Идентификация и свойства бета-лактамаз полирезистентных штаммов грамотрицательных бактерий
Модифицированные микрон одометрический и потенциомегрический методы определения /-лактамазной активности и метод быстрого обнаружения двухЗ-лактамаз у штамма с помощью ЭВМ могут быть использованы в лабораторной практике цри характеристике полирезистентных клинических штаммов бактерий, а также при поисковой работе и оценке новых-лактамных структур. Практическая ценность работы. Изученные… Читать ещё >
Содержание
- ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- ГЛАВА I. ИСТОРИЯ ОТКРЫТИЯ, БИОЛОГИЧЕСКАЯ РОЛЬ И
- ПРОИСХОЖДЕНИЕ .^-ЛАКТАМАЗ
- ГЛАВА 2. ОСНОВНЫЕ СВОЙСТВА /-ЛАКТАМАЗ ГРАМПО ЛОЖИТЕЛЬНЫХ И ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ
- 2. 1. Субстратные спектры-лактамаз и новые? -лактамные антибиотики
- 2. 2. Ингибиторы и индукторы ^-лактамаз
- ГЛАВА 3. АНАЛИТИЧЕСКИЕ И ПРЕПАРАТИВНЫЕ МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ. /-ЛАКТАМАЗ
- 3. 1. Микробиологические методы определения ^з-лактамаз
- 3. 2. Методы регистрации-лактамазной активности
- 3. 3. Аналитическое изоэлектрическое фокусирование. .^-лактамаз
- 3. 4. Методы выделения и очистки ^А-лактамаз
- ГЛАВА 4. СИСТЕМЫ КЛАССИФИКАЦИИ И ПРИМЕНЕНИЕ
- -ЛАКТАМАЗ
- 4. 1. Основные принципы классификации
- -лактамаз
- 4. 2. Использование-лактамаз при скрининге з-лактамных структур и характеристике новых полусинтетических 3 -лактамных соединений
- ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
- I. Бактериальные штаммы — источнике .Я-лактамаз
- 2. Антибиотики и основные реактивы
- 3. Методы очистки и изучения З-лактамаз
- РЕЗУЛЬТАТЫ
- ГЛАВА I. РАЗРАБОТКА МЕТОДОВ ОПРВДЕЯЕНШ АКТИВНОСТИ И ХАРАКТЕРИСТИКИ СВОЙСТВ Я -ЛАКТАМАЗ
- 1. 1. Определение л-лактамаз.ной активности модифицированным микроиодометрическим методом
- 1. 2. Модифицированный потенциометрический метод определения активности, ^б-лактамаз
- 1. 3. Метод препаративного изоэлектрического фокусирования ^-лактамаз
- ГЛАВА 2. ИЗУЧЕНИЕ СВОЙСТВ И КЛАССИФИКАЦИЯ
- -ЛАКТАМАЗ ИЗ ПОЗШРЕЗИСТЕНТНЫХ ШТАММОВ. ГРАМОТРИЦАТЕЛЬНЫХ БАКТЕРИЙ
- 2. 1. Характеристика ферментов цефалоспориназного типа действия
- 2. 2. Свойства пенициллиназ различных классов
- ГЛАВА 3. ДИФФЕРЕНЦИАЦИЯ БАКТЕРИАЛЬНЫХ-ЛАКТАМАЗ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ЭВМ
- 3. 1. Вывод расчетной формулы
- 3. 2. Применение программы вьас для анализа спектров-лактамазной активности и подтверждение данных ЭВМ методами препаративного разделения ферментов
- ГЛАВА 4. ВЫДЕЛЕНИЕ, ОЧИСТКА И ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА /-ЛАКТАМАЗЫ ПЕНИЦИЛЛИНАЗНО-ГО ТИПА, ОБРАЗУЕМОЙ citrobacter
- PREUNDII
- ГЛАВА 5. ВЫДЕЛЕНИЕ, ОЧИСТКА И ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА jÖ--ЛАКТАМАШ ЦЕФАЛОСПОРИНАЗ-НОГО ТИПА ИЗ КЛЕТОК enterobacter aerogeues
- ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ. вывода
- ШСОМЕНДАЦИИ ПО ПРАКТИЧЕСКОМУ ПРИМЕНЕНИЮ РЕЗУЛЬТАТОВ РАБОТЫ
Идентификация и свойства бета-лактамаз полирезистентных штаммов грамотрицательных бактерий (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Актуальность проблемы.
Бактериальная резистентность к широко применяемым в клинике /-лактамным антибиотикам — пенициллинам и цефалоспоринам обусловлена в большинстве случаев их ферментативной инактивацией. Ферменты, инактивирующие /-лактамные антибиотики путем расщепления £-лактамного кольца, получили название ^-лактамаз.
