Катионные ?-спиральные олигопептиды — носители ДНК
Целью данной работы являлся синтез новых олигомерных соединений, как потенциальных носителей ДНК, на основе катионных олигопептидов с теоретически рассчитанной структурой, в. том числе модифицированных гидрофобными остатками каприновой (декановой) кислоты, что позволяет как усилить их взаимодействие с внешней поверхностью клеточной мембраны, так и способствовать освобождению из эндосом… Читать ещё >
Содержание
- Список используемых в тексте сокращений и терминов
- ВВЕДЕНИЕ
- 2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
- 2. 1. Молекулярная структура белков и олигопептидов
- 2. 1. 1. Взаимодействие амфипатических олигопептидов с мембранами
- 2. 2. Проникновение невирусных векторов в клетку
- 2. 2. 1. Комплексообразование и компактизация ДНК
- 2. 2. 2. Связывание с поверхностью клетки. г^ 2.2.3 Транспорт в ядро клетки
- 2. 3. Носители ДНК в генной терапии
- 2. 3. 1. Использование катионных липидов в качестве носителей ДНК
- 2. 3. 2. Катионные полимеры как носители ДНК
- 2. 3. 3. Использование катионных олигопептидов как носителей ДНК
- 2. 1. Молекулярная структура белков и олигопептидов
- 3. 1. Синтез пептидов
- 3. 1. 1. Синтез пептидов РР, РР1 и РР
- 3. 1. 2. Синтез пептидов N2 и
- 3. 1. 3. Синтез пептидов N4 и ЯЖ
- 3. 2. Изучение вторичной структуры пептидов методом кругового дихроизма
- 3. 3. Исследование структуры и размеров комплексов синтезированных пептидов с ДНК методом электронной микроскопии
- 3. 4. Исследование комплексообразования и защиты ДНК от нуклеазного расщепления методом гель-электрофореза
- 3. 5. Исследование гемолитической активности пептидов
- 3. 6. Исследование эндосомолитических свойств пептидов
- 3. 7. Взаимодействие пептидов с аденилатциклазной системой клетки
- 4. 2. Оборудование
- 4. 3. Методы
- 4. 3. 1. Синтез пептидов FP, FP1, FP4, JTS-1, N2, RN2, N4, RN
- 4. 3. 2. Спектроскопия кругового дихроизма
- 4. 3. 3. Электронная микроскопия комплексов пептид- ДНК
- 4. 3. 4. Получение комплексов пептид-ДНК и изучение их устойчивости к ферментативному расщеплению методом гель-ретардации (DNase I protection assay)
- 4. 3. 5. Определение гемолитической активности
- 4. 3. 6. Оценка эффективности трансфекции комплексами пептид pCMV-nlsLacZ
- 4. 3. 7. Изучение влияния пептидов на аденилатциклазную систему
Катионные ?-спиральные олигопептиды — носители ДНК (реферат, курсовая, диплом, контрольная)
Актуальность работы. В последнее время высокомолекулярные соединения получают все большее распространение в новых биомедицинских технологиях, в частности, в генной терапии, целью которой является коррекция нарушений функционирования генома при помощи двух основных подходов: 1) замены дефектного участка генома нормальным и 2) введения в организм функционально активных генов, продуцирующих необходимые белки или гормоны, либо олигодезоксирибонукпеотидов, регулирующих функциональную активность целевых генов [1−2]. Наиболее распространенным в современной генотерапии способом введения в клетки и ткани терапевтических генов является использование рекомбинантных вирусных векторов, которые обеспечивают высокую эффективность трансфекции, то есть проникновения чужеродного гена. Однако у вирусных векторов есть ряд недостатков. Очень часто они вызывают иммунный ответ, вследствие чего проведение повторных курсов лечения затруднено. Такие векторы также могут встраиваться в геном, что может привести к повреждению других генов. Размер ДНК, которая может быть включена в состав вирусных векторов, ограничен. Кроме того, стоимость их довольно высока и может достигать в настоящее время 200−500 тысяч долларов [3]. Сообщение о смерти одного из пациентов при введении рекомбинантного аденовирусного вектора [4] существенно затормозило все клинические испытания с использованием вирусных векторов и привлекло внимание к поиску новых методов доставки ДНК в клетки и применению невирусных систем, моделирующих отдельные этапы проникновения в клетку вирусов, в том числе полностью синтетических векторов для систематической доставки генов.
