Диплом, курсовая, контрольная работа
Помощь в написании студенческих работ

Сравнительное исследование химерных, мутантных и TAG-форм нуклеозиддифосфаткиназы крысы

Диссертация: Сравнительное исследование химерных, мутантных и TAG-форм нуклеозиддифосфаткиназы крысы
ДиссертацияПомощь в написанииУзнать стоимостьмоей работы

В ходе этих исследований особый интерес вызвали данные, согласно которым гексамеры NDP киназы млекопитающих, в отличие от ферментов низших организмов, состоят из двух типов низкомолекулярных (Мт ~ 17 000) предельно консервативных и близких по первичной структуре (степень гомологии 90%, основные различия локализованы в вариабельных областях VI и V2 (остатки 37−50 и 131−150, соответственно… Читать ещё >

Содержание

  • ГЛАВА I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
    • 1. Общие представления о свойствах и функции нуклеозиддифосфаткиназы. Особенности нуклеозиддифосфаткиназы в клетках млекопитающих
    • 2. Трехмерная структура NDP киназы
      • 2. 1. Пространственная структура субъединицы NDP киназы
      • 2. 2. Структура гексамера NDP киназы
    • 3. Мультифункциональная роль NDP киназ в клетке
    • 4. Возможные молекулярные механизмы участия NDP киназ в регуляторных процессах
      • 4. 1. Протеинкиназная активность NDP киназы
      • 4. 2. NM23 как регулятор транскрипции онкогенов
      • 4. 3. Белки, взаимодействующие с NDP киназой
      • 4. 4. NDP киназа как возможный активатор GTP-связывающих белков
    • 5. Взаимодействие NDP киназ с комплексом родопсин-трансдуцин в фоторецепторных мембранах наружных сегментов палочек сетчатки быка
    • 6. Исследование изоформ NDP киназы млекопитающих методом собственной белковой флуоресценции

Сравнительное исследование химерных, мутантных и TAG-форм нуклеозиддифосфаткиназы крысы (реферат, курсовая, диплом, контрольная)

Актуальность темы

Работа посвящена сравнительному исследованию рекомбинантных форм нуклеозиддифосфаткиназы (NDP киназа) млекопитающих — одного из первых известных к настоящему времени супрессоров метастаз при канцерогенезе.

В последнее десятилетие исследования NDP киназ — семейства ферментов, основной функцией которых, как считалось ранее [Park and Agarval, 1973], является синтез нуклеозидтрифосфатов из нуклеозиддифосфатов за счет АТФ, привлекают дополнительное внимание. В начале 90-х годов неожиданно выяснилось, что ряд генов (Nm23), нарушение работы которых ведет к увеличению метастатического потенциала раковых клеток, кодируют субъединицы NDP киназы. Это положило начало новому этапу исследований NDP киназы, в результате которого было показано, что NDP киназы могут играть роль регуляторов транскрипции онкогенов и участвуют во многих клеточных процессах, таких, например, как дифференцировка клеток, метастазирование и апоптоз, причем эти функции NDP киназы не всегда связаны с ее активностью как фермента. Совокупность этих неожиданных данных привела к предположению о том, что NDP киназа является мультифункциональным белком и стимулировала всесторонние исследования представителей этого семейства.

В ходе этих исследований особый интерес вызвали данные, согласно которым гексамеры NDP киназы млекопитающих, в отличие от ферментов низших организмов, состоят из двух типов низкомолекулярных (Мт ~ 17 000) предельно консервативных и близких по первичной структуре (степень гомологии 90%, основные различия локализованы в вариабельных областях VI и V2 (остатки 37−50 и 131−150, соответственно)) субъединиц и, таким образом, представлены в клетке набором изоформ. Оказалось также, что каждый из видов тканей млекопитающих характеризуется своим набором изоформ. Исследования рекомбинантных белков, состоящих из субъединиц только одного типа, показали, что такие изоформы практически неразличимы по своим ферментативным характеристикам и трехмерной структуре в кристалле. Функциональный смысл присутствия в клетке изоформ NDP киназы с одинаковыми каталитическими и структурными свойствами несмотря на усилия многих лабораторий долгое время оставался принципиально неясным. Однако наше недавнее исследование рекомбинантных крысиных NDP киназ, а и Р, содержащих только один тип субъединиц (а или Р), неожиданно показало, что изоформа а, в отличие от изоформы р, способна взаимодействовать с локализованным в мембранах наружных сегментов палочек (НСП) сетчатки комплексом между фотоактивированным рецептором света родопсином (R*) и.

G-белком трансдуцином (Gt) [Orlov et al., 1996]. Такое взаимодействие высокоспецифично, поскольку связанная NDP киназа высвобождается в присутствии GTP, индуцирующего, как известно [Kiihn, 1980], процесс диссоциации комплекса R*-Gt. Эти результаты явились одним из первых прямых экспериментальных подтверждений точки зрения (см. напр. [Kimura, 1993]), согласно которой регуляторное действие NDP киназ может опосредоваться через гетеротримерные GTP-связывающие белки (G-белки), являющиеся ключевыми компонентами систем клеточной трансдукции.

В целях выяснения молекулярной природы различий между изоформами, определяющих их различное сродство к R*-Gt комплексу, в последующей работе было выполнено сравнительное исследование рекомбинантных NDP киназ, а и Р крысы методом собственной белковой флуоресценции [Orlov et al., 1999]. Обе изоформы содержат остатки триптофана и тирозина в одинаковых позициях, но проявляют ярко выраженные различия в положении максимума спектра флуоресценции, форме спектров и значениях квантового выхода (q) при рН 8. Более того, NDP киназа, а подвергается структурным изменениям в диапазоне рН 5−8, тогда как в тех же условиях NDP киназа р не претерпевает структурных перестроек. Подобие рН-зависимостей q флуоресценции NDP киназы, а и процесса связывания этого фермента с R*-Gt комплексом позволило предположить, что различия между NDP киназами, а и р в конформационной лабильности и различия в связывании с комплексом R*-Gt могут иметь ту же самую физическую основу, которая, в свою очередь, и определяет функциональные различия изоформ в клетке.

