenylation. Genes and Dev., 8, 926−938.
Shestakova, E. A., Motuz, L. P. and Gavrilova, L. P. (1993a) Co-localization of components of the protein-synthesizing machinery with the cytoskeleton in GO-arrested cells. Cell Biol. Int., 17, 417−424.
Shestakova, E. A., Motuz, L. P., Minin, A. A. and Gavrilova, L. P. (1993b) Study of localization of the protein-synthesizing machinery along actin filament bundles. Cell. Biol Int., 17, 409−416.
Shyu, A. B., Belasco, J. G. and Greenberg, M. E. (1991) Two distinct destabilizing elements in the c-fos message trigger deadenylation as a first step in rapid mRNA decay. Genes Dev., 5, 221−231.
Shyu, A.-B. and Wilkinson, M. F. (2000) The double lives of shuttling mRNA binding proteins. Cell, 102, 135−138.
Singer, R H. (1993) Spatial organization of mRNA within cells. J. Cell. Biochem., 52, 125 126.
Siomi, H. and Dreyfuss, G. (1997) RNA-binding proteins as regulators of gene expression. Curr. Opin. Gen. Dev., 7, 345−353.
Smailov, S. K., Lee, A. V. and Iskakov, B. K. (1993) Study of phosphorylation of translation elongation factor 2 (EF-2) from wheat germ. FEBS Lett, 321, 219−223.
Sommerville, J. (1992) RNA-binding proteins: masking proteins revealed. BioEssays., 14, 337−338.
Sommerville, J. (1999) Activities of cold-shock domain proteins in translation control. BioEssays, 21, 319−325.
Sommerville, J. and Ladomery, M. (1996a) Masking of mRNA by Y-box proteins. FASEB J., 10, 435−443.
Sommerville, J. and Ladomery, M. (1996b) Transcription and masking of mRNA in germ cells: involvment of Y-box proteins. Chromosoma, 104, 469−478.
Spirin, A. S. (1994) Storage of messenger RNA in eukaryotes: envelopment with protein, translational barrier at 5' side, or conformational masking by 3' side? Mol Reprod. Dev., 38, 107 117.
Spirin, A. S. (1996) Masked and translatable messenger ribonucleoproteins in higher eukaryotes. In Translational control (Edited by Hershey J. W. B., Mathews M. B. and Sonenberg N.) Cold Spring Harbor Laboratory press, New York, 319−334.
Spirin, A. S. and Ajtkhozhin, M. A. (1985) Informosomes and polyribosome associated proteins in eukaryotes. TrendsBiochem. Sci., 10, 162−165.
Stapulionis, R., Kolli, S. and Deutcher, M. P. (1997) Efficient mammalian protein synthesis requires an intact F-actin system. J. Biol. Chem., 272, 24 980−24 986.
Sundell, C. L. and Singer, R. H. (1991) Requirements of microfilaments in sorting of actin messenger RNA. Science, 252, 1275−1277.
Svitkin, Y. V., Lyapustin, V. N., Lashkevich, V. A. and Agol, V. I. (1986) Synthesis and membrane-dependent processing of a precursor of tick-borne encephalitis virus (flavivirus) structural proteins in cell-free systems. Mol. Biol., 20, 1251−1263.
Svitkin, Y. V., Ovchinnikov, L. P., Dreyfuss, G. and Sonenberg, N. (1996) General RNA binding proteins render translation cap dependent. EMBO J., 15, 7147−7155.
Swamynathan, S. K., Nambiar, A. and Guntaka, R. V. (1998) Role of single-stranded DNA regions and Y-box proteins in transcriptional regulation of viral and cellular genes. FASEB J., 12, 515−522.
Tafuri, S. and Wolffe, A. (1993) Selective recruitment of masked maternal mRNA from messenger ribonucleoprotein particles containing FRGY2 (mRNP4). J. Biol. Chem., 268, 2 425 524 261.
Tafuri, S. R., Familari, M. and Wolffe, A. P. (1993) A mouse Y box protein, MSY1, is associated with paternal mRNA in spermatocytes. J. Biol. Chem., 268, 12 213−12 220.
Tafuri, S. R. and Wolffe, A. P. (1990) Xenopus Y-box transcription factors: molecular cloning, functional analysis and developmental regulation. Proc. Natl. Acad Sci. USA, 87, 90 289 032.
Takizawa, P. A., Sil, A., Swedlow, J. R., Herskowitz, I. and Vale, R. D. (1997) Actin-dependent localization of an RNA encoding a cell-fate determinants in yeast. Nature (London), 389, 90−93.
Taneja, K. L., Lifshitz, L. M., Fay, F. S. and Singer, R. H. (1992) Poly (A) RNA codestribution with microfilaments: evaluation by in situ hybridization and quantitative digital imaging microscopy. J.CellBiol., 119, 1245−1260.
Tarun, S. Z. and Sachs, A. B. (1995) A common function for mRNA 5' and 3' ends in translation initiation in yeast. Genes Dev., 9,2997−3007.
Tarun, S. Z. and Sachs, A. B. (1996) Association of the yeast poly (A) tail binding protein with translational initiation factor eIF-4G. EMBOJ., 15, 7168−7177.