Физические методы введения в клетку чужеродного гена (электропорация, бомбардировка микрочастицами с нанесенной на них ДНК и т. д.) не могут широко использоваться из-за низкой выживаемости клеток и невысокой эффективности — только в отдельных клетках, подвергнутых обработке, введенная ДНК оказывается способной к экспрессии, то есть к считыванию гена и синтезу соответствующего белка. Непосредственная инъекция в ядро хоть и является более эффективной [5], не может быть применена в условиях in vivo. Более перспективными являются искусственные макромолекулярные системы, состоящие из синтетических катионных носителей и ДНК. Идеальная система для невирусной доставки ДНК должна:
1) быть структурно хорошо охарактеризованной, нетоксичной, биодеградируемой системой, которая защищает ДНК от действия нуклеаз, t.
2) обеспечивать доставку ДНК к определенным типам клеток, то есть иметь лиганд для связывания со специфическими рецепторами на поверхности плазматической мембраны данного типа клеток,.
3) способствовать быстрому pH-зависимому освобождению комплекса из эндосом (клеточных образований, куда попадают из внешней среды крупные частицы и высокомолекулярные соединения) и транспорту ДНК в ядро клетки.
При использовании пептидных носителей ДНК многообещающим является синтез многофункциональных пептидов (в том числе с дендримерной структурой), которые позволяют выполнять несколько вышеупомянутых функций одновременно.
Целью данной работы являлся синтез новых олигомерных соединений, как потенциальных носителей ДНК, на основе катионных олигопептидов с теоретически рассчитанной структурой, в. том числе модифицированных гидрофобными остатками каприновой (декановой) кислоты, что позволяет как усилить их взаимодействие с внешней поверхностью клеточной мембраны, так и способствовать освобождению из эндосом их комплексов с ДНК, а также синтез носителей на основе фрагмента пептидной последовательности вируса иммунодефицита человека HIV-1 Tat (48−60), по литературным данным обладающего способностью проникать через мембраны клетки и накапливаться в ядре. Звездообразная структура носителей с наличием нескольких таких фрагментов, а также введение лигандов для связывания с рецепторами на поверхности клетки может усилить эти свойства и способствовать более эффективной защите ДНК от ферментативного расщепления и целевой доставке в ядро клетки. Диссертация предусматривала изучение конформационных характеристик синтезированных носителей и изменения структуры ДНК при взаимодействии ДНК-пептид с помощью метода кругового дихроизма. Образование комплексов носитель-ДНК и защита нуклеиновой кислоты от действия гидролитических ферментов также были изучены с помощью гель-электрофореза. Большое внимание в диссертации уделено исследованию способности синтезированных пептидов нарушать целостность биологических мембран (эритроцитарных и эндосомальных) и влиянию на протекание биохимических реакций в клетке на примере аденилатциклазной системы, что обычно упускается из внимания при создании и исследовании носителя.
Научная новизна работы заключалась в теоретическом поиске наиболее оптимальных структур ДНК-связывающих пептидов и синтезе новых катионных олигопептидов, гидрофильно-гидрофобный баланс которых варьировался от сильно гидрофобного пептида со структурой, способствующей формированию амфипатической а-спирали, до гидрофильных димеров и звездообразных тетрамеров на основе фрагмента 48−60 белка вируса иммунодефицита человека. Изучение свойств синтезированных соединений показало зависимость содержания а-спиральной конформации в структуре пептидов и увеличение размеров их комплекса с ДНК от гидрофобности пептида. Кроме того, было обнаружено, что переход от линейной структуры пептида к звездообразной, а также введение лиганда 01ЮВ8 резко меняет структуру пептида и его комплекса с.
ДНК. Впервые было рассмотрено влияние катионных олигопептидовносителей ДНК — на протекание биохимических процессов в клетке на примере аденилатциклазной системы и был обнаружен рост базальной активности аденилатциклазы с увеличением гидрофобности пептидов, что можно объяснить усилением их взаимодействия с мембраной клетки. Эти данные подтверждаются также ростом гемолитической активности более гидрофобных пептидов и ярко выраженной способностью амфипатического олигопептида к проникновению через эндосомальную мембрану и их следует принимать во внимание при создании поликатионных носителей ДНК и других биологически активных веществ.
Эти результаты составляют основу выносимых на защиту диссертации положений.
Практическая значимость работы: в результате проведенной работы был синтезирован ряд новых катионных олигопептидов, потенциальных носителей ДНК, и изучены их свойства. Поиск новых компактизующих пептидов, модификация их лигандами, позволяющими осуществлять направленный транспорт к определенным типам клеток и транспорт ДНК в их ядра, а также поиск эндосомолитических компактизующих пептидов, которые могут существенно повысить эффективность проникновения чужеродной ДНК в клетку и достигнуть уровня вирусных носителей, избавившись от присущих им недостатков, является одной из главных задач генной терапии. Исследование механизмов проникновения невирусных векторов в клетку, взаимодействия их с клеточными структурами и влияния на биохимические реакции, протекающие в клетке в их присутствии, позволяет определить направление этого поиска. Поэтому проведенная работа является значимой как с научной, так и с практической точки зрения.