В независимых работах было также показано [Postel et aL, 2000], что NDP киназа также взаимодействует с определенными сайтами (NHE) промоторных участков гена с-тус и генов факторов роста. Данный тип DNA-связывающей активности, как и обнаруженная недавно неожиданная способность NDP киназы осуществлять процессинг и репарацию DNA, также являются изоформ-специфичными [Agou et al., 1999, 2000; Postel et al., 2000; Postel, 2003]. Все эти данные дали начало сравнительным исследованиям рекомбинантных изоформ NDP киназы и их производных для определения физико-химических основ их функциональных различий. Очевидно, что подобный подход является необходимым этапом при выяснении молекулярных механизмов мультифункциональной активности этих белков в клетке в норме и патологии.

Цели и задачи работы. Основной задачей работы являлось выяснение структурной основы различий между изоформами NDP киназы, возможно определяющей все последующие функциональные различия изоформ в клетках млекопитающих. Для этого были использованы рекомбинантные, а и Р изоформы NDP киназы крысы и различные типы их генноинженерных производных для исследования (1) характеристик белковой флуоресценции этих белков в широком диапазоне условий, (2) параметров их взаимодействия с родопсин-трансдуциновым комплексом, (3) сравнительной термостабильности методом остаточной ферментативной активности, и (4) стабильности NDP киназ как гексамеров.

Научная новизна. Впервые показано, что различия в вариабельной области VI NDP киназы млекопитающих определяют различия физико-химических характеристик изоформ фермента. Результаты настоящей работы дают основания считать, что способность NDP киназ млекопитающих взаимодействовать с G-белком палочек сетчатки трансдуцином определяется вариабельной областью VI, тогда как вариабельный участок V2 не участвует во взаимодействии. Получены данные, свидетельствующие о высокой стабильности гексамерной структуры NDP киназ млекопитающих. Рассмотрен вопрос о функциональной роли взаимодействия между NDP киназой и комплексом родопсин-трансдуцин.

Практическая ценность. Исследованные в настоящей работе химерные и tag-производные изоформ NDP киназы могут быть рекомендованы для использования в физиологических опытах, связанных с экспрессией генов производных в различных линиях культур раковых клеток с целью выяснения роли различных участков фермента в подавлении метастатического потенциала раковых клеток. Полученные нами данные также необходимо учитывать при экспрессии генов мутантных форм NDP киназы, не имеющих ферментативной активности, в различных линиях. культур клеток. Эксперименты по трансфекции раковых клеток генами производных NDP киназы являются одним, из современных подходов к поиску новых путей терапии злокачественных опухолей.

1. Результаты исследования рекомбинантных NDP киназ, а и Р крысы и их химерных, мутантных и tag-производных методом собственной белковой флуоресценции дают основания считать, что уникальные флуоресцентные свойства NDP киназы, а и ее способность к конформационным перестройкам, отличающие ее от изоформы р, определяются свойствами вариабельного участка VI. Возможно, что различия в структуре и свойствах этого участка и определяют функциональные различия изоформ, а и р в клетке.

2. Данные, полученные в ходе опытов по связыванию рекомбинантных HA-NDP киназ ар и Ра крысы с комплексом R*-Gt, являющимся одним из ключевых промежуточных состояний системы фототрансдукции палочек сетчатки позвоночных, свидетельствуют в пользу того, что способность NDP киназы, а взаимодействовать с G-белками определяется вариабельной областью VI, тогда как вклад С-концевой вариабельной области V2 и начального участка N-концевой области мал.

3. Результаты экспериментов по исследованию сравнительной термостабильности рекомбинантных изоформ NDP киназы крысы и их производных показали, что стабильность, а формы выше, чем стабильность Р формы, а различия в их температурах инактивации обусловлены вариабельными остатками, преимущественно локализованными в вариабельном участке V1.

4. Сделан вывод о том, что дальнейшие исследования по выявлению основ функциональных различий между изоформами NDP киназы млекопитающих должны сводиться к изучению точечных мутантных форм NDP киназы по вариабельным аминокислотным остаткам участка VI. Наиболее вероятными заменами, определяющими функциональные различия изоформ аир крысы, являются замены Arg42Gln, His47Leu и Asn69His. В дальнейших исследованиях эти аминокислотные остатки должны быть главной мишенью для направленного мутагенеза.

5. Использован метод изоэлектрического фокусирования для анализа смесей различных гомогексамеров NDP киназы крысы, состоящих из субъединиц, значительно различающихся значением pi. Результаты, полученные с помощью такого подхода, свидетельствуют о высокой стабильности NDP киназы как гексамера.

6. Анализируется гипотеза, согласно которой функциональный смысл подтвержденного результатами настоящей работы специфического взаимодействия между NDP киназой и R*-Gt комплексом отражает один из этапов участия этого фермента в процессе активации G-белка палочек сетчатки. Рассмотрены преимущества схемы активации трансдуцина с участием NDP киназы.