Tarun, S. Z., Wells, S. E., Deardorff, J. A. and Sachs, A. B. (1997) Translation initiation factor eIF4G mediates in vitro poly (A) tail-dependent translation. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 94, 9046−9051.
Van Venrooij, W. J., Van Eekelen, C. A. G., Jansen, R. T. P. and Princen, J. M. G. (1977) Specific polyA-binding protein of 76,000 molecular weight in polyribosomes is not present on polyA of free cytoplasmic mRNP. Nature, 270, 189−191.
Vilela, C., Velasco, C., Ptushkina, M. and McCarthy, J. E. G. (2000) The eucaryotic mRNA decapping protein Dcpl interacts physically and functionally with the eIF4 °F translation initiation complex. EMBO J., 19, 4372−4382.
Vincent, A., Goldberg, S. and Scherrer, K. (1981) Comparison of proteins associated with duck-globin mRNA and its polyadenylated segment in polyribosomal and repressed free messenger ribonucleoprotein complex. Eur. J. Biochem., 114, 179−193.
Visa, N., Alzhanova-Ericsson, A. T., Sun, X., Kiseleva, E., Bjorkroth, B., Wurtz, T. and Danehold, B. (1996) A pre-mRNA-binding protein accompanies the RNA from the gene through the nuclear pores and into polysomes. Cell, 84, 253−264.
Voeltz, G. K. and Steitz, J. A. (1998) AUUUA sequences direct mRNA deadenylation uncoupled from decay during Xenopus early development. Mol. Cell Biol, 18, 7537−7545.
Wang, Z., Day, N., Trifillis, P. and Kiledjian, M. (1999) An mRNA stability complex functions with poly (A)-binding protein to stabilize mRNA in vitro. Mol Cell. Biol, 19, 4552−4560.
Wang, Z. and Kiledjian, M. (2000) The poly (A)-binding protein and an mRNA stability protein jointly regulate an endoribonuclease activity. Mol Cell Biol, 20, 6334−6341.
Wei, C.-C., Balasta, L. M., Ren, J. and Goss, D. J. (1998) Wheat germ poly (A) binding protein enhances the binding affinity of eucaryotic initiation factor 4 °F and (iso)4 °F for cap analogues. Biochemistry, 37, 1910−1916.
Wells, S., Hillner, P., Vale, R. D. and Sachs, A. (1998) Circularization of mRNA by eucaryotic translational initiation factors. Mol. Cell, 2, 135−140.
Wickens, M., Anderson, P. and Jackson, R. J. (1997) Life and death in cytoplasm: messages from 3' end. Curr. Opin. Gen. Dev., 7, 220−232.
Wilhelm, J. E. and Vale, R. D. (1993) RNA on the move: the mRNA localization pathway. J. Cell Biol., 123, 269−274.
Wisdom, R. and Lee, W. (1991) The protein-coding region of c-myc mRNA contains a sequence that specifies rapid mRNA turnover and induction by protein synthesis inhibitors. Genes Dev., 5, 232−243.
Wistow, G. (1990) Cold shock and DNA binding. Nature, 344, 823−824.
Wolffe, A. (1994) Structural and functional properties of the evotutionarily ancient Y-box family of nucleic acid binding proteins. BioEssays, 16, 245−251.
Wolffe, A. P. (1995) The cold-shock response in bacteria. Sci. Prog., 78, 301−310.
Wolffe, A. P. and Meric, F. (1996) Coupling transcription to translation: a novel site for regulation of eukaryotic gene expression. Int. J. Biochem. Cell Biol, 28, 247−257.
Wolffe, A. P., Tafuri, S., Ranjan, M. and Familiari, M. (1992) The Y-box factors: a family of nucleic acid binding proteins conserved from Escherichia coli to man. New Biologist, 4, 290−298.
Xu, N., Chen, C.-Y. A. and Shyu, A.-B. (1997) Modulation of the fate of cytoplasmic mRNA by AU-Rich elements: key sequence features controlling mRNA deadenylation and decay. Mol. Cell Biol., 17, 4611−4621.
Yamanaka, K. and Inouye, M. (1997) Growth-phase-dependent expression of cspD, encoding a member of the CspA family in Escherichia coli. J. Bacteriol, 179, 5126−5130.
Yang, F., Demma, M., Warren, V., Dharmawardhane, S. and Condeelis, J. (1990) Identification of an actin-binding protein from Dictyostelium as elongation factor la. Nature (London), 347, 494−496.
Yenofsky, R., Bergman, I. and Brawerman, G. (1982) Messenger mRNA species partially in a repressed state in mouse sarkoma ascites cells. Proc. Natl. Acad Sci. USA, 79, 5876−5880.
Yisraeli, J. K., Sokol, S. and Melton, D. A. (1990) A two-step model for the localization of m RNA in Xenopus oocytes: involevement of microtubules and microfilaments in the translocation and anchoring of Vgl mRNA. Developement, 108, 289−298.
Zambetti, G., Fey, E. G., Penman, S., Stein, J. and Stein, G. (1990) Multiple types of mRNA-cytoskeleton interactions. J. Cell Biochem., 44, 177−187.

Заполнить форму текущей работой