Диссертация состоит из 6 разделов: введения, обзора литературы, касающейся данной проблемы, обсуждения результатов проведенной работы, экспериментальной части, выводов и списка литературы, который включает 137 наименований.
Работа выполнена как часть исследований, проводящихся в ИВС РАН по теме «Гидрофильные синтетические и природные полимеры, биологически активные соединения и материалы на их основе». и.
2 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.
5 ВЫВОДЫ.
1. С учетом литературных данных и теоретических расчетов, синтезирован ряд новых катионных олигопептидов, носителей ДНК, гидрофильно-гидрофобный баланс которых варьировался от сильно гидрофобного пептида (FP4) со структурой, способствующей формированию амфипатической ос-спирали, до гидрофильных димеров и тетрамеров звездообразной структуры на основе фрагмента 48−60 белка Tat вируса иммунодефицита человека.
2. Синтез димерной и тетрамерной форм фрагмента 48−60 белка Tat вируса иммунодефицита человека был проведен по оригинальной методике, позволившей получить эти пептиды с высокой степенью чистоты.
3. При изучении с помощью гель-электрофореза (метод ретардации) комплексов пептидов с ДНК было показано, что все синтезированные пептиды способны как к связыванию и компактизации ДНК, так и к ее эффективной защите от ферментативного гидролиза.
4. Изучение вторичной структуры синтезированных пептидов методом кругового дихроизма показало увеличение а-спиральности при возрастании их гидрофобности. Переход от димерной к тетрамерной форме пептидов, фрагментов белка вируса иммунодефицита человека, а также введение лиганда GRGDS по данным кругового дихроизма резко меняет структуру пептида и его комплекса с ДНК.
5. С помощью метода электронной микроскопии было показано, что увеличение гидрофобности пептидов приводит к увеличению размеров комплекса пептида с ДНК.
6. Показано, что более гидрофобные пептиды обладают способностью разрушать биологические мембраны.
7. Впервые на примере аденилатциклазной системы было рассмотрено влияние катионных олигопептидов — носителей ДНК — на протекание биохимических процессов в клетке. Был обнаружен рост базальной активности аденилатциклазы с увеличением гидрофобности пептидов. В то же время гидрофильные катионные пептиды аденилатцитклазную систему не активируют. Эти данные следует принимать во внимание при создании новых поликатионных носителей ДНК и других биологически активных веществ.
Список литературы
- Агат Kh., Aubertin А.-М., Roche А.-С., Monsigny М., Mayer R. Synthesis and antiviral activity of peptide-oligonucleotide conjugates prepared by using ^-(bromoacetyOpeptides. Bioconjugate Chem. 1995. V. 6. P. 573−577
- Zauner W., Ogris M., Wagner E. Polylysine-based transfection systems utilizing receptor-mediated delivery. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 30. P. 97−113
- Богданенко E. В., Свиридов Ю. В., Московцев А. А., Жданов Р. И. Невирусный перенос генов in vivo в генной терапии. Вопросы медицинской химии. 2000. Т. 46. С. 226−245
- Smaglik P. Gene therapy death may delay new trials. The Scientist. 1999. V. 13. P. 9−14
- Capecchi M. R. High efficiency transformation by direct microinjektion of DNA into mammalian cells. Cell. 1980. V. 22. P. 479−483
- Кнорре Д., Г., Мызина С. Д. Биологическая химия. Москва. «Высшая школа». 1998
- Никифорович Г. В., Галактионов С. Г., Чипенс Г. И. Конформациипептидных биорегуляторов. Москва. «Медицина». 1983
- Терентьев А.П., Потапов В. М. Основы стереохимии. Москва. «Химия». 1964
- Кочетков Н.К., Торгов И. В., Ботвиник М. М. Химия природных соединений. Москва. Издательство Академии Наук СССР. 1961
- Hruby V., Udenfriend S., Meienhofer J. The peptides. Analysis, synthesis, biology. V.7. London. Academic press, Inc. 1985
- Xiong H., Buckwalter B. L., Shieh H. M., Hecht M. N. Periodicity of polar and nonpolar amino acids is the major determinant of secondary structure in self-assembling oligomeric peptides. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 6349−6353
- L-P. Liu, Sh.-Ch. Li, N. K. Goto, and Ch. M. Deber. Threshold hydrophobicity dictates helical conformations of peptides in membrane environments. Biopolimers. 1996. V. 39. P. 465−470
- Honda S., Morii H., Uedaira H. Design of membrane protein consisting of a metal binding loop and a transmembrane helix. Proc. 23th EPS. 1994. P. 447