— Лактамазы составляют обширную группу ферментов, различающихся по субстратной специфичности и другим свойствам. Наиболее многочисленную и сравнительно мало изученную группу-лак-тамаз составляютлактамазы грамотрицательных.бактерий. Кроме того, внедрение в клинику. новых поколений пенициллинов. и цефа-лоспоринов приводит. к распространению в микробных популяциях-лактамаз с измененными субстратными спектрами, а также к появлению штаммов бактерий, содержащих в клетке две различных по субстратной. специфичностиб-лактамазы. Разностороннее. изучение каталитических и физико-химических свойствз-лактамаз грамотрицательных бактерий является весьма актуальным, поскольку, эффективность антибиотикотерапии во многом зависит. от создания новых /-лактамных структур, не являющихся субстратами наиболее распространенных. £-лактамаз. Препараты £-лактамаз необходимы при оценке, .получаемых путем скрининга или химической, трансформации-лактамных антибиотиков, а также при оценке ингибиторов-лактамаз, которые могут быть использованы в комбинациях с-лактамными антибиотиками.. Характеристика. /-лактамаз бактерий, выделяемых в клинике, необходима при изучении эпидемиологии антибиотикорезистент-ности. .
Цель и основные задачи работы.
Цель работы заключалась в идентификации, изучении свойств и классификации-лактамаз, ввделенных из клинических полирезистентных штаммов грамотрицательных бактерий, принадлежащих к семейству Enterobacteriaceae И роду Pseudomonas, Для ЭТОГО предстояло решить следующие основные задачи: — модифицировать микроиодометрический и потенциометричес-кий методы определения активности3-лактамаз с целью их использования для работы как с пенициллинами, так и с цефалоспоринами;
— разработать быстрый метод дифференциации ^ß—лактамаз у штаммов, содержащих по две jß—лактамазы с разным субстратным спектром;
— определить субстратную, специфичность и провести классификацию >-лактнмаз, присутствующих у. полирезистентных жаммов, выявить среди них частоту встречаемости бактерий, содержащих в клетке одновременно две различные js-лактамазы;
— выделить, очистить до гомогенного состояния и исследовать физико-химические свойства /-лактамаз пенициллиназного и цефа-лоспориназного типов- .
— изучить особенности взаимодействия очищенных препаратов J3—лактамаз. -с ингибиторами — аналогами субстратов.
Научная новизна работы. Получены данные о субстратной. специфичности и распределении по классификационным группам ./-лактамаз полирезистентных штаммов грамотрицательных бактерий, выделенных в ряде клиник.
Разработаны схемы выделения высокоочищенных ферментных препаратов ß—лактамаз. .
Предложена модификация микроиодоме. трического метода определения активности yö—лактамаз, позволяющая использовать этот метод при сравнительных исследованиях ферментов, а также в случае испытания как субстратов не только пенициллинов, но и цефалоспо-ринов.
Внесены модификации в потенциометрический метод определения ,^-лактамазной активности, уменьшающие зависимость получаемых результатов от непостоянства емкости буферных растворов при изменениях рН.
Впервые разработан основанный на применении ЭВМ метод, позволяющий быстро устанавливать одновременное наличие в клетках одного штамма двух-лактамаз. Метод может быть использован дляхарактеристики штаммов при массовых исследованиях и изучении эпидемиологии-лактамаз и не требует предварительного разделения ферментных., б елков.
Модифицирован, применительно кй-лактамазам, метод изсн-электрического фокусирования, позволяющий выделять,з-лактама-зы в препаративных количествах. Модификации приводят к более полному извлечениюВ-лактамаз из геля, ж предотвращают возможную инактивацию ферментных белков цри крайних (низких или высоких) значениях рН во время их миграции в геле.
При изучении кинетики гидролиза различных субстратов гомогенными препаратами-лактамаз впервые для регистрации ферментативной активности был использован метод кругового дихроизма, позволивший выявить особенности действия этих ферментов на некоторые субстраты, не выявляемые обычными методами, а также оцре-делить дот оСиспиральных участков в полипептидной цепи.
Практическая ценность работы. Изученные бактериальные штаммы с установленным классом ./З-лактамаз были рекомендованы к использованию в лабораторной практике во ВНИИА: I) при сравнительной характеристике новых клинических штаммов, 2) при поиске и оценке природныхЛ-лактамных структур с антибиотическими свойствами и/или свойствами ингибиторов ./-лактамаз.
Гомогенный препарат фермента цефалоспориназного типа был применен в практике работы ВНИИА при изучении фармакокинетики антибиотиков в случае комбинированной антибиотикотерапии. Фермент использован для инактивации цефалоспоринов (и выявлении при этом активности применяемых совместно с цефалоспоринами аминогликози-дов).