Показать весь текст

Список литературы

  1. , Е.А. (1977) Собственная флуоресценция белка. Природа и применение. Итоги науки и техники (серия Биофизика) т.7, ВИНИТИ, М.
  2. Н.Я., Тищенков В. Г., Багиров И. Г., Шныров В Л. (1983) GTP-связывающий белковый комплекс в препаратах наружный сегментов палочек сетчатки лягушки. Биофизика 28,793−799.
  3. В.Г., Грумбкова Л., Орлов Н. Я. (1982) Фосфорилирование связанного 14C.GDP в препаратах наружных сегментов палочек сетчатки лягушки. Докл. АН СССР, 268, 735−738.
  4. В.Г., Орлов Н. Я. (1983) Взаимодействие гуаниновых нуклеотидов с наружными сегментами палочек сетчатки лягушки. Биофизика, т.28,274−279
  5. В.Г., Орлов Н. Я. (1984) Аденилаткиназная и GDP киназная активность препаратов наружных сегментов палочек сетчатки лягушки. Возможная функциональная роль р-субъединицы трансдуцина. Молекулярная биология 18, 776−785
  6. Abdulaev NG, Kakuev DL, Ridge KD. (2000) Bovine retinal nucleoside diphosphate kinase: biochemistry and molecular cloning. Methods Enzymol. 316, 87−100.
  7. Abornev, S.M. and E.A. Burstein (1992) Resolution of tryptophan fluorescence spectra into elementary components. Molecular Biology, 26,1350−1361 EngL Transl.
  8. F., Raven S., Veron M. (2000) The binding mode of human nucleoside diphoshate kinase В to single-strand DNA. J. Bioenerg. Biomembranes 32 (3) 285−292.
  9. Arnaud-Dabernat S, Bourbon PM, Dierich A, Le Meur M, Daniel JY. (2003) Knockout mice as model systems for studying nm23/NDP kinase gene functions. Application to the nm23-M1 gene. J Bioenerg Biomembr. 2003 Feb-35(l):19−30. Review.
  10. Arshavsky V. Yu., Lamb T.D., Pugh E.N., Jr. (2002) G-proteins and Phototransduction. Ann. Rev. PhysioL 64, 153−187.
  11. G., Gaillard S., Castets F., Monneron A. (2002) Interactions of phocein with nucleoside-diphosphate kinase, Epsl5, and Dynamin I. J. Biol. Chem. 277(21), 18 961−18 966.
  12. Baillat, G., Moqrich, A., Castets, F., Baude, Bailly, Y., Benmerah, A., and Monneron, A. (2001) Molecular cloning and characterization of phocein, a protein found from the Golgi complex to dendritic spines. Mol. Biol. Cell 12,663−673.
  13. Barthel, Т.К., Waler, G.C. (1999). Inferences concerning the ATPase properties of DnaK and other HSP70s are affected by the ADP kinase activity of copurifying nucleoside-diphosphate kinase. J. Biol. Chem. 274,36 670−36 678.
  14. N. (1982) Light-induced interaction between rhodopsin and the GTP-binding protein. Relation with phosphodiesterase activation.- Eur. J. Biochem.123,133−139.
  15. Bennett N., Michel Villaz M., Kuhn H.(1982) Light-induced interaction between rhodopsin and GTP-binding protein. Metarhodopsin II is the major photoproduct involved.- Eur. J. Biochem. 127, 97−103.
  16. S.J., Postel E.H. (1995) PuF/NM23-H2/NDPK-B transactivates a human c-myc promoter-CAT gene via a functional nuclease hypersensitive element. Oncogene 10,2343−2347.
  17. J., Hersperger E., Steeg P., Liotta L.A., Shearn A. (1990) A gene that is homologous to a mammalian gene associated with tumor metastasis codes for nucleoside diphosphate kinase. Cell 63, 933−940
  18. J., Tripoulas N., Hersperger E., Dearolf C., Shearn A. (1988) Analysis of the lethal interaction between the prune and Killer of prune mutations of Drosophila. Genes and Dev. 2, 1333−1343.
  19. Bilan P. J,. Moyers J.S., Kahn C.R. (1998) The ras-related protein rad associates with the cytoskeleton in a non-lipid-dependent manner. Exp. Cell Res. 242(2), 391−400.
  20. A.A., Tepper A.D., Veron M. (1994) Autophosphorylation of nucleoside diphosphate kinase on non-histidine residues. FEBS Lett. 353(1), 5−8
  21. Brune Corrie J.E., Webb M.R. (2001) A fluorescent sensor of the phosphorylation state of nucleoside diphosphate kinase and its use to monitor nucleoside diphosphate concentrations in real time. Biochemistry 40(16), 5087−5094.
  22. Cervoni L., Lascu I., Xu Y., Gonin P., Morr M., Merouani M., Janin J., Giartosio A.2001) Binding of nucleotides to nucleoside diphosphate kinase: a calorimetric study. Biochemistry 40(15), 4583−4589.
  23. RF. (1967) Analyt. Letts. 1,35−42
  24. Cheng S., Alfonso-Jaume M.A., Mertens P.R., Lovett D.H. (2002) Tumour metastasis suppressor, nm23-beta, inhibits gelatinase A transcription by interference with transactivator Y-box protein-1 (YB-1). Biochem. J. 366(Pt3), 807−816.
  25. Chiadmi M., Morera S., Lascu I., Dumas C., Le Bras G., Veron M., Janin J. (1993) Crystal structure of the Awd nucleotide diphosphate kinase from Drosophila. Structure. Dec 15−1(4): 283−293.
  26. Cho S.J., Lee N.S., Jung Y.S., Lee IL, Lee K.J., Kim E., Chae S.K. (2001) Identification of structural domains affecting transactivation potential of Nm23. Biochem. Biophys. Res. Commun. 289(3), 738−743.
  27. L., Mohr R., Chen Y.Y., Huang M., Kato R., Dorin D., Tamanoi F., Goga A., Afar D., Rosenberg N., Witte O. (1994) Transcriptional activation of a ras-like gene (kir) by oncogenic tyrosine kinases. Proc Natl Acad Sci U S A 91(26), 12 448−12 452.