- Tripet B., Zhou N., Sonnichsen F., Hodges R. S. Hybritein 1: A de novo designed protein displaying cooperative interactions between a metal-ion binding loop and a helix-helix dimerization motif. Proc. 23th EPS, 1994, P. 79
- Renold P., Tsang K. Y., Shimizu L., Kemp D. S. For short alanine-lysine peptides the helical propensities of lysine residues (s values) are strongly temperature dependent. J. Am. Chem. Soc. 1996. V. 118. P. 12 234−12 235
- Yumoto N., Murase S., Petukhov M. G., Yamamoto H., Tatsu Y., Taguchi T., Yoshikawa S. Effect of the N-terminal modification on the stability of cx-helix in the C-terminal fragment of neuropeptide Y. Proc. 23th EPS, 1994. P. 555
- Marqusee S., Baldwin R. L. Helix stabilisation by Glu".Lis+ salt bridges in short peptides of de novo design. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1987. V. 84. P. 8898−8902
- Holtz J. S., Holtz J. H., Chi Z., Asher S. A. Ultraviolet raman examination ofthe environmental dependence of bombolitin I and bombolitin III secondary structure. Biophys. J. 1999. V. 76. № 6. P. 3227−323
- Ruan F., Chen Y., Hopkins P. B. Metal ion enhanced helicity in synthetic peptides containing unnatural, metal-ligating residues. J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9403−9404
- Ghadiri M. R., Feraholz A. K. Peptide architecture. Design of stable a-helical metallopeptides via a novel exchange-inert Ru3+ complex. J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9633−9635 J. Am. Chem. Soc. 1990. V. 112. P. 9403−9404
- Vogel H., Dhanapal B., Pawlak M., Meseth U., Eggleston., Mutter M. Membrane channel forming properties of melittin-TASP. Proc. 23th EPS, 1994, P. 449
- Coraut I., Buttner K., Dasseux J-L., Dufourcq J. The amphipatic alpha- helix concept. Application to the de novo design of ideally amphipatic Leu, Lys peptides with hemolytic activity higher than the melittin. FEBS Letters. 1994. V. 349. P. 29−33
- Niidome T., Anzai Sh., Sonoda J., Tokunaga Y., Nakahara M., Hatakeyama T., Ayoagi H. Effect of amino acid substitution in amphiphilic alpha- helical peptides on peptide-phospholipid membrane interaction. J. Pep. Sci. 1999. V. 5. P. 298−305
- Ohmori N., Niidome T., Hatakeyama T., Mihara H., Aoyagi H. Interaction of alpha- helical peptides with phospholipid membrane: effects of chain length and hydrophobicity of peptides. J. Peptide Res. 1998. V. 51. P. 103−109
- Blondelle S. E., Takahashi E., Houghten R. A., Perez-Paya E. Design of conformationally defined combinatorial libraries. Proc. 23th EPS, 1994, P. 85
- Krause E., Rothemund S., Dathe M., Beyermann M., Mark-Kross L. J., Ennis M., Bienert M. Influence of amphipaticity and helicity on the peptide-induced mast cell activation. Proc. 23th EPS, 1994. P. 387
- R. Epand, Y. Shai, J. Segrest, and G. M. Anantharamaian. Mechanisms for the modulation of membrane bilayer properties by amphipatic helical peptides. Biopolimers. 1995. V. 37. P. 319−338
- Epand R., Shai Y., Segrest J., Anantharamaian G. M. Mechanisms for the modulation of membrane bilayer properties by amphipatic helical peptides. Biopolimers. 1995. V. 37. P. 319−338
- Nir S., Nieva J. L. Interacton of peptides with liposomes: pore formation and fusion. Progress in lipid research. 2000. V. 39. P. 181−206
- T. Niidome, M. Wakamatsu, A. Wada, T. Hirayama, and H. Aoyagi. Required structure of cationic peptide for oligonucleotide- binding and -delivering into cells. J. Pep. Sci. 2000. V. 6. P. 271−279
- Ряднова И. Ю. Интерполимерные комплексы нуклеиновых кислот с белками. Диссертация на соискание ученой степени кандидата химических наук. С-Петербург. 1999
- Smith L. С., Duguid J., Manpreed S. W., Logan M. J., Tung Ch.-H., Edwards V., Sparrow J. T. Synthetic peptide-based DNA complexes for nonviral gene delivery. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 30. P. 115−131
- De Smedt S. C., Demeester J., Hennink W. E. Cationic Polymer Based Gene Delivery Systems. Pharm. Res. 2000. V. 17. P. 113−126
- Porschke D., Ronnenberg J. The reaction of aromatic peptides with double helical DNA. Quantitative characterization of a two step reaction scheme. Biophys. Chem. 1981. V.13. P. 283−290
- Porschke D. Dynamics of DNA condensation. Biochemistry. 1984. V. 23. P. 4821−4828