Модифицированные микрон одометрический и потенциомегрический методы определения /-лактамазной активности и метод быстрого обнаружения двухЗ-лактамаз у штамма с помощью ЭВМ могут быть использованы в лабораторной практике цри характеристике полирезистентных клинических штаммов бактерий, а также при поисковой работе и оценке новых-лактамных структур.
Методы препаративного выделения-лактамаз, в частности с помощью улыврафильтрации и изофокусирования могут быть использованы в работах по получению этих ферментов.
— 122 -ВЫВОДЫ.
1. Из 56 полирезистентных клинических штаммов грамотрица-тельных бактерий выделены и охарактеризованы препараты? -лак-тамаз. Изученные /-лактамазы отнесены к пяти классам по клас-. сификации Richmond. Около 30 $ из них составляли ферменты цефало-спориназного типа (I класс), 70 $ - пенициллиназы (П-У.классы). Видовой специфичности? -лактамаз не было обнаружено.
2. Разработаны модифицированные микроиодометрический и по-тенциометрический методы определения? -лактамаз. Методы. при-, годны для работы с различными? -лактамазами при использовании. в качестве субстратов как пенициллинов, так и цефалоспоринов. Разработан модифицированный метод изоэлектрического фокусированиялактамаз для аналитических и препаративных целей.
3. Разработан метод анализа спектра? -лактамазной активности с использованием ЭВМ, позволяющий выявлять одновременное присутствие у штамма двух? -лактамаз с описанием субстратного спектра каждого фермента. Обнаружены сочетания /-лактамаз (ТЕМ и PSE-2 — Ш класс, ТЕМ и I класс, ТЕМ и П класс, ТЕМ и У класс).
У штаммов, относящихся к Ps. aeruginosa, Ent. aerogenes, И Kl.pneumoniae. Данные ЭВМ подтверждены биохимическими методами.
4. Пенициллиназа группы ТЕМ, кодируемая плазмидой из Citr. freundii^n ?> -лактамаза цефалоспориназного типа из Ent. aerogenes 6803 с ранее не описанным субстратным спектром были получены в гомогенном состоянии. Определены их кинетические параметры и чувствительность к. реагентам на функциональные группы и? -лактам-ным ингибиторам. Установлено соотношение о (- и? -спиральных структур в молекулах.
5. Применение для изучения /-лактамаз метода кругового дихроизма позволило выявить не обнаруживаемый другими методами медленный гидролиз некоторых ингибиторов /-лактамной структуры. Впервые были определены Км и Ккат при гидролизе рлактамазой ТМ метициллина. Показан гидролиз-лактамазой из Еп-иаегс^епев 6803 ее. ингибитора цефазолина, но не второго ингибитора — цефу-роксима.
6. Штаммы-продуценты охарактеризованных рлактамаз, препараты ферментов, а также модифицированные методы определения активности рлактамаз использованы при скрининге новых рлак-тамных структур.
РЖОМЕНДАЦИИ ПО. ПРАКТИЧЕСКОМУ ПРИМЕНЕНИЮ РЕЗУЛЬТАТОВ РАБОТЫ.
Модифицированные микроиодометрический и потенциометрический методы определения активностилактамаз, а также бактериальные штаммы с идентифицированными и отнесенными к разным классамлактамазами могут быть использованы при скрининге и оценке свойств новых природных и полусинтетических рлактамных структур.
Метод дифференциациилактамаз при помощи ЭВМ может применяться для характеристики бактериальных штаммов при изучении эпидемиологии антибиотикорезистентности.
Указанные методы впервые апробированы в Лаборатории экспериментальной химиотерапии ВНИИА.
— 125.
Список литературы
- Аверьянова Е.В., Богачева Т. И., Роканская Т. И., Селезнева A.A. Экспресс-метод определения активности ингибитора в -лактама-зы. Антибиотики, 1984, 29, И 4, 245−248.
- Бибикова М.В., Иваницкая Л. П., Никишина В. Г., Кузнецова С. М. Характеристика субстратной специфичности сырцов эндогенныхв-лактамаз грамотрицательных бактерий. Антибиотики, 1983, 28, J* 3, 566−573.
- Иваницкая Л.П. Направленный поиск природных беталактамных антибиотиков. Антибиотики, 1982, 28, te 2, 117−136.
- Макарова P.A. К вопросу об образовании пенициллиназы грамотри-цательныш бактериями. Антибиотики, 1968, 13, Ji 5, 391−395.