  28. Cox R., Mirkin S.M. (1997) Proc.Natl. Acad. ScL USA 94, 5237−5242.
  29. Dabernat S, Larou M, Masse K, Dobremez E, Landry M, Mathieu C, Daniel JY. (1999) Organization and expression of mouse nm23-Ml gene. Comparison with nm23-M2 expression. Gene. Aug 20−236(2):221−30.
  30. De la Rosa A., Williams R.L., Steeg P. S. (1995) Nm23/nucleoside diphosphate kinase: toward a structural and biochemical understanding of its biological functions. Bioessays 17(1), 53−62
  31. C.R., Hersperger E., Sbearn A. (1988) Developmental consequences of awdb3, a cell-autonomous lethal mutation of Drosophila induced by hybrid dysgenesis. Dev. Biol. 129(1), 159−168
  32. Dearolf CR, Tripoulas N, Biggs J, Shearn A. (1988) Molecular consequences of awdb3, a cell-autonomous lethal mutation of Drosophila induced by hybrid dysgenesis. Dev. Biol. 129(1):169−178
  33. M.T., Welch D.R. (2001) Genetic basis of human breast cancer metastasis. J. Mammary Gland BioL Neoplasia 6(4), 441−451
  34. D. (2001) shibire’s enhancer is cancer’s suppressor. Trends NeuroscL 24(11):625−626.
  35. Du J., Hannon G.J. (2002) The centrosomal kinase Aurora-A/STK15 interacts with a putative tumor suppressor NM23-H1. Nucleic Acids Res. 30(24), 5465−5475
  36. Dumas, С., I. Lascu, S. Morera, F. Glaser, R. Fourme, V. Wallet, M.-L.Lacombe, M. Veron, and J. Janin (1992) X-rays structure of nucleoside diphosphate kinase. EMBO J., 11, 3203−3208.
  37. DuPont Y. (1984) A rapid-filtration technique for membrane fragments or immobilized enzymes: measurements of substrate binding or ion fluxes with a few-millisecond time resolution. Analytical Biochem., 142, 504−510.
  38. Engel M., Veron M., Theisinger В., Lacombe M.L., Seib Т., Dooley S., Welter C.(1995) A novel serine/threonine-specific protein phosphotransferase activity of Nm23/nucleoside-diphosphate kinase. Eur J Biochem 234(1), 200−207.
  39. Escobar Gatvis M.L., Marttila S., Hakansson G., Forsberg J., Knorpp C. (2001) Heat stress response in pea involves interaction of mitochondrial nucleoside diphosphate kinase with a novel 86-kilodalton protein. Plant Physiol 26(1), 69−77.
  40. Fan Z, Beresford PJ, Oh DY, Zhang D, Lieberman J. (2003) Tumor suppressor NM23-H1 is a granzyme A-activated DNase during CTL-mediated apoptosis, and the nucleosome assembly protein SET is its inhibitor. Cell 112(5):659−72.
  41. S., Breuer H.P., Petruccione F., Honerkamp J., Hofmann K.P. (1996) Stochastic simulation of the transducin GTPase cycle. Biophys. J., 71,3051−3063.
  42. B.S., Andres D.A. (1997) Rem is a new member of the Rad- and Gem/Kir Ras-related GTP-binding protein family repressed by lipopolysaccharide stimulation. J. BioL Chem. 272(35), 21 982−21 988.
  43. Freije JM, MacDonald NJ, Steeg PS. (1998) Nm23 and tumor metastasis: basic and translational advances. Biochem. Soc. Symp. 63:261−271
  44. Fung B. B-K., Hurley J.B., Stryer L. (1981) Flow of information in the light triggered cyclic nucleotide cascade of vision. Proc. NatL Acad. Sci. USA 78, 152−56.
  45. A., Erent M., Cervoni L., Morera S., Janin J., Konrad M., Lascu I. (1996) Thermal stability of hexameric and tetrameric nucleoside diphosphate kinases. Effect of subunit interaction. J. BioL Chem. 271(30), 17 845−17 851
  46. Hartsough MT, Morrison DK, Salerno M, Palmieri D, Ouatas T, Mair M, Patrick J, Steeg PS. (2002) Nm23-Hl metastasis suppressor phosphorylation of kinase suppressor of Ras via a histidine protein kinase pathway. J. BioL Chem. 277(35), 32 389−32 399
  47. M.T., Steeg P. S. (2000) Nm23/nucleoside diphosphate kinase in human cancers. J. Bioenerg. Biomembr. 32(3), 301−308
  48. Hay N., Bishop J.M., Levens D. (1987) Regulatory elements that modulate expression of human c-myc. Genes Develop. 1,659−671.
  49. M., Hofmann K.P. (2001) Maximal rate and nucleotide dependence of rhodopsin-catalyzed transducin activation initial rate analysis based on a double displacement mechanism. J. BioL Chem. 276,10 000−10 009.
  50. E.J., Hofmann K.P. (1996) Structure and function of proteins in G-protein-coupled signal transfer. Biochim.Biophys.Acta, 1286(3), 285−322.
  51. IIeo Y. J., Kim S. Y., Kim E., Lee K.-J. (1997) Quantemary structural analysis of nucleoside diphosphate kinases using capillary electrophoresis. J. Chromatography 781, 251−261
  52. Huitorel P, Simon C, Pantaloni D. (1984) Nucleoside diphosphate kinase from brain. Purification and effect on microtubule assembly in vitro. Eur J Biochem. Oct 15−144(2):233−4l.
  53. Hwang КС, Ok DW, Hong JC, Kim MO, Kim JH. (2003) Cloning, sequencing, and characterization of the murine nm23-M5 gene during mouse spermatogenesis and spermiogenesis. Biochem Biophys Res Commun. Jun 20−306(l):198−207.
  54. Jacobs M, Huitorel P. (1979) Tubulin-associated nucleoside diphosphokinase. Eur J Biochem. Sep-99(3):613−22.