- Yaroslavov A. A., Sukhishvili S. A., Obolsky O. L., Yaroslavova E. G., Kabanov A. V., Kabanov V. A. DNA affinity to biological membranes is enhanced due to complexation with hydrophobized polycation. FEBS lett. 1996. V. 384. P. 177−180
- Wagner E., Zenke M., Cotten M., Beug H., Birnstiel M. L. Transferrin-polycation conjugates as carriers for DNA uptake into cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 3410−3414
- Mervin J. R., Noell G. S., Thomas W. L. Targeted delivery of DNA using YEE (GalNAcAH)3 a synthetic glycopeptide ligand for the asialoglycoprotein receptor. Bioconjug. Chem. 1994. V. 5. P. 612−620
- Niidome T., Urakawa M., Sato H., Takahara Y., Anai T., Hatakeyama T., Wada A., Hirayama T., Ayoagi H. Gene transfer into hepatoma cells mediated by galactose-modified alpha-helical peptides. Biomaterials. 2000. V.21.P. 1811−1819
- Feero W. G., Li S., Rosenblatt J. D. Selection and use of ligands for receptor-mediated gene delivery to myogenic cells. Gene Therapy. 1997. V. 4. P. 664 674
- Wagner E., Zenke M. Transferrin-polycation conjugates as carriers for DNA uptake into cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 3410−3414
- Gottschalk S., Cristiano R. G., Smith L. S., Woo S. L. Folate receptor mediated DNA delivery into tumor cells: potosomal disruption results in enhanced gene expression. Gene Therapy. 1994. V. 1 P. 185−191
- Schneider H., Huse K., Birkenmeier G., Otto A., Scholz G. H., Gene transferimediated by a2-macroglobulin. Nucleic Acids Res. 1996. V. 24. P. 3873−3874
- Huckett В., Ariatti M., Hawtrey A. O., Evidence for targeted gene transfer by receptor-mediated endocytosis. Stable expression following insulin-directed entry of NEO into HepG2 cells. Biochem. Pharm. 1990. V. 40. P. 253−263
- Rosenkranz A. A., Yachmenev S. V., Jans D. A. Serebryakova N. V., Murav’ev V. I., Peters R., Sobolev A. S. Receptor- mediated endocytosis and nuclear transport of a transfecting DNA construct Exp. Cell Res. 1992. V. 199. P. 323−329
- Trubetskoy V. S., Torchilin V. P., Kennel S. J., Huang L., Use of N-terminal modified poly (L-lysine)-antibody conjugate as a carrier for targeted gene delivery in mouse lung endothelial cells. Bioconjug. Chem. 1992. V. 3. P. 323−327
- Геннис P. Биомембраны. Молекулярная структура и функции. Москва. «Мир». 1997
- Wang K., Guan T., Cheresh D. A., Nemerow G. R. Regulation of adenovirus membrane penetration by the cytoplasmic tail of integrin ?5. J. Virology.2000. V. 74. P. 2731−2739
- Nemerov G., Steward Ph. Role of av integrins in adenovirus cell entry and gene delivery. Microbiol. Molecular Biol. Rev. 1999. V. 63. P. 725−734
- Scott E. S., Wiseman J. W., Evans M. J., Colledge W. H. Enhanced gene delivery to human airway epithelial cells using an integrin- targeting lipoplex. J. Gene Medicine. 2001. V. 3. P. 125−134
- Jenkins R. G., Herrik S. E., Meng Q.-H., Kinnon C., Laurent G. J., McAnulty R. J., and Hart S. L. An integrin- targeted non-viral vector for pulmonary gene therapy. Gene therapy. 2000. V.7. P. 393−400
- Subramanian A., Ranganathan P., Diamond S. L. Nuclear targeting peptide scaffolds for lipofection of nondividing mammalian cells. Nature Biotechnology. 1999. V. 17. P. 873- 877
- Cartier R., Reszka R. Utilisation of synthetic peptides containing nuclear localization signals for nonviral gene transfer systems. Gene Therapy. 2002. V.9. P. 157−167
- Pouton C. W. Nuclear import of polypeptides, polynucleotides and supramolecular complexes. Adv. Drug Delivery Rev. 1998. V. 34. P. 51−64
- Reed M. W., Fraga D., Schwartz D. E., Scholler J., Hinrichsen R. D. Synthesis and evaluation of nuclear targeting peptide- antisense oligodeoxynucleotide conjugates. Bioconjugate Chem. 1995. V. 6. P. 101−108
- Gariepy J., Kawamura K. Vectorial delivery of macromolecules into cells using peptide- based vehicles. Trends in Biotechnology. 2001. V. 19. P. 21−28
- Chan C.-K., Senden T., Jans D. A. Supramolecular structure and nuclear targeting efficiency determine the enhancement of transfection by modified polylysines. Gene Therapy. 2000. V. 7. P. 1690−1697
- Singh D., Kiarash R., Kawamura K., LaCasse E. C., Gariepy J. Penetrationand intracellular routing of nucleus-directed peptide-based shuttles (loligomers) in eukaiyotic cells. Biochemistry. 1998. V. 37. P. 5798−5809
- Ritter W, Plank C, Lausier J, Rudolph C, Zink D, Reinhardt D, Rosenecker J.