- Навашин С.М., Петрова М. А., Чавдарова В. Б. Комбинированное действие полу синтетических пенициллинов (ампициллина и оксацил-лина) на клинические штаммы грамполокительных и грамотрица-телышх микроорганизмов. Антибиотики, 1969, 14, te II, 1006-I0II.
- Навашин С.М., Фомина И. П. Природа антибиотикоустойчивости иее механизмы. В кн. «Рациональная антибиотикотерапияй. Москва, „Медицина“, 1982, стр. 28.
- Павлович Н.В., Шиманюк Н. Я., Мшнанышн Б. Н. Выделение и очистка пенициллиназы из клеток возбудителя туляремии. Антибиотики, 1983, 28, Л 10, 743−747.
- Резван С.П., Чайковская С. М. Связь устойчивости E.coli к пенициллинам с образованием пенициллиназы этими культурами. Антибиотики, 1974, 19, Я 2, 139−141.
- Резван С.П., Чайковская С. М. Уровень „внутренней“ устойчивости культур E.coli к бензилпеницидлину. Антибиотики, 1975, 20, ifi 3, 262−266.
- Фомина И.П., Лобусева А. Н., Навашин С. М. Ингибиторы ?-лак-тамаз и их возможная роль в лекарственной терапии. Антибиотики, 1984, 29, Jfi 2, 142−148.
- Чайковская С.М., Венкина Т. Г. Модифицированный и о доме тричес-кий метод определения активности пеницидлиназы. Антибиотики, 1962, 7, А 5, 453−456.
- Baty D., Bernadac A*, Berthois Y», Lazdunski C. Synthesis and export of TEM-1 ?-lactamase in Escherichia coliTPEBS Lett., 1981, 127, N, 1, p. 161−165.
- Breunig K. D", Mackedonski V., Hollenberg C.P. Transcription of the bacterial ?-lactamase gene in Saccharomyces cerevisiae.
- Dubois J., Pechere J.-C., Letarte R. Factors affecting the increase of R plasmids during hospitalization. Current Microbiology, 1981, 5, N 4, p. 219−222.
- Duetz C., Frere J.M., Ghuysen J.M., Van Beeumen J., Delcambe L., Dierickx L. Purification and properties of the exocellular ?-lactamase of Actinomadura strain R39″ Biochim. Biophys. Acta, 1982, 700, N 1, p. 24−32.
- Greenwood D., Eley A. In vitro evaluation of sulbactam, a pe~ nicillanic acid sulphone with ?-lactamase inhibitory properties. J. Antimicrobial Chemotherapy, 1982, 10, N 2, p. 117−123″
- Hamilton-Miller J.M.T. ?-Lactamases and their clinical significance. J. Antimicrobial Chemotherapy, 1982, 9, N 2, Supplement B, p. 11−19*
- Heimdall A., Konow L. von, Kord C"E. Beta-lactamase-producing Bacteroides species in the oral cavity in relation to penicillin therapy. J. Antimicrobial Chemotherapy, 1981, 8, N3″ P" 225−229″
- Holt J., Simpson I.N., Harper P.B. Quantitative methods for assessing stability of ?-lactam antibiotics to cell-free ?-lac-tamase extracts. Soc. Appl. Bacteriol. Tech. Ser. 1983, 18 (Antibiot Assess. Antimicrob. Act. Resist.), p. 127−133″
- Neu H.C. Mechanism of bacterial resistance to antimicrobial agents with particular reference to cefotaxime and other ?~ lactam compounds. Reviews of Infectious Diseases, 1982, 4, Supplement, S288-S299″
- Ogawara H. Biochemical properties of ?-lactamases from strep-tomycetes. Zentralbl. Bakteriol., Mikrobiol., Hyg., Abt.1, Suppl. 1981, 11, (Actinomycetes), p. 291−295″
- Ogawara H., Horikawa S. Purification of ?-lactamase from Streptomyces cellulosae by affinity chromatography on blue sepharose. J. Antibiotics, 1979, 32, N 12, p.1328−1335*
- Reviews of Infections Diseases, 1982, 4, Supplement1, S522-S526.
- Scudamore R.A., Beveridge T.J., Goldner M. Outer membrane penetration barriers as components of intrinsic resistance to beta-lactam and other antibiotics in Escherichia coli K-12. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 1979, 15, N 2, p.182−189.
- Smith W.P., Tai P.-C., Davis B-D. Bacillus licheniformis penicillinase: cleavages and attachment of lipid during cotrans-lational secretion. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1981, 78, N 6, p. 3501−3505.
- Smith J"T., Wyatt J.M. Relation of R factor and chromosomal B-lactamase with the periplasmic space. J. Bacteriology, 1974, 117, N 3, P" 931−939.