  55. Jacobs M, Smith H, Taylor EW. (1974) Tubulin: nucleotide binding and enzymic activity. J Mol BioL Nov 5−89(3):455−68.
  56. Janin J., Dumas C., Morera S., Xu Y., Meyer P., Chiadmi M., Chefils J. (2000) Three-Dimentional Structure of Nucleoside Diphospate Kinase. J. Bioenerg. Biomembranes 32(3), 215 225.
  57. Ji L., Arcinas M., Boxer M.L. (1995) The transcription factor, Nm23H2, binds to and activates the translocated c-myc allele in Burkitt’s lymphoma. J. BioL Chem. 270, 13 392−13 398.
  58. Karlsson A., Mesnildrey S., Xu Y., Morera S., Janin J., Veron M. (1996) Nucleoside diphosphate kinase. Investigation of the intersubunit contacts by site-directed mutagenesis and crystallography. J. BioL Chem. 271(33), 19 928−19 934
  59. Kauffman EC, Robinson VL, Stadler WM, Sokoloff MH, Rinker-Schaeffer CW. (2003) Metastasis suppression: the evolving role of metastasis suppressor genes for regulating cancer cell growth at the secondary site. J. UroL 169(3), 1122−1133
  60. Kim SY, Chang KH, Doh HJ, Jung JA, Kim E, Sim CJ, Lee KJ. (1997) Rapid purification and characterization of nucleoside diphosphate kinase isoforms using ATP-sepharose affinity column chromatography. Mol Cells. Oct 31−7(5):630−4.
  61. , N. (1993) Role of nucleoside diphosphate kinase in G-protein action, in: GTPases in Biology, Handbook of Experimental Pharmacology, VoL 108/11 (Dickey, B.F., and Birnbaumer, L., eds) Springer-Verlag, Berlin-Heidelberg, pp. 485−498.
  62. N., Nagata N. (1979) Mechanism of glucagon stimulation of adenylate cyclase in the presence of GDP in rat liver plasma membranes. J. BioL Chem. 254, 3451 3457.
  63. N., Shimada N., Fukuda M., Ishijima Y., Miyazaki II., Ishii A., Takagi Y., Ishikawa N. (2000) Regulation of cellular functions by nucleoside diphosphate kinases in mammals. J. Bioenerg. Biomembr. 32(3), 309−315.
  64. A. (2002) Identification and characterization of a novel protein histidine kinase in the islet beta cell: evidence for its regulation by mastoparan, an activator of G-proteins and insulin secretion. Biochem. Pharmacol 63(12), 2091−2100.
  65. Krishnan KS, Rikhy R, Rao S, Shivalkar M, Mosko M, Narayanan R, Etter P, Estes PS, Ramaswami M. (2001) Nucleoside diphosphate kinase, a source of GTP, is required for dynamin-dependent synaptic vesicle recycling. Neuron 30(1), 197−210.
  66. H. (1980) Light- and GTP-regulated interaction of GTPase and other proteins with bovine photoreceptor membranes. Nature 283, 587−589.
  67. II. (1980) Light-induced, reversible binding of proteins to bovine photoreceptor membranes. Influence of nucleotides. Neurochemistry, v.2, p. 269−285
  68. Kuhn H., Bennett N., Michel-Villaz M., Chabre M. (1981) Interactions between photoexcited rhodopsin and GTP-binding protein: kinetic and stoichiometric analyses from light-scattering changes. Proc. Natl Acad. Sci. USA 78, 6873−6877.
  69. M.L. (1993) Nucleoside diphosphate kinase/Nm23 and metastatic potency. Bull. Cancer 80(8), 717−722
  70. , M.L., Jakobs K.H. (1992) Nucleoside diphosphate kinases as potential new target for control of development and cancer. Trends Pharmacol Sci., 13,46−48.
  71. M.L., Milon L., Munier A., Mehus J.G., Lambeth D.O. (2000) The human Nm23/nucleoside diphosphate kinases. J. Bioenerg. Biomembr. 32(3), 247−58
  72. Ladner JE, Abdulaev NG, Kakuev DL, Tordova M, Ridge KD, Gilliland GL. (1999) The three-dimensional structures of two iso forms of nucleoside diphosphate kinase from bovine retina. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr Jun-55 (Pt 6): 1127−35
  73. T.D. (1994) Stochastic simulation of activation in the G-protein cascade of phototransduction. Biophys. J. 67, 1439−1454.
  74. T.D. (1996) Gain and kinetics of activation in the G-protein cascade of phototransduction. Proc. Natl. Acad. ScL USA, 93, 566−570.
  75. Langlios G., Chen C.-K., Palczewski K., Hurley J.B., Vuong T.M. (1996) Responses of the phototransduction cascade to dim light. Proc. Natl. Acad. Ssi. USA, 93,4677−4682.
  76. Lascu I., Deville-Bonne D., Glaser P., Veron M. (1993) Equilibrium dissociation and unfolding of nucleoside diphosphate kinase from Dictyostelium discoideum. Role of proline 100 in the stability of the hexameric enzyme. J. BioL Chem. 268,2 026 758−202.
  77. I., Giartosio A., Ransac S., Erent M. (2000) Quaternary structure of nucleoside diphosphate kinases. J. of Bioenergetics and Biomembranes 32(3), 227−236
  78. Leung S.-M., Hightower L.E. (1997) A 16-kDa protein functions as a new regulatory protein for Hsc70 molecular chaperone and is identified as a member of the Nm23/nucleoside diphosphate kinase family. J. BioL Chem. 272(5), 2607−2614.
  79. M.N., Abramczyk B.M., Stock J.B., Postel E.H. (2002) Interactions between Escherichia coli nucleoside-diphosphate kinase and DNA. J. BioL Chem. 277(7):5163−5167.