- A novel transfecting peptide comprising a tetrameric nuclear localization sequence. J. Mol. Med. 2003. V. 81. P. 708−717
- LimaM. C., Simoes S., Pires P., GasparR., Slepushkin V., Duzgunes N. Genedelivery mediated by cationic liposomes: from biophysical aspects to enhancement of transfection. Mol. Membr. Biol. 1999. V. 16. № 1. P. 103 109
- Radler J. O., Koltover I., Salditt T., Safinya C. R. Structure of DNA-cationic liposome complexes: DNA intercalation in multilamellar membranes in distinct interhelical packing regimes. Science. 1997. V. 275. P. 810−814
- Faneca H., Simoes S., Pedroso de Lima M.C. Evaluation of lipid-based reagents to mediate intracellular gene delivery. Biochim. Biophys. Acta. 2002. V. 1567. P. 23−33
- Simoes S., Slepushkin V., Pires P. Mechanisms of gene transfer mediated by lipoplexes associated with targeting ligands or pH-sensitive peptides. Gene Therapy. 1999. V. 6. P. 1798−1807
- Zelphati O., Uyechi L. S., Barron L. G., Szoka Jr F. C. Effect of serum components on the physico-chemical properties of cationiclipid/oligonucleotide complexes and on their interactions with cells. Bioch. Bioph. Acta. 1998. V. 1390. P. 119−133
- Kabanov A. V., Kabanov V. A. DNA complexes with polycations for the delivery of genetic material into cells. Bioconjug. Chem. 1995. V. 6. P. 7−20
- Zauner W., Ogris M., Wagner E. Polylysine-based transfection systems utilizing receptor-mediated delivery. Adv. Drug Del. Rev. 1998. V. 30. P. 97 113
- Wagner E., Cotten M., Foisner R., Bimstiel M. L. Transferrin-polycation-DNA complexes: the effect of polycations on the structure of the complex andI
- DNA delivery to cells. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1991. V. 88. P. 4255259
- Remy J. S., Abdallah B., Zanta M. A., Boussif O., Behr J. P., Demeneix B. Gene transfer with lipospermines and polyethyleneimines. Adv. Drug Deliv. Rev. 1998. V. 30. P. 85−95
- Haensler J. Szoka F. C. J. Polyamidoamine cascade polymers mediate efficient transfection of cells in culture. Bioconjug. Chem. 1993. V. 4. P. 372 379
- Ohsaki M., Okuda T., Wada A., Hirayama T., Niidome T., Aoyagi H. In vitro gene transfection using dendritic poly (l-lysine). Bioconjug. Chem. 2002. V. 13. P. 510−517
- Maruyama A., Ishihara T., Kim J. S., Kim S. W., Akaike T. Nanoparticle DNAcarrier with poly (L-lysine) grafted polysaccharide copolymer and poly (D, L-lactic acid). Bioconjug. Chem. 1997. V. 8. P. 735−742
- Midoux P., Monsigny M. Efficient gene transfer by histidilated polylisine/ pDNA complexes. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 406−411
- Gottschalk S., Sparrow J. T., Hauer J. A novel DNA-peptide complex for efficient gene transfer and expression in mammalian cells. Gene Therapy. 1996. V. 3. P. 448−457
- Choi J. S., Lee E. J., Choi Y. H. Polyethylene glycol)-block-poly (l-lysine) dendrimer: novel linear polymer/dendrimer block copolymer forming a spherical water-soluble polyionic complex with DNA. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 62−65
- Huddle T., Rayner SA., Comer RM. Activated polyamidoamine dendrimers, a non-viral vector for gene transfer to the corneal endothelium. Gene Therapy. 1999. V. 6. P. 939−943
- Richardson S., Ferruti P., Duncan R. Poly (amidoamine)s as potential endosomolytic polymers: evaluation in vitro and body distribution in normal and tumour-bearing animals. J. Drug Target. 1999.