  80. Lieberman J, Fan Z. (2003) Nuclear war: the granzyme A-bomb. Curr Opin Immunol. Oct-15(5):553−9.
  81. Lombardi D, Lacombe ML, Paggi MG. (2000) nm23: unraveling its biological function in cell differentiation. J. Cell. Physiol. 182(2), 144−149
  82. Lombardi D, Sacchi A, D’Agostino G, Tibursi G. (1995) The association of the Nm23-Ml protein and beta-tubulin correlates with cell differentiation. Exp Cell Res. Apr-217(2):267−71.
  83. Lu Q., Park H., Egger L.A., Inouye M. (1996) Nucleoside-diphosphate kinase-mediated signal transduction via histidyl-aspartyl phosphorelay systems in Escherichia coli. J. Biol. Chem. 271,32 886−32 893.
  84. J., Santoro Т., Jensen P., Siebenlist U., Yewdell J., Kelly K. (1994) Gem: an induced, immediate early protein belonging to the Ras family. Science 265 (5169), 241−244.
  85. Martin К. K, Pilkington G. J. (1998) Nm23: an invasion suppressor gene in CNS tumours? Anticancer Res. 18(2A), 919−926
  86. S., Agou F., Karlsson A., Bonne D.D., Veron M. (1998) Coupling between catalysis and oligomeric structure in nucleoside diphosphate kinase. J. BioL Chem. 273(8), 44 364 442.
  87. Mesnildrey S, Agou F, Veron M. (1997) The in vitro DNA binding properties of NDP kinase are related to its oligomeric state. FEBS Lett 418(1−2), 53−57
  88. Michelotti E.F., San ford S., Freije J.M., MacDonald N.J., Steeg PS., Levens D.(1997) Nm23/PuF does not directly stimulate transcription through the CT element in vivo. J. BioL Chem. 272(36), 22 526−22 530.
  89. L., Meyer P., Chiadmi M., Munier A., Johansson M., Karlsson A., Lascu I., Capeau J., Janin J., Lacombe M.L. (2000) The human nm23-H4 gene product is a mitochondrial nucleoside diphosphate kinase. J. BioL Chem. 275(19), 14 264−14 272.
  90. Milon, L., Rousseau-Merck, M., Munier, A., Erent, M4 Lascu, I., Capeau, J., and Lacombe, M. L. (1997) nm23-H4, a new member of the family of human nm23/nucleoside diphosphate kinase genes localised on chromosome 16pl3. Hum. Genet. 99, 550−557
  91. Min К, Song HK, Chang С, Kim SY, Lee К J, Suh SW. (2002) Crystal structure of human nucleoside diphosphate kinase A, a metastasis suppressor. Proteins 2002 Feb 15−46(3):340−2
  92. Mirkin S.M., Lyamichev V.I., Drushlyak K.N., Dobrynin V.N., Filipov S.A., Frank-Kamenetskii M.D. (1987) Nature 330,495.
  93. Morera S, Lacombe ML, Xu Y, LeBras G, Janin J. (1995) X-ray structure of human nucleoside diphosphate kinase В complexed with GDP at 2 A resolution. Structure Dec 15−3(12):1307−14i
  94. Morera, S., G. LeBras, I. Lascu, M.-L. Lacombe, M. Veron and J. Janin (1994) Refined X-ray structure of Dictyostelium discoideum nucleoside diphosphate kinase at 1.8 A resolutioa J. MolBiol., 243, 873−890.
  95. J.S., Bilan P.J., Reynet C., Kahn C.R. (1996) Overexpression of Rad inhibits glucose uptake in cultured muscle and fat cells. J. Biol. Chem. 271(38):23 111−23 116
  96. Moyers J. S., Bilan P.J., Zhu J., Kahn C.R. (1999) Rad and Rad-related GTPases interact with calmodulin and calmodulin-dependent protein kinase II. J. Biol. Chem. 272(18), 1 183 211 839.
  97. Munier A, Serres C, Kann ML, Boissan M, Lesaffre C, Capeau J, Fouquet JP, Lacombe ML.(2003) Nm23/NDP kinases in human male germ cells: role in spermiogenesis and sperm motility? Exp Cell Res. Oct 1 -289(2):295−306.
  98. Munoz-Dorado J., Almaula N., Inouye S., Inouye M. (1993) Autophosphorylation of nucleoside diphosphate kinase from Myxococcus xanthus. BacterioL 175(4), 1176−1181
  99. Narayanan R, Ramaswami M. (2003) Regulation of dynamin by nucleoside diphosphate kinase. J Bioenerg Biomembr. 35(l):49−55.
  100. Nosaka K, Kawahara M, Masuda M, Satomi Y, Nishino H. (1998) Association of nucleoside diphosphate kinase nm23-H2 with human telomeres. Biochem Biophys Res Commun. Feb 13−243(2):342−8.
  101. Ogawa K, Takai H, Ogiwara A, Yokota Ё, Shimizu T, Inaba K, Mohri H. (1996) Is outer arm dynein intermediate chain 1 multifunctional? Mol Biol Cell. Dec-7(12):1895−907
  102. K., Ikeuchi Т., Yokoyama M. (1986) Characterization of nucleoside-diphosphate kinase-associated guanine nucleotide-binding proteins from HeLa S3 cells. Biochim. Biophys. Acta 882(3), 322−330
  103. Orlov NYa, Kalinin EV, Orlova TG, Freidin AA. (1988) Properties and content of cyclic nucleotide phosphodiesterase in photoreceptor outer segments of ground squirrel retina. Biochim Biophys Acta. Jun 13−954(3):325−35.
  104. N.Ya., Kimura N. (1998) Interaction of nucleoside diphosphate kinase with membranes of bleached bovine retinal rod outer segments. Effects of pH, salts, and guanine nucleotides. Biochemistry (Moscow) 63,171−179
  105. N.Ya., Orlova T.G., Nomura K., Hanai N., Kimura N. (1996) Transducin-mediated, iso forms-specific interaction of recombinant rat nucleoside diphosphate kinases with bleached bovine retinal rod outer segments membranes. FEBS Lett., 389, 186−190
  106. N.Ya., Orlova T.G., Reshetnyak Ya. K., Burstein E.A., Kimura N. (1999) Comparative study of recombinant rat nucleoside diphosphate kinases a and p by intrinsic protein fluorescence. J.Biomol. Struct. & Dynamics 16, 955−968
  107. Otsuki Y., Tanaka M., Yoshii S., Kawagoe N., Nakaya Sugimura H. (2001) Tumor metastasis suppressor nm23-Hl regulates Racl GTPase by interaction with Tiaml. Proc. NatL Acad. Sci. 98(8), 4385−4390.
  108. , A.S. (1990) Transphosphorylation and G protein activation. Biochem. Pharmacol., 39,1399−1404.
  109. A. (1997) Copurification of vimentin, energy metabolism enzymes, and a MER5 homo log with nucleoside diphosphate kinase. J. BioL Chem. 272(23), 14 690−14 694.
  110. A.S. (2000) NM23/nucleoside diphosphate kinase and signal transduction. J. Bioenerg. Biomembr. 32(3), 269−275.
  111. A.S., Doyle M.B., Hartsough M.T., Steeg P. S. (1999) Wild-type NM23-H1, but not its SI 20 mutants, suppresses desensitization of muscarinic potassium current. Biochim. Biophys. Acta 1449(2), 157−168
  112. P., Hozumi A., Ogawa K., Inaba K. (2001) Molecular cloning and characterization of a thioredoxin/nucleoside diphosphate kinase related dynein intermediate chain from the ascidian, Ciona intestinalis. Gene 275(1), 177−183
  113. В., Pahler A., Katayanagi К., Miyagawa M., Watanabe К., Kimura N., Matsuzaki T. (1996) 3rd Internet World Congress on Biomedical Sciences (December 9−20), http://www.3iwc.riken.go.ip/CONGRESS/SYMPO/SBC0203/AG0107/TIT.bfTM
  114. Palacios F, Schweitzer JK, Boshans RL, D’Souza-Schorey C. (2002) ARF6-GTP recruits Nm23-Hl to facilitate dynamin-mediated endocytosis during adherens junctions disassembly. Nat Cell Biol. 4(12):929−36.
  115. Pan J.Y., Fieles W.E., White A.M., Egerton M.M., Silberstein D.S. (2000) Ges, A human GTPase of the Rad/Gem/Kir family, promotes endothelial cell sprouting and cytoskeleton reorganization. J. Cell Biol. 149(5), 1107−1116.
  116. Parks, R.E., Jr., Agarwal, R.P. (1973) In The Enzymes, Vol. 8, Academic Press, New-York, pp. 307−334
  117. Patel-King R.S., Benashski S.E., King S.M. (2002) A bipartite CaZT-reguIated nucleoside-diphosphate kinase system within the Chlamydomonas flagellum. The regulatory subunit p72. J. Biol. Chem. 277(37), 34 271−34 279.
  118. Penningroth SM, Kirschner MW. (1977) Nucleotide binding and phosphorylation in microtubule assembly in vitro. J Mol BioL Oct 5−115(4):643−73.
  119. E.H. (1992) Modulation of c-myc transcription by triple helix formation. Ann. N Y Acad. Sci. 660, 57−63.
  120. E. H. (1998) NM23-NDP kinase. Intern. J. Biochem. Cell BioL 30,1291−1295.
  121. E.H. (1999) Cleavage of DNA by human NM23-H2/nucleoside diphosphate kinase involves formation of a covalent protein-DNA complex. J Biol Chem 274(32), 22 821−22 829
  122. Postel E.H., Abramczyk B.A., Gursky S.K., Xu Y. (2002) Structure-based mutational and functional analysis identify human NM23-H2 as a multifunctional enzyme. Biochemistry 41(20), 6330−6337
  123. E.II., Berberich S.J., Flint S.J., Ferrone C.A. (1993) Human c-myc transcription factor PuF identified as nm23-H2 nucleoside diphosphate kinase, a candidate suppressor of tumor metastasis. Science 261(5120), 478−480.
  124. E.H., Berberich S.J., Rooney J.W., Kaetzel D.M. (2000) Human NM23/Nucleoside diphosphate kinase regulates gene expression through DNA binding to nuclease-hypersensitive transcriptional elements. J. Bioenerg. Biomembranes 32 (3) 277−284.
  125. E.II., Ferrone C.A. (1994) Nucleoside diphosphate kinase enzyme activity of NM23-H2/PuF is not required for its DNA binding and in vitro transcriptional functions. J. Biol. Chem. 269, 8627−8630.
  126. E.H., Mango S.E., Flint S.J. (1989) A nuclease-hypersensitive element of the human c-myc promoter interacts with a transcription initiation factor. MoL Cell. Biol. 9(11), 5123−5133.
  127. E.H., Weiss V.H., Beneken J., Kirtane A. (1996) Mutational analysis of NM23-H2/NDP kinase identifies the structural domains critical to recognition of a c-myc regulatory element. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 6892−6897.
  128. Prendergast G.C.(1997) Oncogenes Transcript. Reg. 1,1−28.
  129. E., Vonica A., Lascu I. (1989) Nucleoside diphosphate kinase from human erythrocytes: purification, molecular mass and subunit structure. FEBS Lett. 250(2), 629−632
  130. Pugh E.N., Jr, Lamb T.D. (1993) Amplification and kinetics of the activation steps in phototransduction. Biochim.Biophys.Acta, 1141,111−149.
  131. Raveh S, Vinh J, Rossier J, Agou F, Veron M. (2001) Peptidic determinants and structural model of human NDP kinase В (Nm23-H2) bound to single-stranded DNA. Biochemistry 40(20), 5882−5893.
  132. C., Kahn C.R. (1993) Rad: a member of the Ras family overexpressed in muscle of type II diabetic humans. Science 262(5138), 1441−1444
  133. A.M., Krutzsch II.C., Shearn A., Biggs J.R., Barker E., Margulies I.M., King C.R., Liotta L.A., Steeg P. S. (1989) Reduced Nm23/Awd protein in tumour metastasis and aberrant Drosophila development. Nature 342(6246), 177−180