- Ohmori N., Niidome T., Kiyota T., Lee S., Sugihara G., Wada A., Hirayama
- T., Aoyagi H. Importance of hydrophobic region in amphipatic structures of alpha-helical peptides for their gene transfer-ability into cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1998. V. 245. № 1. P. 259−265
- Forminaya J., Gasset M., Garcia R., Roncal F., Albar J. P., Bernad A. An optimized amphiphilic cationic peptide as an afficient non-viral gene delivery vector. J. Gene Medicine. 2000. V. 2. P. 455−464
- Niidome T., Takaji K., Urakawa M., Ohmori N., and Wada A. Chain length of cationic a-helical peptide sufficient for gene delivery into cells. Bioconjug. Chem. 1999. V. 10. P. 773−780
- Niidome T., Urakava M., Takaji K. et. al. Influence of lipophilic groups in cationic a-helical peptides on their abilities to bind with DNA and deliver genes into cells. J. Peptide Res. 1999. V. 54. P. 361−367
- Morris M. C., Chaloin L., Heitz F., Divita G. Translocating peptides and proteins and their use for gene delivery. Current Opinion in Biotechnology. 2000. V. 11. P. 461−466
- Rittner K., Benavente A., Bombard-Sorlet A., Heitz F., Divita G., Brasseur R., Jacobs E. New basic membrane-destabilizing peptides for plasmid-based gene delivery in vitro and in vivo. Molecular Therapy. 2002. V. 5. P. 104−114
- Vaysse L., Arveiler B. Transfection using synthetic peptides: comparison of three DNA-compacting peptides and effect of centrifugation. Bioch. Bioph. Acta. 2000. V. 1474. P. 244−250
- Gottschalk S., Sparrow J. T., Hauer J., Mims M. P., Leland F. E., Woo S. L. C., Smith L. C. A novel DNA-peptide complex for efficient gene transfer and expression in mammalian cells. Gene Therapy. 1996. V.3. P. 448−457
- Vaysse L., Burgelin I., Merlio J. P., Arveiler B. Improved transfection usingepithelial cell line-selected ligands and fusogenic peptides. Biochim.
- Biophys. Acta. 2000. V. 1475. P. 369−376
- Sheldon K., Liu D., Ferguson J., Gariepy J. Loligomers: Design of de novo peptide-based intracellular vehicles. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1995. V. 92. P. 2056−2060
- Okuda Т., Sigiyama A., Niidome Т., Ayoagi H. Characters of dendritic poly (l-lysine) analogues with the terminal lysines replaced with arginines and histidines as gene carriers in vitro. Biomaterials. 2004. V. 25. P.537−544
- Rodryguez-Hernandez J., Gatti М., Klok Н-А. Highly branched poly (l-lysine). Biomacromolecules. 2003. V. 4. P. 249−258
- Lee H. J., Pardrige W. M. Pharmacokinetics and delivery of Tat and Tatprotein conjugates to tissues in vivo. Bioconjugate Chem. 2001. V. 12. P. 995−999
- Torchilin V., Rammohan R., Weissig V., Levchenko T. Tat peptide on the surface of liposomes affords their efficient intracellular delivery even at low temperature and in presence of metabolic inhibitors. PNAS. 2001. V. 98. № 15. P. 8786−8791
- Rudolph C., Plank C., Lausier J., Schillinger U., Muller R., Rosenecker J. Oligomers of the arginine-rich motif of the HIV-1 Tat protein are capable of transferring plasmid DNA into cells. J. Biol. Chem. 2003. V. 128. № 13. P. 11 411−11 418
- Perutz M. F., Johnson Т., Suzuki M., Finch J. Glutamine repeats as polar zippers: their possible role in inherited neurodegenerative deseases. Proc. Natl. Acad Sci. USA. 1994. V. 91. P. 5355−5358
- Кузнецова Л.А., Плеснева С. А. Влияние биогенных аминов и полипептидных гормонов на активность протеинкиназы «А» и аденилатциклазы в мышцах моллюска Anodonta cygnea. Ж. эволюц. биохим. физиол. 2001. Т. 37. № 5. С. 395−400
- Strader C.D., Fong T.M., Tota M.R., Underwood D., Dixon R.A.F. Structure and function of G protein-coupled receptors Annu. Rev. Biochem. 1994. V. 63. P. 101−132
- Wess J. G protein-coupled receptors: molecular mechanisms involved in receptor activation and selectivity of G protein recognition FASEB J. 1997. V. 11. P. 346−354
- Flawia M.M., Torres H.N. Adenylate cyclase activity in Neurospora crassa. III. Modulation by glucagon and insulin. J. Biol. Chem. 1973. V. 248. P. 4517−4520
- Galperin M.Y., Nikolskaya A.N., Koonin E.V. Novel domains of the prokaryotic two-component signal transduction systems. FEMS Microbiol Lett. 2001. V. 203. P. 11−21
- Paveto C., Mallo G., Egidy G., Galvagno M.A., Passeron S. Activation of the cAMP cascade by steroidogenic hormones and glucagon in the pathogenic fungus Candida albicans. Cell Biol Int. Rep. 1991. V. 15. P. 169−178
- Simon M.I., Strathmann M.P., Gautam N. Diversity of G proteins in signal transduction. Science. 1991. V. 252. P. 802−808
- Inoue H., Yoshioka T. Purification of a regulatory subunit of type II cAMP-dependent protein kinase from Drosophila heads Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997. V. 235. P. 692−696
- Kariya K., Saito K., Iwata H. Adrenergic mechanism in Tetrahymena. III. cAMP and cell proliferation. Jap. J. Pharmacol. 1974. V. 24. P. 129−134
- Перцева М.Н., Шпаков А. О., Плеснева С. А. Современные достижения в изучении сигнальных механизмов действия инсулина и родственных ему пептидов. Ж. эволюц. биохим. физиол. 1996. Т. 32. № 3. С. 318−340
- Шпаков А.О. Молекулярные детерминанты рецепторов и ГТФ-связывающих белков, определяющие специфичность взаимодействий между ними. Журн. эволюц. биохим. физиол. 1996. Т. 32. № 4. С. 488−511
- Перцева М.Н., Шпаков А. О. Консервативность инсулиновой сигнальной системы в эволюции беспозвоночных и позвоночных животных. Журн. эволюц. биохшл. физиол. 2002. Т. 38. № 5. С. 430−441
- Brzostowski J.A., Kimmel A.R. Signaling at zero G: G-protein-independent functions for 7-TM receptors Trends Biochem. Sci. 2001. V. 26. P. 291−297
- Gudermann Т., Kalkbrenner F., Schultz G. Diversity and selectivity of receptor-G protein interaction.Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 1996. V. 36. P. 429−460
- Bourret R.B., Borkovich K.A., Simon M.J. Signal transduction pathways involving protein phosphorylation in prokaryotes. Ann. Rev. Biochem. 1991. V. 60. P. 401−441
- Janetopoulos C., Jin Т., Devreotes P. Receptor-mediated activation of heterotrimeric G-proteins in living cells. Science. 2001. V. 291. P. 24 082 411
- Srinivasan J., Gundersen R.E., Hadwiger J.A. Activated G subunits can inhibit multiple signal transduction pathways during Dictyostelium development. Dev. Biol. 1999. V. 215. P. 443−452
- Шпаков А.О., Перцева М. Н. Структурно-функциональная характеристика ГТФ-связывающих белков беспозвоночных животных Журн. эволюц. биохим. физиол. 1993. Т. 29. № 5−6. С. 635−653
- Шпаков А.О., Перцева М. Н. Структурно-функциональная характеристика Ру-субъединиц G-белков и молекулярные механизмы их сопряжения с другими компонентами систем сигнальной трансдукции Журн. эволюц. биохим. физиол. 1997. Т. 33. № 6. С. 669 688
- Shpakov А.О. Molecular basis of the functional coupling of receptors to GTP-binding proteins. Membr. and Cell Biol. 1996. V. 9. P. 467−488
- Wess J. Molecular basis of receptor/G protein-coupling selectivity Pharmacol. Ther. 1998. V. 80. P. 231−264
- Гершкович А. А., Кибирев В. К. Синтез пептидов. Реагенты и методы. Киев. «Наукова думка». 1987
- Додсон Р., Эллиот Д., Эллиот У., Джонс К. Справочник биохимика. Москва. «Мир». 1991
- Kamber В., Hartmann A., Riniker К., Rink В., Sieber P., Rittel W. Helv. Chem. Acta. 1980. V. 63. P. 899−914
- Маниатис E., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. Методы генетической инженерии. Москва, «Мир», 1984
- Kidwai A.M., Radcliffe A.M., Lee E.V., Daniel E.E. Isolation and properties of skeletal muscle membrane. Biochim. Biophys. Acta. 1973. V. 289. P. 593 607
- Salomon Y., Londos C., Rodbell M.A. Highly sensitive adenylate cyclase assay. Anal. Biochem. 1974. V. 58. P. 541−548