  134. M., Ouatas Т., Palmieri D., Steeg P. S. (2003) Inhibition of signal transduction by the nm23 metastasis suppressor: possible mechanisms. Clin. Exp. Metastasis 20(1), 3−10.
  135. Schneider В., Babolat M., Xu Y.W., Jan in J., Veron M., Deville-Bonne D. (2001) Mechanism of phosphoryl transfer by nucleoside diphoshate kinase. pH dependence and role of the active site Lysl5 and Tyr56 residues. Eur. J. Biochem. 268, 1964−1971.
  136. Schneider В., Biondi R., Sarfati R., Agou F., Guerreiro C., Deville-Bonne D., Veron M.2000) The mechanism of phosphorylation of anti-IIIV D4T by nucleoside diphosphate kinase. Mol. Pharmacol. 57(5), 958−953.
  137. Schneider В., Norda A., Karlsson A., Veron M., Deville-Bonne D. (2002) Nucleotide affinity for a stable phosphorylated intermediate of nucleoside diphosphate kinase. Protein Sci. 11(7), 1648−1656.
  138. S., Hershberger C.D., Chakrabarty A.M. (1997) The nucleoside diphosphate kinase of Mycobacterium smegmatis: identification of proteins that modulate specificity of nucleoside triphosphate synthesis by the enzyme. MoL Microbiol. 24(3):477−487.
  139. Simonsson TM Pecinka P., Kubista M. (1998) Nucleic Acids Res. 26, 1167−1172.
  140. J.A., Leone A., Rosengard A.M., Porter L., King C.R., Steeg P. S. (1991) Identification of a second human nm23 gene, nm23−112. Cancer Res. 51(1), 445−449
  141. Steeg PS, de la Rosa A, Flatow U, MacDonald NJ, Benedict M, Leone A. (1993) Nm23 and breast cancer metastasis. Breast Cancer Res Treat 1993?5(2): 175−87
  142. P. S., Palmieri D., Ouatas Т., Salerno M. (2003) Histidine kinases and histidine phosphorylated proteins in mammalian cell biology, signal transduction and cancer. Cancer Lett. 190(1), 1−12
  143. Sturtevant A.H. (1956) A highly specific complementary lethal system in Drosophila melanogaster Genetics 41, 118−123
  144. Tatischeff I, Klein R, Duquesne M. (1976) A new fluorescent photoproduct of tryptophan evidenced by long wavelength excitation of fluorescence. Photochem PhotobioL 1976 Nov, 24(5):413−6.
  145. Tepper AD, Dammann H, Bominaar AA, Veron M. (1994) Investigation of the active site and the conformational stability of nucleoside diphosphate kinase by site-directed mutagenesis. J Biol Chem. Dec 23?69(51):32 175−80.
  146. L., Shearn A. (2000) Role of AWD/nucleoside diphosphate kinase in Drosophila development. J. Bioenerg Biomembr. 32(3), 293−300
  147. Uhl R., Wagner R. Rvba N. (19 901 Watchina G Droteins at work. Trends Nerosci. i.- -70.
  148. R.M., Chabre M., Stryer L. (1984) Millisecond activation of transducin in the cyclic nucleotide cascade of vision. Nature 311,659−661.
  149. Wagner P.D., Steeg P. S., Vu N.D. (1997) Two-component kinase-like activity of nm23 correlates with its motility-suppressing activity. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94,9000−9005
  150. Wagner P.D., Vu N.-D. (1995) Phosphorylation of ATP-citrate lyase by nucleoside diphosphate kinase. J. BioL Chem. 270,21 758−21 764
  151. Wagner P.D., Vu N.-D. (2000) Histidine to aspartate phosphotransferase activity of nm23 proteins: phosphorylation of aldolase С on Asp-319. Biochem. J. 346,623−630.
  152. Webb PA, Perisic O, Mendola CE, Backer JM, WiUiams RL. (1995) The crystal structure of a human nucleoside diphosphate kinase, NM23-H2. J Mol Biol Aug 25251 (4):574−87
  153. Т., Jakobs K.H. (1989) Receptor-regulated formation of GTPyS with subsequent persistent Gs-protein activation in membrane of human platalets. FEBS Lett. 245,189−193.
  154. Т., Ulibarri I., Cierschik P., Hall A., Aktories K., Jakobs K.H. (1990) Interaction of recombinant rho A GTP-binding proteins with photoexcited rhodopsin. FEBS Lett. 274(1−2), 111−114
  155. Xu, J., Liu, L.Z., Deng, X.F., Timmons, L., Hersperger, E., Steeg, P. S., Veron, M., Shearn, A. (1996). The Enzymatic Activity of Drosophila AWD/NDP Kinase Is Necessary but Not Sufficient for Its Biological Function Develop. BioL 177, 544−557
  156. H., Ohkura N., Tsukada Т., Yamaguchi K. (2002) Menin, the Multiple Endocrine Neoplasia Type 1 Gene Product, Exhibits GTP-hydrolyzing Activity in the Presence of the Tumor Metastasis Suppressor nm23 . J. Biol. Chem., 277 (41), 38 197−38 204.
  157. M. (2000) Intrinsic nucleoside diphosphate kinase-type activity is a novel function of the molecular chaperone and protease. Seikagaku 72(1), 41−45
  158. M., Uesaka H., Ohtsuki K. (1986) Complete recovery of the phosphoenzyme-forming activity of nucleoside-diphosphate kinases after reconstitution of their subunits. FEBS Lett. 206(2), 287−291
  159. Zhu J., Bilan P.J., Moyers J.S., Antonetti D.A., Kahn C.R. (1996) Rad, a novel Ras-related GTPase, interacts with skeletal muscle beta-tropomyosin. J. BioL Chem. 271(2), 768−73.
Заполнить форму текущей работой

На отлично!